Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0843
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0843, 683 aa
1>>>pF1KSDA0843 683 - 683 aa - 683 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4480+/-0.00115; mu= 6.4220+/- 0.068
mean_var=245.3822+/-55.810, 0's: 0 Z-trim(109.4): 121 B-trim: 550 in 1/52
Lambda= 0.081875
statistics sampled from 10746 (10867) to 10746 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16
Scan time: 4.070
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4294.1 ABLIM3 gene_id:22885|Hs108|chr5 ( 683) 4786 579.3 6.2e-165
CCDS78069.1 ABLIM3 gene_id:22885|Hs108|chr5 ( 650) 2905 357.1 4.6e-98
CCDS7590.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 ( 778) 2234 277.9 3.8e-74
CCDS31288.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 ( 718) 2232 277.6 4.2e-74
CCDS78071.1 ABLIM3 gene_id:22885|Hs108|chr5 ( 544) 2209 274.8 2.3e-73
CCDS47015.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 531) 1646 208.3 2.3e-53
CCDS47016.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 470) 1644 208.0 2.5e-53
CCDS47013.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 611) 1597 202.6 1.4e-51
CCDS47012.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 572) 1587 201.4 3.1e-51
CCDS54719.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 521) 1575 199.9 7.7e-51
CCDS47011.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 559) 1574 199.8 8.8e-51
CCDS47014.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 ( 645) 1570 199.4 1.4e-50
CCDS81509.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 ( 748) 1498 191.0 5.4e-48
CCDS47821.1 DMTN gene_id:2039|Hs108|chr8 ( 358) 503 73.1 7.8e-13
CCDS47820.1 DMTN gene_id:2039|Hs108|chr8 ( 383) 503 73.1 8.2e-13
CCDS81508.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 ( 401) 446 66.4 9e-11
CCDS31289.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 ( 455) 446 66.5 9.8e-11
>>CCDS4294.1 ABLIM3 gene_id:22885|Hs108|chr5 (683 aa)
initn: 4786 init1: 4786 opt: 4786 Z-score: 3074.5 bits: 579.3 E(32554): 6.2e-165
Smith-Waterman score: 4786; 100.0% identity (100.0% similar) in 683 aa overlap (1-683:1-683)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNTSIPYQQNPYNPRGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFHIRCFTCQVCGCGLAQSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MNTSIPYQQNPYNPRGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFHIRCFTCQVCGCGLAQSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHPKCFVCSLCRKPFPIGDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHPKCFVCSLCRKPFPIGDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VTFSGKECVCQTCSQSMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQSLLALDKQWHVSCFKCQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VTFSGKECVCQTCSQSMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQSLLALDKQWHVSCFKCQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLEAGGKHYHPTCARCVRCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLEAGGKHYHPTCARCVRCH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTSETSISPPGSSIGSPNRVICAKVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTSETSISPPGSSIGSPNRVICAKVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLISYEPHSRYMSDEMLERCGYGESLGTLSPYSQDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLISYEPHSRYMSDEMLERCGYGESLGTLSPYSQDI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD YENLDLRQRRASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHHYYRSGPESGRSSPYHSQLDVRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YENLDLRQRRASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHHYYRSGPESGRSSPYHSQLDVRSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TPTSYQAPKHFHIPAGDSNIYRKPPIYKRHGDLSTATKSKTSEDISQTSKYSPIYSPDPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TPTSYQAPKHFHIPAGDSNIYRKPPIYKRHGDLSTATKSKTSEDISQTSKYSPIYSPDPY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD YASESEYWTYHGSPKVPRARRFSSGGEEDDFDRSMHKLQSGIGRLILKEEMKARSSSYAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YASESEYWTYHGSPKVPRARRFSSGGEEDDFDRSMHKLQSGIGRLILKEEMKARSSSYAD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PWTPPRSSTSSREALHTAGYEMSLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRRNGLHRTPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PWTPPRSSTSSREALHTAGYEMSLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRRNGLHRTPSA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD DLFHYDSMNAVNWGMREYKIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRTRLERHLSQEEFYQVFGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DLFHYDSMNAVNWGMREYKIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRTRLERHLSQEEFYQVFGM
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KSD TISEFDRLALWKRNELKKQARLF
:::::::::::::::::::::::
CCDS42 TISEFDRLALWKRNELKKQARLF
670 680
>>CCDS78069.1 ABLIM3 gene_id:22885|Hs108|chr5 (650 aa)
initn: 2882 init1: 2882 opt: 2905 Z-score: 1874.0 bits: 357.1 E(32554): 4.6e-98
