Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB0412
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0412, 824 aa
1>>>pF1KB0412 824 - 824 aa - 824 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6410+/-0.00102; mu= 9.7647+/- 0.062
mean_var=125.5922+/-24.590, 0's: 0 Z-trim(107.9): 64 B-trim: 13 in 1/51
Lambda= 0.114444
statistics sampled from 9785 (9849) to 9785 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 5448 911.4 0
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 834 149.4 1.1e-35
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 825 147.9 3.2e-35
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 798 143.5 7.1e-34
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 782 140.8 4.6e-33
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 776 139.9 9.1e-33
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 679 123.9 6.7e-28
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 673 122.9 1.3e-27
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 653 119.5 9.9e-27
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 643 117.9 3.3e-26
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 620 114.1 5.7e-25
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 613 113.1 2e-24
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 603 111.3 3.8e-24
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 603 111.3 3.8e-24
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 602 111.2 5.8e-24
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 597 110.3 7.5e-24
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 581 107.6 3.9e-23
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 579 107.3 6e-23
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 553 103.1 1.2e-21
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 552 103.0 2e-21
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 552 103.0 2e-21
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 548 102.3 2.7e-21
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 545 101.8 5.2e-21
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 545 101.8 5.2e-21
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 526 98.7 3.8e-20
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 526 98.7 4.1e-20
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 522 98.0 5.4e-20
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 510 96.0 2.1e-19
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 510 96.0 2.1e-19
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 502 94.8 8.2e-19
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 502 94.8 8.2e-19
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 487 92.2 2.7e-18
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 487 92.2 3.2e-18
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 487 92.2 3.3e-18
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 487 92.2 3.3e-18
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 487 92.3 3.9e-18
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 480 91.1 9.3e-18
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 478 90.7 9.5e-18
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 471 89.6 1.8e-17
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 437 84.0 9.4e-16
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 432 83.1 1.6e-15
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 432 83.1 1.7e-15
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 432 83.1 1.7e-15
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 379 74.4 6.6e-13
CCDS8656.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 406) 352 69.8 1e-11
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 352 69.9 1.2e-11
>>CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 (824 aa)
initn: 5448 init1: 5448 opt: 5448 Z-score: 4866.2 bits: 911.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5448; 99.8% identity (99.8% similar) in 824 aa overlap (1-824:1-824)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAAFEASGALAAVATAMPAEHVAVQVPAPEPTPGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MAAAFEASGALAAVATAMPAEHVAVQVPAPEPTPGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 PADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAIPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 PADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAIPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 LDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 CHIAVGSPGRIKQLIELDYLNPGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 CHIAVGSPGRIKQLIELDYLNPGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQML
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 AVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSDPSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 AVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSDPSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 QELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 QELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 RVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDWETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 RVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDWETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEEN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 MMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGLMEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGLMEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 RTLQIQKAHGDHMASSRNNSVSGLSVKSKNNTKQKLPVKSHSECGIIEKATSPKELGCDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 RTLQIQKAHGDHMASSRNNSVSGLSVKSKNNTKQKLPVKSHSECGIIEKATSPKELGCDR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 QSEEQMKNSVQTPVENSTNSQHQVKEALPVSLPQIPCLSSFKIHQPYTLTFAELVEDYEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 QSEEQMKNSVQTPVENSTNSQHQVKEALPVSLPQIPCLSSFKIHQPYTLTFAELVEDYEH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 YIKEGLEKPVEIIRHYTGPGDQTVNPQNGFVRNKVTEQRVPVLASSSQSGDSESDSDSYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS84 YIKEGLEKPVEIIRHYTGPGDQTVNPQNGFVRNKVIEQRVPVLASSSQSGDSESDSDSYS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 SRTSSQSKGNKSYLEGSSDNQLKDSESTPVDDRISLEQPPNGSDTPNPEKYQESPGIQMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 SRTSSQSKGNKSYLEGSSDNQLKDSESTPVDDRISLEQPPNGSDTPNPEKYQESPGIQMK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 TRLKEGASQRAKQSRRNLPRRSSFRLQTGAQEDDWYDCHREIRLSFSDTYQDYEEYWRAY
:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 TRLKEGASQRAKQSRRNLPRRSSFRLQTEAQEDDWYDCHREIRLSFSDTYQDYEEYWRAY
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820
pF1KB0 YRAWQEYYAAASHSYYWNAQRHPSWMAAYHMNTIYLQEMMHSNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 YRAWQEYYAAASHSYYWNAQRHPSWMAAYHMNTIYLQEMMHSNQ
790 800 810 820
>>CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 (407 aa)
initn: 640 init1: 270 opt: 834 Z-score: 753.8 bits: 149.4 E(32554): 1.1e-35
Smith-Waterman score: 835; 38.7% identity (70.3% similar) in 364 aa overlap (63-424:34-386)
40 50 60 70 80 90
pF1KB0 TPGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKA
.:... :.. .:.:. : :::.:: .: .:
CCDS32 GSADYNREHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLKESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRA
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KB0 IPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVITA
: : :.:.::.:::::: .:. :..: .: :: :.::::::.: ::..:: :
CCDS32 IIPCIKGYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQLEIEFKETQALVLAPTRELAQQIQKVILA
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KB0 IGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKKC--HIAVGSPGRIKQLIELDYLNPGSIRLFIL
.: : : ::. :::: . .. .:. ::.::.:::. .... ::.: :..:.:
CCDS32 LGDYM-GATCHACIGGTNVRNEMQKLQAEAPHIVVGTPGRVFDMLNRRYLSPKWIKMFVL
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 DEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSD
::::..: .: :..:: :...: .: :.. .:::.: . .. :.:::: . ... .
CCDS32 DEADEMLSRG-FKDQIYEIFQKLNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEE
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 PSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILS
.: :.::.: :. : : . : .:. . ..::..: : . ... :.. .
CCDS32 LTLEGIKQFYINVERE-------EWKLDTLCDLYETLTITQAVIFLNTRRKVDWLTEKMH
250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 SKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDW
.. : . . :.:.:..: : ... ::::.::: .::::...:.::.: :.: .
CCDS32 ARDFTVSALHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNR
300 310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KB0 ETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGLMEECVD
:.:.:::::.:::: :..... ::.. ..:
CCDS32 ENYIHRIGRGGRFGRKGVAINFVT--EEDKRILRDIETFYNTTVEEMPMNVADLI
360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KB0 WDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIERTLQIQKAHGDHMASSRNNSVSGLSVKSKN
>>CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 (406 aa)
initn: 460 init1: 264 opt: 825 Z-score: 745.8 bits: 147.9 E(32554): 3.2e-35
Smith-Waterman score: 826; 37.6% identity (69.3% similar) in 378 aa overlap (64-437:34-399)
40 50 60 70 80 90
pF1KB0 PGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAI
:... ::. .:.:. : :::.:: .: .::
CCDS11 SQDSRSRDNGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KB0 -PLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVITA
: . : :.:.::.:::::: .:. :... :. .:: :.::::::.: ::..:. :
CCDS11 LPCIK-GYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMA
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KB0 IGIKMEGLECHVFIGGTPLSQD--KTRLKKCHIAVGSPGRIKQLIELDYLNPGSIRLFIL
.: : : ::. :::: . . : ... :: ::.:::. .... ::.: :..:.:
CCDS11 LGDYM-GASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVL
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 DEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSD
::::..: .: :..:: :...: .. :.. .:::.: . .. :.:::: . ... .
CCDS11 DEADEMLSRG-FKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEE
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 PSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILS
.: :..:.: :. : : . : .:. . ..::..: : . ... :.. .
CCDS11 LTLEGIRQFYINVERE-------EWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMH
250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 SKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDW
.. : . . :.:.:..: : ... ::::.::: .::::...:.::.: :.: .
