Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0654
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0654, 1194 aa
1>>>pF1KSDA0654 1194 - 1194 aa - 1194 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.0592+/-0.00112; mu= -12.0792+/- 0.066
mean_var=463.5841+/-98.038, 0's: 0 Z-trim(113.8): 84 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.059568
statistics sampled from 14322 (14389) to 14322 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.742), E-opt: 0.2 (0.442), width: 16
Scan time: 5.180
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12758.1 PPFIA3 gene_id:8541|Hs108|chr19 (1194) 7774 683.6 7.5e-196
CCDS31628.1 PPFIA1 gene_id:8500|Hs108|chr11 (1185) 2413 222.9 3.6e-57
CCDS31627.1 PPFIA1 gene_id:8500|Hs108|chr11 (1202) 2413 222.9 3.7e-57
CCDS55853.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1156) 2319 214.8 9.7e-55
CCDS55851.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 ( 783) 1523 146.3 2.8e-34
CCDS55854.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1232) 1264 124.2 2e-27
CCDS55855.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1236) 1248 122.8 5.2e-27
CCDS59236.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1247) 1248 122.8 5.2e-27
CCDS55856.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1251) 1248 122.8 5.2e-27
CCDS55857.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1257) 1248 122.8 5.3e-27
CCDS73503.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1104) 1245 122.5 5.7e-27
CCDS55852.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1152) 1242 122.3 7e-27
CCDS55850.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 ( 443) 1124 111.8 3.8e-24
>>CCDS12758.1 PPFIA3 gene_id:8541|Hs108|chr19 (1194 aa)
initn: 7774 init1: 7774 opt: 7774 Z-score: 3629.6 bits: 683.6 E(32554): 7.5e-196
Smith-Waterman score: 7774; 100.0% identity (100.0% similar) in 1194 aa overlap (1-1194:1-1194)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MMCEVMPTISEDGRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQLRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MMCEVMPTISEDGRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQLRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERNNTRLLLEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERNNTRLLLEHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD ECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRMALER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRMALER
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD VAVLEEELELSNQETLNLREQLSRRRSGLEEPGKDGDGQTLANGLGPGGDSNRRTAELEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VAVLEEELELSNQETLNLREQLSRRRSGLEEPGKDGDGQTLANGLGPGGDSNRRTAELEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD ALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQRED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQRED
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD MEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD LQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQRE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGALEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGALEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD EQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSYSRSLPGSALELRYSQAPTLPSGAHLDPYVAGSGRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSYSRSLPGSALELRYSQAPTLPSGAHLDPYVAGSGRA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GKRGRWSGVKEEPSKDWERSAPAGSIPPPFPGELDGSDEEEAEGMFGAELLSPSGQADVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GKRGRWSGVKEEPSKDWERSAPAGSIPPPFPGELDGSDEEEAEGMFGAELLSPSGQADVQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD TLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLDSLGRYRSSCSLPPSLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLDSLGRYRSSCSLPPSLT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD TSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPAREGTDKANHVPKEEAGAPRGEGPAIPGDTPPPTPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPAREGTDKANHVPKEEAGAPRGEGPAIPGDTPPPTPR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD SARLERMTQALALQAGSLEDGGPPRGSEGTPDSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SARLERMTQALALQAGSLEDGGPPRGSEGTPDSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PPGRDSSSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PPGRDSSSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD PTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD MVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGND
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD WLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 WLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYD
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD RKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDY
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD SDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLR
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD GVTPDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GVTPDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS31628.1 PPFIA1 gene_id:8500|Hs108|chr11 (1185 aa)
initn: 3573 init1: 1156 opt: 2413 Z-score: 1139.8 bits: 222.9 E(32554): 3.6e-57
Smith-Waterman score: 4548; 61.2% identity (80.4% similar) in 1228 aa overlap (1-1176:1-1184)
10 20 30 40 50
pF1KSD MMCEVMPTISE-DGRRGSALG--------PDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQD
::::::::::: .: :.. : :: : ...:.:::.:: ::.:::.::::.:.
CCDS31 MMCEVMPTISEAEGPPGGGGGHGSGSPSQPD-ADSHFEQLMVSMLEERDRLLDTLRETQE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GLATAQLRLRELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERN
:: .: .:.:.:::.:::::::. ::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS31 TLALTQGKLHEVGHERDSLQRQLNTALPQEFAALTKELNVCREQLLEREEEIAELKAERN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD NTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVR
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPAGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KSD ERLRMALERVAVLEEELELSNQETLNLREQLSRRRS---GL------EEPGKDGDGQTLA
::::.:::: ..::::: ...: . :.:: ..... :. .: . .:. .
CCDS31 ERLRVALERCSLLEEELGATHKELMILKEQNNQKKTLTDGVLDINHEQENTPSTSGKRSS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD NGLGPGGDSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEE
.: .. .. ::.: . .: : :..:::: : ....:::.: ::...: :.::
CCDS31 DGSLSHEEDLAKVIELQEIISKQSREQSQMKERLASLSSHVTELEEDLDTARKDLIKSEE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ANSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQ
:.:::::..::.::.:::::::::::::::.:::::::.:: :::::::.:.:.:..::
CCDS31 MNTKLQRDVREAMAQKEDMEERITTLEKRYLAAQREATSVHDLNDKLENEIANKDSMHRQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD SEEKSRQLAEWLDDAKQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQL
.:.:.::: : :. :.:::::::.:::::::.::.::::::::.::::::::.::::::.
CCDS31 TEDKNRQLQERLELAEQKLQQTLRKAETLPEVEAELAQRVAALSKAEERHGNIEERLRQM
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD EAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGALEEKNSL
:::::::::::::::::::::..::::::.:::::::::::::::::::::.:::.::::
CCDS31 EAQLEEKNQELQRARQREKMNEEHNKRLSDTVDKLLSESNERLQLHLKERMAALEDKNSL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD SEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPS-SYSRSLPGSALELRYSQA
.:. . :: .: .:.::. ..: .. :.:..: : : ..: ::. ..:. .:
CCDS31 LREVESAKKQLEETQHDKDQLVLNIEALRAELDHMRLRGASLHHGRPHLGSVPDFRFPMA
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KSD PTLPSGAHLDPYVAGSG-RAGKRGRWSGVKEEPSK-------DWERSAPAG---SIPPPF
.: : : ... : ..:: .....:::: ::::. :. .. :
CCDS31 D-----GHTDSYSTSAVLRRPQKGRLAALRDEPSKVQTLNEQDWERAQQASVLANVAQAF
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KSD PGELDGSD-EEEAEGMFGA-ELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTE
.. : :: :.. . .... .:::::::::..:::.::::::.::::::.:::::::.::
CCDS31 ESDADVSDGEDDRDTLLSSVDLLSPSGQADAHTLAMMLQEQLDAINKEIRLIQEEKENTE
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KSD QRAEELESRVSSSGLDSLGRYRSSCSLPPSLTTSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPAREG
:::::.::::.:..::.:::.:: :.:: .:.::: :::.::.:::: : :::::
CCDS31 QRAEEIESRVGSGSLDNLGRFRSMSSIPP-YPASSLASSSPPGSGRSTPRRIPHSPARE-
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KSD TDK---ANHVP--KEEAGAPRGEGPAIPGDTPPPT-PRSARLERMTQALALQAGSLED--
.:. . .: .::. : . .: .: ::. ::. ::.:. .. ::.. : ::
CCDS31 VDRLGVMTLLPPSREEV---RDDKTTIKCETSPPSSPRALRLDRLHKG-ALHTVSHEDIR
720 730 740 750 760
750 760 770 780
pF1KSD ---------GGP---PRGSEGTPDSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMGPPGRDSSS
:: : .:... ::::::::::.:::::::::::::::: : :... .
