Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0654
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0654, 1194 aa
1>>>pF1KSDA0654 1194 - 1194 aa - 1194 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.7674+/-0.000492; mu= -21.7905+/- 0.030
mean_var=582.9136+/-122.769, 0's: 0 Z-trim(121.8): 218 B-trim: 66 in 1/58
Lambda= 0.053122
statistics sampled from 38608 (38849) to 38608 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.753), E-opt: 0.2 (0.455), width: 16
Scan time: 17.040
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003651 (OMIM: 603144) liprin-alpha-3 [Homo sapi (1194) 7774 611.8 7.9e-174
XP_016882896 (OMIM: 603144) PREDICTED: liprin-alph (1185) 6050 479.7 4.7e-134
XP_016873938 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1212) 2530 210.0 7.7e-53
XP_016858099 (OMIM: 603145) PREDICTED: liprin-alph ( 723) 2511 208.3 1.4e-52
XP_016858097 (OMIM: 603145) PREDICTED: liprin-alph (1184) 2496 207.3 4.6e-52
NP_001291261 (OMIM: 603145) liprin-alpha-4 isoform (1198) 2496 207.4 4.6e-52
XP_016858095 (OMIM: 603145) PREDICTED: liprin-alph (1298) 2496 207.4 4.9e-52
NP_803172 (OMIM: 611054) liprin-alpha-1 isoform a (1185) 2413 201.0 3.8e-50
NP_003617 (OMIM: 611054) liprin-alpha-1 isoform b (1202) 2413 201.0 3.8e-50
XP_011543616 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1257) 2362 197.1 6e-49
NP_001207406 (OMIM: 603143) liprin-alpha-2 isoform (1156) 2319 193.8 5.5e-48
XP_016875586 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1230) 2319 193.8 5.7e-48
XP_016875590 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1226) 2297 192.1 1.8e-47
XP_011543617 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1242) 2287 191.3 3.2e-47
XP_016875584 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1233) 2285 191.2 3.5e-47
XP_016875587 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1229) 2282 191.0 4.1e-47
XP_016875596 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1220) 2277 190.6 5.3e-47
XP_016875593 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1223) 2277 190.6 5.3e-47
XP_011543615 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1267) 2277 190.6 5.5e-47
XP_006718779 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1306) 2277 190.6 5.6e-47
XP_011543608 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1306) 2277 190.6 5.6e-47
XP_011543618 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1237) 2271 190.1 7.4e-47
XP_011537208 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1202) 2266 189.7 9.4e-47
XP_011543610 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1296) 2267 189.8 9.5e-47
XP_011543612 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1281) 2262 189.4 1.2e-46
XP_016875598 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1216) 2255 188.9 1.7e-46
XP_016875600 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1210) 2250 188.5 2.2e-46
XP_016875595 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1220) 2250 188.5 2.2e-46
XP_016875597 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1219) 2240 187.7 3.8e-46
XP_006711649 (OMIM: 603145) PREDICTED: liprin-alph (1307) 2224 186.5 9.4e-46
XP_011543620 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph ( 613) 2211 185.3 1e-45
NP_001291260 (OMIM: 603145) liprin-alpha-4 isoform (1207) 2221 186.3 1e-45
XP_011543611 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1295) 2197 184.5 3.9e-45
XP_016858096 (OMIM: 603145) PREDICTED: liprin-alph (1262) 2174 182.7 1.3e-44
XP_016858098 (OMIM: 603145) PREDICTED: liprin-alph (1162) 2171 182.4 1.4e-44
XP_011508372 (OMIM: 603145) PREDICTED: liprin-alph ( 801) 2096 176.6 5.7e-43
XP_011543619 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1227) 1829 156.2 1.2e-36
NP_001207408 (OMIM: 603143) liprin-alpha-2 isoform ( 783) 1523 132.7 9.3e-30
XP_016875594 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1222) 1440 126.4 1.1e-27
XP_016875591 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1226) 1440 126.4 1.1e-27
XP_016875585 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1232) 1440 126.4 1.1e-27
XP_016875583 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1235) 1440 126.4 1.1e-27
XP_011543621 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1233) 1373 121.3 3.8e-26
XP_011543609 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1297) 1369 121.0 4.9e-26
XP_016875599 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1214) 1303 115.9 1.6e-24
XP_016873937 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1266) 1289 114.9 3.4e-24
XP_011543614 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alph (1276) 1270 113.4 9.4e-24
XP_016875588 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1229) 1264 112.9 1.3e-23
NP_001207403 (OMIM: 603143) liprin-alpha-2 isoform (1232) 1264 112.9 1.3e-23
XP_011537209 (OMIM: 603143) PREDICTED: liprin-alph (1233) 1264 112.9 1.3e-23
>>NP_003651 (OMIM: 603144) liprin-alpha-3 [Homo sapiens] (1194 aa)
initn: 7774 init1: 7774 opt: 7774 Z-score: 3241.7 bits: 611.8 E(85289): 7.9e-174
Smith-Waterman score: 7774; 100.0% identity (100.0% similar) in 1194 aa overlap (1-1194:1-1194)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMCEVMPTISEDGRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MMCEVMPTISEDGRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQLRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERNNTRLLLEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERNNTRLLLEHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRMALER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRMALER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VAVLEEELELSNQETLNLREQLSRRRSGLEEPGKDGDGQTLANGLGPGGDSNRRTAELEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VAVLEEELELSNQETLNLREQLSRRRSGLEEPGKDGDGQTLANGLGPGGDSNRRTAELEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQRED
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGALEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNK
