Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB0488
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0488, 1032 aa
1>>>pF1KB0488 1032 - 1032 aa - 1032 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1396+/-0.000954; mu= 4.5011+/- 0.057
mean_var=239.9669+/-48.889, 0's: 0 Z-trim(113.3): 56 B-trim: 88 in 1/51
Lambda= 0.082794
statistics sampled from 13863 (13905) to 13863 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.751), E-opt: 0.2 (0.427), width: 16
Scan time: 3.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13948.1 CARD10 gene_id:29775|Hs108|chr22 (1032) 6929 841.6 0
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CCDS6997.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 ( 536) 678 94.7 5.5e-19
CCDS48057.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 ( 492) 675 94.3 6.6e-19
CCDS58605.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 ( 740) 468 69.8 2.5e-11
CCDS11768.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 (1004) 468 69.9 3.1e-11
>>CCDS13948.1 CARD10 gene_id:29775|Hs108|chr22 (1032 aa)
initn: 6929 init1: 6929 opt: 6929 Z-score: 4485.7 bits: 841.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6929; 100.0% identity (100.0% similar) in 1032 aa overlap (1-1032:1-1032)
10 20 30 40 50 60
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CCDS13 MPGRAEAGEAEEEAGAGSGSEAEEDALWERIEGVRHRLARALNPAKLTPYLRQCRVIDEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DEEEVLSTYRFPCRVNRTGRLMDILRCRGKRGYEAFLEALEFYYPEHFTLLTGQEPAQRC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 SMILDEEGPEGLTQFLMTEVRRLREARKSQLQREQQLQARGRVLEEERAGLEQRLRDQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SMILDEEGPEGLTQFLMTEVRRLREARKSQLQREQQLQARGRVLEEERAGLEQRLRDQQQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AQERCQRLREDWEAGSLELLRLKDENYMIAMRLAQLSEEKNSAVLRSRDLQLAVDQLKLK
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250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VSRLEEECALLRRARGPPPGAEEKEKEKEKEKEPDNVDLVSELRAENQRLTASLRELQEG
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LQQEASRPGAPGSERILLDILEHDWREAQDSRQELCQKLHAVQGELQWAEELRDQYLQEM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EDLRLKHRTLQKDCDLYKHRMATVLAQLEEIEKERDQAIQSRDRIQLQYSQSLIEKDQYR
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KQVRGLEAERDELLTTLTSLEGTKALLEVQLQRAQGGTCLKACASSHSLCSNLSSTWSLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EFPSPLGGPEATGEAAVMGGPEPHNSEEATDSEKEINRLSILPFPPSAGSILRRQREEDP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 APPKRSFSSMSDITGSVTLKPWSPGLSSSSSSDSVWPLGKPEGLLARGCGLDFLNRSLAI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 RVSGRSPPGGPEPQDKGPDGLSFYGDRWSGAVVRRVLSGPGSARMEPREQRVEAAGLEGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RVSGRSPPGGPEPQDKGPDGLSFYGDRWSGAVVRRVLSGPGSARMEPREQRVEAAGLEGA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 CLEAEAQQRTLLWNQGSTLPSLMDSKACQSFHEALEAWAKGPGAEPFYIRANLTLPERAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CLEAEAQQRTLLWNQGSTLPSLMDSKACQSFHEALEAWAKGPGAEPFYIRANLTLPERAD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 PHALCVKAQEILRLVDSAYKRRQEWFCTRVDPLTLRDLDRGTVPNYQRAQQLLEVQEKCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PHALCVKAQEILRLVDSAYKRRQEWFCTRVDPLTLRDLDRGTVPNYQRAQQLLEVQEKCL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 PSSRHRGPRSNLKKRALDQLRLVRPKPVGAPAGDSPDQLLLEPCAEPERSLRPYSLVRPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PSSRHRGPRSNLKKRALDQLRLVRPKPVGAPAGDSPDQLLLEPCAEPERSLRPYSLVRPL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB0 LVSALRPVVLLPECLAPRLIRNLLDLPSSRLDFQVCPAESLSGEELCPSSAPGAPKAQPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LVSALRPVVLLPECLAPRLIRNLLDLPSSRLDFQVCPAESLSGEELCPSSAPGAPKAQPA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB0 TPGLGSRIRAIQESVGKKHCLLELGARGVRELVQNEIYPIVIHVEVTEKNVREVRGLLGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TPGLGSRIRAIQESVGKKHCLLELGARGVRELVQNEIYPIVIHVEVTEKNVREVRGLLGR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB0 PGWRDSELLRQCRGSEQVLWGLPCSWVQVPAHEWGHAEELAKVVRGRILQEQARLVWVEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PGWRDSELLRQCRGSEQVLWGLPCSWVQVPAHEWGHAEELAKVVRGRILQEQARLVWVEC
