Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA1059
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA1059, 1222 aa
1>>>pF1KSDA1059 1222 - 1222 aa - 1222 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.5198+/-0.00121; mu= 14.0640+/- 0.073
mean_var=165.9921+/-33.618, 0's: 0 Z-trim(107.6): 23 B-trim: 73 in 1/50
Lambda= 0.099548
statistics sampled from 9663 (9672) to 9663 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.297), width: 16
Scan time: 4.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7558.1 SORCS3 gene_id:22986|Hs108|chr10 (1222) 8185 1188.9 0
CCDS7559.1 SORCS1 gene_id:114815|Hs108|chr10 (1168) 5064 740.7 5.1e-213
CCDS47008.1 SORCS2 gene_id:57537|Hs108|chr4 (1159) 3269 482.9 2e-135
CCDS798.1 SORT1 gene_id:6272|Hs108|chr1 ( 831) 826 131.9 6.6e-30
CCDS55618.1 SORT1 gene_id:6272|Hs108|chr1 ( 694) 772 124.1 1.2e-27
CCDS8436.1 SORL1 gene_id:6653|Hs108|chr11 (2214) 664 109.0 1.4e-22
>>CCDS7558.1 SORCS3 gene_id:22986|Hs108|chr10 (1222 aa)
initn: 8185 init1: 8185 opt: 8185 Z-score: 6360.0 bits: 1188.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8185; 100.0% identity (100.0% similar) in 1222 aa overlap (1-1222:1-1222)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAAPASRPPALSPLS
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CCDS75 MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAAPASRPPALSPLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD PRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRGIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRGIP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD APAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAPRAGGSAAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 APAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAPRAGGSAAED
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYGTTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYGTTY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYIQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYIQSL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHMEVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHMEVR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSYRRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSYRRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMENIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMENIKS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGSPVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGSPVH
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD CLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDGGNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDGGNT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD WRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDGALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDGALV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGERKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGERKI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD FKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASPSKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASPSKD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD CSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQGHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 CSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQGHN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD ATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAENNLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAENNLG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD SDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKPLIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKPLIT
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD LDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPDIPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPDIPE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD WRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDLEQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 WRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDLEQI
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD VETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVGLAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVGLAV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD FLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELDTRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELDTRV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220
pF1KSD IGGIATIANSESTKEIPNCTSV
::::::::::::::::::::::
CCDS75 IGGIATIANSESTKEIPNCTSV
1210 1220
>>CCDS7559.1 SORCS1 gene_id:114815|Hs108|chr10 (1168 aa)
initn: 5052 init1: 3031 opt: 5064 Z-score: 3937.8 bits: 740.7 E(32554): 5.1e-213
Smith-Waterman score: 5068; 66.3% identity (85.3% similar) in 1141 aa overlap (12-1150:13-1126)
10 20 30 40 50
pF1KSD MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAA-PASRPPALSP
: .: :. .:::.: . . : :: :. :.: : . :
CCDS75 MGKVGAGGGSQARLSALLAGAGLLILCAPGVCG--------GGSCCPSPHPSSAPRSAS-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LSPRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRG
.::. . : : : .. : : :. : :. .. .: :: : .
CCDS75 -TPRGFSHQGRPGRAPATPLPLVVR---P-LFSVAPGDRALSLE-RARGT-------GAS
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KSD IPAPAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAP-RAGGSA
. . :. : ::: : :::.. . .: : . :.:: . : .:
CCDS75 MAVAARSGRRRRSGADQEK--AERGEGASRSPRGVLRDGGQQEPGTRE--RDPDKATRFR
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AEDLRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYG
:.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::
CCDS75 MEELRLTSTTFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYG
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD TTYEKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYI
::::::::::::::.:::::: ::::::::::.:::.:::.:::::::::::::::.:::
CCDS75 TTYEKLNDKVGLKTILSYLYVCPTNKRKIMLLTDPEIESSLLISSDEGATYQKYRLNFYI
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QSLLFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHM
::::::::::::.:::: ::::::: .:::::::..: ..:::::::: : .:: ::::.