CCDS11 ARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLARGIDVQQVSLVINYDLPTNR
300 310 320 330 340 350
400 410 420 430 440
pF1KB0 ETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMR-IAQKCNINLLPLPDPIPSGLMEECV
:.:.:::::.:::: :..... ::.. .: : : .. .:
CCDS11 ENYIHRIGRGGRFGRKGVAINMVT--EEDKRTLRDIETFYNTSIEEMPLNVADLI
360 370 380 390 400
450 460 470 480 490 500
pF1KB0 DWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIERTLQIQKAHGDHMASSRNNSVSGLSVKSK
>>CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 (411 aa)
initn: 515 init1: 332 opt: 798 Z-score: 721.6 bits: 143.5 E(32554): 7.1e-34
Smith-Waterman score: 804; 34.2% identity (68.6% similar) in 401 aa overlap (38-437:16-404)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 SGALAAVATAMPAEHVAVQVPAPEPTPGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAEPADFESL
:.:. .:... . .:.. . . :. :...
CCDS11 MATTATMATSGSARKRLLKE-EDMTKVEFETSEEVDVTPT-FDTM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 LLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAIPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLE
: . .:.:. : :::.:: .: .:: : :.:.:..:::::: .:: .:. : ..
CCDS11 GLREDLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAIKQIIKGRDVIAQSQSGTGKTATFSISVLQCLDIQ
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 NLSTQILILAPTREIAVQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKKC-HIAVG
:: ::::::::.::::.. . :.: :. ..::. :::: ...: .: :...:
CCDS11 VRETQALILAPTRELAVQIQKGLLALGDYMN-VQCHACIGGTNVGEDIRKLDYGQHVVAG
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 SPGRIKQLIELDYLNPGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATY
.:::. ..:. : .:....:::::..:..: :.::: .: :: . :.. .:::
CCDS11 TPGRVFDMIRRRSLRTRAIKMLVLDEADEMLNKG-FKEQIYDVYRYLPPATQVVLISATL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 PEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSDPSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSR
:. . . .:.: :: . .. .. .: :.::.. .:. : : . : .:..
CCDS11 PHEILEMTNKFMTDPIRILVKRDELTLEGIKQFFVAVERE-------EWKFDTLCDLYDT
230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 IPFNQALVFSNLHSRAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLIST
. ..::..: : . ... :.. . .: . . :.: :..: . : ... ::::::
CCDS11 LTITQAVIFCNTKRKVDWLTEKMREANFTVSSMHGDMPQKERESIMKEFRSGASRVLIST
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 DLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDWETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIA
:. .::.:. .:.:..: :.: . : :.:::::.::.: :..... .... .. :
CCDS11 DVWARGLDVPQVSLIINYDLPNNRELYIHRIGRSGRYGRKGVAINFV-KNDDIRILRDIE
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 QKCNINLLPLPDPIPSGLMEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIERTLQIQ
: . .. .:
CCDS11 QYYSTQIDEMPMNVADLI
400 410
>>CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 (428 aa)
initn: 793 init1: 366 opt: 782 Z-score: 707.1 bits: 140.8 E(32554): 4.6e-33
Smith-Waterman score: 782; 35.2% identity (66.8% similar) in 398 aa overlap (54-447:37-426)
30 40 50 60 70 80
pF1KB0 AVQVPAPEPTPGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFE
:. . . . :...::. .:... :::
CCDS46 DNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKKDVKGSYVSIHSSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFE
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KB0 RPSPVQLKAIPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIA
.:: :: . :: . :.:.. ::::: ::: :: .:..: . ....:.. :::.:
CCDS46 HPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLATLQQLEPVTGQVSVLVMCHTRELA
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KB0 VQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKK-C-HIAVGSPGRIKQLIELDYLN
:: . .. : ... ::.:: ...:. ::: : ::.::.:::: : . ::
CCDS46 FQISKEYERFSKYMPNVKVAVFFGGLSIKKDEEVLKKNCPHIVVGTPGRILALARNKSLN
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KB0 PGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDP
:. ::::: ::.::. ....... :. : ::.. ::: . . . :.:.::
CCDS46 LKHIKHFILDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRMTPHEKQVMMFSATLSKEIRPVCRKFMQDP
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 TFVRLNSSDP-SLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHS
. ... .: ::.::: ... .::...: .:.. . :::...: . .
