FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0932, 1015 aa
1>>>pF1KSDA0932 1015 - 1015 aa - 1015 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6726+/-0.00113; mu= 14.3364+/- 0.067
mean_var=112.6074+/-22.173, 0's: 0 Z-trim(105.4): 167 B-trim: 6 in 1/49
Lambda= 0.120862
statistics sampled from 8238 (8428) to 8238 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 4.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015) 7129 1255.3 0
CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013) 5347 944.5 0
CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 986) 5232 924.5 0
CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 730) 3637 646.3 6.8e-185
CCDS56342.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 ( 392) 1817 328.8 1.4e-89
CCDS8421.1 MFRP gene_id:83552|Hs108|chr11 ( 579) 545 107.1 1.1e-22
CCDS5700.1 PCOLCE gene_id:5118|Hs108|chr7 ( 449) 479 95.5 2.7e-19
CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10 (3623) 485 97.1 6.9e-19
CCDS33249.1 ASTL gene_id:431705|Hs108|chr2 ( 431) 455 91.3 4.7e-18
CCDS33909.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3 ( 380) 441 88.8 2.3e-17
CCDS77173.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 ( 700) 444 89.5 2.6e-17
CCDS45846.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 ( 701) 444 89.5 2.6e-17
CCDS33907.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3 ( 699) 441 89.0 3.7e-17
CCDS33908.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3 ( 728) 441 89.0 3.9e-17
CCDS31735.1 C1S gene_id:716|Hs108|chr12 ( 688) 413 84.1 1.1e-15
CCDS46499.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 555) 385 79.2 2.7e-14
CCDS46498.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 901) 385 79.3 4e-14
CCDS2365.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 906) 385 79.3 4e-14
CCDS46497.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 909) 385 79.3 4e-14
CCDS46496.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 926) 385 79.3 4.1e-14
CCDS2364.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 931) 385 79.3 4.1e-14
CCDS4918.1 MEP1A gene_id:4224|Hs108|chr6 ( 746) 369 76.5 2.4e-13
CCDS31179.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 609) 365 75.7 3.3e-13
CCDS31180.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 644) 365 75.7 3.4e-13
CCDS81448.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 906) 365 75.8 4.5e-13
CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 923) 365 75.8 4.6e-13
CCDS123.1 MASP2 gene_id:10747|Hs108|chr1 ( 686) 350 73.1 2.2e-12
CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8 (3564) 354 74.3 5.1e-12
CCDS81658.1 C1R gene_id:715|Hs108|chr12 ( 705) 340 71.4 7.6e-12
CCDS588.2 CDCP2 gene_id:200008|Hs108|chr1 ( 449) 332 69.9 1.4e-11
CCDS380.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3487) 338 71.5 3.5e-11
CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3631) 338 71.5 3.6e-11
CCDS44492.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (2403) 327 69.5 9.8e-11
CCDS44490.1 DMBT1 gene_id:1755|Hs108|chr10 (2413) 327 69.5 9.8e-11
>>CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015 aa)
initn: 7129 init1: 7129 opt: 7129 Z-score: 6721.6 bits: 1255.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7129; 99.9% identity (99.9% similar) in 1015 aa overlap (1-1015:1-1015)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPRATALGALVSLLLLLPLPRGAGGLGERPDATADYSELDGEEGTEQQLEHYHDPCKAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MPRATALGALVSLLLLLPLPRGAGGLGERPDATADYSELDGEEGTEQQLEHYHDPCKAAV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FWGDIALDEDDLKLFHIDKARDWTKQTVGATGHSTGGLEEQASESSPDTTAMDTGTKEAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FWGDIALDEDDLKLFHIDKARDWTKQTVGATGHSTGGLEEQASESSPDTTAMDTGTKEAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KDGRENTTLLHSPGTLHAAAKTFSPRVRRATTSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KDGRENTTLLHSPGTLHAAAKTFSPRVRRATTSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KQAMRHWEKHTCVTFIERTDEESFIVFSYRTCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KQAMRHWEKHTCVTFIERTDEESFIVFSYRTCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AHELGHVVGFWHEHTRPDRDQHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEAGEVSSLGETYDFDSIMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 AHELGHVVGFWHEHTRPDRDQHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEAGEVSSLGETYDFDSIMH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YARNTFSRGVFLDTILPRQDDNGVRPTIGQRVRLSQGDIAQARKLYKCPACGETLQDTTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YARNTFSRGVFLDTILPRQDDNGVRPTIGQRVRLSQGDIAQARKLYKCPACGETLQDTTG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NFSAPGFPNGYPSYSHCVWRISVTPGEKIVLNFTSMDLFKSRLCWYDYVEVRDGYWRKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 NFSAPGFPNGYPSYSHCVWRISVTPGEKIVLNFTSMDLFKSRLCWYDYVEVRDGYWRKAP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LLGRFCGDKIPEPLVSTDSRLWVEFRSSSNILGKGFFAAYEATCGGDMNKDAGQIQSPNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 LLGRFCGDKIPEPLVSTDSRLWVEFRSSSNILGKGFFAAYEATCGGDMNKDAGQIQSPNY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PDDYRPSKECVWRIMVSEGFHVGLTFQAFEIERHDSCAYDYLEVRDGPTEESALIGHFCG
