Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0634
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0634, 1288 aa
1>>>pF1KSDA0634 1288 - 1288 aa - 1288 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2134+/-0.000385; mu= 14.7459+/- 0.024
mean_var=138.7991+/-28.053, 0's: 0 Z-trim(117.2): 27 B-trim: 261 in 1/55
Lambda= 0.108863
statistics sampled from 29043 (29066) to 29043 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.341), width: 16
Scan time: 13.790
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_054729 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform a p (1288) 8728 1383.4 0
NP_004310 (OMIM: 600904) astrotactin-1 isoform 1 p (1294) 3617 580.7 2.2e-164
XP_016856829 (OMIM: 600904) PREDICTED: astrotactin (1302) 3477 558.7 9.3e-158
NP_996991 (OMIM: 600904) astrotactin-1 isoform 2 p (1216) 3410 548.2 1.3e-154
NP_001273093 (OMIM: 600904) astrotactin-1 isoform (1228) 3410 548.2 1.3e-154
XP_016856830 (OMIM: 600904) PREDICTED: astrotactin (1236) 3270 526.2 5.5e-148
NP_937829 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform b [ ( 440) 2714 438.5 4.7e-122
NP_937830 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform c [ ( 402) 2633 425.8 3e-118
NP_937831 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform d [ ( 395) 2593 419.5 2.3e-116
NP_001171663 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform ( 375) 2506 405.8 2.8e-112
NP_001171664 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform ( 194) 1174 196.4 1.6e-49
>>NP_054729 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform a precu (1288 aa)
initn: 8728 init1: 8728 opt: 8728 Z-score: 7410.4 bits: 1383.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 8728; 100.0% identity (100.0% similar) in 1288 aa overlap (1-1288:1-1288)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MAAAGARLSPGPGSGLRGRPRLCFHPGPPPLLPLLLLFLLLLPPPPLLAGATAAASREPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 MAAAGARLSPGPGSGLRGRPRLCFHPGPPPLLPLLLLFLLLLPPPPLLAGATAAASREPD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD SPCRLKTVTVSTLPALRESDIGWSGARAGAGAGTGAGAAAAAASPGSPGSAGTAAESRLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 SPCRLKTVTVSTLPALRESDIGWSGARAGAGAGTGAGAAAAAASPGSPGSAGTAAESRLL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD LFVRNELPGRIAVQDDLDNTELPFFTLEMSGTAADISLVHWRQQWLENGTLYFHVSMSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 LFVRNELPGRIAVQDDLDNTELPFFTLEMSGTAADISLVHWRQQWLENGTLYFHVSMSSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GQLAQATAPTLQEPSEIVEEQMHILHISVMGGLIALLLLLLVFTVALYAQRRWQKRRRIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 GQLAQATAPTLQEPSEIVEEQMHILHISVMGGLIALLLLLLVFTVALYAQRRWQKRRRIP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD QKSASTEATHEIHYIPSVLLGPQARESFRSSRLQTHNSVIGVPIRETPILDDYDCEEDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 QKSASTEATHEIHYIPSVLLGPQARESFRSSRLQTHNSVIGVPIRETPILDDYDCEEDEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD PPRRANHVSREDEFGSQVTHTLDSLGHPGEEKVDFEKKGGISFGRAKGTSGSEADDETQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 PPRRANHVSREDEFGSQVTHTLDSLGHPGEEKVDFEKKGGISFGRAKGTSGSEADDETQL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD TFYTEQYRSRRRSKGLLKSPVNKTALTLIAVSSCILAMVCGSQMSCPLTVKVTLHVPEHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 TFYTEQYRSRRRSKGLLKSPVNKTALTLIAVSSCILAMVCGSQMSCPLTVKVTLHVPEHF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD IADGSSFVVSEGSYLDISDWLNPAKLSLYYQINATSPWVRDLCGQRTTDACEQLCDPETG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 