CCDS75 QSLLFHPKQEDWILAYSQDQKLYSSAEFGRRWQLIQEGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHL
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KSD EVRTTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSY
:.::.::..::::::.:.:.:..:. :: :: .::.:::.:.:.:.:..:: :::::
CCDS75 EARTVDGHSHYLTCRMQNCTEANRNQPFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSY
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD RREAFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMEN
::.::::.:::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::
CCDS75 RRNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALEN
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IKSSRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGS
..:::: :::.:.:::::::::.::::::.:.::::.::::::::::::::::.::::.
CCDS75 VQSSRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFLANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGD
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KSD PVHCLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDG
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CCDS75 PVHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGIIASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDA
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GNTWRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDG
::::::::.::..: .:: ::.::::::: ::.::::.:::::.::.::.:::.::::::
CCDS75 GNTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDG
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ALVEAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGE
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CCDS75 VLGEPGEETLIMTVFGHFSHRSEWQLVKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQGEACIMGA
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KSD RKIFKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASP
..:.:::: .: :. ..:.. ::::::.. ::.::::::::...::.::::.::.:
CCDS75 KRIYKKRKSERKCMQGK-YAGAMESEPCVCTEADFDCDYGYERHSNGQCLPAFWFNPSSL
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KSD SKDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQ
:::::::::::::::::..::::::::.::.:::: : :::::::::..::.::.:.:::
CCDS75 SKDCSLGQSYLNSTGYRKVVSNNCTDGVREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQ
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KSD GHNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAEN
:::.:... .::::.::: ::.::::::::::.:.: .::::::::...:::.::. ..:
CCDS75 GHNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDN
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KSD NLGSDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKP
.::::.:::.:::.::.::::: .:::. .::::: .::.::::.::::: ::.::.:.:
CCDS75 SLGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFVTTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWYGNNTEP
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD LITLDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPD
::::..:::: : .:: .::::::.::::..:::: :::.: :.: :::::::: .:::
CCDS75 LITLEGSISFRFTSEGMNTITVQVSAGNAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPD
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD IPEWRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDL
:::::.::: :::..::..:.:: ..::.::.:::::.::::.:: .. . . : . ::
CCDS75 IPEWRRDIGRVIKKSLVEATGVPGQHILVAVLPGLPTTAELFVLPYQDPAGENKRSTDDL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD EQIVETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVG
::: : :...:::: :.:::::::.:.:....:: ::::: . ::.:::::::::::::
CCDS75 EQISELLIHTLNQNSVHFELKPGVRVLVHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD LAVFLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELD
::::.::::::..
CCDS75 LAVFVIYKFKRRVALPSPPSPSTQPGDSSLRLQRARHATPPSTPKRGSAGAQYAI
1120 1130 1140 1150 1160
>>CCDS47008.1 SORCS2 gene_id:57537|Hs108|chr4 (1159 aa)
initn: 3194 init1: 1637 opt: 3269 Z-score: 2544.7 bits: 482.9 E(32554): 2e-135
Smith-Waterman score: 3304; 44.4% identity (72.7% similar) in 1154 aa overlap (39-1176:9-1132)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD PAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPG---RPAAPASRPPALSPLSPRAVA
:. ::: : .:.. :: : :::.
CCDS47 MAHRGPSRASKGPGPTARAPSPGAPPP---PRSPRSRP
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRGIPAPAKL
: .: :: :: .:: : : : . :. :: . ::. :.
CCDS47 LLLLLLLLGACGAA--GR--SPE--P---GRLGPHAQLTRVPRSPPA---GRAEPG----
40 50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KSD GGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAPRAGGSAAEDLRLPS
:: :. :. : . : . . ::. : :. : : : : :: :: .. .. : :
CCDS47 GGEDRQARGTEPGAP--GPSPGPAPGPGEDGA-PAAGYRRWERAAPLAGVASRAQVSLIS
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYGTTYEKLND
:::.: ::..::::::::.:.:::::::::: : ..:.: :::::::.:.::.: ::.
