Result of FASTA (omim) for
pF1KSDB0005
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0005, 1271 aa
1>>>pF1KSDB0005 1271 - 1271 aa - 1271 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9390+/-0.000448; mu= 2.6394+/- 0.028
mean_var=263.6588+/-53.892, 0's: 0 Z-trim(118.9): 483 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.078987
statistics sampled from 31763 (32265) to 31763 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.378), width: 16
Scan time: 17.340
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004318 (OMIM: 151410,608232,613065) breakpoint (1271) 8456 978.1 0
NP_067585 (OMIM: 151410,608232,613065) breakpoint (1227) 6456 750.1 2e-215
NP_001309770 (OMIM: 600365) active breakpoint clus (1118) 3797 447.1 3.1e-124
NP_068781 (OMIM: 600365) active breakpoint cluster ( 859) 3782 445.3 8.2e-124
NP_001153218 (OMIM: 600365) active breakpoint clus ( 813) 3768 443.7 2.4e-123
NP_001309769 (OMIM: 600365) active breakpoint clus ( 813) 3768 443.7 2.4e-123
NP_001083 (OMIM: 600365) active breakpoint cluster ( 822) 3691 434.9 1.1e-120
XP_016880028 (OMIM: 600365) PREDICTED: active brea (1137) 3088 366.3 6.6e-100
XP_011522112 (OMIM: 600365) PREDICTED: active brea ( 878) 3073 364.5 1.8e-99
XP_011522116 (OMIM: 600365) PREDICTED: active brea ( 832) 3059 362.9 5.1e-99
XP_011522117 (OMIM: 600365) PREDICTED: active brea ( 832) 3059 362.9 5.1e-99
NP_001269078 (OMIM: 600365) active breakpoint clus ( 641) 3018 358.2 1.1e-97
XP_011522114 (OMIM: 600365) PREDICTED: active brea ( 865) 3009 357.2 2.7e-97
XP_011522115 (OMIM: 600365) PREDICTED: active brea ( 841) 2982 354.1 2.2e-96
XP_016880029 (OMIM: 600365) PREDICTED: active brea (1104) 2845 338.6 1.4e-91
XP_016880030 (OMIM: 600365) PREDICTED: active brea ( 863) 2564 306.5 5e-82
XP_011522113 (OMIM: 600365) PREDICTED: active brea ( 873) 2559 306.0 7.5e-82
XP_016880032 (OMIM: 600365) PREDICTED: active brea ( 660) 2309 277.4 2.3e-73
XP_016880031 (OMIM: 600365) PREDICTED: active brea ( 663) 2306 277.0 2.9e-73
NP_001243776 (OMIM: 600365) active breakpoint clus ( 310) 1240 155.3 5.9e-37
NP_954976 (OMIM: 610591) rho GTPase-activating pro ( 548) 477 68.6 1.4e-10
XP_011522776 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 581) 477 68.6 1.4e-10
XP_005257185 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 667) 477 68.6 1.6e-10
XP_016879801 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 689) 477 68.6 1.6e-10
XP_011522774 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 722) 477 68.6 1.7e-10
XP_011522773 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 865) 477 68.7 2e-10
XP_006721810 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 867) 477 68.7 2e-10
XP_006721808 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 889) 477 68.7 2e-10
NP_001269219 (OMIM: 610591) rho GTPase-activating ( 889) 477 68.7 2e-10
XP_011522771 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 900) 477 68.7 2e-10
XP_011522770 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 922) 477 68.7 2.1e-10
XP_016879800 (OMIM: 610591) PREDICTED: rho GTPase- ( 922) 477 68.7 2.1e-10
NP_001193531 (OMIM: 118423,604356) N-chimaerin iso ( 334) 428 62.8 4.4e-09
XP_011509785 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 397) 429 63.0 4.7e-09
XP_016859989 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 432) 429 63.0 5e-09
XP_011509781 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 475) 429 63.0 5.4e-09
XP_016859988 (OMIM: 610578) PREDICTED: rho GTPase- ( 475) 429 63.0 5.4e-09
NP_060930 (OMIM: 610578) rho GTPase-activating pro ( 475) 429 63.0 5.4e-09
NP_001020372 (OMIM: 118423,604356) N-chimaerin iso ( 433) 428 62.9 5.5e-09
NP_001813 (OMIM: 118423,604356) N-chimaerin isofor ( 459) 428 62.9 5.7e-09
XP_016872443 (OMIM: 610577) PREDICTED: rho GTPase- ( 742) 422 62.4 1.3e-08
NP_001257627 (OMIM: 610577) rho GTPase-activating ( 769) 422 62.4 1.4e-08
XP_011518063 (OMIM: 610577) PREDICTED: rho GTPase- ( 772) 422 62.4 1.4e-08
NP_001257628 (OMIM: 610577) rho GTPase-activating ( 794) 422 62.4 1.4e-08
XP_005252701 (OMIM: 610577) PREDICTED: rho GTPase- ( 794) 422 62.4 1.4e-08
NP_001257626 (OMIM: 610577) rho GTPase-activating ( 799) 422 62.4 1.4e-08
NP_001257625 (OMIM: 610577) rho GTPase-activating ( 816) 422 62.4 1.4e-08
NP_001257624 (OMIM: 610577) rho GTPase-activating ( 841) 422 62.4 1.5e-08
NP_060757 (OMIM: 610577) rho GTPase-activating pro ( 846) 422 62.4 1.5e-08
XP_011517909 (OMIM: 609870) PREDICTED: rho GTPase- (1491) 406 60.8 8.2e-08
>>NP_004318 (OMIM: 151410,608232,613065) breakpoint clus (1271 aa)
