Result of FASTA (omim) for
pF1KSDF0261
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDF0261, 1597 aa
1>>>pF1KSDF0261 1597 - 1597 aa - 1597 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.3249+/-0.000517; mu= -23.3707+/- 0.032
mean_var=622.3010+/-131.933, 0's: 0 Z-trim(122.5): 109 B-trim: 1512 in 1/56
Lambda= 0.051413
statistics sampled from 40625 (40754) to 40625 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.478), width: 16
Scan time: 22.400
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005426 (OMIM: 600888) rho guanine nucleotide ex (1597) 10810 818.3 0
XP_016868112 (OMIM: 600888) PREDICTED: rho guanine (1186) 8060 614.3 2e-174
NP_694945 (OMIM: 612496) rho guanine nucleotide ex ( 802) 1684 141.2 3.3e-32
XP_011539008 (OMIM: 612496) PREDICTED: rho guanine ( 802) 1684 141.2 3.3e-32
NP_001107562 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform 2 [H ( 618) 1222 106.9 5.6e-22
XP_011509225 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 i ( 710) 1222 106.9 6.3e-22
NP_062824 (OMIM: 605991) ephexin-1 isoform 1 [Homo ( 710) 1222 106.9 6.3e-22
XP_011509226 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 i ( 433) 1131 100.0 4.6e-20
XP_011509227 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 i ( 433) 1131 100.0 4.6e-20
NP_079290 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide ex ( 841) 951 86.9 8.1e-16
NP_776089 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide ex ( 841) 951 86.9 8.1e-16
XP_011522038 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine ( 792) 560 57.9 4.1e-07
XP_011522037 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine ( 856) 560 57.9 4.4e-07
XP_011522036 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine ( 856) 560 57.9 4.4e-07
XP_011522039 (OMIM: 608504) PREDICTED: rho guanine ( 439) 448 49.4 8.3e-05
>>NP_005426 (OMIM: 600888) rho guanine nucleotide exchan (1597 aa)
initn: 10810 init1: 10810 opt: 10810 Z-score: 4353.2 bits: 818.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 10810; 99.9% identity (99.9% similar) in 1597 aa overlap (1-1597:1-1597)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEAEEAQRGASPPISAIEEFSIIPEAPMRSSQVSALGLEAQEDEDPSYKWREEHRLSATQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MEAEEAQRGASPPISAIEEFSIIPEAPMRSSQVSALGLEAQEDEDPSYKWREEHRLSATQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QSELRDVCDYAIETMPSFPKEGSADVEPNQESLVAEACDTPEHWEAVPQSLAGRQARTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QSELRDVCDYAIETMPSFPKEGSADVEPNQESLVAEACDTPEHWEAVPQSLAGRQARTLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PPELWACPIQSEHLDMAPFSSDLGSEEEEVEFWPGLTSLTLGSGQAEEEEETSSDNSGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PPELWACPIQSEHLDMAPFSSDLGSEEEEVEFWPGLTSLTLGSGQAEEEEETSSDNSGQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RYYSPCEEHPAETNQNEGSESGTIRQGEELPPEELQESQGLLHPQEVQVLEEQGQQEAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RYYSPCEEHPAETNQNEGSESGTIRQGEELPPEELQESQGLLHPQEVQVLEEQGQQEAGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RGEGTLREDVCADGLLGEEQMIEQVNDEKGEQKQKQEQVQDVMLGRQGERMGLTGEPEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RGEGTLREDVCADGLLGEEQMIEQVNDEKGEQKQKQEQVQDVMLGRQGERMGLTGEPEGL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NDGEWEQEDMERKAQGQGGPEQGEERKRELQVPEENRADSQDEKSQTFLGKSEEVTGKQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NDGEWEQEDMERKAQGQGGPEQGEERKRELQVPEENRADSQDEKSQTFLGKSEEVTGKQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DHGIKEKGVPVSGQEAKEPESWDGGRLGAVGRARSREEENEHHGPSMPALIAPEDSPHCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DHGIKEKGVPVSGQEAKEPESWDGGRLGAVGRARSREEENEHHGPSMPALIAPEDSPHCD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LFPGASYLMTQIPGTQTESRAEELSPAALSPSLEPIRCSHQPISLLGSFLTEESPDKEID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LFPGASYLMTQIPGTQTESRAEELSPAALSPSLEPIRCSHQPISLLGSFLTEESPDKEID
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QNSQQEGSRLRKGTVSSQGTEVVFASASVTPPRTPDSAPPSPAEAYPITPASVSARPPVA
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QNSQQEESRLRKGTVSSQGTEVVFASASVTPPRTPDSAPPSPAEAYPITPASVSARPPVA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD FPRRETSCAARAPETASAPLSMDDPSPCGTSEMCQAALYGFPSTGTSPPRPPANSTGTVQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
