Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0395
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0395, 956 aa
1>>>pF1KA0395 956 - 956 aa - 956 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8796+/-0.00101; mu= 11.4419+/- 0.062
mean_var=189.2999+/-39.497, 0's: 0 Z-trim(110.8): 16 B-trim: 491 in 1/51
Lambda= 0.093218
statistics sampled from 11853 (11861) to 11853 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.364), width: 16
Scan time: 4.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13315.1 ZHX3 gene_id:23051|Hs108|chr20 ( 956) 6361 868.7 0
CCDS6336.1 ZHX2 gene_id:22882|Hs108|chr8 ( 837) 521 83.3 2.2e-15
CCDS6342.1 ZHX1 gene_id:11244|Hs108|chr8 ( 873) 511 82.0 5.7e-15
>>CCDS13315.1 ZHX3 gene_id:23051|Hs108|chr20 (956 aa)
initn: 6361 init1: 6361 opt: 6361 Z-score: 4633.5 bits: 868.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6361; 99.9% identity (99.9% similar) in 956 aa overlap (1-956:1-956)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MASKRKSTTPCMIPVKTVVLQDASMEAQPAETLPEGPQQDLPPEASAASSEAAQNPSSTD
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CCDS13 MASKRKSTTPCMIPVKTVVLQDASMEAQPAETLPEGPQQDLPPEASAASSEAAQNPSSTD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 GSTLANGHRSTLDGYLYSCKYCDFRSHDMTQFVGHMNSEHTDFNKDPTFVCSGCSFLAKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GSTLANGHRSTLDGYLYSCKYCDFRSHDMTQFVGHMNSEHTDFNKDPTFVCSGCSFLAKT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 PEGLSLHNATCHSGEASFVWNVAKPDNHVVVEQSIPESTSTPDLAGEPSAEGADGQAEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PEGLSLHNATCHSGEASFVWNVAKPDNHVVVEQSIPESTSTPDLAGEPSAEGADGQAEII
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 ITKTPIMKIMKGKAEAKKIHTLKENVPSQPVGEALPKLSTGEMEVREGDHSFINGAVPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ITKTPIMKIMKGKAEAKKIHTLKENVPSQPVGEALPKLSTGEMEVREGDHSFINGAVPVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 QASASSAKNPHAANGPLIGTVPVLPAGIAQFLSLQQQPPVHAQHHVHQPLPTAKALPKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QASASSAKNPHAANGPLIGTVPVLPAGIAQFLSLQQQPPVHAQHHVHQPLPTAKALPKVM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 IPLSSIPTYNAAMDSNSFLKNSFHKFPYPTKAELCYLTVVTKYPEEQLKIWFTAQRLKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IPLSSIPTYNAAMDSNSFLKNSFHKFPYPTKAELCYLTVVTKYPEEQLKIWFTAQRLKQG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 ISWSPEEIEDARKKMFNTVIQSVPQPTITVLNTPLVASAGNVQHLIQAALPGHVVGQPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ISWSPEEIEDARKKMFNTVIQSVPQPTITVLNTPLVASAGNVQHLIQAALPGHVVGQPEG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 TGGGLLVTQPLMANGLQATSSPLPLTVTSVPKQPGVAPINTVCSNTTSAVKVVNAAQSLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TGGGLLVTQPLMANGLQATSSPLPLTVTSVPKQPGVAPINTVCSNTTSAVKVVNAAQSLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 TACPSITSQAFLDASIYKNKKSHEQLSALKGSFCRNQFPGQSEVEHLTKVTGLSTREVRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TACPSITSQAFLDASIYKNKKSHEQLSALKGSFCRNQFPGQSEVEHLTKVTGLSTREVRK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 WFSDRRYHCRNLKGSRAMIPGDHSSIIIDSVPEVSFSPSSKVPEVTCIPTTATLATHPSA