initn: 8456 init1: 8456 opt: 8456 Z-score: 5219.9 bits: 978.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8456; 99.9% identity (100.0% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:1-1271)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVDPVGFAEAWKAQFPDSEPPRMELRSVGDIEQELERCKASIRRLEQEVNQERFRMIYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MVDPVGFAEAWKAQFPDSEPPRMELRSVGDIEQELERCKASIRRLEQEVNQERFRMIYLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TLLAKEKKSYDRQRWGFRRAAQAPDGASEPRASASRPQPAPADGADPPPAEEPEARPDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TLLAKEKKSYDRQRWGFRRAAQAPDGASEPRASASRPQPAPADGADPPPAEEPEARPDGE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GSPGKARPGTARRPGAAASGERDDRGPPASVAALRSNFERIRKGHGQPGADAEKPFYVNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GSPGKARPGTARRPGAAASGERDDRGPPASVAALRSNFERIRKGHGQPGADAEKPFYVNV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EFHHERGLVKVNDKEVSDRISSLGSQAMQMERKKSQHGAGSSVGDASRPPYRGRSSESSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EFHHERGLVKVNDKEVSDRISSLGSQAMQMERKKSQHGAGSSVGDASRPPYRGRSSESSC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVDGDYEDAELNPRFLKDNLIDANGGSRPPWPPLEYQPYQSIYVGGMMEGEGKGPLLRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GVDGDYEDAELNPRFLKDNLIDANGGSRPPWPPLEYQPYQSIYVGGMMEGEGKGPLLRSQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD STSEQEKRLTWPRRSYSPRSFEDCGGGYTPDCSSNENLTSSEEDFSSGQSSRVSPSPTTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 STSEQEKRLTWPRRSYSPRSFEDCGGGYTPDCSSNENLTSSEEDFSSGQSSRVSPSPTTY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RMFRDKSRSPSQNSQQSFDSSSPPTPQCHKRHRHCPVVVSEATIVGVRKTGQIWPNDGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RMFRDKSRSPSQNSQQSFDSSSPPTPQCHKRHRHCPVVVSEATIVGVRKTGQIWPNDGEG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDGLPYIDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDGLPYIDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DEELDALKIKISQIKSDIQREKRANKGSKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRN
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DEELDALKIKISQIKNDIQREKRANKGSKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTIN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD AMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIER
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD RGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLF
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NP_004 RGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLF
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD TDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSL
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD HNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 HNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270
pF1KSD KRQSILFSTEV
:::::::::::
NP_004 KRQSILFSTEV
1270
>>NP_067585 (OMIM: 151410,608232,613065) breakpoint clus (1227 aa)
initn: 6456 init1: 6456 opt: 6456 Z-score: 3988.4 bits: 750.1 E(85289): 2e-215
Smith-Waterman score: 8064; 96.5% identity (96.5% similar) in 1271 aa overlap (1-1271:1-1227)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVDPVGFAEAWKAQFPDSEPPRMELRSVGDIEQELERCKASIRRLEQEVNQERFRMIYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 MVDPVGFAEAWKAQFPDSEPPRMELRSVGDIEQELERCKASIRRLEQEVNQERFRMIYLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TLLAKEKKSYDRQRWGFRRAAQAPDGASEPRASASRPQPAPADGADPPPAEEPEARPDGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 TLLAKEKKSYDRQRWGFRRAAQAPDGASEPRASASRPQPAPADGADPPPAEEPEARPDGE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GSPGKARPGTARRPGAAASGERDDRGPPASVAALRSNFERIRKGHGQPGADAEKPFYVNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 GSPGKARPGTARRPGAAASGERDDRGPPASVAALRSNFERIRKGHGQPGADAEKPFYVNV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD EFHHERGLVKVNDKEVSDRISSLGSQAMQMERKKSQHGAGSSVGDASRPPYRGRSSESSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 EFHHERGLVKVNDKEVSDRISSLGSQAMQMERKKSQHGAGSSVGDASRPPYRGRSSESSC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GVDGDYEDAELNPRFLKDNLIDANGGSRPPWPPLEYQPYQSIYVGGMMEGEGKGPLLRSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 GVDGDYEDAELNPRFLKDNLIDANGGSRPPWPPLEYQPYQSIYVGGMMEGEGKGPLLRSQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD STSEQEKRLTWPRRSYSPRSFEDCGGGYTPDCSSNENLTSSEEDFSSGQSSRVSPSPTTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 STSEQEKRLTWPRRSYSPRSFEDCGGGYTPDCSSNENLTSSEEDFSSGQSSRVSPSPTTY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RMFRDKSRSPSQNSQQSFDSSSPPTPQCHKRHRHCPVVVSEATIVGVRKTGQIWPNDGEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 RMFRDKSRSPSQNSQQSFDSSSPPTPQCHKRHRHCPVVVSEATIVGVRKTGQIWPNDGEG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDGLPYIDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 AFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDGLPYIDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 ALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD QQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 QQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD AMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 AMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 LKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 GARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD DEELDALKIKISQIKSDIQREKRANKGSKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRN
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 DEELDALKIKISQIKNDIQREKRANKGSKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 GKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTIN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD KEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 KEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVI
::::::::::::::::
NP_067 --------------------------------------------LDPQALQDRDWQRTVI
970
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD AMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 AMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIER
980 990 1000 1010 1020 1030
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD RGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 RGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLF
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD TDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 TDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD HNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 HNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDS
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1270
pF1KSD KRQSILFSTEV
:::::::::::
NP_067 KRQSILFSTEV
1220
>>NP_001309770 (OMIM: 600365) active breakpoint cluster (1118 aa)
initn: 3933 init1: 3572 opt: 3797 Z-score: 2351.4 bits: 447.1 E(85289): 3.1e-124
Smith-Waterman score: 3859; 53.7% identity (71.5% similar) in 1280 aa overlap (1-1271:1-1118)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVDPVGFAEAWKAQFPDSEPPRMELRSVGDIEQELERCKASIRRLEQEVNQERFRMIYLQ
: :: .: . :.:.:: .: : .:.:: : :.:::: ::: : :: ::
NP_001 MWDPRAFERRWRAEFPGAEAPVPRLESVRDAERELER-----RRL----NLER-----LQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TLLAKEKKSYDRQRWGFRRAAQAPDGASEPRASASRPQPAPADGADPPPAEEPEARPDGE
.::.:. . :: :.:. .: . :.: . :: .::: :
NP_001 QVLAEEQLK-----------------ASLPQAALAR-----GGGGD---SGEP-GRPDPE
50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KSD GSPGKARPGTARRPGAAASGERDD--RGPPASVAALRSNFERIRKGHGQPGADAEKPFYV
. .. :: :: : . : : :: :. : : :. :::
NP_001 AESPRGDPG---RPDPEAESPRGDLPAGPGAAGEA----------GGGRSWADA------
90 100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KSD NVEFHHERGLVKVNDKEVSDRISSLGSQAMQMERKKSQHGAGSSVGDASRPPYRGRSSES
: : :.. :.. . . : .:: . : : ..:.
NP_001 ---VH--RQLLQP-----------------QLRFRAREDDA--PLGDPQAAP--G-TDEG
130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SCGVDGDYEDAELNPRFLKDNLIDANG--GSRPPWPPLEYQPYQSIYVGGMMEGEGKGPL
. : : :.: ...: .:. .. . : :.: .: . .. .. : :. :
NP_001 GDGGDHDFEMVDFNEKFILSHWLVAPCRFGTR----ERARSPRRWMH---LIPG-GRRP-
160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LRSQSTSEQEKRLTWPR-RSYSPRSFEDCGGGYTPDCSSNENLTSSEEDFSSGQSSRVSP
...: . :.: . . : :: . :. : :.: :
NP_001 --QRGTRDLEQREAEAKGRPGSPLAAEETPG--------REHL----------------P
210 220 230
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SPTTYRMFRDKSRSPSQNSQQSFDSSSPPTPQCHKRHRHCPVVVSEATIVGVRKTGQIWP
: : : : : ..: ::: . .::
NP_001 -PWRRRRFL---RVPERDSP---GHSSPERDSDGSRHS----------------------
240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KSD NDGEGAFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDG---LPYIDDSPSSSPHLSSKGRG
.: : : .:: :.:: : . :::. .: .::::.::. ::.::....:
NP_001 SDREDDF--SADFSYGTDEYDG---EGNEEQKGPPEGSETMPYIDESPTMSPQLSARSQG
280 290 300 310 320
480 490 500 510 520 530
pF1KSD SRDALVSGALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAAT
. :. :: . : .. ::::::: ::::.::::: :...:::::::::::::.::
NP_001 GGDG-VSPTPPEGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYINQLEALLLPMKPLKATAT
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KSD TSQPVLTSQQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYR
::::::: :::::::.:. ..:::::::::.: :.::::. : .: ::::::::::::.
NP_001 TSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQLGVYK
390 400 410 420 430 440
600 610 620 630 640 650
pF1KSD AFVDNYGVAMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTR
:::::: ::.: :::: :.: :: .:::.:.... ::.:: :. ..:.:::::.:::::
NP_001 AFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTR
450 460 470 480 490 500
660 670 680 690 700 710
pF1KSD STLVLHDLLKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKD
:::::::::::::..:::.:::::::::::::::::::.: ::: ..:. ::: :::.::
NP_001 STLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKD
510 520 530 540 550 560
720 730 740 750 760 770
pF1KSD SFMVELVEGARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEA
.:.::. :..:::::::::::.:::.:::: :.:: :::::::::::.:: : .: ::
NP_001 GFLVEVSESSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEA
570 580 590 600 610 620
780 790 800 810 820 830
pF1KSD VPNIPLVPDEELDALKIKISQIKSDIQREKRANKG-SKATERLKKKLSEQESLLLLMSPS
:.. ::.::. .:.::: .::.::.:: :::: :.: ::::::. :.: :::: ::.
NP_001 SPQVHPFPDHELEDMKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPT
630 640 650 660 670 680
840 850 860 870 880 890
pF1KSD MAFRVHSRNGKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQT
. ::.:.:::::: ::.::::::.:::: :.. ::: ...: :.:::::.::.:: ::.:
NP_001 IPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRT
690 700 710 720 730 740
900 910 920 930 940 950
pF1KSD VHSIPLTINKEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYR
::.::.: ::.:::::::::::.:::::: :::::.:::::::::::::::.::::::.:
NP_001 VHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFR
750 760 770 780 790 800
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD DTAEPNWNEEFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGKGQVQLDPQALQ
:::::.:.:::::::::::.::::::::::.:::. :...: .:..:::::.:::::...
NP_001 DTAEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVE
810 820 830 840 850 860
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD DRDWQRTVIAMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIV
..:. :: ::::.:..:.::.::..:::: ::.::::::::::.::::::::::::::
NP_001 TKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIV
870 880 890 900 910 920
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD RQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLY
::::::.:.::.:::::::.::::::::::::.::.::::. .:.:.::.::::::::::
NP_001 RQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLY
930 940 950 960 970 980
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD FRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAE
::::::::.::..:: : ::::::::.:::.::..:: :::. ::.::::::.:::::::
NP_001 FRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAE
990 1000 1010 1020 1030 1040
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD KEAVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQ
:: .::::::::::::::::::::: ::: .. . .: :: .::.:::::::.::
NP_001 KEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESK-----AHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQ
1050 1060 1070 1080 1090
1260 1270
pF1KSD LEAIPAPDSKRQSILFSTEV
: . ::... :::.:
NP_001 HPPISFAELKRNTLYFSTDV
1100 1110
>>NP_068781 (OMIM: 600365) active breakpoint cluster reg (859 aa)
initn: 3776 init1: 3572 opt: 3782 Z-score: 2343.8 bits: 445.3 E(85289): 8.2e-124
Smith-Waterman score: 3782; 68.2% identity (86.9% similar) in 847 aa overlap (429-1271:23-859)
400 410 420 430 440 450
pF1KSD VSEATIVGVRKTGQIWPNDGEGAFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDG---LPY
:.:: : . :::. .: .::
NP_068 MEPLSHRGLPRLSWIDTLYSNFSYGTDEYDG---EGNEEQKGPPEGSETMPY
10 20 30 40
460 470 480 490 500 510
pF1KSD IDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSGALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLS
::.::. ::.::....:. :. :: . : .. ::::::: ::::.::::: :..
NP_068 IDESPTMSPQLSARSQGGGDG-VSPTPPEGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYIN
50 60 70 80 90 100
520 530 540 550 560 570
pF1KSD HLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTSQQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQ
.:::::::::::::.::::::::: :::::::.:. ..:::::::::.: :.::::. :
NP_068 QLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQV
110 120 130 140 150 160
580 590 600 610 620 630
pF1KSD RVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGVAMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTT
.: ::::::::::::.:::::: ::.: :::: :.: :: .:::.:.... ::.:: :
NP_068 TMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHT
170 180 190 200 210 220
640 650 660 670 680 690
pF1KSD KNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDLLKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPR
. ..:.:::::.::::::::::::::::::..:::.:::::::::::::::::::.: ::
NP_068 SVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPR
230 240 250 260 270 280
700 710 720 730 740 750
pF1KSD RQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVEGARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKW
: ..:. ::: :::.::.:.::. :..:::::::::::.:::.:::: :.:: :::::::
NP_068 RTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKW
290 300 310 320 330 340
760 770 780 790 800 810
pF1KSD YIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVPDEELDALKIKISQIKSDIQREKRANKG-SKATERL
::::.:: : .: :: :.. ::.::. .:.::: .::.::.:: :::: :.: :::
NP_068 YIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERL
350 360 370 380 390 400
820 830 840 850 860 870
pF1KSD KKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRNGKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSL
:::. :.: :::: ::.. ::.:.:::::: ::.::::::.:::: :.. ::: ...: :
NP_068 KKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVL
410 420 430 440 450 460
880 890 900 910 920 930
pF1KSD TSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTINKEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLE
.:::::.::.:: ::.:::.::.: ::.:::::::::::.:::::: :::::.:::::::
NP_068 SSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLE
470 480 490 500 510 520
940 950 960 970 980 990
pF1KSD VDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEEFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGEST
::::::::.::::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::.:::. :...: .
NP_068 VDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIV
530 540 550 560 570 580
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD DRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVIAMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGV
:..:::::.:::::... ..:. :: ::::.:..:.::.::..:::: ::.::::::::
NP_068 DKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGV
590 600 610 620 630 640
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD KIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSV
::.::::::::::::::::::::.:.::.:::::::.::::::::::::.::.::::. .
NP_068 KISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILL
650 660 670 680 690 700
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD MMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEA
:.:.::.::::::::::::::::::.::..:: : ::::::::.:::.::..:: :::.
