Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB0406
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB0406, 809 aa
1>>>pF1KB0406 809 - 809 aa - 809 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9407+/-0.000965; mu= 18.3356+/- 0.058
mean_var=100.0695+/-19.455, 0's: 0 Z-trim(106.6): 86 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.128210
statistics sampled from 8987 (9076) to 8987 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.279), width: 16
Scan time: 2.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4648.1 PGBD1 gene_id:84547|Hs108|chr6 ( 809) 5523 1032.8 0
CCDS31128.1 PGBD2 gene_id:267002|Hs108|chr1 ( 592) 1784 341.1 3.2e-93
CCDS7230.1 PGBD3 gene_id:267004|Hs108|chr10 ( 593) 1134 220.9 5e-57
CCDS60529.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1061) 1134 221.1 7.8e-57
CCDS31129.1 PGBD2 gene_id:267002|Hs108|chr1 ( 341) 1087 212.0 1.4e-54
CCDS34698.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 563) 617 125.2 2.9e-28
CCDS69349.1 ZKSCAN1 gene_id:7586|Hs108|chr7 ( 527) 581 118.6 2.8e-26
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 559 114.5 5.1e-25
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 535 110.2 1.4e-23
CCDS34355.1 ZBED9 gene_id:114821|Hs108|chr6 (1325) 537 110.7 1.6e-23
CCDS4644.1 ZSCAN16 gene_id:80345|Hs108|chr6 ( 348) 509 105.1 2.1e-22
CCDS5667.1 ZKSCAN5 gene_id:23660|Hs108|chr7 ( 839) 510 105.6 3.6e-22
CCDS2714.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 276) 501 103.5 4.9e-22
CCDS10499.1 ZNF263 gene_id:10127|Hs108|chr16 ( 683) 502 104.0 8.6e-22
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 504 104.6 9.1e-22
CCDS4649.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 ( 406) 497 102.9 1.1e-21
CCDS32814.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 275) 486 100.8 3.4e-21
CCDS47393.1 ZSCAN23 gene_id:222696|Hs108|chr6 ( 389) 484 100.5 5.6e-21
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 482 100.3 9.3e-21
CCDS33743.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 ( 267) 474 98.5 1.5e-20
CCDS4643.1 ZNF165 gene_id:7718|Hs108|chr6 ( 485) 459 96.0 1.6e-19
CCDS4650.1 ZKSCAN3 gene_id:80317|Hs108|chr6 ( 538) 452 94.7 4.4e-19
CCDS77175.1 ZNF24 gene_id:7572|Hs108|chr18 ( 193) 443 92.7 6.3e-19
CCDS4647.1 ZKSCAN4 gene_id:387032|Hs108|chr6 ( 545) 449 94.2 6.5e-19
CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 ( 494) 445 93.4 1e-18
CCDS11912.1 ZNF24 gene_id:7572|Hs108|chr18 ( 368) 443 92.9 1e-18
CCDS11068.1 ZNF232 gene_id:7775|Hs108|chr17 ( 444) 437 91.9 2.6e-18
CCDS82043.1 ZNF232 gene_id:7775|Hs108|chr17 ( 435) 428 90.2 8.1e-18
CCDS10504.1 ZNF174 gene_id:7727|Hs108|chr16 ( 407) 425 89.6 1.1e-17
CCDS10495.1 ZNF213 gene_id:7760|Hs108|chr16 ( 459) 423 89.3 1.6e-17
CCDS32380.1 ZNF174 gene_id:7727|Hs108|chr16 ( 234) 411 86.8 4.4e-17
CCDS78119.1 ZSCAN26 gene_id:7741|Hs108|chr6 ( 478) 407 86.3 1.3e-16
CCDS82246.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18 ( 210) 398 84.4 2.2e-16
CCDS8443.1 ZNF202 gene_id:7753|Hs108|chr11 ( 648) 403 85.7 2.7e-16
CCDS59427.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 ( 290) 398 84.5 2.8e-16