IADGSSFVVSEGSYLDISDWLNPAKLSLYYQINATSPWVRDLCGQRTTDACEQLCDPETG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ECSCHEGYAPDPVHRHLCVRSDWGQSEGPWPYTTLERGYDLVTGEQAPEKILRSTFSLGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 ECSCHEGYAPDPVHRHLCVRSDWGQSEGPWPYTTLERGYDLVTGEQAPEKILRSTFSLGQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GLWLPVSKSFVVPPVELSINPLASCKTDVLVTEDPADVREEAMLSTYFETINDLLSSFGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 GLWLPVSKSFVVPPVELSINPLASCKTDVLVTEDPADVREEAMLSTYFETINDLLSSFGP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD VRDCSRNNGGCTRNFKCVSDRQVDSSGCVCPEELKPMKDGSGCYDHSKGIDCSDGFNGGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 VRDCSRNNGGCTRNFKCVSDRQVDSSGCVCPEELKPMKDGSGCYDHSKGIDCSDGFNGGC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD EQLCLQQTLPLPYDATSSTIFMFCGCVEEYKLAPDGKSCLMLSDVCEGPKCLKPDSKFND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 EQLCLQQTLPLPYDATSSTIFMFCGCVEEYKLAPDGKSCLMLSDVCEGPKCLKPDSKFND
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KSD TLFGEMLHGYNNRTQHVNQGQVFQMTFRENNFIKDFPQLADGLLVIPLPVEEQCRGVLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 TLFGEMLHGYNNRTQHVNQGQVFQMTFRENNFIKDFPQLADGLLVIPLPVEEQCRGVLSE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KSD PLPDLQLLTGDIRYDEAMGYPMVQQWRVRSNLYRVKLSTITLAAGFTNVLKILTKESSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 PLPDLQLLTGDIRYDEAMGYPMVQQWRVRSNLYRVKLSTITLAAGFTNVLKILTKESSRE
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KSD ELLSFIQHYGSHYIAEALYGSELTCIIHFPSKKVQQQLWLQYQKETTELGSKKELKSMPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 ELLSFIQHYGSHYIAEALYGSELTCIIHFPSKKVQQQLWLQYQKETTELGSKKELKSMPF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KSD ITYLSGLLTAQMLSDDQLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 ITYLSGLLTAQMLSDDQLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD PLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 PLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLR
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD LSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 LSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD LGTSCVAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 LGTSCVAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD LVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 LVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD WRSEDELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 WRSEDELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWY
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280
pF1KSD SILKDTKITCEEKMVSMARNTYGESKGR
::::::::::::::::::::::::::::
NP_054 SILKDTKITCEEKMVSMARNTYGESKGR
1270 1280
>>NP_004310 (OMIM: 600904) astrotactin-1 isoform 1 precu (1294 aa)
initn: 3876 init1: 1666 opt: 3617 Z-score: 3072.1 bits: 580.7 E(85289): 2.2e-164
Smith-Waterman score: 4296; 48.9% identity (74.1% similar) in 1312 aa overlap (46-1286:16-1292)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LRGRPRLCFHPGPPPLLPLLLLFLLLLPPPPLLAGATAAASREPDSP--CRLKTVTVSTL
: . ::::.. .:.. :.::..:::.:
NP_004 MALAGLCALLACCWGPAAVLATAAGDVDPSKELECKLKSITVSAL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KSD PALRESDIGWSGARAGAGAGTGAGAAAAAASPGSPGSAGTAAESRLLLFVRNELPGRIAV
: :::.:. . :: .:.: .::. :::..::...:
NP_004 PFLRENDL------------------SIMHSP-------SASEPKLLFSVRNDFPGEMVV
50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KSD QDDLDNTELPFFTLEMSGTAADISLVHWRQQWLENGTLYFHVSMSSSGQLAQATAPTLQE
:::.:::::.:.::.::.. :: ::.::::::::::: ::. .... . :: .
