Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0426
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0426, 604 aa
1>>>pF1KSDA0426 604 - 604 aa - 604 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3656+/-0.00145; mu= 5.8535+/- 0.085
mean_var=263.5160+/-53.465, 0's: 0 Z-trim(107.9): 942 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.079008
statistics sampled from 8861 (9890) to 8861 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.632), E-opt: 0.2 (0.304), width: 16
Scan time: 2.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1538 189.6 1e-47
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1508 186.1 1e-46
CCDS4649.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 ( 406) 1461 180.6 3.5e-45
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1449 179.4 1.1e-44
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1449 179.4 1.2e-44
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1428 177.0 6e-44
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1428 177.1 6.6e-44
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1419 176.1 1.5e-43
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1419 176.1 1.5e-43
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1416 175.8 1.8e-43
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1409 175.1 4e-43
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1409 175.1 4e-43
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1392 173.1 1.3e-42
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1392 173.1 1.3e-42
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1384 171.9 1.8e-42
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1385 172.2 2e-42
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1384 172.1 2.1e-42
CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1380 171.6 2.7e-42
CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1380 171.6 2.8e-42
CCDS59370.1 ZNF728 gene_id:388523|Hs108|chr19 ( 622) 1375 171.0 4.1e-42
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1373 170.7 4.2e-42
CCDS12955.1 ZNF530 gene_id:348327|Hs108|chr19 ( 599) 1373 170.8 4.7e-42
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1373 170.9 5.7e-42
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1373 170.9 5.7e-42
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1373 170.9 5.7e-42
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1376 171.5 6.1e-42
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 1364 169.6 8.5e-42
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 1361 169.3 1.1e-41
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1361 169.5 1.3e-41
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1359 169.1 1.4e-41
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1359 169.2 1.5e-41
CCDS47931.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 496) 1353 168.4 2e-41
CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 536) 1353 168.4 2.1e-41
CCDS42636.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 662) 1347 167.8 3.9e-41
CCDS82405.1 ZNF17 gene_id:7565|Hs108|chr19 ( 664) 1347 167.8 3.9e-41
CCDS74462.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 617) 1346 167.7 4e-41
CCDS62623.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 574) 1345 167.5 4.2e-41
CCDS12950.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 659) 1346 167.7 4.2e-41
CCDS74324.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 586) 1345 167.5 4.2e-41
CCDS74323.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 618) 1345 167.6 4.4e-41
CCDS77365.1 ZNF304 gene_id:57343|Hs108|chr19 ( 706) 1346 167.8 4.4e-41
CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 1345 167.6 4.5e-41
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 ( 541) 1342 167.2 5.1e-41
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 1340 167.2 8.4e-41
CCDS32440.1 ZNF267 gene_id:10308|Hs108|chr16 ( 743) 1336 166.6 1e-40
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1333 166.3 1.3e-40
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1331 166.0 1.3e-40
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 1331 166.0 1.3e-40
CCDS14278.1 ZNF157 gene_id:7712|Hs108|chrX ( 506) 1329 165.7 1.4e-40
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1331 166.0 1.4e-40
>>CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 (614 aa)
initn: 3359 init1: 985 opt: 1538 Z-score: 970.0 bits: 189.6 E(32554): 1e-47
Smith-Waterman score: 1648; 44.6% identity (71.1% similar) in 558 aa overlap (13-562:26-567)
10 20 30 40
pF1KSD MASTWAIQAHMDQDEPLEVKIEEEKYTTRQDWDLRKNNTHSREVFRQ
:.: . . : :. . :. :.... .: : : :
CCDS10 MMAADIPRVTTPLSSLVQVPQEEDRQEEEVTTMILEDD-SWVQEAVLQEDGPES-EPFPQ
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KSD YFRQFCYQE--TSGPREALSRLRELCHQWLRPETHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAW
. :: : ::. ::.::::::..:::::.:::::.: :.::.:.:::
CCDS10 SAGKGGPQEEVTRGPQGALGRLRELCRRWLRPEVHTKEQML---------TMLPKEIQAW
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KSD VQEQHPESGEEVVTVLEDLERELDEPGEQVSVHTGE---QEMFLQETVRLRKEGEPSMSL
.::..:::.::.....::: . :.. ... ..:: :.:: .:. .. .: . :
CCDS10 LQEHRPESSEEAAALVEDLTQTLQDSDFEIQSENGENCNQDMFENESRKIFSEMPEGESA
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KSD QSMKAQPKYESPELESQQEQVLDVETGNEYGNLKQEVSEEMEPHGKTSSKFENDMSKSAR
: .. .: .. ... :...:.. .. : . : .. . . . .
