Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0711
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0711, 623 aa
1>>>pF1KA0711 623 - 623 aa - 623 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1793+/-0.000894; mu= 8.6412+/- 0.054
mean_var=235.1130+/-49.365, 0's: 0 Z-trim(114.9): 71 B-trim: 963 in 2/52
Lambda= 0.083644
statistics sampled from 15372 (15446) to 15372 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.779), E-opt: 0.2 (0.474), width: 16
Scan time: 3.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34795.1 KBTBD11 gene_id:9920|Hs108|chr8 ( 623) 4285 530.2 3.2e-150
CCDS14097.2 KLHDC7B gene_id:113730|Hs108|chr22 ( 594) 994 133.0 1.1e-30
CCDS185.2 KLHDC7A gene_id:127707|Hs108|chr1 ( 777) 672 94.3 6.6e-19
>>CCDS34795.1 KBTBD11 gene_id:9920|Hs108|chr8 (623 aa)
initn: 4285 init1: 4285 opt: 4285 Z-score: 2810.4 bits: 530.2 E(32554): 3.2e-150
Smith-Waterman score: 4285; 100.0% identity (100.0% similar) in 623 aa overlap (1-623:1-623)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MEHAVAPCVLYPGTEPGAAGESESEGAASPAQTPCSLGASLCFSSGEESPPQSLASAAEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEHAVAPCVLYPGTEPGAAGESESEGAASPAQTPCSLGASLCFSSGEESPPQSLASAAEG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 AATSPPSSGGPRVVERQWEAGSAGAASPEELASPEERACPEEPAAPSPEPRVWLEDPASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AATSPPSSGGPRVVERQWEAGSAGAASPEELASPEERACPEEPAAPSPEPRVWLEDPASP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 EEPGEPAPVPPGFGAVYGEPDLVLEVSGRRLRAHKAVLAARSDYFRARASRDVLRVQGVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EEPGEPAPVPPGFGAVYGEPDLVLEVSGRRLRAHKAVLAARSDYFRARASRDVLRVQGVS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 LTALRLLLADAYSGRMAGVRPDNVAEVVAGARRLQLPGAAQRATDAVGPQLSLANCYEVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LTALRLLLADAYSGRMAGVRPDNVAEVVAGARRLQLPGAAQRATDAVGPQLSLANCYEVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 SAAKRQRLNELRDAAYCFMSDHYLEVLREPAVFGRLSGAERDLLLRRRLRAGRAHLLAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SAAKRQRLNELRDAAYCFMSDHYLEVLREPAVFGRLSGAERDLLLRRRLRAGRAHLLAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LGPAGERAGSRPQSPSGDADARGDAAVYCFHAAAGEWRELTRLPEGAPARGCGLCVLYNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LGPAGERAGSRPQSPSGDADARGDAAVYCFHAAAGEWRELTRLPEGAPARGCGLCVLYNY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 LFVAGGVAPAGPDGRARPSDQVFCYNPATDSWSAVRPLRQARSQLRLLALDGHLYAVGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LFVAGGVAPAGPDGRARPSDQVFCYNPATDSWSAVRPLRQARSQLRLLALDGHLYAVGGE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 CLLSVERYDPRADRWAPVAPLPRGAFAVAHEATTCHGEIYVSGGSLFYRLLKYDPRRDEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CLLSVERYDPRADRWAPVAPLPRGAFAVAHEATTCHGEIYVSGGSLFYRLLKYDPRRDEW
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 QECPCSSSRERSADMVALDGFIYRFDLSGSRGEAQAAGPSGVSVSRYHCLAKQWSPCVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QECPCSSSRERSADMVALDGFIYRFDLSGSRGEAQAAGPSGVSVSRYHCLAKQWSPCVAP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 LRLPGGPTGLQPFRCAALDGAIYCVSRAGTWRFQPAREGEAGGDAGQGGGFEALGAPLDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LRLPGGPTGLQPFRCAALDGAIYCVSRAGTWRFQPAREGEAGGDAGQGGGFEALGAPLDV
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KA0 RGVLIPFALSLPEKPPRGEQGAP
:::::::::::::::::::::::
CCDS34 RGVLIPFALSLPEKPPRGEQGAP
610 620
>>CCDS14097.2 KLHDC7B gene_id:113730|Hs108|chr22 (594 aa)
initn: 1014 init1: 645 opt: 994 Z-score: 664.4 bits: 133.0 E(32554): 1.1e-30
Smith-Waterman score: 1107; 37.8% identity (61.4% similar) in 601 aa overlap (30-612:19-585)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MEHAVAPCVLYPGTEPGAAGESESEGAASPAQTPCS-LGASLCFSSGEESPPQSLASAAE
: .: : .: : : .. :.: ....