CCDS5666.1 ZNF394 gene_id:84124|Hs108|chr7 ( 561) 399 84.9 4e-16
CCDS41300.1 ZSCAN20 gene_id:7579|Hs108|chr1 (1043) 402 85.7 4.4e-16
CCDS11913.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18 ( 333) 394 83.8 5.1e-16
CCDS82247.1 ZNF396 gene_id:252884|Hs108|chr18 ( 335) 394 83.8 5.2e-16
CCDS12988.1 MZF1 gene_id:7593|Hs108|chr19 ( 734) 398 84.8 5.6e-16
CCDS4646.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 ( 394) 390 83.1 9.8e-16
CCDS66921.1 ZSCAN32 gene_id:54925|Hs108|chr16 ( 697) 391 83.5 1.3e-15
CCDS1631.1 ZNF496 gene_id:84838|Hs108|chr1 ( 587) 388 82.9 1.7e-15
CCDS56407.1 ZSCAN9 gene_id:7746|Hs108|chr6 ( 445) 386 82.4 1.8e-15
CCDS5681.1 ZSCAN21 gene_id:7589|Hs108|chr7 ( 473) 385 82.3 2.1e-15
CCDS32410.1 ZKSCAN2 gene_id:342357|Hs108|chr16 ( 967) 387 82.9 2.8e-15
CCDS10095.2 ZSCAN29 gene_id:146050|Hs108|chr15 ( 852) 386 82.7 2.9e-15
CCDS12975.1 ZSCAN22 gene_id:342945|Hs108|chr19 ( 491) 382 81.7 3.2e-15
CCDS76814.1 ZNF500 gene_id:26048|Hs108|chr16 ( 441) 368 79.1 1.8e-14
CCDS76957.1 ZNF18 gene_id:7566|Hs108|chr17 ( 548) 369 79.4 1.9e-14
>>CCDS4648.1 PGBD1 gene_id:84547|Hs108|chr6 (809 aa)
initn: 5523 init1: 5523 opt: 5523 Z-score: 5522.9 bits: 1032.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5523; 100.0% identity (100.0% similar) in 809 aa overlap (1-809:1-809)
10 20 30 40 50 60
pF1KB0 MYEALPGPAPENEDGLVKVKEEDPTWEQVCNSQEGSSHTQEICRLRFRHFCYQEAHGPQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MYEALPGPAPENEDGLVKVKEEDPTWEQVCNSQEGSSHTQEICRLRFRHFCYQEAHGPQE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB0 ALAQLRELCHQWLRPEMHTKEQIMELLVLEQFLTILPKELQPCVKTYPLESGEEAVTVLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ALAQLRELCHQWLRPEMHTKEQIMELLVLEQFLTILPKELQPCVKTYPLESGEEAVTVLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB0 NLETGSGDTGQQASVYIQGQDMHPMVAEYQGVSLECQSLQLLPGITTLKCEPPQRPQGNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NLETGSGDTGQQASVYIQGQDMHPMVAEYQGVSLECQSLQLLPGITTLKCEPPQRPQGNP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB0 QEVSGPVPHGSAHLQEKNPRDKAVVPVFNPVRSQTLVKTEEETAQAVAAEKWSHLSLTRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QEVSGPVPHGSAHLQEKNPRDKAVVPVFNPVRSQTLVKTEEETAQAVAAEKWSHLSLTRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB0 NLCGNSAQETVMSLSPMTEEIVTKDRLFKAKQETSEEMEQSGEASGKPNRECAPQIPCST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NLCGNSAQETVMSLSPMTEEIVTKDRLFKAKQETSEEMEQSGEASGKPNRECAPQIPCST
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB0 PIATERTVAHLNTLKDRHPGDLWARMHISSLEYAAGDITRKGRKKDKARVSELLQGLSFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PIATERTVAHLNTLKDRHPGDLWARMHISSLEYAAGDITRKGRKKDKARVSELLQGLSFS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB0 GDSDVEKDNEPEIQPAQKKLKVSCFPEKSWTKRDIKPNFPSWSALDSGLLNLKSEKLNPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GDSDVEKDNEPEIQPAQKKLKVSCFPEKSWTKRDIKPNFPSWSALDSGLLNLKSEKLNPV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 ELFELFFDDETFNLIVNETNNYASQKNVSLEVTVQEMRCVFGVLLLSGFMRHPRREMYWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ELFELFFDDETFNLIVNETNNYASQKNVSLEVTVQEMRCVFGVLLLSGFMRHPRREMYWE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 