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# NO CUT ENZYMES ( 205 enzymes) #
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AatII Acc65I AccI AccII AccIII
AclI AcyI AfaI AflII AflIII
AgeI AhdI AluI Alw44I AlwNI
AocI Aor51HI ApaI ApaLI AscI
AseI AsnI Asp700I Asp718I AspEI
AspHI AspI AvaI AviII AvrII
BalI BamHI BanI BanII BbeI
BbrPI BbsI BbvCI BbvI BcgI
BclI BcnI BfaI BfrI BglI
BglII BlnI BlpI BmyI BpmI
Bpu1102I BpuAI BsaAI BsaBI BsaHI
BsaI BseAI BseRI BsgI BsiEI
BsiHKAI BsiWI BsiYI BslI BsmAI
BsmBI BsmFI BsoBI Bsp1286I Bsp1407I
BspDI BspEI BspHI BspLU11I BspMI
BsrBI BsrFI BsrGI BssHII BssSI
Bst1107I BstAPI BstEII BstF5I BstPI
BstUI BstXI BstYI BstZ17I Bsu36I
Cac8I CelII Cfr10I ClaI CpoI
DraI DraII DraIII DrdI EaeI
EagI Eam1105I EarI EclXI Eco47III
Eco52I Eco81I EcoNI EcoO109I EcoO65I
EcoRV EcoT22I FauI FbaI FokI
FseI FspI HaeII HaeIII HgaI
Hin1I HincII HindII HindIII HpaI
KasI KpnI Ksp632I KspI MaeI
MamI MboII MfeI MflI MluI
MluNI MroI MscI MslI MspA1I
MunI MvnI MwoI NaeI NarI
NciI NcoI NdeI NgoMIV NheI
NlaIII NotI NruI NsiI NspI
PacI PaeR7I PflFI PflMI PinAI
PmaCI PmeI PmlI PpuMI PshAI
PshBI Psp1406I PstI PvuI PvuII
RcaI RsaI RsrII SacI SacII
SalI SapI SbfI ScaI SexAI
SfcI SfiI SfoI SgrAI SmaI
SmlI SnaBI SpeI SphI Sse8387I
SspBI SspI StuI SwaI TseI
TspRI Tth111I Van91I XbaI XcmI
XhoI XhoII XmaCI XmaI XmnI
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# ONE CUT ENZYMES ( 32 enzymes) #
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AciI 78 CCGC CCGC(-3/-1)
AlwI 231 GGATC GGATC(4/5)
AvaII 154 GGACC G^G[AT]CC
BciVI 12 GGATAC GTATCC(6/5)
BsaWI 16 ACCGGA [AT]^CCGG[AT]
BsmI 164 GAATGC GAATGC(1/-1)
BsrDI 345 CATTGC GCAATG(2/0)
BsrI 157 CCAGT ACTGG(1/-1)
BssKI 322 CCAGG ^CC[ACGT]GG
BstNI 322 CCAGG CC^[AT]GG
CfoI 125 GCGC GCG^C
Cfr13I 154 GGACC G^G[ACGT]CC
DpnII 232 GATC ^GATC
DsaI 29 CCGTGG C^C[GA][CT]GG
EcoRII 322 CCAGG ^CC[AT]GG
EcoT14I 92 CCTTGG C^C[AT][AT]GG
Fnu4HI 77 GCCGC GC^[ACGT]GC
HhaI 125 GCGC GCG^C
HinP1I 125 GCGC G^CGC
ItaI 77 GCCGC GC^[ACGT]GC
MaeIII 340 GTCAC ^GT[ACGT]AC
MboI 232 GATC ^GATC
MvaI 322 CCAGG CC^[AT]GG
NdeII 232 GATC ^GATC
NlaIV 33 GGAGCC GG[ACGT]^[ACGT]CC
PleI 260 GACTC GAGTC(4/5)
Sau3AI 232 GATC ^GATC
Sau96I 154 GGACC G^G[ACGT]CC
ScrFI 322 CCAGG CC^[ACGT]GG
SfaNI 352 GATGC GCATC(5/9)
StyI 92 CCTTGG C^C[AT][AT]GG
Tsp45I 340 GTCAC ^GT[GC]AC
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# TWO CUT ENZYMES ( 16 enzymes) #
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AcsI 56 GAATTC [GA]^AATT[CT]
248 GAATTC
ApoI 56 GAATTC [GA]^AATT[CT]
248 GAATTC
BsaJI 29 CCGTGG C^C[ACGT][ACGT]GG
92 CCTTGG
BstBI 59 TTCGAA TT^CGAA
161 TTCGAA
DdeI 221 CTAAG C^T[ACGT]AG
284 CTGAG
EcoRI 56 GAATTC G^AATTC
248 GAATTC
HapII 17 CCGG C^CGG
37 CCGG
HpaII 17 CCGG C^CGG
37 CCGG
MaeII 83 ACGT A^CGT
226 ACGT
MseI 8 TTAA T^TAA
293 TTAA
MspI 17 CCGG C^CGG
37 CCGG
NspV 59 TTCGAA TT^CGAA
161 TTCGAA
SfuI 59 TTCGAA TT^CGAA
161 TTCGAA
TaqI 60 TCGA T^CGA
162 TCGA
Tru9I 8 TTAA T^TAA
293 TTAA
TthHB8I 60 TCGA T^CGA
162 TCGA
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# 3 OR MORE CUT ENZYMES ( 5 enzymes) #
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HinfI HphI MnlI TfiI Tsp509I