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490 500 510 520 530 540
pF1KSD EQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSYSRSLPGSALELRYSQAPTLPSGAHLDPYVAGSGRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSYSRSLPGSALELRYSQAPTLPSGAHLDPYVAGSGRA
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GKRGRWSGVKEEPSKDWERSAPAGSIPPPFPGELDGSDEEEAEGMFGAELLSPSGQADVQ
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610 620 630 640 650 660
pF1KSD TLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLDSLGRYRSSCSLPPSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLDSLGRYRSSCSLPPSLT
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670 680 690 700 710 720
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPAREGTDKANHVPKEEAGAPRGEGPAIPGDTPPPTPR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SARLERMTQALALQAGSLEDGGPPRGSEGTPDSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PPGRDSSSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDG
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pF1KSD PTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGND
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 WLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD RKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDY
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pF1KSD SDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KSD GVTPDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GVTPDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
1150 1160 1170 1180 1190
>>XP_016882896 (OMIM: 603144) PREDICTED: liprin-alpha-3 (1185 aa)
initn: 7699 init1: 6050 opt: 6050 Z-score: 2527.7 bits: 479.7 E(85289): 4.7e-134
Smith-Waterman score: 7685; 99.2% identity (99.2% similar) in 1194 aa overlap (1-1194:1-1185)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMCEVMPTISEDGRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MMCEVMPTISEDGRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQLRL
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70 80 90 100 110 120
pF1KSD RELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERNNTRLLLEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERNNTRLLLEHL
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pF1KSD ECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRMALER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRMALER
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190 200 210 220 230 240
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XP_016 VAVLEEELELSNQETLNLREQLSRRRSGLEEPGKDGDGQTLANGLGPGGDSNRRTAELEE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQRED
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310 320 330 340 350 360
pF1KSD MEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQK
310 320 330 340 350 360
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pF1KSD LQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQRE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGALEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNK
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pF1KSD EQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSYSRSLPGSALELRYSQAPTLPSGAHLDPYVAGSGRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSYSRSLPGSALELRYSQAPTLPSGAHLDPYVAGSGRA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GKRGRWSGVKEEPSKDWERSAPAGSIPPPFPGELDGSDEEEAEGMFGAELLSPSGQADVQ
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pF1KSD TLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLDSLGRYRSSCSLPPSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLDSLGRYRSSCSLPPSLT
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pF1KSD TSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPAREGTDKANHVPKEEAGAPRGEGPAIPGDTPPPTPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPAREGTDKANHVPKEEAGAPRGEGPAIPGDTPPPTPR
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pF1KSD SARLERMTQALALQAGSLEDGGPPRGSEGTPDSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SARLERMTQALALQAGSLEDGGPPRGSEGTPDSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMG
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790 800 810 820 830 840
pF1KSD PPGRDSSSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPGRDSSSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDG
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850 860 870 880 890 900
pF1KSD PTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQE
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
XP_016 MVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKP---------ILAYGDMNHEWVGND
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GVTPDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
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::::::::::: .: :.. : :: : ...:.:::.:: ::.:::.::::.:.
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:: .: .:.:.:::.:::::::. ::::::::::::::.::::::::::::::::::::
XP_016 TLALTQGKLHEVGHERDSLQRQLNTALPQEFAALTKELNVCREQLLEREEEIAELKAERN
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::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPAGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVR
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pF1KSD ERLRMALERVAVLEEELELSNQETLNLREQLSRRRS---GL------EEPGKDGDGQTLA
::::.:::: ..::::: ...: . :.:: ..... :. .: . .:. .
XP_016 ERLRVALERCSLLEEELGATHKELMILKEQNNQKKTLTDGVLDINHEQENTPSTSGKRSS
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pF1KSD NGLGPGGDSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEE
.: .. .. ::.: . .: : :..:::: : ....:::.: ::...: :.::
XP_016 DGSLSHEEDLAKVIELQEIISKQSREQSQMKERLASLSSHVTELEEDLDTARKDLIKSEE
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pF1KSD ANSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQ
:.:::::..::.::.:::::::::::::::.:::::::.:: :::::::.:.:.:..::
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.:.:.::: : :. :.:::::::.:::::::.::.::::::::.::::::::.::::::.
