Result of FASTA (omim) for
pF1KSDA0341
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0341, 544 aa
1>>>pF1KSDA0341 544 - 544 aa - 544 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0820+/-0.000341; mu= -2.1744+/- 0.021
mean_var=269.4171+/-55.079, 0's: 0 Z-trim(123.8): 22 B-trim: 602 in 1/59
Lambda= 0.078138
statistics sampled from 44307 (44329) to 44307 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.814), E-opt: 0.2 (0.52), width: 16
Scan time: 11.700
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005260949 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 673) 432 61.8 7.8e-09
XP_005260950 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 673) 432 61.8 7.8e-09
XP_011527711 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 703) 432 61.8 8e-09
XP_011527710 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 703) 432 61.8 8e-09
XP_005260947 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 703) 432 61.8 8e-09
NP_001269462 (OMIM: 610484) leucine zipper putativ ( 627) 338 51.2 1.1e-05
NP_115805 (OMIM: 610454) leucine zipper putative t ( 669) 321 49.3 4.5e-05
NP_001305028 (OMIM: 610454) leucine zipper putativ ( 669) 321 49.3 4.5e-05
XP_005270279 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zip ( 669) 321 49.3 4.5e-05
XP_016872269 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zip ( 669) 321 49.3 4.5e-05
NP_001305029 (OMIM: 610454) leucine zipper putativ ( 669) 321 49.3 4.5e-05
XP_011527709 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zip ( 682) 304 47.4 0.00017
XP_016872270 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zip ( 449) 297 46.5 0.00022
NP_001305030 (OMIM: 610454) leucine zipper putativ ( 449) 297 46.5 0.00022
XP_011542688 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 276 44.2 0.0014
XP_005273451 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 276 44.2 0.0014
XP_011542685 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 276 44.2 0.0014
XP_011542687 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 276 44.2 0.0014
XP_011542686 (OMIM: 133239,606551) PREDICTED: leuc ( 596) 276 44.2 0.0014
NP_066300 (OMIM: 133239,606551) leucine zipper put ( 596) 276 44.2 0.0014
>>XP_005260949 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zipper (673 aa)
initn: 654 init1: 237 opt: 432 Z-score: 279.6 bits: 61.8 E(85289): 7.8e-09
Smith-Waterman score: 660; 32.2% identity (55.0% similar) in 609 aa overlap (5-526:69-638)
10 20 30
pF1KSD MATAPGPAGIAMGSVGSLLERQDFSPEEPRAALA
::: : :: :. :: : : .
XP_005 SVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTGGGGSQGSFPGPRG--SGS-GASRERPGRYPSEDK----
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GSRGSRQPDGLLRKGLGQREFLSYLHLPKKDSKSTKNTKRAPRNEPADYATLYYREHSRA
: .: .: :: : . . . . . :.:. .. .:: : ::: :.
XP_005 GLANSLYLNGELR-GSDHTDVCGNVVGSSGGSSSSGGSDKAP---PQ------YREPSHP
100 110 120 130 140
100 110 120 130 140
pF1KSD GDFSKTSLPERGRFDKCR---IRPSVFKPTAGNGKGFLSMQSL------ASHKGQK----
. :: :..:.: .:::.:::.. :.: :::.: .. .:..
XP_005 PKLLATS----GKLDQCSEPLVRPSAFKPVVP--KNFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGPGG
150 160 170 180 190
150 160 170 180
pF1KSD ----LWRS--------NGSLHTLACHPPLSPGPRASQARAQLLHALS-----LDEGGPEP
: .: .:: . . . :. : :.. .: : :: ... :
XP_005 LKGGLDKSRTMTPAGGSGSGLSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLSASTSHINRIGTAS
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230
pF1KSD EPSLSDSSSGGSFGRSP-GTGPSPF-------SSSLGHLNHLGGSLDRASQGPKEAGPPA
: : .::::. : . ::. : :::.:. .::: ...: . : :
XP_005 YGSGSGGSSGGGSGYQDLGTSDSGRASSKSGSSSSMGRPGHLG-----SGEGGGGGLPFA
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VLSCLPEPPPPYEFSCSSAEEMGAVLPETCEE---LKRGLGDEDGSNPFTQVLEERQRLW
.: :: : . .:. : : .: :.:.: :.. .:::::::. :
XP_005 --AC--SPPSPSAL----IQELEERLWEKEQEVAALRRSL--EQSEAAVAQVLEERQKAW
320 330 340 350 360
300 310 320 330 340
pF1KSD ---LAELKRLYVERLHEVTQKAERSERNLQLQLFMAQQEQRRLRKE---LRAQQGLAPEP
::::.. .:..:...:.:....::::.. ::....:..: : :. .