Smith-Waterman score: 4477; 95.2% identity (95.2% similar) in 683 aa overlap (1-683:1-650)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNTSIPYQQNPYNPRGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFHIRCFTCQVCGCGLAQSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MNTSIPYQQNPYNPRGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFHIRCFTCQVCGCGLAQSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHPKCFVCSLCRKPFPIGDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHPKCFVCSLCRKPFPIGDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VTFSGKECVCQTCSQSMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQSLLALDKQWHVSCFKCQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VTFSGKECVCQTCSQSMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQSLLALDKQWHVSCFKCQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLEAGGKHYHPTCARCVRCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 CSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLEAGGKHYHPTCARCVRCH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTSETSISPPGSSIGSPNRVICAKVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTSETSISPPGSSIGSPNRVICAKVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLISYEPHSRYMSDEMLERCGYGESLGTLSPYSQDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLISYEPHSRYMSDEMLERCGYGESLGTLSPYSQDI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD YENLDLRQRRASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHHYYRSGPESGRSSPYHSQLDVRSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 YENLDLRQRRASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHHYYRS-------------------
370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TPTSYQAPKHFHIPAGDSNIYRKPPIYKRHGDLSTATKSKTSEDISQTSKYSPIYSPDPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 --------------AGDSNIYRKPPIYKRHGDLSTATKSKTSEDISQTSKYSPIYSPDPY
410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KSD YASESEYWTYHGSPKVPRARRFSSGGEEDDFDRSMHKLQSGIGRLILKEEMKARSSSYAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 YASESEYWTYHGSPKVPRARRFSSGGEEDDFDRSMHKLQSGIGRLILKEEMKARSSSYAD
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PWTPPRSSTSSREALHTAGYEMSLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRRNGLHRTPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PWTPPRSSTSSREALHTAGYEMSLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRRNGLHRTPSA
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KSD DLFHYDSMNAVNWGMREYKIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRTRLERHLSQEEFYQVFGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DLFHYDSMNAVNWGMREYKIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRTRLERHLSQEEFYQVFGM
570 580 590 600 610 620
670 680
pF1KSD TISEFDRLALWKRNELKKQARLF
:::::::::::::::::::::::
CCDS78 TISEFDRLALWKRNELKKQARLF
630 640 650
>>CCDS7590.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 (778 aa)
initn: 1706 init1: 729 opt: 2234 Z-score: 1444.7 bits: 277.9 E(32554): 3.8e-74
Smith-Waterman score: 2523; 52.7% identity (74.4% similar) in 730 aa overlap (2-683:76-778)
10 20
pF1KSD MNTSIPYQQNPYNPRGSSN--VIQCYRCGDT
:. :. .: .:. :. ::.:..::.
CCDS75 GTSFTAHRRATITHLLYLCPKDYCPRGRVCNSVDPFVAHPQDPHHPSEKPVIHCHKCGEP
50 60 70 80 90 100
30 40 50 60 70 80
pF1KSD CKGEVVRVHNNHFHIRCFTCQVCGCGLAQSGFFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFI
:::::.::...::::.::::.:::: :::.:::.:: ::.:: :::..::::: .: .:.
CCDS75 CKGEVLRVQTKHFHIKCFTCKVCGCDLAQGGFFIKNGEYLCTLDYQRMYGTRCHGCGEFV
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KSD TGEVISALGRTYHPKCFVCSLCRKPFPIGDKVTFSGKECVCQTCSQSMASSKPIKIRGPS
:::..:::.::::.::.:..:..::: ::.:::.:..:.:: :.: :.:: : . :
CCDS75 EGEVVTALGKTYHPNCFACTICKRPFPPGDRVTFNGRDCLCQLCAQPMSSS-PKETTFSS
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KSD HCAGCKEEIKHGQSLLALDKQWHVSCFKCQTCSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIK
.:::: ..::.::.:::::::::..::::..:. .::::::::::.::::.::.. ::.:
CCDS75 NCAGCGRDIKNGQALLALDKQWHLGCFKCKSCGKVLTGEYISKDGAPYCEKDYQGLFGVK
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240 250 260
pF1KSD CETCDRYISGRVLEAGGKHYHPTCARCVRCHQMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEK
::.: ..:.:.::::: :::::.:::: ::.::::::::::: :: :::: :::....:.
CCDS75 CEACHQFITGKVLEAGDKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEE
290 300 310 320 330 340
270 280 290 300 310 320
pF1KSD KLKHRRTSETSI-SPPGSSI-GSPNRVICAKVDNEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLI
::. ::: :: : ::::: :::...: ::::::::.::::::.::::.::...:::::
CCDS75 KLRPTRTSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLI
350 360 370 380 390 400
330 340 350 360 370 380
pF1KSD SYEPHSRYMSDEMLERCGYGESLGTLSPY-SQDIYENLDLRQR---RASSPGYIDSPTYS
.::: :. :: . ::: :::: : . :. :.:.: :..: : :.::.::
CCDS75 TYEPFYTSGYDDKQERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQ--DVRDRMIHRSTSQGSINSPVYS
410 420 430 440 450 460
390 400 410 420 430 440
pF1KSD RQGMSPTFSRSPHHYYRSG--PESGRSSPYHSQLDVRSSTPTSYQAPKHFHIPAGDSNIY
:....:: ::::.:..: : : :::.:: . : : ::: :::::::.: :::
CCDS75 RHSYTPTTSRSPQHFHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIY
470 480 490 500 510 520
450 460 470 480 490
pF1KSD RKPPIYKRHGDLSTATKSKTSEDISQTSKYSPIYSPDPYYAS--ESEYWTYHGSPKV--P
:::::::.:. : :..::.:::: . ::. .::: . :...: : : :
CCDS75 RKPPIYKQHAAL--AAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDPSETPKIETDHWPGPPSFAVVGP
530 540 550 560 570 580
500 510 520 530 540
pF1KSD RARRFSSGGEEDDFD---------RSMHKLQSGIGRLILKEEMKARSSSYADPWTPPRSS
.: ::: :::: . ... ::.::.:.:::::::. .: :::
CCDS75 DMKRRSSGREEDDEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESRE--------RSS
590 600 610 620 630
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TSSREALHTAGYEMSLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRRNGLHRTPSADLFHYDSM
: .. :. .:.. :: . ::.::::.: :::::: :.:. .:.:.
