Result of FASTA (omim) for
pFN21AA0002
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KA0002, 548 aa
1>>>pF1KA0002 548 - 548 aa - 548 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2581+/-0.000444; mu= 18.4355+/- 0.027
mean_var=60.8069+/-12.267, 0's: 0 Z-trim(109.0): 54 B-trim: 175 in 2/50
Lambda= 0.164474
statistics sampled from 17118 (17168) to 17118 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 8.110
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_036205 (OMIM: 256840,610150) T-complex protein ( 541) 835 207.2 1e-52
NP_001293082 (OMIM: 256840,610150) T-complex prote ( 520) 828 205.6 3.2e-52
NP_001293085 (OMIM: 256840,610150) T-complex prote ( 503) 819 203.4 1.4e-51
NP_006421 (OMIM: 605142) T-complex protein 1 subun ( 539) 815 202.5 2.8e-51
NP_005989 (OMIM: 600114) T-complex protein 1 subun ( 545) 761 189.7 2e-47
NP_006420 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 subun ( 543) 738 184.2 8.9e-46
NP_006422 (OMIM: 605139) T-complex protein 1 subun ( 535) 682 170.9 8.8e-42
NP_001185771 (OMIM: 605139) T-complex protein 1 su ( 488) 648 162.8 2.2e-39
NP_001008800 (OMIM: 600114) T-complex protein 1 su ( 507) 640 160.9 8.4e-39
XP_011530781 (OMIM: 605140) PREDICTED: T-complex p ( 499) 639 160.7 9.8e-39
XP_011530780 (OMIM: 605140) PREDICTED: T-complex p ( 499) 639 160.7 9.8e-39
NP_001159757 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 su ( 499) 639 160.7 9.8e-39
NP_001243650 (OMIM: 605142) T-complex protein 1 su ( 509) 628 158.1 6.1e-38
NP_001293084 (OMIM: 256840,610150) T-complex prote ( 448) 609 153.6 1.2e-36
NP_001293083 (OMIM: 256840,610150) T-complex prote ( 486) 609 153.6 1.3e-36
NP_001753 (OMIM: 104613) T-complex protein 1 subun ( 531) 522 133.0 2.3e-30
NP_001159756 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 su ( 456) 517 131.7 4.7e-30
NP_006575 (OMIM: 610730) T-complex protein 1 subun ( 530) 516 131.5 6.3e-30
NP_001008897 (OMIM: 186980) T-complex protein 1 su ( 401) 509 129.8 1.6e-29
NP_110379 (OMIM: 186980) T-complex protein 1 subun ( 556) 499 127.5 1.1e-28
XP_016879512 (OMIM: 610730) PREDICTED: T-complex p ( 464) 498 127.2 1.1e-28
NP_001009570 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 su ( 339) 428 110.6 8.3e-24
NP_001180459 (OMIM: 610730) T-complex protein 1 su ( 485) 410 106.4 2.2e-22
NP_001009186 (OMIM: 104613) T-complex protein 1 su ( 486) 397 103.3 1.8e-21
XP_011522505 (OMIM: 610730) PREDICTED: T-complex p ( 388) 393 102.3 2.9e-21
XP_016879513 (OMIM: 610730) PREDICTED: T-complex p ( 351) 375 98.0 5.2e-20
NP_001180458 (OMIM: 610730) T-complex protein 1 su ( 493) 237 65.3 5e-10
NP_061336 (OMIM: 209900,236700,604896,605231) McKu ( 570) 166 48.5 6.7e-05
NP_740754 (OMIM: 209900,236700,604896,605231) McKu ( 570) 166 48.5 6.7e-05
>>NP_036205 (OMIM: 256840,610150) T-complex protein 1 su (541 aa)
initn: 745 init1: 339 opt: 835 Z-score: 1067.2 bits: 207.2 E(85289): 1e-52
Smith-Waterman score: 835; 31.8% identity (66.8% similar) in 509 aa overlap (24-524:30-533)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNK
::: :. .:.: : .:.: ::. ::::..:
NP_036 MASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLE-ALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 MVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLEL
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NP_036 MMVDKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 AEELLRIGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYG
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NP_036 AEQLLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 N-EVFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDN--IRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKE-TEGD
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NP_036 SCHRQMAEIAVNAVLTV-ADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KA0 VTS-VKDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGAN
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NP_036 MPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGAN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KA0 VVVTGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDS
... : : : . :. :: . ... . ..:. .::.. . :..:
NP_036 LAICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 VYLSEVGDTQ--VVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKR
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NP_036 VQEISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAV-TIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNR
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 LVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKL
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NP_036 VVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 YAVH-QEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIM
: . .: : .:.: . ...:: . ...: .:: :.:::. . .:..:.:
NP_036 RARQVKEMNPALGIDCLHK--GTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRK
480 490 500 510 520 530
530 540
pF1KA0 AKPAGGPKPPSGKKDWDDDQND
NP_036 PGESEE
540
>>NP_001293082 (OMIM: 256840,610150) T-complex protein 1 (520 aa)
initn: 736 init1: 330 opt: 828 Z-score: 1058.5 bits: 205.6 E(85289): 3.2e-52
Smith-Waterman score: 828; 31.3% identity (65.7% similar) in 508 aa overlap (25-524:9-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHL
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NP_001 MNSSLGPTIEKLSVSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKD
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLR
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NP_001 GDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLD
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KA0 IGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYGN-EVFL
:. .. .::: : : : : : .. ...: . . . .:.. :: .. . .
NP_001 RGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQM
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 AKLIAQACVSIFPDSGHFNVDN--IRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVT--SVK
:.. ..: ... : . .:: :.: .:. . ......:.. :. .:.
NP_001 AEIAVNAVLTV-ADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 DAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTGG
:::::. .:::. .:: . . ..:. ..: :.. .. ... : .::::...
NP_001 DAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQW
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 KVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSEV
: : : . :. :: . ... . ..:. .::.. . :..: :
NP_001 GFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISF
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 GDTQ--VVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGGG
: :. ..:... :.. :. :: .::.. .... .:.. :.. ... : ::.:.: :::
NP_001 GTTKDKMLVIEQCKNSRAV-TIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KA0 ATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVH-Q
:.:: : ... .. :: :::::.. ::.:.:.:: ::.::::.. ...... : . .
NP_001 AAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVK
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 EGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGG
: : .:.: . ...:: . ...: .:: :.:::. . .:..:.:
NP_001 EMNPALGIDCLHK--GTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
470 480 490 500 510 520
540
pF1KA0 PKPPSGKKDWDDDQND
>>NP_001293085 (OMIM: 256840,610150) T-complex protein 1 (503 aa)
initn: 730 init1: 324 opt: 819 Z-score: 1047.2 bits: 203.4 E(85289): 1.4e-51
Smith-Waterman score: 819; 31.5% identity (65.9% similar) in 498 aa overlap (35-524:2-495)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 VPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHLEKLF
: : .:.: ::. ::::..::.... .
NP_001 MAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 VTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLRIGLS
::::.:::: ..:.: ::..: :. :..:.::::. :.:.:::::: ::.:: :.
NP_001 VTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIH
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KA0 VSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYGN-EVFLAKLI
.. .::: : : : : : .. ...: . . . .:.. :: .. . .:..
NP_001 PIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIA
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KA0 AQACVSIFPDSGHFNVDN--IRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVT--SVKDAKI
..: ... : . .:: :.: .:. . ......:.. :. .:.::::
NP_001 VNAVLTV-ADMERRDVDFELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKI
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 AVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTGGKVAD
:. .:::. .:: . . ..:. ..: :.. .. ... : .::::... :
NP_001 AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKETGANLAICQWGFDD
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KA0 MALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSEVGDTQ
: : . :. :: . ... . ..:. .::.. . :..: : : :.
