Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0475
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0475, 409 aa
1>>>pF1KSDA0475 409 - 409 aa - 409 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0966+/-0.00045; mu= 18.1218+/- 0.028
mean_var=66.8962+/-13.331, 0's: 0 Z-trim(109.8): 18 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.156810
statistics sampled from 17972 (17988) to 17972 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.581), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16
Scan time: 7.420
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_055679 (OMIM: 611063) glycosaminoglycan xylosyl ( 409) 2763 634.5 1.4e-181
NP_001311239 (OMIM: 611063) glycosaminoglycan xylo ( 409) 2763 634.5 1.4e-181
NP_001311240 (OMIM: 611063) glycosaminoglycan xylo ( 409) 2763 634.5 1.4e-181
XP_016858490 (OMIM: 611063) PREDICTED: glycosamino ( 432) 1954 451.5 1.9e-126
XP_016858491 (OMIM: 611063) PREDICTED: glycosamino ( 432) 1954 451.5 1.9e-126
NP_064608 (OMIM: 259775,611061) extracellular seri ( 584) 941 222.4 2.3e-57
XP_016867944 (OMIM: 259775,611061) PREDICTED: extr ( 350) 894 211.6 2.4e-54
XP_016867940 (OMIM: 259775,611061) PREDICTED: extr ( 670) 894 211.8 4.1e-54
XP_016867939 (OMIM: 259775,611061) PREDICTED: extr ( 671) 894 211.8 4.1e-54
XP_006722022 (OMIM: 204690,611062) PREDICTED: pseu ( 403) 814 193.5 7.7e-49
NP_001230675 (OMIM: 204690,611062) pseudokinase FA ( 403) 814 193.5 7.7e-49
NP_060035 (OMIM: 204690,611062) pseudokinase FAM20 ( 541) 814 193.6 9.7e-49
XP_011523220 (OMIM: 204690,611062) PREDICTED: pseu ( 371) 352 89.0 2.1e-17
XP_016880270 (OMIM: 204690,611062) PREDICTED: pseu ( 389) 352 89.0 2.2e-17
XP_016867941 (OMIM: 259775,611061) PREDICTED: extr ( 447) 240 63.7 1e-09
>>NP_055679 (OMIM: 611063) glycosaminoglycan xylosylkina (409 aa)
initn: 2763 init1: 2763 opt: 2763 Z-score: 3380.7 bits: 634.5 E(85289): 1.4e-181
Smith-Waterman score: 2763; 100.0% identity (100.0% similar) in 409 aa overlap (1-409:1-409)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKLKQRVVLLAILLVIFIFTKVFLIDNLDTSAANREDQRAFHRMMTGLRVELAPKLDHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 MKLKQRVVLLAILLVIFIFTKVFLIDNLDTSAANREDQRAFHRMMTGLRVELAPKLDHTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QSPWEIAAQWVVPREVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADVGYKGTQLKALLILEGGQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 QSPWEIAAQWVVPREVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADVGYKGTQLKALLILEGGQKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VFKPKRYSRDHVVEGEPYAGYDRHNAEVAAFHLDRILGFHRAPLVVGRFVNLRTEIKPVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 VFKPKRYSRDHVVEGEPYAGYDRHNAEVAAFHLDRILGFHRAPLVVGRFVNLRTEIKPVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TEQLLSTFLTVGNNTCFYGKCYYCRETEPACADGDIMEGSVTLWLPDVWPLQKHRHPWGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TEQLLSTFLTVGNNTCFYGKCYYCRETEPACADGDIMEGSVTLWLPDVWPLQKHRHPWGR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIIDTAVFDYLIGNADRHHYESFQDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 TYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIIDTAVFDYLIGNADRHHYESFQDDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVSTWNRLNYLKNGVLKSALKSAMAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 GASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVSTWNRLNYLKNGVLKSALKSAMAH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KSD DPISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGMDTVLVEDRMPLSHL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_055 DPISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGMDTVLVEDRMPLSHL
370 380 390 400
>>NP_001311239 (OMIM: 611063) glycosaminoglycan xylosylk (409 aa)
initn: 2763 init1: 2763 opt: 2763 Z-score: 3380.7 bits: 634.5 E(85289): 1.4e-181
