Result of FASTA (ccds) for
pFN21AA0300
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0300, 2839 aa
1>>>pF1KA0300 2839 - 2839 aa - 2839 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1311+/-0.00121; mu= 5.1301+/- 0.073
mean_var=278.9105+/-55.992, 0's: 0 Z-trim(110.8): 90 B-trim: 162 in 1/50
Lambda= 0.076797
statistics sampled from 11817 (11898) to 11817 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.682), E-opt: 0.2 (0.365), width: 16
Scan time: 8.720
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34137.1 PDZD2 gene_id:23037|Hs108|chr5 (2839) 18766 2094.9 0
CCDS53966.1 IL16 gene_id:3603|Hs108|chr15 (1331) 807 104.9 3.2e-21
CCDS42069.1 IL16 gene_id:3603|Hs108|chr15 (1332) 807 104.9 3.2e-21
CCDS10317.1 IL16 gene_id:3603|Hs108|chr15 ( 631) 688 91.5 1.7e-17
>>CCDS34137.1 PDZD2 gene_id:23037|Hs108|chr5 (2839 aa)
initn: 18766 init1: 18766 opt: 18766 Z-score: 11243.3 bits: 2094.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 18766; 100.0% identity (100.0% similar) in 2839 aa overlap (1-2839:1-2839)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MPITQDNAVLHLPLLYQWLQNSLQEGGDGPEQRLCQAAIQKLQEYIQLNFAVDESTVPPD
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CCDS34 MPITQDNAVLHLPLLYQWLQNSLQEGGDGPEQRLCQAAIQKLQEYIQLNFAVDESTVPPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 HSPPEMEICTVYLTKELGDTETVGLSFGNIPVFGDYGEKRRGGKKRKTHQGPVLDVGCIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HSPPEMEICTVYLTKELGDTETVGLSFGNIPVFGDYGEKRRGGKKRKTHQGPVLDVGCIW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VTELRKNSPAGKSGKVRLRDEILSLNGQLMVGVDVSGASYLAEQCWNGGFIYLIMLRRFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VTELRKNSPAGKSGKVRLRDEILSLNGQLMVGVDVSGASYLAEQCWNGGFIYLIMLRRFK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KA0 HKAHSTYNGNSSNSSEPGETPTLELGDRTAKKGKRTRKFGVISRPPANKAPEESKGSAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HKAHSTYNGNSSNSSEPGETPTLELGDRTAKKGKRTRKFGVISRPPANKAPEESKGSAGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KA0 EVSSDPSTELENGPDPELGNGHVFQLENGPDSLKEVAGPHLERSEVDRGTEHRIPKTDAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EVSSDPSTELENGPDPELGNGHVFQLENGPDSLKEVAGPHLERSEVDRGTEHRIPKTDAP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KA0 LTTSNDKRRFSKGGKTDFQSSDCLAREEVGRIWKMELLKESDGLGIQVSGGRGSKRSPHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LTTSNDKRRFSKGGKTDFQSSDCLAREEVGRIWKMELLKESDGLGIQVSGGRGSKRSPHA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KA0 IVVTQVKEGGAAHRDGRLSLGDELLVINGHLLVGLSHEEAVAILRSATGMVQLVVASKEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IVVTQVKEGGAAHRDGRLSLGDELLVINGHLLVGLSHEEAVAILRSATGMVQLVVASKEN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KA0 SAEDLLRLTSKSLPDLTSSVEDVSSWTDNEDQEADGEEDEGTSSSVQRAMPGTDEPQDVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SAEDLLRLTSKSLPDLTSSVEDVSSWTDNEDQEADGEEDEGTSSSVQRAMPGTDEPQDVC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KA0 GAEESKGNLESPKQGSNKIKLKSRLSGGVHRLESVEEYNELMVRNGDPRIRMLEVSRDGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GAEESKGNLESPKQGSNKIKLKSRLSGGVHRLESVEEYNELMVRNGDPRIRMLEVSRDGR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KA0 