Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0952
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0952, 522 aa
1>>>pF1KSDA0952 522 - 522 aa - 522 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7933+/-0.000976; mu= 15.4162+/- 0.059
mean_var=74.1008+/-14.625, 0's: 0 Z-trim(105.5): 94 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.148992
statistics sampled from 8331 (8434) to 8331 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.634), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 2.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13113.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 ( 522) 3470 755.6 3.1e-218
CCDS13114.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 ( 461) 3086 673.0 1.9e-193
CCDS10002.2 BTBD6 gene_id:90135|Hs108|chr14 ( 485) 2324 509.3 4.1e-144
CCDS12078.1 BTBD2 gene_id:55643|Hs108|chr19 ( 525) 1303 289.8 5.1e-78
CCDS10322.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 ( 482) 1244 277.1 3.1e-74
CCDS32313.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 ( 385) 940 211.7 1.2e-54
CCDS47418.1 BTBD9 gene_id:114781|Hs108|chr6 ( 612) 321 78.8 2e-14
CCDS2234.1 KLHL41 gene_id:10324|Hs108|chr2 ( 606) 288 71.7 2.7e-12
>>CCDS13113.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 (522 aa)
initn: 3470 init1: 3470 opt: 3470 Z-score: 4031.6 bits: 755.6 E(32554): 3.1e-218
Smith-Waterman score: 3470; 100.0% identity (100.0% similar) in 522 aa overlap (1-522:1-522)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MVDDKEKNMKCLTFFLMLPETVKNRSKKSSKKANTSSSSSNSSKLPPVCYEIITLKTKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MVDDKEKNMKCLTFFLMLPETVKNRSKKSSKKANTSSSSSNSSKLPPVCYEIITLKTKKK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD KMAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAPNWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KMAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAPNWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD DVHFVVGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGELAEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DVHFVVGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGELAEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLETSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLETSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRETLNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRETLNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD DLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQSGVLTLNETNDIFLWYTAAKKPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQSGVLTLNETNDIFLWYTAAKKPEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QFVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QFVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD EYSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEYPVQIEPDTFYTASVILDGNELSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EYSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEYPVQIEPDTFYTASVILDGNELSY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KSD FGQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FGQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
490 500 510 520
>>CCDS13114.1 BTBD3 gene_id:22903|Hs108|chr20 (461 aa)
initn: 3086 init1: 3086 opt: 3086 Z-score: 3586.3 bits: 673.0 E(32554): 1.9e-193
Smith-Waterman score: 3086; 100.0% identity (100.0% similar) in 461 aa overlap (62-522:1-461)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD KANTSSSSSNSSKLPPVCYEIITLKTKKKKMAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNN
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KSD NLIPAPNWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFVVGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NLIPAPNWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFVVGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHA
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KSD MFYGELAEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MFYGELAEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARA
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KSD CVNFLETSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CVNFLETSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLES
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KSD ILRRETLNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ILRRETLNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFA
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KSD NGAAQSGVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NGAAQSGVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYR
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KSD GRCDSIQFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAEYSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GRCDSIQFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAEYSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTF
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PVWFEYPVQIEPDTFYTASVILDGNELSYFGQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PVWFEYPVQIEPDTFYTASVILDGNELSYFGQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQ
400 410 420 430 440 450
520
pF1KSD GGQIPELIFYA
:::::::::::
CCDS13 GGQIPELIFYA
460
>>CCDS10002.2 BTBD6 gene_id:90135|Hs108|chr14 (485 aa)
initn: 2324 init1: 2324 opt: 2324 Z-score: 2700.8 bits: 509.3 E(32554): 4.1e-144
Smith-Waterman score: 2324; 75.8% identity (89.9% similar) in 455 aa overlap (68-522:31-485)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD SSSNSSKLPPVCYEIITLKTKKKKMAADIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAP
::. :. . . .:: .:
CCDS10 MAAELYAPASAAAADLANSNAGAAVGRKAGPRSPPSAPAPAPPPPAPAPPTLGNNHQESP
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KSD NWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFVVGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGEL
.:. ::.:::::.::::.:::::::::::::.:. .:.::::::::::::.:::::.:
CCDS10 GWRCCRPTLRERNALMFNNELMADVHFVVGPPGATRTVPAHKYVLAVGSSVFYAMFYGDL
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KSD AEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLE
:: :.::.:::::::::: .:::.: ::::: ::::::::::::::::: ::.:::::::
CCDS10 AEVKSEIHIPDVEPAAFLILLKYMYSDEIDLEADTVLATLYAAKKYIVPALAKACVNFLE
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KSD TSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRET
::: ::::::::::: :::::.::::::::::::::.::.:::::.:: :::: :. ::.
