Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA1059
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1059, 1222 aa
1>>>pF1KSDA1059 1222 - 1222 aa - 1222 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9781+/-0.000465; mu= 17.0853+/- 0.029
mean_var=175.2571+/-36.069, 0's: 0 Z-trim(114.7): 46 B-trim: 326 in 1/56
Lambda= 0.096881
statistics sampled from 24585 (24628) to 24585 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16
Scan time: 16.890
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055793 (OMIM: 606285) VPS10 domain-containing r (1222) 8185 1157.8 0
XP_011537844 (OMIM: 606285) PREDICTED: VPS10 domai ( 866) 5804 824.9 0
NP_001013049 (OMIM: 606283) VPS10 domain-containin (1198) 5297 754.2 1.2e-216
NP_001193498 (OMIM: 606283) VPS10 domain-containin (1179) 5240 746.2 2.9e-214
NP_001193501 (OMIM: 606283) VPS10 domain-containin (1179) 5240 746.2 2.9e-214
XP_011537501 (OMIM: 606283) PREDICTED: VPS10 domai (1187) 5240 746.2 2.9e-214
XP_016871103 (OMIM: 606283) PREDICTED: VPS10 domai (1203) 5240 746.2 3e-214
NP_443150 (OMIM: 606283) VPS10 domain-containing r (1168) 5064 721.6 7.4e-207
NP_001193499 (OMIM: 606283) VPS10 domain-containin (1130) 5063 721.4 7.9e-207
NP_001193500 (OMIM: 606283) VPS10 domain-containin (1159) 5058 720.7 1.3e-206
XP_016871105 (OMIM: 606283) PREDICTED: VPS10 domai (1031) 5001 712.7 3e-204
XP_016871106 (OMIM: 606283) PREDICTED: VPS10 domai (1018) 4999 712.4 3.6e-204
XP_011537503 (OMIM: 606283) PREDICTED: VPS10 domai (1116) 4876 695.3 5.8e-199
XP_016871104 (OMIM: 606283) PREDICTED: VPS10 domai (1159) 4649 663.6 2.1e-189
XP_016871107 (OMIM: 606283) PREDICTED: VPS10 domai ( 726) 3391 487.5 1.3e-136
XP_011511816 (OMIM: 606284) PREDICTED: VPS10 domai (1173) 3306 475.9 6.9e-133
XP_005248044 (OMIM: 606284) PREDICTED: VPS10 domai (1174) 3294 474.2 2.2e-132
XP_016863970 (OMIM: 606284) PREDICTED: VPS10 domai (1166) 3284 472.8 5.7e-132
NP_065828 (OMIM: 606284) VPS10 domain-containing r (1159) 3269 470.7 2.4e-131
XP_011511818 (OMIM: 606284) PREDICTED: VPS10 domai (1160) 3257 469.0 7.8e-131
XP_011511817 (OMIM: 606284) PREDICTED: VPS10 domai (1173) 3257 469.0 7.9e-131
NP_002950 (OMIM: 602458,613589) sortilin isoform 1 ( 831) 826 129.1 1.2e-28
XP_005271157 (OMIM: 602458,613589) PREDICTED: sort ( 830) 824 128.8 1.5e-28
XP_005271159 (OMIM: 602458,613589) PREDICTED: sort ( 695) 774 121.7 1.6e-26
XP_006710875 (OMIM: 602458,613589) PREDICTED: sort ( 695) 774 121.7 1.6e-26
XP_005271158 (OMIM: 602458,613589) PREDICTED: sort ( 695) 774 121.7 1.6e-26
NP_001192157 (OMIM: 602458,613589) sortilin isofor ( 694) 772 121.5 2e-26
XP_016873660 (OMIM: 104300,602005) PREDICTED: sort (1769) 664 106.8 1.3e-21
XP_016873659 (OMIM: 104300,602005) PREDICTED: sort (2039) 664 106.9 1.4e-21
XP_016873658 (OMIM: 104300,602005) PREDICTED: sort (2110) 664 106.9 1.5e-21
XP_011541265 (OMIM: 104300,602005) PREDICTED: sort (2176) 664 106.9 1.5e-21
NP_003096 (OMIM: 104300,602005) sortilin-related r (2214) 664 106.9 1.5e-21
>>NP_055793 (OMIM: 606285) VPS10 domain-containing recep (1222 aa)
initn: 8185 init1: 8185 opt: 8185 Z-score: 6192.0 bits: 1157.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8185; 100.0% identity (100.0% similar) in 1222 aa overlap (1-1222:1-1222)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAAPASRPPALSPLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAAPASRPPALSPLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRGIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRGIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD APAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAPRAGGSAAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 APAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAPRAGGSAAED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYGTTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYGTTY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYIQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYIQSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHMEVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHMEVR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSYRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSYRRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMENIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 AFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMENIKS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGSPVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGSPVH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD CLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDGGNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDGGNT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD WRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDGALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 WRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDGALV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGERKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 EAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGERKI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD FKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASPSKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASPSKD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD CSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQGHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQGHN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD ATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAENNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAENNLG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD SDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKPLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 SDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKPLIT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPDIPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 LDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPDIPE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD WRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDLEQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 WRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDLEQI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD VETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVGLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVGLAV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD FLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELDTRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 FLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELDTRV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220
pF1KSD IGGIATIANSESTKEIPNCTSV
::::::::::::::::::::::
NP_055 IGGIATIANSESTKEIPNCTSV
1210 1220
>>XP_011537844 (OMIM: 606285) PREDICTED: VPS10 domain-co (866 aa)
initn: 5804 init1: 5804 opt: 5804 Z-score: 4395.3 bits: 824.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5804; 100.0% identity (100.0% similar) in 866 aa overlap (357-1222:1-866)
330 340 350 360 370 380
pF1KSD RRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHMEVRTTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFA
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MEVRTTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFA
10 20 30
390 400 410 420 430 440
pF1KSD RSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSYRREAFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSYRREAFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQV
40 50 60 70 80 90
450 460 470 480 490 500
pF1KSD FAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMENIKSSRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMENIKSSRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANK
100 110 120 130 140 150
510 520 530 540 550 560
pF1KSD KVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGSPVHCLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGSPVHCLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISS
160 170 180 190 200 210
570 580 590 600 610 620
pF1KSD KETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDGGNTWRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDGGNTWRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHT
220 230 240 250 260 270
630 640 650 660 670 680
pF1KSD PLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDGALVEAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDGALVEAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKV
280 290 300 310 320 330
690 700 710 720 730 740
pF1KSD DYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGERKIFKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGERKIFKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCV
340 350 360 370 380 390
750 760 770 780 790 800
pF1KSD CANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASPSKDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASPSKDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLR
400 410 420 430 440 450
810 820 830 840 850 860
pF1KSD EKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQGHNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQGHNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIA
460 470 480 490 500 510
870 880 890 900 910 920
pF1KSD VSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAENNLGSDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAENNLGSDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAI
520 530 540 550 560 570
930 940 950 960 970 980
pF1KSD RNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKPLITLDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKPLITLDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNA
580 590 600 610 620 630
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD LIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPDIPEWRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPDIPEWRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILI
640 650 660 670 680 690
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD AVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDLEQIVETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDLEQIVETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVY
700 710 720 730 740 750
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD VTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVGLAVFLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVGLAVFLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQE
760 770 780 790 800 810
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD MIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELDTRVIGGIATIANSESTKEIPNCTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELDTRVIGGIATIANSESTKEIPNCTSV
820 830 840 850 860
>>NP_001013049 (OMIM: 606283) VPS10 domain-containing re (1198 aa)
initn: 5285 init1: 3031 opt: 5297 Z-score: 4010.6 bits: 754.2 E(85289): 1.2e-216
Smith-Waterman score: 5301; 65.2% identity (85.4% similar) in 1213 aa overlap (12-1222:13-1198)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAA-PASRPPALSP
: .: :. .:::.: . . : :: :. :.: : . :
NP_001 MGKVGAGGGSQARLSALLAGAGLLILCAPGVCG--------GGSCCPSPHPSSAPRSAS-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LSPRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRG
.::. . : : : .. : : :. : :. .. .: :: : .
NP_001 -TPRGFSHQGRPGRAPATPLPLVVR---P-LFSVAPGDRALSLE-RARGT-------GAS
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IPAPAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAP-RAGGSA
. . :. : ::: : :::.. . .: : . :.:: . : .:
NP_001 MAVAARSGRRRRSGADQEKA--ERGEGASRSPRGVLRDGGQQEPGTRE--RDPDKATRFR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEDLRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYG
:.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::
NP_001 MEELRLTSTTFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TTYEKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYI
::::::::::::::.:::::: ::::::::::.:::.:::.:::::::::::::::.:::
NP_001 TTYEKLNDKVGLKTILSYLYVCPTNKRKIMLLTDPEIESSLLISSDEGATYQKYRLNFYI
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QSLLFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHM
::::::::::::.:::: ::::::: .:::::::..: ..:::::::: : .:: ::::.
NP_001 QSLLFHPKQEDWILAYSQDQKLYSSAEFGRRWQLIQEGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EVRTTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSY
:.::.::..::::::.:.:.:..:. :: :: .::.:::.:.:.:.:..:: :::::
NP_001 EARTVDGHSHYLTCRMQNCTEANRNQPFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSY
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RREAFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMEN
::.::::.:::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::
NP_001 RRNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALEN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IKSSRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGS
..:::: :::.:.:::::::::.::::::.:.::::.::::::::::::::::.::::.
NP_001 VQSSRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFLANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGD
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PVHCLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDG
:::::::.:::::::..:::::.:: :.::.:::...::.:::: ::: :::..:.:::.
NP_001 PVHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGIIASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDA
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GNTWRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDG
::::::::.::..: .:: ::.::::::: ::.::::.:::::.::.::.:::.::::::
NP_001 GNTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDG
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ALVEAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGE
.: : : :: ::::::::: :::::::::::::::.:.:..:::. :.: .::: :.::
NP_001 VLGEPGEETLIMTVFGHFSHRSEWQLVKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQGEACIMGA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KSD RKIFKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASP
..:.:::: .: :. ..:.. ::::::.. ::.::::::::...::.::::.::.:
NP_001 KRIYKKRKSERKCMQGK-YAGAMESEPCVCTEADFDCDYGYERHSNGQCLPAFWFNPSSL
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SKDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQ
:::::::::::::::::..::::::::.::.:::: : :::::::::..::.::.:.:::
NP_001 SKDCSLGQSYLNSTGYRKVVSNNCTDGVREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQ
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KSD GHNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAEN
:::.:... .::::.::: ::.::::::::::.:.: .::::::::...:::.::. ..:
NP_001 GHNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDN
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KSD NLGSDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKP
.::::.:::.:::.::.::::: .:::. .::::: .::.::::.::::: ::.::.:.:
NP_001 SLGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFVTTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWYGNNTEP
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD LITLDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPD
::::..:::: : .:: .::::::.::::..:::: :::.: :.: :::::::: .:::
NP_001 LITLEGSISFRFTSEGMNTITVQVSAGNAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPD
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD IPEWRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDL
:::::.::: :::..::..:.:: ..::.::.:::::.::::.:: .. . . : . ::
NP_001 IPEWRRDIGRVIKKSLVEATGVPGQHILVAVLPGLPTTAELFVLPYQDPAGENKRSTDDL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD EQIVETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVG
::: : :...:::: :.:::::::.:.:....:: ::::: . ::.:::::::::::::
NP_001 EQISELLIHTLNQNSVHFELKPGVRVLVHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD LAVFLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELD
::::.::::::::: ::.:::.:..::::::. ::.::. :.. ... .: .:.:....