KHSLPQLLDSSSASQEYHIVKKSTRSLSTTQVESPWRLIRPSVISIIGLYKEKGKGLGFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KHSLPQLLDSSSASQEYHIVKKSTRSLSTTQVESPWRLIRPSVISIIGLYKEKGKGLGFS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KA0 IAGGRDCIRGQMGIFVKTIFPNGSAAEDGRLKEGDEILDVNGIPIKGLTFQEAIHTFKQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IAGGRDCIRGQMGIFVKTIFPNGSAAEDGRLKEGDEILDVNGIPIKGLTFQEAIHTFKQI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KA0 RSGLFVLTVRTKLVSPSLTPCSTPTHMSRSASPNFNTSGGASAGGSDEGSSSSLGRKTPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RSGLFVLTVRTKLVSPSLTPCSTPTHMSRSASPNFNTSGGASAGGSDEGSSSSLGRKTPG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KA0 PKDRIVMEVTLNKEPRVGLGIGACCLALENSPPGIYIHSLAPGSVAKMESNLSRGDQILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PKDRIVMEVTLNKEPRVGLGIGACCLALENSPPGIYIHSLAPGSVAKMESNLSRGDQILE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KA0 VNSVNVRHAALSKVHAILSKCPPGPVRLVIGRHPNPKVSEQEMDEVIARSTYQESKEANS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VNSVNVRHAALSKVHAILSKCPPGPVRLVIGRHPNPKVSEQEMDEVIARSTYQESKEANS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KA0 SPGLGTPLKSPSLAKKDSLISESELSQYFAHDVPGPLSDFMVAGSEDEDHPGSGCSTSEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SPGLGTPLKSPSLAKKDSLISESELSQYFAHDVPGPLSDFMVAGSEDEDHPGSGCSTSEE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KA0 GSLPPSTSTHKEPGKPRANSLVTLGSHRASGLFHKQVTVARQASLPGSPQALRNPLLRQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSLPPSTSTHKEPGKPRANSLVTLGSHRASGLFHKQVTVARQASLPGSPQALRNPLLRQR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KA0 KVGCYDANDASDEEEFDREGDCISLPGALPGPIRPLSEDDPRRVSISSSKGMDVHNQEER
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CCDS34 KVGCYDANDASDEEEFDREGDCISLPGALPGPIRPLSEDDPRRVSISSSKGMDVHNQEER
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KA0 PRKTLVSKAISAPLLGSSVDLEESIPEGMVDAASYAANLTDSAEAPKGSPGSWWKKELSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PRKTLVSKAISAPLLGSSVDLEESIPEGMVDAASYAANLTDSAEAPKGSPGSWWKKELSG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KA0 SSSAPKLEYTVRTDTQSPTNTGSPSSPQQKSEGLGSRHRPVARVSPHCKRSEAEAKPSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SSSAPKLEYTVRTDTQSPTNTGSPSSPQQKSEGLGSRHRPVARVSPHCKRSEAEAKPSGS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KA0 QTVNLTGRANDPCDLDSRVQATSVKVTVAGFQPGGAVEKESLGKLTTGDACVSTSCELAS
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CCDS34 QTVNLTGRANDPCDLDSRVQATSVKVTVAGFQPGGAVEKESLGKLTTGDACVSTSCELAS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KA0 ALSHLDASHLTENLPKAASELGQQPMTELDSSSDLISSPGKKGAAHPDPSKTSVDTGQVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ALSHLDASHLTENLPKAASELGQQPMTELDSSSDLISSPGKKGAAHPDPSKTSVDTGQVS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KA0 RPENPSQPASPRVAKCKARSPVRLPHEGSPSPGEKAAAPPDYSKTRSASETSTPHNTRRV
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RPENPSQPASPRVTKCKARSPVRLPHEGSPSPGEKAAAPPDYSKTRSASETSTPHNTRRV
