Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0848
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0848, 977 aa
1>>>pF1KSDA0848 977 - 977 aa - 977 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7381+/-0.00104; mu= 7.4200+/- 0.063
mean_var=219.6550+/-44.038, 0's: 0 Z-trim(112.5): 145 B-trim: 7 in 1/51
Lambda= 0.086537
statistics sampled from 13094 (13248) to 13094 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.407), width: 16
Scan time: 5.310
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3197.1 SLITRK3 gene_id:22865|Hs108|chr3 ( 977) 6637 842.2 0
CCDS9465.1 SLITRK5 gene_id:26050|Hs108|chr13 ( 958) 2256 295.2 4.2e-79
CCDS14680.1 SLITRK2 gene_id:84631|Hs108|chrX ( 845) 1214 165.1 5.5e-40
CCDS14679.1 SLITRK4 gene_id:139065|Hs108|chrX ( 837) 1134 155.1 5.5e-37
CCDS41903.1 SLITRK6 gene_id:84189|Hs108|chr13 ( 841) 1078 148.1 7e-35
CCDS9464.1 SLITRK1 gene_id:114798|Hs108|chr13 ( 696) 873 122.4 3.1e-27
>>CCDS3197.1 SLITRK3 gene_id:22865|Hs108|chr3 (977 aa)
initn: 6637 init1: 6637 opt: 6637 Z-score: 4489.6 bits: 842.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6637; 99.9% identity (99.9% similar) in 977 aa overlap (1-977:1-977)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIH
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CCDS31 MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD CDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 CDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 SKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD APYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 APYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFL
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CCDS31 SLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD YLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD DVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD LVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD GGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGSAERGGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGSAERGGP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD GTQPPGMGEALLGSEQFAETPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GTQPPGMGEALLGSEQFAETPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGSGSMLLDRERPQPAPCTVGFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 PAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGSGSMLLDRERPQPAPCTVGFV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD DCLYGTVPKLKELHVHPPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAEKGFTDHQTQKSDYLELRAKL
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CCDS31 DCLYGTVPKLKELHVHPPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAGKGFTDHQTQKSDYLELRAKL
910 920 930 940 950 960
970
pF1KSD QTKPDYLEVLEKTTYRF
:::::::::::::::::
CCDS31 QTKPDYLEVLEKTTYRF
970
>>CCDS9465.1 SLITRK5 gene_id:26050|Hs108|chr13 (958 aa)
initn: 2348 init1: 1044 opt: 2256 Z-score: 1533.7 bits: 295.2 E(32554): 4.2e-79
Smith-Waterman score: 2420; 42.2% identity (68.5% similar) in 1011 aa overlap (4-974:9-953)
10 20 30 40 50
pF1KSD MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEID---EPCFDPCYCEV
.. . ::: : .:.:.:.. :. . . .: :: : : . : ::
CCDS94 MHTCCPPVTLEQDLHRKMHSW--MLQTLAFAVTSLV--LSCAETIDYYGEICDNACPCEE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD KESLFHIHCDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNA
:.... . :...:. ..:.:. ..: :. : . .:: : :.. ..: ..::.:.
CCDS94 KDGILTVSCENRGIISLSEISPPRFPIYHLLLSGNLLNRLYPNEFVNYTGASILHLGSNV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD LQDIQTGAFNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNL
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CCDS94 IQDIETGAFHGLRGLRRLHLNNNKLELLRDDTFLGLENLEYLQVDYNYISVIEPNAFGKL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD SKLRVLILNDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEEN
:.::::::::. ::.:::. : ::::::::::::.: : :.:.:. . ..:::::::
CCDS94 HLLQVLILNDNLLSSLPNNLFRFVPLTHLDLRGNRLKLLPYVGLLQHMDK-VVELQLEEN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD PWNCTCEIVQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCP--LLSDSEVE
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CCDS94 PWNCSCELISLKDWLDSISYSALVGDVVCETPFRLHGRDLDEVSKQELCPRRLISDYEMR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KSD ASLGIPHSSSSKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPR--PPSTS
:.. : . : :.:. .:: :.::. :: : :: :.:: :: : : .