NP_068 MLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDP
710 720 730 740 750 760
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD NLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDS
::.::::::.::::::::: .::::::::::::::::::::: ::: .. . .:
NP_068 NLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESK-----AHLTSAADI
770 780 790 800 810 820
1240 1250 1260 1270
pF1KSD WSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSKRQSILFSTEV
:: .::.:::::::.:: : . ::... :::.:
NP_068 WSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
830 840 850
>>NP_001153218 (OMIM: 600365) active breakpoint cluster (813 aa)
initn: 3765 init1: 3572 opt: 3768 Z-score: 2335.5 bits: 443.7 E(85289): 2.4e-123
Smith-Waterman score: 3768; 69.5% identity (88.3% similar) in 820 aa overlap (453-1271:1-813)
430 440 450 460 470 480
pF1KSD HGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDGLPYIDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSGAL
.::::.::. ::.::....:. :. :: .
NP_001 MPYIDESPTMSPQLSARSQGGGDG-VSPTP
10 20
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTSQQ
: .. ::::::: ::::.::::: :...:::::::::::::.::::::::: ::
NP_001 PEGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYINQLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQ
30 40 50 60 70 80
550 560 570 580 590 600
pF1KSD IETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGVAM
:::::.:. ..:::::::::.: :.::::. : .: ::::::::::::.:::::: ::.
NP_001 IETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVAL
90 100 110 120 130 140
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDLLK
: :::: :.: :: .:::.:.... ::.:: :. ..:.:::::.:::::::::::::::
NP_001 ETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLK
150 160 170 180 190 200
670 680 690 700 710 720
pF1KSD HTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVEGA
:::..:::.:::::::::::::::::::.: ::: ..:. ::: :::.::.:.::. :..
NP_001 HTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESS
210 220 230 240 250 260
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVPDE
:::::::::::.:::.:::: :.:: :::::::::::.:: : .: :: :.. ::.
NP_001 RKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDH
270 280 290 300 310 320
790 800 810 820 830 840
pF1KSD ELDALKIKISQIKSDIQREKRANKG-SKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRNG
::. .:.::: .::.::.:: :::: :.: ::::::. :.: :::: ::.. ::.:.:::
NP_001 ELEDMKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNG
330 340 350 360 370 380
850 860 870 880 890 900
pF1KSD KSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTINK
::: ::.::::::.:::: :.. ::: ...: :.:::::.::.:: ::.:::.::.: ::
NP_001 KSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNK
390 400 410 420 430 440
910 920 930 940 950 960
pF1KSD EDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEE
.:::::::::::.:::::: :::::.:::::::::::::::.::::::.::::::.:.::
NP_001 DDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEE
450 460 470 480 490 500
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD FEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVIA
:::::::::.::::::::::.:::. :...: .:..:::::.:::::... ..:. ::
NP_001 FEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIE
510 520 530 540 550 560
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD MNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERR
::::.:..:.::.::..:::: ::.::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:
NP_001 MNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKR
570 580 590 600 610 620
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD GMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFT
:.:::::::.::::::::::::.::.::::. .:.:.::.::::::::::::::::::.:
NP_001 GIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLT
630 640 650 660 670 680
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD DEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLH
:..:: : ::::::::.:::.::..:: :::. ::.::::::.::::::::: .::::::
NP_001 DRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLH
690 700 710 720 730 740
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD NLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSK
::::::::::::::: ::: .. . .: :: .::.:::::::.:: : . :
NP_001 NLATVFGPTLLRPSEVESK-----AHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELK
750 760 770 780 790 800
1270
pF1KSD RQSILFSTEV
:... :::.:
NP_001 RNTLYFSTDV
810
>>NP_001309769 (OMIM: 600365) active breakpoint cluster (813 aa)
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Smith-Waterman score: 3768; 69.5% identity (88.3% similar) in 820 aa overlap (453-1271:1-813)
430 440 450 460 470 480
pF1KSD HGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDGLPYIDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSGAL
.::::.::. ::.::....:. :. :: .
NP_001 MPYIDESPTMSPQLSARSQGGGDG-VSPTP
10 20
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTSQQ
: .. ::::::: ::::.::::: :...:::::::::::::.::::::::: ::
NP_001 PEGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYINQLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQ
30 40 50 60 70 80
550 560 570 580 590 600
pF1KSD IETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGVAM
:::::.:. ..:::::::::.: :.::::. : .: ::::::::::::.:::::: ::.
NP_001 IETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVAL
90 100 110 120 130 140
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDLLK
: :::: :.: :: .:::.:.... ::.:: :. ..:.:::::.:::::::::::::::
NP_001 ETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLK
150 160 170 180 190 200
670 680 690 700 710 720
pF1KSD HTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVEGA
:::..:::.:::::::::::::::::::.: ::: ..:. ::: :::.::.:.::. :..
NP_001 HTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESS
210 220 230 240 250 260
730 740 750 760 770 780
pF1KSD RKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVPDE
:::::::::::.:::.:::: :.:: :::::::::::.:: : .: :: :.. ::.