CCDS31 DIRNSTGSQDGPVSNPSSSNSSQDSLHKAPKKKGIKSSIGRLFGKKEKGRPGQTGKEALG
770 780 790 800 810 820
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDGPTVVSWLE
::. .. . : :::.:: : ..:.:. ..:::::::: ::::::: ::::::: :::
CCDS31 QAGVSETDNSSQDALGLSKLGGQAEKNRKLQKKHELLEEARRQGLPFAQWDGPTVVVWLE
830 840 850 860 870 880
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPS
:::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::..::::::
CCDS31 LWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMSALSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEIMSLTSPS
890 900 910 920 930 940
910 920 930 940 950 960
pF1KSD APASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLP
:: .:::. ::::::::::.::.::::::::
CCDS31 APPTSRTT------------------------------LAYGDMNHEWIGNEWLPSLGLP
950 960 970
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD QYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYDRKDLERRR
:::::::: ::::::::::.::.::::::::::::: :.. :::::.:::::::.:::.:
CCDS31 QYRSYFMECLVDARMLDHLTKKDLRGQLKMVDSFHRNSFQCGIMCLRRLNYDRKELERKR
980 990 1000 1010 1020 1030
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD EESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDYSDLALLLQ
::::..:.::.::::.::. :. ..::::.:.:: ::::::::::::::::.: ::::::
CCDS31 EESQSEIKDVLVWSNDRVIRWILSIGLKEYANNLIESGVHGALLALDETFDFSALALLLQ
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD IPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLRGVTPDSAE
:::::.::: .::.::.::. .:::::.:::. ::: :.::::: :: ::.::.. :::
CCDS31 IPTQNTQARAVLEREFNNLLVMGTDRRFDEDDDKSFRRAPSWRKKFRPKDIRGLAAGSAE
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD MLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
:: ::: ......::.. .:.: .:
CCDS31 TLPANFR--VTSSMSSPSMQPKKMQMDGM
1160 1170 1180
>>CCDS31627.1 PPFIA1 gene_id:8500|Hs108|chr11 (1202 aa)
initn: 3573 init1: 1156 opt: 2413 Z-score: 1139.7 bits: 222.9 E(32554): 3.7e-57
Smith-Waterman score: 4621; 61.2% identity (80.6% similar) in 1246 aa overlap (1-1194:1-1202)
10 20 30 40 50
pF1KSD MMCEVMPTISE-DGRRGSALG--------PDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQD
::::::::::: .: :.. : :: : ...:.:::.:: ::.:::.::::.:.
CCDS31 MMCEVMPTISEAEGPPGGGGGHGSGSPSQPD-ADSHFEQLMVSMLEERDRLLDTLRETQE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KSD GLATAQLRLRELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERN
:: .: .:.:.:::.:::::::. ::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS31 TLALTQGKLHEVGHERDSLQRQLNTALPQEFAALTKELNVCREQLLEREEEIAELKAERN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD NTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVR
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPAGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KSD ERLRMALERVAVLEEELELSNQETLNLREQLSRRRS---GL------EEPGKDGDGQTLA
::::.:::: ..::::: ...: . :.:: ..... :. .: . .:. .
CCDS31 ERLRVALERCSLLEEELGATHKELMILKEQNNQKKTLTDGVLDINHEQENTPSTSGKRSS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KSD NGLGPGGDSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEE
.: .. .. ::.: . .: : :..:::: : ....:::.: ::...: :.::
CCDS31 DGSLSHEEDLAKVIELQEIISKQSREQSQMKERLASLSSHVTELEEDLDTARKDLIKSEE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KSD ANSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQ
:.:::::..::.::.:::::::::::::::.:::::::.:: :::::::.:.:.:..::
CCDS31 MNTKLQRDVREAMAQKEDMEERITTLEKRYLAAQREATSVHDLNDKLENEIANKDSMHRQ
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KSD SEEKSRQLAEWLDDAKQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQL
.:.:.::: : :. :.:::::::.:::::::.::.::::::::.::::::::.::::::.
CCDS31 TEDKNRQLQERLELAEQKLQQTLRKAETLPEVEAELAQRVAALSKAEERHGNIEERLRQM
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KSD EAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGALEEKNSL
:::::::::::::::::::::..::::::.:::::::::::::::::::::.:::.::::
CCDS31 EAQLEEKNQELQRARQREKMNEEHNKRLSDTVDKLLSESNERLQLHLKERMAALEDKNSL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KSD SEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPS-SYSRSLPGSALELRYSQA
.:. . :: .: .:.::. ..: .. :.:..: : : ..: ::. ..:. .:
CCDS31 LREVESAKKQLEETQHDKDQLVLNIEALRAELDHMRLRGASLHHGRPHLGSVPDFRFPMA
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KSD PTLPSGAHLDPYVAGSG-RAGKRGRWSGVKEEPSK-------DWERSAPAG---SIPPPF
.: : : ... : ..:: .....:::: ::::. :. .. :
CCDS31 D-----GHTDSYSTSAVLRRPQKGRLAALRDEPSKVQTLNEQDWERAQQASVLANVAQAF
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KSD PGELDGSD-EEEAEGMFGA-ELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTE
.. : :: :.. . .... .:::::::::..:::.::::::.::::::.:::::::.::
CCDS31 ESDADVSDGEDDRDTLLSSVDLLSPSGQADAHTLAMMLQEQLDAINKEIRLIQEEKENTE
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KSD QRAEELESRVSSSGLDSLGRYRSSCSLPPSLTTSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPAREG
:::::.::::.:..::.:::.:: :.:: .:.::: :::.::.:::: : :::::
CCDS31 QRAEEIESRVGSGSLDNLGRFRSMSSIPP-YPASSLASSSPPGSGRSTPRRIPHSPARE-
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720 730 740
pF1KSD TDK---ANHVP--KEEAGAPRGEGPAIPGDTPPPT-PRSARLERMTQALALQAGSLED--
.:. . .: .::. : . .: .: ::. ::. ::.:. .. ::.. : ::
CCDS31 VDRLGVMTLLPPSREEV---RDDKTTIKCETSPPSSPRALRLDRLHKG-ALHTVSHEDIR
720 730 740 750 760
750 760 770 780
pF1KSD ---------GGP---PRGSEGTPDSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMGPPGRDSSS
:: : .:... ::::::::::.:::::::::::::::: : :... .
CCDS31 DIRNSTGSQDGPVSNPSSSNSSQDSLHKAPKKKGIKSSIGRLFGKKEKGRPGQTGKEALG
770 780 790 800 810 820
790 800 810 820 830 840
pF1KSD LAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDGPTVVSWLE
::. .. . : :::.:: : ..:.:. ..:::::::: ::::::: ::::::: :::
CCDS31 QAGVSETDNSSQDALGLSKLGGQAEKNRKLQKKHELLEEARRQGLPFAQWDGPTVVVWLE
830 840 850 860 870 880
850 860 870 880 890 900
pF1KSD LWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPS
:::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::..::::::
CCDS31 LWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMSALSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEIMSLTSPS
890 900 910 920 930 940
910 920 930 940 950 960
pF1KSD APASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLP
:: .:::. ::::::::::.::.::::::::
CCDS31 APPTSRTT------------------------------LAYGDMNHEWIGNEWLPSLGLP
950 960 970
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD QYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYDRKDLERRR
:::::::: ::::::::::.::.::::::::::::: :.. :::::.:::::::.:::.:
CCDS31 QYRSYFMECLVDARMLDHLTKKDLRGQLKMVDSFHRNSFQCGIMCLRRLNYDRKELERKR
980 990 1000 1010 1020 1030
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD EESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDYSDLALLLQ
::::..:.::.::::.::. :. ..::::.:.:: ::::::::::::::::.: ::::::
CCDS31 EESQSEIKDVLVWSNDRVIRWILSIGLKEYANNLIESGVHGALLALDETFDFSALALLLQ
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD IPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLRGVTPDSAE
:::::.::: .::.::.::. .:::::.:::. ::: :.::::: :: ::.::.. :::
CCDS31 IPTQNTQARAVLEREFNNLLVMGTDRRFDEDDDKSFRRAPSWRKKFRPKDIRGLAAGSAE
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD MLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
:: ::: ......::.. .:.: .:..::..: :...::::::
CCDS31 TLPANFR--VTSSMSSPSMQPKKMQMDGNVSGTQRLDSATVRTYSC
1160 1170 1180 1190 1200
>>CCDS55853.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1156 aa)
initn: 3180 init1: 1176 opt: 2319 Z-score: 1096.3 bits: 214.8 E(32554): 9.7e-55
Smith-Waterman score: 4146; 59.8% identity (78.5% similar) in 1168 aa overlap (80-1194:27-1156)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD QDGLATAQLRLRELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAE
::::::::::: :::::::.::::.:::::
CCDS55 MIFSDMNTVSGSPKVHPPNGTRFYTFQEFAALTKELNACREQLLEKEEEISELKAE
10 20 30 40 50
110 120 130 140 150 160
pF1KSD RNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPSGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEK
60 70 80 90 100 110
170 180 190 200 210
pF1KSD VRERLRMALERVAVLEEELELSNQETLNLREQ---LSRRRSGLE-----------EPGKD
::::::..::::..::::: .::: . :::: ..:. .. : :::.
