Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB0445
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0445, 491 aa
1>>>pF1KB0445 491 - 491 aa - 491 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1094+/-0.000755; mu= 14.6604+/- 0.045
mean_var=80.5749+/-16.146, 0's: 0 Z-trim(109.7): 46 B-trim: 50 in 1/52
Lambda= 0.142881
statistics sampled from 11014 (11060) to 11014 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.709), E-opt: 0.2 (0.34), width: 16
Scan time: 3.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 491) 3311 692.0 3.9e-199
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 2514 527.6 1e-149
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 613 135.8 9e-32
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 612 135.6 1.2e-31
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 479 108.2 1.8e-23
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 466 105.4 1e-22
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 450 102.2 1.1e-21
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 431 98.3 1.8e-20
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 430 98.1 2.4e-20
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 427 97.4 3e-20
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 427 97.4 3.1e-20
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 401 92.1 1.3e-18
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 376) 400 91.8 1.3e-18
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 400 91.9 1.4e-18
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 400 91.9 1.4e-18
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 398 91.5 2e-18
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 398 91.5 2.1e-18
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 391 90.0 5e-18
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 391 90.0 5.1e-18
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 381 88.0 2.3e-17
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 373 86.3 6.8e-17
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 372 86.1 7.6e-17
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 372 86.1 7.7e-17
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 372 86.1 7.9e-17
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 361 83.8 3.9e-16
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 360 83.6 4.1e-16
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 357 83.0 6.7e-16
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 355 82.6 8.6e-16
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 353 82.1 8.8e-16
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 346 80.7 3.3e-15
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 333 78.0 1.8e-14
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 329 77.2 3.8e-14
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 296 70.4 3.8e-12
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 293 69.7 4e-12
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 288 68.8 1.2e-11
>>CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 (491 aa)
initn: 3311 init1: 3311 opt: 3311 Z-score: 3688.5 bits: 692.0 E(32554): 3.9e-199
Smith-Waterman score: 3311; 100.0% identity (100.0% similar) in 491 aa overlap (1-491:1-491)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MALLWGLLVLSWSCLQGPCSVFSPVSAMEPLGRQLTSGPNQEQVSPLTLLKLGNQEPGGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MALLWGLLVLSWSCLQGPCSVFSPVSAMEPLGRQLTSGPNQEQVSPLTLLKLGNQEPGGQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 TALKSPPGVCSRDPTPEQTHRLARAMMAFTADLFSLVAQTSTCPNLILSPLSVALALSHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TALKSPPGVCSRDPTPEQTHRLARAMMAFTADLFSLVAQTSTCPNLILSPLSVALALSHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 