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:::::::::::::::::::::..::::::.:::::::::::::::::::::.:::.::::
XP_016 EAQLEEKNQELQRARQREKMNEEHNKRLSDTVDKLLSESNERLQLHLKERMAALEDKNSL
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.:. . :: .: .:.::. ..: .. :.:..: : : ..: ::. ..:. .:
XP_016 LREVESAKKQLEETQHDKDQLVLNIEALRAELDHMRLRGASLHHGRPHLGSVPDFRFPMA
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.: : : ... : ..:: .....:::: ::::. :. .. :
XP_016 D-----GHTDSYSTSAVLRRPQKGRLAALRDEPSKVQTLNEQDWERAQQASVLANVAQAF
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.. : :: :.. . .... .:::::::::..:::.::::::.::::::.:::::::.::
XP_016 ESDADVSDGEDDRDTLLSSVDLLSPSGQADAHTLAMMLQEQLDAINKEIRLIQEEKENTE
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:::::.::::.:..::.:::.:: :.:: .:.::: :::.::.:::: : :::::
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pF1KSD ---G-----TDKANH---VP--KEEAGAPRGEGPAIPGDTPPPT-PRSARLERMTQALAL
: .: .: .: .::. : . .: .: ::. ::. ::.:. .. ::
XP_016 DRLGVMTLPSDLRKHRRKLPPSREEV---RDDKTTIKCETSPPSSPRALRLDRLHKG-AL
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.. : :: :: : .:... ::::::::::.::::::::::::::::
XP_016 HTVSHEDIRDIRNSTGSQDGPVSNPSSSNSSQDSLHKAPKKKGIKSSIGRLFGKKEKGRP
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: :... . ::. .. . : :::.:: : ..:.:. ..:::::::: ::::::: ::
XP_016 GQTGKEALGQAGVSETDNSSQDALGLSKLGGQAEKNRKLQKKHELLEEARRQGLPFAQWD
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pF1KSD GPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQ
::::: ::::::::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GPTVVVWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMSALSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQ
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pF1KSD EMVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGN
:..:::::::: .:::. ::::::::::.::
XP_016 EIMSLTSPSAPPTSRTT------------------------------LAYGDMNHEWIGN
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960 970 980 990 1000 1010
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.:::::::::::::::: ::::::::::.::.::::::::::::: :.. :::::.::::
XP_016 EWLPSLGLPQYRSYFMECLVDARMLDHLTKKDLRGQLKMVDSFHRNSFQCGIMCLRRLNY
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pF1KSD DRKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFD
:::.:::.:::::..:.::.::::.::. :. ..::::.:.:: ::::::::::::::::
XP_016 DRKELERKREESQSEIKDVLVWSNDRVIRWILSIGLKEYANNLIESGVHGALLALDETFD
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pF1KSD YSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDL
.: :::::::::::.::: .::.::.::. .:::::.:::. ::: :.::::: :: ::.
XP_016 FSALALLLQIPTQNTQARAVLEREFNNLLVMGTDRRFDEDDDKSFRRAPSWRKKFRPKDI
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pF1KSD RGVTPDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
::.. ::: :: ::: ......::.. .:.: .:..::..: :...::::::
XP_016 RGLAAGSAETLPANFR--VTSSMSSPSMQPKKMQMDGNVSGTQRLDSATVRTYSC
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::::::::.: : : : : : ...:.:::.:: :::.:::.:::.:. ::..: ::
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.. ::.:.:::.:. :::::::.::.::..::::::::::::.::::::::::::::::
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:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
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:..:::.: ..:.. :.. . : .. :: : :. ::: ... :. :
XP_016 VTTLEEQLAGAHQQVSALQQGAGVRDGAAEEEG------TVE--LGPKRLWKEDTGRVEE
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pF1KSD LEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQ
:.: ::.: :. : ::::..: ...:::.::::.:.: :.:: .:: ::::.:::::
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pF1KSD REDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDA
.:::::::::::::::.:::::::.:: :::::::::.::::.:: :::.:.: : :. :
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pF1KSD KQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRAR
.::::::..:::::::.::.::::.:::.::::::::.::.:::::.::::::::: :.:
XP_016 EQKLQQTMRKAETLPEVEAELAQRIAALTKAEERHGNIEEHLRQLEGQLEEKNQELARVR
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pF1KSD QREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGALEEKNSLSEEIANMKKLQDELL
::::::.:::::::.:::.:::::::::::::::::.::::::.: .:. . .. .:
XP_016 QREKMNEDHNKRLSDTVDRLLSESNERLQLHLKERMAALEEKNTLIQELESSQRQIEEQH
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pF1KSD LNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGR--P--PSSYSRSLPGSALELRYSQAPTLPSGAHLDPY
.: .: :.:....:.:::.:: : . .::: ::: ..:.: : . .: :
XP_016 HHKGRLSEEIEKLRQEVDQLKGRGGPFVDGVHSRSHMGSAADVRFS----LGTTTHAPP-
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pF1KSD VAGSGRAGKRGRWSGVKEEPSKDWERSAPAGSIPP---P-FPG--ELDGSDEEEAEGMFG
: . :.:...:: .:::: : : . : : : . :.. ::.: :. :
XP_016 -------GVHRRYSALREESAKDWETSPLPGMLAPAAGPAFDSDPEISDVDEDEPGGLVG
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pF1KSD -AELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLDSL
:...::::..:.::::.::::::.:::.::..::::::.:: ::::.:.::.:.....:
XP_016 SADVVSPSGHSDAQTLAMMLQEQLDAINEEIRMIQEEKESTELRAEEIETRVTSGSMEAL
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pF1KSD G--RYRSSCSLPPSLTTSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPAREGTDKAN--HVPKEEAGA
. . :. :.: :::. .::: ::: ::.:::.:. : :.. :. . .:..
