FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1951, 670 aa
1>>>pF1KSDA1951 670 - 670 aa - 670 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5360+/-0.000374; mu= 0.0059+/- 0.024
mean_var=435.3044+/-92.000, 0's: 0 Z-trim(126.1): 1622 B-trim: 1824 in 1/60
Lambda= 0.061472
statistics sampled from 49270 (51265) to 49270 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.824), E-opt: 0.2 (0.601), width: 16
Scan time: 14.430
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_597701 (OMIM: 614387) zinc finger protein 526 [ ( 670) 4740 434.6 5.6e-121
NP_001300962 (OMIM: 614387) zinc finger protein 52 ( 670) 4740 434.6 5.6e-121
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 717 77.9 1.4e-13
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 717 77.9 1.4e-13
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 715 77.6 1.5e-13
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 715 77.6 1.5e-13
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 717 77.9 1.5e-13
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 717 77.9 1.5e-13
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 717 77.9 1.5e-13
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 715 77.6 1.5e-13
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 715 77.7 1.6e-13
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 715 77.7 1.6e-13
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 720 78.3 1.6e-13
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 720 78.3 1.6e-13
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 720 78.3 1.6e-13
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 720 78.3 1.6e-13
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 720 78.3 1.6e-13
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 715 77.7 1.6e-13
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 715 77.7 1.6e-13
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 715 77.7 1.6e-13
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 715 77.7 1.6e-13
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 715 77.7 1.6e-13
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 692 75.8 7.7e-13
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 692 75.8 8.2e-13
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 692 75.8 8.2e-13
XP_016882719 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 684 74.9 1e-12
XP_016882718 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 684 74.9 1e-12
XP_016882717 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 646) 684 74.9 1e-12
XP_016882712 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_011525573 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_016882714 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_011525571 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_016882710 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_016882716 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_016882706 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_016882711 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_016882709 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_016882715 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_016882708 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_016882707 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_011525569 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_011525575 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
XP_016882713 (OMIM: 194554) PREDICTED: zinc finger ( 682) 684 74.9 1.1e-12
NP_003416 (OMIM: 194554) zinc finger protein 45 [H ( 682) 684 74.9 1.1e-12
NP_003424 (OMIM: 604074) zinc finger protein 132 [ ( 706) 677 74.3 1.7e-12
NP_001273627 (OMIM: 194552) zinc finger protein 79 ( 364) 666 73.0 2.2e-12
XP_016881627 (OMIM: 606956) PREDICTED: zinc finger ( 474) 668 73.3 2.3e-12
NP_001252529 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 503) 668 73.4 2.4e-12
NP_001252528 (OMIM: 601856) zinc finger protein 21 ( 555) 668 73.4 2.5e-12
XP_011526568 (OMIM: 603971) PREDICTED: zinc finger (1092) 675 74.4 2.6e-12
>>NP_597701 (OMIM: 614387) zinc finger protein 526 [Homo (670 aa)
initn: 4740 init1: 4740 opt: 4740 Z-score: 2293.0 bits: 434.6 E(85289): 5.6e-121
Smith-Waterman score: 4740; 100.0% identity (100.0% similar) in 670 aa overlap (1-670:1-670)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEVVAEVAEMPTQMSPGAVEMSTPMSAEMMEMSTEVTEMTPGEALASSLFFQHHQFMCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 MAEVVAEVAEMPTQMSPGAVEMSTPMSAEMMEMSTEVTEMTPGEALASSLFFQHHQFMCS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ECGSLYNTLEEVLSHQEQHMLAVSEEEALTTQNVGLEPELVPGAEGPFQCGECSQLILSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 ECGSLYNTLEEVLSHQEQHMLAVSEEEALTTQNVGLEPELVPGAEGPFQCGECSQLILSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GELLAHQDAHLRESANQIQYQCWDCQELFPSPELWVAHRKAQHLSATVAEPPVPPPLPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 