:::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 PDDYRPSKECVWRITVSEGFHVGLTFQAFEIERHDSCAYDYLEVRDGPTEESALIGHFCG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD YEKPEDVKSSSNRLWMKFVSDGSINKAGFAANFFKEVDECSWPDHGGCEHRCVNTLGSYK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YEKPEDVKSSSNRLWMKFVSDGSINKAGFAANFFKEVDECSWPDHGGCEHRCVNTLGSYK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD CACDPGYELAADKKMCEVACGGFITKLNGTITSPGWPKEYPTNKNCVWQVVAPAQYRISL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 CACDPGYELAADKKMCEVACGGFITKLNGTITSPGWPKEYPTNKNCVWQVVAPAQYRISL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD QFEVFELEGNDVCKYDFVEVRSGLSPDAKLHGRFCGSETPEVITSQSNNMRVEFKSDNTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QFEVFELEGNDVCKYDFVEVRSGLSPDAKLHGRFCGSETPEVITSQSNNMRVEFKSDNTV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SKRGFRAHFFSDKDECAKDNGGCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHDCKEAGCAHKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SKRGFRAHFFSDKDECAKDNGGCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHDCKEAGCAHKI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SSVEGTLASPNWPDKYPSRRECTWNISSTAGHRVKLTFNEFEIEQHQECAYDHLEMYDGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SSVEGTLASPNWPDKYPSRRECTWNISSTAGHRVKLTFNEFEIEQHQECAYDHLEMYDGP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD DSLAPILGRFCGSKKPDPTVASGSSMFLRFYSDASVQRKGFQAVHSTECGGRLKAEVQTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 DSLAPILGRFCGSKKPDPTVASGSSMFLRFYSDASVQRKGFQAVHSTECGGRLKAEVQTK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ELYSHAQFGDNNYPSEARCDWVIVAEDGYGVELTFRTFEVEEEADCGYDYMEAYDGYDSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ELYSHAQFGDNNYPSEARCDWVIVAEDGYGVELTFRTFEVEEEADCGYDYMEAYDGYDSS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010
pF1KSD APRLGRFCGSGPLEEIYSAGDSLMIRFRTDDTINKKGFHARYTSTKFQDALHMKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 APRLGRFCGSGPLEEIYSAGDSLMIRFRTDDTINKKGFHARYTSTKFQDALHMKK
970 980 990 1000 1010
>>CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013 aa)
initn: 5333 init1: 5333 opt: 5347 Z-score: 5042.3 bits: 944.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5347; 72.3% identity (88.7% similar) in 1012 aa overlap (7-1015:3-1013)
10 20 30 40 50
pF1KSD MPRATALGALVSLLLLLPLPRGAGGLGER-PDATADYS-ELDGEEGTEQQLEHYHDPCKA
::.: .:. . : :: : ::. .::.: . . :.:::::
CCDS38 MGLGTLSPRMLVWLVASGIVFYGELWVCAGLDYDYTFDGNEEDKTETIDYKDPCKA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD AVFWGDIALDEDDLKLFHIDKARDWTKQTVGATGHSTGGLEEQA-SESSPDTTAMDTGTK
::::::::::..::..:.::.. : :.. : ::.:::: ..: :.. . .
CCDS38 AVFWGDIALDDEDLNIFQIDRTIDLTQNPFGNLGHTTGGLGDHAMSKKRGALYQLIDRIR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD EAGKDGRENTTLLHSPGTLHAAAKTFSPRVRRATTSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQR
. : : :... ... :. .... . :: ::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS38 RIGF-GLEQNNTVKGKVPLQFSGQNEKNRVPRAATSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AIFKQAMRHWEKHTCVTFIERTDEESFIVFSYRTCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKF
:.:::::::::::::::::::.::::.:::.:: :::::::::::.::::::::::::::
CCDS38 AMFKQAMRHWEKHTCVTFIERSDEESYIVFTYRPCGCCSYVGRRGNGPQAISIGKNCDKF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GIVAHELGHVVGFWHEHTRPDRDQHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEAGEVSSLGETYDFDS
:::.::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::: :::.:::: :::::
CCDS38 GIVVHELGHVIGFWHEHTRPDRDNHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEPGEVNSLGERYDFDS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IMHYARNTFSRGVFLDTILPRQDDNGVRPTIGQRVRLSQGDIAQARKLYKCPACGETLQD
::::::::::::.::::::: .::::.::.::::.:::.::::::::::.:::::::::.
CCDS38 IMHYARNTFSRGMFLDTILPSRDDNGIRPAIGQRTRLSKGDIAQARKLYRCPACGETLQE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD TTGNFSAPGFPNGYPSYSHCVWRISVTPGEKIVLNFTSMDLFKSRLCWYDYVEVRDGYWR
..::.:.::::::::::.::.::.:::::::::::::.:::.:: ::::::.::::::::
CCDS38 SNGNLSSPGFPNGYPSYTHCIWRVSVTPGEKIVLNFTTMDLYKSSLCWYDYIEVRDGYWR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD KAPLLGRFCGDKIPEPLVSTDSRLWVEFRSSSNILGKGFFAAYEATCGGDMNKDAGQIQS
:.::::::::::.:: :.:::::.:.::::::: .:::: :.::: :::.. :. :::::
CCDS38 KSPLLGRFCGDKLPEVLTSTDSRMWIEFRSSSNWVGKGFAAVYEAICGGEIRKNEGQIQS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD PNYPDDYRPSKECVWRIMVSEGFHVGLTFQAFEIERHDSCAYDYLEVRDGPTEESALIGH
::::::::: :::::.: :::..:::::::.:::::::.::::::::::: .:.: :::.
