FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0426, 845 aa
1>>>pF1KB0426 845 - 845 aa - 845 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.6790+/-0.000598; mu= 5.8909+/- 0.036
mean_var=453.3220+/-100.143, 0's: 0 Z-trim(115.7): 263 B-trim: 0 in 0/56
Lambda= 0.060238
statistics sampled from 26043 (26308) to 26043 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.658), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16
Scan time: 13.540
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005419 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav isofor ( 845) 5790 519.6 2.4e-146
XP_005259699 (OMIM: 164875) PREDICTED: proto-oncog ( 821) 5052 455.4 4.8e-127
NP_001245135 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav iso ( 823) 4385 397.4 1.4e-109
NP_001245136 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav iso ( 813) 4309 390.8 1.3e-107
NP_006104 (OMIM: 605541) guanine nucleotide exchan ( 847) 3428 314.3 1.5e-84
XP_016855543 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 783) 3155 290.5 2e-77
XP_016855544 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 751) 2816 261.0 1.4e-68
XP_005270417 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 753) 2810 260.5 2.1e-68
NP_003362 (OMIM: 600428) guanine nucleotide exchan ( 839) 2808 260.4 2.5e-68
XP_016870601 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 844) 2790 258.8 7.3e-68
XP_005272270 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 868) 2544 237.5 2e-61
XP_005270418 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 621) 2526 235.7 5e-61
XP_016870599 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 873) 2526 235.9 6e-61
XP_016855542 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 823) 2513 234.8 1.3e-60
NP_001127870 (OMIM: 600428) guanine nucleotide exc ( 878) 2510 234.5 1.6e-60
XP_016870598 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 891) 1858 177.9 1.8e-43
XP_016870600 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 867) 1840 176.3 5.3e-43
XP_016870597 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 896) 1840 176.3 5.4e-43
XP_016870602 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nuc ( 620) 1738 167.2 2.1e-40
XP_016855545 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nuc ( 407) 1462 142.9 2.8e-33
NP_001073343 (OMIM: 605541) guanine nucleotide exc ( 287) 924 95.9 2.7e-19
XP_005263745 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 393 50.1 2.8e-05
XP_005263746 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 393 50.1 2.8e-05
XP_011509578 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 393 50.1 2.8e-05
XP_011509579 (OMIM: 605216) PREDICTED: rho guanine ( 483) 393 50.1 2.8e-05
NP_001273723 (OMIM: 613324) spermatogenesis-associ ( 596) 357 47.2 0.00027
XP_011529194 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 456) 336 45.2 0.00084
NP_001166950 (OMIM: 300429,300607) rho guanine nuc ( 463) 336 45.2 0.00085
XP_016884862 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 414) 334 44.9 0.0009
NP_001166951 (OMIM: 300429,300607) rho guanine nuc ( 414) 334 44.9 0.0009
XP_016884869 (OMIM: 300429,300607) PREDICTED: rho ( 305) 307 42.4 0.0039
NP_065871 (OMIM: 606905) phosphatidylinositol 3,4, (1659) 321 44.7 0.0041
XP_006723397 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1327) 318 44.3 0.0043
XP_016882640 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1371) 318 44.3 0.0044
XP_016882639 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1374) 318 44.4 0.0044
NP_073746 (OMIM: 611893,616763) pleckstrin homolog (1386) 318 44.4 0.0044
XP_005259220 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1386) 318 44.4 0.0044
XP_011525534 (OMIM: 611893,616763) PREDICTED: plec (1387) 318 44.4 0.0044
NP_079446 (OMIM: 612139) phosphatidylinositol 3,4, ( 979) 304 42.9 0.0086
XP_011515914 (OMIM: 612139) PREDICTED: phosphatidy (1157) 304 43.0 0.0094
>>NP_005419 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav isoform 1 (845 aa)
initn: 5790 init1: 5790 opt: 5790 Z-score: 2748.3 bits: 519.6 E(85289): 2.4e-146
Smith-Waterman score: 5790; 100.0% identity (100.0% similar) in 845 aa overlap (1-845:1-845)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
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pF1KB0 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVH
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670 680 690 700 710 720
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
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pF1KB0 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
790 800 810 820 830 840
pF1KB0 YSEYC
:::::
NP_005 YSEYC
>>XP_005259699 (OMIM: 164875) PREDICTED: proto-oncogene (821 aa)
initn: 5052 init1: 5052 opt: 5052 Z-score: 2401.8 bits: 455.4 E(85289): 4.8e-127
Smith-Waterman score: 5052; 100.0% identity (100.0% similar) in 739 aa overlap (1-739:1-739)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