NP_001 LAVFVIYKFKRKIPGINVYAQMQNEKEQEMISPVSHSESRPNVPQTELRRPGQLIDEKVE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1200 1210 1220
pF1KSD TRVIGGIATIANSESTKEIPNCTSV
...::.:. .:...::::::. ..:
NP_001 SQLIGSISIVAENQSTKEIPTYVNV
1180 1190
>>NP_001193498 (OMIM: 606283) VPS10 domain-containing re (1179 aa)
initn: 5238 init1: 3031 opt: 5240 Z-score: 3967.7 bits: 746.2 E(85289): 2.9e-214
Smith-Waterman score: 5244; 65.5% identity (85.3% similar) in 1193 aa overlap (12-1202:13-1178)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAA-PASRPPALSP
: .: :. .:::.: . . : :: :. :.: : . :
NP_001 MGKVGAGGGSQARLSALLAGAGLLILCAPGVCG--------GGSCCPSPHPSSAPRSAS-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LSPRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRG
.::. . : : : .. : : :. : :. .. .: :: : .
NP_001 -TPRGFSHQGRPGRAPATPLPLVVR---P-LFSVAPGDRALSLE-RARGT-------GAS
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IPAPAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAP-RAGGSA
. . :. : ::: : :::.. . .: : . :.:: . : .:
NP_001 MAVAARSGRRRRSGADQEKA--ERGEGASRSPRGVLRDGGQQEPGTRE--RDPDKATRFR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEDLRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYG
:.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::
NP_001 MEELRLTSTTFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TTYEKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYI
::::::::::::::.:::::: ::::::::::.:::.:::.:::::::::::::::.:::
NP_001 TTYEKLNDKVGLKTILSYLYVCPTNKRKIMLLTDPEIESSLLISSDEGATYQKYRLNFYI
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QSLLFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHM
::::::::::::.:::: ::::::: .:::::::..: ..:::::::: : .:: ::::.
NP_001 QSLLFHPKQEDWILAYSQDQKLYSSAEFGRRWQLIQEGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EVRTTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSY
:.::.::..::::::.:.:.:..:. :: :: .::.:::.:.:.:.:..:: :::::
NP_001 EARTVDGHSHYLTCRMQNCTEANRNQPFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSY
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RREAFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMEN
::.::::.:::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::
NP_001 RRNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALEN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IKSSRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGS
..:::: :::.:.:::::::::.::::::.:.::::.::::::::::::::::.::::.
NP_001 VQSSRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFLANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGD
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PVHCLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDG
:::::::.:::::::..:::::.:: :.::.:::...::.:::: ::: :::..:.:::.
NP_001 PVHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGIIASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDA
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GNTWRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDG
::::::::.::..: .:: ::.::::::: ::.::::.:::::.::.::.:::.::::::
NP_001 GNTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDG
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ALVEAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGE
.: : : :: ::::::::: :::::::::::::::.:.:..:::. :.: .::: :.::
NP_001 VLGEPGEETLIMTVFGHFSHRSEWQLVKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQGEACIMGA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KSD RKIFKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASP
..:.:::: .: :. ..:.. ::::::.. ::.::::::::...::.::::.::.:
NP_001 KRIYKKRKSERKCMQGK-YAGAMESEPCVCTEADFDCDYGYERHSNGQCLPAFWFNPSSL
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SKDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQ
:::::::::::::::::..::::::::.::.:::: : :::::::::..::.::.:.:::
NP_001 SKDCSLGQSYLNSTGYRKVVSNNCTDGVREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQ
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KSD GHNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAEN
:::.:... .::::.::: ::.::::::::::.:.: .::::::::...:::.::. ..:
NP_001 GHNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDN
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KSD NLGSDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKP
.::::.:::.:::.::.::::: .:::. .::::: .::.::::.::::: ::.::.:.:
NP_001 SLGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFVTTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWYGNNTEP
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD LITLDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPD
::::..:::: : .:: .::::::.::::..:::: :::.: :.: :::::::: .:::
NP_001 LITLEGSISFRFTSEGMNTITVQVSAGNAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPD
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD IPEWRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDL
:::::.::: :::..::..:.:: ..::.::.:::::.::::.:: .. . . : . ::
NP_001 IPEWRRDIGRVIKKSLVEATGVPGQHILVAVLPGLPTTAELFVLPYQDPAGENKRSTDDL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD EQIVETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVG
::: : :...:::: :.:::::::.:.:....:: ::::: . ::.:::::::::::::
NP_001 EQISELLIHTLNQNSVHFELKPGVRVLVHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD LAVFLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELD
::::.::::::::: ::.:::.:..::::::. ::.::. :.. ... .: .:.:....