CCDS38 PNYPDDYRPMKECVWKITVSESYHVGLTFQSFEIERHDNCAYDYLEVRDGTSENSPLIGR
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD FCGYEKPEDVKSSSNRLWMKFVSDGSINKAGFAANFFKEVDECSWPDHGGCEHRCVNTLG
::::.::::..:.:: :::::::::..:::::::::::: :::. ::.::::.::.::::
CCDS38 FCGYDKPEDIRSTSNTLWMKFVSDGTVNKAGFAANFFKEEDECAKPDRGGCEQRCLNTLG
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD SYKCACDPGYELAADKKMCEVACGGFITKLNGTITSPGWPKEYPTNKNCVWQVVAPAQYR
::.:::.:::::. :.. ::.::::..::::::::.:::::::: :::::::::::.:::
CCDS38 SYQCACEPGYELGPDRRSCEAACGGLLTKLNGTITTPGWPKEYPPNKNCVWQVVAPTQYR
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ISLQFEVFELEGNDVCKYDFVEVRSGLSPDAKLHGRFCGSETPEVITSQSNNMRVEFKSD
::..:: ::::::.:::::.::. :::: ..::::.:::.:.::::::: ::::.:::::
CCDS38 ISVKFEFFELEGNEVCKYDYVEIWSGLSSESKLHGKFCGAEVPEVITSQFNNMRIEFKSD
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KSD NTVSKRGFRAHFFSDKDECAKDNGGCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHDCKEAGCA
:::::.::.::::::::::.:::::::::::::.:::.:.::::. ::.: :::::: :
CCDS38 NTVSKKGFKAHFFSDKDECSKDNGGCQHECVNTMGSYMCQCRNGFVLHDNKHDCKEAECE
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD HKISSVEGTLASPNWPDKYPSRRECTWNISSTAGHRVKLTFNEFEIEQHQECAYDHLEMY
.:: : : ..:::::::::::.::::.::.: :::.::.:.::::::::::::::::..
CCDS38 QKIHSPSGLITSPNWPDKYPSRKECTWEISATPGHRIKLAFSEFEIEQHQECAYDHLEVF
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KSD DGPDSLAPILGRFCGSKKPDPTVASGSSMFLRFYSDASVQRKGFQAVHSTECGGRLKAEV
:: .:::::.::.: ::: ::.:..::.:: ::::::::::::.::::::::::::
CCDS38 DGETEKSPILGRLCGNKIPDPLVATGNKMFVRFVSDASVQRKGFQATHSTECGGRLKAES
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KSD QTKELYSHAQFGDNNYPSEARCDWVIVAEDGYGVELTFRTFEVEEEADCGYDYMEAYDGY
. ..:::::::::::::... :.:..:.: : .::.:.::::::::::::::.: .::
CCDS38 KPRDLYSHAQFGDNNYPGQVDCEWLLVSERGSRLELSFQTFEVEEEADCGYDYVELFDGL
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD DSSAPRLGRFCGSGPLEEIYSAGDSLMIRFRTDDTINKKGFHARYTSTKFQDALHMKK
::.: ::::::::: ::::: :::..:.:.::::::::::: :: : .. :. : ::
CCDS38 DSTAVGLGRFCGSGPPEEIYSIGDSVLIHFHTDDTINKKGFHIRYKSIRYPDTTHTKK
960 970 980 990 1000 1010
>>CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 (986 aa)
initn: 6470 init1: 5227 opt: 5232 Z-score: 4934.1 bits: 924.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5384; 73.5% identity (88.4% similar) in 1015 aa overlap (1-1015:1-986)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPRATALGALVSLLLLLPLPRGAGGLGERPDATADYSELDGEEGTEQQLEHYHDPCKAAV
:: .. : :..:::: :: . :: :::. .:: . : .:.::::::.
CCDS60 MPGVARLPLLLGLLLL---PRPG-----RPLDLADYTYDLAEEDDSEPL-NYKDPCKAAA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FWGDIALDEDDLKLFHIDKARDWTKQTVGATGHSTGGLEEQASESSPDTTAMDTGTKEAG
: :::::::.::. :....: : ..: . .:. .. :.:. . . : . :
CCDS60 FLGDIALDEEDLRAFQVQQAVDLRRHT---ARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTN-GQPQRG
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KDGRENTTLLHSPGTLHAAAKTFSPRVRRATTSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAIF
:: : : :::.::: ::.:: ::::.::::::::::::.:
CCDS60 ACGRWR-------GR---------SRSRRAATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVF
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KQAMRHWEKHTCVTFIERTDEESFIVFSYRTCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIV
.::::::::::::::.:::::.:.:::.:: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTYRPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AHELGHVVGFWHEHTRPDRDQHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEAGEVSSLGETYDFDSIMH
.:::::::::::::::::::.::.:.:::::::::::::::: :: :::::::::::::
CCDS60 VHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVRENIQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMH
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YARNTFSRGVFLDTILPRQDDNGVRPTIGQRVRLSQGDIAQARKLYKCPACGETLQDTTG
:::::::::.:::::.:. . :::.: ::::.:::.:::::::::::::::::::::.::
CCDS60 YARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTG
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NFSAPGFPNGYPSYSHCVWRISVTPGEKIVLNFTSMDLFKSRLCWYDYVEVRDGYWRKAP
:::.: .:::: .. ::::::::::::::.:::::.::..::::::::::::::.:::::
CCDS60 NFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAP
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LLGRFCGDKIPEPLVSTDSRLWVEFRSSSNILGKGFFAAYEATCGGDMNKDAGQIQSPNY
: :::::.:.:::.:::::::::::::::: .::::::.::: ::::..:: :.::::::
CCDS60 LRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNY
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PDDYRPSKECVWRIMVSEGFHVGLTFQAFEIERHDSCAYDYLEVRDGPTEESALIGHFCG
:::::::: :.:::.::::::::::::.::::::::::::::::::: .: :.:::..::
CCDS60 PDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCG
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD YEKPEDVKSSSNRLWMKFVSDGSINKAGFAANFFKEVDECSWPDHGGCEHRCVNTLGSYK
::::.:.::.:.:::.::::::::::::::.:::::::::: :..::::.::.:::::::
CCDS60 YEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYK
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD CACDPGYELAADKKMCEVACGGFITKLNGTITSPGWPKEYPTNKNCVWQVVAPAQYRISL
:.:::::::: ::. ::.:::::.:::::.::::::::::: ::::.::.:::.::::::
CCDS60 CSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNGSITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISL
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KSD QFEVFELEGNDVCKYDFVEVRSGLSPDAKLHGRFCGSETPEVITSQSNNMRVEFKSDNTV
::. :: :::::::::::::::::. :.::::.::::: ::::::: :::::::::::::
CCDS60 QFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSKLHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTV
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SKRGFRAHFFSDKDECAKDNGGCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHDCKEAGCAHKI
::.::.::::::::::.:::::::..:::::::: :.::.:. ::.: :::::::: ::.