GELLAHQDAHLRESANQIQYQCWDCQELFPSPELWVAHRKAQHLSATVAEPPVPPPLPPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TPLPPPSPPSEVKMEPYECPECSTLCATPEEFLEHQGTHFDSLEKEERNGLEEEEEDDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 TPLPPPSPPSEVKMEPYECPECSTLCATPEEFLEHQGTHFDSLEKEERNGLEEEEEDDEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVGGDESTAGWAQGCGDCPQHQPSAGARRQHRRTAHSPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 DEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVGGDESTAGWAQGCGDCPQHQPSAGARRQHRRTAHSPAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ATHPFHCSQCQRSFSSANRLQAHGRAHVGGTHECTTCSKVFKKAASLEQHLRLHRGEARY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 ATHPFHCSQCQRSFSSANRLQAHGRAHVGGTHECTTCSKVFKKAASLEQHLRLHRGEARY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LCVDCGRGFGTELTLVAHRRAHTANPLHRCRCGKTFSNMTKFLYHRRTHAGKSGAPPTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 LCVDCGRGFGTELTLVAHRRAHTANPLHRCRCGKTFSNMTKFLYHRRTHAGKSGAPPTGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TAPPAPAEPTPPPPPPAPPAQLPCPQCSKSFASASRLSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 TAPPAPAEPTPPPPPPAPPAQLPCPQCSKSFASASRLSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD FKKLIHVRNHLRTHTGERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 FKKLIHVRNHLRTHTGERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SNLQQHRRLHLRPVAFARAPRLPITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARART
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 SNLQQHRRLHLRPVAFARAPRLPITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARART
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LTLQPPRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIETSQPLALEDTLQLCQAALGASEAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_597 LTLQPPRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIETSQPLALEDTLQLCQAALGASEAG
610 620 630 640 650 660
670
pF1KSD GLLQLDTAFV
::::::::::
NP_597 GLLQLDTAFV
670
>>NP_001300962 (OMIM: 614387) zinc finger protein 526 [H (670 aa)
initn: 4740 init1: 4740 opt: 4740 Z-score: 2293.0 bits: 434.6 E(85289): 5.6e-121
Smith-Waterman score: 4740; 100.0% identity (100.0% similar) in 670 aa overlap (1-670:1-670)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAEVVAEVAEMPTQMSPGAVEMSTPMSAEMMEMSTEVTEMTPGEALASSLFFQHHQFMCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAEVVAEVAEMPTQMSPGAVEMSTPMSAEMMEMSTEVTEMTPGEALASSLFFQHHQFMCS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ECGSLYNTLEEVLSHQEQHMLAVSEEEALTTQNVGLEPELVPGAEGPFQCGECSQLILSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ECGSLYNTLEEVLSHQEQHMLAVSEEEALTTQNVGLEPELVPGAEGPFQCGECSQLILSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GELLAHQDAHLRESANQIQYQCWDCQELFPSPELWVAHRKAQHLSATVAEPPVPPPLPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GELLAHQDAHLRESANQIQYQCWDCQELFPSPELWVAHRKAQHLSATVAEPPVPPPLPPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TPLPPPSPPSEVKMEPYECPECSTLCATPEEFLEHQGTHFDSLEKEERNGLEEEEEDDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPLPPPSPPSEVKMEPYECPECSTLCATPEEFLEHQGTHFDSLEKEERNGLEEEEEDDEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVGGDESTAGWAQGCGDCPQHQPSAGARRQHRRTAHSPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVGGDESTAGWAQGCGDCPQHQPSAGARRQHRRTAHSPAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD ATHPFHCSQCQRSFSSANRLQAHGRAHVGGTHECTTCSKVFKKAASLEQHLRLHRGEARY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATHPFHCSQCQRSFSSANRLQAHGRAHVGGTHECTTCSKVFKKAASLEQHLRLHRGEARY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LCVDCGRGFGTELTLVAHRRAHTANPLHRCRCGKTFSNMTKFLYHRRTHAGKSGAPPTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LCVDCGRGFGTELTLVAHRRAHTANPLHRCRCGKTFSNMTKFLYHRRTHAGKSGAPPTGA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TAPPAPAEPTPPPPPPAPPAQLPCPQCSKSFASASRLSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAPPAPAEPTPPPPPPAPPAQLPCPQCSKSFASASRLSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD FKKLIHVRNHLRTHTGERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FKKLIHVRNHLRTHTGERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD SNLQQHRRLHLRPVAFARAPRLPITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARART
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNLQQHRRLHLRPVAFARAPRLPITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARART
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD LTLQPPRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIETSQPLALEDTLQLCQAALGASEAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTLQPPRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIETSQPLALEDTLQLCQAALGASEAG
610 620 630 640 650 660
670
pF1KSD GLLQLDTAFV
::::::::::
NP_001 GLLQLDTAFV
670
>>NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 is (675 aa)
initn: 3037 init1: 381 opt: 717 Z-score: 364.7 bits: 77.9 E(85289): 1.4e-13
Smith-Waterman score: 796; 28.0% identity (53.1% similar) in 561 aa overlap (59-596:148-645)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD EMMEMSTEVTEMTPGEALASSLFFQHHQFMCSECGSLYNTLEEVLSHQEQHM----LAVS
:.:::. .. .. ::. : .