NP_001 RKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDH
270 280 290 300 310 320
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pF1KSD ELDALKIKISQIKSDIQREKRANKG-SKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRNG
::. .:.::: .::.::.:: :::: :.: ::::::. :.: :::: ::.. ::.:.:::
NP_001 ELEDMKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNG
330 340 350 360 370 380
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pF1KSD KSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTINK
::: ::.::::::.:::: :.. ::: ...: :.:::::.::.:: ::.:::.::.: ::
NP_001 KSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNK
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD EDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEE
.:::::::::::.:::::: :::::.:::::::::::::::.::::::.::::::.:.::
NP_001 DDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEE
450 460 470 480 490 500
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD FEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVIA
:::::::::.::::::::::.:::. :...: .:..:::::.:::::... ..:. ::
NP_001 FEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIE
510 520 530 540 550 560
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD MNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERR
::::.:..:.::.::..:::: ::.::::::::::.::::::::::::::::::::.:.:
NP_001 MNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKR
570 580 590 600 610 620
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD GMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFT
:.:::::::.::::::::::::.::.::::. .:.:.::.::::::::::::::::::.:
NP_001 GIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLT
630 640 650 660 670 680
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD DEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLH
:..:: : ::::::::.:::.::..:: :::. ::.::::::.::::::::: .::::::
NP_001 DRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLH
690 700 710 720 730 740
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD NLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSK
::::::::::::::: ::: .. . .: :: .::.:::::::.:: : . :
NP_001 NLATVFGPTLLRPSEVESK-----AHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELK
750 760 770 780 790 800
1270
pF1KSD RQSILFSTEV
:... :::.:
NP_001 RNTLYFSTDV
810
>>NP_001083 (OMIM: 600365) active breakpoint cluster reg (822 aa)
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Smith-Waterman score: 3691; 70.7% identity (89.1% similar) in 786 aa overlap (487-1271:43-822)
460 470 480 490 500 510
pF1KSD DDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSGALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSH
: ... ::::::: ::::.::::: :...
NP_001 KVLEDEDVFLLEECELGTPTSPGSGSPFLVAVKVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYINQ
20 30 40 50 60 70
520 530 540 550 560 570
pF1KSD LEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTSQQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQR
:::::::::::::.::::::::: :::::::.:. ..:::::::::.: :.::::. :
NP_001 LEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVT
80 90 100 110 120 130
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pF1KSD VGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGVAMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTK
.: ::::::::::::.:::::: ::.: :::: :.: :: .:::.:.... ::.:: :.
NP_001 MGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTS
140 150 160 170 180 190
640 650 660 670 680 690
pF1KSD NSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDLLKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRR
..:.:::::.::::::::::::::::::..:::.:::::::::::::::::::.: :::
NP_001 VTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRR
200 210 220 230 240 250
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pF1KSD QSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELVEGARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWY
..:. ::: :::.::.:.::. :..:::::::::::.:::.:::: :.:: ::::::::
NP_001 TAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWY
260 270 280 290 300 310
760 770 780 790 800 810
pF1KSD IPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVPDEELDALKIKISQIKSDIQREKRANKG-SKATERLK
:::.:: : .: :: :.. ::.::. .:.::: .::.::.:: :::: :.: ::::
NP_001 IPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERLK
320 330 340 350 360 370
820 830 840 850 860 870
pF1KSD KKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRNGKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLT
::. :.: :::: ::.. ::.:.:::::: ::.::::::.:::: :.. ::: ...: :.
NP_001 KKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLS
380 390 400 410 420 430
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pF1KSD SVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTINKEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEV
:::::.::.:: ::.:::.::.: ::.:::::::::::.:::::: :::::.::::::::
NP_001 SVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEV
440 450 460 470 480 490
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pF1KSD DSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEEFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTD
:::::::.::::::.::::::.:.:::::::::::.::::::::::.:::. :...: .:
NP_001 DSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVD
500 510 520 530 540 550
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pF1KSD RLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVIAMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVK
..:::::.:::::... ..:. :: ::::.:..:.::.::..:::: ::.:::::::::
NP_001 KIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVK
560 570 580 590 600 610
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD IAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVNNKDVSVM
:.::::::::::::::::::::.:.::.:::::::.::::::::::::.::.::::. .:
NP_001 ISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDANNKDILLM
620 630 640 650 660 670
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD MSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEAN
.:.::.::::::::::::::::::.::..:: : ::::::::.:::.::..:: :::. :
NP_001 LSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPN
680 690 700 710 720 730
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KSD LLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSW
:.::::::.::::::::: .::::::::::::::::::::: ::: .. . .: :
NP_001 LITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESK-----AHLTSAADIW
740 750 760 770 780
1240 1250 1260 1270
pF1KSD SLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSKRQSILFSTEV
: .::.:::::::.:: : . ::... :::.:
NP_001 SHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
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>>XP_016880028 (OMIM: 600365) PREDICTED: active breakpoi (1137 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVDPVGFAEAWKAQFPDSEPPRMELRSVGDIEQELERCKASIRRLEQEVNQERFRMIYLQ
: :: .: . :.:.:: .: : .:.:: : :.:::: ::: : :: ::
XP_016 MWDPRAFERRWRAEFPGAEAPVPRLESVRDAERELER-----RRL----NLER-----LQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD TLLAKEKKSYDRQRWGFRRAAQAPDGASEPRASASRPQPAPADGADPPPAEEPEARPDGE
.::.:. . :: :.:. .: . :.: . :: .::: :
XP_016 QVLAEEQLK-----------------ASLPQAALAR-----GGGGD---SGEP-GRPDPE
50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KSD GSPGKARPGTARRPGAAASGERDD--RGPPASVAALRSNFERIRKGHGQPGADAEKPFYV
. .. :: :: : . : : :: :. : : :. :::
XP_016 AESPRGDPG---RPDPEAESPRGDLPAGPGAAGEA----------GGGRSWADA------
90 100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KSD NVEFHHERGLVKVNDKEVSDRISSLGSQAMQMERKKSQHGAGSSVGDASRPPYRGRSSES
: : :.. :.. . . : .:: . : : ..:.
