Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0915
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0915, 841 aa
1>>>pF1KSDA0915 841 - 841 aa - 841 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.7273+/-0.00104; mu= -11.5146+/- 0.062
mean_var=480.2511+/-97.324, 0's: 0 Z-trim(116.3): 56 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.058525
statistics sampled from 16916 (16961) to 16916 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.799), E-opt: 0.2 (0.521), width: 16
Scan time: 5.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11139.1 ARHGEF15 gene_id:22899|Hs108|chr17 ( 841) 5756 500.9 3.7e-141
CCDS46544.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 ( 618) 979 97.5 7.6e-20
CCDS2500.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 ( 710) 979 97.5 8.4e-20
CCDS34771.1 ARHGEF5 gene_id:7984|Hs108|chr7 (1597) 951 95.5 8e-19
CCDS170.1 ARHGEF19 gene_id:128272|Hs108|chr1 ( 802) 896 90.6 1.2e-17
CCDS58858.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 ( 791) 810 83.3 1.8e-15
CCDS46938.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 ( 871) 810 83.3 1.9e-15
CCDS46.2 ARHGEF16 gene_id:27237|Hs108|chr1 ( 709) 782 80.9 8.6e-15
>>CCDS11139.1 ARHGEF15 gene_id:22899|Hs108|chr17 (841 aa)
initn: 5756 init1: 5756 opt: 5756 Z-score: 2647.8 bits: 500.9 E(32554): 3.7e-141
Smith-Waterman score: 5756; 99.9% identity (99.9% similar) in 841 aa overlap (1-841:1-841)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPRNSNDAPTPMCTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPRNSNDAPTPMCTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD IFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASPEPAPRSPVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASPEPAPRSPVPP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVRRLAGRFEGGAEGRAQDADAPEPGLQARAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVRRLAGRFEGGAEGRAQDADAPEPGLQARAD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGLEVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGLEVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD LPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD EVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD PLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDPSGPPTFRLSLLSNHQGRPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDPSGPPTFRLSLLSNHQGRPT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD HRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD AAPKHLHKTPEGWLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGPSSGTPNAPP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS11 AAPKHLHKTPEGWLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGSSSGTPNAPP
790 800 810 820 830 840
pF1KSD P
:
CCDS11 P
>>CCDS46544.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 (618 aa)
initn: 870 init1: 689 opt: 979 Z-score: 469.7 bits: 97.5 E(32554): 7.6e-20
Smith-Waterman score: 980; 32.9% identity (60.1% similar) in 601 aa overlap (246-831:20-601)
220 230 240 250 260 270
pF1KSD TTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRRASPLRTSRSRPHPPSIGH-PAVVLTSYRST-AERK
::.: . . :: :. .: .. : .
CCDS46 MELLAAAFSAACAVDHDSSTSESDARDSAAGHLPGSESSSTPGNGATPE
10 20 30 40
280 290 300 310 320 330
pF1KSD LLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPDLDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEE
: : .:: . . .. : . : : : : .: ... .: :...
CCDS46 EWPALAD-SPTTLTEALRMIHPIPADSWRNLIE---QIGLLYQEYRDKSTLQEIETRRQQ
50 60 70 80 90 100
340 350 360 370 380
pF1KSD GLEVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAVLSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPR-----P
:. . : .: : . :: :. ::. . :.:.
CCDS46 DAEIEDNTNGSPASEDTPEEE--------EE-----EEEEEEPASPPERKTLPQICLLSN
110 120 130 140 150
390 400 410 420 430 440
pF1KSD PGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQA
: : .:::.:: ...::.:. :.:.: ..::..::.::::::: .:: ::.. :. ..
CCDS46 PHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENER
160 170 180 190 200 210
450 460 470 480 490 500
pF1KSD LRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYV
.: : : . : ::::: : .:::::: : :.. . :::.::.:. .:. ::::.