CCDS46 MEIFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKD--------NEKNRKLFDLLDVLEFNQVVIFVKSVQ
250 260 270 280 290
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 RAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNL
: ::..: ..::: : .: :..::. . ..: :. :.:..:.: .::.: :.::.
CCDS46 RCIALAQLLVEQNFPAIAIHRGMPQEERLSRYQQFKDFQRRILVATNLFGRGMDIERVNI
300 310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KB0 VVNLDVPLDWETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPI
. : :.: : .::.::..::::::: ::..:. .. ... . .. ..:. ::: :
CCDS46 AFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDENDAKILNDVQDRFEVNISELPDEI
360 370 380 390 400 410
450 460 470 480 490
pF1KB0 P-SGLMEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIERTLQIQKAHGDHMASSRNN
:. .:.
CCDS46 DISSYIEQTR
420
>>CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 (427 aa)
initn: 775 init1: 370 opt: 776 Z-score: 701.7 bits: 139.9 E(32554): 9.1e-33
Smith-Waterman score: 783; 34.1% identity (65.6% similar) in 419 aa overlap (26-440:20-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MAAAFEASGALAAVATAMPAEHVAVQVPAPEPTPGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAE
:.: : ::.: . .:.. :. . .
CCDS12 MAEQDVENDLLDYDEEEEPQAPQ-ESTPAPPK-----KDIK------GSYVSIH
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 PADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAIPLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIA
. :...::. .:... :::.:: :: . :: . :.:.. ::::: ::: :: .
CCDS12 SSGFRDFLLKPELLRAIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAKSGMGKTAVFVLAT
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 LDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKK
:... : .. .:.. :::.: :: . .. : ... ::.:: ...:. :::
CCDS12 LQQIEPVNGQVTVLVMCHTRELAFQISKEYERFSKYMPSVKVSVFFGGLSIKKDEEVLKK
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB0 -C-HIAVGSPGRIKQLIELDYLNPGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQ
: :..::.:::: :.. .. ... :.::: ::.::. ....... :. : ::
CCDS12 NCPHVVVGTPGRILALVRNRSFSLKNVKHFVLDECDKMLEQLDMRRDVQEIFRLTPHEKQ
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB0 MLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSDP-SLIGLKQYY-KVVNSYPLAHKVFEEK
. ::: . . . :.:.:: : ... .: ::.::: :. .: ::
CCDS12 CMMFSATLSKDIRPVCRKFMQDPMEVFVDDETKLTLHGLQQYYVKLKDS---------EK
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB0 TQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLK
...: .:.. . :::...: . .: . ::..: ..::: : .: :..::. . ..:
CCDS12 NRKLFDLLDVLEFNQVIIFVKSVQRCMALAQLLVEQNFPAIAIHRGMAQEERLSRYQQFK
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB0 HFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDWETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRG
:. :.:..:.: .::.: :.::.: : :.: : .::.::..::::::: ::..:.
CCDS12 DFQRRILVATNLFGRGMDIERVNIVFNYDMPEDSDTYLHRVARAGRFGTKGLAITFVSDE
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB0 EEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGLMEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQI
.. ... . .. ..:. ::. :
CCDS12 NDAKILNDVQDRFEVNVAELPEEIDISTYIEQSR
400 410 420
>>CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 (479 aa)
initn: 644 init1: 215 opt: 679 Z-score: 614.4 bits: 123.9 E(32554): 6.7e-28
Smith-Waterman score: 679; 34.3% identity (64.6% similar) in 376 aa overlap (64-430:94-460)
40 50 60 70 80 90
pF1KB0 PGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAI
:: : :. .:.:. : ::.::: .: .:.
CCDS10 KLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKSFEELRLKPQLLQGVYAMGFNRPSKIQENAL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB0 PL--GRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVIT
:: .. .::.:..:::::: .: :... : : : :.:: :.:.: .::
CCDS10 PLMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSQVEPANKYPQCLCLSPTYELALQTGKVIE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB0 AIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKKCHIAVGSPGRIKQLI-ELDYLNPGSIRLFIL
.: . :. . :. : . . .... .:..:.:: . . .: ...: .:..:.:
CCDS10 QMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQ-KISE-QIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVFVL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 DEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSD
:::: .. . :.: : :: . ::: :::. . . . : . ::. ..:. .