Smith-Waterman score: 2763; 100.0% identity (100.0% similar) in 409 aa overlap (1-409:1-409)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKLKQRVVLLAILLVIFIFTKVFLIDNLDTSAANREDQRAFHRMMTGLRVELAPKLDHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKLKQRVVLLAILLVIFIFTKVFLIDNLDTSAANREDQRAFHRMMTGLRVELAPKLDHTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QSPWEIAAQWVVPREVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADVGYKGTQLKALLILEGGQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSPWEIAAQWVVPREVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADVGYKGTQLKALLILEGGQKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VFKPKRYSRDHVVEGEPYAGYDRHNAEVAAFHLDRILGFHRAPLVVGRFVNLRTEIKPVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFKPKRYSRDHVVEGEPYAGYDRHNAEVAAFHLDRILGFHRAPLVVGRFVNLRTEIKPVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TEQLLSTFLTVGNNTCFYGKCYYCRETEPACADGDIMEGSVTLWLPDVWPLQKHRHPWGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TEQLLSTFLTVGNNTCFYGKCYYCRETEPACADGDIMEGSVTLWLPDVWPLQKHRHPWGR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIIDTAVFDYLIGNADRHHYESFQDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIIDTAVFDYLIGNADRHHYESFQDDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVSTWNRLNYLKNGVLKSALKSAMAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVSTWNRLNYLKNGVLKSALKSAMAH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KSD DPISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGMDTVLVEDRMPLSHL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGMDTVLVEDRMPLSHL
370 380 390 400
>>NP_001311240 (OMIM: 611063) glycosaminoglycan xylosylk (409 aa)
initn: 2763 init1: 2763 opt: 2763 Z-score: 3380.7 bits: 634.5 E(85289): 1.4e-181
Smith-Waterman score: 2763; 100.0% identity (100.0% similar) in 409 aa overlap (1-409:1-409)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKLKQRVVLLAILLVIFIFTKVFLIDNLDTSAANREDQRAFHRMMTGLRVELAPKLDHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MKLKQRVVLLAILLVIFIFTKVFLIDNLDTSAANREDQRAFHRMMTGLRVELAPKLDHTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QSPWEIAAQWVVPREVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADVGYKGTQLKALLILEGGQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QSPWEIAAQWVVPREVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADVGYKGTQLKALLILEGGQKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VFKPKRYSRDHVVEGEPYAGYDRHNAEVAAFHLDRILGFHRAPLVVGRFVNLRTEIKPVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFKPKRYSRDHVVEGEPYAGYDRHNAEVAAFHLDRILGFHRAPLVVGRFVNLRTEIKPVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TEQLLSTFLTVGNNTCFYGKCYYCRETEPACADGDIMEGSVTLWLPDVWPLQKHRHPWGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TEQLLSTFLTVGNNTCFYGKCYYCRETEPACADGDIMEGSVTLWLPDVWPLQKHRHPWGR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD TYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIIDTAVFDYLIGNADRHHYESFQDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIIDTAVFDYLIGNADRHHYESFQDDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVSTWNRLNYLKNGVLKSALKSAMAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVSTWNRLNYLKNGVLKSALKSAMAH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400
pF1KSD DPISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGMDTVLVEDRMPLSHL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DPISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGMDTVLVEDRMPLSHL
370 380 390 400
>>XP_016858490 (OMIM: 611063) PREDICTED: glycosaminoglyc (432 aa)
initn: 1954 init1: 1954 opt: 1954 Z-score: 2391.2 bits: 451.5 E(85289): 1.9e-126
Smith-Waterman score: 2707; 94.7% identity (94.7% similar) in 432 aa overlap (1-409:1-432)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKLKQRVVLLAILLVIFIFTKVFLIDNLDTSAANREDQRAFHRMMTGLRVELAPKLDHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKLKQRVVLLAILLVIFIFTKVFLIDNLDTSAANREDQRAFHRMMTGLRVELAPKLDHTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QSPWEIAAQWVVPREVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADVGYKGTQLKALLILEGGQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QSPWEIAAQWVVPREVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADVGYKGTQLKALLILEGGQKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150