CCDS94 -----PQTPLSTTGYLHTTPASV-NSVA-TSSSAVYKPPLKPPKGTRQPNKPRVRPTSRQ
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KSD QALYPG-PNQPPIAPYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRP
. : : : :::. :.:. :::.:.:::.:.::::.:::.:: ...:.:: :.:
CCDS94 PSKDLGYSNYGPSIAYQTKSPVPLECPTACSCNLQISDLGLNVNCQERKIESIAELQPKP
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KSD LNAKKLYLSSNLIQKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGND
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CCDS94 YNPKKMYLTENYIAVVRRTDFLEATGLDLLHLGNNRISMIQDRAFGDLTNLRRLYLNGNR
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KSD IEKLTPGMFRGLQSLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGT
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CCDS94 IERLSPELFYGLQSLQYLFLQYNLIREIQSGTFDPVPNLQLLFLNNNLLQAMPSGVFSGL
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KSD SLARLNLRKNYFLYLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVG
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CCDS94 TLLRLNLRSNHFTSLPVSGVLDQLKSLIQIDLHDNPWDCTCDIVGMKLWVEQLKVGVLVD
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630
pF1KSD DVLCRSPENLTHRDVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQ---PGDSHLIGAP-----TSA
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CCDS94 EVICKAPKKFAETDMRSIKSELLCPDYSDVVVSTPTPSSIQVPARTSAV-TPAVRLNSTG
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KSD SPYEFSPPGGP--VPLSVLILSLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVD
.: .. :: :::::::::::..:. .::::::::. :..::.:. ... ... :
CCDS94 APASLGAGGGASSVPLSVLILSLLLVFIMSVFVAAGLFVLVMKRRKKNQSDHTSTNNS-D
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KSD LTGIQMQCHRLFEDGGGGGGGSGGGGR-------PTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQM
.....:: . .. :::::.:: . :.: :. :.::::::::::. .:
CCDS94 VSSFNMQ-YSVY----GGGGGTGGHPHAHVHHRGPAL--PKVKTPAGHVYEYIPHPLGHM
710 720 730 740 750
760 770 780 790
pF1KSD CNNPIYKPRE-----------EEEVAVSSAQEAGSAERGGPGTQPPGMGEALLGSEQFAE
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CCDS94 CKNPIYRSREGNSVEDYKDLHELKVTYSSNHHLQQQQQPPPPPQQPQQQPP----PQLQL
760 770 780 790 800 810
800 810 820 830 840 850
pF1KSD TPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNHHHPHHPAVGGVSGVVGGTGGDLAG
: : :...: :: . :: . :: . :: .
CCDS94 QPGE---------EERRE-----------------SHHLRSPAYS-VSTIEPRE--DLLS
820 830 840
860 870 880 890 900 910
pF1KSD FRHHEKNGGVVLFPPGGGCGS---GSMLLDRERPQPAPCTVGFVDCLYGTVPKLKELHVH
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CCDS94 PVQDADRFYRGILEPDKHCSTTPAGNSL--PEYPK-FPCS----PAAYTFSPNY-DLR-R
850 860 870 880 890
920 930 940 950 960 970
pF1KSD PPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAEKG-FTDHQTQKSDYLELRAKLQTKPDYLEVLEKTTY
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CCDS94 PHQYLHPG-AGDSRLREPVLYSPPSAVFV--EPNRNEYLELKAKLNVEPDYLEVLEKQTT
900 910 920 930 940 950
pF1KSD RF
CCDS94 FSQF
>>CCDS14680.1 SLITRK2 gene_id:84631|Hs108|chrX (845 aa)
initn: 2191 init1: 1010 opt: 1214 Z-score: 831.4 bits: 165.1 E(32554): 5.5e-40
Smith-Waterman score: 2199; 44.3% identity (70.8% similar) in 808 aa overlap (15-817:5-765)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIH
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CCDS14 MLSGVWFLSVLTVA-G----ILQTESRKTAKDICKIRCLCEEKENVLNIN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD CDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGA
:..::::..: . : ..:.:. : . .:: : :.. .:::...::::.::.:.:::
CCDS14 CENKGFTTVSLLQPPQYRIYQLFLNGNLLTRLYPNEFVNYSNAVTLHLGNNGLQEIRTGA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KSD FNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLIL
:.::: ::::.:..:::...:.::::::::::::::::: :. ::.::: .:.::.::::
CCDS14 FSGLKTLKRLHLNNNKLEILREDTFLGLESLEYLQADYNYISAIEAGAFSKLNKLKVLIL
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KSD NDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEI
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CCDS14 NDNLLLSLPSNVFRFVLLTHLDLRGNRLKVMPFAGVLEHIG-GIMEIQLEENPWNCTCDL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KSD VQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSS
. ::.::. : :..::.:.:::::..::::. .. . .::: : :. .: :...