NP_004 VDDLENTELPYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLFHIHHQDGAPSLPGQDPTEEP
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KSD PSEIVEEQMHILHISVMGGLIALLLLLLVFTVALYAQRRWQKRRRIPQ--KSASTEATHE
: .::...:::::::::.::::: .: ... ::..::: ::::.:: ::::.::..:
NP_004 QHESAEEELRILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRWCKRRRVPQPQKSASAEAANE
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KSD IHYIPSVLLGPQARESFRSSRLQTHNSVIGVPIRETPILDDYDCEEDEEPPRRANHVSRE
::::::::.: ..:::.:..:.: ::: . :::::::: : : : : .:..::
NP_004 IHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILDGY--EYDITDLR--HHLQRE
210 220 230 240 250
320 330
pF1KSD -----DEFGSQVTHTLDSL-------GH---PGEE-------------------------
..:.::::.::::: : :: .
NP_004 CMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNKYKDNIIATSPVDSNHQ
260 270 280 290 300 310
340 350 360 370
pF1KSD --------------KVDFEKKGGISFGRAKGTSGSEADDETQLTFYTEQYRSRRRSK-GL
... . ..: .: .: ::.::... ::::::. ::::::. :
NP_004 QATLLSHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSGTEAENDPQLTFYTDPSRSRRRSRVGS
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KSD LKSPVNKTALTLIAVSSCILAMVCGSQMSCPLTVKVTLHVPEHFIADGSSFVVSEGSYLD
.::::::.::::...::....::.:...:::.::.:::::::.::::: :.. ::: ::
NP_004 PRSPVNKTTLTLISITSCVIGLVCSSHVNCPLVVKITLHVPEHLIADGSRFILLEGSQLD
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KSD ISDWLNPAKLSLYYQINATSPWVRDLCGQRTTDACEQLCDPETGECSCHEGYAPDPVHRH
:::::::.. :. : :...::. :::..: : ::. :::::::: :.::: ::::.:
NP_004 ASDWLNPAQVVLFSQQNSSGPWAMDLCARRLLDPCEHQCDPETGECLCYEGYMKDPVHKH
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540 550
pF1KSD LCVRSDWGQSEGPWPYTTLERGYDLVTGEQAPEKILRSTFSLGQGLWLPVSKSFVVPPVE
::.:..:: ..:::::: ..::.::: ::: .::.: :..::.:.:::.:::::.::.:
NP_004 LCIRNEWGTNQGPWPYTIFQRGFDLVLGEQPSDKIFRFTYTLGEGMWLPLSKSFVIPPAE
500 510 520 530 540 550
560 570 580 590 600 610
pF1KSD LSINPLASCKTDVLVTEDPADVREEAMLSTYFETINDLLSSFGPVRDCSRNNGGCTRNFK
:.::: :.::::. : :: ..:::: : :. :.... ::.:::::::::..::::..::.
NP_004 LAINPSAKCKTDMTVMEDAVEVREELMTSSSFDSLEVLLDSFGPVRDCSKDNGGCSKNFR
560 570 580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KSD CVSDRQVDSSGCVCPEELKPMKDGSGCYDHSKGIDCSDGFNGGCEQLCLQQTLPLPYDAT
:.:::..::.::::: :.::::.:::::. :.::::::::::::::::: :.: : :
NP_004 CISDRKLDSTGCVCPSGLSPMKDSSGCYDRHIGVDCSDGFNGGCEQLCLQQMAPFPDDPT
620 630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KSD SSTIFMFCGCVEEYKLAPDGKSCLMLSDVC-EGPKCLKP-DSKFNDTLFGEMLHGYNNRT
.:.:::::.:.:::. ::.:: .....: :: : . . .:.::::::. ::::..
NP_004 LYNILMFCGCIEDYKLGVDGRSCQLITETCPEGSDCGESRELPMNQTLFGEMFFGYNNHS
680 690 700 710 720 730
740 750 760 770 780 790
pF1KSD QHVNQGQVFQMTFRENNFIKDFPQ-LADGLLVIPLPVEEQCRGVLSEPLPDLQLLTGDIR
..: :::.. :::.::: . . : : :::.: .:.:.:: .::: :: ..::: .