CCDS60 SKKGFKAHFFSDKDECSKDNGGCQQDCVNTFGSYECQCRSGFVLHDNKHDCKEAGCDHKV
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SSVEGTLASPNWPDKYPSRRECTWNISSTAGHRVKLTFNEFEIEQHQECAYDHLEMYDGP
.:. ::..::::::::::..:::: :::: :::::::: :..::.. ::::::::..::
CCDS60 TSTSGTITSPNWPDKYPSKKECTWAISSTPGHRVKLTFMEMDIESQPECAYDHLEVFDGR
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890 900
pF1KSD DSLAPILGRFCGSKKPDPTVASGSSMFLRFYSDASVQRKGFQAVHSTECGGRLKAEVQTK
:. ::.::::::::::.:..:.:: :::::::: ::::::::: :.:::::...:.:.::
CCDS60 DAKAPVLGRFCGSKKPEPVLATGSRMFLRFYSDNSVQRKGFQASHATECGGQVRADVKTK
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ELYSHAQFGDNNYPSEARCDWVIVAEDGYGVELTFRTFEVEEEADCGYDYMEAYDGYDSS
.:::::::::::::. . :.::::::.::::::.:.:::::::.:::::::: .:::::.
CCDS60 DLYSHAQFGDNNYPGGVDCEWVIVAEEGYGVELVFQTFEVEEETDCGYDYMELFDGYDST
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010
pF1KSD APRLGRFCGSGPLEEIYSAGDSLMIRFRTDDTINKKGFHARYTSTKFQDALHMKK
::::::.::::: ::.::::::....:..::::.::::: :::::::::.:: .:
CCDS60 APRLGRYCGSGPPEEVYSAGDSVLVKFHSDDTITKKGFHLRYTSTKFQDTLHSRK
940 950 960 970 980
>>CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 (730 aa)
initn: 4554 init1: 3627 opt: 3637 Z-score: 3432.9 bits: 646.3 E(32554): 6.8e-185
Smith-Waterman score: 3789; 72.0% identity (85.5% similar) in 746 aa overlap (1-746:1-717)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MPRATALGALVSLLLLLPLPRGAGGLGERPDATADYSELDGEEGTEQQLEHYHDPCKAAV
:: .. : :..:::: :: . :: :::. .:: . : .:.::::::.
CCDS34 MPGVARLPLLLGLLLL---PRPG-----RPLDLADYTYDLAEEDDSEPL-NYKDPCKAAA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FWGDIALDEDDLKLFHIDKARDWTKQTVGATGHSTGGLEEQASESSPDTTAMDTGTKEAG
: :::::::.::. :....: : ..: . .:. .. :.:. . . : . :
CCDS34 FLGDIALDEEDLRAFQVQQAVDLRRHT---ARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTN-GQPQRG
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD KDGRENTTLLHSPGTLHAAAKTFSPRVRRATTSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAIF
:: : :::.::: ::.:: ::::.::::::::::::.:
CCDS34 ACGRWRGR----------------SRSRRAATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVF
110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KSD KQAMRHWEKHTCVTFIERTDEESFIVFSYRTCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIV
.::::::::::::::.:::::.:.:::.:: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTYRPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIV
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KSD AHELGHVVGFWHEHTRPDRDQHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEAGEVSSLGETYDFDSIMH
.:::::::::::::::::::.::.:.:::::::::::::::: :: :::::::::::::
CCDS34 VHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVRENIQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMH
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KSD YARNTFSRGVFLDTILPRQDDNGVRPTIGQRVRLSQGDIAQARKLYKCPACGETLQDTTG
:::::::::.:::::.:. . :::.: ::::.:::.:::::::::::::::::::::.::
CCDS34 YARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTG
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KSD NFSAPGFPNGYPSYSHCVWRISVTPGEKIVLNFTSMDLFKSRLCWYDYVEVRDGYWRKAP
:::.: .:::: .. ::::::::::::::.:::::.::..::::::::::::::.:::::
CCDS34 NFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAP
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LLGRFCGDKIPEPLVSTDSRLWVEFRSSSNILGKGFFAAYEATCGGDMNKDAGQIQSPNY
: :::::.:.:::.:::::::::::::::: .::::::.::: ::::..:: :.::::::
CCDS34 LRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNY
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PDDYRPSKECVWRIMVSEGFHVGLTFQAFEIERHDSCAYDYLEVRDGPTEESALIGHFCG
:::::::: :.:::.::::::::::::.::::::::::::::::::: .: :.:::..::
CCDS34 PDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCG
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KSD YEKPEDVKSSSNRLWMKFVSDGSINKAGFAANFFKEVDECSWPDHGGCEHRCVNTLGSYK
::::.:.::.:.:::.::::::::::::::.:::::::::: :..::::.::.:::::::
CCDS34 YEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYK
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KSD CACDPGYELAADKKMCEVACGGFITKLNGTITSPGWPKEYPTNKNCVWQVVAPAQYRISL
:.:::::::: ::. ::.:::::.:::::.::::::::::: ::::.::.:::.::::::
CCDS34 CSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNGSITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISL
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KSD QFEVFELEGNDVCKYDFVEVRSGLSPDAKLHGRFCGSETPEVITSQSNNMRVEFKSDNTV
::. :: :::::::::::::::::. :.::::.::::: ::::::: :::::::::::::
CCDS34 QFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSKLHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTV
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SKRGFRAHFFSDKDECAKDNGGCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHDCKEAGCAHKI
::.::.:::::.: . : :.
