Result of FASTA (omim) for
pFN21AA1588
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA1588, 595 aa
1>>>pF1KA1588 595 - 595 aa - 595 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0612+/-0.000743; mu= 18.2168+/- 0.046
mean_var=318.9384+/-62.211, 0's: 0 Z-trim(112.4): 2063 B-trim: 97 in 1/53
Lambda= 0.071816
statistics sampled from 18994 (21355) to 18994 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 7.630
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065984 (OMIM: 613864) zinc finger protein 317 i ( 595) 4220 452.6 1.7e-126
NP_001177720 (OMIM: 613864) zinc finger protein 31 ( 563) 3361 363.5 1e-99
NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 73 ( 536) 1548 175.7 3.6e-43
NP_062537 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 is ( 533) 1537 174.5 7.9e-43
XP_016875410 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 546) 1537 174.5 8e-43
NP_001243208 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 ( 566) 1537 174.6 8.1e-43
XP_016875409 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 575) 1537 174.6 8.1e-43
NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [ ( 642) 1527 173.6 1.8e-42
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1525 173.8 2.5e-42
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1525 173.8 2.5e-42
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1525 173.8 2.5e-42
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1525 173.8 2.5e-42
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1525 173.8 2.5e-42
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1518 172.7 3.3e-42
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1518 172.7 3.3e-42
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1518 172.7 3.3e-42
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1518 172.7 3.4e-42
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1518 172.7 3.4e-42
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1518 172.7 3.4e-42
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1518 172.7 3.4e-42
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1518 172.7 3.4e-42
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1518 172.7 3.4e-42
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1518 172.8 3.4e-42
NP_689690 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [ ( 499) 1513 172.0 4.3e-42
XP_016881830 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1513 172.0 4.3e-42
NP_001035939 (OMIM: 614275) zinc finger protein 56 ( 499) 1513 172.0 4.3e-42
XP_011524816 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1513 172.0 4.3e-42
XP_011524814 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1513 172.0 4.3e-42
NP_001269289 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 820) 1514 172.5 5e-42
NP_001317443 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 ( 513) 1511 171.8 5e-42
NP_001317442 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 ( 513) 1511 171.8 5e-42
XP_005266240 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 513) 1511 171.8 5e-42
XP_016875411 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 513) 1511 171.8 5e-42
XP_016875412 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger ( 513) 1511 171.8 5e-42
NP_001287880 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 (1159) 1508 172.1 8.9e-42
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1500 171.0 1.3e-41
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 1500 171.0 1.3e-41
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1500 171.0 1.3e-41
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1500 171.0 1.3e-41
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1500 171.0 1.3e-41
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1500 171.0 1.3e-41
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1500 171.0 1.3e-41
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1500 171.0 1.3e-41
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1500 171.0 1.3e-41
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1500 171.0 1.3e-41
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 1500 171.0 1.3e-41
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1500 171.0 1.3e-41
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1500 171.0 1.3e-41
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1500 171.0 1.3e-41
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 1500 171.0 1.3e-41
>>NP_065984 (OMIM: 613864) zinc finger protein 317 isofo (595 aa)
initn: 4220 init1: 4220 opt: 4220 Z-score: 2391.9 bits: 452.6 E(85289): 1.7e-126
Smith-Waterman score: 4220; 100.0% identity (100.0% similar) in 595 aa overlap (1-595:1-595)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAALSPTFATSTQDSTCLQDSEFPVSSKDHSCPQNLDLFVCSGLEPHTPSVGSQESVTFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MAALSPTFATSTQDSTCLQDSEFPVSSKDHSCPQNLDLFVCSGLEPHTPSVGSQESVTFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 DVAVDFTEKEWPLLDSSQRKLYKDVMLENYSNLTSLGYQVGKPSLISHLEQEEEPRTEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DVAVDFTEKEWPLLDSSQRKLYKDVMLENYSNLTSLGYQVGKPSLISHLEQEEEPRTEER