CCDS10 DEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNVIKLKREE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 PSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILS
.: .:::: . .: .:: : : .:.. : . ::..: . .. :. :: ::
CCDS10 ETLDTIKQYYVLCSSR-------DEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELS
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 SKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDW
..: . .::.: .:: .. .... . .::..:.. .::::.:.:..:.:.:.:.:
CCDS10 KEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KB0 ------ETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGL
:::.:::::.:::: ::.:.. . :.. :: .. :
CCDS10 DGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKIERLDTDDLDEI
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB0 MEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIERTLQIQKAHGDHMASSRNNSVSGL
CCDS10 EKIAN
>>CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 (478 aa)
initn: 636 init1: 215 opt: 673 Z-score: 609.1 bits: 122.9 E(32554): 1.3e-27
Smith-Waterman score: 673; 34.0% identity (64.4% similar) in 376 aa overlap (64-430:93-459)
40 50 60 70 80 90
pF1KB0 PGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAI
:: : :. .:.:. : ::.::: .: .:.
CCDS10 KLIRSNLVDNTNQVEVLQRDPNSPLYSVKSFEELRLKPQLLQGVYAMGFNRPSKIQENAL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB0 P--LGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVIT
: :.. .::.:..:::::: .: :. . . : : :.:: :.:.: .::
CCDS10 PMMLAEPPQNLIAQSQSGTGKTAAFVLAMLSRVEPSDRYPQCLCLSPTYELALQTGKVIE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB0 AIGIKMEGLECHVFIGGTPLSQDKTRLKKCHIAVGSPGRIKQLI-ELDYLNPGSIRLFIL
.: . :. . :. : . . .... .:..:.:: . . .: ...: .:..:.:
CCDS10 QMGKFYPELKLAYAVRGNKLERGQ-KISE-QIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVFVL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 DEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSD
:::: .. . :.: : :: . ::: :::. . . . : . ::. ..:. .
CCDS10 DEADVMIATQGHQDQSIRIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNVIKLKREE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 PSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILS
.: .:::: . .: .:: : : .:.. : . ::..: . .. :. :: ::
CCDS10 ETLDTIKQYYVLCSSR-------DEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELS
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 SKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDW
..: . .::.: .:: .. .... . .::..:.. .::::.:.:..:.:.:.:.:
CCDS10 KEGHQVALLSGEMMVEQRAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDK
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KB0 ------ETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGL
:::.:::::.:::: ::.:.. . :.. :: .. :
CCDS10 DGNPDNETYLHRIGRTGRFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKIERLDTDDLDEI
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB0 MEECVDWDVEVKAAVHTYGIASVPNQPLKKQIQKIERTLQIQKAHGDHMASSRNNSVSGL
CCDS10 EKIAN
>>CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 (347 aa)
initn: 294 init1: 264 opt: 653 Z-score: 593.4 bits: 119.5 E(32554): 9.9e-27
Smith-Waterman score: 653; 36.7% identity (68.8% similar) in 311 aa overlap (64-371:34-334)
40 50 60 70 80 90
pF1KB0 PGPVRILRTAQDLSSPRTRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAI
:... ::. .:.:. : :::.:: .: .::
CCDS58 SQDSRSRDNGPDGMEPEGVIESNWNEIVDSFDDMNLSESLLRGIYAYGFEKPSAIQQRAI
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KB0 -PLGRCGLDLIVQAKSGTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVITA
: . : :.:.::.:::::: .:. :... :. .:: :.::::::.: ::..:. :
CCDS58 LPCIK-GYDVIAQAQSGTGKTATFAISILQQIELDLKATQALVLAPTRELAQQIQKVVMA
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KB0 IGIKMEGLECHVFIGGTPLSQD--KTRLKKCHIAVGSPGRIKQLIELDYLNPGSIRLFIL
.: : : ::. :::: . . : ... :: ::.:::. .... ::.: :..:.:
CCDS58 LGDYM-GASCHACIGGTNVRAEVQKLQMEAPHIIVGTPGRVFDMLNRRYLSPKYIKMFVL
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KB0 DEADKLLEEGSFQEQINWIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSD
::::..: .: :..:: :...: .. :.. .:::.: . .. :.:::: . ... .