CCDS14 MVLRSHPFPRQDRPQGSVPRAVPGSPVGPSTSTHSEDRHGPSSSVGTVI
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 GAATSPPSSGGPRVVERQWEAGSAGAASPEELASPEERACPEEPAAPSPEPRVWLEDPAS
:..:. .: . :. : . :. ::. : :. . . .: :.. . : .
CCDS14 GTGTGGLVEAGGQPQPRSSE--TNGSPSPDP--PPGLRGEGTREKSLDPLPQAAM--PRG
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 PEEPGEPAPVPPGFGAVYGEPDLVLEVSGRRLRAHKAVLAARSDYFRARASRDVL-RVQG
: .: :: ::: :. . : : :.. . . . : :: : .. :
CCDS14 PAQP--PAQRPPG-PAASSSARRSQPVPQLRKRSRCEIAPSSEQEVRPAASGDPQGEAPG
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 VSLT------ALRLLLADAYSGRMAGVRPDNVAEVVAGARRLQLPGAAQRATDAVGPQLS
. . :: .: . . :: . . :: : :. . . .. :. .:.
CCDS14 EGGSPAGRSGALTEKQEEARKLMVFLQRPGGWG-VVEGPRKPSSRALEPATAAALRRRLD
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 LANCYEVLSAAKRQRLNELRDAAYCFMSDHYLEVLREPAVFGRLSGAERDLLLRRRLRAG
:..: .::. :... : . .: .:::. :.:: .: .. :::.:.:. .: : :
CCDS14 LGSCLDVLAFAQQHGEPGLAQETYALMSDNLLRVLGDPCLYRRLSAADRERILSLRTGRG
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KA0 RAHLLAAALGPA---GERAGSRPQSPSGDADARG-------DAAVYCFHAAAGEWRELTR
:: .:.. . :. : :.: :..: :. . : .. :. . :: ::.
CCDS14 RA-VLGVLVLPSLYQGGRSGL-PRGPRGEEPPAAAPVSLPLPAHLHVFNPRENTWRPLTQ
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 LPEGAPARGCGLCVLYNYLFVAGGVAPAGPDGRARPSDQVFCYNPATDSWSAVRPLRQAR
.:: :: ::::::...::::.:::. .: ..: :..:::::: :. :: :::..:::
CCDS14 VPEEAPLRGCGLCTMHNYLFLAGGIRGSG--AKAVCSNEVFCYNPLTNIWSQVRPMQQAR
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 SQLRLLALDGHLYAVGGECLLSVERYDPRADRWAPVAPLPRGAFAVAHEATTCHGEIYVS
.::.:.:::: :::.::::: :.: ::::.: :.: :::: :.: :::::..:.:.:::.
CCDS14 AQLKLVALDGLLYAIGGECLYSMECYDPRTDAWTPRAPLPAGTFPVAHEAVACRGDIYVT
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 GGSLFYRLLKYDPRRDEWQECPCSSSRERSADMVALDGFIYRFDLSGSRGEAQAAGPSGV
:: ::::::.:.: .: :.::: :.:..::.:.::: ::.::::: :: :.