NP_005 FPRRETSCAARAPETASAPLSMDDPSPCGTSEMCPAALYGFPSTGTSPPRPPANSTGTVQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD HLRSDSFPGSHRTEQTPDLVGMLLSYSHSELPQRPPKPAIYSSVTPRRDRRSGRDYSTVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 HLRSDSFPGSHRTEQTPDLVGMLLSYSHSELPQRPPKPAIYSSVTPRRDRRSGRDYSTVS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD ASPTALSTLKQDSQESISNLERPSSPPSIQPWVSPHNPAFATESPAYGSSPSFVSMEDVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ASPTALSTLKQDSQESISNLERPSSPPSIQPWVSPHNPAFATESPAYGSSPSFVSMEDVR
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730 740 750 760 770 780
pF1KSD IHEPLPPPPPQRRDTHPSVVETDGHARVVVPTLKQHSHPPPLALGSGLHAPHKGPLPQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IHEPLPPPPPQRRDTHPSVVETDGHARVVVPTLKQHSHPPPLALGSGLHAPHKGPLPQAS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DPAVARQHRPLPSTPDSSHHAQATPRWRYNKPLPPTPDLPQPHLPPISAPGSSRIYRPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DPAVARQHRPLPSTPDSSHHAQATPRWRYNKPLPPTPDLPQPHLPPISAPGSSRIYRPLP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PLPIIDPPTEPPPLPPKSRGRSRSTRGGHMNSGGHAKTRPACQDWTVPLPASAGRTSWPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 PLPIIDPPTEPPPLPPKSRGRSRSTRGGHMNSGGHAKTRPACQDWTVPLPASAGRTSWPP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ATARSTESFTSTSRSKSEVSPGMAFSNMTNFLCPSSPTTPWTPELQGPTSKDEAGVSEHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ATARSTESFTSTSRSKSEVSPGMAFSNMTNFLCPSSPTTPWTPELQGPTSKDEAGVSEHP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EAPAREPLRRTTPQQGASGPGRSPVGQARQPEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EAPAREPLRRTTPQQGASGPGRSPVGQARQPEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDSSG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD QAVAPSEGANKHKGWSRQGLRRPSILPEGSSDSRGPAVEKHPGPSDTVVFREKKPKEVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QAVAPSEGANKHKGWSRQGLRRPSILPEGSSDSRGPAVEKHPGPSDTVVFREKKPKEVMG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD GFSRRCSKLINSSQLLYQEYSDVVLNKEIQSQQRLESLSETPGPSSPRQPRKALVSSESY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GFSRRCSKLINSSQLLYQEYSDVVLNKEIQSQQRLESLSETPGPSSPRQPRKALVSSESY
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD LQRLSMASSGSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LQRLSMASSGSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHF
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD QLSTSLRATLSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QLSTSLRATLSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD RRVYLPYVTNQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RRVYLPYVTNQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KSD KLLLQNILKRTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEFECK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KLLLQNILKRTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEFECK
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KSD IFPLISQSRWLVKSGELTALEFSASPGLRRKLNTRPVHLHLFNDCLLLSRPREGSRFLVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IFPLISQSRWLVKSGELTALEFSASPGLRRKLNTRPVHLHLFNDCLLLSRPREGSRFLVF
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KSD DHAPFSSIRGEKCEMKLHGPHKNLFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISALAMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DHAPFSSIRGEKCEMKLHGPHKNLFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISALAMP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KSD REELDLLECYNSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSDGERGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 REELDLLECYNSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSDGERGW
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590
pF1KSD FPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQA
1570 1580 1590
>>XP_016868112 (OMIM: 600888) PREDICTED: rho guanine nuc (1186 aa)
initn: 8117 init1: 8060 opt: 8060 Z-score: 3252.6 bits: 614.3 E(85289): 2e-174