NP_001 VTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRHQRTHTGEKPYKCN
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KSD E-EEALTTQNVGLEPELVPGAEGPFQCGECSQLILSPGELLAHQDAHLRESANQIQYQCW
: :.:.. .. .. . . .. :..: .:.. .. : :: : :. :.:
NP_001 ECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGEKP----YKCD
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DCQELFPSPELWVAHRKAQHLSATVAEPPVPPPLPPPTPLPPPSPPSEVKMEPYECPECS
.: . : . : :.. : . .:: : ::.
NP_001 ECGKAFSQRTHLVQHQRI-HTGE----------------------------KPYTCNECG
240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KSD TLCATPEEFLEHQGTHFDSLEKEERNGLEEEEEDDEEDEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVG
. .:.::: : . :: . .: :. . ... . .
NP_001 KAFSQRGHFMEHQKIH--TGEKPFKC------------DECDKTFTRSTHLTQ--HQKIH
270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD GDESTAGWAQGCGDCPQ--HQPSAGARRQHRRTAHSPASATHPFHCSQCQRSFSSANRLQ
:.: :..: . . ::. : : : .. .:..:..: ..::. . :
NP_001 TGEKT----YKCNECGKAFNGPSTFIR--H----HMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNLT
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KSD AHGRAHVG-GTHECTTCSKVFKKAASLEQHLRLHRGEARYLCVDCGRGFGTELTLVAHRR
: ..:.: ..:. :.: :. .:: :::..: :: : : .::..:. .:. :::
NP_001 QHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECGKAFSYCSSLTQHRR
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430
pF1KSD AHTANPLHRC-RCGKTFSNMTKFLYHRRTHAGKSG--APPTG-ATAPPAPAEPTPPPPPP
:: . .: .:::.:: .... :..::. ... : : .
NP_001 IHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTG
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KSD APPAQLPCPQCSKSFASASRLSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKGFKKLIHVRNHLRTHTG
: : : .:.:.:. .: : .::. .: :: ..:. ::..:.. ::. .: : :::
NP_001 EKPYQ--CHECGKTFSYGSSLIQHRK-IH-TGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTG
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KSD ERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQSSNLQQHRRLHL--RPV
.:..: :::.: ..:..:: ::: .:::: : : :.:::.: ::.:.: .:
NP_001 AKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPY
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600
pF1KSD -------AFARAPRLP--ITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQP
::.:. .: . ...:: :. : . : . : :::.:.
NP_001 KCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCND
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIETSQPLALEDTLQLCQAALGASEAGGLLQL
NP_001 CGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
660 670
>>XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger pro (675 aa)
initn: 3037 init1: 381 opt: 717 Z-score: 364.7 bits: 77.9 E(85289): 1.4e-13
Smith-Waterman score: 796; 28.0% identity (53.1% similar) in 561 aa overlap (59-596:148-645)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD EMMEMSTEVTEMTPGEALASSLFFQHHQFMCSECGSLYNTLEEVLSHQEQHM----LAVS
:.:::. .. .. ::. : .
XP_011 VTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRHQRTHTGEKPYKCN
120 130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KSD E-EEALTTQNVGLEPELVPGAEGPFQCGECSQLILSPGELLAHQDAHLRESANQIQYQCW
: :.:.. .. .. . . .. :..: .:.. .. : :: : :. :.:
XP_011 ECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGEKP----YKCD
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DCQELFPSPELWVAHRKAQHLSATVAEPPVPPPLPPPTPLPPPSPPSEVKMEPYECPECS
.: . : . : :.. : . .:: : ::.