NP_004 KEVAAGQVLKGTFRQNNFARGLDQQLPDGLVVATVPLENQCLEEISEPTPDPDFLTGMVN
740 750 760 770 780 790
800 810 820 830 840 850
pF1KSD YDEAMGYPMVQQWRVRSNLYRVKLSTITLAAGFTNVLKILTKESSREELLSFIQHYGSHY
..:. :::..:.:.::: .:..::. .... ...:.:. : .:: .........:.::
NP_004 FSEVSGYPVLQHWKVRSVMYHIKLNQVAISQALSNALHSLDGATSRADFVALLDQFGNHY
800 810 820 830 840 850
860 870 880 890 900 910
pF1KSD IAEALYGSELTCIIHFPSKKVQQQLWLQYQ---KETTELGSKKELKSMPFITYLSGLLTA
: ::.:: : .: : .:.:.::..:::.:. : .. ..: . : . . .:.
NP_004 IQEAIYGFEESCSIWYPNKQVQRRLWLEYEDISKGNSPSDESEERERDPKVLTFPEYITS
860 870 880 890 900 910
920 930 940 950 960
pF1KSD QMLSDD---QLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQ
:::. .. .::...:. ::::::.: ::. .. . :::::.....:.: :.
NP_004 --LSDSGTKHMAAGVRMECHSKGRCPSSCPLCHVTSSPDTPAEPVLLEVTKAAPIYELVT
920 930 940 950 960 970
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD DNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEP
.: :.. .. : ::: :::: ::::.:::::: .:: :.:::.:.:: ::::::: . ::
NP_004 NNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCDSTAFGADGLPTCAPLPQPVLRLSTVHEP
980 990 1000 1010 1020 1030
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTD-TDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCV
:::.: ::: .: ::... ::.:...:: . : . . : :::.::..:: . :.
NP_004 SSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTDRMDHSKVETETVLSFVDDIISGAKSPCA
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KSD AAGRSHGEVPE--VSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDD
. .::. .. :.:..::::: .: :::..::. ::.:. : : ..: ::.:::
NP_004 MPS----QVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMFTLWGVDNTGRRSRPSDVIVKTPCPVVDD
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KSD NKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSE
::.:::::::::.:::::::::: :::::..... : :: .:::.:::.::.:.:: :
NP_004 VKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVLYHYNQHYESFGEFTWRCE
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KSD DELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILK
:::::::: ::: .: .:: :..::. :. : .. :: :: :..: :. : . .
NP_004 DELGPRKAGLILSQLGDLSSWCNGLLQEPKISLRRSSLKYLGCRYSEIKPYGLDWAELSR
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1270 1280
pF1KSD DTKITCEEKMVSMARNTYGESKGR
: . ::::. .:. : ::.::
NP_004 DLRKTCEEQTLSIPYNDYGDSKEI
1280 1290
>>XP_016856829 (OMIM: 600904) PREDICTED: astrotactin-1 i (1302 aa)
initn: 3476 init1: 1171 opt: 3477 Z-score: 2953.3 bits: 558.7 E(85289): 9.3e-158
Smith-Waterman score: 4270; 48.6% identity (73.6% similar) in 1320 aa overlap (46-1286:16-1300)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LRGRPRLCFHPGPPPLLPLLLLFLLLLPPPPLLAGATAAASREPDSP--CRLKTVTVSTL
: . ::::.. .:.. :.::..:::.:
XP_016 MALAGLCALLACCWGPAAVLATAAGDVDPSKELECKLKSITVSAL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KSD PALRESDIGWSGARAGAGAGTGAGAAAAAASPGSPGSAGTAAESRLLLFVRNELPGRIAV
: :::.:. . :: .:.: .::. :::..::...:
XP_016 PFLRENDL------------------SIMHSP-------SASEPKLLFSVRNDFPGEMVV
50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KSD QDDLDNTELPFFTLEMSGTAADISLVHWRQQWLENGTLYFHVSMSSSGQLAQATAPTLQE
:::.:::::.:.::.::.. :: ::.::::::::::: ::. .... . :: .
