Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDB0002
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDB0002, 1242 aa
1>>>pF1KSDB0002 1242 - 1242 aa - 1242 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6077+/-0.000885; mu= 5.2192+/- 0.054
mean_var=247.3739+/-49.423, 0's: 0 Z-trim(115.0): 22 B-trim: 7 in 1/53
Lambda= 0.081545
statistics sampled from 15566 (15584) to 15566 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.479), width: 16
Scan time: 6.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2463.1 IRS1 gene_id:3667|Hs108|chr2 (1242) 8526 1016.8 0
CCDS9510.1 IRS2 gene_id:8660|Hs108|chr13 (1338) 1545 195.6 7.3e-49
CCDS14544.1 IRS4 gene_id:8471|Hs108|chrX (1257) 758 103.0 5.1e-21
>>CCDS2463.1 IRS1 gene_id:3667|Hs108|chr2 (1242 aa)
initn: 8526 init1: 8526 opt: 8526 Z-score: 5429.8 bits: 1016.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8526; 100.0% identity (100.0% similar) in 1242 aa overlap (1-1242:1-1242)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASPPESDGFSDVRKVGYLRKPKSMHKRFFVLRAASEAGGPARLEYYENEKKWRHKSSAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MASPPESDGFSDVRKVGYLRKPKSMHKRFFVLRAASEAGGPARLEYYENEKKWRHKSSAP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KRSIPLESCFNINKRADSKNKHLVALYTRDEHFAIAADSEAEQDSWYQALLQLHNRAKGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 KRSIPLESCFNINKRADSKNKHLVALYTRDEHFAIAADSEAEQDSWYQALLQLHNRAKGH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD HDGAAALGAGGGGGSCSGSSGLGEAGEDLSYGDVPPGPAFKEVWQVILKPKGLGQTKNLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 HDGAAALGAGGGGGSCSGSSGLGEAGEDLSYGDVPPGPAFKEVWQVILKPKGLGQTKNLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GIYRLCLTSKTISFVKLNSEAAAVVLQLMNIRRCGHSENFFFIEVGRSAVTGPGEFWMQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GIYRLCLTSKTISFVKLNSEAAAVVLQLMNIRRCGHSENFFFIEVGRSAVTGPGEFWMQV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DDSVVAQNMHETILEAMRAMSDEFRPRSKSQSSSNCSNPISVPLRRHHLNNPPPSQVGLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 DDSVVAQNMHETILEAMRAMSDEFRPRSKSQSSSNCSNPISVPLRRHHLNNPPPSQVGLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD RRSRTESITATSPASMVGGKPGSFRVRASSDGEGTMSRPASVDGSPVSPSTNRTHAHRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 RRSRTESITATSPASMVGGKPGSFRVRASSDGEGTMSRPASVDGSPVSPSTNRTHAHRHR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GSARLHPPLNHSRSIPMPASRCSPSATSPVSLSSSSTSGHGSTSDCLFPRRSSASVSGSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GSARLHPPLNHSRSIPMPASRCSPSATSPVSLSSSSTSGHGSTSDCLFPRRSSASVSGSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SDGGFISSDEYGSSPCDFRSSFRSVTPDSLGHTPPARGEEELSNYICMGGKGPSTLTAPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SDGGFISSDEYGSSPCDFRSSFRSVTPDSLGHTPPARGEEELSNYICMGGKGPSTLTAPN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD GHYILSRGGNGHRCTPGTGLGTSPALAGDEAASAADLDNRFRKRTHSAGTSPTITHQKTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GHYILSRGGNGHRCTPGTGLGTSPALAGDEAASAADLDNRFRKRTHSAGTSPTITHQKTP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SQSSVASIEEYTEMMPAYPPGGGSGGRLPGHRHSAFVPTRSYPEEGLEMHPLERRGGHHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SQSSVASIEEYTEMMPAYPPGGGSGGRLPGHRHSAFVPTRSYPEEGLEMHPLERRGGHHR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PDSSTLHTDDGYMPMSPGVAPVPSGRKGSGDYMPMSPKSVSAPQQIINPIRRHPQRVDPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 PDSSTLHTDDGYMPMSPGVAPVPSGRKGSGDYMPMSPKSVSAPQQIINPIRRHPQRVDPN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD GYMMMSPSGGCSPDIGGGPSSSSSSSNAVPSGTSYGKLWTNGVGGHHSHVLPHPKPPVES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GYMMMSPSGGCSPDIGGGPSSSSSSSNAVPSGTSYGKLWTNGVGGHHSHVLPHPKPPVES