CCDS10 QHSDGESDFER---DAGIQRLQGHSPGEDHGEVVSQDREVGQLIGLQGTYLGEKPYECPQ
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KSD CGET--REPEEITEEPSACSREDKQPTCDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESYGCDDCG
::.: :. . ::.: . . .: ::: : :....:. ..:: ::. : : :::
CCDS10 CGKTFSRKSHLITHERTHTG--EKYYKCDECGKSFSDGSNFSRHQTTHTGEKPYKCRDCG
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KSD KAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFG
:.::. ..:: :::::::..:..: ::::.: :: :. :::::::.: ::::.::
CCDS10 KSFSRSANLITHQRIHTGEKPFQCAECGKSFSRSPNLIAHQRTHTGEKPYSCPECGKSFG
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KSD RWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSI
:.:: :: .::::: :.:..::..:: ...:..: .::: .:::.::.:.. ::. :
CCDS10 NRSSLNTHQGIHTGEKPYECKECGESFSYNSNLIRHQRIHTGEKPYKCTDCGQRFSQSSA
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KSD LTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFSQSG-LIQH
: :. .::: :::.:.::::.: .:.:..:.. : :: :.: ::::::::. :: :
CCDS10 LITHRRTHTGEKPYQCSECGKSFSRSSNLATHRRTHMVEKPYKCGVCGKSFSQSSSLIAH
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KSD QRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIH
: .:::::::.: .: ..: ..: .::::::::.::::..::: :.::: :. ::: :
CCDS10 QGMHTGEKPYECLTCGESFSWSSNLLKHQRIHTGEKPYKCSECGKCFSQRSQLVVHQRTH
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KSD TGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHS
:::.:::: ::..: . :..::: : :.:::.: ::::.:
CCDS10 TGEKPYKCLMCGKSFSRGSILVMHQRAHLGDKPYRCPECGKGFSWNSVLIIHQRIHTGEK
530 540 550 560 570 580
580 590 600
pF1KSD EPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL
CCDS10 PYKCPECGKGFSNSSNFITHQRTHMKEKLY
590 600 610
>>CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 (544 aa)
initn: 3448 init1: 924 opt: 1508 Z-score: 952.2 bits: 186.1 E(32554): 1e-46
Smith-Waterman score: 1520; 53.5% identity (74.8% similar) in 409 aa overlap (196-602:117-502)
170 180 190 200 210 220
pF1KSD KAQPKYESPELESQQEQVLDVETGNEYGNLKQEVSEEMEPHGKTSSKFE-NDMSKSARCG
. .:: : : .:... ::.: ...:
CCDS27 TFIHKEAPPEIISQGYNFEKSLLLTSSLVTRLRVSTEESLHQWETSNIQTNDISDQSKC-
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KSD ETREPEEITEEPSACSREDKQPTCDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESYGCDDCGKAFS
:. :... :. :.: : ..:..:. :.::: ::. : :..::::::
CCDS27 -----------PTLCTQK-KSWKCNECGKTFTQSSSLTQHQRTHTGERPYTCEECGKAFS
150 160 170 180 190
290 300 310 320 330 340
pF1KSD QHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGRWSA
. : :..::::::: .:: ::.:::.:: :. : .:. ::::::::::::::..: :
CCDS27 RSSFLVQHQRIHTGVKPYGCEQCGKTFRCRSFLTQHQRIHTGEKPYKCNECGNSFRNHSH
200 210 220 230 240 250
350 360 370 380 390 400
pF1KSD LNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQH
:..:::.::::: :.:: :::::.:.. :.:: .::: .::: :..:..:: ..: ::::
CCDS27 LTEHQRIHTGEKPYKCNRCGKAFNQNTHLIHHQRIHTGEKPYICSECGSSFRKHSNLTQH
260 270 280 290 300 310
410 420 430 440 450 460
pF1KSD QGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFSQS-GLIQHQRIH
: .::: ::..:.::::.: ...: .::.:: :: :.::::::.: :: .::.:::::
CCDS27 QRIHTGEKPHKCDECGKTFQTKANLSQHQRIHSGEKPYKCKECGKAFCQSPSLIKHQRIH
320 330 340 350 360 370
470 480 490 500 510 520
pF1KSD TGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGER
:::::::: : ::: : : ::.:::::::::::::..::::: : : .::: ::::.