CCDS75 ------LLASRYDSPINSA--SHIPS------SKTASLPGYGRNGLHRPVSTDFAQYNSY
640 650 660 670
610 620 630 640
pF1KSD NAVNWGMREY-------------------------KIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRT
. :. :.:.: ::.:::.:.::.::::.. ..::::
CCDS75 GDVSGGVRDYQTLPDGHMPAMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILREVDRT
680 690 700 710 720 730
650 660 670 680
pF1KSD RLERHLSQEEFYQVFGMTISEFDRLALWKRNELKKQARLF
::::::. : : ..:::.:.::::: ::.::..::.:.::
CCDS75 RLERHLAPEVFREIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF
740 750 760 770
>>CCDS31288.1 ABLIM1 gene_id:3983|Hs108|chr10 (718 aa)
initn: 1706 init1: 729 opt: 2232 Z-score: 1443.8 bits: 277.6 E(32554): 4.2e-74
Smith-Waterman score: 2521; 52.7% identity (74.7% similar) in 727 aa overlap (5-683:22-718)
10 20 30 40
pF1KSD MNTSIPYQQNPYNPRGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFH
. . :.:..: . . ::.:..::. :::::.::...:::
CCDS31 MLMTLEMTELTDPHHTMGDYKVAHPQDPHHP-SEKPVIHCHKCGEPCKGEVLRVQTKHFH
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD IRCFTCQVCGCGLAQSGFFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHP
:.::::.:::: :::.:::.:: ::.:: :::..::::: .: .:. :::..:::.::::
CCDS31 IKCFTCKVCGCDLAQGGFFIKNGEYLCTLDYQRMYGTRCHGCGEFVEGEVVTALGKTYHP
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KSD KCFVCSLCRKPFPIGDKVTFSGKECVCQTCSQSMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQS
.::.:..:..::: ::.:::.:..:.:: :.: :.:: : . :.:::: ..::.::.
CCDS31 NCFACTICKRPFPPGDRVTFNGRDCLCQLCAQPMSSS-PKETTFSSNCAGCGRDIKNGQA
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LLALDKQWHVSCFKCQTCSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLE
:::::::::..::::..:. .::::::::::.::::.::.. ::.:::.: ..:.:.:::
CCDS31 LLALDKQWHLGCFKCKSCGKVLTGEYISKDGAPYCEKDYQGLFGVKCEACHQFITGKVLE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD AGGKHYHPTCARCVRCHQMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTSETSI-S
:: :::::.:::: ::.::::::::::: :: :::: :::....:.::. ::: :: :
CCDS31 AGDKHYHPSCARCSRCNQMFTEGEEMYLQGSTVWHPDCKQSTKTEEKLRPTRTSSESIYS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD PPGSSI-GSPNRVICAKVDNEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLISYEPHSRYMSDEML
::::: :::...: ::::::::.::::::.::::.::...:::::.::: :.