CCDS10 TSLEAKNACVLLSQSRLFEEPELTQRCWEVIDAQAEMALRSEGFCEIDRQTLEIIVTREA
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQS
::.:: :::::.:::::.::.:: : .. .:::.:::.::::.:::::.:..::::::::
CCDS10 LNTKEAVVFEAVLNWAEAECKRQGLPITPRNKRHVLGRALYLVRIPTMTLEEFANGAAQS
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KSD GVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSKARKGLVPQRCHRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSI
.:::.::..:::::::..::.:.: ::::.::::::::: ::::::::::::::::
CCDS10 DILTLEETHSIFLWYTATNKPRLDFPLTKRKGLAPQRCHRFQSSAYRSNQWRYRGRCDSI
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KSD QFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAEYSAKIELKRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEY
:::::.::::::.:::::: :.::::.:::::: ::::.:::.:..:::::::::::::.
CCDS10 QFAVDRRVFIAGLGLYGSSSGKAEYSVKIELKRLGVVLAQNLTKFMSDGSSNTFPVWFEH
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PVQIEPDTFYTASVILDGNELSYFGQEGMTEVQCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
:::.: :::::::..:::.::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::
CCDS10 PVQVEQDTFYTASAVLDGSELSYFGQEGMTEVQCGKVAFQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPE
430 440 450 460 470 480
520
pF1KSD LIFYA
:::::
CCDS10 LIFYA
>>CCDS12078.1 BTBD2 gene_id:55643|Hs108|chr19 (525 aa)
initn: 1266 init1: 957 opt: 1303 Z-score: 1514.1 bits: 289.8 E(32554): 5.1e-78
Smith-Waterman score: 1303; 46.8% identity (75.9% similar) in 436 aa overlap (96-521:93-524)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAPNWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHFV
: :::. ::..:: :..:::... ::::.
CCDS12 PGPGTDAQAAGAERAEEAAGPGAAALQREAAYNWQASKPTVQERFAFLFNNEVLCDVHFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VGPPGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGELAEDKDEIRIPDVEPAAFLAMLKYIYCDE
:: ..::.:.:..::::::.:: ::: : .: . ::..::::::::::.::..: ::
CCDS12 VGKGLSSQRIPAHRFVLAVGSAVFDAMFNGGMATTSTEIELPDVEPAAFLALLKFLYSDE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD IDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLETSLSAKNACVLLSQSCLFEEPDLTQRCW
.... .::..:::.:::: :: : ::.::. .: : :: .::.:. ::.::.:.. :
CCDS12 VQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLKKNLRADNAFMLLTQARLFDEPQLASLCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD EVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRETLNAKEIVVFEAALNWAEVECQRQDLALS
: :: .. :. .::: :::..:: ..:.:.::. .:. .:.:.. :.:.:::::.: ..
CCDS12 ENIDKNTADAITAEGFTDIDLDTLVAVLERDTLGIREVRLFNAVVRWSEAECQRQQLQVT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD IENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQSGVLTLNETNDIFLWYTAAKKPELQFVSK
::.:::::::: :::.: :....:: : ::::.:. :. ..:: .:. ::...:...
CCDS12 PENRRKVLGKALGLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILVDREVVSLFLHFTVNPKPRVEFIDR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ARKGLVPQRC--HRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDKRVFIAGFGLYGSSCGSAEYS
: : ..: .:::. : : : : : :.:.:.::.:..::::::: : ..:.
CCDS12 PRCCLRGKECSINRFQQVESR---WGYSGTSDRIRFSVNKRIFVVGFGLYGSIHGPTDYQ
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KSD AKIELKR--QGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEYPVQIEPDTFYTASVILDGNELSYF
..:.. . ...::::: . . :::..:: : :. ::.. :.. ::: . : : . :..