XP_005 ERELAELRQGCSGKLQQVARRAQRAQQGLQLQVLRLQQDKKQLQEEAARLMRQREELEDK
370 380 390 400 410 420
350 360 370 380 390 400
pF1KSD RAPGTLPEADPSARPEEEARWEVCQKTAEISLLKQQLREAQAELAQKLAEIFSLKTQLRG
: .:: : :: ..::::::..:::::::::...::...:::.:: .:..:::
XP_005 VAACQKEQADFLPRIEE-TKWEVCQKAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLRE
430 440 450 460 470
410 420 430 440
pF1KSD SRAQAQAQDAELVRLREAVRSLQ----------------------EQAPREEAPGSCETD
.::. . .. .:. ::.. : : . : ..: ..::.:
XP_005 GRASLREKEEQLLSLRDSFSSKQASLELGEGELPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESD
480 490 500 510 520 530
450 460 470 480
pF1KSD DCKSRGLLG--------------EAGGSEA----RDSAEQLRAELLQERLRGQEQALRFE
. : : : :::: . : . .:.::: :: ..:. :
XP_005 EAKMRRQAGVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTRALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFA
540 550 560 570 580 590
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QERRTWQEEKERVLRYQREIQGGYMDMYRRNQALEQELRALREPPTPWSPRLESSKI
.:::.: ::::.:..::...: .:..::.::: ::..::
XP_005 EERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKA
600 610 620 630 640 650
XP_005 WTPSRLERIESTEI
660 670
>>XP_005260950 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zipper (673 aa)
initn: 654 init1: 237 opt: 432 Z-score: 279.6 bits: 61.8 E(85289): 7.8e-09
Smith-Waterman score: 660; 32.2% identity (55.0% similar) in 609 aa overlap (5-526:69-638)
10 20 30
pF1KSD MATAPGPAGIAMGSVGSLLERQDFSPEEPRAALA
::: : :: :. :: : : .
XP_005 SVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTGGGGSQGSFPGPRG--SGS-GASRERPGRYPSEDK----
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GSRGSRQPDGLLRKGLGQREFLSYLHLPKKDSKSTKNTKRAPRNEPADYATLYYREHSRA
: .: .: :: : . . . . . :.:. .. .:: : ::: :.
XP_005 GLANSLYLNGELR-GSDHTDVCGNVVGSSGGSSSSGGSDKAP---PQ------YREPSHP
100 110 120 130 140
100 110 120 130 140
pF1KSD GDFSKTSLPERGRFDKCR---IRPSVFKPTAGNGKGFLSMQSL------ASHKGQK----
. :: :..:.: .:::.:::.. :.: :::.: .. .:..
XP_005 PKLLATS----GKLDQCSEPLVRPSAFKPVVP--KNFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGPGG
150 160 170 180 190
150 160 170 180
pF1KSD ----LWRS--------NGSLHTLACHPPLSPGPRASQARAQLLHALS-----LDEGGPEP
: .: .:: . . . :. : :.. .: : :: ... :
XP_005 LKGGLDKSRTMTPAGGSGSGLSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLSASTSHINRIGTAS
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230
pF1KSD EPSLSDSSSGGSFGRSP-GTGPSPF-------SSSLGHLNHLGGSLDRASQGPKEAGPPA
: : .::::. : . ::. : :::.:. .::: ...: . : :
XP_005 YGSGSGGSSGGGSGYQDLGTSDSGRASSKSGSSSSMGRPGHLG-----SGEGGGGGLPFA
260 270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VLSCLPEPPPPYEFSCSSAEEMGAVLPETCEE---LKRGLGDEDGSNPFTQVLEERQRLW
.: :: : . .:. : : .: :.:.: :.. .:::::::. :
XP_005 --AC--SPPSPSAL----IQELEERLWEKEQEVAALRRSL--EQSEAAVAQVLEERQKAW
320 330 340 350 360
300 310 320 330 340
pF1KSD ---LAELKRLYVERLHEVTQKAERSERNLQLQLFMAQQEQRRLRKE---LRAQQGLAPEP
::::.. .:..:...:.:....::::.. ::....:..: : :. .
XP_005 ERELAELRQGCSGKLQQVARRAQRAQQGLQLQVLRLQQDKKQLQEEAARLMRQREELEDK
370 380 390 400 410 420
350 360 370 380 390 400
pF1KSD RAPGTLPEADPSARPEEEARWEVCQKTAEISLLKQQLREAQAELAQKLAEIFSLKTQLRG
: .:: : :: ..::::::..:::::::::...::...:::.:: .:..:::
XP_005 VAACQKEQADFLPRIEE-TKWEVCQKAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLRE
430 440 450 460 470
410 420 430 440
pF1KSD SRAQAQAQDAELVRLREAVRSLQ----------------------EQAPREEAPGSCETD
.::. . .. .:. ::.. : : . : ..: ..::.:
XP_005 GRASLREKEEQLLSLRDSFSSKQASLELGEGELPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESD
480 490 500 510 520 530
450 460 470 480
pF1KSD DCKSRGLLG--------------EAGGSEA----RDSAEQLRAELLQERLRGQEQALRFE
. : : : :::: . : . .:.::: :: ..:. :
XP_005 EAKMRRQAGVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTRALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFA
540 550 560 570 580 590
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QERRTWQEEKERVLRYQREIQGGYMDMYRRNQALEQELRALREPPTPWSPRLESSKI
.:::.: ::::.:..::...: .:..::.::: ::..::
XP_005 EERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKA
600 610 620 630 640 650
XP_005 WTPSRLERIESTEI
660 670
>>XP_011527711 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zipper (703 aa)
initn: 546 init1: 237 opt: 432 Z-score: 279.4 bits: 61.8 E(85289): 8e-09
Smith-Waterman score: 660; 32.2% identity (55.0% similar) in 609 aa overlap (5-526:99-668)
10 20 30
pF1KSD MATAPGPAGIAMGSVGSLLERQDFSPEEPRAALA
::: : :: :. :: : : .