CCDS34 SKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKFRVQKRNRTPQ
700 710 720 730
>>CCDS56342.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (392 aa)
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Smith-Waterman score: 1817; 67.4% identity (84.9% similar) in 390 aa overlap (7-393:3-391)
10 20 30 40 50
pF1KSD MPRATALGALVSLLLLLPLPRGAGGLGER-PDATADYS-ELDGEEGTEQQLEHYHDPCKA
::.: .:. . : :: : ::. .::.: . . :.:::::
CCDS56 MGLGTLSPRMLVWLVASGIVFYGELWVCAGLDYDYTFDGNEEDKTETIDYKDPCKA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD AVFWGDIALDEDDLKLFHIDKARDWTKQTVGATGHSTGGLEEQA-SESSPDTTAMDTGTK
::::::::::..::..:.::.. : :.. : ::.:::: ..: :.. . .
CCDS56 AVFWGDIALDDEDLNIFQIDRTIDLTQNPFGNLGHTTGGLGDHAMSKKRGALYQLIDRIR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD EAGKDGRENTTLLHSPGTLHAAAKTFSPRVRRATTSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQR
. : : :... ... :. .... . :: ::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RIGF-GLEQNNTVKGKVPLQFSGQNEKNRVPRAATSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD AIFKQAMRHWEKHTCVTFIERTDEESFIVFSYRTCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKF
:.:::::::::::::::::::.::::.:::.:: :::::::::::.::::::::::::::
CCDS56 AMFKQAMRHWEKHTCVTFIERSDEESYIVFTYRPCGCCSYVGRRGNGPQAISIGKNCDKF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD GIVAHELGHVVGFWHEHTRPDRDQHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEAGEVSSLGETYDFDS
:::.::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::: :::.:::: :::::
CCDS56 GIVVHELGHVIGFWHEHTRPDRDNHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEPGEVNSLGERYDFDS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD IMHYARNTFSRGVFLDTILPRQDDNGVRPTIGQRVRLSQGDIAQARKLYKCPACGETLQD
::::::::::::.::::::: .::::.::.::::.:::.::::::::::.:::::::::.
CCDS56 IMHYARNTFSRGMFLDTILPSRDDNGIRPAIGQRTRLSKGDIAQARKLYRCPACGETLQE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD TTGNFSAPGFPNGYPSYSHCVWRISVTPGEKIVLNFTSMDLFKSRLCWYDYVEVRDGYWR
..::.:.::::::::::.::.::.:::::::.:...
CCDS56 SNGNLSSPGFPNGYPSYTHCIWRVSVTPGEKVVFSLC
360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD KAPLLGRFCGDKIPEPLVSTDSRLWVEFRSSSNILGKGFFAAYEATCGGDMNKDAGQIQS
>>CCDS8421.1 MFRP gene_id:83552|Hs108|chr11 (579 aa)
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Smith-Waterman score: 611; 32.7% identity (60.7% similar) in 333 aa overlap (455-773:135-448)
430 440 450 460 470 480
pF1KSD FCGDKIPEPLVSTDSRLWVEFRSSSNILGKGFFAAYEATCGGDMNKDAGQIQSPNYPDDY
: . ..:::: .. : ..:::::: :
CCDS84 LPAGGLTTTTTTPTITTSQAAGTPKGQQESGVSPSPQSTCGGLLSGPRGFFSSPNYPDPY
110 120 130 140 150 160
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RPSKECVWRIMVSEGFHVGLTFQAFEIERHDSCAYDYLEVRDGPTEESALIGHFCGYEKP
:. .:::.:.:. . : ..:. :: :: .: ::. .: :. :. . :: :
CCDS84 PPNTHCVWHIQVATDHAIQLKIEALSIESVASCLFDRLEL--SPEPEGPLL-RVCGRVPP
170 180 190 200 210 220
550 560 570 580 590 600
pF1KSD EDVKSSSNRLWMKFVSDGSINKAGFAANFFKEVDECSWPDHGGCEH---RCVNTLGSYK-
.......: . ::::.:.. :: : . . : .:.: : :: . .
CCDS84 PTLNTNASHLLVVFVSDSSVEGFGFHAWY-----QAMAPGRGSCAHDEFRCDQLICLLPD
230 240 250 260 270
610 620 630 640 650
pF1KSD CACDPGYELAAD---KKMCEV---ACGGFITKLNGTITSPGWPKEYPTNKNCVWQVVAPA
.:: :. :: . : . .::: .: :.::...:.. ..:: . :.:.. .::
CCDS84 SVCD-GFANCADGSDETNCSAKFSGCGGNLTGLQGTFSTPSYLQQYPHQLLCTWHISVPA
280 290 300 310 320 330
660 670 680 690 700 710
pF1KSD QYRISLQFEVFELEGNDVCKYDFVEVRSGLSPDA-KLHGRFCGSETPEVITSQSNNMRVE
. : :::. : ::..: ::.:.::: : : .: :::::.: : ..:. ... :
CCDS84 GHSIELQFHNFSLEAQDECKFDYVEVYETSSSGAFSLLGRFCGAEPPPHLVSSHHELAVL
340 350 360 370 380 390
720 730 740 750 760 770
pF1KSD FKSDNTVSKRGFRAHFFS---DKDECAKDNGGCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHD
:..:. .:. :: : ... .. :. .. .:: :. :.. :. . .:
CCDS84 FRTDHGISSGGFSATYLAFNATENPCGPSELSCQA------GG----CKGVQWMCDMWRD
400 410 420 430 440
780 790 800 810 820 830
pF1KSD CKEAGCAHKISSVEGTLASPNWPDKYPSRRECTWNISSTAGHRVKLTFNEFEIEQHQECA
: .