CCDS31 RPGSSIPGSPGHTIYAKVDNEILDYKDLAAIPKVKAIYDIERPDLITYEPFYTSGYDDKQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KSD ERCGYGESLGTLSPY-SQDIYENLDLRQR---RASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHH
:: . ::: :::: : . :. :.:.: :..: : :.::.:::....:: ::::.:
CCDS31 ERQSLGESPRTLSPTPSAEGYQ--DVRDRMIHRSTSQGSINSPVYSRHSYTPTTSRSPQH
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KSD YYRSG--PESGRSSPYHSQLDVRSSTPTSYQAPKHFHIPAGDSNIYRKPPIYKRHGDLST
..: : : :::.:: . : : ::: :::::::.: ::::::::::.:. :
CCDS31 FHRPGNEPSSGRNSPLPYRPDSRPLTPTYAQAPKHFHVPDQGINIYRKPPIYKQHAAL--
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500
pF1KSD ATKSKTSEDISQTSKYSPIYSPDPYYAS--ESEYWTYHGSPKV----PRARRFSSGGEED
:..::.:::: . ::. .::: . :...: : :. : .: ::: :::
CCDS31 AAQSKSSEDIIKFSKFPAAQAPDPSETPKIETDHWP--GPPSFAVVGPDMKRRSSGREED
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KSD DFD---------RSMHKLQSGIGRLILKEEMKARSSSYADPWTPPRSSTSSREALHTAGY
: . ... ::.::.:.:::::::. .: ::: : .. :
CCDS31 DEELLRRRQLQEEQLMKLNSGLGQLILKEEMEKESR--------ERSS------LLASRY
540 550 560 570
570 580 590 600 610
pF1KSD EMSLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRRNGLHRTPSADLFHYDSMNAVNWGMREY--
. .:.. :: . ::.::::.: :::::: :.:. .:.:.. :. :.:.:
CCDS31 DSPINSA--SHIPS------SKTASLPGYGRNGLHRPVSTDFAQYNSYGDVSGGVRDYQT
580 590 600 610 620 630
620 630 640 650
pF1KSD -----------------------KIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRTRLERHLSQEEFY
::.:::.:.::.::::.. ..::::::::::. : :
CCDS31 LPDGHMPAMRMDRGVSMPNMLEPKIFPYEMLMVTNRGRNKILREVDRTRLERHLAPEVFR
640 650 660 670 680 690
660 670 680
pF1KSD QVFGMTISEFDRLALWKRNELKKQARLF
..:::.:.::::: ::.::..::.:.::
CCDS31 EIFGMSIQEFDRLPLWRRNDMKKKAKLF
700 710
>>CCDS78071.1 ABLIM3 gene_id:22885|Hs108|chr5 (544 aa)
initn: 3484 init1: 2171 opt: 2209 Z-score: 1430.7 bits: 274.8 E(32554): 2.3e-73
Smith-Waterman score: 3540; 82.8% identity (82.8% similar) in 646 aa overlap (1-646:1-535)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNTSIPYQQNPYNPRGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFHIRCFTCQVCGCGLAQSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MNTSIPYQQNPYNPRGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFHIRCFTCQVCGCGLAQSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD FFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHPKCFVCSLCRKPFPIGDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 FFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHPKCFVCSLCRKPFPIGDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VTFSGKECVCQTCSQSMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQSLLALDKQWHVSCFKCQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VTFSGKECVCQTCSQSMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQSLLALDKQWHVSCFKCQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD CSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLEAGGKHYHPTCARCVRCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 CSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLEAGGKHYHPTCARCVRCH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTSETSISPPGSSIGSPNRVICAKVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 QMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTSETSISPPGSSIGSPNRVIC----
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KSD NEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLISYEPHSRYMSDEMLERCGYGESLGTLSPYSQDI
::
CCDS78 ----------------------------------------------------------DI
370 380 390 400 410 420
pF1KSD YENLDLRQRRASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHHYYRSGPESGRSSPYHSQLDVRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 YENLDLRQRRASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHHYYRSG------------------
300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KSD TPTSYQAPKHFHIPAGDSNIYRKPPIYKRHGDLSTATKSKTSEDISQTSKYSPIYSPDPY
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 -------------------------------DLSTATKSKTSEDISQTSKYSPIYSPDPY
350 360
490 500 510 520 530 540
pF1KSD YASESEYWTYHGSPKVPRARRFSSGGEEDDFDRSMHKLQSGIGRLILKEEMKARSSSYAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 YASESEYWTYHGSPKVPRARRFSSGGEEDDFDRSMHKLQSGIGRLILKEEMKARSSSYAD
370 380 390 400 410 420
550 560 570 580 590 600
pF1KSD PWTPPRSSTSSREALHTAGYEMSLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRRNGLHRTPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PWTPPRSSTSSREALHTAGYEMSLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRRNGLHRTPSA
430 440 450 460 470 480
610 620 630 640 650 660
pF1KSD DLFHYDSMNAVNWGMREYKIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRTRLERHLSQEEFYQVFGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DLFHYDSMNAVNWGMREYKIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRTRLEGNFWKSGCL
490 500 510 520 530 540
670 680
pF1KSD TISEFDRLALWKRNELKKQARLF
>>CCDS47015.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 (531 aa)
initn: 1887 init1: 704 opt: 1646 Z-score: 1071.4 bits: 208.3 E(32554): 2.3e-53
Smith-Waterman score: 1764; 45.1% identity (62.5% similar) in 688 aa overlap (3-683:2-531)
10 20 30 40 50
pF1KSD MNTSIPYQQNPYNP--RGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFHIRCFTCQVCGCGLAQ
... : .: .. :..: : ::..:::::.::....:::.::.:..::: ::.
