FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1066, 1336 aa
1>>>pF1KSDA1066 1336 - 1336 aa - 1336 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0164+/-0.00112; mu= 2.6118+/- 0.068
mean_var=251.2884+/-49.522, 0's: 0 Z-trim(111.9): 21 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.080907
statistics sampled from 12744 (12761) to 12744 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.71), E-opt: 0.2 (0.392), width: 16
Scan time: 6.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10442.2 MAPK8IP3 gene_id:23162|Hs108|chr16 (1336) 8938 1057.5 0
CCDS81929.1 MAPK8IP3 gene_id:23162|Hs108|chr16 (1337) 8926 1056.1 0
CCDS45379.1 MAPK8IP3 gene_id:23162|Hs108|chr16 (1330) 8872 1049.8 0
CCDS45740.1 SPAG9 gene_id:9043|Hs108|chr17 (1321) 2772 337.8 1.2e-91
CCDS58578.1 SPAG9 gene_id:9043|Hs108|chr17 (1311) 2768 337.3 1.6e-91
CCDS11577.1 SPAG9 gene_id:9043|Hs108|chr17 (1307) 2650 323.5 2.3e-87
CCDS58577.1 SPAG9 gene_id:9043|Hs108|chr17 (1177) 2345 287.9 1.1e-76
>>CCDS10442.2 MAPK8IP3 gene_id:23162|Hs108|chr16 (1336 aa)
initn: 8938 init1: 8938 opt: 8938 Z-score: 5648.6 bits: 1057.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8938; 100.0% identity (100.0% similar) in 1336 aa overlap (1-1336:1-1336)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NVLENLDSVLSENQEHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRRQAEEKFIEFEDALEQEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NVLENLDSVLSENQEHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRRQAEEKFIEFEDALEQEKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQISRLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQISRLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RSKMQQVGGNSQTESSLPGRRKERPTSLNVFPLADGTVRAQIGGKLVPAGDHWHLSDLGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RSKMQQVGGNSQTESSLPGRRKERPTSLNVFPLADGTVRAQIGGKLVPAGDHWHLSDLGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LQSSSSYQCPQDEMSESGQSSAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQPLGDYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LQSSSSYQCPQDEMSESGQSSAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQPLGDYGV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GSKNSKRAREKRDSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDMCPETRLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GSKNSKRAREKRDSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDMCPETRLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RTGSSPTQGIVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFSVRDDFFGMGKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RTGSSPTQGIVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFSVRDDFFGMGKEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GNLLLENSQLLETKNALNVVKNDLIAKVDQLSGEQEVLRGELEAAKQAKVKLENRIKELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GNLLLENSQLLETKNALNVVKNDLIAKVDQLSGEQEVLRGELEAAKQAKVKLENRIKELE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EELKRVKSEAIIARREPKEEAEDVSSYLCTESDKIPMAQRRRFTRVEMARVLMERNQYKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 EELKRVKSEAIIARREPKEEAEDVSSYLCTESDKIPMAQRRRFTRVEMARVLMERNQYKE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD RLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKRPYPSVNIHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKRPYPSVNIHY
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD KSPTTAGFSQRRNHAMCPISAGSRPLEFFPDDDCTSSARREQKREQYRQVREHVRNDDGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KSPTTAGFSQRRNHAMCPISAGSRPLEFFPDDDCTSSARREQKREQYRQVREHVRNDDGR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LQACGWSLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMKLWCAAGVNLSGWRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LQACGWSLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMKLWCAAGVNLSGWRP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD NEDDAGNGVKPAPGRDPLTCDREGDGEPKSAHTSPEKKKAKELPEMDATSSRVWILTSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NEDDAGNGVKPAPGRDPLTCDREGDGEPKSAHTSPEKKKAKELPEMDATSSRVWILTSTL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD TTSKVVIIDANQPGTVVDQFTVCNAHVLCISSIPAASDSDYPPGEMFLDSDVNPEDPGAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TTSKVVIIDANQPGTVVDQFTVCNAHVLCISSIPAASDSDYPPGEMFLDSDVNPEDPGAD
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD GVLAGITLVGCATRCNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGEVATIANGKVNPSQSTEEATEATE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GVLAGITLVGCATRCNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGEVATIANGKVNPSQSTEEATEATE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD VPDPGPSEPETATLRPGPLTEHVFTDPAPTPSSGPQPGSENGPEPDSSSTRPEPEPSGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VPDPGPSEPETATLRPGPLTEHVFTDPAPTPSSGPQPGSENGPEPDSSSTRPEPEPSGDP
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD TGAGSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TGAGSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LAIFHRGEDGQWDLSNYHLMDLGHPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LAIFHRGEDGQWDLSNYHLMDLGHPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD FDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD GFSFVRITALLVAGSRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLLGLRANKTSPTSGEGARP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GFSFVRITALLVAGSRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLLGLRANKTSPTSGEGARP
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD GGIIHVYGDDSSDRAASSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLATLNGSVLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GGIIHVYGDDSSDRAASSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLATLNGSVLDS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KSD PAEGPGPAAPASEVEGQKLRNVLVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEEGAGDMSQVKPVLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PAEGPGPAAPASEVEGQKLRNVLVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEEGAGDMSQVKPVLSK
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330
pF1KSD AERSHIIVWQVSYTPE
::::::::::::::::
CCDS10 AERSHIIVWQVSYTPE
1330
>>CCDS81929.1 MAPK8IP3 gene_id:23162|Hs108|chr16 (1337 aa)
initn: 7655 init1: 7655 opt: 8926 Z-score: 5641.0 bits: 1056.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8926; 99.9% identity (99.9% similar) in 1337 aa overlap (1-1336:1-1337)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NVLENLDSVLSENQEHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRRQAEEKFIEFEDALEQEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 NVLENLDSVLSENQEHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRRQAEEKFIEFEDALEQEKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQISRLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQISRLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KSD RSKMQQVGGNSQTESSLPGR-RKERPTSLNVFPLADGTVRAQIGGKLVPAGDHWHLSDLG
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RSKMQQVGGNSQTESSLPGRSRKERPTSLNVFPLADGTVRAQIGGKLVPAGDHWHLSDLG
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KSD QLQSSSSYQCPQDEMSESGQSSAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQPLGDYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QLQSSSSYQCPQDEMSESGQSSAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQPLGDYG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KSD VGSKNSKRAREKRDSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDMCPETRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VGSKNSKRAREKRDSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDMCPETRL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KSD DRTGSSPTQGIVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFSVRDDFFGMGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DRTGSSPTQGIVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFSVRDDFFGMGKE
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KSD VGNLLLENSQLLETKNALNVVKNDLIAKVDQLSGEQEVLRGELEAAKQAKVKLENRIKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VGNLLLENSQLLETKNALNVVKNDLIAKVDQLSGEQEVLRGELEAAKQAKVKLENRIKEL
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KSD EEELKRVKSEAIIARREPKEEAEDVSSYLCTESDKIPMAQRRRFTRVEMARVLMERNQYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EEELKRVKSEAIIARREPKEEAEDVSSYLCTESDKIPMAQRRRFTRVEMARVLMERNQYK
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKRPYPSVNIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKRPYPSVNIH
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KSD YKSPTTAGFSQRRNHAMCPISAGSRPLEFFPDDDCTSSARREQKREQYRQVREHVRNDDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 YKSPTTAGFSQRRNHAMCPISAGSRPLEFFPDDDCTSSARREQKREQYRQVREHVRNDDG
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KSD RLQACGWSLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMKLWCAAGVNLSGWR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RLQACGWSLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMKLWCAAGVNLSGWR
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KSD PNEDDAGNGVKPAPGRDPLTCDREGDGEPKSAHTSPEKKKAKELPEMDATSSRVWILTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PNEDDAGNGVKPAPGRDPLTCDREGDGEPKSAHTSPEKKKAKELPEMDATSSRVWILTST
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KSD LTTSKVVIIDANQPGTVVDQFTVCNAHVLCISSIPAASDSDYPPGEMFLDSDVNPEDPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LTTSKVVIIDANQPGTVVDQFTVCNAHVLCISSIPAASDSDYPPGEMFLDSDVNPEDPGA
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KSD DGVLAGITLVGCATRCNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGEVATIANGKVNPSQSTEEATEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DGVLAGITLVGCATRCNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGEVATIANGKVNPSQSTEEATEAT
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930 940 950
pF1KSD EVPDPGPSEPETATLRPGPLTEHVFTDPAPTPSSGPQPGSENGPEPDSSSTRPEPEPSGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EVPDPGPSEPETATLRPGPLTEHVFTDPAPTPSSGPQPGSENGPEPDSSSTRPEPEPSGD
910 920 930 940 950 960
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD PTGAGSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PTGAGSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADG
970 980 990 1000 1010 1020
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD TLAIFHRGEDGQWDLSNYHLMDLGHPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TLAIFHRGEDGQWDLSNYHLMDLGHPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD SFDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SFDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD LGFSFVRITALLVAGSRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLLGLRANKTSPTSGEGAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LGFSFVRITALLVAGSRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLLGLRANKTSPTSGEGAR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD PGGIIHVYGDDSSDRAASSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLATLNGSVLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PGGIIHVYGDDSSDRAASSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLATLNGSVLD
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KSD SPAEGPGPAAPASEVEGQKLRNVLVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEEGAGDMSQVKPVLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SPAEGPGPAAPASEVEGQKLRNVLVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEEGAGDMSQVKPVLS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1320 1330
pF1KSD KAERSHIIVWQVSYTPE
:::::::::::::::::
CCDS81 KAERSHIIVWQVSYTPE
1330
>>CCDS45379.1 MAPK8IP3 gene_id:23162|Hs108|chr16 (1330 aa)