ALGAQNHTLQRLQQVLHAGSGPCLPHLLSRLCQDLGPGAFRLAARMYLQKGFPIKEDFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALGAQNHTLQRLQQVLHAGSGPCLPHLLSRLCQDLGPGAFRLAARMYLQKGFPIKEDFLE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 QSEQLFGAKPVSLTGKQEDDLANINQWVKEATEGKIQEFLSGLPEDTVLLLLNAIHFQGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QSEQLFGAKPVSLTGKQEDDLANINQWVKEATEGKIQEFLSGLPEDTVLLLLNAIHFQGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 WRNKFDPSLTQRDSFHLDEQFTVPVEMMQARTYPLRWFLLEQPEIQVAHFPFKNNMSFVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WRNKFDPSLTQRDSFHLDEQFTVPVEMMQARTYPLRWFLLEQPEIQVAHFPFKNNMSFVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 LVPTHFEWNVSQVLANLSWDTLHPPLVWERPTKVRLPKLYLKHQMDLVATLSQLGLQELF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LVPTHFEWNVSQVLANLSWDTLHPPLVWERPTKVRLPKLYLKHQMDLVATLSQLGLQELF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 QAPDLRGISEQSLVVSGVQHQSTLELSEVGVEAAAATSIAMSRMSLSSFSVNRPFLFFIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QAPDLRGISEQSLVVSGVQHQSTLELSEVGVEAAAATSIAMSRMSLSSFSVNRPFLFFIF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 EDTTGLPLFVGSVRNPNPSAPRELKEQQDSPGNKDFLQSLKGFPRGDKLFGPDLKLVPPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EDTTGLPLFVGSVRNPNPSAPRELKEQQDSPGNKDFLQSLKGFPRGDKLFGPDLKLVPPM
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB0 EEDYPQFGSPK
:::::::::::
CCDS11 EEDYPQFGSPK
490
>>CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 (427 aa)
initn: 2507 init1: 2507 opt: 2514 Z-score: 2801.6 bits: 527.6 E(32554): 1e-149
Smith-Waterman score: 2736; 86.6% identity (87.0% similar) in 491 aa overlap (1-491:1-427)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MALLWGLLVLSWSCLQGPCSVFSPVSAMEPLGRQLTSGPNQEQVSPLTLLKLGNQEPGGQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MALLWGLLVLSWSCLQGPCSVFSPVSAMEPLGRQLTSGPNQEQVSPLTLLKLGNQ-----
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 TALKSPPGVCSRDPTPEQTHRLARAMMAFTADLFSLVAQTSTCPNLILSPLSVALALSHL
..:
CCDS54 -----------------------------------------------VQP----------
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 ALGAQNHTLQRLQQVLHAGSGPCLPHLLSRLCQDLGPGAFRLAARMYLQKGFPIKEDFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 --GAQNHTLQRLQQVLHAGSGPCLPHLLSRLCQDLGPGAFRLAARMYLQKGFPIKEDFLE
60 70 80 90 100 110
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 QSEQLFGAKPVSLTGKQEDDLANINQWVKEATEGKIQEFLSGLPEDTVLLLLNAIHFQGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QSEQLFGAKPVSLTGKQEDDLANINQWVKEATEGKIQEFLSGLPEDTVLLLLNAIHFQGF
120 130 140 150 160 170
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 WRNKFDPSLTQRDSFHLDEQFTVPVEMMQARTYPLRWFLLEQPEIQVAHFPFKNNMSFVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 WRNKFDPSLTQRDSFHLDEQFTVPVEMMQARTYPLRWFLLEQPEIQVAHFPFKNNMSFVV
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 LVPTHFEWNVSQVLANLSWDTLHPPLVWERPTKVRLPKLYLKHQMDLVATLSQLGLQELF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LVPTHFEWNVSQVLANLSWDTLHPPLVWERPTKVRLPKLYLKHQMDLVATLSQLGLQELF
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 QAPDLRGISEQSLVVSGVQHQSTLELSEVGVEAAAATSIAMSRMSLSSFSVNRPFLFFIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QAPDLRGISEQSLVVSGVQHQSTLELSEVGVEAAAATSIAMSRMSLSSFSVNRPFLFFIF
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 EDTTGLPLFVGSVRNPNPSAPRELKEQQDSPGNKDFLQSLKGFPRGDKLFGPDLKLVPPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EDTTGLPLFVGSVRNPNPSAPRELKEQQDSPGNKDFLQSLKGFPRGDKLFGPDLKLVPPM
360 370 380 390 400 410
490
pF1KB0 EEDYPQFGSPK
:::::::::::
CCDS54 EEDYPQFGSPK
420
>>CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 (418 aa)
initn: 605 init1: 326 opt: 613 Z-score: 683.9 bits: 135.8 E(32554): 9e-32
Smith-Waterman score: 613; 29.2% identity (63.8% similar) in 414 aa overlap (31-436:10-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MALLWGLLVLSWSCLQGPCSVFSPVSAMEPLGRQLTSGPNQEQVSPLTLLKLGNQEPGGQ
.: : . :. .:: . :. .: .