CCDS27 TGEKPYKCKECGKAFTQSTPLTKHQRIHTGERPYKCSECGKAFIQSICLIRHQRSHTGEK
380 390 400 410 420 430
530 540 550 560 570 580
pF1KSD PYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHSEPQA
::::.:::..: : : ::.:::::::::.: :::::: . .. : .: . ..
CCDS27 PYKCNECGKGFNQNTCLTQHMRIHTGEKPYKCKECGKAFAHSSS-------LTEHHRTHT
440 450 460 470 480
590 600
pF1KSD GVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL
: .: : : .. ::.
CCDS27 GEKLYKCS---ECEKTFRKYAHLSEHYRIHTGEKPYECIECGKFFRHSSVLFRHQKLHSG
490 500 510 520 530 540
>>CCDS4649.1 ZSCAN31 gene_id:64288|Hs108|chr6 (406 aa)
initn: 1783 init1: 1356 opt: 1461 Z-score: 924.7 bits: 180.6 E(32554): 3.5e-45
Smith-Waterman score: 1461; 56.4% identity (78.4% similar) in 399 aa overlap (19-413:13-406)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASTWAIQAHMDQDEPLEVKIEEEKYTTRQDWDLRKNNTHSREVFRQYFRQFCYQETSGP
::.::. :. :: :: ..:. :: ::::::::: ::
CCDS46 MASTEEQYDLKIVKVEEDPIWD-QETHLRGNNFSGQEASRQLFRQFCYQETPGP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KSD REALSRLRELCHQWLRPETHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVQEQHPESGEEVVTV
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::.:.:
CCDS46 REALSRLRELCHQWLRPEIHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVREHHPESGEEAVAV
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KSD LEDLERELDEPGEQVSVHT-GEQEMFLQETVRLRKEGEPS-MSLQSMKAQPKYESPELES
.::::.::.:::.:. : :..:..:... .:. . ::. ..:: : .: .::: :..
CCDS46 VEDLEQELSEPGNQAPDHEHGHSEVLLEDVEHLKVKQEPTDIQLQPMVTQLRYESFCLHQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD QQEQVLDVETGNEYGNL--KQEVSEEMEPHGKTSSKFENDMSKSARCGETREPEEITEEP
::: : :. : .: :::. .::: : .::.. :.: ... :: . . .:.
CCDS46 FQEQ--DGESIPENQELASKQEILKEMEHLG--DSKLQRDVSLDSKYRETCKRDSKAEKQ
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SACSREDKQPTCDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESYGCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIH
.: : ... :.: : :.:..: ::::: ::. : :..::::::..: : ::.: :
CCDS46 QAHSTGERRHRCNECGKSFTKSSVLIEHQRIHTGEKPYECEECGKAFSRRSSLNEHRRSH
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TGDRPYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGRWSALNQHQRLHTGEK
::..::.:.:::::: . . : ::. ::::::::.:. ::::: : : ::::.:::::
CCDS46 TGEKPYQCKECGKAFSASNGLTRHRRIHTGEKPYECKVCGKAFLLSSCLVQHQRIHTGEK
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KSD HYHCNDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYEC
.:.: .::::: :.::::.:...:: .:::::.::.: ::.:..: .:: .::: .:
CCDS46 RYQCRECGKAFIQNAGLFQHLRVHTGEKPYQCSQCSKLFSKRTLLKKHQKIHTGERP
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KSD NECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFSQSGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEK
>>CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 (580 aa)
initn: 2486 init1: 874 opt: 1449 Z-score: 915.5 bits: 179.4 E(32554): 1.1e-44
Smith-Waterman score: 1472; 45.2% identity (69.6% similar) in 516 aa overlap (98-579:36-545)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RELCHQWLRPETHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVQEQH--PESGEEVVTVLEDLE
: .: . ::.:.. . :: : :...