CCDS84 CTDGSDDNCSGPLFPPPELACEPVQVEMCLGLSYNTTAFPNIWVGMITQEEVVEVLSGYK
450 460 470 480 490 500
>>CCDS5700.1 PCOLCE gene_id:5118|Hs108|chr7 (449 aa)
initn: 391 init1: 295 opt: 479 Z-score: 460.0 bits: 95.5 E(32554): 2.7e-19
Smith-Waterman score: 562; 33.1% identity (58.7% similar) in 281 aa overlap (464-742:37-283)
440 450 460 470 480 490
pF1KSD LVSTDSRLWVEFRSSSNILGKGFFAAYEATCGGDMNKDAGQIQSPNYPDDYRPSKECVWR
::::.. ..: . : ..:. : :.:::.:
CCDS57 ASLLGPLLTACALLPFAQGQTPNYTRPVFLCGGDVKGESGYVASEGFPNLYPPNKECIWT
10 20 30 40 50 60
500 510 520 530 540 550
pF1KSD IMVSEGFHVGLTFQAFEIERHDSCAYDYLEVRDGPTEESALIGHFCGYEKPEDVKSSSNR
: : :: :.:.:..:..: : .: :: ::: : . .:.::: .: . . .:.
CCDS57 ITVPEGQTVSLSFRVFDLELHPACRYDALEVFAGSGTSGQRLGRFCGTFRPAPLVAPGNQ
70 80 90 100 110 120
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LWMKFVSDGSINKAGFAANFFKEVDECSWPDHGGCEHRCVNTLGSYKCACDPGYELAADK
. .....: . . :: . : .: ::.
CCDS57 VTLRMTTDEGTGGRGFLLWY-------SGRATSGTEHQF---------------------
130 140 150
620 630 640 650 660 670
pF1KSD KMCEVACGGFITKLNGTITSPGWPK-EYPTNKNCVWQVVAPAQYRISLQFEVFELEGNDV
::: . : .::.:.:.::. .:: . .: :...:: . :.: :: :.:: .
CCDS57 ------CGGRLEKAQGTLTTPNWPESDYPPGISCSWHIIAPPDQVIALTFEKFDLEPDTY
160 170 180 190 200 210
680 690 700 710 720 730
pF1KSD CKYDFVEVRSG-LSPDAKLHGRFCGSETPEVITSQSNNMRVEFKSDNTVSKRGFRAHFFS
:.:: : : .: .: :.. :.:::. .: :.:..:.. :.: :: .:. :: : . .
CCDS57 CRYDSVSVFNGAVSDDSRRLGKFCGDAVPGSISSEGNELLVQFVSDLSVTADGFSASYKT
220 230 240 250 260 270
740 750 760 770 780 790
pF1KSD DKDECAKDNGGCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHDCKEAGCAHKISSVEGTLASPN
::.. :
CCDS57 LPRGTAKEGQGPGPKRGTEPKVKLPPKSQPPEKTEESPSAPDAPTCPKQCRRTGTLQSNF
280 290 300 310 320 330
>>CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10 (3623 aa)
initn: 1071 init1: 327 opt: 485 Z-score: 452.5 bits: 97.1 E(32554): 6.9e-19
Smith-Waterman score: 1129; 30.3% identity (58.1% similar) in 742 aa overlap (277-1002:1551-2210)
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VVGFWHEHTRPDRDQHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEAGEVSSLGETYD-FDSIMHYARNT
:: .. .: .:: ..: : :
CCDS71 IHSPNYPSPYRSNTDCSWVIRVDRNHRVLLNFTDFDLEPQDSCIMAYDGLSSTMSRLART
1530 1540 1550 1560 1570 1580
310 320 330 340 350 360
pF1KSD FSRGVFLDTILPRQDDNGVRPTIGQRVRLSQGDIAQARKLYKCPACG-ETLQDTTGNFSA
.: . . :. .. .: : : ..: :: :. ::: . : .. . :.
CCDS71 CGREQLANPIVSSGNSLFLRFQSGPS-RQNRGFRAQFRQ-----ACGGHILTSSFDTVSS
1590 1600 1610 1620 1630
370 380 390 400 410 420
pF1KSD PGFPNGYPSYSHCVWRISVTPG-EKIVLNFTSMDLFKSRLCWYDYVEVRDGYWRKAPLLG
: :: .::. ..: : :.. : ..:.:.:: ..: .: : :.::. :: . ::: :
CCDS71 PRFPANYPNNQNCSWIIQAQPPLNHITLSFTHFELERSTTCARDFVEILDGGHEDAPLRG
1640 1650 1660 1670 1680 1690
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RFCGDKIPEPLVSTDSRLWVEFRSSSNILGKGFFAAYEAT---CGGDMNKDAGQIQSPNY
:.:: .:.:..: .: : ..: :.:.: . :: .. :. ::: . : ..::.:
CCDS71 RYCGTDMPHPITSFSSALTLRFVSDSSISAGGFHTTVTASVSACGGTFYMAEGIFNSPGY
1700 1710 1720 1730 1740 1750
490 500 510 520 530 540
pF1KSD PDDYRPSKECVWRIMVSEGFHVGLTFQAFEIERHDSCAYDYLEVRDGPTEESALIGHFCG
:: : :. :::: :. : : .. :.: .:..: ..:. :..:.:.: . . :.:..::
CCDS71 PDIYPPNVECVWNIVSSPGNRLQLSFISFQLEDSQDCSRDFVEIREG-NATGHLVGRYCG
1760 1770 1780 1790 1800 1810
550 560 570 580 590
pF1KSD YEKPEDVKS-SSNRLWMKFVSDGSINKAGFAANFFKEVDECSWPDHGGCEHRCVNTLGSY
: . .: .. ::..:.:::: . .:: :.:.: : . : .:..