CCDS46 IRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYI
220 230 240 250 260 270
510 520 530 540 550 560
pF1KSD DYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQ
:: :: :::.::..:.. .. : . .:. :::. ::. :::.:::::::::..:.:
CCDS46 TYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQ
280 290 300 310 320 330
570 580 590 600 610 620
pF1KSD NILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPL
:::...:: : :. .: : . ... :. : .:..::..: . ....: :.:..:.
CCDS46 NILKRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEF-KIKSVPI
340 350 360 370 380 390
630 640 650 660 670 680
pF1KSD VSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYA
.: :: : :::: ... . . . .. : . :.::.:::.: . :.. ::.: :
CCDS46 ISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSA
400 410 420 430 440 450
690 700 710 720 730 740
pF1KSD HRSLVQAQQVPDPSGP--PTFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLP
:.:...... : . .: : :: : . : . .:.::: :.:.::. .. .:.
CCDS46 PRGLLRVEELEDQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSL-APNRRT
460 470 480 490 500 510
750 760 770 780 790 800
pF1KSD CSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLP------GA
. . :: : : . . . . .:: . : :: .::. : :
CCDS46 KFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGW
520 530 540 550 560 570
810 820 830 840
pF1KSD FPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGPSSGTPNAPPP
::.... :. . . : ..:.. :. . :
CCDS46 FPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
580 590 600 610
>>CCDS2500.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 (710 aa)
initn: 870 init1: 689 opt: 979 Z-score: 468.9 bits: 97.5 E(32554): 8.4e-20
Smith-Waterman score: 979; 36.2% identity (65.1% similar) in 475 aa overlap (370-831:221-693)
340 350 360 370 380 390
pF1KSD EQNWELPLQDEPLYQTYRAAVLSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPR-----PPGPRNT
:. ::. . :.:. : : .
CCDS25 IETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPEEEEEEEEEEEPASPPERKTLPQICLLSNPHSRFN
200 210 220 230 240 250
400 410 420 430 440 450
pF1KSD LWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLT
:::.:: ...::.:. :.:.: ..::..::.::::::: .:: ::.. :. .. .: :
CCDS25 LWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILH
260 270 280 290 300 310
460 470 480 490 500 510
pF1KSD PRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQ
: . : ::::: : .:::::: : :.. . :::.::.:. .:. ::::. :: ::
CCDS25 PSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQ
320 330 340 350 360 370
520 530 540 550 560 570
pF1KSD QYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQT
:::.::..:.. .. : . .:. :::. ::. :::.:::::::::..:.::::...
CCDS25 TYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILKRV
380 390 400 410 420 430
580 590 600 610 620 630
pF1KSD EEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRR
:: : :. .: : . ... :. : .:..::..: . ....: :.:..:..: ::
CCDS25 EERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEF-KIKSVPIISHSRW
440 450 460 470 480
640 650 660 670 680 690
pF1KSD LEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQ
: :::: ... . . . .. : . :.::.:::.: . :.. ::.: : :.:..
CCDS25 LLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLR
490 500 510 520 530 540
700 710 720 730 740 750
pF1KSD AQQVPDPSGP--PTFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTI
.... : . .: : :: : . : . .:.::: :.:.::. .. .:. .
CCDS25 VEELEDQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSL-APNRRTKFVSFT
550 560 570 580 590 600
760 770 780 790 800
pF1KSD YEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLP------GAFPAQLV
. :: : : . . . . .:: . : :: .::. : : ::....
CCDS25 SRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMT
610 620 630 640 650 660
810 820 830 840
pF1KSD CEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGPSSGTPNAPPP
:. . . : ..:.. :. . :
CCDS25 EEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
670 680 690 700 710
>>CCDS34771.1 ARHGEF5 gene_id:7984|Hs108|chr7 (1597 aa)
initn: 827 init1: 665 opt: 951 Z-score: 451.5 bits: 95.5 E(32554): 8e-19
Smith-Waterman score: 1025; 29.4% identity (54.9% similar) in 874 aa overlap (22-828:726-1588)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGPPHNGSSPQELPR-NS
: :: . : .. .: . .: ..