VSDTDQNLVRDAIRRDRFELIFSNLHFADNGHLDQKDKFTKLRPLIKQMNKNFLLYAPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VSDTDQNLVRDAIRRDRFELIFSNLHFADNGHLDQKDKFTKLRPLIKQMNKNFLLYAPLE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 EYYCFDKSMCECFDSDQFLNGKPIRIGYKIWCGTTTQGYLVWFEPYQEESTMKVDEDPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EYYCFDKSMCECFDSDQFLNGKPIRIGYKIWCGTTTQGYLVWFEPYQEESTMKVDEDPDL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 GLGGNLVMNFADVLLERGQYPYHLCFDSFFTSVKLLSALKKKGVRATGTIRENRTEKCPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GLGGNLVMNFADVLLERGQYPYHLCFDSFFTSVKLLSALKKKGVRATGTIRENRTEKCPL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 MNVEHMKKMKRGYFDFRIEENNEIILCRWYGDGIISLCSNAVGIEPVNEVSCCDADNEEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MNVEHMKKMKRGYFDFRIEENNEIILCRWYGDGIISLCSNAVGIEPVNEVSCCDADNEEI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 PQISQPSIVKVYDECKEGVAKMDQIISKYRVRIRSKKWYSILVSYMIDVAMNNAWQLHRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PQISQPSIVKVYDECKEGVAKMDQIISKYRVRIRSKKWYSILVSYMIDVAMNNAWQLHRA
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KB0 CNPGASLDPLDFRRFVAHFYLEHNAHLSD
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 CNPGASLDPLDFRRFVAHFYLEHNAHLSD
790 800
>>CCDS31128.1 PGBD2 gene_id:267002|Hs108|chr1 (592 aa)
initn: 1584 init1: 815 opt: 1784 Z-score: 1787.1 bits: 341.1 E(32554): 3.2e-93
Smith-Waterman score: 1784; 51.6% identity (78.3% similar) in 516 aa overlap (300-805:16-529)
270 280 290 300 310 320
pF1KB0 AKQETSEEMEQSGEASGKPNRECAPQIPCSTPIATERTVAHLNTLKDRHPGDLWARMHIS
. . . . . ::...... .. .. :.
CCDS31 MASTSRDVIAGRGIHSKVKSAKLLEVLNAMEEEESNNNREEIFIA
10 20 30 40
330 340 350 360 370 380
pF1KB0 SLEYAAGDITRKGR-KKDKARVSEL----LQGLSFSGDSDVEKDNEP-EIQPAQKKLKVS
. :::..: . .:. : ..: :.. . :: . .::. :.:::.:. :.
CCDS31 PPDNAAGEFTDEDSGDEDSQRGAHLPGSVLHASVLCEDSGTGEDNDDLELQPAKKRQKAV
50 60 70 80 90 100
390 400 410 420 430 440
pF1KB0 CFPEKSWTKRDIKPNFPSWSALDSGLLNLKSEKLNPVELFELFFDDETFNLIVNETNNYA
:.. ::::::.:.: ::.: : . .:::..:.:: :::::::. :.:.:::::: ::
CCDS31 VKPQRIWTKRDIRPDFGSWTASDPHIEDLKSQELSPVGLFELFFDEGTINFIVNETNRYA
110 120 130 140 150 160
450 460 470 480 490 500
pF1KB0 SQKNVSLEVTVQEMRCVFGVLLLSGFMRHPRREMYWEVS-DTDQNLVRDAIRRDRFELIF
::::.: .:.::..::.:.:.:::.. .:::.:.::.: :. ..:: ::::::::::::
CCDS31 WQKNVNLSLTAQELKCVLGILILSGYISYPRRRMFWETSPDSHHHLVADAIRRDRFELIF
170 180 190 200 210 220
510 520 530 540 550
pF1KB0 SNLHFADNGHLDQKDKFTKLRPLIKQMNKNFLLYAPLEEYYCFDKSMCECFD---SDQFL
: ::::::..:: .:.:.:.:::: .:: :: .:::::.: : .:::: : : :.
CCDS31 SYLHFADNNELDASDRFAKVRPLIIRMNCNFQKHAPLEEFYSFGESMCEYFGHRGSKQLH
230 240 250 260 270 280
560 570 580 590 600 610
pF1KB0 NGKPIRIGYKIWCGTTTQGYLVWFEPYQEESTMKVDEDPDLGLGGNLVMNFADVLLERGQ
:::.:.:::::::::..:::::::: : .:. . : .: :::..:..:.:.: :::
CCDS31 RGKPVRLGYKIWCGTTSRGYLVWFEPSQ--GTLFTKPDRSLDLGGSMVIKFVDALQERGF
290 300 310 320 330 340
620 630 640 650 660 670
pF1KB0 YPYHLCFDSFFTSVKLLSALKKKGVRATGTIRENRTEKCPLMNVEHMKKMKRGYFDFRIE
:::. ::. ::::::.: :.::::.::::.:: :::.::: . ...:::::: ::....