NP_001 LAVFVIYKFKRKIPGINVYAQMQNEKEQEMISPVSHSESRPNVPQTELRRPGQLIDEKVE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1200 1210 1220
pF1KSD TRVIGGIATIANSESTKEIPNCTSV
...::
NP_001 SQLIGK
>>NP_001193501 (OMIM: 606283) VPS10 domain-containing re (1179 aa)
initn: 5238 init1: 3031 opt: 5240 Z-score: 3967.7 bits: 746.2 E(85289): 2.9e-214
Smith-Waterman score: 5244; 65.5% identity (85.3% similar) in 1193 aa overlap (12-1202:13-1178)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAA-PASRPPALSP
: .: :. .:::.: . . : :: :. :.: : . :
NP_001 MGKVGAGGGSQARLSALLAGAGLLILCAPGVCG--------GGSCCPSPHPSSAPRSAS-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LSPRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRG
.::. . : : : .. : : :. : :. .. .: :: : .
NP_001 -TPRGFSHQGRPGRAPATPLPLVVR---P-LFSVAPGDRALSLE-RARGT-------GAS
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IPAPAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAP-RAGGSA
. . :. : ::: : :::.. . .: : . :.:: . : .:
NP_001 MAVAARSGRRRRSGADQEKA--ERGEGASRSPRGVLRDGGQQEPGTRE--RDPDKATRFR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEDLRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYG
:.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::
NP_001 MEELRLTSTTFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TTYEKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYI
::::::::::::::.:::::: ::::::::::.:::.:::.:::::::::::::::.:::
NP_001 TTYEKLNDKVGLKTILSYLYVCPTNKRKIMLLTDPEIESSLLISSDEGATYQKYRLNFYI
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QSLLFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHM
::::::::::::.:::: ::::::: .:::::::..: ..:::::::: : .:: ::::.
NP_001 QSLLFHPKQEDWILAYSQDQKLYSSAEFGRRWQLIQEGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EVRTTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSY
:.::.::..::::::.:.:.:..:. :: :: .::.:::.:.:.:.:..:: :::::
NP_001 EARTVDGHSHYLTCRMQNCTEANRNQPFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSY
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RREAFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMEN
::.::::.:::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::
NP_001 RRNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALEN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IKSSRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGS
..:::: :::.:.:::::::::.::::::.:.::::.::::::::::::::::.::::.
NP_001 VQSSRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFLANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGD
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PVHCLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDG
:::::::.:::::::..:::::.:: :.::.:::...::.:::: ::: :::..:.:::.
NP_001 PVHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGIIASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDA
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GNTWRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDG
::::::::.::..: .:: ::.::::::: ::.::::.:::::.::.::.:::.::::::
NP_001 GNTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDG
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ALVEAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGE
.: : : :: ::::::::: :::::::::::::::.:.:..:::. :.: .::: :.::
NP_001 VLGEPGEETLIMTVFGHFSHRSEWQLVKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQGEACIMGA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KSD RKIFKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASP
..:.:::: .: :. ..:.. ::::::.. ::.::::::::...::.::::.::.:
NP_001 KRIYKKRKSERKCMQGK-YAGAMESEPCVCTEADFDCDYGYERHSNGQCLPAFWFNPSSL
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SKDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQ
:::::::::::::::::..::::::::.::.:::: : :::::::::..::.::.:.:::
NP_001 SKDCSLGQSYLNSTGYRKVVSNNCTDGVREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQ
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KSD GHNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAEN
:::.:... .::::.::: ::.::::::::::.:.: .::::::::...:::.::. ..:
NP_001 GHNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDN
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KSD NLGSDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKP
.::::.:::.:::.::.::::: .:::. .::::: .::.::::.::::: ::.::.:.:
NP_001 SLGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFVTTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWYGNNTEP
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD LITLDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPD
::::..:::: : .:: .::::::.::::..:::: :::.: :.: :::::::: .:::
NP_001 LITLEGSISFRFTSEGMNTITVQVSAGNAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPD
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD IPEWRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDL
:::::.::: :::..::..:.:: ..::.::.:::::.::::.:: .. . . : . ::
NP_001 IPEWRRDIGRVIKKSLVEATGVPGQHILVAVLPGLPTTAELFVLPYQDPAGENKRSTDDL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD EQIVETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVG
::: : :...:::: :.:::::::.:.:....:: ::::: . ::.:::::::::::::
NP_001 EQISELLIHTLNQNSVHFELKPGVRVLVHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD LAVFLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELD
::::.::::::::: ::.:::.:..::::::. ::.::. :.. ... .: .:.:....
NP_001 LAVFVIYKFKRKIPGINVYAQMQNEKEQEMISPVSHSESRPNVPQTELRRPGQLIDEKVE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1200 1210 1220
pF1KSD TRVIGGIATIANSESTKEIPNCTSV
...::
NP_001 SQLIGE
>>XP_011537501 (OMIM: 606283) PREDICTED: VPS10 domain-co (1187 aa)
initn: 5238 init1: 3031 opt: 5240 Z-score: 3967.6 bits: 746.2 E(85289): 2.9e-214
Smith-Waterman score: 5244; 65.5% identity (85.3% similar) in 1193 aa overlap (12-1202:13-1178)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAA-PASRPPALSP
: .: :. .:::.: . . : :: :. :.: : . :
XP_011 MGKVGAGGGSQARLSALLAGAGLLILCAPGVCG--------GGSCCPSPHPSSAPRSAS-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LSPRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRG
.::. . : : : .. : : :. : :. .. .: :: : .