pF1KSD VFKPKR-----------------------YSRDHVVEGEPYAGYDRHNAEVAAFHLDRIL
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VFKPKRFLCGHKFSTHLDRYQKHNCWTTWYSRDHVVEGEPYAGYDRHNAEVAAFHLDRIL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GFHRAPLVVGRFVNLRTEIKPVATEQLLSTFLTVGNNTCFYGKCYYCRETEPACADGDIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GFHRAPLVVGRFVNLRTEIKPVATEQLLSTFLTVGNNTCFYGKCYYCRETEPACADGDIM
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD EGSVTLWLPDVWPLQKHRHPWGRTYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EGSVTLWLPDVWPLQKHRHPWGRTYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIID
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD TAVFDYLIGNADRHHYESFQDDEGASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TAVFDYLIGNADRHHYESFQDDEGASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVS
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD TWNRLNYLKNGVLKSALKSAMAHDPISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGMDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TWNRLNYLKNGVLKSALKSAMAHDPISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGMDT
370 380 390 400 410 420
400
pF1KSD VLVEDRMPLSHL
::::::::::::
XP_016 VLVEDRMPLSHL
430
>>XP_016858491 (OMIM: 611063) PREDICTED: glycosaminoglyc (432 aa)
initn: 1954 init1: 1954 opt: 1954 Z-score: 2391.2 bits: 451.5 E(85289): 1.9e-126
Smith-Waterman score: 2707; 94.7% identity (94.7% similar) in 432 aa overlap (1-409:1-432)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MKLKQRVVLLAILLVIFIFTKVFLIDNLDTSAANREDQRAFHRMMTGLRVELAPKLDHTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MKLKQRVVLLAILLVIFIFTKVFLIDNLDTSAANREDQRAFHRMMTGLRVELAPKLDHTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD QSPWEIAAQWVVPREVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADVGYKGTQLKALLILEGGQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QSPWEIAAQWVVPREVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADVGYKGTQLKALLILEGGQKV
70 80 90 100 110 120
130 140 150
pF1KSD VFKPKR-----------------------YSRDHVVEGEPYAGYDRHNAEVAAFHLDRIL
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VFKPKRFLCGHKFSTHLDRYQKHNCWTTWYSRDHVVEGEPYAGYDRHNAEVAAFHLDRIL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KSD GFHRAPLVVGRFVNLRTEIKPVATEQLLSTFLTVGNNTCFYGKCYYCRETEPACADGDIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GFHRAPLVVGRFVNLRTEIKPVATEQLLSTFLTVGNNTCFYGKCYYCRETEPACADGDIM
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KSD EGSVTLWLPDVWPLQKHRHPWGRTYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EGSVTLWLPDVWPLQKHRHPWGRTYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIID
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD TAVFDYLIGNADRHHYESFQDDEGASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TAVFDYLIGNADRHHYESFQDDEGASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVS
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD TWNRLNYLKNGVLKSALKSAMAHDPISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGMDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TWNRLNYLKNGVLKSALKSAMAHDPISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGMDT
370 380 390 400 410 420
400
pF1KSD VLVEDRMPLSHL
::::::::::::
XP_016 VLVEDRMPLSHL
430
>>NP_064608 (OMIM: 259775,611061) extracellular serine/t (584 aa)
initn: 883 init1: 417 opt: 941 Z-score: 1150.8 bits: 222.4 E(85289): 2.3e-57
Smith-Waterman score: 943; 42.5% identity (71.7% similar) in 346 aa overlap (75-408:237-578)
50 60 70 80 90 100
pF1KSD MTGLRVELAPKLDHTLQSPWEIAAQWVVPREVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADVGYK
:.: ...: . :..: .....: .. .
NP_064 AEGAEFLSPGEAAVDSYPNWLKFHIGINRYELYSRHNPAIEALLHDLSSQRITSVAMKSG
210 220 230 240 250 260
110 120 130 140 150 160
pF1KSD GTQLKALLILEGGQKVVFKPKRYSRDHVVEGEP----YAGYDRHNAEVAAFHLDRILGFH
::::: .. ... ...::: . .:.. : : .. :.:::::.::::::::: :.
NP_064 GTQLKLIMTFQNYGQALFKPMKQTREQ--ETPPDFFYFSDYERHNAEIAAFHLDRILDFR
270 280 290 300 310 320
170 180 190 200 210
pF1KSD RAPLVVGRFVNLRTEIKPVATEQLL--STFLTVGNNTCFYGKC-YYCRETEPACADGDIM
:.: :.::.::. ::. :. .. : . :.. .:: ::::.: ::: . :. : .