CCDS34 HNPAFATESPAYGSSPSFVSMEDVRIHEPLPPPPPQRRDTHPSVVETDGHARVVVPTLKQ
700 710 720 730 740 750
60 70 80 90 100 110
pF1KSD NDAPTPMCTPIFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASP
.. : :. . : . : : :...: ..::: : .: : .
CCDS34 HSHPPPLALGSGLHAPHKGPLPQAS-DPAVARQHRPLPSTPDS-SHHAQATPRWRYNKPL
760 770 780 790 800 810
120 130 140 150 160
pF1KSD EPAPRSPVPPPKPSGSPCT-----PLLPMAGVLAQNGSASAP----GTVRRL-AGRFEGG
:.: : : : ..: . :: :. . . : : : .:....:
CCDS34 PPTPDLPQPHLPPISAPGSSRIYRPLPPLPIIDPPTEPPPLPPKSRGRSRSTRGGHMNSG
820 830 840 850 860 870
170 180 190 200 210
pF1KSD AEGRA----QDADAPEPGLQARAD----VNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPC
..... :: .: :. .:.. . :. . : :. . .: ... :
CCDS34 GHAKTRPACQDWTVPLPASAGRTSWPPATARSTESFTSTSRSKSEVSPGMAFSNMTNFLC
880 890 900 910 920 930
220 230 240 250 260
pF1KSD VCHTTRPGLELRWVPVG----GYEEVPRVPRRASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRS
: : :.. : : :..: : ::: :. :. . : . . :.
CCDS34 PSSPTTPWTPELQGPTSKDEAGVSEHPEAPARE-PLR--RTTPQQGASGPGRSPVGQARQ
940 950 960 970 980 990
270 280 290 300 310
pF1KSD TAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDP------PQPDLDL---LSEDGIQT------GD
. . : : : . . :... :: :. . :..:.. :.
CCDS34 PEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDSSGQAVAPSEGANKHKGWSRQGLRRPSILPEGS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
320 330 340 350 360
pF1KSD SPDEAP----QNTPPATVEGREEEGLEVL---KEQNWELPLQDEPLYQTYRAAVLSEELW
: ...: . : :: ::.. ::. ... .: ... ::: : .::..:.
CCDS34 SDSRGPAVEKHPGPSDTVVFREKKPKEVMGGFSRRCSKLINSSQLLYQEYSDVVLNKEIQ
1060 1070 1080 1090 1100 1110
370 380 390 400 410
pF1KSD GVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPP-------------GPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSP
. . : : . . ..: :: . ..::::.:.:. : .: ...
CCDS34 SQQRLESLSETPGPSSPRQPRKALVSSESYLQRLSMASSGSLWQEIPVVRNSTVLLSMTH
1120 1130 1140 1150 1160 1170
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSE
.....:: ::...::::::::: . .: : :: .:: ::. ..:. ::: .: :. ::
CCDS34 EDQKLQEVKFELIVSEASYLRSLNIAVDHFQLSTSLRATLSNQEHQWLFSRLQDVRDVSA
1180 1190 1200 1210 1220 1230
480 490 500 510 520 530
pF1KSD RFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSA
::. : ... ..:::: :: ::. :: :: :::.:.. ::..: :
CCDS34 TFLSDLEENFENNIFSFQVCDVVLNHAPDFRRVYLPYVTNQTYQERTFQSLMNSNSNFRE
1240 1250 1260 1270 1280 1290
540 550 560 570 580 590
pF1KSD ELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSK
:..:.: : :.:: : :::.:::::::::..::::::..:. :::.. .: :: :. .