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KA0 AALRGAGPGAEGMTPAGAVLPGDPLTSQEQRQGAPGNHSKALEMTGIHAPESSQEPSLLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AALRGAGPGAEGMTPAGAVLPGDPLTSQEQRQGAPGNHSKALEMTGIHAPESSQEPSLLE
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KA0 GADSVSSRAPQASLSMLPSTDNTKEACGHVSGHCCPGGSRESPVTDIDSFIKELDASAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GADSVSSRAPQASLSMLPSTDNTKEACGHVSGHCCPGGSRESPVTDIDSFIKELDASAAR
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KA0 SPSSQTGDSGSQEGSAQGHPPAGAGGGSSCRAEPVPGGQTSSPRRAWAAGAPAYPQWASQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SPSSQTGDSGSQEGSAQGHPPAGAGGGSSCRAEPVPGGQTSSPRRAWAAGAPAYPQWASQ
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KA0 PSVLDSINPDKHFTVNKNFLSNYSRNFSSFHEDSTSLSGLGDSTEPSLSSMYGDAEDSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PSVLDSINPDKHFTVNKNFLSNYSRNFSSFHEDSTSLSGLGDSTEPSLSSMYGDAEDSSS
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KA0 DPESLTEAPRASARDGWSPPRSRVSLHKEDPSESEEEQIEICSTRGCPNPPSSPAHLPTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DPESLTEAPRASARDGWSPPRSRVSLHKEDPSESEEEQIEICSTRGCPNPPSSPAHLPTQ
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KA0 AAICPASAKVLSLKYSTPRESVASPREKAACLPGSYTSGPDSSQPSSLLEMSSQEHETHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AAICPASAKVLSLKYSTPRESVASPREKAACLPGSYTSGPDSSQPSSLLEMSSQEHETHA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KA0 DISTSQNHRPSCAEETTEVTSASSAMENSPLSKVARHFHSPPIILSSPNMVNGLEHDLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DISTSQNHRPSCAEETTEVTSASSAMENSPLSKVARHFHSPPIILSSPNMVNGLEHDLLD
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KA0 DETLNQYETSINAAASLSSFSVDVPKNGESVLENLHISESQDLDDLLQKPKMIARRPIMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DETLNQYETSINAAASLSSFSVDVPKNGESVLENLHISESQDLDDLLQKPKMIARRPIMA
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KA0 WFKEINKHNQGTHLRSKTEKEQPLMPARSPDSKIQMVSSSQKKGVTVPHSPPQPKTNLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 WFKEINKHNQGTHLRSKTEKEQPLMPARSPDSKIQMVSSSQKKGVTVPHSPPQPKTNLEN
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KA0 KDLSKKSPAEMLLTNGQKAKCGPKLKRLSLKGKAKVNSEAPAANAVKAGGTDHRKPLISP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KDLSKKSPAEMLLTNGQKAKCGPKLKRLSLKGKAKVNSEAPAANAVKAGGTDHRKPLISP
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KA0 QTSHKTLSKAVSQRLHVADHEDPDRNTTAAPRSPQCVLESKPPLATSGPLKPSVSDTSIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QTSHKTLSKAVSQRLHVADHEDPDRNTTAAPRSPQCVLESKPPLATSGPLKPSVSDTSIR
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KA0 TFVSPLTSPKPVPEQGMWSRFHMAVLSEPDRGCPTTPKSPKCRAEGRAPRADSGPVSPAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TFVSPLTSPKPVPEQGMWSRFHMAVLSEPDRGCPTTPKSPKCRAEGRAPRADSGPVSPAA
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KA0 SRNGMSVAGNRQSEPRLASHVAADTAQPRPTGEKGGNIMASDRLERTNQLKIVEISAEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SRNGMSVAGNRQSEPRLASHVAADTAQPRPTGEKGGNIMASDRLERTNQLKIVEISAEAV
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KA0 SETVCGNKPAESDRRGGCLAQGNCQEKSEIRLYRQVAESSTSHPSSLPSHASQAEQEMSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SETVCGNKPAESDRRGGCLAQGNCQEKSEIRLYRQVAESSTSHPSSLPSHASQAEQEMSR