CCDS47 MSAVSQPQAAPSPLEKSPSTAILCNTCGNVCKGEVLRVQDKYFHIKCFVCKACGCDLAE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SGFFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHPKCFVCSLCRKPFPIG
.::: .. ::::: :::.:::::: :: .:: :::.::::.:::: ::::..:: ::: :
CCDS47 GGFFVRQGEYICTLDYQRLYGTRCFSCDQFIEGEVVSALGKTYHPDCFVCAVCRLPFPPG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DKVTFSGKECVCQTCSQ--SMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQSLLALDKQWHVSCF
:.:::.::::.:: :: :..:: .. .: :.:: :::.::.:.::::.::..::
CCDS47 DRVTFNGKECMCQKCSLPVSVGSSAHLS-QGLRSCGGCGTEIKNGQALVALDKHWHLGCF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KCQTCSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLEAGGKHYHPTCARC
::..:. .:..:::::::.::::.::::.:::.:..:..::.::::::: :::::.:: :
CCDS47 KCKSCGKLLNAEYISKDGLPYCEADYHAKFGIRCDSCEKYITGRVLEAGEKHYHPSCALC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VRCHQMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTS-ETSISPPGSSI-GSPNRV
::: :::.::::::: :: .::: :.::::.: . :. ::: :. :: :.:: :::.::
CCDS47 VRCGQMFAEGEEMYLQGSSIWHPACRQAARTEDRNKETRTSSESIISVPASSTSGSPSRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ICAKVDNEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLISYEPHSRYMSDEMLERCGYGESLGTLS
: ::. .:::.:.::::::: :.::...:::.::: : :.: .: .:::: ::
CCDS47 IYAKLGGEILDYRDLAALPKSKAIYDIDRPDMISYSP---YISHSAGDRQSYGESPQLLS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PY-SQDIYENLDLRQRRASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHHYYRSGPESGRSSPYHS
: .. .. . .: :.:::. : . .: ..:: ::::.:: :
CCDS47 PTPTEGDQDDRSYKQCRTSSPSSTGSVSLGR--YTPT-SRSPQHYSR-------------
360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QLDVRSSTPTSYQAPKHFHIPAGDSNIYRKPPIYKRHGDLSTATKSKTSEDISQTSKYSP
CCDS47 ------------------------------------------------------------
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IYSPDPYYASESEYWTYHGSPKVPRARRFSSGGEEDDFDRSMHKLQSGIGRLILKEEMKA
: ::: : ::. ..:.. .: .: :.:: . .
CCDS47 -----------------------PAARR--SDGEDGSLDQDNRKKSSW---LMLKGDADT
400 410 420 430
540 550 560 570 580 590
pF1KSD RSSSYADPWTPPRSSTSSREALHTAGYEMSLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRRNG
:..: : .:.: :..: .: ::: : :
CCDS47 RTNS-------PDLDTQSLS--HSSG--------------TDRDPL---------QRMAG
440 450
600 610 620 630 640 650
pF1KSD LHRTPSADLFHYDSMNAVNWGMREYKIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRTRLERHLSQEE
: :: .::::::. :.::.: : .::::::::::::::: ::
CCDS47 -------DSFH-----------SQYKIYPYDSLIVTNRIRVKLPKDVDRTRLERHLSPEE
460 470 480 490 500
660 670 680
pF1KSD FYQVFGMTISEFDRLALWKRNELKKQARLF
: .::::.: :::::::::::.:::.: ::
CCDS47 FQEVFGMSIEEFDRLALWKRNDLKKKALLF
510 520 530
>>CCDS47016.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 (470 aa)
initn: 1560 init1: 704 opt: 1644 Z-score: 1070.8 bits: 208.0 E(32554): 2.5e-53
Smith-Waterman score: 1647; 52.0% identity (75.6% similar) in 467 aa overlap (3-462:2-448)
10 20 30 40 50
pF1KSD MNTSIPYQQNPYNP--RGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFHIRCFTCQVCGCGLAQ
... : .: .. :..: : ::..:::::.::....:::.::.:..::: ::.
CCDS47 MSAVSQPQAAPSPLEKSPSTAILCNTCGNVCKGEVLRVQDKYFHIKCFVCKACGCDLAE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SGFFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHPKCFVCSLCRKPFPIG
.::: .. ::::: :::.:::::: :: .:: :::.::::.:::: ::::..:: ::: :
CCDS47 GGFFVRQGEYICTLDYQRLYGTRCFSCDQFIEGEVVSALGKTYHPDCFVCAVCRLPFPPG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DKVTFSGKECVCQTCSQ--SMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQSLLALDKQWHVSCF
:.:::.::::.:: :: :..:: .. .: :.:: :::.::.:.::::.::..::
CCDS47 DRVTFNGKECMCQKCSLPVSVGSSAHLS-QGLRSCGGCGTEIKNGQALVALDKHWHLGCF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KCQTCSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLEAGGKHYHPTCARC
::..:. .:..:::::::.::::.::::.:::.:..:..::.::::::: :::::.:: :
CCDS47 KCKSCGKLLNAEYISKDGLPYCEADYHAKFGIRCDSCEKYITGRVLEAGEKHYHPSCALC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VRCHQMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTS-ETSISPPGSSI-GSPNRV
::: :::.::::::: :: .::: :.::::.: . :. ::: :. :: :.:: :::.::
CCDS47 VRCGQMFAEGEEMYLQGSSIWHPACRQAARTEDRNKETRTSSESIISVPASSTSGSPSRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ICAKVDNEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLISYEPHSRYMSDEMLERCGYGESLGTLS
: ::. .:::.:.::::::: :.::...:::.::: : :.: .: .:::: ::
CCDS47 IYAKLGGEILDYRDLAALPKSKAIYDIDRPDMISYSP---YISHSAGDRQSYGESPQLLS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PY-SQDIYENLDLRQRRASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHHYYRSGPESGRSSPYHS
: .. .. . .: :.:::. : . .: ..:: ::::.:: : : . ::. .