NP_001 EANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLVQEISFGTTK
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KA0 --VVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGGGATEI
..:... :.. :. :: .::.. .... .:.. :.. ... : ::.:.: ::::.::
NP_001 DKMLVIEQCKNSRAV-TIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVVYGGGAAEI
340 350 360 370 380
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pF1KA0 ELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVH-QEGNK
: ... .. :: :::::.. ::.:.:.:: ::.::::.. ...... : . .: :
NP_001 SCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRARQVKEMNP
390 400 410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KA0 NVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPP
.:.: . ...:: . ...: .:: :.:::. . .:..:.:
NP_001 ALGIDCLHK--GTNDMKQQHVIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGESEE
450 460 470 480 490 500
540
pF1KA0 SGKKDWDDDQND
>>NP_006421 (OMIM: 605142) T-complex protein 1 subunit d (539 aa)
initn: 634 init1: 303 opt: 815 Z-score: 1041.6 bits: 202.5 E(85289): 2.8e-51
Smith-Waterman score: 815; 29.2% identity (66.5% similar) in 511 aa overlap (30-528:35-539)
10 20 30 40 50
pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINH
. ::.: : .:.. ::. ::.::.::. .
NP_006 VAPRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KA0 LEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELL
. .:::.::::....: ::::.:.: :. :. :.::::. :...::.::. .::
NP_006 KGDVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KA0 RIGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSK---QYGNE
. :. . . :... : .:. ::: .. .: : . . . ::. :: ::..
NP_006 QKGIHPTIISESFQKALEKGIEILTDM--SRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYSS-
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 VFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVD--NIRVCKILGSGISSSSVLHGMVF-KKETEGDVTS
.:. . ..: .... . .:: .:.. : ::. :.. ...:.:. .: ... .:
NP_006 -LLSPMSVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGITR
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 VKDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVT
:. :::.. . ... :. . .... .. . :. . :: : :: ::..
NP_006 VEKAKIGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQIKKTGCNVLLI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KA0 GGKV-----ADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCD
.. .:.:::. ::..::... . :.. .:::.:. . .. . . .: .
NP_006 QKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADMLGSAE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 -SVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKR
. .. :. ... . : :::.:::. .... ::.. :.. ... :.. .
NP_006 LAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLVKKRA
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 LVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKL
:. :::: ::::: ..: :..: :.:.: .. ::.:.:.:: .::::.:.. ....:
NP_006 LIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTEL
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 YAVHQEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMA
: .:.:..:.... .....:: ... : . :. :::... ..:..:... .
NP_006 RNRHAQGEKTAGINVRK--GGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVVNT
490 500 510 520 530
530 540
pF1KA0 KPAGGPKPPSGKKDWDDDQND
.
NP_006 R
>>NP_005989 (OMIM: 600114) T-complex protein 1 subunit g (545 aa)
initn: 750 init1: 326 opt: 761 Z-score: 972.3 bits: 189.7 E(85289): 2e-47
Smith-Waterman score: 769; 30.5% identity (62.5% similar) in 547 aa overlap (14-547:9-534)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHL
.:....:. :: ... ::.: : .:. :: ::..: ::... .
NP_005 MMGHRPVLVLSQNTKRESG-RKVQSGNINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KA0 EKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLR
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NP_005 GGIVMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KA0 IGLSVSEVIEGYEIACRKA-HEILPNLVCCSAK-NLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYGNEVF
. . :: .: ::: ... .: : .. : : . ... .:: .: .
NP_005 QQMHPTVVISAY----RKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KA0 LAKLIAQACVSI--FPDSGHFNVD---NIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVTS
:: :: :.. : ..:. ..: :: :: :. : .: ::.:....:..
NP_005 LACNIALDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KA0 --VKDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVV
.:. .:.. . .. :.. . : :.. . . ::. .. . : . .::
NP_005 RYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KA0 VTGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEE--MGHCDS
.: ..:.: :: . :: .: : : :. .. :: . : : :.: .: .
NP_005 ITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSR--PEELREDDVGTGAG
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KA0 VY-LSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRL
. ....:: . .: . .: ::.:::.. ......:: ..:.... . . : .:
NP_005 LLEIKKIGD-EYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQL
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KA0 VPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLY
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NP_005 VPGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLR
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KA0 AVH-QEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMA
: : ::. .. : ...:. .. :: : :: . : . : :...:: .::.:.:.
NP_005 AKHTQENCETWG--VNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIV--
470 480 490 500 510 520
530 540
pF1KA0 KPAGGPKPPSGKKDWDDDQND
::.: :::.