NP_064 RVPPVAGRMVNMTKEIRDVTRDKKLWRTFFISPANNICFYGECSYYCSTEHALCGKPDQI
330 340 350 360 370 380
220 230 240 250 260 270
pF1KSD EGSVTLWLPDVWPLQKH---RHPWGRTYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLD
:::.. .:::. : :. :.:: :.:.. : :.:: : .::. ::.: ::::. :.::
NP_064 EGSLAAFLPDL-SLAKRKTWRNPWRRSYHKRKKAEWEVDPDYCEEVKQTPPYDSSHRILD
390 400 410 420 430 440
280 290 300 310 320 330
pF1KSD IIDTAVFDYLIGNADRHHYESFQDDEGASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCII
..: ..::.:.:: ::::::.:. . ...: :::...::. : :: :::.:: ::: :
NP_064 VMDMTIFDFLMGNMDRHHYETFEKFGNETFIIHLDNGRGFGKYSHDELSILVPLQQCCRI
450 460 470 480 490 500
340 350 360 370 380 390
pF1KSD RVSTWNRLNYLKNGVLKSALKSA--MAHDPISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQ
: ::. ::. : . : .: : . : ..::: .:::.:.:.:: :: .:..:...
NP_064 RKSTYLRLQLLAKEEYKLSLLMAESLRGDQVAPVLYQPHLEALDRRLRVVLKAVRDCVER
510 520 530 540 550 560
400
pF1KSD FGMDTVLVEDRMPLSHL
:. .: :.: . :
NP_064 NGLHSV-VDDDLDTEHRAASAR
570 580
>>XP_016867944 (OMIM: 259775,611061) PREDICTED: extracel (350 aa)
initn: 883 init1: 417 opt: 894 Z-score: 1096.5 bits: 211.6 E(85289): 2.4e-54
Smith-Waterman score: 897; 43.4% identity (70.0% similar) in 343 aa overlap (85-408:6-344)
60 70 80 90 100
pF1KSD KLDHTLQSPWEIAAQWVVPREVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADV-----GYK--GTQ
:. : : : .: . :: ..: :::
XP_016 MTRAKGGNMGAHADGSISHLDVFLWSTAMKSGGTQ
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KSD LKALLILEGGQKVVFKPKRYSRDHVVEGEP----YAGYDRHNAEVAAFHLDRILGFHRAP
:: .. ... ...::: . .:.. : : .. :.:::::.::::::::: :.:.:
XP_016 LKLIMTFQNYGQALFKPMKQTREQ--ETPPDFFYFSDYERHNAEIAAFHLDRILDFRRVP
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KSD LVVGRFVNLRTEIKPVATEQLL--STFLTVGNNTCFYGKC-YYCRETEPACADGDIMEGS
:.::.::. ::. :. .. : . :.. .:: ::::.: ::: . :. : .:::
XP_016 PVAGRMVNMTKEIRDVTRDKKLWRTFFISPANNICFYGECSYYCSTEHALCGKPDQIEGS
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270
pF1KSD VTLWLPDVWPLQKH---RHPWGRTYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIID
.. .:::. : :. :.:: :.:.. : :.:: : .::. ::.: ::::. :.::..:
XP_016 LAAFLPDL-SLAKRKTWRNPWRRSYHKRKKAEWEVDPDYCEEVKQTPPYDSSHRILDVMD
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KSD TAVFDYLIGNADRHHYESFQDDEGASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVS
..::.:.:: ::::::.:. . ...: :::...::. : :: :::.:: ::: :: :
XP_016 MTIFDFLMGNMDRHHYETFEKFGNETFIIHLDNGRGFGKYSHDELSILVPLQQCCRIRKS
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KSD TWNRLNYLKNGVLKSALKSA--MAHDPISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGM
:. ::. : . : .: : . : ..::: .:::.:.:.:: :: .:..:... :.