XP_016 ---VH--RQLLQP-----------------QLRFRAREDDA--PLGDPQAAP--G-TDEG
130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SCGVDGDYEDAELNPRFLKDNLIDANG--GSRPPWPPLEYQPYQSIYVGGMMEGEGKGPL
. : : :.: ...: .:. .. . : :.: .: . .. .. : :. :
XP_016 GDGGDHDFEMVDFNEKFILSHWLVAPCRFGTR----ERARSPRRWMH---LIPG-GRRP-
160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KSD LRSQSTSEQEKRLTWPR-RSYSPRSFEDCGGGYTPDCSSNENLTSSEEDFSSGQSSRVSP
...: . :.: . . : :: . :. : :.: :
XP_016 --QRGTRDLEQREAEAKGRPGSPLAAEETPG--------REHL----------------P
210 220 230
360 370 380 390 400 410
pF1KSD SPTTYRMFRDKSRSPSQNSQQSFDSSSPPTPQCHKRHRHCPVVVSEATIVGVRKTGQIWP
: : : : : ..: ::: . .::
XP_016 -PWRRRRFL---RVPERDSP---GHSSPERDSDGSRHS----------------------
240 250 260 270
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pF1KSD NDGEGAFHGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDG---LPYIDDSPSSSPHLSSKGRG
.: : : .:: :.:: : . :::. .: .::::.::. ::.::....:
XP_016 SDREDDF--SADFSYGTDEYDG---EGNEEQKGPPEGSETMPYIDESPTMSPQLSARSQG
280 290 300 310 320
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pF1KSD SRDALVSGALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAAT
. :. :: . : .. ::::::: ::::.::::: :...:::::::::::::.::
XP_016 GGDG-VSPTPPEGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYINQLEALLLPMKPLKATAT
330 340 350 360 370 380
540 550 560 570 580 590
pF1KSD TSQPVLTSQQIETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYR
::::::: :::::::.:. ..:::::::::.: :.::::. : .: ::::::::::::.
XP_016 TSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQLGVYK
390 400 410 420 430 440
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pF1KSD AFVDNYGVAMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTR
:::::: ::.: :::: :.: :: .:::.:.... ::.:: :. ..:.:::::.:::::
XP_016 AFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTR
450 460 470 480 490 500
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pF1KSD STLVLHDLLKHTPASHPDHPLLQDALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKD
:::::::::::::..:::.:::::::::::::::::::.: ::: ..:. ::: :::.::
XP_016 STLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKD
510 520 530 540 550 560
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pF1KSD SFMVELVEGARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEA
.:.::. :..:::::::::::.:::.:::: :.:: :::::::::::.:: : .: ::
XP_016 GFLVEVSESSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEA
570 580 590 600 610 620
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pF1KSD VPNIPLVPDEELDALKIKISQIKSDIQREKRANKG-SKATERLKKKLSEQESLLLLMSPS
:.. ::.::. .:.::: .::.::.:: :::: :.: ::::::. :.: :::: ::.
XP_016 SPQVHPFPDHELEDMKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPT
630 640 650 660 670 680
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pF1KSD MAFRVHSRNGKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSLTSVELQMLTNSCVKLQT
. ::.:.:::::: ::.::::::.:::: :.. ::: ...: :.:::::.::.:: ::.:
XP_016 IPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRT
690 700 710 720 730 740
900 910 920 930 940 950
pF1KSD VHSIPLTINKEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYR
::.::.: ::.:::::::::::.:::::: :::::.:::::::::::::::.::::::.:
XP_016 VHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLEVDSFGYFVSKAKTRVFR
750 760 770 780 790 800
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pF1KSD DTAEPNWNEEFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGESTDRLMGKGQVQLDPQALQ
:::::.:.:::::::::::.::::::::::.:::. :...: .:..:::::.:::::...
XP_016 DTAEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVE
810 820 830 840 850 860
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD DRDWQRTVIAMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGVKIAVVTKRERSKVPYIV
..:. :: ::::.:..:.::.::..:::: ::.::::::::::.::::::::::::::
XP_016 TKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIV
870 880 890 900 910 920
1080 1090 1100 1110
pF1KSD RQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVN-------------------NKDV
::::::.:.::.:::::::.::::::::::::.::.. :::.
XP_016 RQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDASKQLQKLTRADSLAQDDPTYNKDI
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1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD SVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLP
.:.:.::.::::::::::::::::::.::..:: : ::::::::.:::.::..:: :::
XP_016 LLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLP
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pF1KSD EANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMT
. ::.::::::.::::::::: .::::::::::::::::::::: ::: .. . .