CCDS55 VRERLRVSLERVSALEEELAAANQEIVALREQNVHIQRKMASSEGSTESEHLEGMEPGQK
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KSD GDGQTLANGLGPGGDSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHR
. :.:: . : . . .::.: ::.: :. :..::::.: .....:.: ::..
CCDS55 VHEKRLSNGSIDSTDETSQIVELQELLEKQNYEMAQMKERLAALSSRVGEVEQEAETARK
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KSD ELGKAEEANSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELAS
.: :.:: :.: :::..::.::.::::::::::::::::::::.::.:: :::::::::.
CCDS55 DLIKTEEMNTKYQRDIREAMAQKEDMEERITTLEKRYLSAQRESTSIHDMNDKLENELAN
240 250 260 270 280 290
340 350 360 370 380 390
pF1KSD KESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNF
::.. :: :::.::: : :. :.::::::..:::::::.::.::::.:::.::::::::.
CCDS55 KEAILRQMEEKNRQLQERLELAEQKLQQTMRKAETLPEVEAELAQRIAALTKAEERHGNI
300 310 320 330 340 350
400 410 420 430 440 450
pF1KSD EERLRQLEAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGA
:::.:.::.:::::::::::::::::::..::::::.:::.::.::::::::::::::.:
CCDS55 EERMRHLEGQLEEKNQELQRARQREKMNEEHNKRLSDTVDRLLTESNERLQLHLKERMAA
360 370 380 390 400 410
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSYSRSLPGSAL-
::::: : .: ...: .: : .::.: :.:... :.:::. : : ..: . :
CCDS55 LEEKNVLIQESETFRKNLEESLHDKERLAEEIEKLRSELDQLKMRTGSLIEPTIPRTHLD
420 430 440 450 460 470
520 530 540 550 560
pF1KSD ---ELRYSQAPTLPSGAHLDPYVAGSGRAGKRGRWSGVKEEPS------KDWERSAPAGS
::::: . . : . : .. : .::: . ..::. ..:.:. :
CCDS55 TSAELRYSVGSLVDSQS--DYRTTKVIRRPRRGRMGVRRDEPKVKSLGDHEWNRTQQIGV
480 490 500 510 520 530
570 580 590 600 610 620
pF1KSD IPP-PFPGELDGSD--EEEAEGMFGA-ELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLEAINKEIKLIQ
. :: .. . :: ... : .:.. .::::::..:.::::.::::::.::::::.:::
CCDS55 LSSHPFESDTEMSDIDDDDRETIFSSMDLLSPSGHSDAQTLAMMLQEQLDAINKEIRLIQ
540 550 560 570 580 590
630 640 650 660 670
pF1KSD EEKETTEQRAEELESRVSSSGLD--SLGRYRSSCSLPPSLTTSTLASPSPPSSGHSTPRL
::::.:: ::::.:.::.: .:. .:.: . . :. :.:.:.::: :::: :::::.:
CCDS55 EEKESTELRAEEIENRVASVSLEGLNLARVHPGTSITASVTASSLASSSPPS-GHSTPKL
600 610 620 630 640 650
680 690 700 710 720
pF1KSD APPSPARE----G-----TDKANHVPK----EEAGAPRGEGPAIPGDT-PPPTPRSARLE
.: ::::: : .: .: : :: : : . .: .: ::::::. :.
CCDS55 TPRSPAREMDRMGVMTLPSDLRKHRRKIAVVEEDG--REDKATIKCETSPPPTPRALRMT
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770
pF1KSD RM------TQALALQAGSLEDGGPPRGS-EGTPDSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGR
. ..: . . ::: . :: ... ::::::::::.::::::::::::::.:
CCDS55 HTLPSSYHNDARSSLSVSLEPESLGLGSANSSQDSLHKAPKKKGIKSSIGRLFGKKEKAR
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KSD MGPPGRDSSSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAW
.: .: : :. : . :::.:: ..:::: :.:::::::: :.::::: :
CCDS55 LG-------QLRGFMETEAAAQESLGLGKLGTQAEKDRRLKKKHELLEEARRKGLPFAQW
780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KSD DGPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAI
::::::.:::::.::::::::::::::::::::. :::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DGPTVVAWLELWLGMPAWYVAACRANVKSGAIMSALSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAI
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940 950
pF1KSD QEMVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVG
:::::::::::: .:::. :..: :: : ::::::::::.:
CCDS55 QEMVSLTSPSAPPTSRTK--------------------ESEEGSWAQTLAYGDMNHEWIG
890 900 910 920
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD NDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLN
:.:::::::::::::::: ::::::::::.::.:: .:::::::::.::.::::::::::
CCDS55 NEWLPSLGLPQYRSYFMECLVDARMLDHLTKKDLRVHLKMVDSFHRTSLQYGIMCLKRLN
930 940 950 960 970 980
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD YDRKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETF
::::.:::::: :: .:.::.::::.::. :....::.:.:.:. ::::::.:.::::.:
CCDS55 YDRKELERRREASQHEIKDVLVWSNDRVIRWIQAIGLREYANNILESGVHGSLIALDENF
990 1000 1010 1020 1030 1040
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD DYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKD
:::.:::::::::::.::::.::.:..::..:::.:::::.. :.: :. .::..: ..
CCDS55 DYSSLALLLQIPTQNTQARQILEREYNNLLALGTERRLDESDDKNFRRGSTWRRQFPPRE
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD LRGVT--PDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
..:.. : :.: :: .:: : . . ::. . .: .: :. .::::::
CCDS55 VHGISMMPGSSETLPAGFR------LTTTSGQSRKMTTDVASSRLQRLDNSTVRTYSC
1110 1120 1130 1140 1150
>>CCDS55851.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (783 aa)
initn: 2422 init1: 1017 opt: 1523 Z-score: 728.9 bits: 146.3 E(32554): 2.8e-34
Smith-Waterman score: 2693; 57.4% identity (76.6% similar) in 796 aa overlap (399-1155:1-760)
370 380 390 400 410 420
pF1KSD ETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNK
.:.::.:::::::::::::::::::..:::
CCDS55 MRHLEGQLEEKNQELQRARQREKMNEEHNK
10 20 30
430 440 450 460 470 480
pF1KSD RLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGALEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEME
:::.:::.::.::::::::::::::.:::::: : .: ...: .: : .::.: :.:
CCDS55 RLSDTVDRLLTESNERLQLHLKERMAALEEKNVLIQESETFRKNLEESLHDKERLAEEIE
40 50 60 70 80 90
490 500 510 520 530 540
pF1KSD RMQMEIDQLRGRPPSSYSRSLPGSAL----ELRYSQAPTLPSGAHLDPYVAGSGRAGKRG
... :.:::. : : ..: . : ::::: . . : . : .. : .::
CCDS55 KLRSELDQLKMRTGSLIEPTIPRTHLDTSAELRYSVGSLVDSQS--DYRTTKVIRRPRRG
100 110 120 130 140
550 560 570 580 590
pF1KSD RWSGVKEEPS------KDWERSAPAGSIPP-PFPGELDGSD--EEEAEGMFGA-ELLSPS
: . ..::. ..:.:. : . :: .. . :: ... : .:.. .:::::
CCDS55 RMGVRRDEPKVKSLGDHEWNRTQQIGVLSSHPFESDTEMSDIDDDDRETIFSSMDLLSPS
150 160 170 180 190 200
600 610 620 630 640 650
pF1KSD GQADVQTLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLD--SLGRYRSS
:..:.::::.::::::.::::::.:::::::.:: ::::.:.::.: .:. .:.: . .