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GAHQGACADWETPSKTKWSLLMEDIFGKETPSGVTMERAGLGEKSTEYAHLFEVFGMDPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GAHQGACADWETPSKTKWSLLMEDIFGKETPSGVTMERAGLGEKSTEYAHLFEVFGMDPH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LTQPMGRHAGKRPYHRRDYGVAFKGRPHLTQHMSMYDGRKMHECHQCQKAFTTSASLTRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LTQPMGRHAGKRPYHRRDYGVAFKGRPHLTQHMSMYDGRKMHECHQCQKAFTTSASLTRH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 RRIHTGEKPYECSDCGKAFNDPSALRSHARTHLKEKPFDCSQCGNAFRTLSALKIHMRVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RRIHTGEKPYECSDCGKAFNDPSALRSHARTHLKEKPFDCSQCGNAFRTLSALKIHMRVH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TGERPYKCDQCGKAYGRSCHLIAHKRTHTGERPYECHDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TGERPYKCDQCGKAYGRSCHLIAHKRTHTGERPYECHDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 PYACTQCGKAFRWKSNFNLHKKNHMVEKTYECKECGKSFGDLVSRRKHMRIHIVKKPVEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 PYACTQCGKAFRWKSNFNLHKKNHMVEKTYECKECGKSFGDLVSRRKHMRIHIVKKPVEC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGEKPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERRYECAACG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 RQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGEKPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERRYECAACG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 KVFGDYLSRRRHMSVHLVKKRVECRQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 KVFGDYLSRRRHMSVHLVKKRVECRQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KA1 IGSNLNVHRRIHTGEKPYECLVCGKAFSDHSSLRSHVKTHRGEKLFVSSVWKRLQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 IGSNLNVHRRIHTGEKPYECLVCGKAFSDHSSLRSHVKTHRGEKLFVSSVWKRLQ
550 560 570 580 590
>>NP_001177720 (OMIM: 613864) zinc finger protein 317 is (563 aa)
initn: 3361 init1: 3361 opt: 3361 Z-score: 1911.1 bits: 363.5 E(85289): 1e-99
Smith-Waterman score: 3926; 94.6% identity (94.6% similar) in 595 aa overlap (1-595:1-563)
10 20 30 40 50 60
pF1KA1 MAALSPTFATSTQDSTCLQDSEFPVSSKDHSCPQNLDLFVCSGLEPHTPSVGSQESVTFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAALSPTFATSTQDSTCLQDSEFPVSSKDHSCPQNLDLFVCSGLEPHTPSVGSQESVTFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA1 DVAVDFTEKEWPLLDSSQRKLYKDVMLENYSNLTSLGYQVGKPSLISHLEQEEEPRTEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DVAVDFTEKEWPLLDSSQRKLYKDVMLENYSNLTSL------------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA1 GAHQGACADWETPSKTKWSLLMEDIFGKETPSGVTMERAGLGEKSTEYAHLFEVFGMDPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 --------DWETPSKTKWSLLMEDIFGKETPSGVTMERAGLGEKSTEYAHLFEVFGMDPH
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KA1 LTQPMGRHAGKRPYHRRDYGVAFKGRPHLTQHMSMYDGRKMHECHQCQKAFTTSASLTRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTQPMGRHAGKRPYHRRDYGVAFKGRPHLTQHMSMYDGRKMHECHQCQKAFTTSASLTRH
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KA1 RRIHTGEKPYECSDCGKAFNDPSALRSHARTHLKEKPFDCSQCGNAFRTLSALKIHMRVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRIHTGEKPYECSDCGKAFNDPSALRSHARTHLKEKPFDCSQCGNAFRTLSALKIHMRVH
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KA1 TGERPYKCDQCGKAYGRSCHLIAHKRTHTGERPYECHDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGERPYKCDQCGKAYGRSCHLIAHKRTHTGERPYECHDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEK
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KA1 PYACTQCGKAFRWKSNFNLHKKNHMVEKTYECKECGKSFGDLVSRRKHMRIHIVKKPVEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PYACTQCGKAFRWKSNFNLHKKNHMVEKTYECKECGKSFGDLVSRRKHMRIHIVKKPVEC
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KA1 RQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGEKPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERRYECAACG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGEKPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERRYECAACG
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KA1 KVFGDYLSRRRHMSVHLVKKRVECRQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVFGDYLSRRRHMSVHLVKKRVECRQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFS
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590
pF1KA1 IGSNLNVHRRIHTGEKPYECLVCGKAFSDHSSLRSHVKTHRGEKLFVSSVWKRLQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IGSNLNVHRRIHTGEKPYECLVCGKAFSDHSSLRSHVKTHRGEKLFVSSVWKRLQ
510 520 530 540 550 560
>>NP_001152765 (OMIM: 603984) zinc finger protein 737 [H (536 aa)
initn: 1365 init1: 1365 opt: 1548 Z-score: 896.1 bits: 175.7 E(85289): 3.6e-43
Smith-Waterman score: 1551; 43.8% identity (67.2% similar) in 537 aa overlap (59-585:6-536)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 DHSCPQNLDLFVCSGLEPHTPSVGSQESVTFQDVAVDFTEKEWPLLDSSQRKLYKDVMLE
:.:::..:. .:: ::..::.::..::::
NP_001 MGPLQFRDVAIEFSLEEWHCLDTAQRNLYRNVMLE
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 NYSNLTSLGYQVGKPSLISHLEQEEEPRTEERGAHQGACADWETPSKTKWSLLMEDIFGK
:: ::. :: :.::.::. ::: ..: : .. :. . : :. .: :. . :
NP_001 NYRNLVFLGIVVSKPDLITCLEQGKKPLTMKK--HEMVANPSVTCSHFARDLWPEQSI-K
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KA1 ETPSGVTMER-AGLGEKSTEYAHLFEVFGMDPHLTQPMGRHAGKRPYHRRDYGVAFKGRP
.. . ::..: . :. . .. . : ..: .. : . : : . :.