XP_016 DPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESK-----AHLTSAA
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pF1KSD DSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSKRQSILFSTEV
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XP_016 DIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
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pF1KSD IDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSGALESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLS
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XP_011 IDESPTMSPQLSARSQGGGDG-VSPTPPEGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYIN
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XP_011 QLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQIETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQV
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pF1KSD RVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGVAMEMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTT
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XP_011 TMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVALETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHT
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XP_011 SVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLKHTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPR
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XP_011 RTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESSRKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKW
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pF1KSD YIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVPDEELDALKIKISQIKSDIQREKRANKG-SKATERL
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XP_011 YIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDHELEDMKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERL
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pF1KSD KKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRNGKSYTFLISSDYERAEWRENIREQQKKCFRSFSL
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XP_011 KKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNGKSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVL
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pF1KSD TSVELQMLTNSCVKLQTVHSIPLTINKEDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLE
.:::::.::.:: ::.:::.::.: ::.:::::::::::.:::::: :::::.:::::::
XP_011 SSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNKDDDESPGLYGFLHVIVHSAKGFKQSANLYCTLE
470 480 490 500 510 520
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pF1KSD VDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEEFEIELEGSQTLRILCYEKCYNKTKIPKEDGEST
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XP_011 VDSFGYFVSKAKTRVFRDTAEPKWDEEFEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIV
530 540 550 560 570 580
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD DRLMGKGQVQLDPQALQDRDWQRTVIAMNGIEVKLSVKFNSREFSLKRMPSRKQTGVFGV
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XP_011 DKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIEMNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGV
590 600 610 620 630 640
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pF1KSD KIAVVTKRERSKVPYIVRQCVEEIERRGMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVN------
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XP_011 KISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKRGIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDASKQLQKL
650 660 670 680 690 700
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KSD -------------NKDVSVMMSEMDVNAIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALS
:::. .:.:.::.::::::::::::::::::.::..:: : ::::::
XP_011 TRADSLAQDDPTYNKDILLMLSDMDINAIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALS
710 720 730 740 750 760
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pF1KSD DPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFLLDHLKRVAEKEAVNKMSLHNLATVFGPTLLRPS
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XP_011 DPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFLLEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPS
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1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KSD EKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQVQVLLYFLQLEAIPAPDSKRQSILFSTEV
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XP_011 EVESK-----AHLTSAADIWSHDVMAQVQVLLYYLQHPPISFAELKRNTLYFSTDV
830 840 850 860 870
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pF1KSD HGDADGSFGTPPGYGCAADRAEEQRRHQDGLPYIDDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSGAL
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XP_011 MPYIDESPTMSPQLSARSQGGGDG-VSPTP
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pF1KSD ESTKASELDLEKGLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALLLPMKPLKAAATTSQPVLTSQQ
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XP_011 PEGLAPGVEAGKGLEMRKLVLSGFLASEEIYINQLEALLLPMKPLKATATTSQPVLTIQQ
30 40 50 60 70 80
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pF1KSD IETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGVAM
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XP_011 IETIFYKIQDIYEIHKEFYDNLCPKVQQWDSQVTMGHLFQKLASQLGVYKAFVDNYKVAL
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pF1KSD EMAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKNSLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDLLK
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XP_011 ETAEKCSQSNNQFQKISEELKVKGPKDSKDSHTSVTMEALLYKPIDRVTRSTLVLHDLLK
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XP_011 HTPVDHPDYPLLQDALRISQNFLSSINEDIDPRRTAVTTPKGETRQLVKDGFLVEVSESS
210 220 230 240 250 260
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pF1KSD RKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLVPDE
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XP_011 RKLRHVFLFTDVLLCAKLKKTSAGKHQQYDCKWYIPLADLVFPSPEESEASPQVHPFPDH
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pF1KSD ELDALKIKISQIKSDIQREKRANKG-SKATERLKKKLSEQESLLLLMSPSMAFRVHSRNG
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XP_011 ELEDMKMKISALKSEIQKEK-ANKGQSRAIERLKKKMFENEFLLLLNSPTIPFRIHNRNG
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XP_011 KSYLFLLSSDYERSEWREAIQKLQKKDLQAFVLSSVELQVLTGSCFKLRTVHNIPVTSNK
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pF1KSD EDDESPGLYGFLNVIVHSATGFKQSSNLYCTLEVDSFGYFVNKAKTRVYRDTAEPNWNEE
.:::::::::::.:::::: :::::.:::::::::::::::.::::::.::::::.:.::
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XP_011 FEIELEGSQSLRILCYEKCYDKTKVNKDNNEIVDKIMGKGQIQLDPQTVETKNWHTDVIE
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XP_011 MNGIKVEFSMKFTSRDMSLKRTPSKKQTGVFGVKISVVTKRERSKVPYIVRQCVEEVEKR
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pF1KSD GMEEVGIYRVSGVATDIQALKAAFDVN-------------------NKDVSVMMSEMDVN
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XP_011 GIEEVGIYRISGVATDIQALKAVFDASKQLQKLTRADSLAQDDPTYNKDILLMLSDMDIN
630 640 650 660 670 680
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pF1KSD AIAGTLKLYFRELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAKESCMLNLLLSLPEANLLTFLFL
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XP_011 AIAGTLKLYFRELPEPLLTDRLYPAFMEGIALSDPAAKENCMMHLLRSLPDPNLITFLFL
690 700 710 720 730 740
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pF1KSD LDHLKRVAEKEAVNKMSLHNLATVFGPTLLRPSEKESKLPANPSQPITMTDSWSLEVMSQ
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XP_011 LEHLKRVAEKEPINKMSLHNLATVFGPTLLRPSEVESK-----AHLTSAADIWSHDVMAQ
750 760 770 780 790 800
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1271 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]