CCDS71 NSFPLNYSSIVGHTLWVRFISDGSGSGTGFQATFMKIF---------GND----NIVGTH
1820 1830 1840 1850 1860
600 610 620 630 640 650
pF1KSD KCACDPGYELAADKKMCEVACGGFITKLNGTITSPGWPKEYPTNKNCVWQVVAPAQYRIS
: ..:: ::..:: :.: : : . :.. .
CCDS71 -----------------------------GKVASPFWPENYPHNSNYQWTVNVNASHVVH
1870 1880 1890
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pF1KSD LQFEVFELEGNDVCKYDFVEVRSGLSPDAKLHGRFCGSETPEVITSQSNNMRVEFKSDNT
.. ...: . : :: ... .: : :.: : .::..: : ..: .:.. .: ::..
CCDS71 GRILEMDIEEIQNCYYDKLRIYDGPSIHARLIGAYCGTQT-ESFSSTGNSLTFHFYSDSS
1900 1910 1920 1930 1940 1950
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pF1KSD VSKRGFRAHFFSDKDECAKDNGGCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHDCKEAGCAHK
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CCDS71 ISGKGFLLEWFA-VD--APDG------VLPTIAPGAC----GGFL--------------R
1960 1970 1980
780 790 800 810 820 830
pF1KSD ISSVEGTLASPNWPDKYPSRRECTWNISSTAGHRVKLTFNEFEIEQHQECAYDHLEMYDG
... : ::.:::.: .: .::: :.. . :.:.. ..::.:. :::: : . ::
CCDS71 TGDAPVFLFSPGWPDSYSNRVDCTWLIQAPDS-TVELNILSLDIESHRTCAYDSLVIRDG
1990 2000 2010 2020 2030 2040
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pF1KSD PDSLAPILGRFCGSKKPDPTVASGSSMFLRFYSDASVQRKGFQAVHSTECGGRLKAEVQT
..:: :. .:: . : : ..: ::.:: ::.:: : ::.: ::: :.:.
CCDS71 DNNLAQQLAVLCGREIPGPIRSTGEYMFIRFTSDSSVTRAGFNASFHKSCGGYLHAD---
2050 2060 2070 2080 2090
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CCDS71 RGIITSPKYPET-YPSNLNCSWHVLVQSGLTIAVHFEQPFQIPNGDSSCNQGDYLVLRNG
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CCDS71 PDICSPPLGPPGGNGHFCGSHASSTLFTSDNQMFVQFISDHSNEGQGFKIKYEAKSLACG
2160 2170 2180 2190 2200 2210
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CCDS71 GNVYIHDADSAGYVTSPNHPHNYPPHADCIWILAAPPETRIQLQFEDRFDIEVTPNCTSN
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CCDS71 GNTMKVIFFTDGSRPYGGFTASYTSSEDAVCGGSLPNTPEGNFTSPGY-DGVRNYSRNLN
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: : .: .:.. .: ..: .. : . . : .: .: : : .::. :.:: . :
CCDS71 CEWTLS-NPNQGNSSISIHFEDFYLESHQDCQFDVLEFRVGD-ADGPLMWRLCGPSKPTL
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CCDS71 PLVIPYSQVWIHFVTNERVEHIGFHAKYSFTDCGGIQIGDSGVITSPNYPNAYDSLTHCS
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CCDS71 SLLEAPQGHTITLTFSDFDIEPHTTCAWDSVTVRNGGSPESPIIGQYCGNSNPRTIQSGS
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:.: . : :: :.. .:: : .: . :::
CCDS71 NQLVVTFNSDHSLQGGGFYA---------TWNTQ---------TLG--------------
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CCDS71 --------CGGIFHSDNGTIRSPHWPQNFPENSRCSWTAITHKSKHLEISFDNNFLIPSG
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pF1KSD NDVCKYDFVEVRSGLSP-DAKLHGRFCGSETPEVITSQSNNMRVEFKSDNTVSKRGFRAH
. :. .::.: .: : : . ::. .: . . ::.. . :.:... .. :: :
CCDS71 DGQCQNSFVKVWAGTEEVDKALLATGCGNVAPGPVITPSNTFTAVFQSQEAPAQ-GFSAS
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pF1KSD FFSDKDECAKDNGGCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHDCKEAGCAHKISSVEGTLA
: : :: ... .. : .
CCDS71 FVS-------------------------RCGSNF------------------TGPSGYII
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:::.: .: . .::. : .. : ::: :..: .. :. : ... : . ..
CCDS71 SPNYPKQYDNNMNCTYVIEANPLSVVLLTFVSFHLEARSAVTGSCVNDGVHIIRGYSVMS
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pF1KSD PILGRFCGSKKPDPTVASGSSMFLRFYSDASVQRKGFQ-AVHSTECGG--RLKAEVQTKE
.. ::.. : : . .: ..: :::. .. ::. . . ::: ... . :.