Smith-Waterman score: 8060; 99.7% identity (99.7% similar) in 1180 aa overlap (1-1180:1-1180)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEAEEAQRGASPPISAIEEFSIIPEAPMRSSQVSALGLEAQEDEDPSYKWREEHRLSATQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEAEEAQRGASPPISAIEEFSIIPEAPMRSSQVSALGLEAQEDEDPSYKWREEHRLSATQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QSELRDVCDYAIETMPSFPKEGSADVEPNQESLVAEACDTPEHWEAVPQSLAGRQARTLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QSELRDVCDYAIETMPSFPKEGSADVEPNQESLVAEACDTPEHWEAVPQSLAGRQARTLA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PPELWACPIQSEHLDMAPFSSDLGSEEEEVEFWPGLTSLTLGSGQAEEEEETSSDNSGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPELWACPIQSEHLDMAPFSSDLGSEEEEVEFWPGLTSLTLGSGQAEEEEETSSDNSGQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RYYSPCEEHPAETNQNEGSESGTIRQGEELPPEELQESQGLLHPQEVQVLEEQGQQEAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RYYSPCEEHPAETNQNEGSESGTIRQGEELPPEELQESQGLLHPQEVQVLEEQGQQEAGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD RGEGTLREDVCADGLLGEEQMIEQVNDEKGEQKQKQEQVQDVMLGRQGERMGLTGEPEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RGEGTLREDVCADGLLGEEQMIEQVNDEKGEQKQKQEQVQDVMLGRQGERMGLTGEPEGL
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310 320 330 340 350 360
pF1KSD NDGEWEQEDMERKAQGQGGPEQGEERKRELQVPEENRADSQDEKSQTFLGKSEEVTGKQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NDGEWEQEDMERKAQGQGGPEQGEERKRELQVPEENRADSQDEKSQTFLGKSEEVTGKQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD DHGIKEKGVPVSGQEAKEPESWDGGRLGAVGRARSREEENEHHGPSMPALIAPEDSPHCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DHGIKEKGVPVSGQEAKEPESWDGGRLGAVGRARSREEENEHHGPSMPALIAPEDSPHCD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LFPGASYLMTQIPGTQTESRAEELSPAALSPSLEPIRCSHQPISLLGSFLTEESPDKEID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFPGASYLMTQIPGTQTESRAEELSPAALSPSLEPIRCSHQPISLLGSFLTEESPDKEID
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490 500 510 520 530 540
pF1KSD QNSQQEGSRLRKGTVSSQGTEVVFASASVTPPRTPDSAPPSPAEAYPITPASVSARPPVA
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QNSQQEESRLRKGTVSSQGTEVVFASASVTPPRTPDSAPPSPAEAYPITPASVSARPPVA
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pF1KSD FPRRETSCAARAPETASAPLSMDDPSPCGTSEMCQAALYGFPSTGTSPPRPPANSTGTVQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::
XP_016 FPRRETSCAARAPETASAPLSMDDPSPCGTSEMCPAALYGFPSTGTSPPRPPANSTGTVQ
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pF1KSD HLRSDSFPGSHRTEQTPDLVGMLLSYSHSELPQRPPKPAIYSSVTPRRDRRSGRDYSTVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HLRSDSFPGSHRTEQTPDLVGMLLSYSHSELPQRPPKPAIYSSVTPRRDRRSGRDYSTVS
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670 680 690 700 710 720
pF1KSD ASPTALSTLKQDSQESISNLERPSSPPSIQPWVSPHNPAFATESPAYGSSPSFVSMEDVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ASPTALSTLKQDSQESISNLERPSSPPSIQPWVSPHNPAFATESPAYGSSPSFVSMEDVR
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730 740 750 760 770 780
pF1KSD IHEPLPPPPPQRRDTHPSVVETDGHARVVVPTLKQHSHPPPLALGSGLHAPHKGPLPQAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IHEPLPPPPPQRRDTHPSVVETDGHARVVVPTLKQHSHPPPLALGSGLHAPHKGPLPQAS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DPAVARQHRPLPSTPDSSHHAQATPRWRYNKPLPPTPDLPQPHLPPISAPGSSRIYRPLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DPAVARQHRPLPSTPDSSHHAQATPRWRYNKPLPPTPDLPQPHLPPISAPGSSRIYRPLP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PLPIIDPPTEPPPLPPKSRGRSRSTRGGHMNSGGHAKTRPACQDWTVPLPASAGRTSWPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PLPIIDPPTEPPPLPPKSRGRSRSTRGGHMNSGGHAKTRPACQDWTVPLPASAGRTSWPP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ATARSTESFTSTSRSKSEVSPGMAFSNMTNFLCPSSPTTPWTPELQGPTSKDEAGVSEHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ATARSTESFTSTSRSKSEVSPGMAFSNMTNFLCPSSPTTPWTPELQGPTSKDEAGVSEHP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EAPAREPLRRTTPQQGASGPGRSPVGQARQPEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EAPAREPLRRTTPQQGASGPGRSPVGQARQPEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDSSG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD QAVAPSEGANKHKGWSRQGLRRPSILPEGSSDSRGPAVEKHPGPSDTVVFREKKPKEVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QAVAPSEGANKHKGWSRQGLRRPSILPEGSSDSRGPAVEKHPGPSDTVVFREKKPKEVMG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD GFSRRCSKLINSSQLLYQEYSDVVLNKEIQSQQRLESLSETPGPSSPRQPRKALVSSESY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GFSRRCSKLINSSQLLYQEYSDVVLNKEIQSQQRLESLSETPGPSSPRQPRKALVSSESY
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD LQRLSMASSGSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHF
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
XP_016 LQRLSMASSGSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVPFRPGREL
1150 1160 1170 1180