CCDS14 LPLKAWLDTI--TVFVGEIVCETPFRLHGKDVTQLTRQDLCPRKSASD--SSQRGSHADT
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KSD SKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPI
. :: .. . .. .... :: ..: ::: ... : ::
CCDS14 HVQRLSPTMNPAL--------NPTRAPKASRPPKMRNRP-TPRVTVSKDRQSFG----PI
290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KSD APYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLI
:::. :.:. ::..:.:. . .: ::.:::.:: :.:::.: :.: . :::::..: .
CCDS14 MVYQTKSPVPLTCPSSCVCTSQSSDNGLNVNCQERKFTNISDLQPKPTSPKKLYLTGNYL
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KSD QKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQ
: .:..:. ..:::::::::::::. .:.::: :: .:. :.:::: .: : :.:: :::
CCDS14 QTVYKNDLLEYSSLDLLHLGNNRIAVIQEGAFTNLTSLRRLYLNGNYLEVLYPSMFDGLQ
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KSD SLHYLYFEFNVIREIQPAAFSLMPNLKLLFLNNNLLRTLPTDAFAGTSLARLNLRKNYFL
::.:::.:.:::.::.: .:. . ::.::::::::::.:: . :.::.:.:::::.:.:
CCDS14 SLQYLYLEYNVIKEIKPLTFDALINLQLLFLNNNLLRSLPDNIFGGTALTRLNLRNNHFS
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KSD YLPVAGVLEHLNAIVQIDLNENPWDCTCDLVPFKQWIETISSVSVVGDVLCRSPENLTHR
.::: :::..: :..::::.:::::::::.. .:.: : .: ....: :.:: . . .
CCDS14 HLPVKGVLDQLPAFIQIDLQENPWDCTCDIMGLKDWTEHANSPVIINEVTCESPAKHAGE
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650
pF1KSD DVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTS--ASPYEFSPPGGPVPLSVLIL
.. . :..::. .: . . . .: .: : .:: . ::::::::
CCDS14 ILKFLGREAICPD----SPNLSDGTVLSMNHNTDTPRSLSVSPSSYPELHTEVPLSVLIL
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700 710
pF1KSD SLLVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGVDLTGIQMQCHRLFEDGGGGGGG
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CCDS14 GLLVVFILSVCFGAGLFVFVLKRR-KGVPSVPRNTNNLDVSSFQLQY-------------
630 640 650 660
720 730 740 750 760 770
pF1KSD SGGGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGSAERG
: . . .:. ::::.::: :: :::.:::: .: . :: . :
CCDS14 ----GSYNTETHDKTD--GHVYNYIPPPVGQMCQNPIYMQKEGDPVAYYRNLQEFSYSNL
670 680 690 700 710 720
780 790 800 810 820 830
pF1KSD GPGTQPPGMGEALLGSEQFAE---TPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQLNTIVTVNH
. :. ... .. : ::.: . :... :. ::
CCDS14 EEKKEEPATPAYTISATELLEKQATPREPELLYQNIAERVKELPSAGLVHYNFCTLPKRQ
730 740 750 760 770 780
840 850 860 870 880 890
pF1KSD HHPHHPAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGSGSMLLDRERPQPAPC
CCDS14 FAPSYESRRQNQDRINKTVLYGTPRKCFVGQSKPNHPLLQAKPQSEPDYLEVLEKQTAIS
790 800 810 820 830 840
>>CCDS14679.1 SLITRK4 gene_id:139065|Hs108|chrX (837 aa)
initn: 1221 init1: 964 opt: 1134 Z-score: 777.5 bits: 155.1 E(32554): 5.5e-37
Smith-Waterman score: 2011; 45.8% identity (74.3% similar) in 696 aa overlap (15-707:3-670)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKPSIAEMLHRGRMLWIILLSTIALGWTTPIPLIEDSEEIDEPCFDPCYCEVKESLFHIH
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CCDS14 MFLWLFLILSALISSTNA-----DSDISVEIC-NVCSCVSVENVLYVN
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KSD CDSKGFTNISQITEFWSRPFKLYLQRNSMRKLYTNSFLHLNNAVSINLGNNALQDIQTGA
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CCDS14 CEKVSVYRPNQLKPPWSNFYHLNFQNNFLNILYPNTFLNFSHAVSLHLGNNKLQNIEGGA