970 980 990 1000 1010 1020
1030
pF1KB0 GSSRGCPSSSEA
::::::::::::
CCDS13 GSSRGCPSSSEA
1030
>>CCDS5336.2 CARD11 gene_id:84433|Hs108|chr7 (1154 aa)
initn: 1989 init1: 829 opt: 855 Z-score: 564.1 bits: 116.1 E(32554): 4.2e-25
Smith-Waterman score: 1619; 36.1% identity (58.0% similar) in 1060 aa overlap (23-925:18-1057)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MPGRAEAGEAEEEAGAGSGSEAEEDALWERIEGVRHRLARALNPAKLTPYLRQCRVIDEQ
::::::: .: :: :.: .::::::::::::.:::::
CCDS53 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQ
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 DEEEVLSTYRFPCRVNRTGRLMDILRCRGKRGYEAFLEALEFYYPEHFTLLTGQEPAQRC
::.:::.. .: ..::.:::.:::. .:.::: .:::.::::::: . :.::.::..:
CCDS53 DEDEVLNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB0 SMILDEEGPEGLTQFLMTEVRRLREARKSQ-LQREQQLQARGRVLEEERAGLEQRLRDQQ
: :. ::: ::::.:::.:: .:.. :.. ::: . : :: : ::.:. . .
CCDS53 STIVVEEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCE-LLARLRQLEDEKKQMTLTRVELL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 QAQERCQRLREDWEAGSLELLRLKDENYMIAMRLAQLSEEKNSAVLRSRDLQLAVDQLKL
::: ...:. .. . ::...::.:: .::: :::::::: ::.::::::: .::::
CCDS53 TFQERYYKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 KVSRLEEECALLRRARGPPPGAEEKEKEKEKEKEPDNVDLVSELRAENQRLTASLRELQE
.....:::: : : . :.. .::. : ::. ::. : .. .:::
CCDS53 RLNKMEEECKLERNQSLKLKNDIENRPKKEQ---------VLELERENEMLKTKNQELQS
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 GLQQEASRPGAPGSERILLDILEHDWREAQDSRQELCQKLHAVQGELQWAEELRDQYLQE
.: :.. . : :.. .::::::: .:: ..:::: .... .: : . ::::::.::.:
CCDS53 IIQ--AGKRSLPDSDKAILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 MEDLRLKHRTLQKDCDLYKHRMATVLAQLEEIEKERDQAIQSRDRIQLQYSQSLIEKDQY
:::.:: :: :::..::::: ::. ::::.:.:::::..:::. : :::: :::::.:
CCDS53 KEDLELKCSTLGKDCEMYKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKY
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KB0 RKQVRGLEAERDELLTTLTSLEGTKALLEVQLQR-AQGGTCL------------------
:::.: :: . ::. .. :. . :: .:.: .. .. :
CCDS53 RKQIRELEEKNDEMRIEMVRREACIVNLESKLRRLSKDSNNLDQSLPRNLPVTIISQDFG
410 420 430 440 450 460
470 480 490
pF1KB0 ---------KACASSHSLCSNLSSTWSLSEFP----------------SPLGGP-----E
.: :: : : .: . : : ::.. .
CCDS53 DASPRTNGQEADDSSTSEESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQ
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540
pF1KB0 ATG--EAAVMGGPEPHNSEEATDSEKEI----NRLSILPF---PPSAGSILRRQREEDPA
: : : .. ..: .: :.: .. .: ::. . ::. ::.:: .:. :
CCDS53 AKGHEEEGTDASPSSCGSLPITNSFTKMQPPRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKED--A
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590
pF1KB0 PPKRSFSSMSDITGSVTL-------KPWSPGLSSSSSSDSVWPLGKPEGLLARG---CGL
: . . .: : .: . .: : :: ::.: . ::: : .:
CCDS53 PHRSTVEEDNDSGGFDALDLDDDSHERYSFGPSSIHSSSSS---HQSEGLDAYDLEQVNL
590 600 610 620 630
600 610 620 630
pF1KB0 DF----LNRSLAIRVSGRSPPGGPEPQ--------DKGPDGLSFYGDRWSGAVVRRVLSG
: :.: . :.. . :: :. :. . :.. : :. :. : :
CCDS53 MFRKFSLERPFRPSVTSVGHVRGPGPSVQHTTLNGDSLTSQLTLLGGNARGSFVHSVKPG
640 650 660 670 680 690
640 650 660 670 680
pF1KB0 PGSARMEPREQRVEAAGLEGACLEAEAQQRTL--------LWN-QGSTLPSLMDSKAC-Q
. . :: . . ::: :...: :. : :. : . : . :. .