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD QLSTSLRATLSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDF
>>NP_694945 (OMIM: 612496) rho guanine nucleotide exchan (802 aa)
initn: 1528 init1: 1032 opt: 1684 Z-score: 699.1 bits: 141.2 E(85289): 3.3e-32
Smith-Waterman score: 1734; 41.4% identity (64.1% similar) in 839 aa overlap (782-1594:6-799)
760 770 780 790 800
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pF1KSD TLKQHSHPPPLALGSGLHAPHKGPLPQASDPAVARQHRPLPSTPDSSHHAQATPRWRY--
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pF1KSD --NKPL--PPTP---DLPQPHLPP-ISAPGSS-RIYRPLPPLPIIDPPTEPPPLPPKSRG
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:: . :.: : ....:..: .: .
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. :::. : .. . :.:: . : . :. :. .:. . . . .
NP_062 LNIPWSRMPPCRTAMQTDPGAQEMSESSSTPGNGATPEEWPALADSPTTLTEALRMIHPI
110 120 130 140 150 160
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. .::.. :::::: : .::.. :: : ..: : :.: :.. :
NP_062 PADSWRNLIEQIGLLYQEYRDKSTLQEIETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPEEEEEEEE
170 180 190 200 210 220
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pF1KSD ----------SYLQRLSMASSG----SLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIV
. : .. . :. .:::..: .:.: :: . :. ::::. :::..
NP_062 EEEPASPPERKTLPQICLLSNPHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVT
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::::: .:::. :.::. . .: : .: . ::: . :: :: :: .::. .:.::
NP_062 SEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENI
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.:::.: .: : ::. ::.::::::::...:.. .. :::.. .:: :: :. :
NP_062 VISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGL
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..::::::::::::::::.::::::.. : .: : ::. ::.... ::..:..: :
NP_062 PFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILKRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSR
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pF1KSD TEELIYLSQKIEFECKIFPLISQSRWLVKSGELTALEF-SASPGLRRKLNTRPVHLHLFN
::..: ...:.::. : :.::.::::.:.::: . ..: :: : . ..: :::
NP_062 TEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFN
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pF1KSD DCLLLSRPREGSRFLVFDHAPFSSIRGEKCEMKLHGPH-KNLFRLFLRQNTQGAQAEFLF
: :.. : :... ::: :: . .: : :.. .: :.: : : .:.. .: ...
NP_062 DLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLRVE--ELEDQGQTLANVFILRLLENADDREATYML
530 540 550 560 570 580
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pF1KSD RTETQSEKLRWISALAMPREEL------DLLECYNSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADV
.. .::: ::...:: :. ::.: :::::.. : .. :::.:: ::.
NP_062 KASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDC---PQVQCVHPYVAQQPDELTLELADI
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pF1KSD VMVTQQSSDGWLEGVRLSDGERGWFPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQ
. . ....:::. : :: : :::::: ...: : ::..:.::::: ::
NP_062 LNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQN
640 650 660 670 680 690
pF1KSD A
NP_062 KDRRKLGSRNRQ
700 710
>>XP_011509226 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 isofo (433 aa)
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:::..::::: .:::. :.::. . .:
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: .: . ::: . :: :: :: .::. .:.:: .:::.: .: : ::. ::.
XP_011 LHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVS
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pF1KSD NQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQNILK
::::::::...:.. .. :::.. .:: :: :. : ..::::::::::::::::.:::::
XP_011 NQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILK
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pF1KSD RTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEFECKIFPLISQSR
:.. : .: : ::. ::.... ::..:..: :::..: ...:.::. : :.::.::
XP_011 RVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSR
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::.:.::: . ..: : : :. ..: :::: :.. : :... ::: ::
XP_011 WLLKQGELQQM---SGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPR
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pF1KSD SSIRGEKCEMKLHGPH-KNLFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISALAMPREEL
. .: : :.. .: :.: : : .:.. .: ..... .::: ::...:: :.