CCDS34 VLEKLESDPVCQRLSLKSFLILPFQRITRLKLLLQNILKRTQPGSSEEAEATKAHHALEQ
1300 1310 1320 1330 1340 1350
600 610 620 630 640 650
pF1KSD IIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLF
.:. :. .: :..::::: :.:...: . : .::.: :: : .:::: : . :
CCDS34 LIRDCNNNVQSMRRTEELIYLSQKIEF-ECKIFPLISQSRWLVKSGELTALEFSASPGL-
1360 1370 1380 1390 1400
660 670 680 690 700 710
pF1KSD ASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDP-SGPPT--FRLS
. :. : ::.: ::...:. :.:. :.:.: : ..... :: :::
CCDS34 RRKLNTRPVHLHLFNDCLLLSRPREGSRFLVFDHAPFSSIRGEKCEMKLHGPHKNLFRLF
1410 1420 1430 1440 1450 1460
720 730 740 750 760 770
pF1KSD LLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPA
: .: :: .. :... . :. ::..:. .: . : . : : .. :
CCDS34 LRQNTQGAQAEFLFRTETQSEKLRWISALA----MPREELDLLECYNSPQVQCLRAYKPR
1470 1480 1490 1500 1510 1520
780 790 800 810 820
pF1KSD KTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLP------GAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQR
... .::. . ... .:::.:. : ::.: : ... . : ..:.. .:
CCDS34 ENDELALEKADVVMVTQQSSDGWLEGVRLSDGERGWFPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHR
1530 1540 1550 1560 1570 1580
830 840
pF1KSD LLEAVGPSSGTPNAPPP
. :
CCDS34 VKTAKLQLVEQQA
1590
>>CCDS170.1 ARHGEF19 gene_id:128272|Hs108|chr1 (802 aa)
initn: 793 init1: 657 opt: 896 Z-score: 430.4 bits: 90.6 E(32554): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 925; 30.6% identity (55.5% similar) in 850 aa overlap (16-836:5-801)
10 20 30 40 50
pF1KSD MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPGP--PHNGSSPQELPRNSNDAPTPMC
:: ..:. . .:. : ... : ::: . :.:.:
CCDS17 MDCGPPATLQPHLTGPPGTAHHPVAVCQQESLSFAELP--ALKPPSPVC
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KSD TPIFWEPPAASLKPPALLPPSASRASLDSQTSPDSPSSTPTPSPVSRRSASPEPA---PR
.: : :. :. .. : :.. : ::... : .. . : : :.
CCDS17 LDLFPVAPEE-LRAPGSRWSLGTPAPLQGLLWPLSPGGSDTE--ITSGGMRPSRAGSWPH
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KSD SP-VPPPKPSGSPCTPLLPMAGVLAQNGSASAPGTVR-RLAGRFEGGAEGRAQDADAPEP
: . :: : : .: . :..:: . . . :. : : . .:. : ::
CCDS17 CPGAQPPALEG-PWSPRHTQPQRRASHGSEKKSAWRKMRVYQREEVPGCPEAH-AVFLEP
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KSD G--LQARADVNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGY
: .: .: . : .. :.:: .:. :.. :.: :
CCDS17 GQVVQEQALSTEEPRVELSGSTRVSLEGPERRRFSASELMTRLHSS---LRL------GR
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD EEVPRVPRRASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDAT
. . :. .: :. .: : : : : . ...: .. : : :.
CCDS17 NSAARALISGSG--TGAAREGKAS-GMEA---RSVEMSGDR-----VSRPAPGDSRE---
220 230 240 250
300 310 320 330 340
pF1KSD IFGDPPQPDLDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGL--EVLKEQNWELPLQD
:: .: :: . .: : .. .: : :. . : :: .. ..
CCDS17 --GDWSEPRLD-----------TQEEPPLGSR-STNERRQSRFLLNSVLYQEYSDVASAR
260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KSD EPLYQTYRAAVLSEELWGVGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNT---LWQELPAVQASG
: : . ..: :. : .: :: . . .: . :.. :::..: :..::
CCDS17 ELRRQQREEEGPGDEAEGAEEGPGPPRANLSPSSSFRAQRSARGSTFSLWQDIPDVRGSG
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KSD LLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQ
.: ::: .. ..::. ::..::::::..:: . . :. : : . : .:.. :::..