XP_011 -TPRGFSHQGRPGRAPATPLPLVVR---P-LFSVAPGDRALSLE-RARGT-------GAS
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IPAPAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAP-RAGGSA
. . :. : ::: : :::.. . .: : . :.:: . : .:
XP_011 MAVAARSGRRRRSGADQEKA--ERGEGASRSPRGVLRDGGQQEPGTRE--RDPDKATRFR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEDLRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYG
:.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::
XP_011 MEELRLTSTTFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TTYEKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYI
::::::::::::::.:::::: ::::::::::.:::.:::.:::::::::::::::.:::
XP_011 TTYEKLNDKVGLKTILSYLYVCPTNKRKIMLLTDPEIESSLLISSDEGATYQKYRLNFYI
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QSLLFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHM
::::::::::::.:::: ::::::: .:::::::..: ..:::::::: : .:: ::::.
XP_011 QSLLFHPKQEDWILAYSQDQKLYSSAEFGRRWQLIQEGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EVRTTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSY
:.::.::..::::::.:.:.:..:. :: :: .::.:::.:.:.:.:..:: :::::
XP_011 EARTVDGHSHYLTCRMQNCTEANRNQPFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSY
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RREAFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMEN
::.::::.:::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::
XP_011 RRNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALEN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IKSSRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGS
..:::: :::.:.:::::::::.::::::.:.::::.::::::::::::::::.::::.
XP_011 VQSSRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFLANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGD
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PVHCLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDG
:::::::.:::::::..:::::.:: :.::.:::...::.:::: ::: :::..:.:::.
XP_011 PVHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGIIASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDA
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GNTWRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDG
::::::::.::..: .:: ::.::::::: ::.::::.:::::.::.::.:::.::::::
XP_011 GNTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDG
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ALVEAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGE
.: : : :: ::::::::: :::::::::::::::.:.:..:::. :.: .::: :.::
XP_011 VLGEPGEETLIMTVFGHFSHRSEWQLVKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQGEACIMGA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KSD RKIFKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASP
..:.:::: .: :. ..:.. ::::::.. ::.::::::::...::.::::.::.:
XP_011 KRIYKKRKSERKCMQGK-YAGAMESEPCVCTEADFDCDYGYERHSNGQCLPAFWFNPSSL
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SKDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQ
:::::::::::::::::..::::::::.::.:::: : :::::::::..::.::.:.:::
XP_011 SKDCSLGQSYLNSTGYRKVVSNNCTDGVREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQ
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KSD GHNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAEN
:::.:... .::::.::: ::.::::::::::.:.: .::::::::...:::.::. ..:
XP_011 GHNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDN
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KSD NLGSDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKP
.::::.:::.:::.::.::::: .:::. .::::: .::.::::.::::: ::.::.:.:
XP_011 SLGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFVTTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWYGNNTEP
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD LITLDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPD
::::..:::: : .:: .::::::.::::..:::: :::.: :.: :::::::: .:::
XP_011 LITLEGSISFRFTSEGMNTITVQVSAGNAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPD
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD IPEWRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDL
:::::.::: :::..::..:.:: ..::.::.:::::.::::.:: .. . . : . ::
XP_011 IPEWRRDIGRVIKKSLVEATGVPGQHILVAVLPGLPTTAELFVLPYQDPAGENKRSTDDL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD EQIVETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVG
::: : :...:::: :.:::::::.:.:....:: ::::: . ::.:::::::::::::
XP_011 EQISELLIHTLNQNSVHFELKPGVRVLVHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD LAVFLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELD
::::.::::::::: ::.:::.:..::::::. ::.::. :.. ... .: .:.:....
XP_011 LAVFVIYKFKRKIPGINVYAQMQNEKEQEMISPVSHSESRPNVPQTELRRPGQLIDEKVE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1200 1210 1220
pF1KSD TRVIGGIATIANSESTKEIPNCTSV
...::
XP_011 SQLIGRYRSTLQSL
1180
>>XP_016871103 (OMIM: 606283) PREDICTED: VPS10 domain-co (1203 aa)
initn: 5220 init1: 3031 opt: 5240 Z-score: 3967.6 bits: 746.2 E(85289): 3e-214
Smith-Waterman score: 5244; 64.8% identity (84.8% similar) in 1211 aa overlap (12-1220:13-1194)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAA-PASRPPALSP
: .: :. .:::.: . . : :: :. :.: : . :
XP_016 MGKVGAGGGSQARLSALLAGAGLLILCAPGVCG--------GGSCCPSPHPSSAPRSAS-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LSPRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRG
.::. . : : : .. : : :. : :. .. .: :: : .
XP_016 -TPRGFSHQGRPGRAPATPLPLVVR---P-LFSVAPGDRALSLE-RARGT-------GAS
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IPAPAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAP-RAGGSA
. . :. : ::: : :::.. . .: : . :.:: . : .:
XP_016 MAVAARSGRRRRSGADQEKA--ERGEGASRSPRGVLRDGGQQEPGTRE--RDPDKATRFR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEDLRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYG
:.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::
XP_016 MEELRLTSTTFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TTYEKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYI
::::::::::::::.:::::: ::::::::::.:::.:::.:::::::::::::::.:::
XP_016 TTYEKLNDKVGLKTILSYLYVCPTNKRKIMLLTDPEIESSLLISSDEGATYQKYRLNFYI
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QSLLFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHM
::::::::::::.:::: ::::::: .:::::::..: ..:::::::: : .:: ::::.