XP_011 GLLRVE--ELEDQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTK
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pF1KSD ------DLLECYNSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSDGER
::.: :::::.. : .. :::.:: ::.. . ....:::. : :: : ::
XP_011 FVSFTSRLLDC---PQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQER
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD GWFPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQA
:::: ...: : ::..:.::::: ::
XP_011 GWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
390 400 410 420 430
>>XP_011509227 (OMIM: 605991) PREDICTED: ephexin-1 isofo (433 aa)
initn: 980 init1: 716 opt: 1131 Z-score: 481.2 bits: 100.0 E(85289): 4.6e-20
Smith-Waterman score: 1131; 44.8% identity (70.7% similar) in 417 aa overlap (1180-1585:2-410)
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD GSLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHFQLSTSLRAT
:::..::::: .:::. :.::. . .:
XP_011 MFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKI
10 20 30
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD LSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDFRRVYLPYVT
: .: . ::: . :: :: :: .::. .:.:: .:::.: .: : ::. ::.
XP_011 LHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVS
40 50 60 70 80 90
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pF1KSD NQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQNILK
::::::::...:.. .. :::.. .:: :: :. : ..::::::::::::::::.:::::
XP_011 NQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILK
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pF1KSD RTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEFECKIFPLISQSR
:.. : .: : ::. ::.... ::..:..: :::..: ...:.::. : :.::.::
XP_011 RVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSR
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::.:.::: . ..: : : :. ..: :::: :.. : :... ::: ::
XP_011 WLLKQGELQQM---SGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPR
220 230 240 250 260
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pF1KSD SSIRGEKCEMKLHGPH-KNLFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISALAMPREEL
. .: : :.. .: :.: : : .:.. .: ..... .::: ::...:: :.
XP_011 GLLRVE--ELEDQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTK
270 280 290 300 310 320
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::.: :::::.. : .. :::.:: ::.. . ....:::. : :: : ::
XP_011 FVSFTSRLLDC---PQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQER
330 340 350 360 370 380
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:::: ...: : ::..:.::::: ::
XP_011 GWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
390 400 410 420 430
>>NP_079290 (OMIM: 608504) rho guanine nucleotide exchan (841 aa)
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pF1KSD HNPAFATESPAYGSSPSFVSMEDVRIHEPLPPPPPQRRDTHPSVVETDGHARVVVPTLKQ
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NP_079 MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPR-NS
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pF1KSD HSHPPPLALGSGLHAPHKGPLPQAS-DPAVARQHRPLPSTPDS-SHHAQATPRWRYNKPL
.. : :. . : . : : :...: ..::: : .: : .
NP_079 NDAPTPMCTPIFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASP
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pF1KSD PPTPDLPQPHLPPISAPGSSRIYRPLPPLPIIDPPTEPPPLPPKSRGRSRSTRGGHMNSG
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NP_079 EPAPRSPVPPPKPSGSPCT-----PLLPMAGVLAQNGSASAP----GTVRRL-AGRFEGG
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..... :: .: :. .:.. . :. . : :. . .: ... :
NP_079 AEGRA----QDADAPEPGLQARAD----VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPC
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: : :. .: : :..: : ::: :. :. . : . . :.
NP_079 VCHTTRPGLELRWVPV----GGYEEVPRVPRRASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRS
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pF1KSD PEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDSSGQAVAPSEGANKHKGWSRQGLRRPSILPEGS
. . : : : . . :... :: :. . :..:.. :.
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. . : : . . ..: :: . ..::::.:.:. : .: ...
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.....:: ::...::::::::: . .: : :: .:: ::. ..:. ::: .: :. ::
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NP_079 ELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSK
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pF1KSD LIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEF-ECKIFPLISQSRWLVKSGELTALEFSASPGLR
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NP_079 IIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTEL------GCR
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: . .:: . : ::.: ::...:. :.:. :.:.: : ..... ::
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650 660 670 680 690 700
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pF1KSD NLFRLFLRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISALA----MPREELDLLECYNSPQVQCL
::: : .: :: .. :... . :. ::..:. .: . : . : :
NP_079 --FRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCS
710 720 730 740 750 760
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NP_079 ESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLP------GAFPAQLVCEVTGEHERRRH
770 780 790 800 810
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pF1KSD LKEAHRVKTAKLQLVEQQA
:.. .:. :
NP_079 LRQNQRLLEAVGSSSGTPNAPPP
820 830 840
1597 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 08:58:07 2016 done: Thu Nov 3 08:58:10 2016
Total Scan time: 22.400 Total Display time: 0.450
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]