CCDS55 GHSDAQTLAMMLQEQLDAINKEIRLIQEEKESTELRAEEIENRVASVSLEGLNLARVHPG
210 220 230 240 250 260
660 670 680 690
pF1KSD CSLPPSLTTSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPARE----G-----TDKANHVPK----EE
:. :.:.:.::: :::: :::::.:.: ::::: : .: .: : ::
CCDS55 TSITASVTASSLASSSPPS-GHSTPKLTPRSPAREMDRMGVMTLPSDLRKHRRKIAVVEE
270 280 290 300 310 320
700 710 720 730 740 750
pF1KSD AGAPRGEGPAIPGDT-PPPTPRSARLERM------TQALALQAGSLEDGGPPRGS-EGTP
: : . .: .: ::::::. :. . ..: . . ::: . :: ...
CCDS55 DG--REDKATIKCETSPPPTPRALRMTHTLPSSYHNDARSSLSVSLEPESLGLGSANSSQ
330 340 350 360 370 380
760 770 780 790 800 810
pF1KSD DSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMGPPGRDSSSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGP
::::::::::.::::::::::::::.:.: .: : :. : . :::.::
CCDS55 DSLHKAPKKKGIKSSIGRLFGKKEKARLG-------QLRGFMETEAAAQESLGLGKLGTQ
390 400 410 420 430
820 830 840 850 860 870
pF1KSD GDKDRRNKRKHELLEEACRQGLPFAAWDGPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIM
..:::: :.:::::::: :.::::: :::::::.:::::.::::::::::::::::::::
CCDS55 AEKDRRLKKKHELLEEARRKGLPFAQWDGPTVVAWLELWLGMPAWYVAACRANVKSGAIM
440 450 460 470 480 490
880 890 900 910 920 930
pF1KSD ANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHEEMESLT
. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .::: :..
CCDS55 SALSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPPTSRTCP--VFL---------
500 510 520 530 540
940 950 960 970 980 990
pF1KSD ATTKPETKEISWEQILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLDHLNKKE
: ::::::::::.::.:::::::::::::::: ::::::::::.::.
CCDS55 -------------QTLAYGDMNHEWIGNEWLPSLGLPQYRSYFMECLVDARMLDHLTKKD
550 560 570 580 590
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KSD LRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKRLNYDRKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVS
:: .:::::::::.::.::::::::::::::.:::::: :: .:.::.::::.::. :..
CCDS55 LRVHLKMVDSFHRTSLQYGIMCLKRLNYDRKELERRREASQHEIKDVLVWSNDRVIRWIQ
600 610 620 630 640 650
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KSD GLGLKEFATNLTESGVHGALLALDETFDYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLG
..::.:.:.:. ::::::.:.::::.::::.:::::::::::.::::.::.:..::..::
CCDS55 AIGLREYANNILESGVHGSLIALDENFDYSSLALLLQIPTQNTQARQILEREYNNLLALG
660 670 680 690 700 710
1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD TDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFREKDLRGVT--PDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPL
:.:::::.. :.: :. .::..: ....:.. : :.: :: .::
CCDS55 TERRLDESDDKNFRRGSTWRRQFPPREVHGISMMPGSSETLPAGFRLTTTSGQSRKMTTD
720 730 740 750 760 770
1170 1180 1190
pF1KSD RKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
CCDS55 DGVFSVYST
780
>>CCDS55854.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1232 aa)
initn: 3458 init1: 1176 opt: 1264 Z-score: 605.9 bits: 124.2 E(32554): 2e-27
Smith-Waterman score: 4469; 60.9% identity (80.6% similar) in 1221 aa overlap (1-1155:1-1209)
10 20 30 40 50
pF1KSD MMCEVMPTISED---GRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQ
:::::::::.:: ..::: . ... ...:.:::.:: ::.:::.::::.:..:. ::
CCDS55 MMCEVMPTINEDTPMSQRGSQSSGSDSDSHFEQLMVNMLDERDRLLDTLRETQESLSLAQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KSD LRLRELGHEKDSLQRQLSIALPQEFAALTKELNLCREQLLEREEEIAELKAERNNTRLLL
::... ...:::::::. :::::::::::::: :::::::.::::.:::::::::::::
CCDS55 QRLQDVIYDRDSLQRQLNSALPQEFAALTKELNACREQLLEKEEEISELKAERNNTRLLL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KSD EHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRMA
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::..
CCDS55 EHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPSGVSSEVEVLKALKSLFEHHKALDEKVRERLRVS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220
pF1KSD LERVAVLEEELELSNQETLNLREQ---LSRRRSGLE-----------EPGKDGDGQTLAN
::::..::::: .::: . :::: ..:. .. : :::. . :.:
CCDS55 LERVSALEEELAAANQEIVALREQNVHIQRKMASSEGSTESEHLEGMEPGQKVHEKRLSN
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KSD GLGPGGDSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQLEEELGTAHRELGKAEEA
: . : . . .::.: ::.: :. :..::::.: .....:.: ::...: :.::
CCDS55 GSIDSTDETSQIVELQELLEKQNYEMAQMKERLAALSSRVGEVEQEAETARKDLIKTEEM
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KSD NSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDANDKLENELASKESLYRQS
:.: :::..::.::.::::::::::::::::::::.::.:: :::::::::.::.. ::
CCDS55 NTKYQRDIREAMAQKEDMEERITTLEKRYLSAQRESTSIHDMNDKLENELANKEAILRQM
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KSD EEKSRQLAEWLDDAKQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAALNKAEERHGNFEERLRQLE
:::.::: : :. :.::::::..:::::::.::.::::.:::.::::::::.:::.:.::
CCDS55 EEKNRQLQERLELAEQKLQQTMRKAETLPEVEAELAQRIAALTKAEERHGNIEERMRHLE
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KSD AQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERLQLHLKERMGALEEKNSLS
.:::::::::::::::::::..::::::.:::.::.::::::::::::::.:::::: :
CCDS55 GQLEEKNQELQRARQREKMNEEHNKRLSDTVDRLLTESNERLQLHLKERMAALEEKNVLI
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510
pF1KSD EEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSYSRSLPGSAL----ELRYS
.: ...: .: : .::.: :.:... :.:::. : : ..: . : :::::
CCDS55 QESETFRKNLEESLHDKERLAEEIEKLRSELDQLKMRTGSLIEPTIPRTHLDTSAELRYS
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KSD QAPTLPSGAHLDPYVAGSGRAGKRGRWSGVKEEPS------KDWERSAPAGSIPP-PFPG
. . : . : .. : .::: . ..::. ..:.:. : . :: .
CCDS55 VGSLVDSQS--DYRTTKVIRRPRRGRMGVRRDEPKVKSLGDHEWNRTQQIGVLSSHPFES
550 560 570 580 590
580 590 600 610 620
pF1KSD ELDGSD--EEEAEGMFGA-ELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLEAINKEIKLIQEEKETTEQ
. . :: ... : .:.. .::::::..:.::::.::::::.::::::.:::::::.::
CCDS55 DTEMSDIDDDDRETIFSSMDLLSPSGHSDAQTLAMMLQEQLDAINKEIRLIQEEKESTEL
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KSD RAEELESRVSSSGLD--SLGRYRSSCSLPPSLTTSTLASPSPPSSGHSTPRLAPPSPARE
::::.:.::.: .:. .:.: . . :. :.:.:.::: :::: :::::.:.: :::::
CCDS55 RAEEIENRVASVSLEGLNLARVHPGTSITASVTASSLASSSPPS-GHSTPKLTPRSPARE
660 670 680 690 700 710
690 700 710 720
pF1KSD ----G-----TDKANHVPK----EEAGAPRGEGPAIPGDT-PPPTPRSARLERM------
: .: .: : :: : : . .: .: ::::::. :. .