XP_011 SVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTGGGGSQGSFPGPRG--SGS-GASRERPGRYPSEDK----
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GSRGSRQPDGLLRKGLGQREFLSYLHLPKKDSKSTKNTKRAPRNEPADYATLYYREHSRA
: .: .: :: : . . . . . :.:. .. .:: : ::: :.
XP_011 GLANSLYLNGELR-GSDHTDVCGNVVGSSGGSSSSGGSDKAP---PQ------YREPSHP
130 140 150 160 170
100 110 120 130 140
pF1KSD GDFSKTSLPERGRFDKCR---IRPSVFKPTAGNGKGFLSMQSL------ASHKGQK----
. :: :..:.: .:::.:::.. :.: :::.: .. .:..
XP_011 PKLLATS----GKLDQCSEPLVRPSAFKPVVP--KNFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGPGG
180 190 200 210 220
150 160 170 180
pF1KSD ----LWRS--------NGSLHTLACHPPLSPGPRASQARAQLLHALS-----LDEGGPEP
: .: .:: . . . :. : :.. .: : :: ... :
XP_011 LKGGLDKSRTMTPAGGSGSGLSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLSASTSHINRIGTAS
230 240 250 260 270 280
190 200 210 220 230
pF1KSD EPSLSDSSSGGSFGRSP-GTGPSPF-------SSSLGHLNHLGGSLDRASQGPKEAGPPA
: : .::::. : . ::. : :::.:. .::: ...: . : :
XP_011 YGSGSGGSSGGGSGYQDLGTSDSGRASSKSGSSSSMGRPGHLG-----SGEGGGGGLPFA
290 300 310 320 330 340
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VLSCLPEPPPPYEFSCSSAEEMGAVLPETCEE---LKRGLGDEDGSNPFTQVLEERQRLW
.: :: : . .:. : : .: :.:.: :.. .:::::::. :
XP_011 --AC--SPPSPSAL----IQELEERLWEKEQEVAALRRSL--EQSEAAVAQVLEERQKAW
350 360 370 380 390
300 310 320 330 340
pF1KSD ---LAELKRLYVERLHEVTQKAERSERNLQLQLFMAQQEQRRLRKE---LRAQQGLAPEP
::::.. .:..:...:.:....::::.. ::....:..: : :. .
XP_011 ERELAELRQGCSGKLQQVARRAQRAQQGLQLQVLRLQQDKKQLQEEAARLMRQREELEDK
400 410 420 430 440 450
350 360 370 380 390 400
pF1KSD RAPGTLPEADPSARPEEEARWEVCQKTAEISLLKQQLREAQAELAQKLAEIFSLKTQLRG
: .:: : :: ..::::::..:::::::::...::...:::.:: .:..:::
XP_011 VAACQKEQADFLPRIEE-TKWEVCQKAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLRE
460 470 480 490 500
410 420 430 440
pF1KSD SRAQAQAQDAELVRLREAVRSLQ----------------------EQAPREEAPGSCETD
.::. . .. .:. ::.. : : . : ..: ..::.:
XP_011 GRASLREKEEQLLSLRDSFSSKQASLELGEGELPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESD
510 520 530 540 550 560
450 460 470 480
pF1KSD DCKSRGLLG--------------EAGGSEA----RDSAEQLRAELLQERLRGQEQALRFE
. : : : :::: . : . .:.::: :: ..:. :
XP_011 EAKMRRQAGVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTRALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFA
570 580 590 600 610 620
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QERRTWQEEKERVLRYQREIQGGYMDMYRRNQALEQELRALREPPTPWSPRLESSKI
.:::.: ::::.:..::...: .:..::.::: ::..::
XP_011 EERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKA
630 640 650 660 670 680
XP_011 WTPSRLERIESTEI
690 700
>>XP_011527710 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zipper (703 aa)
initn: 546 init1: 237 opt: 432 Z-score: 279.4 bits: 61.8 E(85289): 8e-09
Smith-Waterman score: 660; 32.2% identity (55.0% similar) in 609 aa overlap (5-526:99-668)
10 20 30
pF1KSD MATAPGPAGIAMGSVGSLLERQDFSPEEPRAALA
::: : :: :. :: : : .
XP_011 SVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTGGGGSQGSFPGPRG--SGS-GASRERPGRYPSEDK----
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GSRGSRQPDGLLRKGLGQREFLSYLHLPKKDSKSTKNTKRAPRNEPADYATLYYREHSRA
: .: .: :: : . . . . . :.:. .. .:: : ::: :.
XP_011 GLANSLYLNGELR-GSDHTDVCGNVVGSSGGSSSSGGSDKAP---PQ------YREPSHP
130 140 150 160 170
100 110 120 130 140
pF1KSD GDFSKTSLPERGRFDKCR---IRPSVFKPTAGNGKGFLSMQSL------ASHKGQK----
. :: :..:.: .:::.:::.. :.: :::.: .. .:..