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SGGKLLPCTGDYMNMSPVGDSNTSSPSDCYYGPEDPQHKPVLSYYSLPRSFKHTQRPGEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SGGKLLPCTGDYMNMSPVGDSNTSSPSDCYYGPEDPQHKPVLSYYSLPRSFKHTQRPGEP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD EEGARHQHLRLSTSSGRLLYAATADDSSSSTSSDSLGGGYCGARLEPSLPHPHHQVLQPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 EEGARHQHLRLSTSSGRLLYAATADDSSSSTSSDSLGGGYCGARLEPSLPHPHHQVLQPH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LPRKVDTAAQTNSRLARPTRLSLGDPKASTLPRAREQQQQQQPLLHPPEPKSPGEYVNIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LPRKVDTAAQTNSRLARPTRLSLGDPKASTLPRAREQQQQQQPLLHPPEPKSPGEYVNIE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD FGSDQSGYLSGPVAFHSSPSVRCPSQLQPAPREEETGTEEYMKMDLGPGRRAAWQESTGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 FGSDQSGYLSGPVAFHSSPSVRCPSQLQPAPREEETGTEEYMKMDLGPGRRAAWQESTGV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD EMGRLGPAPPGAASICRPTRAVPSSRGDYMTMQMSCPRQSYVDTSPAAPVSYADMRTGIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 EMGRLGPAPPGAASICRPTRAVPSSRGDYMTMQMSCPRQSYVDTSPAAPVSYADMRTGIA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD AEEVSLPRATMAAASSSSAASASPTGPQGAAELAAHSSLLGGPQGPGGMSAFTRVNLSPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 AEEVSLPRATMAAASSSSAASASPTGPQGAAELAAHSSLLGGPQGPGGMSAFTRVNLSPN
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD RNQSAKVIRADPQGCRRRHSSETFSSTPSATRVGNTVPFGAGAAVGGGGGSSSSSEDVKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 RNQSAKVIRADPQGCRRRHSSETFSSTPSATRVGNTVPFGAGAAVGGGGGSSSSSEDVKR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD HSSASFENVWLRPGELGGAPKEPAKLCGAAGGLENGLNYIDLDLVKDFKQCPQECTPEPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 HSSASFENVWLRPGELGGAPKEPAKLCGAAGGLENGLNYIDLDLVKDFKQCPQECTPEPQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240
pF1KSD PPPPPPPHQPLGSGESSSTRRSSEDLSAYASISFQKQPEDRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 PPPPPPPHQPLGSGESSSTRRSSEDLSAYASISFQKQPEDRQ
1210 1220 1230 1240
>>CCDS9510.1 IRS2 gene_id:8660|Hs108|chr13 (1338 aa)
initn: 1792 init1: 604 opt: 1545 Z-score: 990.8 bits: 195.6 E(32554): 7.3e-49
Smith-Waterman score: 2446; 41.0% identity (59.6% similar) in 1351 aa overlap (13-1222:31-1287)
10 20 30
pF1KSD MASPPESDGFSDVRKVGYLRKPKSMHKRFFVLRA-------A
::: ::::: : ::::::::. :
CCDS95 MASPPRHGPPGPASGDGPNLNNNNNNNNHSVRKCGYLRKQKHGHKRFFVLRGPGAGGDEA
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KSD SEAGG----PARLEYYENEKKWRHKSSAPKRSIPLESCFNINKRADSKNKHLVALYTRDE
. .:: : ::::::.::::: :..:::: : :. :.:::::::.:.:.:.::::.::
CCDS95 TAGGGSAPQPPRLEYYESEKKWRSKAGAPKRVIALDCCLNINKRADAKHKYLIALYTKDE
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KSD HFAIAADSEAEQDSWYQALLQL--HNRAKGHHDGAAALGAGGGGGSCSGSSG--LGEAGE
.::.::..: ::..::.:: .: ..:: . :: :.. ..: :. : : ::
CCDS95 YFAVAAENEQEQEGWYRALTDLVSEGRAAAGDAPPAAAPAASCSASLPGALGGSAGAAGA
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DLSYGDVPPGPA-FKEVWQVILKPKGLGQTKNLIGIYRLCLTSKTISFVKLNSEAAAVVL
. ::: : :. : ..::::: ::::::::.::: :.:::::...::.::::: : .:.:
CCDS95 EDSYGLVAPATAAYREVWQVNLKPKGLGQSKNLTGVYRLCLSARTIGFVKLNCEQPSVTL
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KSD QLMNIRRCGHSENFFFIEVGRSAVTGPGEFWMQVDDSVVAQNMHETILEAMRAMSD--EF
:::::::::::..::::::::::::::::.:::.::::::::.::::::::.:... ::
CCDS95 QLMNIRRCGHSDSFFFIEVGRSAVTGPGELWMQADDSVVAQNIHETILEAMKALKELFEF
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD RPRSKSQSS-SNCSNPISVP--LRRHHLNNPPPSQVGLTRRSRTESITATSPASMVGGKP
::::::::: :. ..::::: :.::: : ::::.::.:::::.:..:: ::. :
CCDS95 RPRSKSQSSGSSATHPISVPGARRHHHLVNLPPSQTGLVRRSRTDSLAATPPAA----KC
310 320 330 340 350
330 340 350 360
pF1KSD GSFRVRASSDGEGTMS--------RPASVDGSPVSPSTNRTHAHR-H--------RGS-A
.: :::..:.:.: . ::.:: :::.::. :. : : ::: .