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KA0 SFSMAKLASSSSSLQTAIRKAEYSQGKSSLMSDSRGVPRNSIPGGPSGEDHLYFTPRPAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SFSMAKLASSSSSLQTAIRKAEYSQGKSSLMSDSRGVPRNSIPGGPSGEDHLYFTPRPAT
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KA0 RTYSMPAQFSSHFGREGHPPHSLGRSRDSQVPVTSSVVPEAKASRGGLPSLANGQGIYSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RTYSMPAQFSSHFGREGHPPHSLGRSRDSQVPVTSSVVPEAKASRGGLPSLANGQGIYSV
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KA0 KPLLDTSRNLPATDEGDIISVQETSCLVTDKIKVTRRHYCYEQNWPHESTSFFSVKQRIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KPLLDTSRNLPATDEGDIISVQETSCLVTDKIKVTRRHYCYEQNWPHESTSFFSVKQRIK
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KA0 SFENLANADRPVAKSGASPFLSVSSKPPIGRRSSGSIVSGSLGHPGDAAARLLRRSLSSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SFENLANADRPVAKSGASPFLSVSSKPPIGRRSSGSIVSGSLGHPGDAAARLLRRSLSSC
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KA0 SENQSEAGTLLPQMAKSPSIMTLTISRQNPPETSSKGSDSELKKSLGPLGIPTPTMTLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SENQSEAGTLLPQMAKSPSIMTLTISRQNPPETSSKGSDSELKKSLGPLGIPTPTMTLAS
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470 2480 2490 2500 2510 2520
pF1KA0 PVKRNKSSVRHTQPSPVSRSKLQELRALSMPDLDKLCSEDYSAGPSAVLFKTELEITPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PVKRNKSSVRHTQPSPVSRSKLQELRALSMPDLDKLCSEDYSAGPSAVLFKTELEITPRR
2470 2480 2490 2500 2510 2520
2530 2540 2550 2560 2570 2580
pF1KA0 SPGPPAGGVSCPEKGGNRACPGGSGPKTSAAETPSSASDTGEAAQDLPFRRSWSVNLDQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SPGPPAGGVSCPEKGGNRACPGGSGPKTSAAETPSSASDTGEAAQDLPFRRSWSVNLDQL
2530 2540 2550 2560 2570 2580
2590 2600 2610 2620 2630 2640
pF1KA0 LVSAGDQQRLQSVLSSVGSKSTILTLIQEAKAQSENEEDVCFIVLNRKEGSGLGFSVAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVSAGDQQRLQSVLSSVGSKSTILTLIQEAKAQSENEEDVCFIVLNRKEGSGLGFSVAGG
2590 2600 2610 2620 2630 2640
2650 2660 2670 2680 2690 2700
pF1KA0 TDVEPKSITVHRVFSQGAASQEGTMNRGDFLLSVNGASLAGLAHGNVLKVLHQAQLHKDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TDVEPKSITVHRVFSQGAASQEGTMNRGDFLLSVNGASLAGLAHGNVLKVLHQAQLHKDA
2650 2660 2670 2680 2690 2700
2710 2720 2730 2740 2750 2760
pF1KA0 LVVIKKGMDQPRPSARQEPPTANGKGLLSRKTIPLEPGIGRSVAVHDALCVEVLKTSAGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVVIKKGMDQPRPSARQEPPTANGKGLLSRKTIPLEPGIGRSVAVHDALCVEVLKTSAGL
2710 2720 2730 2740 2750 2760
2770 2780 2790 2800 2810 2820
pF1KA0 GLSLDGGKSSVTGDGPLVIKRVYKGGAAEQAGIIEAGDEILAINGKPLVGLMHFDAWNIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GLSLDGGKSSVTGDGPLVIKRVYKGGAAEQAGIIEAGDEILAINGKPLVGLMHFDAWNIM
2770 2780 2790 2800 2810 2820
2830
pF1KA0 KSVPEGPVQLLIRKHRNSS
:::::::::::::::::::
CCDS34 KSVPEGPVQLLIRKHRNSS
2830
>>CCDS53966.1 IL16 gene_id:3603|Hs108|chr15 (1331 aa)
initn: 1311 init1: 415 opt: 807 Z-score: 494.4 bits: 104.9 E(32554): 3.2e-21
Smith-Waterman score: 850; 27.1% identity (55.6% similar) in 1065 aa overlap (429-1450:66-1046)
400 410 420 430 440 450
pF1KA0 EAVAILRSATGMVQLVVASKENSAEDLLRLTSKSLPDLTSSVEDVSSWTDNEDQEADGEE
::.. : ::: :.. .. . .: :.