initn: 6255 init1: 6255 opt: 8872 Z-score: 5606.9 bits: 1049.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8872; 99.6% identity (99.6% similar) in 1336 aa overlap (1-1336:1-1330)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD NVLENLDSVLSENQEHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRRQAEEKFIEFEDALEQEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NVLENLDSVLSENQEHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRRQAEEKFIEFEDALEQEKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQISRLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQISRLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RSKMQQVGGNSQTESSLPGRRKERPTSLNVFPLADGTVRAQIGGKLVPAGDHWHLSDLGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RSKMQQVGGNSQTESSLPGRRKERPTSLNVFPLADGTVRAQIGGKLVPAGDHWHLSDLGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD LQSSSSYQCPQDEMSESGQSSAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQPLGDYGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LQSSSSYQCPQDEMSESGQSSAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQPLGDYGV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GSKNSKRAREKRDSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDMCPETRLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GSKNSKRAREKRDSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDMCPETRLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD RTGSSPTQGIVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFSVRDDFFGMGKEV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS45 RTGSSPTQGIVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFS------GMGKEV
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD GNLLLENSQLLETKNALNVVKNDLIAKVDQLSGEQEVLRGELEAAKQAKVKLENRIKELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GNLLLENSQLLETKNALNVVKNDLIAKVDQLSGEQEVLRGELEAAKQAKVKLENRIKELE
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EELKRVKSEAIIARREPKEEAEDVSSYLCTESDKIPMAQRRRFTRVEMARVLMERNQYKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 EELKRVKSEAIIARREPKEEAEDVSSYLCTESDKIPMAQRRRFTRVEMARVLMERNQYKE
480 490 500 510 520 530
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pF1KSD RLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKRPYPSVNIHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKRPYPSVNIHY
540 550 560 570 580 590
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pF1KSD KSPTTAGFSQRRNHAMCPISAGSRPLEFFPDDDCTSSARREQKREQYRQVREHVRNDDGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KSPTTAGFSQRRNHAMCPISAGSRPLEFFPDDDCTSSARREQKREQYRQVREHVRNDDGR
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pF1KSD LQACGWSLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMKLWCAAGVNLSGWRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LQACGWSLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMKLWCAAGVNLSGWRP
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pF1KSD NEDDAGNGVKPAPGRDPLTCDREGDGEPKSAHTSPEKKKAKELPEMDATSSRVWILTSTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 NEDDAGNGVKPAPGRDPLTCDREGDGEPKSAHTSPEKKKAKELPEMDATSSRVWILTSTL
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pF1KSD TTSKVVIIDANQPGTVVDQFTVCNAHVLCISSIPAASDSDYPPGEMFLDSDVNPEDPGAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TTSKVVIIDANQPGTVVDQFTVCNAHVLCISSIPAASDSDYPPGEMFLDSDVNPEDPGAD
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pF1KSD GVLAGITLVGCATRCNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGEVATIANGKVNPSQSTEEATEATE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GVLAGITLVGCATRCNVPRSNCSSRGDTPVLDKGQGEVATIANGKVNPSQSTEEATEATE
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pF1KSD VPDPGPSEPETATLRPGPLTEHVFTDPAPTPSSGPQPGSENGPEPDSSSTRPEPEPSGDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VPDPGPSEPETATLRPGPLTEHVFTDPAPTPSSGPQPGSENGPEPDSSSTRPEPEPSGDP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 TGAGSSAAPTMWLGAQNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGT
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pF1KSD LAIFHRGEDGQWDLSNYHLMDLGHPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LAIFHRGEDGQWDLSNYHLMDLGHPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKS
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pF1KSD FDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FDAHPRRESQVRQLAWIGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKL
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pF1KSD GFSFVRITALLVAGSRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLLGLRANKTSPTSGEGARP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GFSFVRITALLVAGSRLWVGTGNGVVISIPLTETVVLHRGQLLGLRANKTSPTSGEGARP
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pF1KSD GGIIHVYGDDSSDRAASSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLATLNGSVLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GGIIHVYGDDSSDRAASSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLATLNGSVLDS
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pF1KSD PAEGPGPAAPASEVEGQKLRNVLVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEEGAGDMSQVKPVLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PAEGPGPAAPASEVEGQKLRNVLVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEEGAGDMSQVKPVLSK
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1330
pF1KSD AERSHIIVWQVSYTPE
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CCDS45 AERSHIIVWQVSYTPE
1320 1330
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pF1KSD MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVV
:. ::: .. ::.::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS45 MELEDGVVYQEEPGGSGAVMSERVSGLAGSIYREFERLIGRYDEEVVKELMPLVV
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pF1KSD NVLENLDSVLSENQEHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRRQAEEKFIEFEDALEQEKK
::::::::....:::.:::::::.:::::.::::::::::..::::::::::. :::::
CCDS45 AVLENLDSVFAQDQEHQVELELLRDDNEQLITQYEREKALRKHAEEKFIEFEDSQEQEKK
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pF1KSD ELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQISRLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIE
.:: .:: : :::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::..:.::.:
CCDS45 DLQTRVESLESQTRQLELKAKNYADQISRLEEREAELKKEYNALHQRHTEMIHNYMEHLE
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pF1KSD RSKMQQVGGNSQTESSLPGR-RKERPTSLNVFPL--ADG--TVRAQIGGKLVPAGDHWHL
:.:..:..:..: ::. .: ::::: ::..::: .:: : :: ::. .:....:..