CCDS55 MDRMGVMTLPSDLRKHRRKIAVVEEDG--REDKATIKCETSPPPTPRALRMTHTLPSSYH
720 730 740 750 760 770
730 740 750 760 770 780
pF1KSD TQALALQAGSLEDGGPPRGS-EGTPDSLHKAPKKKSIKSSIGRLFGKKEKGRMGPPGRDS
..: . . ::: . :: ... ::::::::::.::::::::::::::.:.:
CCDS55 NDARSSLSVSLEPESLGLGSANSSQDSLHKAPKKKGIKSSIGRLFGKKEKARLG------
780 790 800 810 820
790 800 810 820 830 840
pF1KSD SSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRK---HELLEEACRQGLPFAAWDGPTV
.: : :. : . :::.:: ..:::: :.. ::::::: :.::::: ::::::
CCDS55 -QLRGFMETEAAAQESLGLGKLGTQAEKDRRLKKNTSGHELLEEARRKGLPFAQWDGPTV
830 840 850 860 870 880
850 860 870 880 890 900
pF1KSD VSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVS
:.:::::.::::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VAWLELWLGMPAWYVAACRANVKSGAIMSALSDTEIQREIGISNPLHRLKLRLAIQEMVS
890 900 910 920 930 940
910 920 930 940 950
pF1KSD LTSPSAPASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKP-ETKEISWEQ------ILAYGDMNHEW
::::::: .::: .::::.::::::.:.: .: :..: :: : ::::::::::
CCDS55 LTSPSAPPTSRTPSGNVWVTHEEMENLAAPAKTKESEEGSWAQCPVFLQTLAYGDMNHEW
950 960 970 980 990 1000
960 970 980 990 1000 1010
pF1KSD VGNDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLHYGIMCLKR
.::.:::::::::::::::: ::::::::::.::.:: .:::::::::.::.::::::::
CCDS55 IGNEWLPSLGLPQYRSYFMECLVDARMLDHLTKKDLRVHLKMVDSFHRTSLQYGIMCLKR
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KSD LNYDRKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVHGALLALDE
::::::.:::::: :: .:.::.::::.::. :....::.:.:.:. ::::::.:.::::
CCDS55 LNYDRKELERRREASQHEIKDVLVWSNDRVIRWIQAIGLREYANNILESGVHGSLIALDE
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KSD TFDYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSPSWRKMFRE
.::::.:::::::::::.::::.::.:..::..:::.:::::.. :.: :. .::..:
CCDS55 NFDYSSLALLLQIPTQNTQARQILEREYNNLLALGTERRLDESDDKNFRRGSTWRRQFPP
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KSD KDLRGVT--PDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADGVSVRTYSC
....:.. : :.: :: .::
CCDS55 REVHGISMMPGSSETLPAGFRLTTTSGQSRKMTTDDGVFSVYST
1190 1200 1210 1220 1230
>>CCDS55855.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1236 aa)
initn: 3441 init1: 1176 opt: 1248 Z-score: 598.4 bits: 122.8 E(32554): 5.2e-27
Smith-Waterman score: 4331; 58.4% identity (77.8% similar) in 1265 aa overlap (4-1194:4-1236)
10 20 30 40 50
pF1KSD MMCEVMPTISED---GRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQ
::::::.:: ..::: . ... ...:.:::.:: ::.:::.::::.:..:. ::
CCDS55 MMCEVMPTINEDTPMSQRGSQSSGSDSDSHFEQLMVNMLDERDRLLDTLRETQESLSLAQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90
pF1KSD LRLRELGHEKDSLQRQLSIALPQ------------------EFAALTKELNLCREQLLER
::... ...:::::::. :::: :::::::::: :::::::.
CCDS55 QRLQDVIYDRDSLQRQLNSALPQDIESLTGGLAGSKGADPPEFAALTKELNACREQLLEK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD EEEIAELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSL
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS55 EEEISELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPSGVSSEVEVLKALKSL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FEHHKALDEKVRERLRMALERVAVLEEELELSNQETLNLREQ---LSRRRSGLE------
::::::::::::::::..::::..::::: .::: . :::: ..:. .. :
CCDS55 FEHHKALDEKVRERLRVSLERVSALEEELAAANQEIVALREQNVHIQRKMASSEGSTESE
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KSD -----EPGKDGDGQTLANGLGPGGDSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQ
:::. . :.:: . : . . .::.: ::.: :. :..::::.: ....
CCDS55 HLEGMEPGQKVHEKRLSNGSIDSTDETSQIVELQELLEKQNYEMAQMKERLAALSSRVGE
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDA
.:.: ::...: :.:: :.: :::..::.::.::::::::::::::::::::.::.::
CCDS55 VEQEAETARKDLIKTEEMNTKYQRDIREAMAQKEDMEERITTLEKRYLSAQRESTSIHDM
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD NDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAAL
:::::::::.::.. :: :::.::: : :. :.::::::..:::::::.::.::::.:::
CCDS55 NDKLENELANKEAILRQMEEKNRQLQERLELAEQKLQQTMRKAETLPEVEAELAQRIAAL
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KSD NKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERL
.::::::::.:::.:.::.:::::::::::::::::::..::::::.:::.::.::::::
CCDS55 TKAEERHGNIEERMRHLEGQLEEKNQELQRARQREKMNEEHNKRLSDTVDRLLTESNERL
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KSD QLHLKERMGALEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSY
::::::::.:::::: : .: ...: .: : .::.: :.:... :.:::. : :
CCDS55 QLHLKERMAALEEKNVLIQESETFRKNLEESLHDKERLAEEIEKLRSELDQLKMRTGSLI
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550
pF1KSD SRSLPGSAL----ELRYSQAPTLPSGAHLDPYVAGSGRAGKRGRWSGVKEEPS------K
..: . : ::::: . . : . : .. : .::: . ..::. .
CCDS55 EPTIPRTHLDTSAELRYSVGSLVDSQS--DYRTTKVIRRPRRGRMGVRRDEPKVKSLGDH
550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD DWERSAPAGSIPP-PFPGELDGSD--EEEAEGMFGA-ELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLE
.:.:. : . :: .. . :: ... : .:.. .::::::..:.::::.::::::.
CCDS55 EWNRTQQIGVLSSHPFESDTEMSDIDDDDRETIFSSMDLLSPSGHSDAQTLAMMLQEQLD
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660
pF1KSD AINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLD--SLGRYRSSCSLPPSLTTSTLASPSP
::::::.:::::::.:: ::::.:.::.: .:. .:.: . . :. :.:.:.::: ::
CCDS55 AINKEIRLIQEEKESTELRAEEIENRVASVSLEGLNLARVHPGTSITASVTASSLASSSP
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710
pF1KSD PSSGHSTPRLAPPSPARE----G-----TDKANHVPK----EEAGAPRGEGPAIPGDT-P
:: :::::.:.: ::::: : .: .: : :: : : . .: .: :
CCDS55 PS-GHSTPKLTPRSPAREMDRMGVMTLPSDLRKHRRKIAVVEEDG--REDKATIKCETSP
720 730 740 750 760 770
720 730 740 750 760
pF1KSD PPTPRSARLERM------TQALALQAGSLEDGGPPRGS-EGTPDSLHKAPKKKSIKSSIG
:::::. :. . ..: . . ::: . :: ... ::::::::::.::::::
CCDS55 PPTPRALRMTHTLPSSYHNDARSSLSVSLEPESLGLGSANSSQDSLHKAPKKKGIKSSIG
780 790 800 810 820 830
770 780 790 800 810 820
pF1KSD RLFGKKEKGRMGPPGRDSSSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEA
::::::::.:.: .: : :. : . :::.:: ..:::: :.::::::::
CCDS55 RLFGKKEKARLG-------QLRGFMETEAAAQESLGLGKLGTQAEKDRRLKKKHELLEEA
840 850 860 870 880
830 840 850 860 870 880
pF1KSD CRQGLPFAAWDGPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNP
:.::::: :::::::.:::::.::::::::::::::::::::. :::::::::::::::
CCDS55 RRKGLPFAQWDGPTVVAWLELWLGMPAWYVAACRANVKSGAIMSALSDTEIQREIGISNP
890 900 910 920 930 940
890 900 910 920 930 940
pF1KSD LHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKPETKEISWEQILA
:::::::::::::::::::::: .::: .: : . . : . : ::
CCDS55 LHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPPTSRT---------KESEEGSWAQCP-----VFLQTLA
950 960 970 980 990
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD YGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSLH
::::::::.::.:::::::::::::::: ::::::::::.::.:: .:::::::::.::.