CCDS53 SPDEKYPDPFEISLAQGKEGIFHSSVQLADTSEAGP---SSVPDLALASEAAQLQAAGN-
40 50 60 70 80 90
460 470 480 490 500 510
pF1KA0 DEGTSSSVQRAMPGTDEPQDVCGAEESKGNLESPKQGSNKIKLKSRLSGGVHRLESVEEY
:.: . : . ... ...:. :.::. :.:: . :. . . ::. :
CCDS53 DRGKTCRRIFFM----KESSTASSREKPGKLEA--QSSNFLFPKACHQRARSNSTSVNPY
100 110 120 130 140
520 530 540 550 560 570
pF1KA0 NELMV------RNGDPRIRMLEVSRDGRKHSLPQLLDSSSASQEYHIVKKSTRSLSTTQV
. ... : :. : . ..:: : :: ... ... ::::::.:.
CCDS53 CTREIDFPMTKKSAAPTDRQ-PYSLCSNRKSLSQQLDCPAGKAAG--TSRPTRSLSTAQL
150 160 170 180 190 200
580 590 600 610 620 630
pF1KA0 ESPWRLIRPSVISIIGLYKEKGKGLGFSIAGGRDCIRGQMGIFVKTIFPNGSAAEDGRLK
.: .. :::: : :.: ..:::::::.::.: : : .::.::::: .:.:: ::::.
CCDS53 VQPSGGLQASVISNIVLMKGQAKGLGFSIVGGKDSIYGPIGIYVKTIFAGGAAAADGRLQ
210 220 230 240 250 260
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pF1KA0 EGDEILDVNGIPIKGLTFQEAIHTFKQIRSGLFVLTVRTKLVSPSLTPCSTPTHMSRSAS
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CCDS53 EGDEILELNGESMAGLTHQDALQKFKQAKKGLLTLTVRTRLTAPP-SLCS---HLSPPLC
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pF1KA0 PNFNTSGGASAGGSDEG-SSSSLGRKTPGPKDRIVMEVTLNKEPRVGLGIGACCLALENS
....: . .:. . : : .: :. ::..::.:.:: :::::: : . .
CCDS53 RSLSSSTCITKDSSSFALESPSAPISTAKPNYRIMVEVSLQKEAGVGLGIGLCSVPYFQC
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CCDS53 ISGIFVHTLSPGSVAHLDGRLRCGDEIVEISDSPVHCLTLNEVYTILSHCDPGPVPIIVS
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: . :. .: : .. ::. : ...:. : . :::. :. : : :.
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: : : : . .. : ::.. :. .. . . . : .. . ::: . :
CCDS53 SKPK--PPPRKYFKSDSDPQK-SLEERENSSCSSGHTPPTCGQEAREL-LPLLLPQEDTA
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: . . . . . .. . .: :: :.. ....: ...:.
CCDS53 GRSPSASAGCPGPGIG-PQTKSSTEGEPG--WRRASPVTQTSPIKHPLLKRQARMDYSFD
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: ...: : :: . ::. : : : ..:. . .: :. .:.:.