50 60 70 80 90 100
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pF1KSD FNGLKILKRLYLHENKLDVFRNDTFLGLESLEYLQADYNVIKRIESGAFRNLSKLRVLIL
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CCDS14 FLGLSALKQLHLNNNELKILRADTFLGIENLEYLQADYNLIKYIERGAFNKLHKLKVLIL
110 120 130 140 150 160
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pF1KSD NDNLIPMLPTNLFKAVSLTHLDLRGNRLKVLFYRGMLDHIGRSLMELQLEENPWNCTCEI
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CCDS14 NDNLISFLPDNIFRFASLTHLDIRGNRIQKLPYIGVLEHIGR-VVELQLEDNPWNCSCDL
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pF1KSD VQLKSWLERIPYTALVGDITCETPFHFHGKDLREIRKTELCPLLSDSEVEASLGIPHSSS
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CCDS14 LPLKAWLENMPYNIYIGEAICETPSDLYGRLLKETNKQELCPMGTGSDFDVRILPP---S
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pF1KSD SKENAWPTKPSSMLSSVHFTASSVEYKSSNKQPKPTKQPRTPRPPSTSQALYPGPNQPPI
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CCDS14 QLENGY-TTPNG-----HTTQTSL-HRLVTKPPK-TTNPSKISGIVAGKAL-SNRNLSQI
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pF1KSD APYQTRPPIPIICPTGCTCNLHINDLGLTVNCKERGFNNISELLPRPLNAKKLYLSSNLI
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CCDS14 VSYQTRVPPLTPCPAPCFCKTHPSDLGLSVNCQEKNIQSMSELIPKPLNAKKLHVNGNSI
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pF1KSD QKIYRSDFWNFSSLDLLHLGNNRISYVQDGAFINLPNLKSLFLNGNDIEKLTPGMFRGLQ
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CCDS14 KDVDVSDFTDFEGLDLLHLGSNQITVIKGDVFHNLTNLRRLYLNGNQIERLYPEIFSGLH
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CCDS14 NLQYLYLEYNLIKEISAGTFDSMPNLQLLYLNNNLLKSLPVYIFSGAPLARLNLRNNKFM
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CCDS14 YLPVSGVLDQLQSLTQIDLEGNPWDCTCDLVALKLWVEKLSDGIVVKELKCETPVQFANI
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pF1KSD DVRTIELEVLCPEMLHVAPAGESPAQPGDSHLIGAPTSASPYEFSPPGGPVPLSVLILSL
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CCDS14 ELKSLKNEILCPKLLNKPSAPFTSPAPA----ITFTTPLGPIR-SPPGGPVPLSILILSI
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pF1KSD LVLFFSAVFVAAGLFAYVLRRRRKKLPFRSKRQEGV---DLTGIQMQCHRLFEDGGGGGG
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CCDS14 LVVLILTVFVAFCLLVFVLRRNKK--P--TVKHEGLGNPDCGSMQLQLRKHDHKTNKKDG
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pF1KSD GSGGGGRPTLSSPEKAPPVGHVYEYIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVSSAQEAGSAER
CCDS14 LSTEAFIPQTIEQMSKSHTCGLKESETGFMFSDPPGQKVVMRNVADKEKDLLHVDTRKRL
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CCDS41 TMLINCEAKGIKMVSEISVPPSRPFQLSLLNNGLTMLHTNDFSGLTNAISIHLGFNNIAD
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CCDS41 KVLILNDNAIESLPPNIFRFVPLTHLDLRGNQLQTLPYVGFLEHIGR-ILDLQLEDNKWA
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CCDS41 CNCDLLQLKTWLENMPPQSIIGDVVCNSPPFFKGSILSRLKKESICPT------------
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CCDS41 TKP-----STQLPGPY-CPIPCNCKV-LSPSGLLIHCQERNIESLSDLRPPPQNPRKLIL
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..:.:.....::. .. .:..:::::::: ...:.:.:: :..:.:::: . ::. ::
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.: ........ :.::: ... .:..: .. . . : :. . .