XP_011 ECGKAFSQRTHLVQHQRI-HTGE----------------------------KPYTCNECG
240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KSD TLCATPEEFLEHQGTHFDSLEKEERNGLEEEEEDDEEDEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVG
. .:.::: : . :: . .: :. . ... . .
XP_011 KAFSQRGHFMEHQKIH--TGEKPFKC------------DECDKTFTRSTHLTQ--HQKIH
270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD GDESTAGWAQGCGDCPQ--HQPSAGARRQHRRTAHSPASATHPFHCSQCQRSFSSANRLQ
:.: :..: . . ::. : : : .. .:..:..: ..::. . :
XP_011 TGEKT----YKCNECGKAFNGPSTFIR--H----HMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNLT
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KSD AHGRAHVG-GTHECTTCSKVFKKAASLEQHLRLHRGEARYLCVDCGRGFGTELTLVAHRR
: ..:.: ..:. :.: :. .:: :::..: :: : : .::..:. .:. :::
XP_011 QHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECGKAFSYCSSLTQHRR
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430
pF1KSD AHTANPLHRC-RCGKTFSNMTKFLYHRRTHAGKSG--APPTG-ATAPPAPAEPTPPPPPP
:: . .: .:::.:: .... :..::. ... : : .
XP_011 IHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTG
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KSD APPAQLPCPQCSKSFASASRLSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKGFKKLIHVRNHLRTHTG
: : : .:.:.:. .: : .::. .: :: ..:. ::..:.. ::. .: : :::
XP_011 EKPYQ--CHECGKTFSYGSSLIQHRK-IH-TGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTG
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KSD ERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQSSNLQQHRRLHL--RPV
.:..: :::.: ..:..:: ::: .:::: : : :.:::.: ::.:.: .:
XP_011 AKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPY
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600
pF1KSD -------AFARAPRLP--ITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQP
::.:. .: . ...:: :. : . : . : :::.:.
XP_011 KCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCND
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIETSQPLALEDTLQLCQAALGASEAGGLLQL
XP_011 CGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
660 670
>>NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 is (616 aa)
initn: 3524 init1: 441 opt: 715 Z-score: 364.2 bits: 77.6 E(85289): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 787; 32.4% identity (60.3% similar) in 413 aa overlap (192-599:167-534)
170 180 190 200 210 220
pF1KSD QHLSATVAEPPVPPPLPPPTPLPPPSPPSEVKMEPYECPECSTLCATPEEFLEHQGTHFD
:: .::.: ::. . ..::. ::
NP_001 PMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTH--
140 150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KSD SLEKEERNGLEEEEEDDEEDEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVGGDESTAGWAQGCGDCPQH
.: : : .: . ... :... . . :. : .: .
NP_001 -------TG-----ERPYECHECLKGFRNSSALTK--HQRIHTGEKP----YKCTQCGRT
200 210 220 230
290 300 310 320 330 340
pF1KSD QPSAGARRQHRRTAHSPASATHPFHCSQCQRSFSSANRLQAHGRAHVG-GTHECTTCSKV
. . ::.:: : .. .:..::.: .::: . .. : :.:.: .::. :.:.
NP_001 FNQIAPLIQHQRT-H---TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKA
240 250 260 270 280 290
350 360 370 380 390
pF1KSD FKKAASLEQHLRLHRGEARYLCVDCGRGFGTELTLVAHRRAHTANPLHRCR-CGKTFSNM
:... : ::::.: :: : : .::..:. .:. :.: ::.. ..:. :::.:...
NP_001 FRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQI
300 310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TKFLYHRRTHAGKSGAPPTGATAPPAPAEPTP-PPPPPAPPAQLP--CPQCSKSFASASR
: .. :.:::.:.. : . : .. : .. : : .:.:.:. .:
NP_001 TPLIQHQRTHTGEK--PYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSS
360 370 380 390 400 410
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKGFKKLIHVRNHLRTHTGERPFQCHSCGKTFASLANLS
::.:.:. : :. ..:. :::.:.. :. .: : ::::.:..:..:::.:. ..:.
