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# NO CUT ENZYMES ( 174 enzymes) #
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AatII Acc65I AccI AccII AclI
AcsI AcyI AfaI AflII AgeI
AhdI Alw44I AlwNI AocI Aor51HI
ApaI ApaLI ApoI AscI AseI
AsnI Asp700I Asp718I AspEI AspHI
AspI AvaI AviII AvrII BalI
BamHI BanI BanII BbeI BbsI
BbvCI BcgI BciVI BclI BfrI
BglI BlnI BlpI BmyI Bpu1102I
BpuAI BsaHI BsaI BsiEI BsiHKAI
BsiWI BsmAI BsmBI BsmI BsoBI
Bsp1286I Bsp1407I BspDI BspHI BspMI
BsrBI BsrDI BsrFI BsrGI BssHII
Bst1107I BstAPI BstBI BstEII BstNI
BstPI BstUI BstZ17I Bsu36I CelII
CfoI Cfr10I ClaI CpoI DraI
DraII DrdI DsaI EagI Eam1105I
EclXI Eco47III Eco52I Eco81I EcoNI
EcoO109I EcoO65I EcoRI EcoRII EcoRV
EcoT22I FauI FbaI FseI FspI
HaeII HgaI HhaI Hin1I HinP1I
HincII HindII HindIII HpaI KasI
KpnI KspI MaeIII MfeI MluI
MluNI MscI MunI MvaI MvnI
NaeI NarI NcoI NdeI NgoMIV
NheI NlaIV NotI NruI NsiI
NspV PacI PaeR7I PflFI PflMI
PinAI PmeI PpuMI PshAI PshBI
Psp1406I PstI PvuI RcaI RsaI
RsrII SacI SacII SalI SbfI
ScaI SexAI SfiI SfoI SfuI
SgrAI SmaI SnaBI SpeI SphI
Sse8387I SspBI SspI StuI SwaI
Tsp45I Tth111I Van91I XbaI XcmI
XhoI XmaCI XmaI XmnI
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# ONE CUT ENZYMES ( 33 enzymes) #
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AccIII 272 TCCGGA T^CCGGA
AlwI 539 GGATC GGATC(4/5)
BbrPI 724 CACGTG CAC^GTG
BglII 143 AGATCT A^GATCT
BsaAI 724 CACGTG [CT]AC^GT[GA]
BsaJI 218 CCAAGG C^C[ACGT][ACGT]GG
BsaWI 272 TCCGGA [AT]^CCGG[AT]
BseAI 272 TCCGGA T^CCGGA
BsgI 194 CTGCAC GTGCAG(16/14)
BsiYI 768 CCAGAGTCAGG CC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GG
BslI 768 CCAGAGTCAGG CC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GG
BsmFI 585 GGGAC GGGAC(10/14)
BspEI 272 TCCGGA T^CCGGA
BsrI 466 ACTGG ACTGG(1/-1)
BssSI 737 CACGAG CACGAG(-5/-1)
BstXI 656 CCATGCTGGTGG CCA[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT]TGG
BstYI 143 AGATCT [GA]^GATC[CT]
Cac8I 564 GCAAGC GC[ACGT]^[ACGT]GC
DraIII 712 CACACAGTG CAC[ACGT][ACGT][ACGT]^GTG
EaeI 521 CGGCCA [CT]^GGCC[GA]
EarI 285 GAAGAG CTCTTC(1/4)
EcoT14I 218 CCAAGG C^C[AT][AT]GG
Ksp632I 285 GAAGAG CTCTTC(1/4)
MflI 143 AGATCT [GA]^GATC[CT]
MroI 272 TCCGGA T^CCGGA
MwoI 441 GCGAATCCAGC GC[ACGT][ACGT][ACGT][ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]GC
PmaCI 724 CACGTG CAC^GTG
PmlI 724 CACGTG CAC^GTG
SapI 285 GAAGAGC GCTCTTC(1/4)
SfcI 177 CTACAG C^T[GA][CT]AG
SmlI 410 CTCAAG C^T[CT][GA]AG
StyI 218 CCAAGG C^C[AT][AT]GG
XhoII 143 AGATCT [GA]^GATC[CT]
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# TWO CUT ENZYMES ( 29 enzymes) #
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AciI 61 GCGG CCGC(-3/-1)
450 GCGG
AflIII 153 ACATGT A^C[GA][CT]GT
638 ACATGT
AvaII 6 GGACC G^G[AT]CC
720 GGACC
BcnI 519 CCCGG CC^[GC]GG
779 CCCGG
BfaI 229 CTAG C^TAG
808 CTAG
BsaBI 69 GATTGCTATC GAT[ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]ATC
792 GATAATTATC
BspLU11I 153 ACATGT A^CATGT
638 ACATGT
BssKI 519 CCCGG ^CC[ACGT]GG
779 CCCGG
BstF5I 45 GGATG GGATG(2/0)
222 GGATG
DpnII 144 GATC ^GATC
540 GATC
FokI 45 GGATG GGATG(9/13)
222 GGATG
HphI 387 GGTGA GGTGA(8/7)
676 GGTGA
MaeI 229 CTAG C^TAG
808 CTAG
MaeII 269 ACGT A^CGT
725 ACGT
MamI 69 GATTGCTATC GAT[ACGT][ACGT]^[ACGT][ACGT]ATC
792 GATAATTATC
MboI 144 GATC ^GATC
540 GATC
MseI 131 TTAA T^TAA
251 TTAA
NciI 519 CCCGG CC^[GC]GG
779 CCCGG
NdeII 144 GATC ^GATC
540 GATC
NspI 153 ACATGT [GA]CATG^[CT]
638 ACATGT
PleI 547 GACTC GAGTC(4/5)
771 GAGTC
PvuII 19 CAGCTG CAG^CTG
34 CAGCTG
Sau3AI 144 GATC ^GATC
540 GATC
ScrFI 519 CCCGG CC^[ACGT]GG
779 CCCGG
SfaNI 58 GATGC GCATC(5/9)
620 GCATC
TaqI 77 TCGA T^CGA
458 TCGA
Tru9I 131 TTAA T^TAA
251 TTAA
TspRI 573 CAGTG CA[GC]TG[ACGT][ACGT]^
716 CAGTG
TthHB8I 77 TCGA T^CGA
458 TCGA
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# 3 OR MORE CUT ENZYMES ( 22 enzymes) #
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AluI BbvI BpmI BseRI Cfr13I
DdeI Fnu4HI HaeIII HapII HinfI
HpaII ItaI MboII MnlI MslI
MspA1I MspI NlaIII Sau96I TfiI
TseI Tsp509I