CCDS17 VLATLSLRDCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSECLGAQDKQWLFSKLP
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KSD RVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMD
.:...::::: : .:.... ..:::: : . ::. :: :: :::.::.::.
CCDS17 EVKSTSERFLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYVTNQAYQERTYQRLLL
430 440 450 460 470 480
530 540 550 560 570 580
pF1KSD TNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQK
: :: . : ::. : :.:::: :::.:::::::::.::..:::..: .:: .. : :
CCDS17 ENPRFPGILARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILKRTAQGSEDEDMATK
490 500 510 520 530 540
590 600 610 620 630 640
pF1KSD ALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGC
:..:.......:.: : ::.:::::.:.....:. : .::.: .: : .:::.::.
CCDS17 AFNALKELVQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEG-KIFPLISQARWLVRHGELVELA-
550 560 570 580 590 600
650 660 670 680 690 700
pF1KSD RRGGVLFASRPRFTPLC-----LLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQVPDP
: :. : : : ::.: ::... : .. :. .:. . .:....
CCDS17 ----PLPAAPPAKLKLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAKMAELQVRDLSLK
610 620 630 640 650
710 720 730 740 750
pF1KSD -SGPP--TFRLSLLSNHQGRPTHR-LLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCD
.: : .: :.:: : . :. ::.: . :. :::..:. .: . ..: : :
CCDS17 LQGIPGHVFLLQLL--HGQHMKHQFLLRARTESEKQRWISALCPSSPQE-DKEVISEGED
660 670 680 690 700 710
760 770 780 790 800 810
pF1KSD CSQELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGL------PGAFPAQLVCEVTG
: : : .. . . .::. . : .:::.:. : : : :...
CCDS17 CPQVQCVRTYKALHPDELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAYVEEISS
720 730 740 750 760 770
820 830 840
pF1KSD EHERRRHLRQNQRLLEAVGPSSGTPNAPPP
: :.::.:.:. :.. . .:
CCDS17 LSARLRNLRENKRVTSATSKLGEAPV
780 790 800
>>CCDS58858.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 (791 aa)
initn: 759 init1: 534 opt: 810 Z-score: 391.2 bits: 83.3 E(32554): 1.8e-15
Smith-Waterman score: 868; 29.7% identity (55.3% similar) in 781 aa overlap (17-739:26-777)
10 20 30 40
pF1KSD MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPG-------PPHNGSS--
:. . : : .. :::. : ..:..
CCDS58 MDGESEVDFSSNSITPLWRRRSIPQPHQVLGRSKPRPQSYQSPNGLLITDFPVEDGGTLL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KSD ----PQELPRNSNDAPTPMCTPIFWEPPAASLKPPALLPPSASRAS--LDSQTSPDSPSS
: ..: : :. : .:.. .. . : :: : :: :..
CCDS58 AAQIPAQVPTAS-DSRTVHRSPLLLGAQRRAVANGGTASPEYRAASPRLRRPKSPKLPKA
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KSD TPTPSPVSRRSAS---PEPAPRSPV--PPPKPSG-SPCTPLLPMAGVLAQN-GSASAPGT
.: :: : ... : : : :: :: :.. .:::: ..:. :. : .: :
CCDS58 VPGGSPKSPANGAVTLPAPPP-PPVLRPPRTPNAPAPCTPEEDLTGLTASPVPSPTANGL
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KSD VRRLAGRFEGGAEGR-AQDADAPEPGL-QARADVNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACP
. . :. :: :.: :: :: . ..:.. :: :::: .
CCDS58 AANNDSPGSGSQSGRKAKD---PERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLEN-----
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD PCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRRASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYR
: : .: :. :: . .:. :: .. :.: . .: : . :
CCDS58 ---PSVVLSTNSPAALK---VGKQQIIPK--SLASEIKISKSNNQNV---EPHKRLLKVR
240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KSD STAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPDLDLLSEDGIQTG---DSPDEAPQNT--
: .: :: . . ..: .:. :. . . . .. .: ::: . ...