CCDS55 YGDMNHEWIGNEWLPSLGLPQYRSYFMECLVDARMLDHLTKKDLRVHLKMVDSFHRTSLQ
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD YGIMCLKRLNYDRKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGVH
::::::::::::::.:::::: :: .:.::.::::.::. :....::.:.:.:. :::::
CCDS55 YGIMCLKRLNYDRKELERRREASQHEIKDVLVWSNDRVIRWIQAIGLREYANNILESGVH
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD GALLALDETFDYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRSP
:.:.::::.::::.:::::::::::.::::.::.:..::..:::.:::::.. :.: :.
CCDS55 GSLIALDENFDYSSLALLLQIPTQNTQARQILEREYNNLLALGTERRLDESDDKNFRRGS
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD SWRKMFREKDLRGVT--PDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRADG
.::..: ....:.. : :.: :: .:: : . . ::. . .: .: :.
CCDS55 TWRRQFPPREVHGISMMPGSSETLPAGFR------LTTTSGQSRKMTTDVASSRLQRLDN
1180 1190 1200 1210 1220
1190
pF1KSD VSVRTYSC
.::::::
CCDS55 STVRTYSC
1230
>>CCDS59236.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1247 aa)
initn: 3545 init1: 1176 opt: 1248 Z-score: 598.4 bits: 122.8 E(32554): 5.2e-27
Smith-Waterman score: 4418; 60.1% identity (79.6% similar) in 1233 aa overlap (4-1155:4-1224)
10 20 30 40 50
pF1KSD MMCEVMPTISED---GRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQ
::::::.:: ..::: . ... ...:.:::.:: ::.:::.::::.:..:. ::
CCDS59 MMCEVMPTINEDTPMSQRGSQSSGSDSDSHFEQLMVNMLDERDRLLDTLRETQESLSLAQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90
pF1KSD LRLRELGHEKDSLQRQLSIALPQ------------------EFAALTKELNLCREQLLER
::... ...:::::::. :::: :::::::::: :::::::.
CCDS59 QRLQDVIYDRDSLQRQLNSALPQDIESLTGGLAGSKGADPPEFAALTKELNACREQLLEK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD EEEIAELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSL
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS59 EEEISELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPSGVSSEVEVLKALKSL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FEHHKALDEKVRERLRMALERVAVLEEELELSNQETLNLREQ---LSRRRSGLE------
::::::::::::::::..::::..::::: .::: . :::: ..:. .. :
CCDS59 FEHHKALDEKVRERLRVSLERVSALEEELAAANQEIVALREQNVHIQRKMASSEGSTESE
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KSD -----EPGKDGDGQTLANGLGPGGDSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQ
:::. . :.:: . : . . .::.: ::.: :. :..::::.: ....
CCDS59 HLEGMEPGQKVHEKRLSNGSIDSTDETSQIVELQELLEKQNYEMAQMKERLAALSSRVGE
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDA
.:.: ::...: :.:: :.: :::..::.::.::::::::::::::::::::.::.::
CCDS59 VEQEAETARKDLIKTEEMNTKYQRDIREAMAQKEDMEERITTLEKRYLSAQRESTSIHDM
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD NDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAAL
:::::::::.::.. :: :::.::: : :. :.::::::..:::::::.::.::::.:::
CCDS59 NDKLENELANKEAILRQMEEKNRQLQERLELAEQKLQQTMRKAETLPEVEAELAQRIAAL
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KSD NKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERL
.::::::::.:::.:.::.:::::::::::::::::::..::::::.:::.::.::::::
CCDS59 TKAEERHGNIEERMRHLEGQLEEKNQELQRARQREKMNEEHNKRLSDTVDRLLTESNERL
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KSD QLHLKERMGALEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSY
::::::::.:::::: : .: ...: .: : .::.: :.:... :.:::. : :
CCDS59 QLHLKERMAALEEKNVLIQESETFRKNLEESLHDKERLAEEIEKLRSELDQLKMRTGSLI
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550
pF1KSD SRSLPGSAL----ELRYSQAPTLPSGAHLDPYVAGSGRAGKRGRWSGVKEEPS------K
..: . : ::::: . . : . : .. : .::: . ..::. .
CCDS59 EPTIPRTHLDTSAELRYSVGSLVDSQS--DYRTTKVIRRPRRGRMGVRRDEPKVKSLGDH
550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD DWERSAPAGSIPP-PFPGELDGSD--EEEAEGMFGA-ELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLE
.:.:. : . :: .. . :: ... : .:.. .::::::..:.::::.::::::.
CCDS59 EWNRTQQIGVLSSHPFESDTEMSDIDDDDRETIFSSMDLLSPSGHSDAQTLAMMLQEQLD
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660
pF1KSD AINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLD--SLGRYRSSCSLPPSLTTSTLASPSP
::::::.:::::::.:: ::::.:.::.: .:. .:.: . . :. :.:.:.::: ::
CCDS59 AINKEIRLIQEEKESTELRAEEIENRVASVSLEGLNLARVHPGTSITASVTASSLASSSP
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710
pF1KSD PSSGHSTPRLAPPSPARE----G-----TDKANHVPK----EEAGAPRGEGPAIPGDT-P
:: :::::.:.: ::::: : .: .: : :: : : . .: .: :
CCDS59 PS-GHSTPKLTPRSPAREMDRMGVMTLPSDLRKHRRKIAVVEEDG--REDKATIKCETSP
720 730 740 750 760 770
720 730 740 750 760
pF1KSD PPTPRSARLERM------TQALALQAGSLEDGGPPRGS-EGTPDSLHKAPKKKSIKSSIG
:::::. :. . ..: . . ::: . :: ... ::::::::::.::::::
CCDS59 PPTPRALRMTHTLPSSYHNDARSSLSVSLEPESLGLGSANSSQDSLHKAPKKKGIKSSIG
780 790 800 810 820 830
770 780 790 800 810 820
pF1KSD RLFGKKEKGRMGPPGRDSSSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEA
::::::::.:.: .: : :. : . :::.:: ..:::: :.::::::::
CCDS59 RLFGKKEKARLG-------QLRGFMETEAAAQESLGLGKLGTQAEKDRRLKKKHELLEEA
840 850 860 870 880
830 840 850 860 870 880
pF1KSD CRQGLPFAAWDGPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNP
:.::::: :::::::.:::::.::::::::::::::::::::. :::::::::::::::
CCDS59 RRKGLPFAQWDGPTVVAWLELWLGMPAWYVAACRANVKSGAIMSALSDTEIQREIGISNP
890 900 910 920 930 940
890 900 910 920 930 940
pF1KSD LHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKP-ETKEISWEQ--
:::::::::::::::::::::: .::: .::::.::::::.:.: .: :..: :: :
CCDS59 LHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPPTSRTPSGNVWVTHEEMENLAAPAKTKESEEGSWAQCP
950 960 970 980 990 1000
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD ----ILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDS
::::::::::.::.:::::::::::::::: ::::::::::.::.:: .::::::
CCDS59 VFLQTLAYGDMNHEWIGNEWLPSLGLPQYRSYFMECLVDARMLDHLTKKDLRVHLKMVDS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD FHRVSLHYGIMCLKRLNYDRKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATN
:::.::.::::::::::::::.:::::: :: .:.::.::::.::. :....::.:.:.:
CCDS59 FHRTSLQYGIMCLKRLNYDRKELERRREASQHEIKDVLVWSNDRVIRWIQAIGLREYANN
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD LTESGVHGALLALDETFDYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSA
. ::::::.:.::::.::::.:::::::::::.::::.::.:..::..:::.:::::..