XP_016 NLKQLRKRGSIPTSLTALSLASASPPLSGRSTPKLTSRSAAQD-LDRMGVMTLPSDLRKH
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pF1KSD PRGEGPAIPGDTPPPTPRSARLERMTQALALQAGSLEDGGPPRGSEGTPDSLHKAPKKKS
: : .. ::.:. .:
XP_016 RRKLLDAAAREAWPPSPEPGRRQEFC
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pF1KSD MMCEVMPTISEDGRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQLRL
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XP_016 MCEVMPTINEGDRLGPPHGAD-ADANFEQLMVNMLDEREKLLESLRESQETLAATQSRL
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.. ::.:.:::.:. :::::::.::.::..::::::::::::.::::::::::::::::
XP_016 QDAIHERDQLQRHLNSALPQEFATLTRELSMCREQLLEREEEISELKAERNNTRLLLEHL
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pF1KSD ECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRMALER
:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
XP_016 ECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPSGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRAALER
120 130 140 150 160 170
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pF1KSD VAVLEEELELSNQETLNLREQLSRRRSGLEEPGKDGDGQTLANGLGPG---GDSNRRTAE
:..:::.: ..:.. :.. . : .. :: : :. ::: ... :. :
XP_016 VTTLEEQLAGAHQQVSALQQGAGVRDGAAEEEG------TVE--LGPKRLWKEDTGRVEE
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pF1KSD LEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQ
:.: ::.: :. : ::::..: ...:::.::::.:.: :.:: .:: ::::.:::::
XP_016 LQELLEKQNFELSQARERLVTLTTTVTELEEDLGTARRDLIKSEELSSKHQRDLREALAQ
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pF1KSD REDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDA
.:::::::::::::::.:::::::.:: :::::::::.::::.:: :::.:.: : :. :
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pF1KSD KQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRAR
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::::::.:::::::.:::.:::::::::::::::::.::::::.: .:. . .. .:
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XP_016 HHKGRLSEEIEKLRQEVDQLKGRGGPFVDGVHSRSHMGSAADVRFS----LGTTTHAPP-
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pF1KSD VAGSGRAGKRGRWSGVKEEPSKDWERSAPAGSIPP---P-FPG--ELDGSDEEEAEGMFG
: . :.:...:: .:::: : : . : : : . :.. ::.: :. :
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pF1KSD G--RYRSSCSLPPSLTTSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPA----REG-----TDKANHV
. . :. :.: :::. .::: ::: ::.:::.:. : : : : .: .:
XP_016 NLKQLRKRGSIPTSLTALSLASASPPLSGRSTPKLTSRSAAQDLDRMGVMTLPSDLRKHR
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pF1KSD PKEEAGAPRGEG----PAIPGDTPPPT-PRSARLERMTQ-ALALQAG--SLED-GGPPRG
: . . : :. .: .: ::. ::. :::.. . ::. . : .::: :. : .