XP_016 QSLLFHPKQEDWILAYSQDQKLYSSAEFGRRWQLIQEGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EVRTTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSY
:.::.::..::::::.:.:.:..:. :: :: .::.:::.:.:.:.:..:: :::::
XP_016 EARTVDGHSHYLTCRMQNCTEANRNQPFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSY
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RREAFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMEN
::.::::.:::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::
XP_016 RRNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALEN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IKSSRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGS
..:::: :::.:.:::::::::.::::::.:.::::.::::::::::::::::.::::.
XP_016 VQSSRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFLANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGD
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PVHCLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDG
:::::::.:::::::..:::::.:: :.::.:::...::.:::: ::: :::..:.:::.
XP_016 PVHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGIIASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDA
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GNTWRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDG
::::::::.::..: .:: ::.::::::: ::.::::.:::::.::.::.:::.::::::
XP_016 GNTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDG
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ALVEAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGE
.: : : :: ::::::::: :::::::::::::::.:.:..:::. :.: .::: :.::
XP_016 VLGEPGEETLIMTVFGHFSHRSEWQLVKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQGEACIMGA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KSD RKIFKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASP
..:.:::: .: :. ..:.. ::::::.. ::.::::::::...::.::::.::.:
XP_016 KRIYKKRKSERKCMQGK-YAGAMESEPCVCTEADFDCDYGYERHSNGQCLPAFWFNPSSL
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SKDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQ
:::::::::::::::::..::::::::.::.:::: : :::::::::..::.::.:.:::
XP_016 SKDCSLGQSYLNSTGYRKVVSNNCTDGVREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQ
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KSD GHNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAEN
:::.:... .::::.::: ::.::::::::::.:.: .::::::::...:::.::. ..:
XP_016 GHNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDN
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KSD NLGSDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKP
.::::.:::.:::.::.::::: .:::. .::::: .::.::::.::::: ::.::.:.:
XP_016 SLGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFVTTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWYGNNTEP
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD LITLDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPD
::::..:::: : .:: .::::::.::::..:::: :::.: :.: :::::::: .:::
XP_016 LITLEGSISFRFTSEGMNTITVQVSAGNAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPD
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD IPEWRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDL
:::::.::: :::..::..:.:: ..::.::.:::::.::::.:: .. . . : . ::
XP_016 IPEWRRDIGRVIKKSLVEATGVPGQHILVAVLPGLPTTAELFVLPYQDPAGENKRSTDDL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD EQIVETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVG
::: : :...:::: :.:::::::.:.:....:: ::::: . ::.:::::::::::::
XP_016 EQISELLIHTLNQNSVHFELKPGVRVLVHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD LAVFLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELD
::::.::::::::: ::.:::.:..::::::. ::.::. :.. ... .: .:.:....
XP_016 LAVFVIYKFKRKIPGINVYAQMQNEKEQEMISPVSHSESRPNVPQTELRRPGQLIDEKVE
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1200 1210 1220
pF1KSD TRVIGGIATIANSESTKEIPNCTSV
...: . .: ::. . .:.
XP_016 SQLIE--VPNSNFESSGVLGSCSVFSRNPTEH
1180 1190 1200
>>NP_443150 (OMIM: 606283) VPS10 domain-containing recep (1168 aa)
initn: 5052 init1: 3031 opt: 5064 Z-score: 3834.8 bits: 721.6 E(85289): 7.4e-207
Smith-Waterman score: 5068; 66.3% identity (85.3% similar) in 1141 aa overlap (12-1150:13-1126)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAA-PASRPPALSP
: .: :. .:::.: . . : :: :. :.: : . :
NP_443 MGKVGAGGGSQARLSALLAGAGLLILCAPGVCG--------GGSCCPSPHPSSAPRSAS-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LSPRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRG
.::. . : : : .. : : :. : :. .. .: :: : .
NP_443 -TPRGFSHQGRPGRAPATPLPLVVR---P-LFSVAPGDRALSLE-RARGT-------GAS
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IPAPAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAP-RAGGSA
. . :. : ::: : :::.. . .: : . :.:: . : .:
NP_443 MAVAARSGRRRRSGADQEK--AERGEGASRSPRGVLRDGGQQEPGTRE--RDPDKATRFR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEDLRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYG
:.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::
NP_443 MEELRLTSTTFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TTYEKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYI
::::::::::::::.:::::: ::::::::::.:::.:::.:::::::::::::::.:::
NP_443 TTYEKLNDKVGLKTILSYLYVCPTNKRKIMLLTDPEIESSLLISSDEGATYQKYRLNFYI
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QSLLFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHM
::::::::::::.:::: ::::::: .:::::::..: ..:::::::: : .:: ::::.
NP_443 QSLLFHPKQEDWILAYSQDQKLYSSAEFGRRWQLIQEGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EVRTTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSY
:.::.::..::::::.:.:.:..:. :: :: .::.:::.:.:.:.:..:: :::::
NP_443 EARTVDGHSHYLTCRMQNCTEANRNQPFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSY
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RREAFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMEN
::.::::.:::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::
NP_443 RRNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALEN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IKSSRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGS
..:::: :::.:.:::::::::.::::::.:.::::.::::::::::::::::.::::.
NP_443 VQSSRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFLANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGD
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PVHCLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDG
:::::::.:::::::..:::::.:: :.::.:::...::.:::: ::: :::..:.:::.