CCDS31 LPYHIFFDKVFTSVKLMSILRKKGVKATGTVREYRTERCPLKDPKELKKMKRGSFDYKVD
350 360 370 380 390 400
680 690 700 710 720 730
pF1KB0 ENNEIILCRWYGDGIISLCSNAVGIEPVNEVSCCDADNEEIPQISQPSIVKVYDECKEGV
:..:::.:::. ......:::::::::: .: .. . :. :::.::.:.: ::
CCDS31 ESEEIIVCRWHDSSVVNICSNAVGIEPVRLTSRHSGAAKTRTQVHQPSLVKLYQEKVGGV
410 420 430 440 450 460
740 750 760 770 780 790
pF1KB0 AKMDQIISKYRVRIRSKKWYSILVSYMIDVAMNNAWQLHRACNPGASLDPLDFRRFVAHF
..::: :.::.:.::. :::: ...:.::.:.:::::::: : :..: : :::..:
CCDS31 GRMDQNIAKYKVKIRGMKWYSSFIGYVIDAALNNAWQLHRICCQDAQVDLLAFRRYIACV
470 480 490 500 510 520
800
pF1KB0 YLEHNAHLSD
::: ::
CCDS31 YLESNADTTSQGRRSRRLETESRFDMIGHWIIHQDKRTRCALCHSQTNTRCEKCQKGVHA
530 540 550 560 570 580
>>CCDS7230.1 PGBD3 gene_id:267004|Hs108|chr10 (593 aa)
initn: 628 init1: 369 opt: 1134 Z-score: 1137.3 bits: 220.9 E(32554): 5e-57
Smith-Waterman score: 1135; 39.5% identity (69.6% similar) in 474 aa overlap (353-806:64-529)
330 340 350 360 370
pF1KB0 WARMHISSLEYAAGDITRKGRKKDKARVSELLQ-GLSFSGDSD----VEKDNEPE-----
:.: : . .::: . ::. :.
CCDS72 TAPVSDEESGDEEGGTINNLPGSLLHTAAYLIQDGSDAESDSDDPSYAPKDDSPDEVPST
40 50 60 70 80 90
380 390 400 410 420
pF1KB0 --IQ--PAQKKLKVSCFPEKSWTKRD--IKPNFPSWSALDSGLLNLKSEKLNPVELFELF
.: : ... :.. . : : : : ..: .: . .... .:.:..:::
CCDS72 FTVQQPPPSRRRKMTKILCK-WKKADLTVQPVAGRVTAPPNDFFTVMR---TPTEILELF
100 110 120 130 140
430 440 450 460 470 480
pF1KB0 FDDETFNLIVNETNNYASQKNVSLEVTVQEMRCVFGVLLLSGFMRHPRREMYWEV-SDTD
.:::...:::. .: :: .:.: : .: .:..: .:...:::.. :::.:.:: .:.
CCDS72 LDDEVIELIVKYSNLYACSKGVHLGLTSSEFKCFLGIIFLSGYVSVPRRRMFWEQRTDVH
150 160 170 180 190 200
490 500 510 520 530 540
pF1KB0 QNLVRDAIRRDRFELIFSNLHFADNGHLDQKDKFTKLRPLIKQMNKNFLLYAPLEEYYCF
. :: :.:::::: :::::: :::..:: :::.::::::...:. . ..: : :. :
CCDS72 NVLVSAAMRRDRFETIFSNLHVADNANLDPVDKFSKLRPLISKLNERCMKFVPNETYFSF
210 220 230 240 250 260
550 560 570 580 590 600
pF1KB0 DKSMCECFDSD---QFLNGKPIRIGYKIWCGTTTQGYLVWFEPYQEESTMKVDEDPDLGL
:. : : ::. :::::.:::.:::.: ::. ::.::: .. : . :.