CCDS53 TTAEDPWVRISDCIKNLFSPIM-SENHG--HMP---LQPNASLNEEEGTQGHPDGTPPKL
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.:.: : .. : .. .. : : : : ...... : .::. :
CCDS53 DTANGTPKVYKSADSSTVKKGPPVAPKPAWFRQSLKGLRNRASDPRGLPDPALSTQPAPA
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CCDS53 SR-EHL-GSHIRAS--SSSSSIRQRISSFETFGSSQLPDKGAQRLSLQPS-------SGE
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...: . . . .. .:. .:.. : ....: :..:. . . .: :
CCDS53 AAKPLGKHEEGRFSGLLGRGAAPTLVPQQ--PEQVLSSGSPAA-SEARDPGVSESPPPGR
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CCDS53 Q-PNQKTLPPGPD---PLLRLLSTQAEESQGPVLKMPSQRARSFPLTRSQSCETKLLDEK
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: : . .: : : . :: :::. . :... : : . ::... . :
CCDS53 TSKLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSIS----CAQTP--CIPKEG-ASPTSSSNE-----D
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..: : ... :.:
CCDS53 SAANGSAETSALDTGFSLNLSELREYTEGLTEAKEDDDGDHSSLQSGQSVISLLSSEELK
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>--
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CCDS53 TSALDTGFSLNLSELREYTEGLTEAKEDDDGDHSSLQSGQSVISLLSSEELKKLIEEVKV
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CCDS53 SDVSVE---------STEATVCTVTLEKMSAGLGFSLEGGKGSLHGDKPLTINRIFKGAA
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CCDS53 S
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pF1KA0 EGDEILDVNGIPIKGLTFQEAIHTFKQIRSGLFVLTVRTKLVSPSLTPCSTPTHMSRSAS
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CCDS42 EGDEILELNGESMAGLTHQDALQKFKQAKKGLLTLTVRTRLTAPP-SLCS---HLSPPLC
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pF1KA0 PNFNTSGGASAGGSDEG-SSSSLGRKTPGPKDRIVMEVTLNKEPRVGLGIGACCLALENS
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CCDS42 RSLSSSTCITKDSSSFALESPSAPISTAKPNYRIMVEVSLQKEAGVGLGIGLCSVPYFQC
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CCDS42 ISGIFVHTLSPGSVAHLDGRLRCGDEIVEISDSPVHCLTLNEVYTILSHCDPGPVPIIVS
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CCDS42 RHPDPQVSEQQLKEAVAQAVENTKFGKERHQWSLEGVKRLESSWHGRPTLEKEREKNSAP
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: : : : . .. : ::.. :. .. . . . : .. . ::: . :
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: . . . . . .. . .: :: :.. ....: ...:.
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CCDS42 TSKLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSIS----CAQTP--CIPKEG-ASPTSSSNE-----D
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CCDS10 MDYSFDTTAEDPWVRISDCIKNLFSPIMSENHGHMPLQPNASLNEEEGTQGHP
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CCDS10 DGTPPKLDTANGT--PKVYKSADSSTVKKG--PPVAPKPAWF--RQSLKGLRNRASDPRG
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: :. ..:.: . . :.: :..:::.:::..... :. .
CCDS10 -----LPDPALSTQPAPASREHL---GSHIRASSSSSSIRQRISSFETFGSSQLPDKGAQ
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. . .: . ..:: .:.. : . :: ::. :: :. .. ::: : :::
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: ...:: .:: .: : : :. :. . . .: : .: .:
CCDS10 --PGVSESPP-----PGRQPNQKTLPPGPDPLLRL-LSTQAEESQGPVLKMPSQRARSF-
220 230 240 250 260
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:..::. : . ::. :. :: . :....:. : . : .
CCDS10 ------PLTRSQSCETKL-----LDEKTSKLYSISSQVSSAVMKSLLCLPSSIS----CA
270 280 290 300 310
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. : : : : : .:. . :::. . .:: ::: . .: : .. .: . .
CCDS10 QTPCIPKEG--ASPTSSSNEDSAANGSAETSALDTGFSL-NLSELREYTEGLTEAKEDDD
320 330 340 350 360
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