CCDS56 RNLYRDVMLENYSNLVTVGCQVTKPDVIFKLEQEEEPWVMEEEMFGRHCPEVWEVDEQIK
10 20 30 40 50 60
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RELDEPGEQVSVHTGEQEMFLQETVRLRKEGE--PSMSLQSMKAQPKYESPELESQQEQV
.. . ..:. ... .. ..... .: .. : : . : :. :.. :.
CCDS56 KQQETLVRKVT-SISKKILIKEKVIECKKVAKIFPLSSDIVTSRQSFYDCDSLDKGLEHN
70 80 90 100 110 120
190 200 210 220
pF1KSD LDV---ETG-------NEYGN-LKQEVSEEMEPH-----GKT-SSKFENDMSKSARCGET
::. : : ::.:. . . .: . : :. : :: :. . :
CCDS56 LDLLRYEKGCVREKQSNEFGKPFYHCASYVVTPFKCNQCGQDFSHKF--DLIRHERIHAG
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270
pF1KSD REPEEITEEPSACSRED-----------KQP-TCDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESY
..: : : .: ::.. ..: :.: : .. . :. .:.:: ::. :
CCDS56 EKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPY
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KSD GCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNE
.: :: :::::.:.::::.:::::..::.:.::::.: . ::.:. :::::::: :::
CCDS56 ACKDCWKAFSQKSNLIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNE
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KSD CGKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKS
::.::.: :... :.: ::::: :.:: ::::::: . .. :.. :: .::: :..:.:.
CCDS56 CGRAFSRMSSVTLHMRSHTGEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKA
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KSD FSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFSQ-
::. : :: :. ::. :::::.:::::: . .:..::.:: :: :.:.::::.: :
CCDS56 FSQSSSLTVHMRNHTAEKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQM
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KSD SGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLT
:.::.::::::::::: : :: ::: :...::::..:::::.::.:..:::::.::. :
CCDS56 SNLIRHQRIHTGEKPYACTVCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLL
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KSD EHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEI
::..:::::.:.::.:::.:: :.:: : : :::::::.:..::::: : : :
CCDS56 EHEKIHTGEKPFKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQ---CSLLII
490 500 510 520 530
580 590 600
pF1KSD LLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL
...:.
CCDS56 HMRSHTGEKPFECNECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY
540 550 560 570 580
>>CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 (644 aa)
initn: 2486 init1: 874 opt: 1449 Z-score: 915.0 bits: 179.4 E(32554): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 1472; 45.2% identity (69.6% similar) in 516 aa overlap (98-579:100-609)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD RELCHQWLRPETHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVQEQH--PESGEEVVTVLEDLE
: .: . ::.:.. . :: : :...
CCDS42 RNLYRDVMLENYSNLVTVGCQVTKPDVIFKLEQEEEPWVMEEEMFGRHCPEVWEVDEQIK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD RELDEPGEQVSVHTGEQEMFLQETVRLRKEGE--PSMSLQSMKAQPKYESPELESQQEQV
.. . ..:. ... .. ..... .: .. : : . : :. :.. :.