NP_001 DSFQKVTLRRYENYGHDNLQFKKGCE--SVDECKVHKRG-YNGLNQYLTTTQSKIFQCDK
100 110 120 130 140
210 220 230 240 250
pF1KA1 HL---------TQHMSMYDGRKMHECHQCQKAFTTSASLTRHRRIHTGEKPYECSDCGKA
.. ..: . :.: .: .: :::. :..:: :..:::::::..: .::::
NP_001 YVKVIHKFSNSNRHKIRHTGKKPFKCIECGKAFNQSSTLTTHKKIHTGEKPFKCEECGKA
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KA1 FNDPSALRSHARTHLKEKPFDCSQCGNAFRTLSALKIHMRVHTGERPYKCDQCGKAYGRS
:: : : .: : : :: . : .::.:: .: : : .:.::.::::..::::. ::
NP_001 FNWSSHLTTHKRIHTGEKRYKCEDCGKAFSRFSYLTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKRS
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KA1 CHLIAHKRTHTGERPYECHDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEKPYACTQCGKAFRWKSNFN
.: .:: ::::.::.:..:::::.. : : : :.::::: : .:::::. : ..
NP_001 SNLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFKRSSILTAHKIIHSGEKPYKCEECGKAFKHPSVLT
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KA1 LHKKNHMVEKTYECKECGKSFGDLVSRRKHMRIHIVKKPVECRQCGKTFRNQSILKTHMN
::. : :: :.:.:::..: . : : :: .:: .:..:::.: .: : ::
NP_001 THKRIHTGEKPYKCEECGRAFKYFSSLTTHKIIHSGEKPYKCEECGKAFNWSSHLTTHKR
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KA1 SHTGEKPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERRYECAACGKVFGDYLSRRRHMSVHLV
::::::: :. ::.::. ::.::.:. ::: .. ..: :::.: . : .:
NP_001 IHTGEKPYKCEECGEAFKYSSSLTTHKIIHTGQQPFKCEECGKAFKCFSILTTHKRIHTG
390 400 410 420 430 440
500 510 520 530 540 550
pF1KA1 KKRVECRQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFSIGSNLNVHRRIHTGEKPY
.: .:..::::: ..: : .: : :::::::.:..:::::. . :. :.:::::::::
NP_001 EKPYKCEECGKAFNSSSHLTAHKRIHTGEKPYKCERCGKAFKRSFILTRHKRIHTGEKPY
450 460 470 480 490 500
560 570 580 590
pF1KA1 ECLVCGKAFSDHSSLRSHVKTHRGEKLFVSSVWKRLQ
.: :::.:. :.: .: : ::::
NP_001 KCEECGKGFKCPSTLTTHKVIHTGEKL
510 520 530
>>NP_062537 (OMIM: 194537) zinc finger protein 26 isofor (533 aa)
initn: 4506 init1: 1265 opt: 1537 Z-score: 889.9 bits: 174.5 E(85289): 7.9e-43
Smith-Waterman score: 1537; 42.5% identity (70.5% similar) in 529 aa overlap (57-581:14-533)
30 40 50 60 70 80
pF1KA1 SKDHSCPQNLDLFVCSGLEPHTPSVGSQESVTFQDVAVDFTEKEWPLLDSSQRKLYKDVM
..:.:....:: :: ::::.:. ::.::.