CCDS45 RTKLHQLSGSDQLESTAHSRIRKERPISLGIFPLPAGDGLLTPDAQKGGE-TPGSEQWKF
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pF1KSD SDLGQLQSSSSYQCPQDEMSESG--QSSAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQ
..:.: .: .: . .. ... : . . : :.:..::.:.. : ..: ...
CCDS45 QELSQPRSHTSLKVSNSPEPQKAVEQEDELSDVSQGGSKATTPASTANSDVATIPTDT--
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pF1KSD PLGDYGVGSKNSKRAREKRD-SRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELD
:: . . : . : .: . :...::::.:: :::: : . ..: :.:: ::.::::::
CCDS45 PLKEENEGFVKVTDAPNKSEISKHIEVQVAQETRNVSTGSAENEEKSEVQAIIESTPELD
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pF1KSD MCPETRLDRTGSSPTQGIVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFSVRDD
: . . .:.::.:: :::: ::.::..:::.::: .::::::::::::
CCDS45 MDKDLSGYKGSSTPTKGIENKAFDRNTESLFEELSSAGSGLIGDVDEGADLLG-------
360 370 380 390 400
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pF1KSD FFGMGKEVGNLLLENSQLLETKNALNVVKNDLIAKVDQLSGEQEVLRGELEAAKQAKVKL
::.:: ::.:::.::::::::::.::::::::::.:. :..::.:::::.::::.::
CCDS45 ---MGREVENLILENTQLLETKNALNIVKNDLIAKVDELTCEKDVLQGELEAVKQAKLKL
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pF1KSD ENRIKELEEELKRVKSEAIIARREPKEEAEDVSSYLCTESDKIPMAQRRRFTRVEMARVL
:.. .::::::.....:: ::.. :.. .:: :: :::.:::::::::::
CCDS45 EEKNRELEEELRKARAEAEDARQKAKDD---------DDSD-IPTAQRKRFTRVEMARVL
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pF1KSD MERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKRP
::::::::::::::::::::::::::::.:..::::.:.:::::::::::::. .:.:
CCDS45 MERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASRENPAMQEKKRSSIWQFFSRLFSSSSN--TTKKP
520 530 540 550 560 570
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pF1KSD YPSVNIHYKSPTT--AGFSQRRNHAMCPISAG-SRPLEFFPDDDCTSSA-RREQKREQYR
: ::..:..::. . ..:. .. . . :. ..:. .. .: : ::::::::::
CCDS45 EPPVNLKYNAPTSHVTPSVKKRSSTLSQLPGDKSKAFDFLSEETEASLASRREQKREQYR
580 590 600 610 620 630
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pF1KSD QVREHVRNDDGRLQACGWSLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMKLW
::. ::...:::.:: ::::: ::::.. .:: ...:::.::::: ::: ::: .::::
CCDS45 QVKAHVQKEDGRVQAFGWSLPQKYKQVT--NGQGENKMKNLPVPVYLRPLDEKDTSMKLW
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pF1KSD CAAGVNLSGWRPNEDDAGNGVKPAP-GRDPLTCDREGDGEPKSAHTSPEK------KKAK
::.:::::: . :.:. : . .: : ::. . .....: .: .. :
CCDS45 CAVGVNLSGGKTR--DGGSVVGASVFYKDVAGLDTEGSKQRSASQSSLDKLDQELKEQQK
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pF1KSD ELPEMDATSSRVWILTSTLTTSKVVIIDANQPGTVVDQFTVCNAHVLCISSIPAASDSDY
:: ... :: ::: ::: ...::.:::: :::...:.:::::.:::::.:.:.: ..::
CCDS45 ELKNQEELSSLVWICTSTHSATKVLIIDAVQPGNILDSFTVCNSHVLCIASVPGARETDY
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pF1KSD PPGEMFLDSD-----------VNPEDPGADGVLAGITLVGCATR-CNVPRSNCSSRGDTP
: :: . .: .. . .:..:.:::.:::... . .. :. : .:
CCDS45 PAGEDLSESGQVDKASLCGSMTSNSSAETDSLLGGITVVGCSAEGVTGAATSPSTNGASP
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pF1KSD VLDKGQGEVATIANGKVNPSQST-EEATEATEVPDPGPSEPETATLRPGPLTEHVFTDP-
:.:: : :..:. . : :::::::: . : .: . . : ::::::::
CCDS45 VMDKPPEMEAE--NSEVDENVPTAEEATEATE-GNAGSAEDTVDISQTGVYTEHVFTDPL
870 880 890 900 910 920
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pF1KSD -APTPSS-GP--QPGSENGPEPDSSSTRP-EPEPSGDPTGAGSSAAPTMWLGAQNGWLYV
. : . .: : .... :. :. : : . . . :: :::::::::: :::
CCDS45 GVQIPEDLSPVYQSSNDSDAYKDQISVLPNEQDLVREEAQKMSSLLPTMWLGAQNGCLYV
930 940 950 960 970 980
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pF1KSD HSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDGQWDLSNYHLMDL
::.::.:.:::::::::::.::.::::: :::::::::::::::: :::::::::::.::
CCDS45 HSSVAQWRKCLHSIKLKDSILSIVHVKGIVLVALADGTLAIFHRGVDGQWDLSNYHLLDL
990 1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KSD GHPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKSFDAHPRRESQVRQLAWIGDGVW
:.::::::::.::.:.:::::.::..:.:::.:.::::::::::.:::::::::.:::::
CCDS45 GRPHHSIRCMTVVHDKVWCGYRNKIYVVQPKAMKIEKSFDAHPRKESQVRQLAWVGDGVW
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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pF1KSD VSIRLDSTLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALLVAGSRLWVGTG
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:. .:::::::
CCDS45 VSIRLDSTLRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALMVSCNRLWVGTG
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pF1KSD NGVVISIPLTETVVLHRGQLLGLRANKTSPTSGEGARPGGIIHVYGDDSSDRAA-SSFIP
:::.:::::::: :::: . :. :::..:.::::..::... ..:::
CCDS45 NGVIISIPLTET-------------NKTSGVPGN--RPGSVIRVYGDENSDKVTPGTFIP
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pF1KSD YCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLA---TLNGSVLDSPAEGPGPAAPASEVEGQK
:::::.::::::::::::::::.:::.:.. . .:. : . ::. :.:..
CCDS45 YCSMAHAQLCFHGHRDAVKFFVAVPGQVISPQSSSSGTDLTGDKAGPSAQEPGSQTP---
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pF1KSD LRNVLVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEEGAGDMSQVKPVLSKAERSHIIVWQVSYTPE
:...::.::::::::::.:: : :.: . :. ..: ..::::::.::::: : :
CCDS45 LKSMLVISGGEGYIDFRMGD-EGGESELLGEDLP-LEPSVTKAERSHLIVWQVMYGNE
1270 1280 1290 1300 1310 1320
>>CCDS58578.1 SPAG9 gene_id:9043|Hs108|chr17 (1311 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMEIQMDEGGGVVVYQDDYCSGSVMSERVSGLAGSIYREFERLIHCYDEEVVKELMPLVV
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CCDS58 MELEDGVVYQEEPGGSGAVMSERVSGLAGSIYREFERLIGRYDEEVVKELMPLVV
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pF1KSD NVLENLDSVLSENQEHEVELELLREDNEQLLTQYEREKALRRQAEEKFIEFEDALEQEKK
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CCDS58 AVLENLDSVFAQDQEHQVELELLRDDNEQLITQYEREKALRKHAEEKFIEFEDSQEQEKK
60 70 80 90 100 110
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pF1KSD ELQIQVEHYEFQTRQLELKAKNYADQISRLEERESEMKKEYNALHQRHTEMIQTYVEHIE
.:: .:: : :::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::..:.::.:
CCDS58 DLQTRVESLESQTRQLELKAKNYADQISRLEEREAELKKEYNALHQRHTEMIHNYMEHLE
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD RSKMQQVGGNSQTESSLPGR-RKERPTSLNVFPL--ADG--TVRAQIGGKLVPAGDHWHL
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CCDS58 RTKLHQLSGSDQLESTAHSRIRKERPISLGIFPLPAGDGLLTPDAQKGGE-TPGSEQWKF
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD SDLGQLQSSSSYQCPQDEMSESGQS-SAAATPSTTGTKSNTPTSSVPSAAVTPLNESLQP
..:.: .: .: . ::.:. .:. : :.::..: .:. ....:. :::.: .
CCDS58 QELSQPRSHTSLK---DELSDVSQGGSKATTPAST---ANSDVATIPTD--TPLKEENEG
240 250 260 270 280
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pF1KSD LGDYGVGSKNSKRAREKRDSRNMEVQVTQEMRNVSIGMGSSDEWSDVQDIIDSTPELDMC
. : . ... :...::::.:: :::: : . ..: :.:: ::.:::::::
CCDS58 F------VKVTDAPNKSEISKHIEVQVAQETRNVSTGSAENEEKSEVQAIIESTPELDMD
290 300 310 320 330 340
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pF1KSD PETRLDRTGSSPTQGIVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFSVRDDFF
. . .:.::.:: :::: ::.::..:::.::: .::::::::::::
CCDS58 KDLSGYKGSSTPTKGIENKAFDRNTESLFEELSSAGSGLIGDVDEGADLLG---------
350 360 370 380 390
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pF1KSD GMGKEVGNLLLENSQLLETKNALNVVKNDLIAKVDQLSGEQEVLRGELEAAKQAKVKLEN
::.:: ::.:::.::::::::::.::::::::::.:. :..::.:::::.::::.:::.