CCDS42 KQQETLVRKVT-SISKKILIKEKVIECKKVAKIFPLSSDIVTSRQSFYDCDSLDKGLEHN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KSD LDV---ETG-------NEYGN-LKQEVSEEMEPH-----GKT-SSKFENDMSKSARCGET
::. : : ::.:. . . .: . : :. : :: :. . :
CCDS42 LDLLRYEKGCVREKQSNEFGKPFYHCASYVVTPFKCNQCGQDFSHKF--DLIRHERIHAG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KSD REPEEITEEPSACSRED-----------KQP-TCDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESY
..: : : .: ::.. ..: :.: : .. . :. .:.:: ::. :
CCDS42 EKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPY
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD GCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNE
.: :: :::::.:.::::.:::::..::.:.::::.: . ::.:. :::::::: :::
CCDS42 ACKDCWKAFSQKSNLIEHERIHTGEKPYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD CGKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKS
::.::.: :... :.: ::::: :.:: ::::::: . .. :.. :: .::: :..:.:.
CCDS42 CGRAFSRMSSVTLHMRSHTGEKPYKCNKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKA
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD FSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFSQ-
::. : :: :. ::. :::::.:::::: . .:..::.:: :: :.:.::::.: :
CCDS42 FSQSSSLTVHMRNHTAEKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQM
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD SGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLT
:.::.::::::::::: : :: ::: :...::::..:::::.::.:..:::::.::. :
CCDS42 SNLIRHQRIHTGEKPYACTVCGKAFSQKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLL
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KSD EHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEI
::..:::::.:.::.:::.:: :.:: : : :::::::.:..::::: : : :
CCDS42 EHEKIHTGEKPFKCNECGKAFSRISSLTLHVRSHTGEKPYECNKCGKAFSQ---CSLLII
550 560 570 580 590 600
580 590 600
pF1KSD LLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL
...:.
CCDS42 HMRSHTGEKPFECNECGKAFSQRASLSIHKRGHTGERHQVY
610 620 630 640
>>CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 (595 aa)
initn: 5557 init1: 889 opt: 1428 Z-score: 902.4 bits: 177.0 E(32554): 6e-44
Smith-Waterman score: 1428; 44.6% identity (72.4% similar) in 489 aa overlap (94-573:52-531)
70 80 90 100 110 120
pF1KSD LSRLRELCHQWLRPETHTKEQILELLVLEQFLTILPEELQAWVQEQHPESGEEVVTVLED
..: : . .:: ...: . ...
CCDS32 DTAQRNLYRNVMLENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSH
30 40 50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KSD LERELDEPGEQVSVHTGEQEMFLQETVRLRKEGEP------SMSLQSM-KAQPKYESPEL
. ..: : :: ... . :.. :.. . :.:. : ::. .: :. . . :
CCDS32 FAQDL-WP-EQ-NIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCL
90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KSD ESQQEQVLDVETGNEYGNLKQEVSEEMEPHGKTSSKFENDMSKSARCGETREPEEITEEP
. : .... ..: .. .. :. . . . ..: : ..::.. :
CCDS32 TATQSKIFQC---DKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKK---KPFKCTKCGKSFGMISCLTEH
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KSD SACSREDKQPTCDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESYGCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIH
: . . :.: : ... .: :.:.:: ::. : :..:::::.: :.::.:..::
CCDS32 SRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIH
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KSD TGDRPYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGRWSALNQHQRLHTGEK
::..:::::::::.: ..: :::::::::::::.::::::.: :.:. :...:::::
CCDS32 TGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEK
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KSD HYHCNDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYEC
:.:..:::::.:...: : ::: .:::.: .:.:.:.. . :: :. .::: :::.:
CCDS32 PYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKC
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KSD NECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFSQSG-LIQHQRIHTGEKPYKCDVCE
..::::: . : :..:. :: :: :.::::::.:..:. : .:. :::::::::: ::
CCDS32 EKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECE
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KSD KAFIQRTSLTEHQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFR
::: : ..::::..:::::.::.:.::::::.: : ::.:.. :: :.::::.:::..:.