CCDS47 PTPTEGDQDDRSYKQCRTSSPSSTGSVSLGR--YTPT-SRSPQHYSR--PAARRSDGEDG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD QLDVRSSTPTSYQAPKHFHIPAGDSNIYRKPPIYKRHGDLSTATKSKTSEDISQTSKYSP
.:: . . . . . ::.. . : ::.: . :..:
CCDS47 SLD-----QDNRKQKSSWLMLKGDADTRTNSP------DLDTQSLSHSSGTDRDPLQRMA
420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KSD IYSPDPYYASESEYWTYHGSPKVPRARRFSSGGEEDDFDRSMHKLQSGIGRLILKEEMKA
CCDS47 GDSFHSREWFF
460 470
>>CCDS47013.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 (611 aa)
initn: 2068 init1: 704 opt: 1597 Z-score: 1039.3 bits: 202.6 E(32554): 1.4e-51
Smith-Waterman score: 2126; 49.8% identity (70.6% similar) in 691 aa overlap (3-683:2-611)
10 20 30 40 50
pF1KSD MNTSIPYQQNPYNP--RGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFHIRCFTCQVCGCGLAQ
... : .: .. :..: : ::..:::::.::....:::.::.:..::: ::.
CCDS47 MSAVSQPQAAPSPLEKSPSTAILCNTCGNVCKGEVLRVQDKYFHIKCFVCKACGCDLAE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SGFFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHPKCFVCSLCRKPFPIG
.::: .. ::::: :::.:::::: :: .:: :::.::::.:::: ::::..:: ::: :
CCDS47 GGFFVRQGEYICTLDYQRLYGTRCFSCDQFIEGEVVSALGKTYHPDCFVCAVCRLPFPPG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DKVTFSGKECVCQTCSQ--SMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQSLLALDKQWHVSCF
:.:::.::::.:: :: :..:: .. .: :.:: :::.::.:.::::.::..::
CCDS47 DRVTFNGKECMCQKCSLPVSVGSSAHLS-QGLRSCGGCGTEIKNGQALVALDKHWHLGCF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KCQTCSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLEAGGKHYHPTCARC
::..:. .:..:::::::.::::.::::.:::.:..:..::.::::::: :::::.:: :
CCDS47 KCKSCGKLLNAEYISKDGLPYCEADYHAKFGIRCDSCEKYITGRVLEAGEKHYHPSCALC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VRCHQMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTS-ETSISPPGSSI-GSPNRV
::: :::.::::::: :: .::: :.::::.: . :. ::: :. :: :.:: :::.::
CCDS47 VRCGQMFAEGEEMYLQGSSIWHPACRQAARTEDRNKETRTSSESIISVPASSTSGSPSRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ICAKVDNEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLISYEPHSRYMSDEMLERCGYGESLGTLS
: ::. .:::.:.::::::: :.::...:::.::: : :.: .: .:::.
CCDS47 IYAKLGGEILDYRDLAALPKSKAIYDIDRPDMISYSP---YISHSAGDRQSYGEG-----
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PYSQDIYENLDLRQRRASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHHYYRSGPESGRSSPYHSQ
.:: . . .: :.:::. : . .: ..:: ::::.:: : : :::::.: :
CCDS47 --DQD---DRSYKQCRTSSPSSTGSVSLGR--YTPT-SRSPQHYSRPGSESGRSTPSLSV
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LDVRSSTPTSYQ-APKHFHIP-AG-DSNIYRKPPIYKRHGDLSTATKSKTSEDISQTSKY
:. . :..:: ::.:::.: .: .:::::::::..:.
CCDS47 LSDSKPPPSTYQQAPRHFHVPDTGVKDNIYRKPPIYRQHA--------------------
410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KSD SPIYSPDPYYASESEYWTYHGSPKVPRARRFSSGGEEDDFDRSMHKLQSGIGRLILKEEM
::: : ::. ..:.. .: .: :.:: .
CCDS47 ---------------------------ARR--SDGEDGSLDQDNRKKSSW---LMLKGDA
450 460 470
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KARSSSYA-DPWTPPRSSTSSREALHTAGYEMSLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYR
.:..: : . .:: ..:. :. . . . : :. :::: :..