CCDS47 TSFVLKGDATHNQAMVHWTGENSSVILILTKYYHADMGKVLESSLWRSSDFGTSYTKLTL
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KSD KVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDP--EMESSILISSDEGATYQKYRLTFYIQSLLFH
. :. ::.. .:. ::::::..:.:. . ..:...:.:::::.:: . :....:.::
CCDS47 QPGVTTVIDNFYICPTNKRKVILVSSSLSDRDQSLFLSADEGATFQKQPIPFFVETLIFH
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHMEVRTTD
::.:: ::::. ..::: : :.:..: :..::.: .. .:::.:.: . ::::.:..
CCDS47 PKEEDKVLAYTKESKLYVSSDLGKKWTLLQERVTKDHVFWSVSGVDADPDLVHVEAQDLG
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KSD GYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSYRREAFA
: .:.:: :..:.: ..::: :: .::.:::.:::...:......:::::::. :.
CCDS47 GDFRYVTCAIHNCSEKMLTAPFAGPIDHGSLTVQDDYIFFKATSANQTKYYVSYRRNEFV
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMENIKSSRG
.:::::.::::..::::::.:::.::::: : :::::: :: ::. ..:......:::
CCDS47 LMKLPKYALPKDLQIISTDESQVFVAVQEWYQMDTYNLYQSDPRGVRYALVLQDVRSSRQ
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530 540
pF1KSD LMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGSPVHCLL
...:.. :: :.::.::::.:.: .: : ::::::::: :. :..:. :.:..:
CCDS47 AEESVLIDILEVRGVKGVFLANQKIDGKVMTLITYNKGRDWDYLRPPSMDMNGKPTNCKP
440 450 460 470 480 490
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDGGNTWRQ
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CCDS47 PDCHLHLHLRWADNPYVSGTVHTKDTAPGLIMGAGNLGSQLVEYKEEMYITSDCGHTWRQ
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pF1KSD IFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDGALVEAG
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CCDS47 VFEEEHHILYLDHGGVIVAIKDTSIPLKILKFSVDEGLTWSTHNFTSTSVFVDGLLSEPG
560 570 580 590 600 610
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pF1KSD METHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLN-QGEPCVMGERKIFK
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CCDS47 DETLVMTVFGHISFRSDWELVKVDFRPSFSRQCGEEDYSSWELSNLQGDRCIMGQQRSFR
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::: . : ::. .....:. : : . :: ::::.:: . :. : ::.:: ::
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pF1KSD SKDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVA-E
::.:::.: .: :::..::: : :. . . .:: ::::.: . .:. :: .
CCDS47 PDDCALGQTYTSSLGYRKVVSNVCEGGVDMQQSQVQLQCPLTPPRGLQV-SIQGEAVAVR
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pF1KSD QGHNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAE
:... :.. .:.::. :. :.:.:::. . :.:.. . :.: :.: ::..:.. ::
CCDS47 PGEDVLFVVRQEQGDVLTTKYQVDLGDGFKAMYVNLTLTGEPIRHRYESPGIYRVSVRAE
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pF1KSD NNLGSDTAVLFLHVVCPVEHVHLRV-PFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNST
:. : : ::::..: :.. ..:.: : ... :.:::..::. : . . ...::.:.:
CCDS47 NTAGHDEAVLFVQVNSPLQALYLEVVPVIGL-NQEVNLTAVLLPLNPNLTVFYWWIGHSL
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pF1KSD KPLITLDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHN
.::..::.:.. : : .:::.: ::...::.. . : . :: . :.:: .:: .:
CCDS47 QPLLSLDNSVTTRFSDTGDVRVTVQAACGNSVLQDSRVLRVLDQFQVMPLQFSKELDAYN
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pF1KSD PDIPEWRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFIL--PPKNLTERRKGN
:. ::::.:.: :. : : : ::::.. .. .: ::::: :.:..: ::. .: ..