CCDS32 KAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFK
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KSD GITSLIQHQRIHTGEKPYQCDECGKAFRQRKK-TSYKEILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIP
..: :. ::::::::.:.:::::: : .: :..:.:
CCDS32 WPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSN
500 510 520 530 540 550
600
pF1KSD EWQSCFRRDL
CCDS32 LTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
560 570 580 590
>>CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 (678 aa)
initn: 3438 init1: 901 opt: 1428 Z-score: 901.8 bits: 177.1 E(32554): 6.6e-44
Smith-Waterman score: 1428; 54.9% identity (74.7% similar) in 368 aa overlap (219-584:263-622)
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GNEYGNLKQEVSEEMEPHGKTSSKFENDMSKSARCGET-REPEEITEEPSACSREDKQPT
: .::.. : ..: . . : :
CCDS46 PYKCNECGKVFSQPSNLAGHQRIHTGEKPYKCNECGKAFRAHSKLTTHQVIHTGE-KPYK
240 250 260 270 280 290
250 260 270 280 290 300
pF1KSD CDENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESYGCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEEC
: : : .:.:: . :.:: ::. : :..:::::: .: : :: ::::..::::.::
CCDS46 CKECGKCFTQNSHLASHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSLTTHQTIHTGEKPYKCNEC
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAF
::.:: . : .:. :::::::::::::::::. : :..:: .::::: ..::.: :.:
CCDS46 GKVFRHNSYLAKHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTKHQIIHTGEKPFKCNECVKVF
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KSD SQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNS
.: . : .: .::: .:::.: .:.:.:: :: :: ::..::: :::.::.:::.:. ::
CCDS46 TQYSHLANHRRIHTGEKPYRCDECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGEKPYKCNDCGKVFTQNS
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KSD SLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFSQ-SGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTE
:.::. :: :: :.: ::::.::: : : .: :.:::::::::. : ::: ..:::
CCDS46 HLASHRGIHSGEKPYKCDECGKAFSQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNECGKAFSVHSSLTI
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KSD HQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRI
:: ::::..::::. :::.: . : :. ::::::::.::::.:::.:: ..: :: :
CCDS46 HQTIHTGQKPYKCNDCGKVFRHNSYLAIHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSVHSNLATHQVI
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KSD HTGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL
:::::::.:.::::.: : .. : :: . ..:
CCDS46 HTGEKPYKCNECGKVFTQNSH-------LANHRRIHTGEKPYRCNECGKAFSVRSTLTTH
600 610 620 630 640
CCDS46 MAVHTGDKPYKCNQCGKVFTQNSNLAKHRRIHSG
650 660 670
>>CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 (782 aa)
initn: 4188 init1: 899 opt: 1419 Z-score: 895.5 bits: 176.1 E(32554): 1.5e-43
Smith-Waterman score: 1419; 53.8% identity (76.2% similar) in 357 aa overlap (219-574:278-634)
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GNEYGNLKQEVSEEMEPHGKTSSKFENDMSKSARCGETREPEEITEEPSACSREDKQPTC
: .::.. . . .: :
CCDS82 PYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKC
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESYGCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECG
.: : .. .:. : :: : ::. . :..::: :.:.:::: : :::::..::::.:::
CCDS82 NECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECG
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFS
::: :. : :. :::::::::::::::.: : :..:.:.::::: :.::.::::::
CCDS82 KAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFS
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSS
....: : ::: ::..:..:.: :.. : :..:. .::: :::.:::::::: ::
CCDS82 MHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSS
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFSQ-SGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEH
:..:: :: :: :.: ::::::.: : : .:. ::.:::::::. : :.: : ..:..:
CCDS82 LTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARH
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIH
:.::::.::::. ::.::..:: :: :: :::::.:::: :::..:: . : :.:::
CCDS82 WRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIH
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL
::::::.:.:::::: .... . ....