NP_443 PVHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGIIASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDA
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GNTWRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDG
::::::::.::..: .:: ::.::::::: ::.::::.:::::.::.::.:::.::::::
NP_443 GNTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDG
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ALVEAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGE
.: : : :: ::::::::: :::::::::::::::.:.:..:::. :.: .::: :.::
NP_443 VLGEPGEETLIMTVFGHFSHRSEWQLVKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQGEACIMGA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KSD RKIFKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASP
..:.:::: .: :. ..:.. ::::::.. ::.::::::::...::.::::.::.:
NP_443 KRIYKKRKSERKCMQGK-YAGAMESEPCVCTEADFDCDYGYERHSNGQCLPAFWFNPSSL
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SKDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQ
:::::::::::::::::..::::::::.::.:::: : :::::::::..::.::.:.:::
NP_443 SKDCSLGQSYLNSTGYRKVVSNNCTDGVREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQ
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KSD GHNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAEN
:::.:... .::::.::: ::.::::::::::.:.: .::::::::...:::.::. ..:
NP_443 GHNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDN
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KSD NLGSDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKP
.::::.:::.:::.::.::::: .:::. .::::: .::.::::.::::: ::.::.:.:
NP_443 SLGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFVTTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWYGNNTEP
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD LITLDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPD
::::..:::: : .:: .::::::.::::..:::: :::.: :.: :::::::: .:::
NP_443 LITLEGSISFRFTSEGMNTITVQVSAGNAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPD
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD IPEWRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDL
:::::.::: :::..::..:.:: ..::.::.:::::.::::.:: .. . . : . ::
NP_443 IPEWRRDIGRVIKKSLVEATGVPGQHILVAVLPGLPTTAELFVLPYQDPAGENKRSTDDL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD EQIVETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVG
::: : :...:::: :.:::::::.:.:....:: ::::: . ::.:::::::::::::
NP_443 EQISELLIHTLNQNSVHFELKPGVRVLVHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD LAVFLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELD
::::.::::::..
NP_443 LAVFVIYKFKRRVALPSPPSPSTQPGDSSLRLQRARHATPPSTPKRGSAGAQYAI
1120 1130 1140 1150 1160
>>NP_001193499 (OMIM: 606283) VPS10 domain-containing re (1130 aa)
initn: 5061 init1: 3031 opt: 5063 Z-score: 3834.2 bits: 721.4 E(85289): 7.9e-207
Smith-Waterman score: 5067; 66.5% identity (85.3% similar) in 1140 aa overlap (12-1149:13-1125)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAA-PASRPPALSP
: .: :. .:::.: . . : :: :. :.: : . :
NP_001 MGKVGAGGGSQARLSALLAGAGLLILCAPGVCG--------GGSCCPSPHPSSAPRSAS-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LSPRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRG
.::. . : : : .. : : :. : :. .. .: :: : .
NP_001 -TPRGFSHQGRPGRAPATPLPLVVR---P-LFSVAPGDRALSLE-RARGT-------GAS
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IPAPAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAP-RAGGSA
. . :. : ::: : :::.. . .: : . :.:: . : .:
NP_001 MAVAARSGRRRRSGADQEK--AERGEGASRSPRGVLRDGGQQEPGTRE--RDPDKATRFR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEDLRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYG
:.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::
NP_001 MEELRLTSTTFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TTYEKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYI
::::::::::::::.:::::: ::::::::::.:::.:::.:::::::::::::::.:::
NP_001 TTYEKLNDKVGLKTILSYLYVCPTNKRKIMLLTDPEIESSLLISSDEGATYQKYRLNFYI
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QSLLFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHM
::::::::::::.:::: ::::::: .:::::::..: ..:::::::: : .:: ::::.
NP_001 QSLLFHPKQEDWILAYSQDQKLYSSAEFGRRWQLIQEGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EVRTTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSY
:.::.::..::::::.:.:.:..:. :: :: .::.:::.:.:.:.:..:: :::::
NP_001 EARTVDGHSHYLTCRMQNCTEANRNQPFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSY
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RREAFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMEN
::.::::.:::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::
NP_001 RRNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALEN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IKSSRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGS
..:::: :::.:.:::::::::.::::::.:.::::.::::::::::::::::.::::.
NP_001 VQSSRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFLANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGD
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PVHCLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDG
:::::::.:::::::..:::::.:: :.::.:::...::.:::: ::: :::..:.:::.