CCDS59 ILESGVHGSLIALDENFDYSSLALLLQIPTQNTQARQILEREYNNLLALGTERRLDESDD
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD KSFSRSPSWRKMFREKDLRGVT--PDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTS
:.: :. .::..: ....:.. : :.: :: .::
CCDS59 KNFRRGSTWRRQFPPREVHGISMMPGSSETLPAGFRLTTTSGQSRKMTTDDGVFSVYST
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1180 1190
pF1KSD GSSRADGVSVRTYSC
>>CCDS55856.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1251 aa)
initn: 3564 init1: 1176 opt: 1248 Z-score: 598.3 bits: 122.8 E(32554): 5.2e-27
Smith-Waterman score: 4482; 59.5% identity (79.1% similar) in 1266 aa overlap (4-1194:4-1251)
10 20 30 40 50
pF1KSD MMCEVMPTISED---GRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQ
::::::.:: ..::: . ... ...:.:::.:: ::.:::.::::.:..:. ::
CCDS55 MMCEVMPTINEDTPMSQRGSQSSGSDSDSHFEQLMVNMLDERDRLLDTLRETQESLSLAQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90
pF1KSD LRLRELGHEKDSLQRQLSIALPQ------------------EFAALTKELNLCREQLLER
::... ...:::::::. :::: :::::::::: :::::::.
CCDS55 QRLQDVIYDRDSLQRQLNSALPQDIESLTGGLAGSKGADPPEFAALTKELNACREQLLEK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD EEEIAELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSL
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS55 EEEISELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPSGVSSEVEVLKALKSL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FEHHKALDEKVRERLRMALERVAVLEEELELSNQETLNLREQ---LSRRRSGLE------
::::::::::::::::..::::..::::: .::: . :::: ..:. .. :
CCDS55 FEHHKALDEKVRERLRVSLERVSALEEELAAANQEIVALREQNVHIQRKMASSEGSTESE
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KSD -----EPGKDGDGQTLANGLGPGGDSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQ
:::. . :.:: . : . . .::.: ::.: :. :..::::.: ....
CCDS55 HLEGMEPGQKVHEKRLSNGSIDSTDETSQIVELQELLEKQNYEMAQMKERLAALSSRVGE
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDA
.:.: ::...: :.:: :.: :::..::.::.::::::::::::::::::::.::.::
CCDS55 VEQEAETARKDLIKTEEMNTKYQRDIREAMAQKEDMEERITTLEKRYLSAQRESTSIHDM
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD NDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAAL
:::::::::.::.. :: :::.::: : :. :.::::::..:::::::.::.::::.:::
CCDS55 NDKLENELANKEAILRQMEEKNRQLQERLELAEQKLQQTMRKAETLPEVEAELAQRIAAL
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KSD NKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERL
.::::::::.:::.:.::.:::::::::::::::::::..::::::.:::.::.::::::
CCDS55 TKAEERHGNIEERMRHLEGQLEEKNQELQRARQREKMNEEHNKRLSDTVDRLLTESNERL
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KSD QLHLKERMGALEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSY
::::::::.:::::: : .: ...: .: : .::.: :.:... :.:::. : :
CCDS55 QLHLKERMAALEEKNVLIQESETFRKNLEESLHDKERLAEEIEKLRSELDQLKMRTGSLI
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550
pF1KSD SRSLPGSAL----ELRYSQAPTLPSGAHLDPYVAGSGRAGKRGRWSGVKEEPS------K
..: . : ::::: . . : . : .. : .::: . ..::. .
CCDS55 EPTIPRTHLDTSAELRYSVGSLVDSQS--DYRTTKVIRRPRRGRMGVRRDEPKVKSLGDH
550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD DWERSAPAGSIPP-PFPGELDGSD--EEEAEGMFGA-ELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLE
.:.:. : . :: .. . :: ... : .:.. .::::::..:.::::.::::::.
CCDS55 EWNRTQQIGVLSSHPFESDTEMSDIDDDDRETIFSSMDLLSPSGHSDAQTLAMMLQEQLD
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660
pF1KSD AINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLD--SLGRYRSSCSLPPSLTTSTLASPSP
::::::.:::::::.:: ::::.:.::.: .:. .:.: . . :. :.:.:.::: ::
CCDS55 AINKEIRLIQEEKESTELRAEEIENRVASVSLEGLNLARVHPGTSITASVTASSLASSSP
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710
pF1KSD PSSGHSTPRLAPPSPARE----G-----TDKANHVPK----EEAGAPRGEGPAIPGDT-P
:: :::::.:.: ::::: : .: .: : :: : : . .: .: :
CCDS55 PS-GHSTPKLTPRSPAREMDRMGVMTLPSDLRKHRRKIAVVEEDG--REDKATIKCETSP
720 730 740 750 760 770
720 730 740 750 760
pF1KSD PPTPRSARLERM------TQALALQAGSLEDGGPPRGS-EGTPDSLHKAPKKKSIKSSIG
:::::. :. . ..: . . ::: . :: ... ::::::::::.::::::
CCDS55 PPTPRALRMTHTLPSSYHNDARSSLSVSLEPESLGLGSANSSQDSLHKAPKKKGIKSSIG
780 790 800 810 820 830
770 780 790 800 810 820
pF1KSD RLFGKKEKGRMGPPGRDSSSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEA
::::::::.:.: .: : :. : . :::.:: ..:::: :.::::::::
CCDS55 RLFGKKEKARLG-------QLRGFMETEAAAQESLGLGKLGTQAEKDRRLKKKHELLEEA
840 850 860 870 880
830 840 850 860 870 880
pF1KSD CRQGLPFAAWDGPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNP
:.::::: :::::::.:::::.::::::::::::::::::::. :::::::::::::::
CCDS55 RRKGLPFAQWDGPTVVAWLELWLGMPAWYVAACRANVKSGAIMSALSDTEIQREIGISNP
890 900 910 920 930 940
890 900 910 920 930 940
pF1KSD LHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKP-ETKEISWEQIL
:::::::::::::::::::::: .::: .::::.::::::.:.: .: :..: :: : :
CCDS55 LHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPPTSRTPSGNVWVTHEEMENLAAPAKTKESEEGSWAQTL
950 960 970 980 990 1000
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD AYGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDSFHRVSL
:::::::::.::.:::::::::::::::: ::::::::::.::.:: .:::::::::.::
CCDS55 AYGDMNHEWIGNEWLPSLGLPQYRSYFMECLVDARMLDHLTKKDLRVHLKMVDSFHRTSL
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD HYGIMCLKRLNYDRKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATNLTESGV
.::::::::::::::.:::::: :: .:.::.::::.::. :....::.:.:.:. ::::
CCDS55 QYGIMCLKRLNYDRKELERRREASQHEIKDVLVWSNDRVIRWIQAIGLREYANNILESGV
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD HGALLALDETFDYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSAKSFSRS
::.:.::::.::::.:::::::::::.::::.::.:..::..:::.:::::.. :.: :.
CCDS55 HGSLIALDENFDYSSLALLLQIPTQNTQARQILEREYNNLLALGTERRLDESDDKNFRRG
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1130 1140 1150 1160 1170 1180
pF1KSD PSWRKMFREKDLRGVT--PDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTSGSSRAD
.::..: ....:.. : :.: :: .:: : . . ::. . .: .: :
CCDS55 STWRRQFPPREVHGISMMPGSSETLPAGFR------LTTTSGQSRKMTTDVASSRLQRLD
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1190
pF1KSD GVSVRTYSC
. .::::::
CCDS55 NSTVRTYSC
1250
>>CCDS55857.1 PPFIA2 gene_id:8499|Hs108|chr12 (1257 aa)
initn: 3545 init1: 1176 opt: 1248 Z-score: 598.3 bits: 122.8 E(32554): 5.3e-27
Smith-Waterman score: 4460; 59.2% identity (78.7% similar) in 1272 aa overlap (4-1194:4-1257)
10 20 30 40 50
pF1KSD MMCEVMPTISED---GRRGSALGPDEAGGELERLMVTMLTERERLLETLREAQDGLATAQ
::::::.:: ..::: . ... ...:.:::.:: ::.:::.::::.:..:. ::
CCDS55 MMCEVMPTINEDTPMSQRGSQSSGSDSDSHFEQLMVNMLDERDRLLDTLRETQESLSLAQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90
pF1KSD LRLRELGHEKDSLQRQLSIALPQ------------------EFAALTKELNLCREQLLER
::... ...:::::::. :::: :::::::::: :::::::.