XP_011 PKLLATS----GKLDQCSEPLVRPSAFKPVVP--KNFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGPGG
180 190 200 210 220
150 160 170 180
pF1KSD ----LWRS--------NGSLHTLACHPPLSPGPRASQARAQLLHALS-----LDEGGPEP
: .: .:: . . . :. : :.. .: : :: ... :
XP_011 LKGGLDKSRTMTPAGGSGSGLSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLSASTSHINRIGTAS
230 240 250 260 270 280
190 200 210 220 230
pF1KSD EPSLSDSSSGGSFGRSP-GTGPSPF-------SSSLGHLNHLGGSLDRASQGPKEAGPPA
: : .::::. : . ::. : :::.:. .::: ...: . : :
XP_011 YGSGSGGSSGGGSGYQDLGTSDSGRASSKSGSSSSMGRPGHLG-----SGEGGGGGLPFA
290 300 310 320 330 340
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VLSCLPEPPPPYEFSCSSAEEMGAVLPETCEE---LKRGLGDEDGSNPFTQVLEERQRLW
.: :: : . .:. : : .: :.:.: :.. .:::::::. :
XP_011 --AC--SPPSPSAL----IQELEERLWEKEQEVAALRRSL--EQSEAAVAQVLEERQKAW
350 360 370 380 390
300 310 320 330 340
pF1KSD ---LAELKRLYVERLHEVTQKAERSERNLQLQLFMAQQEQRRLRKE---LRAQQGLAPEP
::::.. .:..:...:.:....::::.. ::....:..: : :. .
XP_011 ERELAELRQGCSGKLQQVARRAQRAQQGLQLQVLRLQQDKKQLQEEAARLMRQREELEDK
400 410 420 430 440 450
350 360 370 380 390 400
pF1KSD RAPGTLPEADPSARPEEEARWEVCQKTAEISLLKQQLREAQAELAQKLAEIFSLKTQLRG
: .:: : :: ..::::::..:::::::::...::...:::.:: .:..:::
XP_011 VAACQKEQADFLPRIEE-TKWEVCQKAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLRE
460 470 480 490 500
410 420 430 440
pF1KSD SRAQAQAQDAELVRLREAVRSLQ----------------------EQAPREEAPGSCETD
.::. . .. .:. ::.. : : . : ..: ..::.:
XP_011 GRASLREKEEQLLSLRDSFSSKQASLELGEGELPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESD
510 520 530 540 550 560
450 460 470 480
pF1KSD DCKSRGLLG--------------EAGGSEA----RDSAEQLRAELLQERLRGQEQALRFE
. : : : :::: . : . .:.::: :: ..:. :
XP_011 EAKMRRQAGVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTRALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFA
570 580 590 600 610 620
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QERRTWQEEKERVLRYQREIQGGYMDMYRRNQALEQELRALREPPTPWSPRLESSKI
.:::.: ::::.:..::...: .:..::.::: ::..::
XP_011 EERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKA
630 640 650 660 670 680
XP_011 WTPSRLERIESTEI
690 700
>>XP_005260947 (OMIM: 610484) PREDICTED: leucine zipper (703 aa)
initn: 546 init1: 237 opt: 432 Z-score: 279.4 bits: 61.8 E(85289): 8e-09
Smith-Waterman score: 660; 32.2% identity (55.0% similar) in 609 aa overlap (5-526:99-668)
10 20 30
pF1KSD MATAPGPAGIAMGSVGSLLERQDFSPEEPRAALA
::: : :: :. :: : : .
XP_005 SVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTGGGGSQGSFPGPRG--SGS-GASRERPGRYPSEDK----
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GSRGSRQPDGLLRKGLGQREFLSYLHLPKKDSKSTKNTKRAPRNEPADYATLYYREHSRA
: .: .: :: : . . . . . :.:. .. .:: : ::: :.
XP_005 GLANSLYLNGELR-GSDHTDVCGNVVGSSGGSSSSGGSDKAP---PQ------YREPSHP
130 140 150 160 170
100 110 120 130 140
pF1KSD GDFSKTSLPERGRFDKCR---IRPSVFKPTAGNGKGFLSMQSL------ASHKGQK----
. :: :..:.: .:::.:::.. :.: :::.: .. .:..
