Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0585
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0585, 414 aa
1>>>pF1KSDA0585 414 - 414 aa - 414 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3342+/-0.000319; mu= 7.4854+/- 0.020
mean_var=113.1242+/-22.563, 0's: 0 Z-trim(118.9): 18 B-trim: 1112 in 1/53
Lambda= 0.120586
statistics sampled from 32386 (32404) to 32386 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.731), E-opt: 0.2 (0.38), width: 16
Scan time: 8.170
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001074930 (OMIM: 604914) bifunctional arginine ( 414) 2850 506.4 5.2e-143
NP_055982 (OMIM: 604914) bifunctional arginine dem ( 403) 2764 491.5 1.6e-138
XP_016862668 (OMIM: 608263) PREDICTED: HSPB1-assoc ( 426) 175 41.1 0.0065
XP_011511434 (OMIM: 608263) PREDICTED: HSPB1-assoc ( 449) 175 41.1 0.0068
XP_011511432 (OMIM: 608263) PREDICTED: HSPB1-assoc ( 451) 175 41.1 0.0068
NP_078886 (OMIM: 608263) HSPB1-associated protein ( 488) 175 41.1 0.0073
>>NP_001074930 (OMIM: 604914) bifunctional arginine deme (414 aa)
initn: 2850 init1: 2850 opt: 2850 Z-score: 2688.5 bits: 506.4 E(85289): 5.2e-143
Smith-Waterman score: 2850; 100.0% identity (100.0% similar) in 414 aa overlap (1-414:1-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNHKSKKRIREAKRSARPELKDSLDWTRHNYYESFSLSPAAVADNVERADALQLSVEEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MNHKSKKRIREAKRSARPELKDSLDWTRHNYYESFSLSPAAVADNVERADALQLSVEEFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ERYERPYKPVVLLNAQEGWSAQEKWTLERLKRKYRNQKFKCGEDNDGYSVKMKMKYYIEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERYERPYKPVVLLNAQEGWSAQEKWTLERLKRKYRNQKFKCGEDNDGYSVKMKMKYYIEY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD MESTRDDSPLYIFDSSYGEHPKRRKLLEDYKVPKFFTDDLFQYAGEKRRPPYRWFVMGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MESTRDDSPLYIFDSSYGEHPKRRKLLEDYKVPKFFTDDLFQYAGEKRRPPYRWFVMGPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RSGTGIHIDPLGTSAWNALVQGHKRWCLFPTSTPRELIKVTRDEGGNQQDEAITWFNVIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSGTGIHIDPLGTSAWNALVQGHKRWCLFPTSTPRELIKVTRDEGGNQQDEAITWFNVIY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PRTQLPTWPPEFKPLEILQKPGETVFVPGGWWHVVLNLDTTIAITQNFASSTNFPVVWHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRTQLPTWPPEFKPLEILQKPGETVFVPGGWWHVVLNLDTTIAITQNFASSTNFPVVWHK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TVRGRPKLSRKWYRILKQEHPELAVLADSVDLQESTGIASDSSSDSSSSSSSSSSDSDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TVRGRPKLSRKWYRILKQEHPELAVLADSVDLQESTGIASDSSSDSSSSSSSSSSDSDSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KSD CESGSEGDGTVHRRKKRRTCSMVGNGDTTSQDDCVSKERSSSRIRDTCGGRAHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CESGSEGDGTVHRRKKRRTCSMVGNGDTTSQDDCVSKERSSSRIRDTCGGRAHP
370 380 390 400 410
>>NP_055982 (OMIM: 604914) bifunctional arginine demethy (403 aa)
initn: 2764 init1: 2764 opt: 2764 Z-score: 2607.9 bits: 491.5 E(85289): 1.6e-138