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CCDS13 WFSDRRYHCRNLKGSRAMIPGDHSSIIIDSVPEVSFSPSSKVPEVTCIPTTATLATHPSA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 KRQSWHQTPDFTPTKYKERAPEQLRALESSFAQNPLPLDEELDRLRSETKMTRREIDSWF
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CCDS13 KRQSWHQTPDFTPTKYKERAPEQLRALESSFAQNPLPLDEELDRLRSETKMTRREIDSWF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 SERRKKVNAEETKKAEENASQEEEEAAEDEGGEEDLASELRVSGENGSLEMPSSHILAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SERRKKVNAEETKKAEENASQEEEEAAEDEGGEEDLASELRVSGENGSLEMPSSHILAER
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 KVSPIKINLKNLRVTEANGRNEIPGLGACDPEDDESNKLAEQLPGKVSCKKTAQQRHLLR
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CCDS13 KVSPIKINLKNLRVTEANGRNEIPGLGACDPEDDESNKLAEQLPGKVSCKKTAQQRHLLR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 QLFVQTQWPSNQDYDSIMAQTGLPRPEVVRWFGDSRYALKNGQLKWYEDYKRGNFPPGLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QLFVQTQWPSNQDYDSIMAQTGLPRPEVVRWFGDSRYALKNGQLKWYEDYKRGNFPPGLL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 VIAPGNRELLQDYYMTHKMLYEEDLQNLCDKTQMSSQQVKQWFAEKMGEETRAVADTGSE
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CCDS13 VIAPGNRELLQDYYMTHKMLYEEDLQNLCDKTQMSSQQVKQWFAEKMGEETRAVADTGSE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KA0 DQGPGTTELTAVHKGMGDTYSEVSENSESWEPRVPEASSEPFDTSSPQAGRQLETD
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DQGPGTGELTAVHKGMGDTYSEVSENSESWEPRVPEASSEPFDTSSPQAGRQLETD
910 920 930 940 950
>>CCDS6336.1 ZHX2 gene_id:22882|Hs108|chr8 (837 aa)
initn: 1261 init1: 377 opt: 521 Z-score: 389.7 bits: 83.3 E(32554): 2.2e-15
Smith-Waterman score: 1475; 33.5% identity (59.9% similar) in 965 aa overlap (1-946:1-827)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MASKRKSTTPCMIPVKTVVLQDASMEAQPAETLPEG-PQQDLPPEASAASSEAAQNPSST
::::::::::::. .. :: ::. :.. :. : :: :. .. :: : ... . .
CCDS63 MASKRKSTTPCMVRTSQVVEQDVPEEVDRAKEKGIGTPQPDVAKDSWAAELENSSKENEV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 -DGSTLANGHRSTLDGYLYSCKYCDFRSHDMTQFVGHMNSEHTDFNKDPTFVCSGCSFLA
. ....... . :.: : :::: . ......:. :.. .: . .: .::. :.: .
CCDS63 IEVKSMGESQSKKLQGG-YECKYCPYSTQNLNEFTEHVDMQHPNVILNPLYVCAECNFTT
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KTPEGLSLHNATCHSGEASFVWNVAKPDNHVVVEQSIPESTSTPDLAGEPSAEGADGQAE
: ..:: ::. : :::.: .. : .:..:.:::: .. . ... . : :...
CCDS63 KKYDSLSDHNSKFHPGEANFKLKLIKRNNQTVLEQSIETTNHVVSITTSGPGTG-DSDSG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 IIITKTPIMKIMKGKAEAKKIHTLKENVPSQPVGEALPKLSTGEMEVREGDHSFINGAVP
: ..:::::: : ::.::: ::..: : : : .: :: ... ..