XP_005 PKLLATS----GKLDQCSEPLVRPSAFKPVVP--KNFHSMQNLCPPQTNGTPEGRQGPGG
180 190 200 210 220
150 160 170 180
pF1KSD ----LWRS--------NGSLHTLACHPPLSPGPRASQARAQLLHALS-----LDEGGPEP
: .: .:: . . . :. : :.. .: : :: ... :
XP_005 LKGGLDKSRTMTPAGGSGSGLSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLAPLSASTSHINRIGTAS
230 240 250 260 270 280
190 200 210 220 230
pF1KSD EPSLSDSSSGGSFGRSP-GTGPSPF-------SSSLGHLNHLGGSLDRASQGPKEAGPPA
: : .::::. : . ::. : :::.:. .::: ...: . : :
XP_005 YGSGSGGSSGGGSGYQDLGTSDSGRASSKSGSSSSMGRPGHLG-----SGEGGGGGLPFA
290 300 310 320 330 340
240 250 260 270 280 290
pF1KSD VLSCLPEPPPPYEFSCSSAEEMGAVLPETCEE---LKRGLGDEDGSNPFTQVLEERQRLW
.: :: : . .:. : : .: :.:.: :.. .:::::::. :
XP_005 --AC--SPPSPSAL----IQELEERLWEKEQEVAALRRSL--EQSEAAVAQVLEERQKAW
350 360 370 380 390
300 310 320 330 340
pF1KSD ---LAELKRLYVERLHEVTQKAERSERNLQLQLFMAQQEQRRLRKE---LRAQQGLAPEP
::::.. .:..:...:.:....::::.. ::....:..: : :. .
XP_005 ERELAELRQGCSGKLQQVARRAQRAQQGLQLQVLRLQQDKKQLQEEAARLMRQREELEDK
400 410 420 430 440 450
350 360 370 380 390 400
pF1KSD RAPGTLPEADPSARPEEEARWEVCQKTAEISLLKQQLREAQAELAQKLAEIFSLKTQLRG
: .:: : :: ..::::::..:::::::::...::...:::.:: .:..:::
XP_005 VAACQKEQADFLPRIEE-TKWEVCQKAGEISLLKQQLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLRE
460 470 480 490 500
410 420 430 440
pF1KSD SRAQAQAQDAELVRLREAVRSLQ----------------------EQAPREEAPGSCETD
.::. . .. .:. ::.. : : . : ..: ..::.:
XP_005 GRASLREKEEQLLSLRDSFSSKQASLELGEGELPAACLKPALTPVDPAEPQDALATCESD
510 520 530 540 550 560
450 460 470 480
pF1KSD DCKSRGLLG--------------EAGGSEA----RDSAEQLRAELLQERLRGQEQALRFE
. : : : :::: . : . .:.::: :: ..:. :
XP_005 EAKMRRQAGVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTRALRREVGRLQAELAAERRARERQGASFA
570 580 590 600 610 620
490 500 510 520 530 540
pF1KSD QERRTWQEEKERVLRYQREIQGGYMDMYRRNQALEQELRALREPPTPWSPRLESSKI
.:::.: ::::.:..::...: .:..::.::: ::..::
XP_005 EERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLERRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKA
630 640 650 660 670 680
XP_005 WTPSRLERIESTEI
690 700
>>NP_001269462 (OMIM: 610484) leucine zipper putative tu (627 aa)
initn: 582 init1: 237 opt: 338 Z-score: 222.8 bits: 51.2 E(85289): 1.1e-05
Smith-Waterman score: 563; 30.1% identity (53.0% similar) in 574 aa overlap (5-526:69-592)
10 20 30
pF1KSD MATAPGPAGIAMGSVGSLLERQDFSPEEPRAALA
::: : :: :. :: : : .
NP_001 SVGSGVAHAQEFAMKSVGTRTGGGGSQGSFPGPRG--SGS-GASRERPGRYPSEDK----
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KSD GSRGSRQPDGLLRKGLGQREFLSYLHLPKKDSKSTKNTKRAPRNEPADYATLYYREHSRA
: .: .: :: : . . . . . :.:. .. .:: : ::: :.
NP_001 GLANSLYLNGELR-GSDHTDVCGNVVGSSGGSSSSGGSDKAP---PQ------YREPSHP
100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KSD GDFSKTSLPERGRFDKCR---IRPSVFKPTAGNGKGFLSMQSLASHKGQKLWRSNGSLHT
. :: :..:.: .:::.:::.. :.: :::.: . .::.
NP_001 PKLLATS----GKLDQCSEPLVRPSAFKPVVP--KNFHSMQNLCPPQ------TNGT---
150 160 170 180
160 170 180 190 200
pF1KSD LACHPPLSPGPRASQARAQLLHALSLDEGGPEPEPSLSDS-----SSGGSFGRSPGTGPS
: :: . .. : .. .. .: .:::: .: ... : . .
NP_001 ----PEGRQGP--GGLKGGLDKSRTMTPAGGSGS-GLSDSGRNSLTSLPTYSSSYSQHLA
190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KSD PFSSSLGHLNHLGGSLDRASQGPKEAGPPAVLSCLPEPPPPYEFSCSSAEEMGAVLPETC
:.:.: .:.:..: . ...: . .: . . . .:. :: :
NP_001 PLSASTSHINRIGTASYGSGSGGSSGGGSGYQDLGTSDSGRASSKSGSSSSMGR--PG--
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KSD EELKRGLGDEDGSNPFTQVLEERQRLWLAELKRLYVERLHEVTQKAERSERNL-QLQLFM
.: : : :. ::. . ::. ::: : :.. .:.: : . .