Smith-Waterman score: 2764; 100.0% identity (100.0% similar) in 403 aa overlap (1-403:1-403)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MNHKSKKRIREAKRSARPELKDSLDWTRHNYYESFSLSPAAVADNVERADALQLSVEEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MNHKSKKRIREAKRSARPELKDSLDWTRHNYYESFSLSPAAVADNVERADALQLSVEEFV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD ERYERPYKPVVLLNAQEGWSAQEKWTLERLKRKYRNQKFKCGEDNDGYSVKMKMKYYIEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 ERYERPYKPVVLLNAQEGWSAQEKWTLERLKRKYRNQKFKCGEDNDGYSVKMKMKYYIEY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD MESTRDDSPLYIFDSSYGEHPKRRKLLEDYKVPKFFTDDLFQYAGEKRRPPYRWFVMGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MESTRDDSPLYIFDSSYGEHPKRRKLLEDYKVPKFFTDDLFQYAGEKRRPPYRWFVMGPP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD RSGTGIHIDPLGTSAWNALVQGHKRWCLFPTSTPRELIKVTRDEGGNQQDEAITWFNVIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 RSGTGIHIDPLGTSAWNALVQGHKRWCLFPTSTPRELIKVTRDEGGNQQDEAITWFNVIY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD PRTQLPTWPPEFKPLEILQKPGETVFVPGGWWHVVLNLDTTIAITQNFASSTNFPVVWHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 PRTQLPTWPPEFKPLEILQKPGETVFVPGGWWHVVLNLDTTIAITQNFASSTNFPVVWHK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD TVRGRPKLSRKWYRILKQEHPELAVLADSVDLQESTGIASDSSSDSSSSSSSSSSDSDSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TVRGRPKLSRKWYRILKQEHPELAVLADSVDLQESTGIASDSSSDSSSSSSSSSSDSDSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KSD CESGSEGDGTVHRRKKRRTCSMVGNGDTTSQDDCVSKERSSSRIRDTCGGRAHP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 CESGSEGDGTVHRRKKRRTCSMVGNGDTTSQDDCVSKERSSSR
370 380 390 400
>>XP_016862668 (OMIM: 608263) PREDICTED: HSPB1-associate (426 aa)
initn: 148 init1: 94 opt: 175 Z-score: 173.3 bits: 41.1 E(85289): 0.0065
Smith-Waterman score: 175; 22.7% identity (52.9% similar) in 278 aa overlap (129-392:52-312)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD FKCGEDNDGYSVKMKMKYYIEYMESTRDDSPLYIFDSS----YGEHPKRRKLLEDYKVPK
:. .: : :... .:.::
XP_016 VPQFETTCNYVEATLEEFLTWNCDQSSISGPFRDYDHSKFWAYADYKYFVSLFEDK--TD
30 40 50 60 70
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FFTD---DLFQYAGEKRRPPYRWFVMGPPRSGTGIHIDPLGTSAWNALVQGHKRWCLFPT
.: : . : . :.. . : .: . : :.: : . :::.::: :::
XP_016 LFQDVKWSDFGFPGRNGQESTLW--IGSLGAHTPCHLDSYGCNLVFQ-VQGRKRWHLFPP
80 90 100 110 120 130
220 230 240 250 260
pF1KSD -STPRELIKVTRDEGGNQQDEAITWFNVIYPRTQLPTWPPEFKPLE---ILQKPGETVFV
.:: .. :: ... ... .::. : .: .: .:. . . .::...::
XP_016 EDTP--FLYPTRIP--YEESSVFSKINVVNP--DLKRFP-QFRKAQRHAVTLSPGQVLFV
140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KSD PGGWWHVVLNLDTTIAITQNFASSTNFPVVWHKTVRGRPKLSRKWYRILKQ-EHPE-LAV
: ::: : ..: .... : . . . . .: . ..: :: :.:. .
XP_016 PRHWWHYVESIDP-VTVSIN----SWIELEEDHLARVEEAITRMLVCALKTAENPQNTRA
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KSD LADSVDLQESTGIASDSSSDSSSSSSSSSSDSDSECE-SGSEGDGTVHRRKKRRTCSMVG
. ....:.. .. ... :. . .. : .. . :: .... .:. .
XP_016 WLNPTEVEETSHAVNCCYLNAAVSAFFDRCRTSEVVEIQALRTDGEHMKKEELNVCNHME
250 260 270 280 290 300
390 400 410
pF1KSD NGDTTSQDDCVSKERSSSRIRDTCGGRAHP
:.: ::.