CCDS47 PNTPEWREDVGLVVTRLLSKETSVPQELLVTVVKPGLPTLADLYVLLPPPRPTRKRSLSS
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pF1KSD EGDLEQIVETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQL-TLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLS
. : : . .:: . ..: :. ::.:.: . . : : . ...:. . ..:....
CCDS47 DKRLAAIQQ----VLNAQKISFLLRGGVRVLVALRDTGTGAEQLGGGGGYWAVVVLFVIG
1040 1050 1060 1070 1080 1090
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pF1KSD VVFVGLAVFLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELL
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CCDS47 LFAAG--AFILYKFKRKRPGRTVYAQMHNEKEQEMTSPVSHSEDVQGAVQGNHSGVVLSI
1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KSD DKELDTRVIGGIATIANSESTKEIPNCTSV
CCDS47 NSREMHSYLVS
1150
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. :. .: .: ... . :. .... . : : ...:::.:: .. . . . .
CCDS79 ECGRVRDFVA---KLANNTHQHVFDDLRGSVSLSWVGDSTGVILVLTTFHVPLVIMTFGQ
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:.:.:: ::: ... ..: .. ..: .. . ..: :. :..: .. : :. :
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:. . :. . .::: .:. ::.: . : .. : .: . :
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.. .: :.:.:. . ..... .::. . . . :.......:: :.:
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... ... :: ::: .. ... .. .. : :. .. .:....:..... . :.
CCDS79 PGDTGFGTIFTSDDRGIVYSKSLDRHLYTTTG--GET--DFTNVTSLRGVYITSVLSEDN
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...:.::...: : :. :. . . .. ::::.: . : . . .. :.
CCDS79 SIQTMITFDQGGRWTHLRKPENSECDATAKNK-NECSLHIHASYSISQKLNVPMAPLSEP
430 440 450 460 470 480
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pF1KSD TAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDGGNTWRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPL
.: :.:.: :..: .: :.::.::: .: .... . .:: :: .::..:.
CCDS79 NAVGIVIAHGSVGDAISVMVPDVYISDDGGYSWTKMLEGPHYYTILDSGGIIVAIEHSSR
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pF1KSD PVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDGALVEAGMETHIMTVFGHFS---LRSEWQLVK
:. . : :::. :. : :: :.. : : : .. ....: :. : :.:
CCDS79 PINVIKFSTDEGQCWQTYTFTRDPIYFTGLASEPGARSMNISIWG-FTESFLTSQWVSYT
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.:.:.:. :.: ..:: : : .. .: :..: .. : . . .. : :::.
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:...: :.:. :: ::.:: : ...:.:: .: ..: : : . .:...:
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::.: ...: :.
CCDS79 YRKIPGDKCQGGVNPVREVKDLKKKCTSNFLSPEKQNSKSNSVPIILAIVGLMLVTVVAG
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. ..: :. :..: .. : :. ::: . .. . : :. . .... :.. :..
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:: : .. :. : .:: .:. .:. . . : ..... . . .:: .:. ::.:
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. : .. : .: . : .. .: :.:.:. . ....
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. .::. . . . :.......:: :.: ... ... :: ::: .. ... .. ..
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: :. .. .:....:..... . :....:.::...: : :. :. . . ..
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::::.: . : . . .. :. .: :.:.: :..: .: :.::.:::
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.: .... . .:: :: .::..:. :. . : :::. :. : :: :.. :
CCDS55 SWTKMLEGPHYYTILDSGGIIVAIEHSSRPINVIKFSTDEGQCWQTYTFTRDPIYFTGLA
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: : .. ....: :. : :.: .:.:.:. :.: ..:: : : .. .:
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pF1KSD PAFWYNPASPSKD---CSLG-QSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRG
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CCDS55 E----QPELKGHDLEFCLYGREEHLTTNGYRKIPGDKCQGGVNPVREVKDLKKKCTSNFL
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CCDS55 SPEKQNSKSNSVPIILAIVGLMLVTVVAGVLIVKKYVCGGRFLVHRYSVLQQHAEANGVD
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.: . .. :. :.:: . . : . .