CCDS47 DTRTNSPDLDTQSLSHSSGTDRDPLQRMAGDSFHSRFPYSK----SDPL-------PGHG
480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KSD RNGLHRTPSADLFHYDSMNAVNWGMREYKIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRTRLERHLS
.::: . .:.: . ..:::::::::::. :.::.: : .:::::::::::::::
CCDS47 KNGLDQR-NANLAPCGADPDASWGMREYKIYPYDSLIVTNRIRVKLPKDVDRTRLERHLS
520 530 540 550 560 570
660 670 680
pF1KSD QEEFYQVFGMTISEFDRLALWKRNELKKQARLF
::: .::::.: :::::::::::.:::.: ::
CCDS47 PEEFQEVFGMSIEEFDRLALWKRNDLKKKALLF
580 590 600 610
>>CCDS47012.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 (572 aa)
initn: 2026 init1: 704 opt: 1587 Z-score: 1033.3 bits: 201.4 E(32554): 3.1e-51
Smith-Waterman score: 2009; 48.7% identity (67.7% similar) in 690 aa overlap (3-683:2-572)
10 20 30 40 50
pF1KSD MNTSIPYQQNPYNP--RGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFHIRCFTCQVCGCGLAQ
... : .: .. :..: : ::..:::::.::....:::.::.:..::: ::.
CCDS47 MSAVSQPQAAPSPLEKSPSTAILCNTCGNVCKGEVLRVQDKYFHIKCFVCKACGCDLAE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SGFFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHPKCFVCSLCRKPFPIG
.::: .. ::::: :::.:::::: :: .:: :::.::::.:::: ::::..:: ::: :
CCDS47 GGFFVRQGEYICTLDYQRLYGTRCFSCDQFIEGEVVSALGKTYHPDCFVCAVCRLPFPPG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DKVTFSGKECVCQTCSQ--SMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQSLLALDKQWHVSCF
:.:::.::::.:: :: :..:: .. .: :.:: :::.::.:.::::.::..::
CCDS47 DRVTFNGKECMCQKCSLPVSVGSSAHLS-QGLRSCGGCGTEIKNGQALVALDKHWHLGCF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KCQTCSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLEAGGKHYHPTCARC
::..:. .:..:::::::.::::.::::.:::.:..:..::.::::::: :::::.:: :
CCDS47 KCKSCGKLLNAEYISKDGLPYCEADYHAKFGIRCDSCEKYITGRVLEAGEKHYHPSCALC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VRCHQMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTS-ETSISPPGSSI-GSPNRV
::: :::.::::::: :: .::: :.::::.: . :. ::: :. :: :.:: :::.::
CCDS47 VRCGQMFAEGEEMYLQGSSIWHPACRQAARTEDRNKETRTSSESIISVPASSTSGSPSRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ICAKVDNEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLISYEPHSRYMSDEMLERCGYGESLGTLS
: ::. .:::.:.::::::: :.::...:::.::: : :.: .: .:::.
CCDS47 IYAKLGGEILDYRDLAALPKSKAIYDIDRPDMISYSP---YISHSAGDRQSYGEG-----
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PYSQDIYENLDLRQRRASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHHYYRSGPESGRSSPYHSQ
.:: . . .: :.:::. : . .: ..:: ::::.:: : : :::::.: :
CCDS47 --DQD---DRSYKQCRTSSPSSTGSVSLGR--YTPT-SRSPQHYSRPGSESGRSTPSLSV
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LDVRSSTPTSYQ-APKHFHIP-AG-DSNIYRKPPIYKRHGDLSTATKSKTSEDISQTSKY
:. . :..:: ::.:::.: .: .:::::::::..:.
CCDS47 LSDSKPPPSTYQQAPRHFHVPDTGVKDNIYRKPPIYRQHA--------------------
410 420 430 440
480 490 500 510 520 530
pF1KSD SPIYSPDPYYASESEYWTYHGSPKVPRARRFSSGGEEDDFDRSMHKLQSGIGRLILKEEM
::: : ::. ..:.. .: .: :.:: .
CCDS47 ---------------------------ARR--SDGEDGSLDQDNRKKSSW---LMLKGDA
450 460 470
540 550 560 570 580 590
pF1KSD KARSSSYADPWTPPRSSTSSREALHTAGYEMSLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRR
.:..: : .:.: :..: .: ::: :
CCDS47 DTRTNS-------PDLDTQSLS--HSSG--------------TDRDPL---------QRM
480 490
600 610 620 630 640 650
pF1KSD NGLHRTPSADLFHYDSMNAVNWGMREYKIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRTRLERHLSQ
: : :: .::::::. :.::.: : .:::::::::::::::
CCDS47 AG-------DSFH-----------SQYKIYPYDSLIVTNRIRVKLPKDVDRTRLERHLSP
500 510 520 530 540
660 670 680
pF1KSD EEFYQVFGMTISEFDRLALWKRNELKKQARLF
::: .::::.: :::::::::::.:::.: ::
CCDS47 EEFQEVFGMSIEEFDRLALWKRNDLKKKALLF
550 560 570
>>CCDS54719.1 ABLIM2 gene_id:84448|Hs108|chr4 (521 aa)
initn: 1887 init1: 704 opt: 1575 Z-score: 1026.2 bits: 199.9 E(32554): 7.7e-51
Smith-Waterman score: 1740; 44.8% identity (62.3% similar) in 687 aa overlap (3-683:2-521)
10 20 30 40 50
pF1KSD MNTSIPYQQNPYNP--RGSSNVIQCYRCGDTCKGEVVRVHNNHFHIRCFTCQVCGCGLAQ
... : .: .. :..: : ::..:::::.::....:::.::.:..::: ::.