CCDS72 DEFMVPYFGRHGCKQFIRGKPIRFGYKFWCGATCLGYICWFQPYQGKNPNTKHE--EYGV
270 280 290 300 310 320
610 620 630 640 650 660
pF1KB0 GGNLVMNFADVLLERGQYPYHLCFDSFFTSVKLLSALKKKGVRATGTIRENRTEKCPLMN
:..::..:...: : ::. :..::::. ::. :.. : .::::.:... .. :: .
CCDS72 GASLVLQFSEALTEAHPGQYHFVFNNFFTSIALLDKLSSMGHQATGTVRKDHIDRVPLES
330 340 350 360 370 380
670 680 690 700 710 720
pF1KB0 VEHMKKMKRGYFDFRIEENNEIILCRWYGDGIISLCSNAVGIEPVNEVSCCDADNEEIPQ
.:: .:: ::.::. ...:. ::: ...... :...::.:. :: . .. :
CCDS72 DVALKKKERGTFDYRIDGKGNIV-CRWNDNSVVTVASSGAGIHPLCLVSRYSQKLKKKIQ
390 400 410 420 430 440
730 740 750 760 770 780
pF1KB0 ISQPSIVKVYDECKEGVAKMDQIISKYRVRIRSKKWYSILVSYMIDVAMNNAWQLHRACN
..::...:::.. :: . :. :.:::. ::.::::: . . ......::::::.. .
CCDS72 VQQPNMIKVYNQFMGGVDRADENIDKYRASIRGKKWYSSPLLFCFELVLQNAWQLHKTYD
450 460 470 480 490 500
790 800
pF1KB0 PGASLDPLDFRRFVAHFYLEHNAHLSD
.: :.::: :. ::: ..:
CCDS72 E-KPVDFLEFRRRVVCHYLETHGHPPEPGQKGRPQKRNIDSRYDGINHVIVKQGKQTRCA
510 520 530 540 550 560
>>CCDS60529.1 ERCC6 gene_id:2074|Hs108|chr10 (1061 aa)
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10 20 30
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.. . : : : : ..: .: . .... .:.:..:::.:::...:::. .
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: :::::: :::..:: :::.::::::...:. . ..: : :. ::. : :
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pF1KB0 -QFLNGKPIRIGYKIWCGTTTQGYLVWFEPYQEESTMKVDEDPDLGLGGNLVMNFADVLL
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CCDS60 EAHPGQYHFVFNNFFTSIALLDKLSSMGHQATGTVRKDHIDRVPLESDVALKKKERGTFD
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pF1KB0 FRIEENNEIILCRWYGDGIISLCSNAVGIEPVNEVSCCDADNEEIPQISQPSIVKVYDEC
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CCDS60 YRIDGKGNIV-CRWNDNSVVTVASSGAGIHPLCLVSRYSQKLKKKIQVQQPNMIKVYNQF
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pF1KB0 KEGVAKMDQIISKYRVRIRSKKWYSILVSYMIDVAMNNAWQLHRACNPGASLDPLDFRRF
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800
pF1KB0 VAHFYLEHNAHLSD
:. ::: ..:
CCDS60 VVCHYLETHGHPPEPGQKGRPQKRNIDSRYDGINHVIVKQGKQTRCAECHKNTTFRCEKC
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CCDS31 KQLHRGKPVRLGYKIWCGTTSRGYLVWFEPSQ--GTLFTKPDRSLDLGGSMVIKFVDALQ
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CCDS31 ERGFLPYHIFFDKVFTSVKLMSILRKKGVKATGTVREYRTERCPLKDPKELKKMKRGSFD
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CCDS31 YKVDESEEIIVCRWHDSSVVNICSNAVGIEPVRLTSRHSGAAKTRTQVHQPSLVKLYQEK
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CCDS31 VGGVGRMDQNIAKYKVKIRGMKWYSSFIGYVIDAALNNAWQLHRICCQDAQVDLLAFRRY
210 220 230 240 250 260
800
pF1KB0 VAHFYLEHNAHLSD
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CCDS31 IACVYLESNADTTSQGRRSRRLETESRFDMIGHWIIHQDKRTRCALCHSQTNTRCEKCQK
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10 20 30 40
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.:::::::.::.:: .:::. ..: .: . :: . :. : .:..: :
CCDS34 PDSGEEAVTLLEDLELDL--SGQQVPGQVHGPEMLARGMVP-LDPVQ-ESSSFDLHHEAT
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CCDS34 QSHFKHSSRKPRLLQSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIED-MAVS
180 190 200 210 220 230
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. :.:. .:.:::: .. ::. : :. : .... .: ::::. . ::..:
CCDS34 LILEEWGCQNLARRNLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTG
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. ..:
CCDS34 RSQKEFGEKRDQEGKTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLG
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10 20 30 40 50 60
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CCDS69 MWGQDSTLQDTPPPDPEIFRQRFRRFCYQNTFGPRE
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CCDS69 DLELDL--SGQQVPGQVHGPEMLARGMVPLDPVQESSSFDLHHEATQSHFKHSSRKPRLL
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CCDS69 QSRALPAAHIPAPPHEGSPRDQAMASALFTADSQAMVKIED-MAVSLILEEWGCQNLARR
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:: .. ::. : :. : .... .: ::::. . ::..:. ..:
CCDS69 NLSRDNRQENYGSAFPQGGENRNENEESTSKAETSEDSASRGETTGRSQKEFGEKRDQEG
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CCDS69 KTGERQQKNPEEKTRKEKRDSGPAIGKDKKTITGERGPREKGKGLGRSFSLSSNFTTPEE
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: .::.. .::: ::: :.: . .:.. ::. :::::.. :
CCDS46 MAEESRKPSAPSPPDQTPEEDLVIVKV-EEDHGWDQESSLHESNPLGQEVFRLRFRQLRY
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CCDS46 QETLGPREALIQLRALCHQWLRPDLNTKEQILELLVLEQFLTILPEELQTLVKEHQLENG
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CCDS46 EEVVTLLEDLERQIDILGRPVSARVHGHRVLWEEVVHSASAPEPPNTQLQSEATQHKSPV
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CCDS46 PQESQ----ERAMSTSQSPTRSQKGSSGDQEMTATLLTAGFQTLEKIED-MAVSLIREEW
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:. ....:: .. :. .. . : ...: . .:: : .. ::...: :
CCDS46 L-LDPSQKDLCRDNRPENFRNMFSLGGETRSENRELASKQVISTGIQPHGETAAKCNGDV
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CCDS46 IRGLEHEEARDLLGRLERQRGNPTQERRHKCDECGKSFAQSSGLVRHWRIHTGEKPYQCN
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CCDS27 MTTAGRGNLGLIPRSTAFQKQEGRLTVKQEPANQTWGQGSSLQKNYPPVCEIFRLHFRQL
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CCDS27 CYHEMSGPQEALSRLRELCRWWLMPEVHTKEQILELLVLEQFLSILPGELRTWVQLHHPE
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CCDS27 SGEEAVAVVEDFQRHLSG--SEEVSAPAQKQEMHFEETTALGTTKESPPTSPLSGGSAPG
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. ::: . :.:. . ..::: : : :.: . :. :: : : :.
CCDS27 AHLEPPYDPGTHHLPSGDFAQCTSPVPTLP---QVGNSGDQAGATVLRMVRPQDTVAYED
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pF1KB0 ETAQAVAAEKWSHLSLTRRNLCGNSAQETVMSLSPMTEEIVTKDRLFKAKQETSEEMEQS
... . .::. :.:..: : : :. :.. .. : . : . ::: . :.:
CCDS27 LSVD-YTQKKWKSLTLSQRALQWNMMPENHHSMASLAGENMMKGSELTPKQEFFKGSESS
240 250 260 270 280 290
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pF1KB0 GEASGKPNRECAPQIPCSTPIATERTVAHLNTLKDRHPGDLWARMHISSLEYAAGDITRK
...::
CCDS27 NRTSGGLFGVVPGAAETGDVCEDTFKELEGQTSDEEGSRLENDFLEITDEDKKKSTKDRY
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>>CCDS34355.1 ZBED9 gene_id:114821|Hs108|chr6 (1325 aa)
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CCDS34 MEAVSRVFPALAGQAPEEQGEIIKVKVKEEDHTWDQESALRRNLSYTRELSRQRFRQFCY
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CCDS34 QETPGPREALSQLRELCRQWLNPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQSWVREHNPESG
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CCDS34 EEVVTLLEDLERELDEPRQQVSQGTYGQEVSMEEMIPLDSAKESLGTQLQSME-----DR
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CCDS34 MECESPEPHPLQDNGSFLWFSMMSQSMGGDNLSSLDTNEAEIEPENMREKFFRSLARLLE
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