CCDS58 DEADEMLSRG-FKDQIYDIFQKLNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKKFMRDPIRILVKKEE
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KB0 PSLIGLKQYYKVVNSYPLAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILS
.: :..:.: :. : : . : .:. . ..::..: : . ... :.. .
CCDS58 LTLEGIRQFYINVERE-------EWKLDTLCDLYETLTITQAVIFINTRRKVDWLTEKMH
250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KB0 SKGFPAECISGNMNQNQRLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDW
.. : . . :.:.:..: : ... ::::.::: ..
CCDS58 ARDFTVSAMHGDMDQKERDVIMREFRSGSSRVLITTDLLGKLYPQNRSRWTVWP
300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KB0 ETYMHRIGRAGRFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGLMEECVD
>>CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 (370 aa)
initn: 608 init1: 215 opt: 643 Z-score: 584.0 bits: 117.9 E(32554): 3.3e-26
Smith-Waterman score: 643; 34.0% identity (64.6% similar) in 359 aa overlap (81-430:2-351)
60 70 80 90 100
pF1KB0 TRTGDVLLAEPADFESLLLSRPVLEGLRAAGFERPSPVQLKAIPL--GRCGLDLIVQAKS
::.::: .: .:.:: .. .::.:..:
CCDS42 MGFNRPSKIQENALPLMLAEPPQNLIAQSQS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB0 GTGKTCVFSTIALDSLVLENLSTQILILAPTREIAVQIHSVITAIGIKMEGLECHVFIGG
::::: .: :... : : : :.:: :.:.: .:: .: . :. . :
CCDS42 GTGKTAAFVLAMLSQVEPANKYPQCLCLSPTYELALQTGKVIEQMGKFYPELKLAYAVRG
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB0 TPLSQDKTRLKKCHIAVGSPGRIKQLI-ELDYLNPGSIRLFILDEADKLLEEGSFQEQIN
. : . . .... .:..:.:: . . .: ...: .:..:.::::: .. . :.:
CCDS42 NKLERGQ-KISE-QIVIGTPGTVLDWCSKLKFIDPKKIKVFVLDEADVMIATQGHQDQSI
100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KB0 WIYSSLPASKQMLAVSATYPEFLANALTKYMRDPTFVRLNSSDPSLIGLKQYYKVVNSYP
: :: . ::: :::. . . . : . ::. ..:. . .: .:::: . .:
CCDS42 RIQRMLPRNCQMLLFSATFEDSVWKFAQKVVPDPNVIKLKREEETLDTIKQYYVLCSSR-
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KB0 LAHKVFEEKTQHLQELFSRIPFNQALVFSNLHSRAQHLADILSSKGFPAECISGNMNQNQ
.:: : : .:.. : . ::..: . .. :. :: ::..: . .::.: .:
CCDS42 ------DEKFQALCNLYGAITIAQAMIFCHTRKTASWLAAELSKEGHQVALLSGEMMVEQ
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KB0 RLDAMAKLKHFHCRVLISTDLTSRGIDAEKVNLVVNLDVPLDW------ETYMHRIGRAG
: .. .... . .::..:.. .::::.:.:..:.:.:.:.: :::.:::::.:
CCDS42 RAAVIERFREGKEKVLVTTNVCARGIDVEQVSVVINFDLPVDKDGNPDNETYLHRIGRTG
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KB0 RFGTLGLTVTYCCRGEEENMMMRIAQKCNINLLPLPDPIPSGLMEECVDWDVEVKAAVHT
::: ::.:.. . :.. :: .. :
CCDS42 RFGKRGLAVNMVDSKHSMNILNRIQEHFNKKIERLDTDDLDEIEKIAN
330 340 350 360 370
824 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 18:51:43 2016 done: Mon Nov 7 18:51:44 2016
Total Scan time: 3.120 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]