NP_062 MATSFRTASCWGLLSFKDISMEFTWDEWQLLDSTQKYLYRDVI
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KA1 LENYSNLTSLGYQVGKPSLISHLEQEEEPRTEERGAHQGACAD-WETPSKTKWSLLMEDI
:::: :: :.::. ::.:: .::: :.: . . .: : :: ... . : :.:
NP_062 LENYHNLISVGYHGTKPDLIFKLEQGEDPWIINAKISRQSCPDGWEEWYQNNQDEL-ESI
50 60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
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... . .. : .:.. ... .:... : . ::: : .: : :.. :.
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: .:.. .:. .. .: : .: ::: ...: : ::::::.::::: : .::.
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: : .: :.: :::..::.: ..: : : .:...::: .:: :..:::::. . .:.
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:.:.::: .:::: .:::::. : . : :.::: ::. :..:::::: :: . .: .
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: :: :.:..:::.:. .. :. .: ..: .: .:::.: . : .:. .:.:
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::::::. ::::::..: :. ::. :: :: :::. : ..: . :. .: ..:
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:: .: ::. ...:. :...:.::::..:..:::::. :.:. :.:.::::::..:
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:::.: .:.:: : :::.
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: :: :.:..:::.:. .. :. .: ..: .: .:::.: . : .:. .:.:
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pF1KA1 CGKAFSDHSSLRSHVKTHRGEKLFVSSVWKRLQ
:::.: .:.:: : :::.
NP_001 CGKSFCWNSGLRIHRKTHK
550 560
>>XP_016875409 (OMIM: 194537) PREDICTED: zinc finger pro (575 aa)
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Smith-Waterman score: 1537; 42.5% identity (70.5% similar) in 529 aa overlap (57-581:56-575)
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pF1KA1 SKDHSCPQNLDLFVCSGLEPHTPSVGSQESVTFQDVAVDFTEKEWPLLDSSQRKLYKDVM
..:.:....:: :: ::::.:. ::.::.
XP_016 RSLLMSSSVKFGNLLGVPWAQGNSALPEGLLSFKDISMEFTWDEWQLLDSTQKYLYRDVI
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pF1KA1 LENYSNLTSLGYQVGKPSLISHLEQEEEPRTEERGAHQGACAD-WETPSKTKWSLLMEDI
:::: :: :.::. ::.:: .::: :.: . . .: : :: ... . : :.:
XP_016 LENYHNLISVGYHGTKPDLIFKLEQGEDPWIINAKISRQSCPDGWEEWYQNNQDEL-ESI
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pF1KA1 FGKETPSGVTMERAGLGE-KSTEYAHLFEVFGMDPHLTQPMGRHAGKRPYHRRDYGVAFK
... . .. : .:.. ... .:... : . ::: : .: : :.. :.
XP_016 --ERSYACSVLGRLNLSKTHDSSRQRLYNTRGKS--LTQ---NSAPSRSYLRKNPD-KFH
150 160 170 180 190
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pF1KA1 G--RPHLTQHMSMYDGRKMHECHQCQKAFTTSASLTRHRRIHTGEKPYECSDCGKAFNDP
: .:.. .:. .. .: : .: ::: ...: : ::::::.::::: : .::.
XP_016 GYEEPYFLKHQRAHSIEKNCVCSECGKAFRCKSQLIVHLRIHTGERPYECSKCERAFSAK
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pF1KA1 SALRSHARTHLKEKPFDCSQCGNAFRTLSALKIHMRVHTGERPYKCDQCGKAYGRSCHLI
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XP_016 SNLNAHQRVHTGEKPYSCSECEKVFSFRSQLIVHQEIHTGGKPYGCSECGKAYSWKSQLL
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pF1KA1 AHKRTHTGERPYECHDCGKAFQHPSHLKEHVRNHTGEKPYACTQCGKAFRWKSNFNLHKK
:.:.::: .:::: .:::::. : . : :.::: ::. :..:::::: :: . .: .
XP_016 LHQRSHTGVKPYECSECGKAFSLKSPFVVHQRTHTGVKPHKCSECGKAFRSKSYLLVHIR
320 330 340 350 360 370
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pF1KA1 NHMVEKTYECKECGKSFGDLVSRRKHMRIHIVKKPVECRQCGKTFRNQSILKTHMNSHTG
: :: :.:..:::.:. .. :. .: ..: .: .:::.: . : .:. .:.:
XP_016 MHTGEKPYQCSDCGKAFNMKTQLIVHQGVHTGNNPYQCGECGKAFGRKEQLTAHLRAHAG
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pF1KA1 EKPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERRYECAACGKVFGDYLSRRRHMSVHLVKKRV
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XP_016 EKPYGCSECGKAFSSKSYLVIHRRTHTGERPYECSLCERAFCGKSQLIIHQRTHSTEKPY
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pF1KA1 ECRQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKAFSIGSNLNVHRRIHTGEKPYECLV
:: .: ::. ...:. :...:.::::..:..:::::. :.:. :.:.::::::..:
XP_016 ECNECEKAYPRKASLQIHQKTHSGEKPFKCSECGKAFTQKSSLSEHQRVHTGEKPWKCSE
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pF1KA1 CGKAFSDHSSLRSHVKTHRGEKLFVSSVWKRLQ
:::.: .:.:: : :::.