NP_001 LSQHERTHTG--EKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLT
420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KSD RHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQSSNLQQHRRLHLRPVAFARAPRLPITGLYNKSPYYCG
.:: ::: .::.: .::. :.: . : ::.:.: :: ..:: :.
NP_001 KHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIH--------------TG---EKPYECN
470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KSD TCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQPPRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIE
::: : . : :::.:.. .
NP_001 QCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGK
520 530 540 550 560 570
>>XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (621 aa)
initn: 3524 init1: 441 opt: 715 Z-score: 364.2 bits: 77.6 E(85289): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 787; 32.4% identity (60.3% similar) in 413 aa overlap (192-599:172-539)
170 180 190 200 210 220
pF1KSD QHLSATVAEPPVPPPLPPPTPLPPPSPPSEVKMEPYECPECSTLCATPEEFLEHQGTHFD
:: .::.: ::. . ..::. ::
XP_016 PMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTH--
150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KSD SLEKEERNGLEEEEEDDEEDEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVGGDESTAGWAQGCGDCPQH
.: : : .: . ... :... . . :. : .: .
XP_016 -------TG-----ERPYECHECLKGFRNSSALTK--HQRIHTGEKP----YKCTQCGRT
200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KSD QPSAGARRQHRRTAHSPASATHPFHCSQCQRSFSSANRLQAHGRAHVG-GTHECTTCSKV
. . ::.:: : .. .:..::.: .::: . .. : :.:.: .::. :.:.
XP_016 FNQIAPLIQHQRT-H---TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKA
250 260 270 280 290
350 360 370 380 390
pF1KSD FKKAASLEQHLRLHRGEARYLCVDCGRGFGTELTLVAHRRAHTANPLHRCR-CGKTFSNM
:... : ::::.: :: : : .::..:. .:. :.: ::.. ..:. :::.:...
XP_016 FRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQI
300 310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TKFLYHRRTHAGKSGAPPTGATAPPAPAEPTP-PPPPPAPPAQLP--CPQCSKSFASASR
: .. :.:::.:.. : . : .. : .. : : .:.:.:. .:
XP_016 TPLIQHQRTHTGEK--PYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSS
360 370 380 390 400 410
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKGFKKLIHVRNHLRTHTGERPFQCHSCGKTFASLANLS
::.:.:. : :. ..:. :::.:.. :. .: : ::::.:..:..:::.:. ..:.
XP_016 LSQHERTHTG--EKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLT
420 430 440 450 460 470
520 530 540 550 560 570
pF1KSD RHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQSSNLQQHRRLHLRPVAFARAPRLPITGLYNKSPYYCG
.:: ::: .::.: .::. :.: . : ::.:.: :: ..:: :.
XP_016 KHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIH--------------TG---EKPYECN
480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KSD TCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQPPRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIE
::: : . : :::.:.. .
XP_016 QCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGK
520 530 540 550 560 570
>>NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 is (751 aa)
initn: 3037 init1: 381 opt: 717 Z-score: 364.2 bits: 77.9 E(85289): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 796; 28.0% identity (53.1% similar) in 561 aa overlap (59-596:224-721)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD EMMEMSTEVTEMTPGEALASSLFFQHHQFMCSECGSLYNTLEEVLSHQEQHM----LAVS
:.:::. .. .. ::. : .
NP_001 VTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRHQRTHTGEKPYKCN
200 210 220 230 240 250
90 100 110 120 130 140
pF1KSD E-EEALTTQNVGLEPELVPGAEGPFQCGECSQLILSPGELLAHQDAHLRESANQIQYQCW
: :.:.. .. .. . . .. :..: .:.. .. : :: : :. :.:
NP_001 ECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGEKP----YKCD
260 270 280 290 300
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DCQELFPSPELWVAHRKAQHLSATVAEPPVPPPLPPPTPLPPPSPPSEVKMEPYECPECS
.: . : . : :.. : . .:: : ::.
NP_001 ECGKAFSQRTHLVQHQRI-HTGE----------------------------KPYTCNECG
310 320 330 340
210 220 230 240 250 260
pF1KSD TLCATPEEFLEHQGTHFDSLEKEERNGLEEEEEDDEEDEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVG
. .:.::: : . :: . .: :. . ... . .