CCDS14 GGHLFYRLLRYSPVKDAWDECPYSASHRRSSDIVALGGFLYRFDLL--RG-------VGA
460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KA0 SVSRYHCLAKQWSPCVAPLRLPGGPTGLQPFRCAALDGAIYCVSRAGTWRFQPAREGEAG
.: ::. .. .:: .: : ::. :. :..:..: ..:::.. : : . :
CCDS14 AVMRYNTVTGSWSR-AASLPLPA-PA---PLHCTTLGNTIYCLNPQVTATFTVS-----G
510 520 530 540 550
590 600 610 620
pF1KA0 GDAGQGGGFEALGAPLDVRGVLIPFALSLPEKPPRGEQGAP
: : : . : :: ::: :: :.::
CCDS14 GTA-QFQAKELQPFPLGSTGVLSPFILTLPPEDRLQTSL
560 570 580 590
>>CCDS185.2 KLHDC7A gene_id:127707|Hs108|chr1 (777 aa)
initn: 1024 init1: 542 opt: 672 Z-score: 452.9 bits: 94.3 E(32554): 6.6e-19
Smith-Waterman score: 994; 36.8% identity (58.2% similar) in 603 aa overlap (15-612:234-768)
10 20 30 40
pF1KA0 MEHAVAPCVLYPGTEPGAAGESESEGAASPAQTPCSLGASLCFS
: ..: :. :. . : . ..: ::
CCDS18 PPHCHYVAPLQGSSDMNQSWVFTRVIGVSREEAGALEAASDVDLTLHQQEGAPNSSYTFS
210 220 230 240 250 260
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 S-GEESPPQSLASAAEGAATSPPSSGGPRVVERQWEAGSAGAASPEELASPEERACPEEP
: .. . . . :::. : .: .: . :. : : .:: :. : : :
CCDS18 SIARVRMEEHFIQKAEGVE--PRLKG--KVYDYYVESTSQ-AIFQGRLA-PRTAALTEVP
270 280 290 300 310
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 AAPSPEPRVWLEDPASPEEPGEPAPVPPGFGAVYGEPDLVLEVSGRRLRAHKAVLAARSD
. : : : :: . :. : . . :. : : . ....:
CCDS18 S-PRPPPGSLGTGAASGGQAGD----TKGAAERAASPQTGPWPSTRGFSRKESLLQI---
320 330 340 350 360
170 180 190 200 210 220
pF1KA0 YFRARASRDVLRVQGVSLTALRLLLADAYSGRMAGVRPDNVAEVVAGARRLQLPGAAQRA
:. . :. .: : : : : . : .: . :::. ...:
CCDS18 ---AENPELQLQPDGFRLPAPPCPDPGALPGLGRSSREPHV-QPVAGTNFFHIP-----L
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260 270 280
pF1KA0 TDAVGPQ--LSLANCYEVLSAAKRQRLNELRDAAYCFMSDHYLEVLREPAVFGRLSGAER
: : .:: :.:.::::::. :::: :. :..::: ::..::.::: : ..: ::::::
CCDS18 TPASAPQVRLDLGNCYEVLTLAKRQNLEALKEAAYKVMSENYLQVLRSPDIYGCLSGAER
430 440 450 460 470 480
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 DLLLRRRLRAGRAHLLAAALGPAGERAGSRPQSPSGDADARGDAAVYCFHAAAGEWRELT
.:.:.:::: :: .:..: . : . .: . :. :: :.
CCDS18 ELILQRRLR-GRQYLVVADVCPKEDSGG-----------------LCCYDDEQDVWRPLA
490 500 510 520
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 RLPEGAPARGCGLCVLYNYLFVAGGVAPAGPDGRARPSDQVFCYNPATDSWSAVRPLRQA
:.: : .:::..: :.:::::..: :: :. .::..:::::: : :: : :: ::
CCDS18 RMPPEAVSRGCAICSLFNYLFVVSGC--QGP-GH-QPSSRVFCYNPLTGIWSEVCPLNQA
530 540 550 560 570
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 RSQLRLLALDGHLYAVGGECLLSVERYDPRADRWAPVAPLPRGAFAVAHEATTCHGEIYV
: . ::.::::::::.::::: :::::::: ::: . ::: .::.:: ::. ::.:
CCDS18 RPHCRLVALDGHLYAIGGECLNSVERYDPRLDRWDFAPPLPSDTFALAHTATVRAKEIFV
580 590 600 610 620 630
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 SGGSLFYRLLKYDPRRDEWQECPCSSSRERSADMVALDGFIYRFDLSGSRGEAQAAGPSG
.:::: . :.... ....: : ..:..:.:.:::..::.:::::. : :
CCDS18 TGGSLRFLLFRFSAQEQRWWAGPTGGSKDRTAEMVAVNGFLYRFDLNRSLG---------
640 650 660 670 680
530 540 550 560 570
pF1KA0 VSVSRYHCLA--KQWSPCVAPLRLPGGPTGLQPFRCAALDGAIYCVSRAGTWRFQPAREG
.. :.: : . : : : : : : . :.::..:. ::::.: .: : .
CCDS18 --IAVYRCSASTRLWYEC-ATYRTPY-P---DAFQCAVVDNLIYCVGRRSTLCFL----A
690 700 710 720 730
580 590 600 610 620
pF1KA0 EAGGDAGQGGGFEALGAPLDVRGVLIPFALSLPEKPPRGEQGAP
.. . .... :: .:.:.: .:.::
CCDS18 DSVSPRFVPKELRSFPAP---QGTLLPTVLTLPTPDLPQTRV
740 750 760 770
623 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 06:40:56 2016 done: Tue Nov 8 06:40:56 2016
Total Scan time: 3.900 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]