CCDS58 -MGREVENLILENTQLLETKNALNIVKNDLIAKVDELTCEKDVLQGELEAVKQAKLKLEE
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD RIKELEEELKRVKSEAIIARREPKEEAEDVSSYLCTESDKIPMAQRRRFTRVEMARVLME
. .::::::.....:: ::.. :.. .:: :: :::.:::::::::::::
CCDS58 KNRELEEELRKARAEAEDARQKAKDD---------DDSD-IPTAQRKRFTRVEMARVLME
460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KSD RNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQF----FSRLFSSSSSPPPAK
::::::::::::::::::::::::::.:..::::.:.:::: :::::::::. .:
CCDS58 RNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASRENPAMQEKKRSSIWQFVPTRFSRLFSSSSN--TTK
510 520 530 540 550
600 610 620 630 640
pF1KSD RPYPSVNIHYKSPTT--AGFSQRRNHAMCPISAG-SRPLEFFPDDDCTSSA-RREQKREQ
.: : ::..:..::. . ..:. .. . . :. ..:. .. .: : ::::::::
CCDS58 KPEPPVNLKYNAPTSHVTPSVKKRSSTLSQLPGDKSKAFDFLSEETEASLASRREQKREQ
560 570 580 590 600 610
650 660 670 680 690 700
pF1KSD YRQVREHVRNDDGRLQACGWSLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMK
::::. ::...:::.:: ::::: ::::.. .:: ...:::.::::: ::: ::: .::
CCDS58 YRQVKAHVQKEDGRVQAFGWSLPQKYKQVT--NGQGENKMKNLPVPVYLRPLDEKDTSMK
620 630 640 650 660 670
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pF1KSD LWCAAGVNLSGWRPNEDDAGNGVKPAP-GRDPLTCDREGDGEPKSAHTSPEK------KK
::::.:::::: . :.:. : . .: : ::. . .....: .: ..
CCDS58 LWCAVGVNLSGGKTR--DGGSVVGASVFYKDVAGLDTEGSKQRSASQSSLDKLDQELKEQ
680 690 700 710 720 730
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pF1KSD AKELPEMDATSSRVWILTSTLTTSKVVIIDANQPGTVVDQFTVCNAHVLCISSIPAASDS
::: ... :: ::: ::: ...::.:::: :::...:.:::::.:::::.:.:.: ..
CCDS58 QKELKNQEELSSLVWICTSTHSATKVLIIDAVQPGNILDSFTVCNSHVLCIASVPGARET
740 750 760 770 780 790
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pF1KSD DYPPGEMFLDSD-----------VNPEDPGADGVLAGITLVGCATR-CNVPRSNCSSRGD
::: :: . .: .. . .:..:.:::.:::... . .. :. :
CCDS58 DYPAGEDLSESGQVDKASLCGSMTSNSSAETDSLLGGITVVGCSAEGVTGAATSPSTNGA
800 810 820 830 840 850
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pF1KSD TPVLDKGQGEVATIANGKVNPSQST-EEATEATEVPDPGPSEPETATLRPGPLTEHVFTD
.::.:: : :..:. . : :::::::: . : .: . . : :::::::
CCDS58 SPVMDKPPEMEAE--NSEVDENVPTAEEATEATE-GNAGSAEDTVDISQTGVYTEHVFTD
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pF1KSD P--APTPSS-GP--QPGSENGPEPDSSSTRP-EPEPSGDPTGAGSSAAPTMWLGAQNGWL
: . : . .: : .... :. :. : : . . . :: :::::::::: :
CCDS58 PLGVQIPEDLSPVYQSSNDSDAYKDQISVLPNEQDLVREEAQKMSSLLPTMWLGAQNGCL
920 930 940 950 960 970
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pF1KSD YVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDGQWDLSNYHLM
::::.::.:.:::::::::::.::.::::: :::::::::::::::: :::::::::::.
CCDS58 YVHSSVAQWRKCLHSIKLKDSILSIVHVKGIVLVALADGTLAIFHRGVDGQWDLSNYHLL
980 990 1000 1010 1020 1030
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pF1KSD DLGHPHHSIRCMAVVYDRVWCGYKNKVHVIQPKTMQIEKSFDAHPRRESQVRQLAWIGDG
:::.::::::::.::.:.:::::.::..:.:::.:.::::::::::.:::::::::.:::
CCDS58 DLGRPHHSIRCMTVVHDKVWCGYRNKIYVVQPKAMKIEKSFDAHPRKESQVRQLAWVGDG
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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pF1KSD VWVSIRLDSTLRLYHAHTHQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALLVAGSRLWVG
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:. .:::::
CCDS58 VWVSIRLDSTLRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALMVSCNRLWVG
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pF1KSD TGNGVVISIPLTETVVLHRGQLLGLRANKTSPTSGEGARPGGIIHVYGDDSSDRAA-SSF
:::::.:::::::: :::: . :. :::..:.::::..::... ..:
CCDS58 TGNGVIISIPLTET-------------NKTSGVPGN--RPGSVIRVYGDENSDKVTPGTF
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pF1KSD IPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLA---TLNGSVLDSPAEGPGPAAPASEVEG
:::::::.::::::::::::::::.:::.:.. . .:. : . ::. :.:..