XP_016 RKLLSPVSREENREDKATIKCETSPPSSPRTLRLEKLGHPALSQEEGKSALEDQGSNPSS
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XP_016 SNSSQDSLHKGAKRKGIKSSIGRLFGKKEKGRLIQLSRDGATGHVLLTDSEFSMQEPMVP
760 770 780 790 800 810
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::: ..:::: :.::.:::.: :.:.::: ::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AKLGTQAEKDRRLKKKHQLLEDARRKGMPFAQWDGPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANV
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870 880 890 900 910 920
pF1KSD KSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHE
::::::. :::::::::::::: :::::::::::::::::::::: .::::.::::.:::
XP_016 KSGAIMSALSDTEIQREIGISNALHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPPTSRTSSGNVWVTHE
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pF1KSD EMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLD
:::.: ..:: ::::::::::.::.:::::::::::::::: ::::::::
XP_016 EMETLETSTKTT---------LAYGDMNHEWIGNEWLPSLGLPQYRSYFMECLVDARMLD
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pF1KSD HLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYDRKDLERRREESQTQIRDVMVWSNER
::.::.:: .:::::::::.::.::::::::::::::.::.:::::: .:.::.::.:..
XP_016 HLTKKDLRVHLKMVDSFHRTSLQYGIMCLKRLNYDRKELEKRREESQHEIKDVLVWTNDQ
990 1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KSD VMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFS
:. ::...::...: :: :::::::::::::.::.. :::.:::::::.::::..:.::.
XP_016 VVHWVQSIGLRDYAGNLHESGVHGALLALDENFDHNTLALILQIPTQNTQARQVMEREFN
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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pF1KSD NLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLRG---VTPDSAEMLPPNFRSAAAGAL
::..:::::.::. . : : :.::::: :: .. .: . ::: :: .:: .. :.:
XP_016 NLLALGTDRKLDDGDDKVFRRAPSWRKRFRPREHHGRGGMLSASAETLPAGFRVSTLGTL
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1170 1180 1190
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: : .:..:::.
XP_016 QPPPAPPKKIMPEGE
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::::::::.: : : : : : ...:.:::.:: :::.:::.:::.:. ::..: ::
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.. ::.:.:::.:. :::::::.::.::..::::::::::::.::::::::::::::::
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.:::::::::::::::.:::::::.:: :::::::::.::::.:: :::.:.: : :. :
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.::::::..:::::::.::.::::.:::.::::::::.::.:::::.::::::::: :.:
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::::::.:::::::.:::.:::::::::::::::::.::::::.: .:. . .. .:
NP_001 QREKMNEDHNKRLSDTVDRLLSESNERLQLHLKERMAALEEKNTLIQELESSQRQIEEQH
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pF1KSD LNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGR--P--PSSYSRSLPGSALELRYSQAPTLPSGAHLDPY
.: .: :.:....:.:::.:: : . .::: ::: ..:.: : . .: :
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: . :.:...:: .:::: : : . : : : . :.. ::.: :. :
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pF1KSD -AELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLDSL
:...::::..:.::::.::::::.:::.::..::::::.:: ::::.:.::.:.....:
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. . :. :.: :::. .::: ::: ::.:::.:. : : : : .: .:
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: . . : :. .: .: ::. ::. :::.. . ::. . : .::: :. : .
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NP_001 SNSSQDSLHKGAKRKGIKSSIGRLFGKKEKGRLIQLSRDGATGHVLLTDSEFSMQEPMVP
760 770 780 790 800 810
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pF1KSD AKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDGPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANV
::: ..:::: :.::.:::.: :.:.::: ::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AKLGTQAEKDRRLKKKHQLLEDARRKGMPFAQWDGPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANV
820 830 840 850 860 870
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pF1KSD KSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHE
::::::. :::::::::::::: :::::::::::::::::::::: .::::.::::.:::
NP_001 KSGAIMSALSDTEIQREIGISNALHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPPTSRTSSGNVWVTHE
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pF1KSD EMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLD
:::.: ..:: ::::::::::.::.:::::::::::::::: ::::::::
NP_001 EMETLETSTKTT---------LAYGDMNHEWIGNEWLPSLGLPQYRSYFMECLVDARMLD
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pF1KSD HLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYDRKDLERRREESQTQIRDVMVWSNER
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NP_001 HLTKKDLRVHLKMVDSFHRTSLQYGIMCLKRLNYDRKELEKRREESQHEIKDVLVWTNDQ
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pF1KSD VMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFS
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NP_001 VVHWVQSIGLRDYAGNLHESGVHGALLALDENFDHNTLALILQIPTQNTQARQVMEREFN
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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pF1KSD NLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLRG---VTPDSAEMLPPNFRSAAAGAL
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NP_001 NLLALGTDRKLDDGDDKVFRRAPSWRKRFRPREHHGRGGMLSASAETLPAGFRVSTLGTL
1110 1120 1130 1140 1150 1160
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pF1KSD GSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
: : .:..::...