XP_016 VDDLENTELPYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLFHIHHQDGAPSLPGQDPTEEP
90 100 110 120 130 140
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: .::...:::::::::.::::: .: ... ::..::: ::::.:: ::::.::..:
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::::::::.: ..:::.:..:.: ::: . :::::::: : : : : .:..::
XP_016 IHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILDGY--EYDITDLR--HHLQRE
210 220 230 240 250
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..:.::::.::::: : :: .
XP_016 CMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNKYKDNIIATSPVDSNHQ
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340 350 360 370
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... . ..: .: .: ::.::... ::::::. ::::::. :
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.::::::.::::...::....::.:...:::.::.:::::::.::::: :.. ::: ::
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::::.:::.:..:: ..:::::: ..::.::: ::: .::.: :..::.:.:::.::
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:::..::.:.:::..::.::::: :.::::.:::::. :.:::::::::::::::::
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. ::::....: :::.. :::.::: . . : : :::.: .:.:.:: .::: ::
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..::: . ..:. :::..:.:.::: .:..::. .... ...:.:. : .:: .....
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....:.::: ::.:: : .: : .:.:.::..:::.:. : .. ..: . : .
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. .:. :::. .. .::...:. ::::::.: ::. .. . :::::....
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NP_996 DELGPR
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pF1KSD LRGRPRLCFHPGPPPLLPLLLLFLLLLPPPPLLAGATAAASREPDSP--CRLKTVTVSTL
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NP_001 IHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILDGY--EYDITDLR--HHLQRE
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NP_001 CMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNKYKDNIIATSPVDSNHQ
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pF1KSD --------------KVDFEKKGGISFGRAKGTSGSEADDETQLTFYTEQYRSRRRSK-GL
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NP_001 PRSPVNKTTLTLISITSCVIGLVCSSHVNCPLVVKITLHVPEHLIADGSRFILLEGSQLD
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680 690 700 710 720 730
pF1KSD SSTIFMFCGCVEEYKLAPDGKSCLMLSDVC-EGPKCLKP-DSKFNDTLFGEMLHGYNNRT
.:.:::::.:.:::. ::.:: .....: :: : . . .:.::::::. ::::..
NP_001 LYNILMFCGCIEDYKLGVDGRSCQLITETCPEGSDCGESRELPMNQTLFGEMFFGYNNHS
680 690 700 710 720 730
740 750 760 770 780 790
pF1KSD QHVNQGQVFQMTFRENNFIKDFPQ-LADGLLVIPLPVEEQCRGVLSEPLPDLQLLTGDIR
..: :::.. :::.::: . . : : :::.: .:.:.:: .::: :: ..::: .
NP_001 KEVAAGQVLKGTFRQNNFARGLDQQLPDGLVVATVPLENQCLEEISEPTPDPDFLTGMVN
740 750 760 770 780 790
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pF1KSD YDEAMGYPMVQQWRVRSNLYRVKLSTITLAAGFTNVLKILTKESSREELLSFIQHYGSHY
..:. :::..:.:.::: .:..::. .... ...:.:. : .:: .........:.::
NP_001 FSEVSGYPVLQHWKVRSVMYHIKLNQVAISQALSNALHSLDGATSRADFVALLDQFGNHY
800 810 820 830 840 850
860 870 880 890 900 910
pF1KSD IAEALYGSELTCIIHFPSKKVQQQLWLQYQ---KETTELGSKKELKSMPFITYLSGLLTA
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NP_001 IQEAIYGFEESCSIWYPNKQVQRRLWLEYEDISKGNSPSDESEERERDPKVLTFPEYITS
860 870 880 890 900 910
920 930 940 950 960
pF1KSD QMLSDD---QLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQ
:::. .. .::...:. ::::::.: ::. .. . :::::.....:.: :.
NP_001 --LSDSGTKHMAAGVRMECHSKGRCPSSCPLCHVTSSPDTPAEPVLLEVTKAAPIYELVT
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KSD DNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEP
.: :.. .. : ::: :::: ::::.:::::: .:: :.:::.:.:: ::::::: . ::
NP_001 NNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCDSTAFGADGLPTCAPLPQPVLRLSTVHEP
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KSD SSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTD-TDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCV
:::.: ::: .: ::... ::.:...:: . : . . : :::.::..:: . :.