CCDS63 ISVSKTPIMKPGKPKADAKK-------VPKKPE-EITP-----ENHV-EGTARLVTDTAE
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VSQASASSAKNPHAANGPLIGTVPVLPAGIAQFLSLQQQPPVHAQHHVHQPLPTAKALPK
. . .: : .: :. :.. :. : :. . .::
CCDS63 ILSR---------------LGGVELL-----------QDTLGHVMPSVQLP-PNINLVPK
230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 VMIPLSSIPTYNAAMDSNSFLKNSFHKFPYPTKAELCYLTVVTKYPEEQLKIWFTAQRLK
: .::.. ::.:.:.:. . :::.::::::.::: .::...:.:::...:::..::::
CCDS63 VPVPLNTTK-YNSALDTNATMINSFNKFPYPTQAELSWLTAASKHPEEHIRIWFATQRLK
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 QGISWSPEEIEDARKKMFNTVIQSVPQPTITVLNTPLVASAGNVQHLIQAALPGHVVGQP
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CCDS63 HGISWSPEEVEEARKKMFNGTIQSVP-PTITVLPAQL-APTKVTQPILQTALPCQILGQT
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 EGTGGGLLVTQPLMANGLQATSSPLPLTVTSVPKQPGVAPINTVCSNTTSAVKVVNAAQS
.:..:: . ... .. ::. :.:..: .. :. : ... : . ::
CCDS63 -----SLVLTQ-VTSGSTTVSCSPITLAVAGVTNHGQKRPL--VTPQAAPEPKRPHIAQ-
380 390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 LLTACPSITSQAFLDASIYKNKKSHEQLSALKGSFCRNQFPGQSEVEHLTKVTGLSTREV
. :.... . :: ::..::.. ::.:: ..::: ..:: .: .::::. :.
CCDS63 VPEPPPKVANPPLTPAS--DRKKTKEQIAHLKASFLQSQFPDDAEVYRLIEVTGLARSEI
430 440 450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KA0 RKWFSDRRYHCRNLKGSRAMIPGDHSSIIIDSVPEVSFSPSSKVPEVTCIPTTATLATHP
.:::::.::.:. :... :. :. ::
CCDS63 KKWFSDHRYRCQ-----RGIVHITSESLAKDQ-----------------------LAIAA
490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KA0 SAKRQSWHQTPDFTPTKYKERAPEQLRALESSFAQNPLPLDEELDRLRSETKMTRREIDS
: . ...: :::.: :.::.. :.. ::.:: .. .: . :::::: :::..::::::
CCDS63 SRHGRTYHAYPDFAPQKFKEKTQGQVKILEDSFLKSSFPTQAELDRLRVETKLSRREIDS
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KA0 WFSERRKKVNAEETKKAEENASQEEEEAAEDEGGEEDLASELRVSGENGSLEMPSSHILA
::::::: .. : .:. : : ... :.. ::.:
CCDS63 WFSERRKLRDSME-------------QAVLDSMGSGKKGQD--VGAPNGALS--------
580 590 600 610
720 730 740 750 760 770
pF1KA0 ERKVSPIKINLKNLRVTEANGRNEIPGLGACDPEDDESNKLAEQLPGKVSCKKTAQQRHL
:. . .: . .: . .: . :. .: ::
CCDS63 --------------RLDQLSGAQLTSSLPSPSP----------------AIAKSQEQVHL
620 630 640
780 790 800 810 820 830
pF1KA0 LRQLFVQTQWPSNQDYDSIMAQTGLPRPEVVRWFGDSRYALKNGQLKWYEDYKRGNFPP-
::. :..::::. :.::.. :.::: : :.:::: ..: ::.: .::.:.:.. .
CCDS63 LRSTFARTQWPTPQEYDQLAAKTGLVRTEIVRWFKENRCLLKTGTVKWMEQYQHQPMADD
650 660 670 680 690 700
840 850 860 870 880
pF1KA0 -GLLVIA----------PGNR-ELLQDYYMTHKMLYEEDLQNLCDKTQMSSQQVKQWFAE
: ..: : : ... .:: : : ::::..: .....:. .:. .