CCDS11 MQALVLLLCIGALLGHSSCQNPASPP---EEGSPDPDST
10 20 30
70 80 90 100 110
pF1KB0 TALKSPPGVCSRDPTPE-QTHRLARAMMAFTADLFSLVAQTSTCPNLILSPLSVALALSH
:: : .:: . ...:: :. : ::. . ..:: :..::::::: :::
CCDS11 GAL-----VEEEDPFFKVPVNKLAAAVSNFGYDLYRVRSSTSPTTNVLLSPLSVATALSA
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB0 LALGAQNHTLQRLQQVLHAG--SGPCLPHLLSRLCQDL-GPGA-FRLAARMYLQKGFPIK
:.:::...: . ....:. :.: . ..: . . .: .. :.:. ..: . ::
CCDS11 LSLGAEQRTESIIHRALYYDLISSPDIHGTYKELLDTVTAPQKNLKSASRIVFEKKLRIK
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB0 EDFLEQSEQLFGAKPVSLTGKQEDDLANINQWVKEATEGKIQEFLSGLPEDTVLLLLNAI
.:. :. .:..: :::. . :: .::.::. .::. . . .:.. .:::..
CCDS11 SSFVAPLEKSYGTRPRVLTGNPRLDLQEINNWVQAQMKGKLARSTKEIPDEISILLLGVA
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 HFQGFWRNKFDPSLTQRDSFHLDEQFTVPVEMMQARTYPLRWFLLEQPEIQVAHFPFKNN
::.: : .::: :. ..:.:::. :: : ::. ::. : . ..:..:. ..
CCDS11 HFKGQWVTKFDSRKTSLEDFYLDEERTVRVPMMSDPKAVLRYGLDSDLSCKIAQLPLTGS
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 MSFVVLVPTHFEWNVSQVLANLSWDTLHPPLVWERPTKVRL--PKLYLKHQMDLVATLSQ
::.. ..: . :.. . .:. . .: . ... : ::: :... ... .:..
CCDS11 MSIIFFLPLKVTQNLTLIEESLTSEFIHDIDRELKTVQAVLTVPKLKLSYEGEVTKSLQE
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 LGLQELFQAPDLRGISEQSLVVSGVQHQSTLELSEVGVEAAAATSIAMSRMSLS-SFSVN
. :: ::..::. :. . . .. :.:.. .: .: :. .. . .. ..... .. .:
CCDS11 MKLQSLFDSPDFSKITGKPIKLTQVEHRAGFEWNEDGAGTTPSPGLQPAHLTFPLDYHLN
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 RPFLFFIFEDTTGLPLFVGSVRNPNPSAPRELKEQQDSPGNKDFLQSLKGFPRGDKLFGP
.::.: . . :: ::.:.. .:
CCDS11 QPFIFVLRDTDTGALLFIGKILDPRGP
400 410
>>CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 (500 aa)
initn: 482 init1: 172 opt: 612 Z-score: 681.6 bits: 135.6 E(32554): 1.2e-31
Smith-Waterman score: 612; 28.5% identity (65.4% similar) in 410 aa overlap (36-436:95-498)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 GLLVLSWSCLQGPCSVFSPVSAMEPLGRQLTSGPNQEQVSPLTLLKLGNQ-EPGGQTALK
:. :. . ..: : : . .: .
CCDS79 LPTTNSTTNSATKITANTTDEPTTQPTTEPTTQPTIQPTQPTTQLPTDSPTQPTTGSFCP
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 SPPGVCSRDPTPEQTHRLARAMMAFTADLF-SLVAQTSTCPNLILSPLSVALALSHLALG
.: .:: . :. :.. :. :. .. :. .. :. .::.:.: :... ::
CCDS79 GPVTLCSDLESHSTEAVLGDALVDFSLKLYHAFSAMKKVETNMAFSPFSIASLLTQVLLG
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 AQNHTLQRLQQVL-HAGSGPCLPHLLSRLCQDLGPGAFRLAARMYLQKGFPIKEDFLEQS
: ..: :...: . . :. . : . . . ..... . . :.. :.. :
CCDS79 AGENTKTNLESILSYPKDFTCVHQAL----KGFTTKGVTSVSQIFHSPDLAIRDTFVNAS
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 EQLFGAKPVSLTGKQEDDLANINQWVKEATEGKIQEFLSGLPEDTVLLLLNAIHFQGFWR
. :....: :..... .: :: :: . :..::...:..:: :: :.:::::.... :.