NP_005 ---------SGHKKKGDDQSRQGGAPDAGQE
530 540
>>NP_006420 (OMIM: 605140) T-complex protein 1 subunit e (543 aa)
initn: 522 init1: 274 opt: 738 Z-score: 942.8 bits: 184.2 E(85289): 8.9e-46
Smith-Waterman score: 738; 27.7% identity (62.7% similar) in 528 aa overlap (9-525:3-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHL
: . .::::. .:. . : ::.::. .:...::. :: ::.:....
NP_006 MMPTPVILLKEGTDSSQGIPQLV-SNISACQVIAEAVRTTLGPRGMDKLIVDGR
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pF1KA0 EKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLR
: ..::.::::. :.: ::::: .: .. :. ::::::. : ..:. .:. .. ..
NP_006 GKATISNDGATILKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVE
60 70 80 90 100 110
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pF1KA0 IGLSVSEVIEGY----EIACRKAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSL--LRTSIMSKQYG
:: . .:... ..: : .:: .. . . : . : .. : ....:.:
NP_006 EGLHPQIIIRAFRTATQLAVNKIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQ--
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pF1KA0 NEVFLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKET-----EG
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NP_006 -KAFFAKMVVDA-VMMLDDLLQLKMIGIK--KVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEM
180 190 200 210 220
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pF1KA0 DVTSVKDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGAN
. . .. :::. . .. . .. . ..:.:. . . .: :.. ... : .::.
NP_006 QPKKYHNPKIALLNVELELKAEKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAK
230 240 250 260 270 280
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pF1KA0 VVVTGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDS
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NP_006 VVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQV
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pF1KA0 VYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLV
...: . : . . :..:::.....:.. ::.. :.. . .. .:
NP_006 FEETQIGGERYNFFTGCPK-AKTCTFILRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSVV
350 360 370 380 390 400
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pF1KA0 PGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYA
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NP_006 AGGGAIEMELSKYLRDYSRTIPGKQQLLIGAYAKALEIIPRQLCDNAGFDATNILNKLRA
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pF1KA0 VHQEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKP
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NP_006 RHAQGGTWYGVDINNE--DIADNFEAFVWEPAMVRINALTAASEAACLIVSVDETIKNPR
470 480 490 500 510 520
530 540
pF1KA0 AGGPKPPSGKKDWDDDQND
NP_006 STVDAPTAAGRGRGRGRPH
530 540
>>NP_006422 (OMIM: 605139) T-complex protein 1 subunit b (535 aa)
initn: 389 init1: 286 opt: 682 Z-score: 871.1 bits: 170.9 E(85289): 8.8e-42
Smith-Waterman score: 682; 27.3% identity (64.0% similar) in 528 aa overlap (8-529:7-525)
10 20 30 40 50 60
pF1KA0 MALHVPKAPGFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHL
:: ....: :: . . : : .. . ... .... ::.::.:....
NP_006 MASLSLAP--VNIFKAGADEERA-ETARLTSFIGAIAIGDLVKSTLGPKGMDKILLSSG
10 20 30 40 50
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pF1KA0 E--KLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEEL
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NP_006 RDASLMVTNDGATILKNIGVDNPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESL
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pF1KA0 LRIGLSVSEVIEGYEIACRKAHE-ILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYGNEV
. . . .: :.. : . :.: .: . : .. ... ... .. :.. :: ..
NP_006 IAKKIHPQTIIAGWREATKAAREALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHK
120 130 140 150 160 170
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pF1KA0 -FLAKLIAQACVSIFPDSGHFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVF-KKETEGDVTSVK
..:: ..: . . .: :.. :.. : ::.....: . .:... :: .. ..
NP_006 DHFTKLAVEAVLRL---KGSGNLEAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVNQPKRIE
180 190 200 210 220 230
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pF1KA0 DAKIAVYSCPFDGMITETKGT-VLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTG
.::: . . .: . :. : . .. .. .. ..:.. : .:. : : : ..
NP_006 NAKILIANTGMDTDKIKIFGSRVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINR
240 250 260 270 280 290
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pF1KA0 GKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSE
. .. . . ..: .. . ..:: ..:. . : : ..: : .