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pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GPPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
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:::::::::::::::::::
XP_005 MTAEGLYRITEKKAFRGLTWEAQSILAQPKPAMTSAPETDQSCRSRRVTSSRSLTRRDSK
730 740 750 760 770 780
>>NP_001245135 (OMIM: 164875) proto-oncogene vav isoform (823 aa)
initn: 4422 init1: 4384 opt: 4385 Z-score: 2088.6 bits: 397.4 E(85289): 1.4e-109
Smith-Waterman score: 5569; 97.4% identity (97.4% similar) in 845 aa overlap (1-845:1-823)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
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70 80 90 100 110 120
pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
70 80 90 100 110 120
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pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKM
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pF1KB0 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQ
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pF1KB0 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEG---------------------
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NP_001 -PPQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRPAVGS
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NP_001 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
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NP_001 YSEYC
820
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NP_001 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
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NP_001 TKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEED
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pF1KB0 YSEYC
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NP_001 YSEYC
810
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.: . :: : : : ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.::: ... .:::
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: .:...: ....:..... . . :::::::.::::...::.::: :::: . :: ..
NP_006 IPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISK
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..:::..::::::.:::::.:::::::.:::::::::::::::::::: . :: ::.::
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::::.:::: ::::::::::::.: .::::::::.: . .:::. :::..::......:
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..:. ::.: :...:::.::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. ::
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.: :.. ::..:::::.::::::.::: :. : .: :::.: .: ..::::.::::::::
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::::: : .: : ::::::::: ::: .. ::.: . . . . :. . :::::
NP_006 FYQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKM
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NP_006 QVIRNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKP
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pF1KB0 YVHGP-PQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVK
: : : : . :::: ::: ::. : :: ..:.:::.:.:...:.::::::: :.:
NP_006 CPCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAK
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pF1KB0 HIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP
::::.: .:...:.:.. :..: ::::.:...:::. :..::::::::.::::. . .:
NP_006 HIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRG
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pF1KB0 -----AVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGW
.. : : .: : ::::::::: :::: .::..:: .: . .::::::. :::::
NP_006 NRAGNSLLSPKVLGIAIARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGW
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840
pF1KB0 FPANYVEEDYSEYC
::..:::::
NP_006 FPSTYVEEDE
840
>>XP_016855543 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nucleot (783 aa)
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pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
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XP_016 MEPWKQCAQWLIHCKVLPTNHRVTWDSAQVFDLAQTLRDGVLLCQLLNNLRAHSINLKEI
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pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
:::::::::::::::::::..::: ::...::::::::::::.:::::: ::: :: :::
XP_016 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLTACCETFGMRKSELFEAFDLFDVRDFGKVIETLSRLSRTPI
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pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMR
: :: :::::: :..:::::.:: : ::.: ::..::::::: .:. :: :.:::::.
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pF1KB0 SEPVSMPPKMTEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFIN
.: . .: : : : : ::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.::: ... .:::
XP_016 AEEAHQP-KCPENDIRSCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFIN
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pF1KB0 IEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAA
: .:...: ....:..... . . :::::::.::::...::.::: :::: . :: ..