NP_001 QPPPAPPKKIMPEAHSHYLYGHMLSAFRD
1170 1180 1190
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.:::::::::::::::.:::::::.:: :::::::::.::::.:: :::.:.: : :. :
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XP_016 QREKMNEDHNKRLSDTVDRLLSESNERLQLHLKERMAALEEKNTLIQELESSQRQIEEQH
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pF1KSD -AELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLDSL
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XP_016 SADVVSPSGHSDAQTLAMMLQEQLDAINEEIRMIQEEKESTELRAEEIETRVTSGSMEAL
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XP_016 SNSSQDSLHKGAKRKGIKSSIGRLFGKKEKGRLIQLSRDGATGHVLLTDSEFSMQEPMVP
760 770 780 790 800 810
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pF1KSD AKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDGPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANV
::: ..:::: :.::.:::.: :.:.::: ::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AKLGTQAEKDRRLKKKHQLLEDARRKGMPFAQWDGPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANV
820 830 840 850 860 870
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pF1KSD KSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHE
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XP_016 KSGAIMSALSDTEIQREIGISNALHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPPTSRTSSGNVWVTHE
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930 940 950 960 970 980
pF1KSD EMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLD
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XP_016 EMETLETSTKTT---------LAYGDMNHEWIGNEWLPSLGLPQYRSYFMECLVDARMLD
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pF1KSD HLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYDRKDLERRREESQTQIRDVMVWSNER
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XP_016 HLTKKDLRVHLKMVDSFHRTSLQYGIMCLKRLNYDRKELEKRREESQHEIKDVLVWTNDQ
990 1000 1010 1020 1030 1040
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pF1KSD VMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFS
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XP_016 VVHWVQSIGLRDYAGNLHESGVHGALLALDENFDHNTLALILQIPTQNTQARQVMEREFN
1050 1060 1070 1080 1090 1100
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pF1KSD NLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLRG---VTPDSAEMLPPNFRSAAAGAL
::..:::::.::. . : : :.::::: :: .. .: . ::: :: .:: .. :.:
XP_016 NLLALGTDRKLDDGDDKVFRRAPSWRKRFRPREHHGRGGMLSASAETLPAGFRVSTLGTL
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1170 1180 1190
pF1KSD GSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
: : .:..::. . . ....: ::
XP_016 QPPPAPPKKIMPEAPSLVRDFPVALDLRIYSSTPSAPHYPESHRVSVVSPVDVAGVSWYC
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XP_016 GGTQVVHAWDSGGRREGQLRVDVKPPFLFWTQPGLHCNLHQDQDPGPQAGMVLPRKGHFR
1230 1240 1250 1260 1270 1280
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NP_803 MMCEVMPTISEAEGPPGGGGGHGSGSPSQPD-ADSHFEQLMVSMLEERDRLLDTLRETQE
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pF1KSD GLATAQLRLRELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERN
:: .: .:.:.:::.:::::::. ::::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_803 TLALTQGKLHEVGHERDSLQRQLNTALPQEFAALTKELNVCREQLLEREEEIAELKAERN
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pF1KSD NTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVR
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
NP_803 NTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPAGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KSD ERLRMALERVAVLEEELELSNQETLNLREQLSRRRS---GL------EEPGKDGDGQTLA
::::.:::: ..::::: ...: . :.:: ..... :. .: . .:. .
NP_803 ERLRVALERCSLLEEELGATHKELMILKEQNNQKKTLTDGVLDINHEQENTPSTSGKRSS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD NGLGPGGDSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEE
.: .. .. ::.: . .: : :..:::: : ....:::.: ::...: :.::
NP_803 DGSLSHEEDLAKVIELQEIISKQSREQSQMKERLASLSSHVTELEEDLDTARKDLIKSEE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ANSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQ
:.:::::..::.::.:::::::::::::::.:::::::.:: :::::::.:.:.:..::
NP_803 MNTKLQRDVREAMAQKEDMEERITTLEKRYLAAQREATSVHDLNDKLENEIANKDSMHRQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD SEEKSRQLAEWLDDAKQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQL
.:.:.::: : :. :.:::::::.:::::::.::.::::::::.::::::::.::::::.