NP_006 QLIYNYPEQLFGAAGVMAIEHADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVM
300 310 320 330 340 350
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pF1KA0 VGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGGGA
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NP_006 IGEDKLIHFSGVAL-GEACTIVLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGC
360 370 380 390 400 410
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pF1KA0 TEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVHQEG
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NP_006 SEMLMAHAVTQLANRTPGKEAVAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAHSEG
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pF1KA0 NKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPK
: ..:::.. .. :: :: ... : .. :..:: ..::::.:: : :
NP_006 NTTAGLDMRE--GTIGDMAILGITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVP
480 490 500 510 520 530
540
pF1KA0 PPSGKKDWDDDQND
NP_006 DHHPC
>>NP_001185771 (OMIM: 605139) T-complex protein 1 subuni (488 aa)
initn: 356 init1: 286 opt: 648 Z-score: 828.1 bits: 162.8 E(85289): 2.2e-39
Smith-Waterman score: 648; 27.7% identity (64.3% similar) in 484 aa overlap (52-529:1-478)
30 40 50 60 70
pF1KA0 FSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHLE--KLFVTNDAATILRELEVQ
:.:.... . .:.::::.::::... :.
NP_001 MDKILLSSGRDASLMVTNDGATILKNIGVD
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KA0 HPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIACRKA
.::::..: :..:..::::::. : :.:. ::. :: :. . . .: :.. : . :
NP_001 NPAAKVLVDMSRVQDDEVGDGTTSVTVLAAELLREAESLIAKKIHPQTIIAGWREATKAA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 HE-ILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSLLRTSIMSKQYGNEV-FLAKLIAQACVSIFPDSGHF
.: .: . : .. ... ... .. :.. :: .. ..:: ..: . . .:
NP_001 REALLSSAVDHGSDEVKFRQDLMNIAGTTLSSKLLTHHKDHFTKLAVEAVLRL---KGSG
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 NVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVF-KKETEGDVTSVKDAKIAVYSCPFDGMITETKGT
:.. :.. : ::.....: . .:... :: .. ...::: . . .: . :.
NP_001 NLEAIHIIKKLGGSLADSYLDEGFLLDKKIGVNQPKRIENAKILIANTGMDTDKIKIFGS
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 -VLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTGGKVADMALHYANKYNIMLVRL
: . .. .. .. ..:.. : .:. : : : .. . .. . . ..: ..
NP_001 RVRVDSTAKVAEIEHAEKEKMKEKVERILKHGINCFINRQLIYNYPEQLFGAAGVMAIEH
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 NSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTI
. ..:: ..:. . : : ..: : . .:. ... :. : ::
NP_001 ADFAGVERLALVTGGEIASTFDHPELVKLGSCKLIEEVMIGEDKLIHFSGVAL-GEACTI
270 280 290 300 310 320
380 390 400 410 420 430
pF1KA0 VLRGSTDNLMDDIERAVDDGVNTFKVLTRDKRLVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQ
::::.:....:. ::.. :.. .. ..:.: : ::: .:. .:. .:. .. :: :
NP_001 VLRGATQQILDEAERSLHDALCVLAQTVKDSRTVYGGGCSEMLMAHAVTQLANRTPGKEA
330 340 350 360 370 380
440 450 460 470 480 490
pF1KA0 YAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVHQEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEA
:....:.:.. .: .:.:.: . .....: :.:.::: ..:::.. .. ::
NP_001 VAMESYAKALRMLPTIIADNAGYDSADLVAQLRAAHSEGNTTAGLDMRE--GTIGDMAIL
390 400 410 420 430 440
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pF1KA0 GILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKKDWDDDQND
:: ... : .. :..:: ..::::.:: : :
NP_001 GITESFQVKRQVLLSAAEAAEVILRVDNIIKAAPRKRVPDHHPC
450 460 470 480
>>NP_001008800 (OMIM: 600114) T-complex protein 1 subuni (507 aa)
initn: 629 init1: 326 opt: 640 Z-score: 817.6 bits: 160.9 E(85289): 8.4e-39
Smith-Waterman score: 648; 29.6% identity (61.3% similar) in 486 aa overlap (75-547:31-496)
50 60 70 80 90 100
pF1KA0 TAYGPNGMNKMVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFV
...::::::: .. :. :..::::::. :
NP_001 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSGNINAAKIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSV
10 20 30 40 50 60
110 120 130 140 150 160
pF1KA0 LVFAGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIACRKA-HEILPNLVCCSAK-NLRDIDEVSS
...:: .: .::..:. . . :: .: ::: ... .: : .. : : . .