NP_001 KAFSQRGHFMEHQKIH--TGEKPFKC------------DECDKTFTRSTHLTQ--HQKIH
350 360 370 380
270 280 290 300 310 320
pF1KSD GDESTAGWAQGCGDCPQ--HQPSAGARRQHRRTAHSPASATHPFHCSQCQRSFSSANRLQ
:.: :..: . . ::. : : : .. .:..:..: ..::. . :
NP_001 TGEKT----YKCNECGKAFNGPSTFIR--H----HMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNLT
390 400 410 420 430
330 340 350 360 370 380
pF1KSD AHGRAHVG-GTHECTTCSKVFKKAASLEQHLRLHRGEARYLCVDCGRGFGTELTLVAHRR
: ..:.: ..:. :.: :. .:: :::..: :: : : .::..:. .:. :::
NP_001 QHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECGKAFSYCSSLTQHRR
440 450 460 470 480 490
390 400 410 420 430
pF1KSD AHTANPLHRC-RCGKTFSNMTKFLYHRRTHAGKSG--APPTG-ATAPPAPAEPTPPPPPP
:: . .: .:::.:: .... :..::. ... : : .
NP_001 IHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTG
500 510 520 530 540 550
440 450 460 470 480 490
pF1KSD APPAQLPCPQCSKSFASASRLSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKGFKKLIHVRNHLRTHTG
: : : .:.:.:. .: : .::. .: :: ..:. ::..:.. ::. .: : :::
NP_001 EKPYQ--CHECGKTFSYGSSLIQHRK-IH-TGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTG
560 570 580 590 600 610
500 510 520 530 540 550
pF1KSD ERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQSSNLQQHRRLHL--RPV
.:..: :::.: ..:..:: ::: .:::: : : :.:::.: ::.:.: .:
NP_001 AKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPY
620 630 640 650 660 670
560 570 580 590 600
pF1KSD -------AFARAPRLP--ITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQP
::.:. .: . ...:: :. : . : . : :::.:.
NP_001 KCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCND
680 690 700 710 720 730
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIETSQPLALEDTLQLCQAALGASEAGGLLQL
NP_001 CGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
740 750
>>NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 isofo (751 aa)
initn: 3037 init1: 381 opt: 717 Z-score: 364.2 bits: 77.9 E(85289): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 796; 28.0% identity (53.1% similar) in 561 aa overlap (59-596:224-721)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD EMMEMSTEVTEMTPGEALASSLFFQHHQFMCSECGSLYNTLEEVLSHQEQHM----LAVS
:.:::. .. .. ::. : .
NP_009 VTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRHQRTHTGEKPYKCN
200 210 220 230 240 250
90 100 110 120 130 140
pF1KSD E-EEALTTQNVGLEPELVPGAEGPFQCGECSQLILSPGELLAHQDAHLRESANQIQYQCW
: :.:.. .. .. . . .. :..: .:.. .. : :: : :. :.:
NP_009 ECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGEKP----YKCD
260 270 280 290 300
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DCQELFPSPELWVAHRKAQHLSATVAEPPVPPPLPPPTPLPPPSPPSEVKMEPYECPECS
.: . : . : :.. : . .:: : ::.
NP_009 ECGKAFSQRTHLVQHQRI-HTGE----------------------------KPYTCNECG
310 320 330 340
210 220 230 240 250 260
pF1KSD TLCATPEEFLEHQGTHFDSLEKEERNGLEEEEEDDEEDEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVG
. .:.::: : . :: . .: :. . ... . .