CCDS55 QRLQDVIYDRDSLQRQLNSALPQDIESLTGGLAGSKGADPPEFAALTKELNACREQLLEK
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KSD EEEIAELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPGGVSSEVEVLKALKSL
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS55 EEEISELKAERNNTRLLLEHLECLVSRHERSLRMTVVKRQAQSPSGVSSEVEVLKALKSL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FEHHKALDEKVRERLRMALERVAVLEEELELSNQETLNLREQ---LSRRRSGLE------
::::::::::::::::..::::..::::: .::: . :::: ..:. .. :
CCDS55 FEHHKALDEKVRERLRVSLERVSALEEELAAANQEIVALREQNVHIQRKMASSEGSTESE
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KSD -----EPGKDGDGQTLANGLGPGGDSNRRTAELEEALERQRAEVCQLRERLAVLCRQMSQ
:::. . :.:: . : . . .::.: ::.: :. :..::::.: ....
CCDS55 HLEGMEPGQKVHEKRLSNGSIDSTDETSQIVELQELLEKQNYEMAQMKERLAALSSRVGE
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KSD LEEELGTAHRELGKAEEANSKLQRDLKEALAQREDMEERITTLEKRYLSAQREATSLHDA
.:.: ::...: :.:: :.: :::..::.::.::::::::::::::::::::.::.::
CCDS55 VEQEAETARKDLIKTEEMNTKYQRDIREAMAQKEDMEERITTLEKRYLSAQRESTSIHDM
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KSD NDKLENELASKESLYRQSEEKSRQLAEWLDDAKQKLQQTLQKAETLPEIEAQLAQRVAAL
:::::::::.::.. :: :::.::: : :. :.::::::..:::::::.::.::::.:::
CCDS55 NDKLENELANKEAILRQMEEKNRQLQERLELAEQKLQQTMRKAETLPEVEAELAQRIAAL
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KSD NKAEERHGNFEERLRQLEAQLEEKNQELQRARQREKMNDDHNKRLSETVDKLLSESNERL
.::::::::.:::.:.::.:::::::::::::::::::..::::::.:::.::.::::::
CCDS55 TKAEERHGNIEERMRHLEGQLEEKNQELQRARQREKMNEEHNKRLSDTVDRLLTESNERL
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KSD QLHLKERMGALEEKNSLSEEIANMKKLQDELLLNKEQLLAEMERMQMEIDQLRGRPPSSY
::::::::.:::::: : .: ...: .: : .::.: :.:... :.:::. : :
CCDS55 QLHLKERMAALEEKNVLIQESETFRKNLEESLHDKERLAEEIEKLRSELDQLKMRTGSLI
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550
pF1KSD SRSLPGSAL----ELRYSQAPTLPSGAHLDPYVAGSGRAGKRGRWSGVKEEPS------K
..: . : ::::: . . : . : .. : .::: . ..::. .
CCDS55 EPTIPRTHLDTSAELRYSVGSLVDSQS--DYRTTKVIRRPRRGRMGVRRDEPKVKSLGDH
550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KSD DWERSAPAGSIPP-PFPGELDGSD--EEEAEGMFGA-ELLSPSGQADVQTLAIMLQEQLE
.:.:. : . :: .. . :: ... : .:.. .::::::..:.::::.::::::.
CCDS55 EWNRTQQIGVLSSHPFESDTEMSDIDDDDRETIFSSMDLLSPSGHSDAQTLAMMLQEQLD
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660
pF1KSD AINKEIKLIQEEKETTEQRAEELESRVSSSGLD--SLGRYRSSCSLPPSLTTSTLASPSP
::::::.:::::::.:: ::::.:.::.: .:. .:.: . . :. :.:.:.::: ::
CCDS55 AINKEIRLIQEEKESTELRAEEIENRVASVSLEGLNLARVHPGTSITASVTASSLASSSP
660 670 680 690 700 710
670 680 690 700 710
pF1KSD PSSGHSTPRLAPPSPARE----G-----TDKANHVPK----EEAGAPRGEGPAIPGDT-P
:: :::::.:.: ::::: : .: .: : :: : : . .: .: :
CCDS55 PS-GHSTPKLTPRSPAREMDRMGVMTLPSDLRKHRRKIAVVEEDG--REDKATIKCETSP
720 730 740 750 760 770
720 730 740 750 760
pF1KSD PPTPRSARLERM------TQALALQAGSLEDGGPPRGS-EGTPDSLHKAPKKKSIKSSIG
:::::. :. . ..: . . ::: . :: ... ::::::::::.::::::
CCDS55 PPTPRALRMTHTLPSSYHNDARSSLSVSLEPESLGLGSANSSQDSLHKAPKKKGIKSSIG
780 790 800 810 820 830
770 780 790 800 810 820
pF1KSD RLFGKKEKGRMGPPGRDSSSLAGTPSDETLATDPLGLAKLTGPGDKDRRNKRKHELLEEA
::::::::.:.: .: : :. : . :::.:: ..:::: :.::::::::
CCDS55 RLFGKKEKARLG-------QLRGFMETEAAAQESLGLGKLGTQAEKDRRLKKKHELLEEA
840 850 860 870 880
830 840 850 860 870 880
pF1KSD CRQGLPFAAWDGPTVVSWLELWVGMPAWYVAACRANVKSGAIMANLSDTEIQREIGISNP
:.::::: :::::::.:::::.::::::::::::::::::::. :::::::::::::::
CCDS55 RRKGLPFAQWDGPTVVAWLELWLGMPAWYVAACRANVKSGAIMSALSDTEIQREIGISNP
890 900 910 920 930 940
890 900 910 920 930 940
pF1KSD LHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPASSRTSTGNVWMTHEEMESLTATTKP-ETKEISWEQ--
:::::::::::::::::::::: .::: .::::.::::::.:.: .: :..: :: :
CCDS55 LHRLKLRLAIQEMVSLTSPSAPPTSRTPSGNVWVTHEEMENLAAPAKTKESEEGSWAQCP
950 960 970 980 990 1000
950 960 970 980 990 1000
pF1KSD ----ILAYGDMNHEWVGNDWLPSLGLPQYRSYFMESLVDARMLDHLNKKELRGQLKMVDS
::::::::::.::.:::::::::::::::: ::::::::::.::.:: .::::::
CCDS55 VFLQTLAYGDMNHEWIGNEWLPSLGLPQYRSYFMECLVDARMLDHLTKKDLRVHLKMVDS
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KSD FHRVSLHYGIMCLKRLNYDRKDLERRREESQTQIRDVMVWSNERVMGWVSGLGLKEFATN
:::.::.::::::::::::::.:::::: :: .:.::.::::.::. :....::.:.:.:
CCDS55 FHRTSLQYGIMCLKRLNYDRKELERRREASQHEIKDVLVWSNDRVIRWIQAIGLREYANN
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KSD LTESGVHGALLALDETFDYSDLALLLQIPTQNAQARQLLEKEFSNLISLGTDRRLDEDSA
. ::::::.:.::::.::::.:::::::::::.::::.::.:..::..:::.:::::..
CCDS55 ILESGVHGSLIALDENFDYSSLALLLQIPTQNTQARQILEREYNNLLALGTERRLDESDD
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1130 1140 1150 1160 1170
pF1KSD KSFSRSPSWRKMFREKDLRGVT--PDSAEMLPPNFRSAAAGALGSPGLPLRKLQPEGQTS
:.: :. .::..: ....:.. : :.: :: .:: : . . ::. . .:
CCDS55 KNFRRGSTWRRQFPPREVHGISMMPGSSETLPAGFR------LTTTSGQSRKMTTDVASS
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1180 1190
pF1KSD GSSRADGVSVRTYSC
.: :. .::::::
CCDS55 RLQRLDNSTVRTYSC
1250
1194 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 02:31:39 2016 done: Thu Nov 3 02:31:39 2016
Total Scan time: 5.180 Total Display time: 0.480
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]