XP_016 TYLRLQLLAKEEYKLSLLMAESLRGDQVAPVLYQPHLEALDRRLRVVLKAVRDCVERNGL
280 290 300 310 320 330
400
pF1KSD DTVLVEDRMPLSHL
.: :.: . :
XP_016 HSV-VDDDLDTEHRAASAR
340 350
>>XP_016867940 (OMIM: 259775,611061) PREDICTED: extracel (670 aa)
initn: 883 init1: 417 opt: 894 Z-score: 1092.5 bits: 211.8 E(85289): 4.1e-54
Smith-Waterman score: 896; 44.6% identity (71.8% similar) in 316 aa overlap (105-408:353-664)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD EVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADVGYKGTQLKALLILEGGQKVVFKPKRYSRDHVVE
::::: .. ... ...::: . .:.. :
XP_016 RVERRGLHWEGLRTFHRVCRAAYLPAMKSGGTQLKLIMTFQNYGQALFKPMKQTREQ--E
330 340 350 360 370 380
140 150 160 170 180
pF1KSD GEP----YAGYDRHNAEVAAFHLDRILGFHRAPLVVGRFVNLRTEIKPVATEQLL--STF
: .. :.:::::.::::::::: :.:.: :.::.::. ::. :. .. : . :
XP_016 TPPDFFYFSDYERHNAEIAAFHLDRILDFRRVPPVAGRMVNMTKEIRDVTRDKKLWRTFF
390 400 410 420 430 440
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LTVGNNTCFYGKC-YYCRETEPACADGDIMEGSVTLWLPDVWPLQKH---RHPWGRTYRE
.. .:: ::::.: ::: . :. : .:::.. .:::. : :. :.:: :.:..
XP_016 ISPANNICFYGECSYYCSTEHALCGKPDQIEGSLAAFLPDL-SLAKRKTWRNPWRRSYHK
450 460 470 480 490
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIIDTAVFDYLIGNADRHHYESFQDDEGASM
: :.:: : .::. ::.: ::::. :.::..: ..::.:.:: ::::::.:. . ..
XP_016 RKKAEWEVDPDYCEEVKQTPPYDSSHRILDVMDMTIFDFLMGNMDRHHYETFEKFGNETF
500 510 520 530 540 550
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVSTWNRLNYLKNGVLKSALKSA--MAHDP
.: :::...::. : :: :::.:: ::: :: ::. ::. : . : .: : . :
XP_016 IIHLDNGRGFGKYSHDELSILVPLQQCCRIRKSTYLRLQLLAKEEYKLSLLMAESLRGDQ
560 570 580 590 600 610
370 380 390 400
pF1KSD ISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGMDTVLVEDRMPLSHL
..::: .:::.:.:.:: :: .:..:... :. .: :.: . :
XP_016 VAPVLYQPHLEALDRRLRVVLKAVRDCVERNGLHSV-VDDDLDTEHRAASAR
620 630 640 650 660 670
>>XP_016867939 (OMIM: 259775,611061) PREDICTED: extracel (671 aa)
initn: 883 init1: 417 opt: 894 Z-score: 1092.5 bits: 211.8 E(85289): 4.1e-54
Smith-Waterman score: 896; 44.6% identity (71.8% similar) in 316 aa overlap (105-408:354-665)
80 90 100 110 120 130
pF1KSD EVYPEETPELGAVMHAMATKKIIKADVGYKGTQLKALLILEGGQKVVFKPKRYSRDHVVE
::::: .. ... ...::: . .:.. :
XP_016 RVERRGLHWEGLRTFHRVCRAAYLPAMKSGGTQLKLIMTFQNYGQALFKPMKQTREQ--E
330 340 350 360 370 380
140 150 160 170 180
pF1KSD GEP----YAGYDRHNAEVAAFHLDRILGFHRAPLVVGRFVNLRTEIKPVATEQLL--STF
: .. :.:::::.::::::::: :.:.: :.::.::. ::. :. .. : . :
XP_016 TPPDFFYFSDYERHNAEIAAFHLDRILDFRRVPPVAGRMVNMTKEIRDVTRDKKLWRTFF
390 400 410 420 430 440
190 200 210 220 230 240
pF1KSD LTVGNNTCFYGKC-YYCRETEPACADGDIMEGSVTLWLPDVWPLQKH---RHPWGRTYRE
.. .:: ::::.: ::: . :. : .:::.. .:::. : :. :.:: :.:..
XP_016 ISPANNICFYGECSYYCSTEHALCGKPDQIEGSLAAFLPDL-SLAKRKTWRNPWRRSYHK
450 460 470 480 490 500
250 260 270 280 290 300
pF1KSD GKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIIDTAVFDYLIGNADRHHYESFQDDEGASM
: :.:: : .::. ::.: ::::. :.::..: ..::.:.:: ::::::.:. . ..