CCDS63 HGYDAVARKATKPMAESPKNGGDVVPQYYKDPKKLCEEDLEKLVTRVKVGSEPAKDCLPA
710 720 730 740 750 760
890 900 910 920 930 940
pF1KA0 KMGEETRAVADTGSED-QGPGTTELTAVHKGMGDTYSE---VSENSESWEPRVPEASSEP
: .: : .. .:.: :: .: ..: . : .: .:. :.:: . :. ::
CCDS63 KPSEATSDRSEGSSRDGQGSDENEESSVVDYVEVTVGEEDAISDRSDSWSQAAAEGVSEL
770 780 790 800 810 820
950
pF1KA0 FDTSSPQAGRQLETD
...:
CCDS63 AESDSDCVPAEAGQA
830
>>CCDS6342.1 ZHX1 gene_id:11244|Hs108|chr8 (873 aa)
initn: 1627 init1: 417 opt: 511 Z-score: 382.2 bits: 82.0 E(32554): 5.7e-15
Smith-Waterman score: 1667; 35.5% identity (60.6% similar) in 986 aa overlap (1-932:1-860)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MASKRKSTTPCMIPVKTVVLQDASMEAQPAETLPEGPQQDLPPEASAASSEAAQNP--SS
:::.::::::::. .. :: ..: : ::: : : . : : .... :
CCDS63 MASRRKSTTPCMVLASE---QDPDLEL--ISDLDEGPPVLTPVENTRAESISSDEEVHES
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 TDGSTLANGHRSTLDGYLYSCKYCDFRSHDMTQFVGHMNSEHTDFNKDPTFVCSGCSFLA
.:.. : . . ..: : :::: :.. :...:. :..::: . . ..:: :.::.
CCDS63 VDSD---NQQNKKVEGG-YECKYCTFQTPDLNMFTFHVDSEHPNVVLNSSYVCVECNFLT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 KTPEGLSLHNATCHSGEASFVWNVAKPDNHVVVEQSIPESTSTPDLAGEPSAEGADG---
: ..:: :: : :: .: ...: .:... ::.: . : ... : .:: :..
CCDS63 KRYDALSEHNLKYHPGEENFKLTMVKRNNQTIFEQTINDLTFDGSFVKEENAEQAESTEV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 -QAEIIITKTPIMKIMKGKAEAKKI---HTLKENVPSQPVGEALPKLSTGEMEVREGDHS
.. : :.::::::.::.:.: :.: :. :.:: . .: : . :. :. :
CCDS63 SSSGISISKTPIMKMMKNKVENKRIAVHHNSVEDVPEEKENEIKPD----REEIVENPSS
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 FINGAVPVSQASASSAKNPHAANGPLIGT-VPVLPAGIAQFLSLQQQPPVHAQHHVHQPL
.. :..:.: .. : ... . : . ::: :.:: .. : ::..
CCDS63 ----SASESNTSTSIVNRIHPSTASTVVTPAAVLP-GLAQVIT-----AVSAQQN-----
230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 PTAKALPKVMIPLSSIPTYNAAMDSNSFLKNSFHKFPYPTKAELCYLTVVTKYPEEQLKI
.. .:::.::..::::::::.:.: .: :...:::::: .:. :.. .:: :::.::
CCDS63 --SNLIPKVLIPVNSIPTYNAALDNNPLLLNTYNKFPYPTMSEITVLSAQAKYTEEQIKI
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 WFTAQRLKQGISWSPEEIEDARKKMFNTVIQSVPQPTITVLNTPLVASAGNVQHLIQAAL
::.:::::.:.::.:::.:.::.:.:: ....::: ::::. : . ...... ..:.
CCDS63 WFSAQRLKHGVSWTPEEVEEARRKQFNGTVHTVPQ-TITVIPTHISTGSNGLPSILQTC-
340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 PGHVVGQPEGTGGGLLVTQPLMANGLQATSSPLPLTVTSVPKQPGVAPINTVCSNTTSAV
..:::: ::..:: .: : .:. :. :::..::.: .. .. .. :. .