NP_001 -HLGSGEGG-GGGLPFAACSPPSPSALIQELE----ERLWEKEQEVAALRRSLEQSEAAV
300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KSD AQQEQRRLRKE---LRAQQGLAPEPRAPGTLPEADPSARPEEEARWEVCQKTAEISLLKQ
:::....:..: : :. . : .:: : :: ..::::::..:::::::
NP_001 AQQDKKQLQEEAARLMRQREELEDKVAACQKEQADFLPRIEE-TKWEVCQKAGEISLLKQ
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430
pF1KSD QLREAQAELAQKLAEIFSLKTQLRGSRAQAQAQDAELVRLREAVRSLQ------------
::...::...:::.:: .:..::: .::. . .. .:. ::.. : :
NP_001 QLKDSQADVSQKLSEIVGLRSQLREGRASLREKEEQLLSLRDSFSSKQASLELGEGELPA
410 420 430 440 450 460
440 450 460
pF1KSD ----------EQAPREEAPGSCETDDCKSRGLLG--------------EAGGSEA----R
. : ..: ..::.:. : : : :::: . :
NP_001 ACLKPALTPVDPAEPQDALATCESDEAKMRRQAGVAAAASLVSVDGEAEAGGESGTRALR
470 480 490 500 510 520
470 480 490 500 510 520
pF1KSD DSAEQLRAELLQERLRGQEQALRFEQERRTWQEEKERVLRYQREIQGGYMDMYRRNQALE
. .:.::: :: ..:. : .:::.: ::::.:..::...: .:..::.::: ::
NP_001 REVGRLQAELAAERRARERQGASFAEERRVWLEEKEKVIEYQKQLQLSYVEMYQRNQQLE
530 540 550 560 570 580
530 540
pF1KSD QELRALREPPTPWSPRLESSKI
..::
NP_001 RRLRERGAAGGASTPTPQHGEEKKAWTPSRLERIESTEI
590 600 610 620
>>NP_115805 (OMIM: 610454) leucine zipper putative tumor (669 aa)
initn: 742 init1: 238 opt: 321 Z-score: 212.0 bits: 49.3 E(85289): 4.5e-05
Smith-Waterman score: 641; 33.3% identity (54.7% similar) in 516 aa overlap (102-528:128-638)
80 90 100 110 120
pF1KSD TKRAPRNEPADYATLYYREHSRAGDFSKTSLPERGRFDKCR----IRPSVFKPTAGNGKG
.: :...: :::..:::. . .:
NP_115 ESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHLRGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRG
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160
pF1KSD FLSMQSLASHKGQKLWRSNGSLHTLACHP---------------PLS--------P-GPR
:. :. . .. : :.::: : : ::. : :
NP_115 APSLPSFMGPRATGLSGSQGSLTQLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTL
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210
pF1KSD ASQARAQLLHALSLDEGGPEPE---PSLSDSSSGGSFGRSPG------TGPSPF----SS
....: .: . . :: :: :. : :.. : :: :::: ::
NP_115 SDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTTSSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSS
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260
pF1KSD SLGHLNHLGGSLDRASQGPKEAGPPAVLSCL-----PEPPPPYEFSCSSAEEMGAVLPET
: . ::: . . : . : :: : :::: . . : . .
NP_115 SSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRASPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDRE
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KSD CE--ELKRGLGDEDGSNPFTQVLEERQRLWLAELKRLYVERLHEVTQKAERSERNLQLQL
: .:. .: ..... . :. ::::: : : . : : .:.:.:... ::::.
NP_115 AELQQLRDSLDENEAT--MCQAYEERQRHWQREREALR-EDCAAQAQRAQRAQQLLQLQV
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KSD FMAQQEQRRLRKELRAQ--QGLAPEPRAPGTLPEADPSARPE-EEARWEVCQKTAEISLL
:. :::.:.:. .. :: : : .:: . . :. ::..::::::..:::::
NP_115 FQLQQEKRQLQDDF-AQLLQEREQLERRCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLL
400 410 420 430 440 450
390 400 410
pF1KSD KQQLREAQAELAQKLAEIFSLKTQLRGSRA---------------------QAQAQDAEL
::::.:.::::.:: .:. .:.. :: .:: . .: . ::
NP_115 KQQLKESQAELVQKGSELVALRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQEL
460 470 480 490 500 510
420 430 440 450 460
pF1KSD VRLREAVRSLQEQAPREEA-----------PGSC------ETDDCKSRGLLGEAGGSEAR
: :. ...:.:.: . .: :.. :.:. : . . .::: :
NP_115 QRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREPPVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGS-LR
520 530 540 550 560 570
470 480 490 500 510 520
pF1KSD DSAEQLRAELLQERLRGQEQALRFEQERRTWQEEKERVLRYQREIQGGYMDMYRRNQALE
..:.::.:: .:: ::.:: :: :: .:: :::.:.:::...: .:..:::::. ::
NP_115 AQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGERLAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLE
580 590 600 610 620 630
530 540
pF1KSD QELRALREPPTPWSPRLESSKI
:::. :
NP_115 QELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCICLEEITATEI
640 650 660
>>NP_001305028 (OMIM: 610454) leucine zipper putative tu (669 aa)
initn: 742 init1: 238 opt: 321 Z-score: 212.0 bits: 49.3 E(85289): 4.5e-05
Smith-Waterman score: 641; 33.3% identity (54.7% similar) in 516 aa overlap (102-528:128-638)
80 90 100 110 120
pF1KSD TKRAPRNEPADYATLYYREHSRAGDFSKTSLPERGRFDKCR----IRPSVFKPTAGNGKG
.: :...: :::..:::. . .:
NP_001 ESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHLRGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRG
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160
pF1KSD FLSMQSLASHKGQKLWRSNGSLHTLACHP---------------PLS--------P-GPR
:. :. . .. : :.::: : : ::. : :
NP_001 APSLPSFMGPRATGLSGSQGSLTQLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTL
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210
pF1KSD ASQARAQLLHALSLDEGGPEPE---PSLSDSSSGGSFGRSPG------TGPSPF----SS
....: .: . . :: :: :. : :.. : :: :::: ::
NP_001 SDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTTSSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSS
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260
pF1KSD SLGHLNHLGGSLDRASQGPKEAGPPAVLSCL-----PEPPPPYEFSCSSAEEMGAVLPET
: . ::: . . : . : :: : :::: . . : . .