XP_016 VGQTGSQNLTTGTDKPEAASPFGPDLVPVAQRSEEPPSERGGIFGSDGKDFVDKDGEHFG
310 320 330 340 350 360
>>XP_011511434 (OMIM: 608263) PREDICTED: HSPB1-associate (449 aa)
initn: 148 init1: 94 opt: 175 Z-score: 172.9 bits: 41.1 E(85289): 0.0068
Smith-Waterman score: 175; 22.7% identity (52.9% similar) in 278 aa overlap (129-392:75-335)
100 110 120 130 140 150
pF1KSD FKCGEDNDGYSVKMKMKYYIEYMESTRDDSPLYIFDSS----YGEHPKRRKLLEDYKVPK
:. .: : :... .:.::
XP_011 VPQFETTCNYVEATLEEFLTWNCDQSSISGPFRDYDHSKFWAYADYKYFVSLFEDK--TD
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KSD FFTD---DLFQYAGEKRRPPYRWFVMGPPRSGTGIHIDPLGTSAWNALVQGHKRWCLFPT
.: : . : . :.. . : .: . : :.: : . :::.::: :::
XP_011 LFQDVKWSDFGFPGRNGQESTLW--IGSLGAHTPCHLDSYGCNLVFQ-VQGRKRWHLFPP
110 120 130 140 150
220 230 240 250 260
pF1KSD -STPRELIKVTRDEGGNQQDEAITWFNVIYPRTQLPTWPPEFKPLE---ILQKPGETVFV
.:: .. :: ... ... .::. : .: .: .:. . . .::...::
XP_011 EDTP--FLYPTRIP--YEESSVFSKINVVNP--DLKRFP-QFRKAQRHAVTLSPGQVLFV
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KSD PGGWWHVVLNLDTTIAITQNFASSTNFPVVWHKTVRGRPKLSRKWYRILKQ-EHPE-LAV
: ::: : ..: .... : . . . . .: . ..: :: :.:. .
XP_011 PRHWWHYVESIDP-VTVSIN----SWIELEEDHLARVEEAITRMLVCALKTAENPQNTRA
220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KSD LADSVDLQESTGIASDSSSDSSSSSSSSSSDSDSECE-SGSEGDGTVHRRKKRRTCSMVG
. ....:.. .. ... :. . .. : .. . :: .... .:. .
XP_011 WLNPTEVEETSHAVNCCYLNAAVSAFFDRCRTSEVVEIQALRTDGEHMKKEELNVCNHME
270 280 290 300 310 320
390 400 410
pF1KSD NGDTTSQDDCVSKERSSSRIRDTCGGRAHP
:.: ::.
XP_011 VGQTGSQNLTTGTDKPEAASPFGPDLVPVAQRSEEPPSERGGIFGSDGKDFVDKDGEHFG
330 340 350 360 370 380
>>XP_011511432 (OMIM: 608263) PREDICTED: HSPB1-associate (451 aa)
initn: 148 init1: 94 opt: 175 Z-score: 172.9 bits: 41.1 E(85289): 0.0068
Smith-Waterman score: 203; 22.1% identity (52.7% similar) in 349 aa overlap (68-392:5-337)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD SPAAVADNVERADALQLSVEEFVERYERPYKPVVLLNAQEGWSAQEKWTLERLKRKYRNQ
.:... : : :.. :. . :.. ...
XP_011 MSLQQPAIFCNMVFDWPARH-WNAKYLSQVLHGK
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KFKCGEDNDGYSVKMKMKYYIEYMESTRDDSPLYIFDSSYGEHPKR----RKL--LEDYK
... ..:. ... .:.:.: .. . :.: : : :. :::
XP_011 QIRFRMGMKSMSTVPQFETTCNYVEATLEEFLTWNCDQSSISGPFRDYDHSKFWAYADYK
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200
pF1KSD V-PKFFTD--DLFQ--------YAGEKRRPPYRWFVMGPPRSGTGIHIDPLGTSAWNALV
..: : :::: . :.. . : .: . : :.: : . :
XP_011 YFVSLFEDKTDLFQDVKWSDFGFPGRNGQESTLW--IGSLGAHTPCHLDSYGCNLVFQ-V
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250
pF1KSD QGHKRWCLFPT-STPRELIKVTRDEGGNQQDEAITWFNVIYPRTQLPTWPPEFKPLE---
::.::: ::: .:: .. :: ... ... .::. : .: .: .:. .