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: :.: :: . : : ::: . . .. .. ...::: .:::.:..:.::. :..
CCDS84 RGDARGASRADEKPLRRKRSAALQPEPIKVYGQVSLNDSHNQMVVHWAGEKSNVIVALAR
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.. :. :... : ::: ...:..::. :: ..:.. .: .:..... ....
CCDS84 -DSLALARPKSSDVYVSYDYGKSFKKISDKLNFGLGNRSEAVIAQFYHSPADNKR-YIFA
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: . . :. : : : . . : .::.: : . .:... ...:..: :::.
CCDS84 DAYAQY-LWITFDFCNTLQGFSIPFRAADLLLHSKASNLLLGFDRSHPNKQLWKSDDFGQ
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pF1KSD RWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHMEVRTTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFAR
: ...:.. . : :.. :: . ...: . .::. . : . .. : . .
CCDS84 TWIMIQEHV--KSFSWGIDPYDKP-NTIYIERHEPSGYSTVF--RSTDFFQS-RENQEVI
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.. .. ..:.:.: ... : . : .::. :. . .. ....: .
CCDS84 LEEVRDFQLRDKYMFATKVVHLLGSEQQSSVQLWVSFGRKPMRAAQFVTRHPINEYYIAD
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pF1KSD TDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMENI--KSSRGLMGNIII--------
..:.:::. :. ..:. :::::...:. :.:..::. : : .. ..
CCDS84 ASEDQVFVCVS--HSNNRTNLYISEAEGLKFSLSLENVLYYSPGGAGSDTLVRYFANEPF
360 370 380 390 400 410
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pF1KSD -ELYEVAGIKGIFLA---NKKVDDQ-VKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGSPVHCLLPF
....: :..:...: : ..... ... ::..:: :..:::: : ..: :
CCDS84 ADFHRVEGLQGVYIATLINGSMNEENMRSVITFDKGGTWEFLQAPAFTGYGEKINCELSQ
420 430 440 450 460 470
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pF1KSD -CSLHLHLQLSENPYSSGR---ISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDGGNTW
::::: .::. . : : :::.::::..:::..: .:. . .:.:::..: :
CCDS84 GCSLHLAQRLSQLLNLQLRRMPILSKESAPGLIIATGSVGKNLA-SKTNVYISSSAGARW
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pF1KSD RQIFD-EEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDGALV
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CCDS84 REALPGPHYYTWG-DHGGIITAIAQG-METNELKYSTNEGETWKTFIFSEKPVFVYGLLT
540 550 560 570 580
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pF1KSD EAGMETHIMTVFG--HFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQ-GEPCVMGE
: : .. ..:.:: . ...: : ...:. . .. ::..::. : .. :. :..:.
CCDS84 EPGEKSTVFTIFGSNKENVHS-WLILQVNATDALGVPCTENDYKLWSPSDERGNECLLGH
590 600 610 620 630 640
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pF1KSD RKIFKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQ---CVP--AFWY
. .::.: : : : :.: . :: : :. :.:::.:.. . . ::: :
CCDS84 KTVFKRRTPHATCFNGEDFDRPVVVSNCSCTREDYECDFGFKMSEDLSLEVCVPDPEFSG
650 660 670 680 690 700
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pF1KSD NPASPSKDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDG-LREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDG
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CCDS84 KSYSPPVPCPVGSTYRRTRGYRKISGDTCSGGDVEARLEGELVPCPLAEENEFILYAVRK
710 720 730 740 750 760
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pF1KSD RLVAEQGHNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQV
CCDS84 SIYRYDLASGATEQLPLTGLRAAVALDFDYEHNCLYWSDLALDVIQRLCLNGSTGQEVII
770 780 790 800 810 820
1222 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 04:48:46 2016 done: Thu Nov 3 04:48:47 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]