CCDS12 VNIQIIHTDSNTVLGQNDTGFSCDGSASTFRVMFKEPVEVLPNVNYTACATLKGPD-SHY
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520
pF1KSD GQEGMTEVQ-----CG-KVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
: .:. .: : :. : .. ..:::.:. :::::.:::
CCDS12 GTKGLRKVTHESPTTGAKTCFTFCYAAGNNNGTSVEDGQIPEVIFYT
480 490 500 510 520
>>CCDS10322.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 (482 aa)
initn: 1228 init1: 814 opt: 1244 Z-score: 1446.2 bits: 277.1 E(32554): 3.1e-74
Smith-Waterman score: 1244; 44.6% identity (73.6% similar) in 444 aa overlap (95-521:44-481)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAPNWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHF
: :::. ...:: :..::..:..::.:
CCDS10 SGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRF
20 30 40 50 60 70
130 140 150 160 170
pF1KSD VVGP------PGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGELAEDKDEIRIPDVEPAAFLAML
:.: :: ::.:.:..:::.::.:: ::: : .: . ::..::::::::::.:
CCDS10 VLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALL
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLETSLSAKNACVLLSQSCLFEEP
...: ::.... .::..:::.:::: :: : ::.:: : : :: .::.:. ::.::
CCDS10 RFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEP
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KSD DLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRETLNAKEIVVFEAALNWAEVECQ
.:.. : ..:: .. :...::: :::..:: ..:.:.::. .: .: :.. :::.:::
CCDS10 QLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQ
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KSD RQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQSGVLTLNETNDIFLWYTAAKKP
::.: ... ::.::::::: :::.: :....:: : ::::.:. :. ..:: .:. ::
CCDS10 RQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKP
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KSD ELQFVSKARKGLVPQRC--HRFQSCAYRSNQWRYRGRCDSIQFAVDKRVFIAGFGLYGSS
....... : : ..: .:::. : : : : : :.:.:..:. :.:::::::
CCDS10 RVEYIDRPRCCLRGKECCINRFQQVESR---WGYSGTSDRIRFTVNRRISIVGFGLYGSI
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KSD CGSAEYSAKIEL----KRQGVVLGQNLSKYFSDGSSNTFPVWFEYPVQIEPDTFYTASVI
: ..:...:.. :.: .:::: . . ::..::: : :. :..: :.. ::: .
CCDS10 HGPTDYQVNIQIIEYEKKQ--TLGQNDTGFSCDGTANTFRVMFKEPIEILPNVCYTACAT
380 390 400 410 420
480 490 500 510 520
pF1KSD LDGNELSYFGQEGMTEV-----QCGKVTVQFQCSSDSTNGTGVQGGQIPELIFYA
: : . :..: .:. .: .:.. : : ..:::... :::::.:::
CCDS10 LKGPD-SHYGTKGLKKVVHETPAASKTVFFFFSSPGNNNGTSIEDGQIPEIIFYT
430 440 450 460 470 480
>>CCDS32313.1 BTBD1 gene_id:53339|Hs108|chr15 (385 aa)
initn: 902 init1: 805 opt: 940 Z-score: 1094.5 bits: 211.7 E(32554): 1.2e-54
Smith-Waterman score: 940; 46.5% identity (75.3% similar) in 312 aa overlap (95-398:44-352)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD DIFPRKKPANSSSTSVQQYHQQNLSNNNLIPAPNWQGLYPTIRERNAMMFNNDLMADVHF
: :::. ...:: :..::..:..::.:
CCDS32 SGAEAEPGPAGPPPPPSPSSLGPLLPLQREPLYNWQATKASLKERFAFLFNSELLSDVRF
20 30 40 50 60 70
130 140 150 160 170
pF1KSD VVGP------PGGTQRLPGHKYVLAVGSSVFHAMFYGELAEDKDEIRIPDVEPAAFLAML
:.: :: ::.:.:..:::.::.:: ::: : .: . ::..::::::::::.:
CCDS32 VLGKGRGAAAAGGPQRIPAHRFVLAAGSAVFDAMFNGGMATTSAEIELPDVEPAAFLALL
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KYIYCDEIDLAADTVLATLYAAKKYIVPHLARACVNFLETSLSAKNACVLLSQSCLFEEP
...: ::.... .::..:::.:::: :: : ::.:: : : :: .::.:. ::.::
CCDS32 RFLYSDEVQIGPETVMTTLYTAKKYAVPALEAHCVEFLTKHLRADNAFMLLTQARLFDEP
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KSD DLTQRCWEVIDAQAELALKSEGFCDIDFQTLESILRRETLNAKEIVVFEAALNWAEVECQ
.:.. : ..:: .. :...::: :::..:: ..:.:.::. .: .: :.. :::.:::
CCDS32 QLASLCLDTIDKSTMDAISAEGFTDIDIDTLCAVLERDTLSIRESRLFGAVVRWAEAECQ
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KSD RQDLALSIENKRKVLGKALYLIRIPTMALDDFANGAAQSGVLTLNETNDIFLWYTAAKKP
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CCDS32 RQQLPVTFGNKQKVLGKALSLIRFPLMTIEEFAAGPAQSGILSDREVVNLFLHFTVNPKP
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380
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]