XP_016 CGKSFCWNSGLRIHRKTHK
560 570
>>NP_940937 (OMIM: 609571) zinc finger protein 699 [Homo (642 aa)
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pF1KA1 TSLGYQVGKPSLISHLEQEEEPRTEERGAHQGACAD-----WETPSKTKWSLLMEDIFG-
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NP_940 ASLGYPLHTPHLISQWEQEEDLQTVKRELIQGIFMGEHREGFETQLKTNESVASQDICGE
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pF1KA1 -----------KETPSGVT-----MERAGLG--EKSTEY---AHLFE-------------
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NP_940 KISNEQKIVRFKRNDSWFSSLHENQESCGIDYQNKSHERHLRNHMVENIYECYEENQDGQ
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pF1KA1 VFGMDPHLT-------------QPMGR--------------HAGKRPYHRRDYGVAF---
.:.. :.: . :. :.:..::. .. : ::
NP_940 TFSQVPNLDSLKRNTEVKSCECHECGKAFVDHSSLKSHIRSHTGSKPYQCKECGKAFHFL
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210 220 230
pF1KA1 -----------KGRPH--------------LTQHMSMYDGRKMHECHQCQKAFTTSASLT
. .:. . ::... :. .::..: :.:. :.:::
NP_940 ACFKKHMKTPTEEKPYECKECTKAFSCSSFFRAHMKIHIGKTNYECKECGKGFSCSSSLT
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240 250 260 270 280 290
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.:.:::.:.:::::..:::::. :.: .: : : .::..:..::.:: . : : ::.:
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.::::.::.: .::::...: .: .: ::::::.::.:..::::.. :: :. :.:.:::
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360 370 380 390 400 410
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:::: : .::::: ...: : ::. :: ::::::::.:. : : :.: : :
NP_940 EKPYECLECGKAFYLPTSLNTHVKNQSREKPYECKECGKAFSCPSSFRAHVRDHTGKIQY
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420 430 440 450 460 470
pF1KA1 ECRQCGKTFRNQSILKTHMNSHTGEKPYGCDLCGKAFSASSNLTAHRKIHTQERRYECAA
::..::::: .: : :. .:.::::: : ::::: .::.::.: . :: :. :::
NP_940 ECKECGKTFSRSSSLTEHLRTHSGEKPYECKECGKAFISSSHLTVHIRTHTGEKPYECKK
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pF1KA1 CGKVFGDYLSRRRHMSVHLVKKRVECRQCGKAFRNQSTLKTHMRSHTGEKPYECDHCGKA
:::.: . : :: .: .: ::..::::::..: : .: : ::::::.:: .::::
NP_940 CGKAFIYPSALRIHMRTHTGEKPYECKECGKAFRHSSYLTVHARMHTGEKPFECLECGKA
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540 550 560 570 580 590
pF1KA1 FSIGSNLNVHRRIHTGEKPYECLVCGKAFSDHSSLRSHVKTHRGEKLFVSSVWKRLQ
:: :.. : : ::::::::: ::::: . .: ::::: :..
NP_940 FSCPSSFRRHVRSHTGEKPYECKECGKAFVCPAYFRRHVKTHTRENI
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>>XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger pro (1059 aa)
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Smith-Waterman score: 1525; 44.3% identity (69.8% similar) in 490 aa overlap (107-590:453-942)
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pF1KA1 SQRKLYKDVMLENYSNLTSLGYQVGKPSLISHLEQEEEPRTEERGAHQGACA-DWETP--
:.: .. . .:.:. ...:. ....:
XP_011 SSSHPIQHPGTYVGFKLYECNECGKAFCQNSNLSKHLRIHTKEKPCDNNGCGRSYKSPLI
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.. : . :: :.: . . .: .::: : . ..:. :: . :.:
XP_011 GHQKTDAEMELCGGSEYGKTSHLKGHQRILMGEKPYECIECGKTFSKTSHLRAHQRIHTG
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:.:
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