NP_009 KAFSQRGHFMEHQKIH--TGEKPFKC------------DECDKTFTRSTHLTQ--HQKIH
350 360 370 380
270 280 290 300 310 320
pF1KSD GDESTAGWAQGCGDCPQ--HQPSAGARRQHRRTAHSPASATHPFHCSQCQRSFSSANRLQ
:.: :..: . . ::. : : : .. .:..:..: ..::. . :
NP_009 TGEKT----YKCNECGKAFNGPSTFIR--H----HMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNLT
390 400 410 420 430
330 340 350 360 370 380
pF1KSD AHGRAHVG-GTHECTTCSKVFKKAASLEQHLRLHRGEARYLCVDCGRGFGTELTLVAHRR
: ..:.: ..:. :.: :. .:: :::..: :: : : .::..:. .:. :::
NP_009 QHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECGKAFSYCSSLTQHRR
440 450 460 470 480 490
390 400 410 420 430
pF1KSD AHTANPLHRC-RCGKTFSNMTKFLYHRRTHAGKSG--APPTG-ATAPPAPAEPTPPPPPP
:: . .: .:::.:: .... :..::. ... : : .
NP_009 IHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTG
500 510 520 530 540 550
440 450 460 470 480 490
pF1KSD APPAQLPCPQCSKSFASASRLSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKGFKKLIHVRNHLRTHTG
: : : .:.:.:. .: : .::. .: :: ..:. ::..:.. ::. .: : :::
NP_009 EKPYQ--CHECGKTFSYGSSLIQHRK-IH-TGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTG
560 570 580 590 600 610
500 510 520 530 540 550
pF1KSD ERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQSSNLQQHRRLHL--RPV
.:..: :::.: ..:..:: ::: .:::: : : :.:::.: ::.:.: .:
NP_009 AKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPY
620 630 640 650 660 670
560 570 580 590 600
pF1KSD -------AFARAPRLP--ITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQP
::.:. .: . ...:: :. : . : . : :::.:.
NP_009 KCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCND
680 690 700 710 720 730
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIETSQPLALEDTLQLCQAALGASEAGGLLQL
NP_009 CGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
740 750
>>NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 is (751 aa)
initn: 3037 init1: 381 opt: 717 Z-score: 364.2 bits: 77.9 E(85289): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 796; 28.0% identity (53.1% similar) in 561 aa overlap (59-596:224-721)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD EMMEMSTEVTEMTPGEALASSLFFQHHQFMCSECGSLYNTLEEVLSHQEQHM----LAVS
:.:::. .. .. ::. : .
NP_001 VTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIRHQRTHTGEKPYKCN
200 210 220 230 240 250
90 100 110 120 130 140
pF1KSD E-EEALTTQNVGLEPELVPGAEGPFQCGECSQLILSPGELLAHQDAHLRESANQIQYQCW
: :.:.. .. .. . . .. :..: .:.. .. : :: : :. :.:
NP_001 ECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGEKP----YKCD
260 270 280 290 300
150 160 170 180 190 200
pF1KSD DCQELFPSPELWVAHRKAQHLSATVAEPPVPPPLPPPTPLPPPSPPSEVKMEPYECPECS
.: . : . : :.. : . .:: : ::.
NP_001 ECGKAFSQRTHLVQHQRI-HTGE----------------------------KPYTCNECG
310 320 330 340
210 220 230 240 250 260
pF1KSD TLCATPEEFLEHQGTHFDSLEKEERNGLEEEEEDDEEDEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVG
. .:.::: : . :: . .: :. . ... . .
NP_001 KAFSQRGHFMEHQKIH--TGEKPFKC------------DECDKTFTRSTHLTQ--HQKIH
350 360 370 380
270 280 290 300 310 320
pF1KSD GDESTAGWAQGCGDCPQ--HQPSAGARRQHRRTAHSPASATHPFHCSQCQRSFSSANRLQ
:.: :..: . . ::. : : : .. .:..:..: ..::. . :
NP_001 TGEKT----YKCNECGKAFNGPSTFIR--H----HMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNLT
390 400 410 420 430
330 340 350 360 370 380
pF1KSD AHGRAHVG-GTHECTTCSKVFKKAASLEQHLRLHRGEARYLCVDCGRGFGTELTLVAHRR
: ..:.: ..:. :.: :. .:: :::..: :: : : .::..:. .:. :::
NP_001 QHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECGKAFSYCSSLTQHRR
440 450 460 470 480 490
390 400 410 420 430
pF1KSD AHTANPLHRC-RCGKTFSNMTKFLYHRRTHAGKSG--APPTG-ATAPPAPAEPTPPPPPP
:: . .: .:::.:: .... :..::. ... : : .