CCDS54 MSAVSQPQAAPSPLEKSPSTAILCNTCGNVCKGEVLRVQDKYFHIKCFVCKACGCDLAE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD SGFFFKNQEYICTQDYQQLYGTRCDSCRDFITGEVISALGRTYHPKCFVCSLCRKPFPIG
.::: .. ::::: :::.:::::: :: .:: :::.::::.:::: ::::..:: ::: :
CCDS54 GGFFVRQGEYICTLDYQRLYGTRCFSCDQFIEGEVVSALGKTYHPDCFVCAVCRLPFPPG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD DKVTFSGKECVCQTCSQ--SMASSKPIKIRGPSHCAGCKEEIKHGQSLLALDKQWHVSCF
:.:::.::::.:: :: :..:: .. .: :.:: :::.::.:.::::.::..::
CCDS54 DRVTFNGKECMCQKCSLPVSVGSSAHLS-QGLRSCGGCGTEIKNGQALVALDKHWHLGCF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD KCQTCSVILTGEYISKDGVPYCESDYHAQFGIKCETCDRYISGRVLEAGGKHYHPTCARC
::..:. .:..:::::::.::::.::::.:::.:..:..::.::::::: :::::.:: :
CCDS54 KCKSCGKLLNAEYISKDGLPYCEADYHAKFGIRCDSCEKYITGRVLEAGEKHYHPSCALC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VRCHQMFTEGEEMYLTGSEVWHPICKQAARAEKKLKHRRTS-ETSISPPGSSI-GSPNRV
::: :::.::::::: :: .::: :.::::.: . :. ::: :. :: :.:: :::.::
CCDS54 VRCGQMFAEGEEMYLQGSSIWHPACRQAARTEDRNKETRTSSESIISVPASSTSGSPSRV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD ICAKVDNEILNYKDLAALPKVKSIYEVQRPDLISYEPHSRYMSDEMLERCGYGESLGTLS
: ::. .:::.:.::::::: :.::...:::.::: : :.: .: .:::.
CCDS54 IYAKLGGEILDYRDLAALPKSKAIYDIDRPDMISYSP---YISHSAGDRQSYGEG-----
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD PYSQDIYENLDLRQRRASSPGYIDSPTYSRQGMSPTFSRSPHHYYRSGPESGRSSPYHSQ
.:: . . .: :.:::. : . .: ..:: ::::.:: :
CCDS54 --DQD---DRSYKQCRTSSPSSTGSVSLGR--YTPT-SRSPQHYSR--------------
360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KSD LDVRSSTPTSYQAPKHFHIPAGDSNIYRKPPIYKRHGDLSTATKSKTSEDISQTSKYSPI
CCDS54 ------------------------------------------------------------
480 490 500 510 520 530
pF1KSD YSPDPYYASESEYWTYHGSPKVPRARRFSSGGEEDDFDRSMHKLQSGIGRLILKEEMKAR
: ::: : ::. ..:.. .: .:. :.:: . .:
CCDS54 ----------------------PAARR--SDGEDGSLDQDNRKQKSSW--LMLKGDADTR
390 400 410 420
540 550 560 570 580 590
pF1KSD SSSYADPWTPPRSSTSSREALHTAGYEMSLNGSPRSHYLADSDPLISKSASLPAYRRNGL
..: : .:.: :..: .: ::: : :
CCDS54 TNS-------PDLDTQSLS--HSSG--------------TDRDPL---------QRMAG-
430 440
600 610 620 630 640 650
pF1KSD HRTPSADLFHYDSMNAVNWGMREYKIYPYELLLVTTRGRNRLPKDVDRTRLERHLSQEEF
: :: .::::::. :.::.: : .::::::::::::::: :::
CCDS54 ------DSFH-----------SQYKIYPYDSLIVTNRIRVKLPKDVDRTRLERHLSPEEF
450 460 470 480 490
660 670 680
pF1KSD YQVFGMTISEFDRLALWKRNELKKQARLF
.::::.: :::::::::::.:::.: ::
CCDS54 QEVFGMSIEEFDRLALWKRNDLKKKALLF
500 510 520
683 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 03:41:20 2016 done: Thu Nov 3 03:41:21 2016
Total Scan time: 4.070 Total Display time: 0.200
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]