XP_016 IPELVKLHRNLMQEIHDSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISK
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pF1KB0 AREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLA
..:::..::::::.:::::.:::::::.:::::::::::::::::::: . :: ::.::
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pF1KB0 LDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSK
::::.:::: ::::::::::::.: .::::::::.: . .:::. :::..::......:
XP_016 LDAMKDLAQYVNEVKRDNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTK
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pF1KB0 MDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGA
..:. ::.: :...:::.::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. ::
XP_016 QERHIFLFDLAVIVCKRKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQ
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pF1KB0 QGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGT
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XP_016 FYQGYLCFKCGARAHKECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKM
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.:...: : ::: :: :.:. :: ::: :..:.. .:.::: ...:.:.:: . :::
XP_016 QVIRNYSGTPPPALHEGPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKP
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pF1KB0 YVHGP-PQDLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVK
: : : : . :::: ::: ::. : :: ..:.:::.:.:...:.::::::: :.:
XP_016 CPCVPKPVDYSCQPWYAGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAK
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pF1KB0 HIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP
::::.: .:...:.:.. :..: ::::.:...:::. :..::::::::.::::. . .:
XP_016 HIKILTRDGFFHIAENRKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRG
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pF1KB0 AVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANY
XP_016 NRAGNS
780
>>XP_016855544 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nucleot (751 aa)
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pF1KB0 TFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPIAQNRGIMPFPTEEESV
::: ::: :: :::: :: :::::: :.
XP_016 MMMRMMTMTTKVIETLSRLSRTPIALATGIRPFPTEE-SI
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pF1KB0 GDEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRSEPVSMPPKMTEYDKR
.:::::.:: : ::.: ::..::::::: .:. :: :.:::::..: . .: : : : :
XP_016 NDEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMKAEEAHQP-KCPENDIR
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pF1KB0 CCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINIEDLLRVHTHFLKEMK
::: ::.:::::::.:: ::...:. ::.::: ... .:::: .:...: ....:..
XP_016 SCCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFINIPELVKLHRNLMQEIH
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pF1KB0 EALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAAREDVQMKLEECSQRA
... . . :::::::.::::...::.::: :::: . :: .. ..:::..::::::.::
XP_016 DSIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISKTKEDVKLKLEECSKRA
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pF1KB0 NNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLALDAMRDLAQCVNEVKR
:::.:::::::.:::::::::::::::::::: . :: ::.::::::.:::: ::::::
XP_016 NNGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLALDAMKDLAQYVNEVKR
220 230 240 250 260 270
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pF1KB0 DNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKMDRYAFLLDKALLICK
::::::.: .::::::::.: . .:::. :::..::......:..:. ::.: :...::
XP_016 DNETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTKQERHIFLFDLAVIVCK
280 290 300 310 320 330
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pF1KB0 RRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQGYELFFKTRELKKKW
:.::.:..:....:..... .. . :..:::::. : ::. :: .: :.. ::..:::::
XP_016 RKGDNYEMKEIIDLQQYKIANNPTTDKENKKWSYGFYLIHTQGQNGLEFYCKTKDLKKKW
340 350 360 370 380 390
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pF1KB0 MEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTFYQGYRCHRCRASAHK
.::::::.::: :. : .: :::.: .: ..::::.::::::::::::: : .: : :::
XP_016 LEQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGTFYQGYLCFKCGARAHK
400 410 420 430 440 450
560 570 580 590 600 610
pF1KB0 ECLGRVPPCGRHGQDFPGTMK--KDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVFQEYYGLPPPPGAI
:::::: ::: .. ::.: . . . . :. . :::::.:...: : :::
XP_016 ECLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQVIRNYSGTPPPALHE
460 470 480 490 500 510
620 630 640 650 660 670
pF1KB0 GPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVHGP-PQDLSVHLWY
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XP_016 GPPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPCPCVPKPVDYSCQPWY
520 530 540 550 560 570
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pF1KB0 AGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEK
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XP_016 AGAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIKILTRDGFFHIAEN
580 590 600 610 620 630
740 750 760 770 780
pF1KB0 KAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP-----AVGSTKYFGTA
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XP_016 RKFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGNRAGNSLLSPKVLGIA
640 650 660 670 680 690
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pF1KB0 KARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEEDYSEYC
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XP_016 IARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWFPSTYVEEDE
700 710 720 730 740 750
>>XP_005270417 (OMIM: 605541) PREDICTED: guanine nucleot (753 aa)
initn: 2545 init1: 1630 opt: 2810 Z-score: 1349.2 bits: 260.5 E(85289): 2.1e-68
Smith-Waterman score: 2810; 55.9% identity (80.9% similar) in 742 aa overlap (108-840:14-752)
80 90 100 110 120 130
pF1KB0 FLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPIAQNRGIMPFPTEEESVG
:: ::: :: :::: :: :::::: :..