CCDS53 SLAEKAGLREGH-QLLLLEG-CIRGERQSVPLDTCTKEEAHWTIQRCSGPVTLHYKVNHE
700 710 720 730 740 750
690 700 710 720 730 740
pF1KB0 SFHEALEAWAKG--PGAEPFYIRANLTLPERADPHALCVKAQEILRLVDSAYKRRQEWFC
.... .. : ... :::: ::.. . : .. .: ...... :. :. :.::.:
CCDS53 GYRKLVKDMEDGLITSGDSFYIRLNLNISSQLDACTMSLKCDDVVHVRDTMYQDRHEWLC
760 770 780 790 800 810
750 760 770
pF1KB0 TRVDPLTLRDLDRGTVPNYQRAQQLLEVQ-----------------------------EK
.::::.: .::: ::.:.:.:::::: :. :.
CCDS53 ARVDPFTDHDLDMGTIPSYSRAQQLLLVKLQRLMHRGSREEVDGTHHTLRALRNTLQPEE
820 830 840 850 860 870
780 790 800 810
pF1KB0 CLPSSRHR-GPR------------------SNLKKR--ALDQLRLVRPKPVGAPAGDSPD
: .: : .:: : :: . ...:.. .:.:. : .: :
CCDS53 ALSTSDPRVSPRLSRASFLFGQLLQFVSRSENKYKRMNSNERVRIISGSPLGSLARSSLD
880 890 900 910 920 930
820 830 840 850 860
pF1KB0 --QLLLEPCAE--PER------SLRPYSLVRPLLVSALRPVVLLPECLAPRLIRNLLDLP
.:: : : :: :: :::::: . :::.. : :: :.. ::.
CCDS53 ATKLLTEKQEELDPESELGKNLSLIPYSLVRAFYCERRRPVLFTPTVLAKTLVQRLLN-S
940 950 960 970 980 990
870 880 890 900 910 920
pF1KB0 SSRLDFQVCPAESLSGEE-LCPSSAPGAPKAQPATPGLGSRIR-AIQESVG--KKHCLLE
.. ..: .: .. .. .: : ... .. .:. : : :.:. .::::::
CCDS53 GGAMEFTICKSDIVTRDEFLRRQKTETIIYSREKNPNAFECIAPANIEAVAAKNKHCLLE
1000 1010 1020 1030 1040 1050
930 940 950 960 970 980
pF1KB0 LGARGVRELVQNEIYPIVIHVEVTEKNVREVRGLLGRPGWRDSELLRQCRGSEQVLWGLP
:
CCDS53 AGIGCTRDLIKSNIYPIVLFIRVCEKNIKRFRKLLPRPETEEEFLRVCRLKEKELEALPC
1060 1070 1080 1090 1100 1110
>>CCDS6997.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 (536 aa)
initn: 684 init1: 401 opt: 678 Z-score: 454.3 bits: 94.7 E(32554): 5.5e-19
Smith-Waterman score: 949; 35.0% identity (63.4% similar) in 543 aa overlap (24-565:7-518)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MPGRAEAGEAEEEAGAGSGSEAEEDALWERIEGVRHRLARALNPAKLTPYLRQCRVIDEQ
.: : .:: : :. ...:...:::::::.:.. .
CCDS69 MSDYENDDECWSVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 DEEEVLSTYRFPCRVNRTGRLMDILRCRGKRGYEAFLEALEFYYPEHFTLLTGQEPAQRC
:::.::: . : ..: :.:::. :..:: ::::.::.:::. . .::.:::.