NP_001 SSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTDRMDHSKVETETVLSFVDDIISGAKSPCA
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pF1KSD AAGRSHGEVPE--VSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDD
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NP_001 MPS----QVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMFTLWGVDNTGRRSRPSDVIVKTPCPVVDD
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pF1KSD NKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSE
::.:::::::::.:::::::::: :::::..... : :: .:::.:::.::.:.:: :
NP_001 VKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVLYHYNQHYESFGEFTWRCE
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pF1KSD DELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILK
::::::
NP_001 DELGPRLPACWDSQRSCR
1220
>>XP_016856830 (OMIM: 600904) PREDICTED: astrotactin-1 i (1236 aa)
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Smith-Waterman score: 4063; 49.0% identity (74.1% similar) in 1244 aa overlap (46-1210:16-1224)
20 30 40 50 60 70
pF1KSD LRGRPRLCFHPGPPPLLPLLLLFLLLLPPPPLLAGATAAASREPDSP--CRLKTVTVSTL
: . ::::.. .:.. :.::..:::.:
XP_016 MALAGLCALLACCWGPAAVLATAAGDVDPSKELECKLKSITVSAL
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80 90 100 110 120 130
pF1KSD PALRESDIGWSGARAGAGAGTGAGAAAAAASPGSPGSAGTAAESRLLLFVRNELPGRIAV
: :::.:. . :: .:.: .::. :::..::...:
XP_016 PFLRENDL------------------SIMHSP-------SASEPKLLFSVRNDFPGEMVV
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pF1KSD QDDLDNTELPFFTLEMSGTAADISLVHWRQQWLENGTLYFHVSMSSSGQLAQATAPTLQE
:::.:::::.:.::.::.. :: ::.::::::::::: ::. .... . :: .
XP_016 VDDLENTELPYFVLEISGNTEDIPLVRWRQQWLENGTLLFHIHHQDGAPSLPGQDPTEEP
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pF1KSD PSEIVEEQMHILHISVMGGLIALLLLLLVFTVALYAQRRWQKRRRIPQ--KSASTEATHE
: .::...:::::::::.::::: .: ... ::..::: ::::.:: ::::.::..:
XP_016 QHESAEEELRILHISVMGGMIALLLSILCLVMILYTRRRWCKRRRVPQPQKSASAEAANE
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pF1KSD IHYIPSVLLGPQARESFRSSRLQTHNSVIGVPIRETPILDDYDCEEDEEPPRRANHVSRE
::::::::.: ..:::.:..:.: ::: . :::::::: : : : : .:..::
XP_016 IHYIPSVLIGGHGRESLRNARVQGHNSSGTLSIRETPILDGY--EYDITDLR--HHLQRE
210 220 230 240 250
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pF1KSD -----DEFGSQVTHTLDSL-------GH---PGEE-------------------------
..:.::::.::::: : :: .