CCDS58 SMVEGLGGPLGHAGEESEVDNDVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRM
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370
pF1KSD --PPATVEGREEEGL--------EVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAVLSEELWGVGEDG
: : ...: . ..:: :. .. :::.:. .:. . :..
CCDS58 SQPVLKVVMEDKEKFSSLGRIKKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDID---SDEES
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KSD SPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASY
:. .. . .. . : :.: :..: ::. .:: .:.: .::. ::..:::..:: ::
CCDS58 EPKEQKSDEKIVIHHKPL-RST-WSQLSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSY
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KSD LRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDL
: ::..: : :. : ::.: ..: ::::. : .:..:. : .: ... :.:.
CCDS58 LLSLEILIRMFKNSKELSDTMTKTERHHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDI
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KSD CDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSF
:.:. :... :. :: : :. ::..: ..:. :: :. : :..: :. ::. ::
CCDS58 SDIVEKHTASTFDPYVKYCTNEVYQQRTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISF
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELI
:.::.::.::: .:...: ..: . : . : ..:: :::... :. . .:..:: .
CCDS58 LILPMQRVTRLPLLMDTICQKTPKDSPKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMY
580 590 600 610 620 630
620 630 640 650 660 670
pF1KSD RLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLL
....:.: :.: .:::: :: : .:::: . :::. : . ..::.:.:.
CCDS58 TINSQLEF-KIKPFPLVSSSRWLVKRGELTAY--VEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLI
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710
pF1KSD ITQPKSGQRLQVLDYAHRS--LVQAQQVPDPSGPP-----------------TFRLSLLS
::. :: . .: ::. :. ::.. . . .. : : :..::
CCDS58 ITKKKSEESYNVNDYSLRDQLLVESCDNEELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLS
700 710 720 730 740 750
720 730 740 750 760 770
pF1KSD NHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTE
:: .. .. :: : . :. ::. :.
CCDS58 NHANEKVEMLLGAETQSERARWITALGHSSGKPPADRTCG
760 770 780 790
>>CCDS46938.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 (871 aa)
initn: 787 init1: 562 opt: 810 Z-score: 390.6 bits: 83.3 E(32554): 1.9e-15
Smith-Waterman score: 887; 28.5% identity (54.3% similar) in 874 aa overlap (17-826:26-865)
10 20 30 40
pF1KSD MSAQSLPAATPPTQKPPRIIRPRPPSRSRAAQSPG-------PPHNGSS--
:. . : : .. :::. : ..:..
CCDS46 MDGESEVDFSSNSITPLWRRRSIPQPHQVLGRSKPRPQSYQSPNGLLITDFPVEDGGTLL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KSD ----PQELPRNSNDAPTPMCTPIFWEPPAASLKPPALLPPSASRAS--LDSQTSPDSPSS
: ..: : :. : .:.. .. . : :: : :: :..
CCDS46 AAQIPAQVPTAS-DSRTVHRSPLLLGAQRRAVANGGTASPEYRAASPRLRRPKSPKLPKA
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KSD TPTPSPVSRRSAS---PEPAPRSPV--PPPKPSG-SPCTPLLPMAGVLAQN-GSASAPGT
.: :: : ... : : : :: :: :.. .:::: ..:. :. : .: :
CCDS46 VPGGSPKSPANGAVTLPAPPP-PPVLRPPRTPNAPAPCTPEEDLTGLTASPVPSPTANGL
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KSD VRRLAGRFEGGAEGR-AQDADAPEPGL-QARADVNGEREAPLTGSGSQENGAPDAGLACP
. . :. :: :.: :: :: . ..:.. :: :::: .
CCDS46 AANNDSPGSGSQSGRKAKD---PERGLFPGPQKSSSEQKLPLQRLPSQENELLEN-----
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD PCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPRVPRRASPLRTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYR
: : .: :. :: . .:. :: .. :.: . .. .: : . :
CCDS46 ---PSVVLSTNSPAALK---VGKQQIIPK--SLASEIKISKSNNQ--NV-EPHKRLLKVR
240 250 260 270
270 280 290 300 310 320
pF1KSD STAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPDLDLLSEDGIQTG---DSPDEAPQNT--
: .: :: . . ..: .:. :. . . . .. .: ::: . ...