XP_005 MQLPDCPCRAHLPVIETLSRLSRTPIALATGIRPFPTEE-SIN
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140 150 160 170 180 190
pF1KB0 DEDIYSGLSDQIDDT-VEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRSEPVSMPPKMTEYDKRC
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XP_005 DEDIYKGLPDLIDETLVEDEEDLYDCVYGED-EGGEVYEDLMKAEEAHQP-KCPENDIRS
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pF1KB0 CCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFINIEDLLRVHTHFLKEMKE
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XP_005 CCLAEIKQTEEKYTETLESIEKYFMAPLKRFLTAAEFDSVFINIPELVKLHRNLMQEIHD
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pF1KB0 ALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVAAAREDVQMKLEECSQRAN
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XP_005 SIVNKNDQNLYQVFINYKERLVIYGQYCSGVESAISSLDYISKTKEDVKLKLEECSKRAN
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pF1KB0 NGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRLALDAMRDLAQCVNEVKRD
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XP_005 NGKFTLRDLLVVPMQRVLKYHLLLQELVKHTTDPTEKANLKLALDAMKDLAQYVNEVKRD
230 240 250 260 270 280
380 390 400 410 420 430
pF1KB0 NETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRSKMDRYAFLLDKALLICKR
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XP_005 NETLREIKQFQLSIENLNQPVLLFGRPQGDGEIRITTLDKHTKQERHIFLFDLAVIVCKR
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pF1KB0 RGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQGAQGYELFFKTRELKKKWM
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pF1KB0 EQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRGTFYQGYRCHRCRASAHKE
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XP_005 EQFEMALSNIRPDYADSNFHDFKMHTFTRVTSCKVCQMLLRGTFYQGYLCFKCGARAHKE
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pF1KB0 CLGRVPPCGRHGQDFPGTMK--KDKLHRRAQDKKRNELGLPKMEVFQEYYGLPPPPGAIG
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XP_005 CLGRVDNCGRVNSGEQGTLKLPEKRTNGLRRTPKQVDPGLPKMQVIRNYSGTPPPALHEG
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pF1KB0 PFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPYVHGP-PQDLSVHLWYA
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XP_005 PPLQLQAGDTVELLKGDAHSLFWQGRNLASGEVGFFPSDAVKPCPCVPKPVDYSCQPWYA
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pF1KB0 GPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAISIKYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEKK
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XP_005 GAMERLQAETELINRVNSTYLVRHRTKESGEYAISIKYNNEAKHIKILTRDGFFHIAENR
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pF1KB0 AFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEPEKRTISRP-----AVGSTKYFGTAK
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XP_005 KFKSLMELVEYYKHHSLKEGFRTLDTTLQFPYKEPEHSAGQRGNRAGNSLLSPKVLGIAI
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pF1KB0 ARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNKKGQQGWWRGEIYGRVGWFPANYVEEDYSEYC
::::::::: :::: .::..:: .: . .::::::. :::::::..:::::
XP_005 ARYDFCARDMRELSLLKGDVVKIYTKMSANGWWRGEVNGRVGWFPSTYVEEDE
710 720 730 740 750
>>NP_003362 (OMIM: 600428) guanine nucleotide exchange f (839 aa)
initn: 2737 init1: 1235 opt: 2808 Z-score: 1347.8 bits: 260.4 E(85289): 2.5e-68
Smith-Waterman score: 2995; 52.0% identity (78.5% similar) in 856 aa overlap (1-840:1-836)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
:: :::: .:::.:.::::.:::.: .: : .:::::::::::::::.:: : .:.:...
NP_003 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
10 20 30 40 50 60
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pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
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NP_003 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
70 80 90 100 110 120
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pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
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NP_003 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSL-EELADEHDLGEDIYDCVPCEDG-GDDIYEDIIKV
130 140 150 160 170
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pF1KB0 EPVSMPPKM--TEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDIEIIFI
: :..: :: :: ::: ::: :::.:: :: :: .:......::. :.: :. .::
NP_003 E-VQQPMKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADMAAVFI
180 190 200 210 220 230
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pF1KB0 NIEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKHLDRVA
:.:::..:: ::. . .. . :...: .::. .:::.:.::.:::..: :.. :...