NP_001 IHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTG
500 510 520 530 540 550
440 450 460 470 480 490
pF1KSD APPAQLPCPQCSKSFASASRLSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKGFKKLIHVRNHLRTHTG
: : : .:.:.:. .: : .::. .: :: ..:. ::..:.. ::. .: : :::
NP_001 EKPYQ--CHECGKTFSYGSSLIQHRK-IH-TGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTG
560 570 580 590 600 610
500 510 520 530 540 550
pF1KSD ERPFQCHSCGKTFASLANLSRHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQSSNLQQHRRLHL--RPV
.:..: :::.: ..:..:: ::: .:::: : : :.:::.: ::.:.: .:
NP_001 AKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPY
620 630 640 650 660 670
560 570 580 590 600
pF1KSD -------AFARAPRLP--ITGLYNKSPYYCGTCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQP
::.:. .: . ...:: :. : . : . : :::.:.
NP_001 KCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCND
680 690 700 710 720 730
610 620 630 640 650 660
pF1KSD PRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIETSQPLALEDTLQLCQAALGASEAGGLLQL
NP_001 CGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
740 750
>>XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger pro (628 aa)
initn: 3524 init1: 441 opt: 715 Z-score: 364.1 bits: 77.6 E(85289): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 787; 32.4% identity (60.3% similar) in 413 aa overlap (192-599:179-546)
170 180 190 200 210 220
pF1KSD QHLSATVAEPPVPPPLPPPTPLPPPSPPSEVKMEPYECPECSTLCATPEEFLEHQGTHFD
:: .::.: ::. . ..::. ::
XP_016 PMTPERQSPHTWGTRGKREKPDLNVLQKTCVKEKPYKCQECGKAFSHSSALIEHHRTH--
150 160 170 180 190 200
230 240 250 260 270 280
pF1KSD SLEKEERNGLEEEEEDDEEDEEDDEEMEDEEAMAEVGDDAVGGDESTAGWAQGCGDCPQH
.: : : .: . ... :... . . :. : .: .
XP_016 -------TG-----ERPYECHECLKGFRNSSALTK--HQRIHTGEKP----YKCTQCGRT
210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KSD QPSAGARRQHRRTAHSPASATHPFHCSQCQRSFSSANRLQAHGRAHVG-GTHECTTCSKV
. . ::.:: : .. .:..::.: .::: . .. : :.:.: .::. :.:.
XP_016 FNQIAPLIQHQRT-H---TGEKPYECSECGKSFSFRSSFSQHERTHTGEKPYECSECGKA
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390
pF1KSD FKKAASLEQHLRLHRGEARYLCVDCGRGFGTELTLVAHRRAHTANPLHRCR-CGKTFSNM
:... : ::::.: :: : : .::..:. .:. :.: ::.. ..:. :::.:...
XP_016 FRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYECHECGKAFTQI
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KSD TKFLYHRRTHAGKSGAPPTGATAPPAPAEPTP-PPPPPAPPAQLP--CPQCSKSFASASR
: .. :.:::.:.. : . : .. : .. : : .:.:.:. .:
XP_016 TPLIQHQRTHTGEK--PYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECGKTFSHSSS
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LSRHRRAVHGPPERRHRCGVCGKGFKKLIHVRNHLRTHTGERPFQCHSCGKTFASLANLS
::.:.:. : :. ..:. :::.:.. :. .: : ::::.:..:..:::.:. ..:.
XP_016 LSQHERTHTG--EKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSLT
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KSD RHQLTHTGARPYQCLDCGKRFTQSSNLQQHRRLHLRPVAFARAPRLPITGLYNKSPYYCG
.:: ::: .::.: .::. :.: . : ::.:.: :: ..:: :.
XP_016 KHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIH--------------TG---EKPYECN
490 500 510 520
580 590 600 610 620 630
pF1KSD TCGRWFRAMAGLRLHQRVHARARTLTLQPPRSPSPAPPPPPEPQQTIMCTELGETIAIIE
::: : . : :::.:.. .
XP_016 QCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGK
530 540 550 560 570 580
670 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 07:46:56 2016 done: Thu Nov 3 07:46:58 2016
Total Scan time: 14.430 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]