XP_016 RKKAEWEVDPDYCEEVKQTPPYDSSHRILDVMDMTIFDFLMGNMDRHHYETFEKFGNETF
510 520 530 540 550 560
310 320 330 340 350 360
pF1KSD LILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVSTWNRLNYLKNGVLKSALKSA--MAHDP
.: :::...::. : :: :::.:: ::: :: ::. ::. : . : .: : . :
XP_016 IIHLDNGRGFGKYSHDELSILVPLQQCCRIRKSTYLRLQLLAKEEYKLSLLMAESLRGDQ
570 580 590 600 610 620
370 380 390 400
pF1KSD ISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGMDTVLVEDRMPLSHL
..::: .:::.:.:.:: :: .:..:... :. .: :.: . :
XP_016 VAPVLYQPHLEALDRRLRVVLKAVRDCVERNGLHSV-VDDDLDTEHRAASAR
630 640 650 660 670
>>XP_006722022 (OMIM: 204690,611062) PREDICTED: pseudoki (403 aa)
initn: 698 init1: 369 opt: 814 Z-score: 997.8 bits: 193.5 E(85289): 7.7e-49
Smith-Waterman score: 815; 37.5% identity (65.9% similar) in 387 aa overlap (52-409:11-392)
30 40 50 60 70 80
pF1KSD VFLIDNLDTSAANREDQRAFHRMMTGLRVELAPKLDHTLQSPWEIAAQWVVPRE-VYPEE
: : :. :.. : . . . :. .: .
XP_006 MYREQMNLTSLDPPLQLRLEASW-VQFHLGINRHGLYSRS
10 20 30
90 100 110 120
pF1KSD TPELGAVMHAMATKKIIKAD-----------------VGYKGTQLKALLILEGGQKVVFK
.: .. ... : :.:: : .:..:: .: . :..::
XP_006 SPVVSKLLQDMRHFPTISADYSQDEKALLGACDCTQIVKPSGVHLKLVLRFSDFGKAMFK
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KSD PKRYSRDHV--VEGEPYAGYDRHNAEVAAFHLDRILGFHRAPLVVGRFVNLRTEIKPVAT
: : .::. :. . ..:::::.::::::::: :.:.: .:::.::. :: :.
XP_006 PMRQQRDEETPVDFFYFIDFQRHNAEIAAFHLDRILDFRRVPPTVGRIVNVTKEILEVTK
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230
pF1KSD EQLLST--FLTVGNNTCFYGKC-YYCRETEPACADGDIMEGSVTLWLP--DVWPLQKHRH
...:.. :.. ..:.::..:: :.:. .:.. ..:::.. .:: .. : . .
XP_006 NEILQSVFFVSPASNVCFFAKCPYMCKTEYAVCGNPHLLEGSLSAFLPSLNLAPRLSVPN
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KSD PWGRTYREGKLARWEYDESYCDAVKKTSPYDSGPRLLDIIDTAVFDYLIGNADRHHYESF
:: :.: . .:: . :::.::. ::... :::..:: :.::.:::: :::::: :
XP_006 PWIRSYTLAGKEEWEVNPLYCDTVKQIYPYNNSQRLLNVIDMAIFDFLIGNMDRHHYEMF
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KSD QD--DEGASMLILLDNAKSFGNPSLDERSILAPLYQCCIIRVSTWNRLNYLKNG--VLKS
:.: .:: ::::..:: : :: :::.:: :::.:. .: .:. : .. :..
XP_006 TKFGDDG--FLIHLDNARGFGRHSHDEISILSPLSQCCMIKKKTLLHLQLLAQADYRLSD
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400
pF1KSD ALKSAMAHDPISPVLSDPHLDAVDQRLLSVLATVKQCTDQFGMDTVLVEDRMPLSHL
... .. .: .::::..::: :.:.:: ..: ::. : :...:.:. :. .:
XP_006 VMRESLLEDQLSPVLTEPHLLALDRRLQTILRTVEGCIVAHGQQSVIVDG--PVEQLAPD
340 350 360 370 380 390
XP_006 SGQANLTS
400
409 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 01:51:16 2016 done: Thu Nov 3 01:51:17 2016
Total Scan time: 7.420 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]