NP_003 NLEDLIKVHHSFLRAIDVSVMV-GGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNTLNQLL
240 250 260 270 280 290
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pF1KB0 AAREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEKENLRL
:.::: ..:.:::. ....:.: :.:::.:::::::::::::.::..:. : :...:.
NP_003 ASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPERQQLKE
300 310 320 330 340 350
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pF1KB0 ALDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITSVERRS
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NP_003 ALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRSIVNHT
360 370 380 390 400 410
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pF1KB0 KMDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLLIEDQG
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NP_003 KQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKWSYGFYLIHLQG
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pF1KB0 AQGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQMLLRG
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NP_003 KQGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKACKMFLRG
480 490 500 510 520 530
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pF1KB0 TFYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELGLPKME
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NP_003 TFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTS---PADL----------DASGAGPG-PKMV
540 550 560 570 580
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pF1KB0 VFQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCNRVKPY
..:.:.: : ::: : : .. ::..:: ... :. ::::: ..: . :.:: . :::
NP_003 AMQNYHGNPAPPGK--PVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSSSVKPC
590 600 610 620 630 640
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pF1KB0 -VHG------PPQ---DLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAAEFAIS
: : ::. : ... :.:: ::: ....: ....::.:.:.: .: .::::
NP_003 PVDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAERFAIS
650 660 670 680 690 700
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pF1KB0 IKYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQFPFKEP
::.: ::::::.. .. .::: : : .: ::::.:: .:::. ::.:::::..:.:
NP_003 IKFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKYPYKSR
710 720 730 740 750 760
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pF1KB0 EK---RTISRPAVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNK-KGQQGWWRGE
:. :. :: : . . .::: :::.: ::: ::::.:::...: .. :.::::.::
NP_003 ERSASRASSRSPVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQGWWKGE
770 780 790 800 810 820
830 840
pF1KB0 IYGRVGWFPANYVEEDYSEYC
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NP_003 TNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
830
>>XP_016870601 (OMIM: 600428) PREDICTED: guanine nucleot (844 aa)
initn: 2663 init1: 1235 opt: 2790 Z-score: 1339.3 bits: 258.8 E(85289): 7.3e-68
Smith-Waterman score: 2977; 51.7% identity (78.0% similar) in 861 aa overlap (1-840:1-841)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MELWRQCTHWLIQCRVLPPSHRVTWDGAQVCELAQALRDGVLLCQLLNNLLPHAINLREV
:: :::: .:::.:.::::.:::.: .: : .:::::::::::::::.:: : .:.:...
XP_016 MEQWRQCGRWLIDCKVLPPNHRVVWPSAVVFDLAQALRDGVLLCQLLHNLSPGSIDLKDI
10 20 30 40 50 60
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pF1KB0 NLRPQMSQFLCLKNIRTFLSTCCEKFGLKRSELFEAFDLFDVQDFGKVIYTLSALSWTPI
:.:::::::::::::::::..: .::::. ::::. ::::::.:::::: ..: :: :
XP_016 NFRPQMSQFLCLKNIRTFLKVCHDKFGLRNSELFDPFDLFDVRDFGKVISAVSRLSLHSI
70 80 90 100 110 120
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pF1KB0 AQNRGIMPFPTEEESVGDEDIYSGLSDQIDDTVEEDEDLYDCVENEEAEGDEIYEDLMRS
:::.:: :::.:: . .:.:.: .: ... : . ::.:::: :.. ::.::::...
XP_016 AQNKGIRPFPSEETTENDDDVYRSL-EELADEHDLGEDIYDCVPCEDG-GDDIYEDIIKV
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KB0 EPVSMP-----PKM--TEYDKRCCCLREIQQTEEKYTDTLGSIQQHFLKPLQRFLKPQDI
: :..: :: :: ::: ::: :::.:: :: :: .:......::. :.: :.