NP_001 IILAGEMLSVAEHFLEQQMHPTVVISAY----RKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLN
70 80 90 100 110
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pF1KA0 LLRTSIMSKQYGNEVFLAKLIAQACVSI--FPDSGHFNVD---NIRVCKILGSGISSSSV
.. .:: .: . :: :: :.. : ..:. ..: :: :: :. : .: :
NP_001 IINSSITTKAISRWSSLACNIALDAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCV
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KA0 LHGMVFKKETEGDVTS--VKDAKIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENL
:.:....:.. .:. .:.. . .. :.. . : :.. . . ::.
NP_001 LRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPRIVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEY
180 190 200 210 220 230
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pF1KA0 MDAQVKAIADTGANVVVTGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPR
.. . : . .::.: ..:.: :: . :: .: : : :. .. :: . :
NP_001 IQQLCEDIIQLKPDVVITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSR
240 250 260 270 280 290
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pF1KA0 LTPPVLEE--MGHCDSVY-LSEVGDTQVVVFKHEKEDGAISTIVLRGSTDNLMDDIERAV
: :.: .: .. ....:: . .: . .: ::.:::.. ......:: .
NP_001 --PEELREDDVGTGAGLLEIKKIGD-EYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNL
300 310 320 330 340 350
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pF1KA0 DDGVNTFKVLTRDKRLVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRAL
.:.... . . : .:::::::.:. .:. .: ... :.::. . :.:.:.:::.:
NP_001 QDAMQVCRNVLLDPQLVPGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTL
360 370 380 390 400 410
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pF1KA0 AENSGVKANEVISKLYAVH-QEGNKNVGLDIEAEVPAVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLA
.: :... .....: : : ::. .. : ...:. .. :: : :: . : . : :
NP_001 IQNCGASTIRLLTSLRAKHTQENCETWG--VNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTA
420 430 440 450 460 470
520 530 540
pF1KA0 TNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGKKDWDDDQND
...:: .::.:.:. ::.: :::.
NP_001 VETAVLLLRIDDIV-----------SGHKKKGDDQSRQGGAPDAGQE
480 490 500
>>XP_011530781 (OMIM: 605140) PREDICTED: T-complex prote (499 aa)
initn: 428 init1: 274 opt: 639 Z-score: 816.4 bits: 160.7 E(85289): 9.8e-39
Smith-Waterman score: 639; 26.6% identity (62.1% similar) in 485 aa overlap (52-525:1-476)
30 40 50 60 70 80
pF1KA0 FSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHP
:.:.... : ..::.::::. :.: ::
XP_011 MDKLIVDGRGKATISNDGATILKLLDVVHP
10 20 30
90 100 110 120 130
pF1KA0 AAKMIVMASHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGY----EIACR
::: .: .. :. ::::::. : ..:. .:. .. .. :: . .:... ..:
XP_011 AAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLKQVKPYVEEGLHPQIIIRAFRTATQLAVN
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KA0 KAHEILPNLVCCSAKNLRDIDEVSSL--LRTSIMSKQYGNEVFLAKLIAQACVSIFPDSG
: .:: .. . . : . : .. : ....:.: ..:.::....: : .. :
XP_011 KIKEIAVTVKKADKVEQRKLLEKCAMTALSSKLISQQ---KAFFAKMVVDA-VMMLDDLL
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KA0 HFNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKET-----EGDVTSVKDAKIAVYSCPFDGMI
.... .:. :. :... .:... :..::: : . . .. :::. . ..
XP_011 QLKMIGIK--KVQGGALEDSQLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKKYHNPKIALLNVELELKA
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KA0 TETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTGGKVADMALHYANKYNI
. .. . ..:.:. . . .: :.. ... : .::.::.. ..:.: .: ..
XP_011 EKDNAEIRVHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEKIHHSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDM
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KA0 MLVRLNSKWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSEVGDTQVVVFKHEKEDG
. . . ::.: . :.. .. . .:.:. ...: . : . .
XP_011 FCAGRVPEEDLKRTMMACGGSIQTSVNALSADVLGRCQVFEETQIGGERYNFFTGCPK-A
270 280 290 300 310 320
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