XP_011 QGRKRWHLFPPEDTP--FLYPTRIP--YEESSVFSKINVVNP--DLKRFP-QFRKAQRHA
160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KSD ILQKPGETVFVPGGWWHVVLNLDTTIAITQNFASSTNFPVVWHKTVRGRPKLSRKWYRIL
. .::...::: ::: : ..: .... : . . . . .: . ..: :
XP_011 VTLSPGQVLFVPRHWWHYVESIDP-VTVSIN----SWIELEEDHLARVEEAITRMLVCAL
210 220 230 240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KSD KQ-EHPE-LAVLADSVDLQESTGIASDSSSDSSSSSSSSSSDSDSECE-SGSEGDGTVHR
: :.:. . . ....:.. .. ... :. . .. : .. . :: .
XP_011 KTAENPQNTRAWLNPTEVEETSHAVNCCYLNAAVSAFFDRCRTSEVVEIQALRTDGEHMK
260 270 280 290 300 310
380 390 400 410
pF1KSD RKKRRTCSMVGNGDTTSQDDCVSKERSSSRIRDTCGGRAHP
... .:. . :.: ::.
XP_011 KEELNVCNHMEVGQTGSQNLTTGTDKPEAASPFGPDLVPVAQRSEEPPSERGGIFGSDGK
320 330 340 350 360 370
>>NP_078886 (OMIM: 608263) HSPB1-associated protein 1 is (488 aa)
initn: 148 init1: 94 opt: 175 Z-score: 172.4 bits: 41.1 E(85289): 0.0073
Smith-Waterman score: 203; 22.1% identity (52.7% similar) in 349 aa overlap (68-392:42-374)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD SPAAVADNVERADALQLSVEEFVERYERPYKPVVLLNAQEGWSAQEKWTLERLKRKYRNQ
.:... : : :.. :. . :.. ...
NP_078 IVAAGAGGEEGEHVKPFKPEKAKEIIMSLQQPAIFCNMVFDWPARH-WNAKYLSQVLHGK
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KFKCGEDNDGYSVKMKMKYYIEYMESTRDDSPLYIFDSSYGEHPKR----RKL--LEDYK
... ..:. ... .:.:.: .. . :.: : : :. :::
NP_078 QIRFRMGMKSMSTVPQFETTCNYVEATLEEFLTWNCDQSSISGPFRDYDHSKFWAYADYK
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200
pF1KSD V-PKFFTD--DLFQ--------YAGEKRRPPYRWFVMGPPRSGTGIHIDPLGTSAWNALV
..: : :::: . :.. . : .: . : :.: : . :
NP_078 YFVSLFEDKTDLFQDVKWSDFGFPGRNGQESTLW--IGSLGAHTPCHLDSYGCNLVFQ-V
140 150 160 170 180
210 220 230 240 250
pF1KSD QGHKRWCLFPT-STPRELIKVTRDEGGNQQDEAITWFNVIYPRTQLPTWPPEFKPLE---
::.::: ::: .:: .. :: ... ... .::. : .: .: .:. .
NP_078 QGRKRWHLFPPEDTP--FLYPTRIP--YEESSVFSKINVVNP--DLKRFP-QFRKAQRHA
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KSD ILQKPGETVFVPGGWWHVVLNLDTTIAITQNFASSTNFPVVWHKTVRGRPKLSRKWYRIL
. .::...::: ::: : ..: .... : . . . . .: . ..: :
NP_078 VTLSPGQVLFVPRHWWHYVESIDP-VTVSIN----SWIELEEDHLARVEEAITRMLVCAL
250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KSD KQ-EHPE-LAVLADSVDLQESTGIASDSSSDSSSSSSSSSSDSDSECE-SGSEGDGTVHR
: :.:. . . ....:.. .. ... :. . .. : .. . :: .
NP_078 KTAENPQNTRAWLNPTEVEETSHAVNCCYLNAAVSAFFDRCRTSEVVEIQALRTDGEHMK
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410
pF1KSD RKKRRTCSMVGNGDTTSQDDCVSKERSSSRIRDTCGGRAHP
... .:. . :.: ::.
NP_078 KEELNVCNHMEVGQTGSQNLTTGTDKPEAASPFGPDLVPVAQRSEEPPSERGGIFGSDGK
360 370 380 390 400 410
414 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 02:11:16 2016 done: Thu Nov 3 02:11:17 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]