CCDS79 RTLYSSSPRVLSNNSDANLELINTWVAKNTNNKISRLLDSLPSDTRLVLLNAIYLSAKWK
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 NKFDPSLTQRDSFHLDEQFTVPVEMMQARTYPLRWFLLEQPEIQVAHFPFKNNMSFVVLV
. :::. :. . ::. .. .. : ::... ::. :. . . .:... ...:.:.:.::
CCDS79 TTFDPKKTRMEPFHFKNS-VIKVPMMNSKKYPVAHFIDQTLKAKVGQLQLSHNLSLVILV
310 320 330 340 350
310 320 330 340 350
pF1KB0 PT---HFEWNVSQVLANLSWDTLHPPLVWER--PTKVRLPKLYLKHQMDLVATLSQLGLQ
: : .. :.:. . .. : . :: . ::.. . ..:... . .: .
CCDS79 PQNLKHRLEDMEQALSPSVFKAIMEKLEMSKFQPTLLTLPRIKVTTSQDMLSIMEKLEFF
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 ELFQAPDLRGISEQ-SLVVSGVQHQSTLELSEVGVEAAAATSIAMSRMSLSSFSVNRPFL
.. .: :..:. .: ::..:::..:::.:.:::::::..:...: .: : :..:::
CCDS79 DFSYDLNLCGLTEDPDLQVSAMQHQTVLELTETGVEAAAASAISVAR-TLLVFEVQQPFL
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 FFIFEDTTGLPLFVGSVRNPNPSAPRELKEQQDSPGNKDFLQSLKGFPRGDKLFGPDLKL
: .... .:.:.: : .:
CCDS79 FVLWDQQHKFPVFMGRVYDPRA
480 490 500
>>CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 (414 aa)
initn: 273 init1: 172 opt: 479 Z-score: 534.7 bits: 108.2 E(32554): 1.8e-23
Smith-Waterman score: 479; 28.0% identity (62.7% similar) in 397 aa overlap (57-436:27-411)
30 40 50 60 70 80
pF1KB0 AMEPLGRQLTSGPNQEQVSPLTLLKLGNQEPGGQTALKSPPGVCSRDPTPEQTHRLARAM
: . ::. : .: . : :::
CCDS99 MNPTLGLAIFLAVLLTVKGLLKPSFSPRNYKALSEVQGWKQRMAAKE----LARQN
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130
pF1KB0 MAFTADLFSLVAQTSTCPNLILSPLSVALALSHLALGAQNHTLQRLQQV----------L
: . :.. .: . :..:::::.. :.: : ::::. ::....: :
CCDS99 MDLGFKLLKKLAFYNPGRNIFLSPLSISTAFSMLCLGAQDSTLDEIKQGFNFRKMPEKDL
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB0 HAGSGPCLPHLLSRLCQDLGPGAFRLAARMYLQKGFPIKEDFLEQSEQLFGAKPVSLTGK
: : . : :.. ::: . .. ..... . .. :::.......:. . ::.
CCDS99 HEGFHYII-HELTQKTQDL---KLSIGNTLFIDQRLQPQRKFLEDAKNFYSAETI-LTNF
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB0 QEDDLAN--INQWVKEATEGKIQEFLSGLPEDTVLLLLNAIHFQGFWRNKFDPSLTQRDS
:. ..:. ::..... :.:::.... .. ::.:: : : :.. :...:::..:....
CCDS99 QNLEMAQKQINDFISQKTHGKINNLIENIDPGTVMLLANYIFFRARWKHEFDPNVTKEED
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB0 FHLDEQFTVPVEMMQARTYPLRWFLLEQPEIQVAHFPFKNNMSFVVLVPTHFEWNVSQVL
: :... .: : :: :. . .. . ..:...:.. . ..: : .....
CCDS99 FFLEKNSSVKVPMM-FRSGIYQVGYDDKLSCTILEIPYQKNITAIFILPD--EGKLKHLE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]