CCDS58 IPYCSMAHAQLCFHGHRDAVKFFVAVPGQVISPQSSSSGTDLTGDKAGPSAQEPGSQTP-
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pF1KSD QKLRNVLVLSGGEGYIDFRIGDGEDDETEEGAGDMSQVKPVLSKAERSHIIVWQVSYTPE
:...::.::::::::::.:: : :.: . :. ..: ..::::::.::::: : :
CCDS58 --LKSMLVISGGEGYIDFRMGD-EGGESELLGEDLP-LEPSVTKAERSHLIVWQVMYGNE
1260 1270 1280 1290 1300 1310
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CCDS11 MELEDGVVYQEEPGGSGAVMSERVSGLAGSIYREFERLIGRYDEEVVKELMPLVV
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::::::::....:::.:::::::.:::::.::::::::::..::::::::::. :::::
CCDS11 AVLENLDSVFAQDQEHQVELELLRDDNEQLITQYEREKALRKHAEEKFIEFEDSQEQEKK
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.:: .:: : :::::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::..:.::.:
CCDS11 DLQTRVESLESQTRQLELKAKNYADQISRLEEREAELKKEYNALHQRHTEMIHNYMEHLE
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CCDS11 RTKLHQLSGSDQLESTAHSRIRKERPISLGIFPLPAGDGLLTPDAQKGGE-TPGSEQWKF
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..:.: .: .: . ::.:. .:. : :.::..: .:. ....:. :::.: .
CCDS11 QELSQPRSHTSLK---DELSDVSQGGSKATTPAST---ANSDVATIPTD--TPLKEENEG
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. : . ... :...::::.:: :::: : . ..: :.:: ::.:::::::
CCDS11 F------VKVTDAPNKSEISKHIEVQVAQETRNVSTGSAENEEKSEVQAIIESTPELDMD
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pF1KSD PETRLDRTGSSPTQGIVNKAFGINTDSLYHELSTAGSEVIGDVDEGADLLGEFSVRDDFF
. . .:.::.:: :::: ::.::..:::.::: .::::::::::::
CCDS11 KDLSGYKGSSTPTKGIENKAFDRNTESLFEELSSAGSGLIGDVDEGADLLG---------
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::.:: ::.:::.::::::::::.::::::::::.:. :..::.:::::.::::.:::.
CCDS11 -MGREVENLILENTQLLETKNALNIVKNDLIAKVDELTCEKDVLQGELEAVKQAKLKLEE
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. .::::::.....:: ::.. :.. .:: :: :::.:::::::::::::
CCDS11 KNRELEEELRKARAEAEDARQKAKDD---------DDSD-IPTAQRKRFTRVEMARVLME
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pF1KSD RNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASREHPSVQEKKKSTIWQFFSRLFSSSSSPPPAKRPYP
::::::::::::::::::::::::::.:..::::.:.:::::::::::::. .:.: :
CCDS11 RNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASRENPAMQEKKRSSIWQFFSRLFSSSSN--TTKKPEP
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pF1KSD SVNIHYKSPTT--AGFSQRRNHAMCPISAG-SRPLEFFPDDDCTSSA-RREQKREQYRQV
::..:..::. . ..:. .. . . :. ..:. .. .: : ::::::::::::
CCDS11 PVNLKYNAPTSHVTPSVKKRSSTLSQLPGDKSKAFDFLSEETEASLASRREQKREQYRQV
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pF1KSD REHVRNDDGRLQACGWSLPAKYKQLSPNGGQEDTRMKNVPVPVYCRPLVEKDPTMKLWCA
. ::...:::.:: ::::: ::::.. .:: ...:::.::::: ::: ::: .::::::
CCDS11 KAHVQKEDGRVQAFGWSLPQKYKQVT--NGQGENKMKNLPVPVYLRPLDEKDTSMKLWCA
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pF1KSD AGVNLSGWRPNEDDAGNGVKPAP-GRDPLTCDREGDGEPKSAHTSPEK------KKAKEL
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... :: ::: ::: ...::.:::: :::...:.:::::.:::::.:.:.: ..:::
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:: . .: .. . .:..:.:::.:::... . .. :. : .::.
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:: : :..:. . : :::::::: . : .: . . : :::::::: .
CCDS11 DKPPEMEAE--NSEVDENVPTAEEATEATE-GNAGSAEDTVDISQTGVYTEHVFTDPLGV
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: . .: : .... :. :. : : . . . :: :::::::::: :::::
CCDS11 QIPEDLSPVYQSSNDSDAYKDQISVLPNEQDLVREEAQKMSSLLPTMWLGAQNGCLYVHS
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.::.:.:::::::::::.::.::::: :::::::::::::::: :::::::::::.:::.