CCDS82 TGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEK
610 620 630 640 650 660
>--
initn: 1070 init1: 631 opt: 631 Z-score: 410.1 bits: 86.3 E(32554): 1.6e-16
Smith-Waterman score: 669; 60.1% identity (82.4% similar) in 148 aa overlap (408-554:635-782)
380 390 400 410 420 430
pF1KSD KIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHH
::: :::.::.:::.:. :: :..::. :
CCDS82 RIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHT
610 620 630 640 650 660
440 450 460 470 480 490
pF1KSD KEKCYQCKECGKSFS-QSGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERP
:: :.:.::::.:: .:.: :: ::::.:::::. : :.: : . :..:.::::::.:
CCDS82 GEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKP
670 680 690 700 710 720
500 510 520 530 540 550
pF1KSD YKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCD
:.: .::::: :: :: :. :::::. :::.:::..:: ..: .:.:.:::::::.
CCDS82 YRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
730 740 750 760 770 780
560 570 580 590 600
pF1KSD ECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL
>>CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 (818 aa)
initn: 4188 init1: 899 opt: 1419 Z-score: 895.3 bits: 176.1 E(32554): 1.5e-43
Smith-Waterman score: 1419; 53.8% identity (76.2% similar) in 357 aa overlap (219-574:314-670)
190 200 210 220 230 240
pF1KSD GNEYGNLKQEVSEEMEPHGKTSSKFENDMSKSARCGETREPEEITEEPSACSREDKQPTC
: .::.. . . .: :
CCDS12 PYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKC
290 300 310 320 330 340
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DENGVSLTENSDHTEHQRICPGEESYGCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECG
.: : .. .:. : :: : ::. . :..::: :.:.:::: : :::::..::::.:::
CCDS12 NECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECG
350 360 370 380 390 400
310 320 330 340 350 360
pF1KSD KAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYKCNECGKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFS
::: :. : :. :::::::::::::::.: : :..:.:.::::: :.::.::::::
CCDS12 KAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFS
410 420 430 440 450 460
370 380 390 400 410 420
pF1KSD QKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSS
....: : ::: ::..:..:.: :.. : :..:. .::: :::.:::::::: ::
CCDS12 MHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSS
470 480 490 500 510 520
430 440 450 460 470 480
pF1KSD LVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSFSQ-SGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEH
:..:: :: :: :.: ::::::.: : : .:. ::.:::::::. : :.: : ..:..:
CCDS12 LTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARH
530 540 550 560 570 580
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIH
:.::::.::::. ::.::..:: :: :: :::::.:::: :::..:: . : :.:::
CCDS12 WRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIH
590 600 610 620 630 640
550 560 570 580 590 600
pF1KSD TGEKPYQCDECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL
::::::.:.:::::: .... . ....
CCDS12 TGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEK
650 660 670 680 690 700
>--
initn: 1070 init1: 631 opt: 631 Z-score: 409.8 bits: 86.3 E(32554): 1.7e-16
Smith-Waterman score: 669; 60.1% identity (82.4% similar) in 148 aa overlap (408-554:671-818)
380 390 400 410 420 430
pF1KSD KIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHH
::: :::.::.:::.:. :: :..::. :
CCDS12 RIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHT
650 660 670 680 690 700
440 450 460 470 480 490
pF1KSD KEKCYQCKECGKSFS-QSGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERP
:: :.:.::::.:: .:.: :: ::::.:::::. : :.: : . :..:.::::::.:
CCDS12 GEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKP
710 720 730 740 750 760
500 510 520 530 540 550
pF1KSD YKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCD
:.: .::::: :: :: :. :::::. :::.:::..:: ..: .:.:.:::::::.
CCDS12 YRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
770 780 790 800 810
560 570 580 590 600
pF1KSD ECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL
>>CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 (751 aa)
initn: 1801 init1: 927 opt: 1416 Z-score: 893.8 bits: 175.8 E(32554): 1.8e-43
Smith-Waterman score: 1444; 40.9% identity (67.8% similar) in 574 aa overlap (28-573:38-607)
10 20 30 40 50
pF1KSD MASTWAIQAHMDQDEPLEVKIEEEKYTTRQDWDLRKNNTHSREVFRQY-FRQFCYQE
:...: .. . .:..::. .... .