CCDS95 SSCRVRTASEGDGGAAAGAAAAGARPVSVAGSPLSPGPVRAPLSRSHTLSGGCGGRGSKV
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400
pF1KSD RLHPP---LNHSRSIPMPASRCSPSATSPVSLSSSSTSGHGSTS----------------
: : :.::::. ::... :.:::: :::::: :::: :
CCDS95 ALLPAGGALQHSRSMSMPVAHSPPAATSPGSLSSSS--GHGSGSYPPPPGPHPPLPHPLH
420 430 440 450 460 470
410 420 430 440 450
pF1KSD --DCLFPRRSSASVSGSPSDGGFISSDEYGSSPCDFRS--SFRSVTPDSLGHTPPAR---
: .:::.:::::: ::.: ::::::: :.:. : :: ::.:...:::::
CCDS95 HGPGQRPSSGSASASGSPSDPGFMSLDEYGSSPGDLRAFCSHRSNTPESIAETPPARDGG
480 490 500 510 520 530
460 470 480 490 500 510
pF1KSD GEEELSNYICMGGKGPSTLTAPNGHYILSRGGNGHRCTPGTGLGTSPALAGDEAASAADL
: :. .:. :. : ::. : ..: ..:: .: ::
CCDS95 GGGEFYGYM--------TMDRP-----LSHCGRSYR-----------RVSGD---AAQDL
540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KSD DNRFRKRTHSAGTSPTITHQKTPSQSSVASIEEYTEMMPAYPPGGGSGGRL-PG-HRHSA
: .::::.: :.:. .:. : : ::..::: : .. .::.::: :. :
CCDS95 DRGLRKRTYSL-TTPA--RQRPVPQPSSASLDEYTLMRATF---SGSAGRLCPSCPASSP
570 580 590 600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KSD FVPTRSYPEEGLEMHPLERRGGHHRPDSSTLHTDDGYMPMSPGVAPVPSGRKG--SGDYM
: . :::. ... : :: .::.: .:::::::.::.: . :: . : :::
CCDS95 KVAYHPYPEDYGDIEI-----GSHRSSSSNLGADDGYMPMTPGAALAGSGSGSCRSDDYM
630 640 650 660 670
640 650 660 670 680
pF1KSD PMSPKSVSAPQQIINP-----IRRHPQRVDPNGYMMMSPSGGCSPDIGGGPSSSSSSSNA
:::: :::::.::..: . : : : .: : ::: ..:: . ..