CCDS69 DEEQVLSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 SMILDEEGPEGLTQFLMTEVRRLREARKSQLQREQQLQARGRVLEEERAGLEQRLRDQQQ
:::.: : ::::.::::: .:. .: : . :... ..: :. .. :: .:
CCDS69 SMIIDASGESGLTQLLMTEVMKLQ--KKVQ-DLTALLSSKDDFIKELRVK-DSLLRKHQ-
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 AQERCQRLREDWEAGSLELLRLKDENYMIAMRLAQLSEEKNSAVLRSRDLQLAVDQLKLK
:: :::.:. :::: :: : :.::: .:::::. ::::..:..:.::::: .:::: .
CCDS69 --ERVQRLKEECEAGSRELKRCKEENYDLAMRLAHQSEEKGAALMRNRDLQLEIDQLKHS
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 VSRLEEECALLRRARGPPPGAEEKEKEKEKEKEPDNVDLVSELRAENQRLTASLRELQEG
. . :..: . :. . . .. :..:.. .:. ::. :. : : ..::. .
CCDS69 LMKAEDDCKVERK--------HTLKLRHAMEQRPSQ-ELLWELQQEKALLQARVQELEAS
220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 LQQEASRPGAPGSERILLDILEHDWREAQDSRQELCQKLHAVQGELQWAEELRDQYLQEM
.:. ..: ...::.:::.: ..:: . . ... .:. .: : . ..:
CCDS69 VQEGKLDRSSP-----YIQVLEEDWRQALRDHQEQANTIFSLRKDLRQGEARRLRCMEEK
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 EDLRLKHRTLQKDCDLYKHRMATVLAQLEEIEKERDQAIQSRDRIQLQYSQSLIEKDQYR
: ..:. .:.:: .:: :. ..: :.::. :::::: .:.... :....: ::: :
CCDS69 EMFELQCLALRKDSKMYKDRIEAILLQMEEVAIERDQAIATREELHAQHARGLQEKDALR
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 KQVRGLEAERDELLTTLTSLEGTKALLEVQLQRAQGGTCLKACASSHSLCSNLSSTWSLS
:::: : . ::: . . :. .: .:.: : :.. . : .: .. .
CCDS69 KQVRELGEKADELQLQVFQCEAQLLAVEGRLRRQQ----LETLVLSSDLEDGSPRRSQEL
390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 EFPSPLGGPEATGEAAVMGGPEPHNSEEATDSEKEINRLSILPFPPSAGSILRRQREEDP
.:. : . . .. . :: :.. : .:. .: : .:: . :..
CCDS69 SLPQDLEDTQLSDKGCLAGGGSPKQPFAALHQEQ------VLRNPHDAGLSSGEPPEKER
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590
pF1KB0 APPKRSFSSMSDITGSVTL-KPWSPGLSSSSSSDSVWPLGKPEGLLARGCGLDFLNRSLA
:.:: .. . . : : :
CCDS69 RRLKESFENYRRKRALRKMQKGWRQGEEDRENTTGSDNTDTEGS
500 510 520 530
>>CCDS48057.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 (492 aa)
initn: 670 init1: 401 opt: 675 Z-score: 452.9 bits: 94.3 E(32554): 6.6e-19
Smith-Waterman score: 947; 36.2% identity (65.0% similar) in 506 aa overlap (24-529:7-481)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MPGRAEAGEAEEEAGAGSGSEAEEDALWERIEGVRHRLARALNPAKLTPYLRQCRVIDEQ
.: : .:: : :. ...:...:::::::.:.. .
CCDS48 MSDYENDDECWSVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 DEEEVLSTYRFPCRVNRTGRLMDILRCRGKRGYEAFLEALEFYYPEHFTLLTGQEPAQRC
:::.::: . : ..: :.:::. :..:: ::::.::.:::. . .::.:::.
CCDS48 DEEQVLSDPNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 SMILDEEGPEGLTQFLMTEVRRLREARKSQLQREQQLQARGRVLEEERAGLEQRLRDQQQ
:::.: : ::::.::::: .:. .: : . :... ..: :. .. :: .
CCDS48 SMIIDASGESGLTQLLMTEVMKLQ--KKVQ-DLTALLSSKDDFIKELRVK-DSLLR---K
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 AQERCQRLREDWEAGSLELLRLKDENYMIAMRLAQLSEEKNSAVLRSRDLQLAVDQLKLK
::: :::.:. :::: :: : :.::: .:::::. ::::..:..:.::::: .:::: .
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1032 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]