XP_016 CMNGGEDFASQVTRTLDSLQGCNEKSGMDLTPGSDNAKLSLMNKYKDNIIATSPVDSNHQ
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pF1KSD --------------KVDFEKKGGISFGRAKGTSGSEADDETQLTFYTEQYRSRRRSK-GL
... . ..: .: .: ::.::... ::::::. ::::::. :
XP_016 QATLLSHTSSSQRKRINNKARAGSAFLNPEGDSGTEAENDPQLTFYTDPSRSRRRSRVGS
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pF1KSD LKSPVNKTALTLIAVSSCILAMVCGSQMSCPLTVKVTLHVPEHFIADGSSFVVSEGSYLD
.::::::.::::...::....::.:...:::.::.:::::::.::::: :.. ::: ::
XP_016 PRSPVNKTTLTLISITSCVIGLVCSSHVNCPLVVKITLHVPEHLIADGSRFILLEGSQLD
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pF1KSD ISDWLNPAKLSLYYQINATSPWVRDLCGQRTTDACEQLCDPETG--------ECSCHEGY
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XP_016 ASDWLNPAQVVLFSQQNSSGPWAMDLCARRLLDPCEHQCDPETGRREHRAAGECLCYEGY
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pF1KSD APDPVHRHLCVRSDWGQSEGPWPYTTLERGYDLVTGEQAPEKILRSTFSLGQGLWLPVSK
::::.:::.:..:: ..:::::: ..::.::: ::: .::.: :..::.:.:::.::
XP_016 MKDPVHKHLCIRNEWGTNQGPWPYTIFQRGFDLVLGEQPSDKIFRFTYTLGEGMWLPLSK
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:::.::.::.::: :.::::. : :: ..:::: : :. :.... ::.:::::::::..:
XP_016 SFVIPPAELAINPSAKCKTDMTVMEDAVEVREELMTSSSFDSLEVLLDSFGPVRDCSKDN
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pF1KSD GGCTRNFKCVSDRQVDSSGCVCPEELKPMKDGSGCYDHSKGIDCSDGFNGGCEQLCLQQT
:::..::.:.:::..::.::::: :.::::.:::::. :.:::::::::::::::::
XP_016 GGCSKNFRCISDRKLDSTGCVCPSGLSPMKDSSGCYDRHIGVDCSDGFNGGCEQLCLQQM
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pF1KSD LPLPYDATSSTIFMFCGCVEEYKLAPDGKSCLMLSDVC-EGPKCLKP-DSKFNDTLFGEM
:.: : : .:.:::::.:.:::. ::.:: .....: :: : . . .:.::::::
XP_016 APFPDDPTLYNILMFCGCIEDYKLGVDGRSCQLITETCPEGSDCGESRELPMNQTLFGEM
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pF1KSD LHGYNNRTQHVNQGQVFQMTFRENNFIKDFPQ-LADGLLVIPLPVEEQCRGVLSEPLPDL
. ::::....: :::.. :::.::: . . : : :::.: .:.:.:: .::: ::
XP_016 FFGYNNHSKEVAAGQVLKGTFRQNNFARGLDQQLPDGLVVATVPLENQCLEEISEPTPDP
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pF1KSD QLLTGDIRYDEAMGYPMVQQWRVRSNLYRVKLSTITLAAGFTNVLKILTKESSREELLSF
..::: . ..:. :::..:.:.::: .:..::. .... ...:.:. : .:: .....
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pF1KSD IQHYGSHYIAEALYGSELTCIIHFPSKKVQQQLWLQYQ---KETTELGSKKELKSMPFIT
....:.::: ::.:: : .: : .:.:.::..:::.:. : .. ..: . : .
XP_016 LDQFGNHYIQEAIYGFEESCSIWYPNKQVQRRLWLEYEDISKGNSPSDESEERERDPKVL
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pF1KSD YLSGLLTAQMLSDD---QLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRV
. .:. :::. .. .::...:. ::::::.: ::. .. . :::::....