NP_001 SSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRASPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDRE
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KSD CE--ELKRGLGDEDGSNPFTQVLEERQRLWLAELKRLYVERLHEVTQKAERSERNLQLQL
: .:. .: ..... . :. ::::: : : . : : .:.:.:... ::::.
NP_001 AELQQLRDSLDENEAT--MCQAYEERQRHWQREREALR-EDCAAQAQRAQRAQQLLQLQV
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KSD FMAQQEQRRLRKELRAQ--QGLAPEPRAPGTLPEADPSARPE-EEARWEVCQKTAEISLL
:. :::.:.:. .. :: : : .:: . . :. ::..::::::..:::::
NP_001 FQLQQEKRQLQDDF-AQLLQEREQLERRCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLL
400 410 420 430 440 450
390 400 410
pF1KSD KQQLREAQAELAQKLAEIFSLKTQLRGSRA---------------------QAQAQDAEL
::::.:.::::.:: .:. .:.. :: .:: . .: . ::
NP_001 KQQLKESQAELVQKGSELVALRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQEL
460 470 480 490 500 510
420 430 440 450 460
pF1KSD VRLREAVRSLQEQAPREEA-----------PGSC------ETDDCKSRGLLGEAGGSEAR
: :. ...:.:.: . .: :.. :.:. : . . .::: :
NP_001 QRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREPPVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGS-LR
520 530 540 550 560 570
470 480 490 500 510 520
pF1KSD DSAEQLRAELLQERLRGQEQALRFEQERRTWQEEKERVLRYQREIQGGYMDMYRRNQALE
..:.::.:: .:: ::.:: :: :: .:: :::.:.:::...: .:..:::::. ::
NP_001 AQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGERLAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLE
580 590 600 610 620 630
530 540
pF1KSD QELRALREPPTPWSPRLESSKI
:::. :
NP_001 QELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCICLEEITATEI
640 650 660
>>XP_005270279 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zipper (669 aa)
initn: 742 init1: 238 opt: 321 Z-score: 212.0 bits: 49.3 E(85289): 4.5e-05
Smith-Waterman score: 641; 33.3% identity (54.7% similar) in 516 aa overlap (102-528:128-638)
80 90 100 110 120
pF1KSD TKRAPRNEPADYATLYYREHSRAGDFSKTSLPERGRFDKCR----IRPSVFKPTAGNGKG
.: :...: :::..:::. . .:
XP_005 ESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHLRGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRG
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160
pF1KSD FLSMQSLASHKGQKLWRSNGSLHTLACHP---------------PLS--------P-GPR
:. :. . .. : :.::: : : ::. : :
XP_005 APSLPSFMGPRATGLSGSQGSLTQLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTL
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210
pF1KSD ASQARAQLLHALSLDEGGPEPE---PSLSDSSSGGSFGRSPG------TGPSPF----SS
....: .: . . :: :: :. : :.. : :: :::: ::
XP_005 SDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTTSSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSS
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260
pF1KSD SLGHLNHLGGSLDRASQGPKEAGPPAVLSCL-----PEPPPPYEFSCSSAEEMGAVLPET
: . ::: . . : . : :: : :::: . . : . .
XP_005 SSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRASPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDRE
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KSD CE--ELKRGLGDEDGSNPFTQVLEERQRLWLAELKRLYVERLHEVTQKAERSERNLQLQL
: .:. .: ..... . :. ::::: : : . : : .:.:.:... ::::.