XP_016 E-VQQPMIRYMQKMGMTEDDKRNCCLLEIQETEAKYYRTLEDIEKNYMSPLRLVLSPADM
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pF1KB0 EIIFINIEDLLRVHTHFLKEMKEALGTPGAANLYQVFIKYKERFLVYGRYCSQVESASKH
.:::.:::..:: ::. . .. . :...: .::. .:::.:.::.:::..: :..
XP_016 AAVFINLEDLIKVHHSFLRAIDVSVMV-GGSTLAKVFLDFKERLLIYGEYCSHMEHAQNT
240 250 260 270 280 290
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pF1KB0 LDRVAAAREDVQMKLEECSQRANNGRFTLRDLLMVPMQRVLKYHLLLQELVKHTQEAMEK
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XP_016 LNQLLASREDFRQKVEECTLKVQDGKFKLQDLLVVPMQRVLKYHLLLKELLSHSAERPER
300 310 320 330 340 350
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pF1KB0 ENLRLALDAMRDLAQCVNEVKRDNETLRQITNFQLSIENLDQSLAHYGRPKIDGELKITS
..:. ::.::.:::. .::::::.::::.:..:: :::::. .: ..::::::::::. :
XP_016 QQLKEALEAMQDLAMYINEVKRDKETLRKISEFQSSIENLQVKLEEFGRPKIDGELKVRS
360 370 380 390 400 410
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pF1KB0 VERRSKMDRYAFLLDKALLICKRRGDSYDLKDFVNLHSFQVRDDSSGDRDNKKWSHMFLL
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XP_016 IVNHTKQDRYLFLFDKVVIVCKRKGYSYELKEIIELLFHKMTDDPMNNKDVKKWSYGFYL
420 430 440 450 460 470
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pF1KB0 IEDQGAQGYELFFKTRELKKKWMEQFEMAISNIYPENATANGHDFQMFSFEETTSCKACQ
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XP_016 IHLQGKQGFQFFCKTEDMKRKWMEQFEMAMSNIKPDKANANHHSFQMYTFDKTTNCKACK
480 490 500 510 520 530
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pF1KB0 MLLRGTFYQGYRCHRCRASAHKECLGRVPPCGRHGQDFPGTMKKDKLHRRAQDKKRNELG
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XP_016 MFLRGTFYQGYMCTKCGVGAHKECLEVIPPCKFTS---PADL----------DASGAGPG
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pF1KB0 LPKMEVFQEYYGLPPPPGAIGPFLRLNPGDIVELTKAEAEQNWWEGRNTSTNEIGWFPCN
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XP_016 -PKMVAMQNYHGNPAPPGK--PVLTFQTGDVLELLRGDPESPWWEGRLVQTRKSGYFPSS
590 600 610 620 630 640
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pF1KB0 RVKPY-VHG------PPQ---DLSVHLWYAGPMERAGAESILANRSDGTFLVRQRVKDAA
::: : : ::. : ... :.:: ::: ....: ....::.:.:.: .:
XP_016 SVKPCPVDGRPPISRPPSREIDYTAYPWFAGNMERQQTDNLLKSHASGTYLIRERPAEAE
650 660 670 680 690 700
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pF1KB0 EFAISIKYNVEVKHIKIMTAEGLYRITEKKAFRGLTELVEFYQQNSLKDCFKSLDTTLQF
.::::::.: ::::::.. .. .::: : : .: ::::.:: .:::. ::.:::::..
XP_016 RFAISIKFNDEVKHIKVVEKDNWIHITEAKKFDSLLELVEYYQCHSLKESFKQLDTTLKY
710 720 730 740 750 760
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pF1KB0 PFKEPEK---RTISRPAVGSTKYFGTAKARYDFCARDRSELSLKEGDIIKILNK-KGQQG
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XP_016 PYKSRERSASRASSRSPVFTPRVIGTAVARYNFAARDMRELSLREGDVVRIYSRIGGDQG
770 780 790 800 810 820
820 830 840
pF1KB0 WWRGEIYGRVGWFPANYVEEDYSEYC
::.:: ::.::::..::::.
XP_016 WWKGETNGRIGWFPSTYVEEEGIQ
830 840
845 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 13:29:11 2016 done: Sun Nov 6 13:29:13 2016
Total Scan time: 13.540 Total Display time: 0.320
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]