CCDS95 PMSPASVSAPKQILQPRAAAAAAAAVPSAGPAGPAPTSAAGRTFPASGGGYKASSPAESS
680 690 700 710 720 730
690 700 710 720 730 740
pF1KSD VPSGTSYGKLWTNGVGGHHSHVLPHPKPPVESSGGKLLPCTGDYMNMSPVGDSNTSSPSD
: ..: ..: .. : .: . ::::: .:::.:.:: .:..: :
CCDS95 -PEDSGYMRMWCGS------------KLSMEHADGKLLP-NGDYLNVSPSDAVTTGTPPD
740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KSD CYYGPEDPQHKPVLS-----YYSLPRSFKHTQRPGEPEEGARHQHLRLSTSSGRLLYAAT
. . : .:. . : :::::.: : : :.. .:. ::.:
CCDS95 FFSAALHPGGEPLRGVPGCCYSSLPRSYKAPYTCG----GDSDQYVLMSSPVGRILEEER
790 800 810 820 830
810 820 830 840 850
pF1KSD ADDSSS---STSSDSLGGGYCGARLEPSLPHPHHQVLQPHLPR--KVDTAAQTNSRLARP
. ... : .....:.: :. : :: : .: : . . .: .::
CCDS95 LEPQATPGPSQAASAFGAG-------PTQP-PHPVVPSPVRPSGGRPEGFLGQRGRAVRP
840 850 860 870 880 890
860 870 880 890 900 910
pF1KSD TRLSL-GDPKASTLPRAREQQQQQQPLLHPPEPKSPGEYVNIEFGSDQSGYLSGPV----
::::: : : .:: .: :: ::::::::::.::.:: . .. :: :.
CCDS95 TRLSLEGLP---SLPSMHE-----YPL--PPEPKSPGEYINIDFG-EPGARLSPPAPPLL
900 910 920 930
920 930 940 950 960
pF1KSD --AFHSSP--SVRCP-SQL---QP---APREEETGTEEYMKMDLGPGRRAAWQESTGVEM
: :: :. : :.: : . .... .::..:.. . .: .
CCDS95 ASAASSSSLLSASSPASSLGSGTPGTSSDSRQRSPLSDYMNLDFSSPKSPKPGAPSGHPV
940 950 960 970 980 990
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD GRL-GPAPPGAASICRPTRAVPSSRGDYMTMQMSCPRQSYVDTSPAAPVSYADMRTGIAA
: : : : :.: : ::. . ..: : . . :.: . : .:
CCDS95 GSLDGLLSPEASSPYPPLPPRPSASPSS-SLQPPPPPPAPGELYRLPPASAVATAQGPGA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1030 1040 1050 1060
pF1KSD EEVSLPRAT--------MA--AASSSSAASASPTGPQGAAELAAHSS---LLGGPQGPGG
:: : :: .:.. :.: :. ::..:. .: :. . .:
CCDS95 AS-SLSSDTGDNGDYTEMAFGVAATPPQPIAAPPKPE-AARVASPTSGVKRLSLMEQVSG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD MSAFTRVNLSPNRNQSAKVIRADPQGCRRRHSSETFSSTPSATRVGNTVPFG--------
. :: ... :. ...:::::::::: :::::::::::: ..: :. . .
CCDS95 VEAFLQASQPPDPHRGAKVIRADPQGGRRRHSSETFSSTTTVTPVSPSFAHNPKRHNSAS
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1130 1140 1150 1160
pF1KSD -----------AGAAVGGGGGSSSSSEDVKRHSSASFE---NVWL--RPGELGGAPKE--
.:..:: :::. . . . . . : .:: : : :
CCDS95 VENVSLRKSSEGGVGVGPGGGDEPPTSPRQLQPAPPLAPQGRPWTPGQPGGLVGCPGSGG
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD -PAKLCGAAGGLENGLNYIDLDLVKDFKQCPQECTPEPQPPPPPPPHQPLGSGESSSTRR
: . .:: ..:::::: .: :.. : :.::::::: : :: :..:: :
CCDS95 SPMRRETSAG-FQNGLNYIAID-VREEPGLP----PQPQPPPPPLP-QP---GDKSSWGR
1240 1250 1260 1270 1280
1230 1240
pF1KSD SSEDLSAYASISFQKQPEDRQ
.