CCDS46 SMVEGLGGPLGHAGEESEVDNDVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRM
280 290 300 310 320 330
330 340 350 360 370
pF1KSD --PPATVEGREEEGL--------EVLKEQNWELPLQDEPLYQTYRAAVLSEELWGVGEDG
: : ...: . ..:: :. .. :::.:. .:. . :..
CCDS46 SQPVLKVVMEDKEKFSSLGRIKKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDID---SDEES
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KSD SPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASY
:. .. . .. . : :.: :..: ::. .:: .:.: .::. ::..:::..:: ::
CCDS46 EPKEQKSDEKIVIHHKPL-RST-WSQLSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSY
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KSD LRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDL
: ::..: : :. : ::.: ..: ::::. : .:..:. : .: ... :.:.
CCDS46 LLSLEILIRMFKNSKELSDTMTKTERHHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDI
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KSD CDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSF
:.:. :... :. :: : :. ::..: ..:. :: :. : :..: :. ::. ::
CCDS46 SDIVEKHTASTFDPYVKYCTNEVYQQRTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISF
520 530 540 550 560 570
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELI
:.::.::.::: .:...: ..: . : . : ..:: :::... :. . .:..:: .
CCDS46 LILPMQRVTRLPLLMDTICQKTPKDSPKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMY
580 590 600 610 620 630
620 630 640 650 660 670
pF1KSD RLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLL
....:.: :.: .:::: :: : .:::: . :::. : . ..::.:.:.
CCDS46 TINSQLEF-KIKPFPLVSSSRWLVKRGELTAY--VEDTVLFSRRTSKQQVYFFLFNDVLI
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710
pF1KSD ITQPKSGQRLQVLDYAHRS--LVQAQQVPDPSGPP-----------------TFRLSLLS
::. :: . .: ::. :. ::.. . . .. : : :..::
CCDS46 ITKKKSEESYNVNDYSLRDQLLVESCDNEELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLS
700 710 720 730 740 750
720 730 740 750 760 770
pF1KSD NHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDCDCSQELCSESSAPAKTE
:: .. .. :: : . :. ::. :. . : . : . .: .: . . .
CCDS46 NHANEKVEMLLGAETQSERARWITALGHSSGKPPADRT-----SLTQVEIVRSFTAKQPD
760 770 780 790 800
780 790 800 810 820
pF1KSD GRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLP------GAFPAQLVCEVTGEHERRRHLRQNQRLLE
::. . ... .:: .: : :: . . :.: . ..... :::
CCDS46 ELSLQVADVVLIYQRVSDGWYEGERLRDGERGWFPMECAKEITCQATIDKNVERMGRLLG
810 820 830 840 850 860
830 840
pF1KSD AVGPSSGTPNAPPP
CCDS46 LETNV
870
>>CCDS46.2 ARHGEF16 gene_id:27237|Hs108|chr1 (709 aa)
initn: 864 init1: 678 opt: 782 Z-score: 379.1 bits: 80.9 E(32554): 8.6e-15
Smith-Waterman score: 858; 32.0% identity (56.6% similar) in 613 aa overlap (178-739:24-615)
150 160 170 180 190 200
pF1KSD GTVRRLAGRFEGGAEGRAQDADAPEPGLQARADVNGEREAPLTGSGSQENGAPDA--GLA
: :..:. : .: . :.: . :
CCDS46 MAQRHSDSSLEEKLLGHRFHSELRLDAGGN---PASGL-PMVRGSPRVRDDAA
10 20 30 40
210 220 230 240 250
pF1KSD CPPCCPCVCHTTRPGLELRWVPVGGYEEVPR---------VPRRASPLRTSRSRPHPPSI
: : . :: : : :. : : .:. . ... . :.