CCDS11 SVAQWRKCLHSIKLKDSILSIVHVKGIVLVALADGTLAIFHRGVDGQWDLSNYHLLDLGR
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::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:. .:::::::::
CCDS11 IRLDSTLRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALMVSCNRLWVGTGNG
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CCDS11 VIISIPLTET-------------NKTSGVPGN--RPGSVIRVYGDENSDKVTPGTFIPYC
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CCDS11 SMAHAQLCFHGHRDAVKFFVAVPGQVISPQSSSSGTDLTGDKAGPSAQEPGSQTP---LK
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CCDS11 SMLVISGGEGYIDFRMGD-EGGESELLGEDLP-LEPSVTKAERSHLIVWQVMYGNE
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CCDS58 TPGSEQWKFQELSQPRSHTSLK---DELSDVSQGGSKATTPAST---ANSDVATIPTD--
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CCDS58 TPLKEE-----NEGF-VKVTDAPNKSEISKHIEVQVAQETRNVSTGSAENEEKSEVQAII
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.::::::: . . .:.::.:: :::: ::.::..:::.::: .::::::::::::
CCDS58 ESTPELDMDKDLSGYKGSSTPTKGIENKAFDRNTESLFEELSSAGSGLIGDVDEGADLLG
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pF1KSD EFSVRDDFFGMGKEVGNLLLENSQLLETKNALNVVKNDLIAKVDQLSGEQEVLRGELEAA
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CCDS58 ----------MGREVENLILENTQLLETKNALNIVKNDLIAKVDELTCEKDVLQGELEAV
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::::.:::.. .::::::.....:: ::.. :.. .:: :: :::.::::
CCDS58 KQAKLKLEEKNRELEEELRKARAEAEDARQKAKDD---------DDSD-IPTAQRKRFTR
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..::::.:.:::::::::::::.
CCDS58 VEMARVLMERNQYKERLMELQEAVRWTEMIRASRENPAMQEKKRSSIWQFFSRLFSSSSN
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pF1KSD PPPAKRPYPSVNIHYKSPTT--AGFSQRRNHAMCPISAG-SRPLEFFPDDDCTSSA-RRE
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CCDS58 --TTKKPEPPVNLKYNAPTSHVTPSVKKRSSTLSQLPGDKSKAFDFLSEETEASLASRRE
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CCDS58 QKREQYRQVKAHVQKEDGRVQAFGWSLPQKYKQVT--NGQGENKMKNLPVPVYLRPLDEK
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: .::::::.:::::: . :.:. : . .: : ::. . .....: .:
CCDS58 DTSMKLWCAVGVNLSGGKTR--DGGSVVGASVFYKDVAGLDTEGSKQRSASQSSLDKLDQ
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pF1KSD ---KKAKELPEMDATSSRVWILTSTLTTSKVVIIDANQPGTVVDQFTVCNAHVLCISSIP
.. ::: ... :: ::: ::: ...::.:::: :::...:.:::::.:::::.:.:
CCDS58 ELKEQQKELKNQEELSSLVWICTSTHSATKVLIIDAVQPGNILDSFTVCNSHVLCIASVP
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.: ..::: :: . .: .. . .:..:.:::.:::... . ..
CCDS58 GARETDYPAGEDLSESGQVDKASLCGSMTSNSSAETDSLLGGITVVGCSAEGVTGAATSP
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CCDS58 STNGASPVMDKPPEMEAE--NSEVDENVPTAEEATEATE-GNAGSAEDTVDISQTGVYTE
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pF1KSD QNGWLYVHSAVANWKKCLHSIKLKDSVLSLVHVKGRVLVALADGTLAIFHRGEDGQWDLS
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CCDS58 QNGCLYVHSSVAQWRKCLHSIKLKDSILSIVHVKGIVLVALADGTLAIFHRGVDGQWDLS
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:.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:. .
CCDS58 WVGDGVWVSIRLDSTLRLYHAHTYQHLQDVDIEPYVSKMLGTGKLGFSFVRITALMVSCN
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::::::::::.:::::::::.::.:.:::::::::: . :. :::..:.::::..::..
CCDS58 RLWVGTGNGVIISIPLTETVILHQGRLLGLRANKTSGVPGN--RPGSVIRVYGDENSDKV
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pF1KSD A-SSFIPYCSMAQAQLCFHGHRDAVKFFVSVPGNVLA---TLNGSVLDSPAEGPGPAAPA
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CCDS58 TPGTFIPYCSMAHAQLCFHGHRDAVKFFVAVPGQVISPQSSSSGTDLTGDKAGPSAQEPG
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CCDS58 SQT---PLKSMLVISGGEGYIDFRMGD-EGGESELLGEDLP-LEPSVTKAERSHLIVWQV
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD SYTPE
: :
CCDS58 MYGNE
1336 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 04:49:40 2016 done: Thu Nov 3 04:49:41 2016
Total Scan time: 6.130 Total Display time: 0.600
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]