CCDS46 DSTLLQGGHNLLSSASFQEAVTFKDVIVDFTQEEW--KQLDPGQRDLFRDVTLENYTHLV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KSD TSGPR----EALSRLRELCHQW-LRPETHTK-----EQILELLVLEQFLTILPEELQAWV
. : . ...:.:.. . : ..: . : :: : : :::. :
CCDS46 SIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWIMEPSIPVGTCADWETRLENSVSAPEPDISEEELSPEV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KSD Q-EQHPESGEEVVTVLEDLERELDEPGEQVSVHTGEQEMFLQE-TVRLRKEGEPSMSL-Q
:.: .. ..::. : : . .:.. .: .:. . : :. ..: . . .
CCDS46 IVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGSLERQQANQQTLPKEIKVTEKTIPSWEKGPVNNEFGK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KSD SMKAQPKYESPELESQQEQVLDVETGNEYGNLKQEVSEEMEPHGKTSSKFENDMSKSARC
:.... . . : : .: .. . .:.: : . . ::. : . . . . :
CCDS46 SVNVSSNLVTQE-PSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFS-YCSALIRHQRT
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KSD GETREPEEITEEPSACSRE------------DKQPTCDENGVSLTENSDHTEHQRICPGE
..: . .: .: :: :: ::. : .. :. . :.:::: ::
CCDS46 HTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KSD ESYGCDDCGKAFSQHSHLIEHQRIHTGDRPYKCEECGKAFRGRTVLIRHKIIHTGEKPYK
. : ::.:::::::..::..:::::::..:: :.:::::: : ...:. :::::::.:
CCDS46 KPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEKPFK
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KSD CNECGKAFGRWSALNQHQRLHTGEKHYHCNDCGKAFSQKAGLFHHIKIHTRDKPYQCTQC
:.:: :.: : . :.:::..::::: :.::.:::::. . ...: ::: .:::.:..:
CCDS46 CDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYECNEC
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KSD NKSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHHKEKCYQCKECGKSF
.:.::..: ::::: .::: :::.: ::::.: : :::..: .:: :: :.:.::::.:
CCDS46 GKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECGKAF
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KSD SQ-SGLIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERPYKCDKCGKAFTQRS
: :.: ::.:::: :::..:. : ::: ..:..::. :: :. :.: .::::: . :
CCDS46 SYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSS
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560
pF1KSD VLTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCDECGKAFRQRKK-TS
:..:.::::::.::.: :::..: .:::::..:::::.::.:.:::.:: : . :.
CCDS46 SLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQ
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600
pF1KSD YKEILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL
.:.:
CCDS46 HKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQHQRI
610 620 630 640 650 660
>--
initn: 1079 init1: 600 opt: 600 Z-score: 391.2 bits: 82.8 E(32554): 1.8e-15
Smith-Waterman score: 671; 61.5% identity (83.2% similar) in 143 aa overlap (408-549:608-750)
380 390 400 410 420 430
pF1KSD KIHTRDKPYQCTQCNKSFSRRSILTQHQGVHTGAKPYECNECGKAFVYNSSLVSHQEIHH
::::::::: :::::: . :::..::. :
CCDS46 KIHTGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHT
580 590 600 610 620 630
440 450 460 470 480 490
pF1KSD KEKCYQCKECGKSFSQSG-LIQHQRIHTGEKPYKCDVCEKAFIQRTSLTEHQRIHTGERP
.:: :::..: :.::::. : ::::::::::::::. :.::: . : ::::: ::::.:
CCDS46 EEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKP
640 650 660 670 680 690
500 510 520 530 540 550
pF1KSD YKCDKCGKAFTQRSVLTEHQRIHTGERPYKCDECGNAFRGITSLIQHQRIHTGEKPYQCD
:.:..: :.:.: . : .:::::.::.:. :..::..:: ..: .:::.: :
CCDS46 YNCNECRKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
700 710 720 730 740 750
560 570 580 590 600
pF1KSD ECGKAFRQRKKTSYKEILLKNHSEPQAGVNLLLSSLIPEWQSCFRRDL
604 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 01:41:58 2016 done: Thu Nov 3 01:41:59 2016
Total Scan time: 2.530 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]