CCDS46 FQPQVPAPPQPRPPGHEEPW-PIVLSTESPAALKLGTQQLIPKSLAVASKAKTPARHQSF
50 60 70 80 90 100
260 270 280 290
pF1KSD GHPAVVLTSYRSTAERKLLP----------LLKPP--------KPTRVRQDATIFGDPP-
: :.::. . . :::: . : : . : .: :
CCDS46 G--AAVLSREAARRDPKLLPAPSFSLDDMDVDKDPGGMLRRNLRNQSYRAAMKGLGKPGG
110 120 130 140 150 160
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QPDLDLLSEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGLEVLKEQNWELPLQDEP-LYQTY
: : :: .. :.. :.. :: .... : .... . ..:.: :::
CCDS46 QGDAIQLSPKLQALAEEPSQ-PHTRSPA--KNKKTLG----RKRGHKGSFKDDPQLYQEI
170 180 190 200 210
360 370 380 390 400 410
pF1KSD --RAAVLSEELWG--VGEDGSPSPANAGDAPTFPRPPGPRNTLWQELPAVQASGLLDTLS
:. :.: . :..:: .. :: . : .. :..:: : :.:: ::
CCDS46 QERGLNTSQESDDDILDESSSPEGTQKVDATIVVKSYRPAQVTWSQLPEVVELGILDQLS
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KSD PQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTLTPRDHHTLFSNVQRVQGVS
.::. ::..::..::: :: .:: .:.. :. :. :: :.: .:: ::::. : :.:
CCDS46 TEERKRQEAMFEILTSEFSYQHSLSILVEEFLQSKELRATVTQMEHHHLFSNILDVLGAS
280 290 300 310 320 330
480 490 500 510 520 530
pF1KSD ERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRNQQYQEETYSRLMDTNVRFS
.::. : .: ... . :. :... :: : :. : :. ::..: ..:...:. :
CCDS46 QRFFEDLEQRHKAQVLVEDISDILEEHAEKHFHPYIAYCSNEVYQQRTLQKLISSNAAFR
340 350 360 370 380 390
540 550 560 570 580 590
pF1KSD AELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQTEEGSSRQENAQKALGAVS
::... : : ::. :::.::.::.::: .:.... .:. : : . :..:: :.:
CCDS46 EALREIERRPACGGLPMLSFLILPMQRVTRLPLLMDTLCLKTQGHSERYKAASRALKAIS
400 410 420 430 440 450
600 610 620 630 640
pF1KSD KIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSRRLEFQGEL---TELGCRRG
:....:. . ::.. :.. : .: : :::.:::.: :: : .::: : : :
CCDS46 KLVRQCNEGAHRMERMEQMYTLHTQLDFSKVKSLPLISASRWLLKRGELFLVEETGLFRK
460 470 480 490 500 510
650 660 670 680 690 700
pF1KSD GVLFASRPRFTPLC-LLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLVQAQQV-----PDPSG
.:::: : :.::.:.:..:. :: . .: :::. . .:.... : :.:
CCDS46 ---IASRPT----CYLFLFNDVLVVTKKKSEESYMVQDYAQMNHIQVEKIEPSELPLPGG
520 530 540 550 560 570
710 720 730 740 750
pF1KSD -------PPTFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDTIYEDC
: :...:: : .:: . ::...: :: ::. :.
CCDS46 GNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQEQLLLSSDSASDRARWIVALTHSERQWQGLSSKGDLP
580 590 600 610 620 630
760 770 780 790 800 810
pF1KSD DCSQELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGLPGAFPAQLVCEVTGEHERR
CCDS46 QVEITKAFFAKQADEVTLQQADVVLVLQQEDGWLYGERLRDGETGWFPEDFARFITSRVA
640 650 660 670 680 690
841 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 04:11:29 2016 done: Thu Nov 3 04:11:30 2016
Total Scan time: 5.490 Total Display time: 0.230
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]