CCDS95 TRSLGGLISAVGVGSTGGGCGGPGPGALPPANTYASIDFLSHHLKEATIVKE
1290 1300 1310 1320 1330
>>CCDS14544.1 IRS4 gene_id:8471|Hs108|chrX (1257 aa)
initn: 974 init1: 510 opt: 758 Z-score: 490.8 bits: 103.0 E(32554): 5.1e-21
Smith-Waterman score: 1196; 29.3% identity (53.3% similar) in 1233 aa overlap (12-1140:78-1218)
10 20 30 40
pF1KSD MASPPESDGFSDVRKVGYLRKPKSMHKRFFVLRAASEAGGP
.: : ::::: : :.:.:::. . : .:
CCDS14 SSCPGAMWLSTATGSRSDSESEEEDLPVGEEVCKRGYLRKQKHGHRRYFVLKLET-ADAP
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80
pF1KSD ARLEYYENEKKWRHKSSA-------------------PKRSIPLESCFNINKRADSKNKH
:::::::: .:.::. : :.: : : .::....:::.. .:
CCDS14 ARLEYYENARKFRHSVRAAAAAAAAAASGAAIPPLIPPRRVITLYQCFSVSQRADARYRH
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KSD LVALYTRDEHFAIAADSEAEQDSWYQALLQLHNRAKGHHDGAAALGAGGGGGSCSGSSGL
:.::.:.::.::..:..:.::.::: : .: ..: .. : .::: : .
CCDS14 LIALFTQDEYFAMVAENESEQESWYLLLSRLILESKRRRCG--TLGAQPDGEPAA-----
170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KSD GEAGEDLSYGDVPPGPAFKEVWQVILKPKGLGQTKNLIGIYRLCLTSKTISFVKLNSEAA
:. . . : .:.:::::.::.:::. :.: :..:::::.. . ::.::.:.:
CCDS14 ------LAAAAAAEPPFYKDVWQVIVKPRGLGHRKELSGVFRLCLTDEEVVFVRLNTEVA
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KSD AVVLQLMNIRRCGHSENFFFIEVGRSAVTGPGEFWMQVDDSVVAQNMHETILEAMRAM-S
.::.::..::::::::..::.:::::.: ::::.:::::: :::::::: .:: :::. .
CCDS14 SVVVQLLSIRRCGHSEQYFFLEVGRSTVIGPGELWMQVDDCVVAQNMHELFLEKMRALCA
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KSD DEFRPRSKSQSSSNCSNPISVPLRRHHLNNPPPSQVGLTRRSRTESITATSPASMVGGKP
::.: : .: : : .. ... :.::. : : :::: :..
CCDS14 DEYRARCRSYSISIGAHLLTLLSARRHLGLVPLEPGGWLRRSRFEQFC------------
340 350 360 370 380
330 340 350 360 370
pF1KSD GSFRVRASSDGEGTM--SRPASVDGSPVSPST-NRTHAHRHRGSAR-LHPPLNHSRSI-P
..:: .::: : .: . . ::. : .: : : : : : . : . : . :
CCDS14 ---HLRAIGDGEDEMLFTRRFVTPSEPVAHSRRGRLHLPRGRRSRRAVSVPASFFRRLAP
390 400 410 420 430
380 390 400 410
pF1KSD MPASRCSPSA--------TSPVSLSSSSTSGH-----------GSTSDCLFPRRSSASVS
:: :. .: :: :.:.. :. :: .: . : . .: .
CCDS14 SPARPRHPAEAPNNGARLSSEVSGSGSGNFGEEGNPQGKEDQEGSGGDYM-PMNNWGSGN
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KSD GSPSDGGFISSDEYGSSPCDFRSSFRSVTPDS---LGHTPPARGEEELS--NYICMGGKG
: : :: :. . .:: . .. . : : . . : .. : . ::.:
CCDS14 GRGSGGGQGSNGQGSSSHSSGGNQCSGEGQGSRGGQGSNGQGSGGNQCSRDGQGTAGGHG
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520
pF1KSD PSTLTAPNGHYILSRGGNGHRCTPGTGLG-TSPALAGDEAASAADLDNR----FRKRTHS
. :.: . : ::.: :.: : .: . :. .....: :.. ..::..
CCDS14 SGGGQRPGGGHG-SGGGQGPGDGHGSGGGKNSGGGKGSGSGKGSDGDGERGKSLKKRSYF
560 570 580 590 600 610
530 540 550 560 570 580
pF1KSD AGTSPTITHQKTPSQSSVASIEEYTEMMPAYPPGGGSGGR-LPGHRHSA-FVPTRSYPEE
. . . .: : : ::.::.::. : : : :. .:
CCDS14 GKLTQSKQQQMPPPPPPP----------PPPPPAGGTGGKGKSGGRFRLYFCVDRGATKE
620 630 640 650 660
590 600 610 620 630
pF1KSD GLEMHPLER----RG---GHHRPDSSTLHTDDGYMPMSPGVA-PVPSGRKGSGDYMPMSP
: . .. .: : :: . :: :.:: :::: :. : :.:::::.:
CCDS14 CKEAKEVKDAEIPEGAARGPHRARAFDEDEDDPYVPMRPGVATPLVS----SSDYMPMAP
670 680 690 700 710 720
640 650 660 670 680 690
pF1KSD KSVSAPQQIINPIRRHPQRV--DPNGYMMMSP--SGGCSPDIGGGPSSSSSSSNAVPSGT
..::: . .:: . : ::::: : : .:. .:.... ... ..