NP_803 TEDKNRQLQERLELAEQKLQQTLRKAETLPEVEAELAQRVAALSKAEERHGNIEERLRQM
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD EAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGALEEKNSL
:::::::::::::::::::::..::::::.:::::::::::::::::::::.:::.::::
NP_803 EAQLEEKNQELQRARQREKMNEEHNKRLSDTVDKLLSESNERLQLHLKERMAALEDKNSL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD SEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPS-SYSRSLPGSALELRYSQA
.:. . :: .: .:.::. ..: .. :.:..: : : ..: ::. ..:. .:
NP_803 LREVESAKKQLEETQHDKDQLVLNIEALRAELDHMRLRGASLHHGRPHLGSVPDFRFPMA
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530 540 550 560 570
pF1KSD PTLPSGAHLDPYVAGSG-RAGKRGRWSGVKEEPSK-------DWERSAPAG---SIPPPF
.: : : ... : ..:: .....:::: ::::. :. .. :
NP_803 D-----GHTDSYSTSAVLRRPQKGRLAALRDEPSKVQTLNEQDWERAQQASVLANVAQAF
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580 590 600 610 620
pF1KSD PGELDGSD-EEEAEGMFGA-ELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTE
.. : :: :.. . .... .:::::::::..:::.::::::.::::::.:::::::.::
NP_803 ESDADVSDGEDDRDTLLSSVDLLSPSGQADAHTLAMMLQEQLDAINKEIRLIQEEKENTE
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KSD QRAEELESRVSSSGLDSLGRYRSSCSLPPSLTTSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPAREG
:::::.::::.:..::.:::.:: :.:: .:.::: :::.::.:::: : :::::
NP_803 QRAEEIESRVGSGSLDNLGRFRSMSSIPP-YPASSLASSSPPGSGRSTPRRIPHSPARE-
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690 700 710 720 730 740
pF1KSD TDK---ANHVP--KEEAGAPRGEGPAIPGDTPPPT-PRSARLERMTQALALQAGSLED--
.:. . .: .::. : . .: .: ::. ::. ::.:. .. ::.. : ::
NP_803 VDRLGVMTLLPPSREEV---RDDKTTIKCETSPPSSPRALRLDRLHKG-ALHTVSHEDIR
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pF1KSD ---------GGP---PRGSEGTPDSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMGPPGRDSSS
:: : .:... ::::::::::.:::::::::::::::: : :... .
NP_803 DIRNSTGSQDGPVSNPSSSNSSQDSLHKAPKKKGIKSSIGRLFGKKEKGRPGQTGKEALG
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790 800 810 820 830 840
pF1KSD LAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDGPTVVSWLE
::. .. . : :::.:: : ..:.:. ..:::::::: ::::::: ::::::: :::
NP_803 QAGVSETDNSSQDALGLSKLGGQAEKNRKLQKKHELLEEARRQGLPFAQWDGPTVVVWLE
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pF1KSD LWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPS
:::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::..::::::
NP_803 LWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMSALSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEIMSLTSPS
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910 920 930 940 950 960
pF1KSD APASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLP
:: .:::. ::::::::::.::.::::::::
NP_803 APPTSRTT------------------------------LAYGDMNHEWIGNEWLPSLGLP
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD QYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYDRKDLERRR
:::::::: ::::::::::.::.::::::::::::: :.. :::::.:::::::.:::.:
NP_803 QYRSYFMECLVDARMLDHLTKKDLRGQLKMVDSFHRNSFQCGIMCLRRLNYDRKELERKR
980 990 1000 1010 1020 1030
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD EESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDYSDLALLLQ
::::..:.::.::::.::. :. ..::::.:.:: ::::::::::::::::.: ::::::
NP_803 EESQSEIKDVLVWSNDRVIRWILSIGLKEYANNLIESGVHGALLALDETFDFSALALLLQ
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD IPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLRGVTPDSAE
:::::.::: .::.::.::. .:::::.:::. ::: :.::::: :: ::.::.. :::
NP_803 IPTQNTQARAVLEREFNNLLVMGTDRRFDEDDDKSFRRAPSWRKKFRPKDIRGLAAGSAE
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1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD MLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
:: ::: ......::.. .:.: .:
NP_803 TLPANFR--VTSSMSSPSMQPKKMQMDGM
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>>NP_003617 (OMIM: 611054) liprin-alpha-1 isoform b [Hom (1202 aa)
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::::::::::: .: :.. : :: : ...:.:::.:: ::.:::.::::.:.
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:: .: .:.:.:::.:::::::. ::::::::::::::.::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPAGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVR
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pF1KSD ERLRMALERVAVLEEELELSNQETLNLREQLSRRRS---GL------EEPGKDGDGQTLA
::::.:::: ..::::: ...: . :.:: ..... :. .: . .:. .