NP_001 PVHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGIIASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDA
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GNTWRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDG
::::::::.::..: .:: ::.::::::: ::.::::.:::::.::.::.:::.::::::
NP_001 GNTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDG
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ALVEAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGE
.: : : :: ::::::::: :::::::::::::::.:.:..:::. :.: .::: :.::
NP_001 VLGEPGEETLIMTVFGHFSHRSEWQLVKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQGEACIMGA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KSD RKIFKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASP
..:.:::: .: :. ..:.. ::::::.. ::.::::::::...::.::::.::.:
NP_001 KRIYKKRKSERKCMQGK-YAGAMESEPCVCTEADFDCDYGYERHSNGQCLPAFWFNPSSL
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SKDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQ
:::::::::::::::::..::::::::.::.:::: : :::::::::..::.::.:.:::
NP_001 SKDCSLGQSYLNSTGYRKVVSNNCTDGVREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQ
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KSD GHNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAEN
:::.:... .::::.::: ::.::::::::::.:.: .::::::::...:::.::. ..:
NP_001 GHNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDN
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KSD NLGSDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKP
.::::.:::.:::.::.::::: .:::. .::::: .::.::::.::::: ::.::.:.:
NP_001 SLGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFVTTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWYGNNTEP
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD LITLDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPD
::::..:::: : .:: .::::::.::::..:::: :::.: :.: :::::::: .:::
NP_001 LITLEGSISFRFTSEGMNTITVQVSAGNAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPD
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD IPEWRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDL
:::::.::: :::..::..:.:: ..::.::.:::::.::::.:: .. . . : . ::
NP_001 IPEWRRDIGRVIKKSLVEATGVPGQHILVAVLPGLPTTAELFVLPYQDPAGENKRSTDDL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD EQIVETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVG
::: : :...:::: :.:::::::.:.:....:: ::::: . ::.:::::::::::::
NP_001 EQISELLIHTLNQNSVHFELKPGVRVLVHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD LAVFLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELD
::::.:::::::
NP_001 LAVFVIYKFKRKYFHSC
1120 1130
>>NP_001193500 (OMIM: 606283) VPS10 domain-containing re (1159 aa)
initn: 5046 init1: 3031 opt: 5058 Z-score: 3830.3 bits: 720.7 E(85289): 1.3e-206
Smith-Waterman score: 5062; 66.3% identity (85.2% similar) in 1141 aa overlap (12-1150:13-1126)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAA-PASRPPALSP
: .: :. .:::.: . . : :: :. :.: : . :
NP_001 MGKVGAGGGSQARLSALLAGAGLLILCAPGVCG--------GGSCCPSPHPSSAPRSAS-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LSPRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRG
.::. . : : : .. : : :. : :. .. .: :: : .
NP_001 -TPRGFSHQGRPGRAPATPLPLVVR---P-LFSVAPGDRALSLE-RARGT-------GAS
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IPAPAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAP-RAGGSA
. . :. : ::: : :::.. . .: : . :.:: . : .:
NP_001 MAVAARSGRRRRSGADQEK--AERGEGASRSPRGVLRDGGQQEPGTRE--RDPDKATRFR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEDLRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYG
:.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::
NP_001 MEELRLTSTTFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TTYEKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYI
::::::::::::::.:::::: ::::::::::.:::.:::.:::::::::::::::.:::
NP_001 TTYEKLNDKVGLKTILSYLYVCPTNKRKIMLLTDPEIESSLLISSDEGATYQKYRLNFYI
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QSLLFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHM
::::::::::::.:::: ::::::: .:::::::..: ..:::::::: : .:: ::::.
NP_001 QSLLFHPKQEDWILAYSQDQKLYSSAEFGRRWQLIQEGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EVRTTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSY
:.::.::..::::::.:.:.:..:. :: :: .::.:::.:.:.:.:..:: :::::
NP_001 EARTVDGHSHYLTCRMQNCTEANRNQPFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSY
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RREAFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMEN
::.::::.:::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::
NP_001 RRNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALEN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IKSSRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGS
..:::: :::.:.:::::::::.::::::.:.::::.::::::::::::::::.::::.
NP_001 VQSSRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFLANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGD
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PVHCLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDG
:::::::.:::::::..:::::.:: :.::.:::...::.:::: ::: :::..:.:::.
NP_001 PVHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGIIASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDA
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GNTWRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDG
::::::::.::..: .:: ::.::::::: ::.::::.:::::.::.::.:::.::::::
NP_001 GNTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDG
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ALVEAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGE
.: : : :: ::::::::: :::::::::::::::.:.:..:::. :.: .::: :.::
NP_001 VLGEPGEETLIMTVFGHFSHRSEWQLVKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQGEACIMGA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KSD RKIFKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASP
..:.:::: .: :. ..:.. ::::::.. ::.::::::::...::.::::.::.:
NP_001 KRIYKKRKSERKCMQGK-YAGAMESEPCVCTEADFDCDYGYERHSNGQCLPAFWFNPSSL
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SKDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQ
:::::::::::::::::..::::::::.::.:::: : :::::::::..::.::.:.:::
NP_001 SKDCSLGQSYLNSTGYRKVVSNNCTDGVREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQ
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KSD GHNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAEN
:::.:... .::::.::: ::.::::::::::.:.: .::::::::...:::.::. ..:
NP_001 GHNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDN
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KSD NLGSDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKP
.::::.:::.:::.::.::::: .:::. .::::: .::.::::.::::: ::.::.:.:
NP_001 SLGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFVTTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWYGNNTEP
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD LITLDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPD
::::..:::: : .:: .::::::.::::..:::: :::.: :.: :::::::: .:::
NP_001 LITLEGSISFRFTSEGMNTITVQVSAGNAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPD
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD IPEWRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDL
:::::.::: :::..::..:.:: ..::.::.:::::.::::.:: .. . . : . ::
NP_001 IPEWRRDIGRVIKKSLVEATGVPGQHILVAVLPGLPTTAELFVLPYQDPAGENKRSTDDL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD EQIVETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVG
::: : :...:::: :.:::::::.:.:....:: ::::: . ::.:::::::::::::
NP_001 EQISELLIHTLNQNSVHFELKPGVRVLVHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD LAVFLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELD
::::.:::::: .
NP_001 LAVFVIYKFKRCVSLYPRSPTPDLFLLPDRFRSMCYSDVHSSDGFY
1120 1130 1140 1150
1222 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 04:48:47 2016 done: Thu Nov 3 04:48:49 2016
Total Scan time: 16.890 Total Display time: 0.640
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]