XP_005 AELQQLRDSLDENEAT--MCQAYEERQRHWQREREALR-EDCAAQAQRAQRAQQLLQLQV
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KSD FMAQQEQRRLRKELRAQ--QGLAPEPRAPGTLPEADPSARPE-EEARWEVCQKTAEISLL
:. :::.:.:. .. :: : : .:: . . :. ::..::::::..:::::
XP_005 FQLQQEKRQLQDDF-AQLLQEREQLERRCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLL
400 410 420 430 440 450
390 400 410
pF1KSD KQQLREAQAELAQKLAEIFSLKTQLRGSRA---------------------QAQAQDAEL
::::.:.::::.:: .:. .:.. :: .:: . .: . ::
XP_005 KQQLKESQAELVQKGSELVALRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQEL
460 470 480 490 500 510
420 430 440 450 460
pF1KSD VRLREAVRSLQEQAPREEA-----------PGSC------ETDDCKSRGLLGEAGGSEAR
: :. ...:.:.: . .: :.. :.:. : . . .::: :
XP_005 QRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREPPVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGS-LR
520 530 540 550 560 570
470 480 490 500 510 520
pF1KSD DSAEQLRAELLQERLRGQEQALRFEQERRTWQEEKERVLRYQREIQGGYMDMYRRNQALE
..:.::.:: .:: ::.:: :: :: .:: :::.:.:::...: .:..:::::. ::
XP_005 AQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGERLAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLE
580 590 600 610 620 630
530 540
pF1KSD QELRALREPPTPWSPRLESSKI
:::. :
XP_005 QELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCICLEEITATEI
640 650 660
>>XP_016872269 (OMIM: 610454) PREDICTED: leucine zipper (669 aa)
initn: 742 init1: 238 opt: 321 Z-score: 212.0 bits: 49.3 E(85289): 4.5e-05
Smith-Waterman score: 641; 33.3% identity (54.7% similar) in 516 aa overlap (102-528:128-638)
80 90 100 110 120
pF1KSD TKRAPRNEPADYATLYYREHSRAGDFSKTSLPERGRFDKCR----IRPSVFKPTAGNGKG
.: :...: :::..:::. . .:
XP_016 ESPPSPSSDVEDAREQRAHNAHLRGPPPKLIPVSGKLEKNMEKILIRPTAFKPVLPKPRG
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160
pF1KSD FLSMQSLASHKGQKLWRSNGSLHTLACHP---------------PLS--------P-GPR
:. :. . .. : :.::: : : ::. : :
XP_016 APSLPSFMGPRATGLSGSQGSLTQLFGGPASSSSSSSSSSAADKPLAFSGWASGCPSGTL
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210
pF1KSD ASQARAQLLHALSLDEGGPEPE---PSLSDSSSGGSFGRSPG------TGPSPF----SS
....: .: . . :: :: :. : :.. : :: :::: ::
XP_016 SDSGRNSLSSLPTYSTGGAEPTTSSPGGHLPSHGSGRGALPGPARGVPTGPSHSDSGRSS
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260
pF1KSD SLGHLNHLGGSLDRASQGPKEAGPPAVLSCL-----PEPPPPYEFSCSSAEEMGAVLPET
: . ::: . . : . : :: : :::: . . : . .
XP_016 SSKSTGSLGGRVAGGLLGSGTRASPDSSSCGERSPPPPPPPPSDEALLHCVLEGKLRDRE
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KSD CE--ELKRGLGDEDGSNPFTQVLEERQRLWLAELKRLYVERLHEVTQKAERSERNLQLQL
: .:. .: ..... . :. ::::: : : . : : .:.:.:... ::::.
XP_016 AELQQLRDSLDENEAT--MCQAYEERQRHWQREREALR-EDCAAQAQRAQRAQQLLQLQV
340 350 360 370 380 390
330 340 350 360 370 380
pF1KSD FMAQQEQRRLRKELRAQ--QGLAPEPRAPGTLPEADPSARPE-EEARWEVCQKTAEISLL
:. :::.:.:. .. :: : : .:: . . :. ::..::::::..:::::
XP_016 FQLQQEKRQLQDDF-AQLLQEREQLERRCATLEREQRELGPRLEETKWEVCQKSGEISLL
400 410 420 430 440 450
390 400 410
pF1KSD KQQLREAQAELAQKLAEIFSLKTQLRGSRA---------------------QAQAQDAEL
::::.:.::::.:: .:. .:.. :: .:: . .: . ::
XP_016 KQQLKESQAELVQKGSELVALRVALREARATLRVSEGRARGLQEAARARELELEACSQEL
460 470 480 490 500 510
420 430 440 450 460
pF1KSD VRLREAVRSLQEQAPREEA-----------PGSC------ETDDCKSRGLLGEAGGSEAR
: :. ...:.:.: . .: :.. :.:. : . . .::: :
XP_016 QRHRQEAEQLREKAGQLDAEAAGLREPPVPPATADPFLLAESDEAKVQRAAAGVGGS-LR
520 530 540 550 560 570
470 480 490 500 510 520
pF1KSD DSAEQLRAELLQERLRGQEQALRFEQERRTWQEEKERVLRYQREIQGGYMDMYRRNQALE
..:.::.:: .:: ::.:: :: :: .:: :::.:.:::...: .:..:::::. ::
XP_016 AQVERLRVELQRERRRGEEQRDSFEGERLAWQAEKEQVIRYQKQLQHNYIQMYRRNRQLE
580 590 600 610 620 630
530 540
pF1KSD QELRALREPPTPWSPRLESSKI
:::. :
XP_016 QELQQLSLELEARELADLGLAEQAPCICLEEITATEI
640 650 660
544 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 01:20:14 2016 done: Thu Nov 3 01:20:16 2016
Total Scan time: 11.700 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]