CCDS63 --QIVGQP-----GLVLTQVAGTNTLPVTA-PIALTVAGVPSQNNIQKSQVPAAQPTAET
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 KVVNAAQSLLTACPSITSQAFLDASIYKNKKSHEQLSALKGSFCRNQFPGQSEVEHLTKV
: ..:: . :. . :. . ::..:::. :: :. .:::: .::. .: :.
CCDS63 KPATAAVPTSQSVKHETALVNPDSFGIRAKKTKEQLAELKVSYLKNQFPHDSEIIRLMKI
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580
pF1KA0 TGLSTREVRKWFSDRRYHCRNLKGSRAM-IPGDHSS-IIIDSVPEVSFSPSSKVPEVTCI
:::. :..::::: ::. :: :... . . .: :. ::::: :.. ::
CCDS63 TGLTKGEIKKWFSDTRYNQRNSKSNQCLHLNNDSSTTIIIDSSDETTESP----------
510 520 530 540 550
590 600 610 620 630 640
pF1KA0 PTTATLATHPSAKRQSWHQTPDFTPTKYKERAPEQLRALESSFAQNPLPLDEELDRLRSE
:..: ..: .:::. ::::: :.::.. ::::.:..:: .. . ::::.:::..
CCDS63 -TVGT--AQP---KQSWNPFPDFTPQKFKEKTAEQLRVLQASFLNSSVLTDEELNRLRAQ
560 570 580 590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KA0 TKMTRREIDSWFSERRKKVNAEETKKA--EENASQEEEEAAEDEGGEEDLASELRVSGEN
::.::::::.::.:..:. .: : : ::.. .:::.:
CCDS63 TKLTRREIDAWFTEKKKSKALKEEKMEIDESNAGSSKEEAGE------------------
610 620 630 640
710 720 730 740 750 760
pF1KA0 GSLEMPSSHILAERKVSPIKINLKNLRVTEANGRNEIPGLGACDPEDDESNKLAEQLPGK
.:: :::. ::
CCDS63 ---------------TSPA----------------------------DESGAPKSGSTGK
650 660
770 780 790 800 810 820
pF1KA0 VSCKKTAQQRHLLRQLFVQTQWPSNQDYDSIMAQTGLPRPEVVRWFGDSRYALKNGQLKW
. :::: .: :.:.. ::.::::: ..::.. ..:: : ..: ::::.::: :::.:::
CCDS63 I-CKKTPEQLHMLKSAFVRTQWPSPEEYDKLAKESGLARTDIVSWFGDTRYAWKNGNLKW
670 680 690 700 710 720
830 840
pF1KA0 YEDY---------------KRG-NFP------------------------PGLLVIAPGN
: : ::: . : :.:. . :.
CCDS63 YYYYQSANSSSMNGLSSLRKRGRGRPKGRGRGRPRGRPRGSKRINNWDRGPSLIKFKTGT
730 740 750 760 770 780
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 RELLQDYYMTHKMLYEEDLQNLCDKTQMSSQQVKQWFAEKMGEETRAVADTGSEDQGPGT
.:.:::. ::.: :.::..: .:..:. .::..::::. . : .. : : .
CCDS63 -AILKDYYLKHKFLNEQDLDELVNKSHMGYEQVREWFAER---QRR--SELGIELFEENE
790 800 810 820 830
910 920 930 940 950
pF1KA0 TELTAVHKGMGDTYSEVSENSESWEPRVPEASSEPFDTSSPQAGRQLETD
: .. : : ...:..:::
CCDS63 EEDEVIDDQEED--EEETDDSDTWEPPRHVKRKLSKSDD
840 850 860 870
956 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 06:54:00 2016 done: Sun Nov 6 06:54:01 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]