NP_003 ERLRVALERCSLLEEELGATHKELMILKEQNNQKKTLTDGVLDINHEQENTPSTSGKRSS
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD NGLGPGGDSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEE
.: .. .. ::.: . .: : :..:::: : ....:::.: ::...: :.::
NP_003 DGSLSHEEDLAKVIELQEIISKQSREQSQMKERLASLSSHVTELEEDLDTARKDLIKSEE
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pF1KSD ANSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQ
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pF1KSD EAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGALEEKNSL
:::::::::::::::::::::..::::::.:::::::::::::::::::::.:::.::::
NP_003 EAQLEEKNQELQRARQREKMNEEHNKRLSDTVDKLLSESNERLQLHLKERMAALEDKNSL
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pF1KSD SEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPS-SYSRSLPGSALELRYSQA
.:. . :: .: .:.::. ..: .. :.:..: : : ..: ::. ..:. .:
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NP_003 D-----GHTDSYSTSAVLRRPQKGRLAALRDEPSKVQTLNEQDWERAQQASVLANVAQAF
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.. : :: :.. . .... .:::::::::..:::.::::::.::::::.:::::::.::
NP_003 ESDADVSDGEDDRDTLLSSVDLLSPSGQADAHTLAMMLQEQLDAINKEIRLIQEEKENTE
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:::::.::::.:..::.:::.:: :.:: .:.::: :::.::.:::: : :::::
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NP_003 VDRLGVMTLLPPSREEV---RDDKTTIKCETSPPSSPRALRLDRLHKG-ALHTVSHEDIR
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:: : .:... ::::::::::.:::::::::::::::: : :... .
NP_003 DIRNSTGSQDGPVSNPSSSNSSQDSLHKAPKKKGIKSSIGRLFGKKEKGRPGQTGKEALG
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790 800 810 820 830 840
pF1KSD LAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDGPTVVSWLE
::. .. . : :::.:: : ..:.:. ..:::::::: ::::::: ::::::: :::
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:::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::..::::::
NP_003 LWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMSALSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEIMSLTSPS
890 900 910 920 930 940
910 920 930 940 950 960
pF1KSD APASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLP
:: .:::. ::::::::::.::.::::::::
NP_003 APPTSRTT------------------------------LAYGDMNHEWIGNEWLPSLGLP
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pF1KSD QYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYDRKDLERRR
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pF1KSD EESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDYSDLALLLQ
::::..:.::.::::.::. :. ..::::.:.:: ::::::::::::::::.: ::::::
NP_003 EESQSEIKDVLVWSNDRVIRWILSIGLKEYANNLIESGVHGALLALDETFDFSALALLLQ
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pF1KSD IPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLRGVTPDSAE
:::::.::: .::.::.::. .:::::.:::. ::: :.::::: :: ::.::.. :::
NP_003 IPTQNTQARAVLEREFNNLLVMGTDRRFDEDDDKSFRRAPSWRKKFRPKDIRGLAAGSAE
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD MLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
:: ::: ......::.. .:.: .:..::..: :...::::::
NP_003 TLPANFR--VTSSMSSPSMQPKKMQMDGNVSGTQRLDSATVRTYSC
1160 1170 1180 1190 1200
>>XP_011543616 (OMIM: 611054) PREDICTED: liprin-alpha-1 (1257 aa)
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pF1KSD MMCEVMPTISEDGRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQ
.:.:::.:: ::.:::.::::.:. :: .:
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pF1KSD LRLRELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERNNTRLLL
.:.:.:::.:::::::. ::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GKLHEVGHERDSLQRQLNTALPQEFAALTKELNVCREQLLEREEEIAELKAERNNTRLLL
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::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:
XP_011 EHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPAGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRVA
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pF1KSD LERVAVLEEELELSNQETLNLREQLSRRRS---GL------EEPGKDGDGQTLANGLGPG
::: ..::::: ...: . :.:: ..... :. .: . .:. ..:
XP_011 LERCSLLEEELGATHKELMILKEQNNQKKTLTDGVLDINHEQENTPSTSGKRSSDGSLSH
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.. .. ::.: . .: : :..:::: : ....:::.: ::...: :.:: :.:::
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pF1KSD RDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQSEEKSR
::..::.::.:::::::::::::::.:::::::.:: :::::::.:.:.:..::.:.:.:
XP_011 RDVREAMAQKEDMEERITTLEKRYLAAQREATSVHDLNDKLENEIANKDSMHRQTEDKNR
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:: : :. :.:::::::.:::::::.::.::::::::.:
XP_011 QLQERLELAEQKLQQTLRKAETLPEVEAELAQRVAALSKSDLLSSGSSAAKEAKLLELTS
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390 400 410 420 430 440
pF1KSD ----AEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNE
:::::::.::::::.:::::::::::::::::::::..::::::.:::::::::::
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::::::::::.:::.:::: .:. . :: .: .:.::. ..: .. :.:..: : :
XP_011 RLQLHLKERMAALEDKNSLLREVESAKKQLEETQHDKDQLVLNIEALRAELDHMRLRGAS
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::::. :. .. : .. : :: :.. . .... .:::::::::..:::.:::::
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610 620 630 640 650 660
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:.::::::.:::::::.:::::::.::::.:..::.:::.:: :.:: .:.::: ::
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:.::.:::: : ::::: .:. . .: .::. : . .: .: ::. ::. :
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::::::: ::::::: ::::::::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::
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