CCDS14 QNVSASK------KRHSRSPFEDSRGYMMMFPRVSPPPAPSPPKAPDTNKEDDSKDNDSE
730 740 750 760 770
700 710 720 730 740 750
pF1KSD SYGKLWTNGVGGHHSHVLPHPKPPVESSGGKLLPCTGDYMNMSPVGDSNTSSPSDCYYGP
: . . :.:. :: : . .::. ..:... : . ::: :
CCDS14 SDYMFMAPGAGAI-------PKNPRNPQGGSSSKSWSSYFSL-P--NPFRSSP----LGQ
780 790 800 810 820
760 770 780 790 800 810
pF1KSD ED-PQHKPVLSYYSLPRSF-KHTQRPGEPEEGARHQHLRLSTSSGRLLYAATADDSSSST
.: .. :.: : :.. :... .:...: : ::. .. .: .: :
CCDS14 NDNSEYVPMLPGKFLGRGLDKEVSYNWDPKDAA-------SKPSGEGSFSKPGDGGSPSK
830 840 850 860 870
820 830 840 850
pF1KSD SSDS------------LGGGYCGARLEPSLPHPHHQVLQPHLPRKVDTAAQTNSRLARPT
:: :. : ...:. .: :. :..:.... .
CCDS14 PSDHEPPKNKAKRPNRLSFITKGYKIKPKPQKPTHE------QREADSSSDYVNMDFTKR
880 890 900 910 920
860 870 880 890 900
pF1KSD RLSLGDPKASTLPRAREQQQQQQPLLHPPEPKSPGEYVNIEFG-------SDQSGYL---
. . :... :: .. .. :. .. ..:::.::: .: : :
CCDS14 ESNTPAPSTQGLP-------DSWGIIAEPRQSAFSNYVNVEFGVPFPNPANDLSDLLRAI
930 940 950 960 970 980
910 920 930 940 950 960
pF1KSD --SGPVAFHSS----PSVRCPSQLQPAPREEETGTEEYMKMDLGPGRRAAWQEST---GV
..:... :. : . . . : .:: : .. . :. : .:. .
CCDS14 PRANPLSLDSARWPLPPLPLSATGSNAIEEEGDYIEVIFNSAMTPA--MALADSAIRYDA
990 1000 1010 1020 1030 1040
970 980 990 1000 1010
pF1KSD EMGRLGPAPPGAASICRPTRAVPS--SRGDYMTMQMSCPRQSYVDTSPAAPVSYADMRTG
: ::. . : . : :: :. .. .. .: . . .: :..
CCDS14 ETGRIYVVDP-FSECCMDISLSPSRCSEPPPVARLLQEEEQERRRPQSRSQSFFAAARAA
1050 1060 1070 1080 1090
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD IAAEEV-SLPRATMAAASSSSAASASPTGPQGAAELAAHSSLLGGPQGPGGMSAFTRVNL
..: . :: : ... . :..: :: . . .:: :.: ..: : :. .: . .
CCDS14 VSAFPTDSLERDLSPSSAPAVASAAEPTLALSQV-VAAASALAAAP-GIGAAAAAAGFDS
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD SPNRNQSAKVIRADPQGCRRRHSSETFSSTPSATRVGNTVPFGAGAAVGGGGGSSSSSED
. : . . :: .. : .. .:.:.: . .. : . : ::....... :
CCDS14 ASARWFQPVANAADAEAVRGAQDVAG-GSNPGAHNPSANLARGDNQA-GGAAAAAAAPEP
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD VKRHSSASFENVWLRPGELGGAPKEPAKLCGAAGGLENGLNYIDLDLVKDFKQCPQECTP
:
CCDS14 PPRSRRVPRPPEREDSDNDDDTHVRMDFARRDNQFDSPKRGR
1220 1230 1240 1250
1242 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 08:01:20 2016 done: Thu Nov 3 08:01:21 2016
Total Scan time: 6.000 Total Display time: 0.190
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]