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::::::::.::..:.. :: :::. . ::.:::. ...:. .. : . ...: . .
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pF1KSD FEDGGGGGGGSGGGGRPTLSSPEKAPPVGHVYE-YIPHPVTQMCNNPIYKPREEEEVAVS
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CCDS41 Y------------GHKTTHHTTER--PSASLYEQHMVSPMVHVYRSPSFGPKHLEEEEER
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pF1KSD SAQEAGSAERGGPGTQPPGMGEALLGSEQFAETPKENHSNYRTLLEKEKEWALAVSSSQL
. .:...:. : . :.:::.:.
CCDS41 NEKEGSDAK----------------------------HLQ-RSLLEQEN-----------
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pF1KSD NTIVTVNHHHPHHPAVGGVSGVVGGTGGDLAGFRHHEKNGGVVLFPPGGGCGSGSMLLDR
: : .: ...... : .. .. . . .:..
CCDS41 -----------HSPLTG-------------SNMKYKTTNQSTEFLSFQDASSLYRNILEK
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pF1KSD ERPQPAPCTVGFVDCLYGTVPKLK-ELHVHPPGMQYPDLQQDARLKETLLFSAEKGFTDH
:: .:... : .. .:. ....: :: ... .: :::..: . .
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pF1KSD QTQKSDYLELRAKLQTKPDYLEVLEKTTYRF
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CCDS41 QT-KNEYFELKANLHAEPDYLEVLEQQT
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CCDS94 MLLWILLLETSLCFAAGNVT-----------GDVCKEKICSCNEIEGD
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CCDS94 LHVDCEKKGFTSLQRFTAPTSQFYHLFLHGNSLTRLFPNEFANFYNAVSLHMENNGLHEI
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CCDS94 VPGAFLGLQLVKRLHINNNKIKSFRKQTFLGLDDLEYLQADFNLLRDIDPGAFQDLNKLE
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CCDS94 VLILNDNLISTLPANVFQYVPITHLDLRGNRLKTLPYEEVLEQIP-GIAEILLEDNPWDC
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CCDS94 TCDLLSLKEWLENIPKNALIGRVVCEAPTRLQGKDLNETTEQDLCPL--KNRVDSSLPAP
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CCDS94 ---PAQEETFAPGP---LPTPFKTNGQEDHATPGSAPNGGTKIPGNWQIKIRPTAAIATG
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CCDS94 LFLRDNKIHSIRKSHFVDYKNLILLDLGNNNIATVENNTFKNLLDLRWLYMDSNYLDTLS
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CCDS94 REKFAGLQNLEYLNVEYNAIQLILPGTFNAMPKLRILILNNNLLRSLPVDVFAGVSLSKL
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CCDS94 TPVNFFRKDFMLLSNDEICPQLYARISPTLTSHSK-NSTGLAETGTHSNSYL---DTSRV
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CCDS94 NGPYNADGAHRVYDCGSHSLSD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]