CCDS71 TPFATVCGDEMPAPLTIAGP-VLLNFYSNEQITDFGFKFSYRIISCGGVFNFSSGIITSP
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CCDS71 AYSYA-----DYPNDMHCLYTITVSDDKVIELKFSDFDVVPSTSCSHDYLAIYDGANTSD
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CCDS71 PLLGKFCGSKRPPNVKSSNNSMLLVFKTDSFQTAKGWKMSFRQTLGPQQGCGGYLTGSNN
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CCDS71 TFASPDSDSNGMYDKNLNCVWIIIAPVNKVIHLTFNTFALEAASTRQRCLYDYVKLYDGD
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.:: . .:: : . :. . .:
CCDS71 KCDSGWTGVNCTENINECLSNPCLNGGTCVDGVDSFSCECTRLWTGALCQVPQ----QVC
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CCDS71 GESLSGINGSFSYRSPDVGYVHDVNCFWVIKTEMGKVLRITFTFFRLESMDNCPHEFLQV
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CCDS71 YDGDSSSAFQLGRFCGSSLPHELLSSDNALYFHLYSEHLRNGRGFTVRWETQQPECGGIL
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CCDS71 TGPYGSIKSPGYPGNYPPGRDCVWIVVTSPDLLVTFTFGTLSLEHHDDCNKDYLEIRDGP
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CCDS71 LYQDPLLGKFCTTFSVPPLQTTGPFARIHFHSDSQISDQGFHITYLTS------PS----
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CCDS71 DLRC---GGNYT---DPEGEL-------------FLPELSGPFTH---------TRQCVY
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CCDS71 MMKQPQGEQIQINFTHVELQCQSDSSQNYIEVRDGET----LLGKVCGNGTISHIKSITN
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.. ..:: : .: :
CCDS71 SVWIRFKIDASVEKASFRAVYQVACGDELTGEGVIRSPFFPNVYPGERTCRWTIHQPQSQ
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CCDS71 TLFTSDNQMFVQFISDHSNEGQGFKIKYEAKSLACGGNVYIHDADSAGYVTSPNHPHNYP
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CCDS71 PHADCIWILAAPPETRIQLQFEDRFDIEVTPNCTSNYLELRDGVDSDAPILSKFCGTSLP
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: :... : .. ..:. :... ..: :..:. :. : . ..:..:: :... .
CCDS71 CEWHLQGLSGHYLTISFEDFNLQNSSGCEKDFVEIWDNHTS-GNILGRYCGNTIPDSIDT
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::: ..::.:::.. .:: : . ..:: :: . ::
CCDS71 SSNTAVVRFVTDGSVTASGFRLRFESSMEEC-----GG------DLQGSI----------
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::.:::..:. : .. : :...:: ::.:
CCDS71 -------------------GTFTSPNYPNPNPHGRICEWRITAPEGRRITLMFNNLRLAT
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pF1KSD NDVCKYDFVEVRSGLSPDAKLHGRFCGSETPEVITSQSNNMRVEFKSDNTVSKRGFRAHF
CCDS71 HPSCNNEHVIVFNGIRSNSPQLEKLCSSVNVSNEIKSSGNTMKVIFFTDGSRPYGGFTAS
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. .:.:.:.:. . . : :..:..: : .:. ::::: : .: : .:..:: : .
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: : ::.:::..:..::.: .:...... . :...: :
CCDS71 Y-----------------TDDLGTFTSPNFPNNYPNNWECIYRITVRTGQLIAVHFTNFS
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:: . . .: ::.:.:.: . : : : ::. : .: :.::.. ..::::. .. :
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: : :: : . .::. ....
CCDS71 FSA----------------------------------YW------DGSSTGCGGNLTTSS
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CCDS71 HLLTQLCGDEKPPLIRSSGDSMFIKLRTDEGQQGRGFKAEYRQTCENVVIVN-QTYGILE
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. : : . .:.:.: : : :. :: .:..:.. .:. ::.: ::: ::
CCDS71 SIGY-PNPYSENQHCNWTIRATTGNTVNYTFLAFDLEHHINCSTDYLELYDG-----PRQ
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CCDS71 MGRYCGVDLPPPGSTTSSKLQVLLLTDGVGRREKGFQMQWFVYGCGGELSGATGSFSSPG
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CCDS71 FPNRYPPNKECIWYIRTDPGSSIQLTIHDFDVEYHSRCNFDVLEIYGGPDFHSPRIAQLC
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initn: 473 init1: 293 opt: 480 Z-score: 447.8 bits: 96.3 E(32554): 1.3e-18
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CCDS71 SMLLVFKTDSFQTAKGWKMSFRQTLGPQQGCGGYLTGSNNTFASPDSDSNGMYDKNLNCV
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CCDS71 W-IIIAPVNKVIHLTFNTFALEAASTRQRCLYDYVKLYDGDSENANLAGTFCGSTVPAPF
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.:. . : :.: :. .. .:: :.: . ::: .: .:.::: : : .
CCDS71 ISSGNFLTVQFISDLTLEREGFNATYTIMDMPCGGTYNATWTPQNISSPNSSDPDVPFSI
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:.: : .: .: :... .: :. .::...:.: .. .::: . :
CCDS71 CTWVIDSPPHQQVKITVWALQLTSQD-CTQNYLQLQDSPQGHGNSRFQFCGRNASAVPVF
3310 3320 3330 3340 3350 3360
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pF1KSD SSSNRLWMKFVSDGSINKAGFAANFFKEVDECSWPDHGGCEHRCVNTLGSYKCACDPGYE
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CCDS71 YSSMSTAMVIFKSGVVNRNS-RMSFTYQIADCNRDYH-----------------------
3370 3380 3390 3400
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pF1KSD LAADKKMCEVACGGFITKLNGTITSPGWPKEYPTNKNCVWQVVAPAQYRISLQFEVFELE
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]