XP_016 TFPEYITS--LSDSGTKHMAAGVRMECHSKGRCPSSCPLCHVTSSPDTPAEPVLLEVTKA
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pF1KSD VPLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVL
.:.: :. .: :.. .. : ::: :::: ::::.:::::: .:: :.:::.:.:: ::::
XP_016 APIYELVTNNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCDSTAFGADGLPTCAPLPQPVL
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pF1KSD RLSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTD-TDLYTGEFLSFADDLL
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XP_016 RLSTVHEPSSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTDRMDHSKVETETVLSFVDDII
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pF1KSD SGLGTSCVAAGRSHGEVPE--VSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLR
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XP_016 SGAKSPCAMPS----QVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMFTLWGVDNTGRRSRPSDVIVK
1100 1110 1120 1130 1140 1150
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pF1KSD TACPLVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKF
: ::.::: ::.:::::::::.:::::::::: :::::..... : :: .:::.:::.:
XP_016 TPCPVVDDVKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVLYHYNQHYESF
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KSD GDFVWRSEDELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAG
:.:.:: :::::::
XP_016 GEFTWRCEDELGPRLPACWDSQRSCR
1220 1230
>>NP_937829 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform b [Homo (440 aa)
initn: 2708 init1: 2708 opt: 2714 Z-score: 2312.3 bits: 438.5 E(85289): 4.7e-122
Smith-Waterman score: 2714; 98.8% identity (99.0% similar) in 413 aa overlap (876-1288:29-440)
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pF1KSD IQHYGSHYIAEALYGSELTCIIHFPSKKVQQQLWLQYQKETTELGSKKELKSMPFITYLS
: : :: .:::::::::::::::::::::
NP_937 MNTLLCKGMFCLLSWEADSRGRLGEYTLQPLSLQ-TEETTELGSKKELKSMPFITYLS
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pF1KSD GLLTAQMLSDDQLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 GLLTAQMLSDDQLISGVEIRCEEKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTL
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pF1KSD IQDNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 IQDNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTV
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pF1KSD EPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 EPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSC
180 190 200 210 220 230
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pF1KSD VAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 VAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDDN
240 250 260 270 280 290
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pF1KSD KAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 KAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSED
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pF1KSD ELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 ELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILKD
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1270 1280
pF1KSD TKITCEEKMVSMARNTYGESKGR
:::::::::::::::::::::::
NP_937 TKITCEEKMVSMARNTYGESKGR
420 430 440
>>NP_937830 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform c [Homo (402 aa)
initn: 2633 init1: 2633 opt: 2633 Z-score: 2244.1 bits: 425.8 E(85289): 3e-118
Smith-Waterman score: 2633; 100.0% identity (100.0% similar) in 391 aa overlap (898-1288:1-391)
870 880 890 900 910 920
pF1KSD HFPSKKVQQQLWLQYQKETTELGSKKELKSMPFITYLSGLLTAQMLSDDQLISGVEIRCE
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 MPFITYLSGLLTAQMLSDDQLISGVEIRCE
10 20 30
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pF1KSD EKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 EKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSG
40 50 60 70 80 90
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pF1KSD KGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 KGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKV
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pF1KSD SDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCVAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 SDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCVAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKC
160 170 180 190 200 210
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pF1KSD LEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 LEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQ
220 230 240 250 260 270
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD QMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSEDELGPRKAHLILRRLERVSSHCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 QMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSEDELGPRKAHLILRRLERVSSHCS
280 290 300 310 320 330
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KSD SLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILKDTKITCEEKMVSMARNTYGESKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 SLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILKDTKITCEEKMVSMARNTYGESKG
340 350 360 370 380 390
pF1KSD R
:
NP_937 RYYLTLSKVSPF
400
>>NP_937831 (OMIM: 612856) astrotactin-2 isoform d [Homo (395 aa)
initn: 2593 init1: 2593 opt: 2593 Z-score: 2210.2 bits: 419.5 E(85289): 2.3e-116
Smith-Waterman score: 2593; 100.0% identity (100.0% similar) in 385 aa overlap (898-1282:1-385)
870 880 890 900 910 920
pF1KSD HFPSKKVQQQLWLQYQKETTELGSKKELKSMPFITYLSGLLTAQMLSDDQLISGVEIRCE
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 MPFITYLSGLLTAQMLSDDQLISGVEIRCE
10 20 30
930 940 950 960 970 980
pF1KSD EKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 EKGRCPSTCHLCRRPGKEQLSPTPVLLEINRVVPLYTLIQDNGTKEAFKSALMSSYWCSG
40 50 60 70 80 90
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KSD KGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 KGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEPSSTVVSLEWVDVQPAIGTKV
100 110 120 130 140 150
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KSD SDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCVAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 SDYILQHKKVDEYTDTDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCVAAGRSHGEVPEVSIYSVIFKC
160 170 180 190 200 210
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KSD LEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_937 LEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDDNKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQ
220 230 240 250 260 270
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KSD QMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSEDELGPRKAHLILRRLERVSSHCS
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NP_937 QMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSEDELGPRKAHLILRRLERVSSHCS
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