Result of FASTA (ccds) for
pF1KSDA0331
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KSDA0331, 775 aa
1>>>pF1KSDA0331 775 - 775 aa - 775 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6345+/-0.00101; mu= 18.6330+/- 0.060
mean_var=74.4118+/-14.637, 0's: 0 Z-trim(104.5): 62 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.148680
statistics sampled from 7879 (7940) to 7879 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 2.860
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34674.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 775) 5344 1156.3 0
CCDS55121.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 715) 4936 1068.8 0
CCDS5599.1 SEMA3A gene_id:10371|Hs108|chr7 ( 771) 2692 587.5 2.8e-167
CCDS2856.1 SEMA3G gene_id:56920|Hs108|chr3 ( 782) 2659 580.4 3.8e-165
CCDS34676.1 SEMA3D gene_id:223117|Hs108|chr7 ( 777) 2358 515.8 1e-145
CCDS82779.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 754) 2320 507.7 2.9e-143
CCDS74941.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 749) 2266 496.1 8.8e-140
CCDS77744.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 748) 2253 493.3 6e-139
CCDS77743.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 754) 2250 492.6 9.5e-139
CCDS82780.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 686) 2217 485.5 1.2e-136
CCDS5596.1 SEMA3C gene_id:10512|Hs108|chr7 ( 751) 2217 485.6 1.3e-136
CCDS2811.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 785) 1938 425.7 1.4e-118
CCDS77745.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 406) 1169 260.6 3.6e-69
CCDS47991.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 738) 1120 250.3 8.6e-66
CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 862) 1120 250.3 9.8e-66
CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 ( 833) 967 217.5 7.2e-56
CCDS32227.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 998) 876 198.0 6.3e-50
CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 597) 870 196.6 1e-49
CCDS32225.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1073) 872 197.1 1.2e-49
CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1017) 870 196.7 1.6e-49
CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1011) 859 194.3 8e-49
CCDS1955.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 770) 821 186.1 1.8e-46
CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15 ( 837) 819 185.7 2.6e-46
CCDS55724.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 702) 777 176.7 1.2e-43
CCDS7501.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 843) 777 176.7 1.4e-43
CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 476) 744 169.5 1.1e-41
CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1030) 719 164.3 8.9e-40
CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1047) 719 164.3 9e-40
CCDS984.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 930) 691 158.3 5.3e-38
CCDS53364.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 962) 691 158.3 5.4e-38
CCDS74529.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 737) 634 146.0 2.1e-34
CCDS53363.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 922) 558 129.8 2e-29
CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19 ( 888) 556 129.3 2.6e-29
CCDS3875.1 SEMA5A gene_id:9037|Hs108|chr5 (1074) 517 121.0 1e-26
CCDS74995.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1057) 498 116.9 1.7e-25
CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1151) 498 116.9 1.8e-25
CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1205) 498 117.0 1.9e-25
CCDS1132.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 761) 452 107.0 1.2e-22
CCDS53378.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 629) 439 104.1 7.1e-22
CCDS62942.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 615) 425 101.1 5.6e-21
CCDS53958.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 501) 323 79.2 1.8e-14
CCDS53959.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 652) 323 79.3 2.3e-14
CCDS10262.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 666) 323 79.3 2.3e-14
>>CCDS34674.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 (775 aa)
initn: 5344 init1: 5344 opt: 5344 Z-score: 6191.0 bits: 1156.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5344; 100.0% identity (100.0% similar) in 775 aa overlap (1-775:1-775)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASAGHIITLLLWGYLLELWTGGHTADTTHPRLRLSHKELLNLNRTSIFHSPFGFLDLHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MASAGHIITLLLWGYLLELWTGGHTADTTHPRLRLSHKELLNLNRTSIFHSPFGFLDLHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KSD MLLDEYQERLFVGGRDLVYSLSLERISDGYKEIHWPSTALKMEECIMKGKDAGECANYVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MLLDEYQERLFVGGRDLVYSLSLERISDGYKEIHWPSTALKMEECIMKGKDAGECANYVR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KSD VLHHYNRTHLLTCGTGAFDPVCAFIRVGYHLEDPLFHLESPRSERGRGRCPFDPSSSFIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLHHYNRTHLLTCGTGAFDPVCAFIRVGYHLEDPLFHLESPRSERGRGRCPFDPSSSFIS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KSD TLIGSELFAGLYSDYWSRDAAIFRSMGRLAHIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNEDRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TLIGSELFAGLYSDYWSRDAAIFRSMGRLAHIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNEDRD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KSD DNKVYFFFTEKALEAENNAHAIYTRVGRLCVNDVGGQRILVNKWSTFLKARLVCSVPGMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DNKVYFFFTEKALEAENNAHAIYTRVGRLCVNDVGGQRILVNKWSTFLKARLVCSVPGMN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KSD GIDTYFDELEDVFLLPTRDHKNPVIFGLFNTTSNIFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPYAHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GIDTYFDELEDVFLLPTRDHKNPVIFGLFNTTSNIFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPYAHK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KSD EGPEYHWSVYEGKVPYPRPGSCASKVNGGRYGTTKDYPDDAIRFARSHPLMYQAIKPAHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EGPEYHWSVYEGKVPYPRPGSCASKVNGGRYGTTKDYPDDAIRFARSHPLMYQAIKPAHK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KSD KPILVKTDGKYNLKQIAVDRVEAEDGQYDVLFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVILE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KPILVKTDGKYNLKQIAVDRVEAEDGQYDVLFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVILE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KSD ELQIFKDPVPIISMEISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHCDMYGSACADCCLARDPYCAWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ELQIFKDPVPIISMEISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHCDMYGSACADCCLARDPYCAWD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KSD GISCSRYYPTGTHAKRRFRRQDVRHGNAAQQCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIENNSTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GISCSRYYPTGTHAKRRFRRQDVRHGNAAQQCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIENNSTLL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KSD ECTPRSLQAKVIWFVQKGRETRKEEVKTDDRVVKMDLGLLFLRLHKSDAGTYFCQTVEHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ECTPRSLQAKVIWFVQKGRETRKEEVKTDDRVVKMDLGLLFLRLHKSDAGTYFCQTVEHS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KSD FVHTVRKITLEVVEEEKVEDMFNKDDEEDRHHRMPCPAQSSISQGAKPWYKEFLQLIGYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FVHTVRKITLEVVEEEKVEDMFNKDDEEDRHHRMPCPAQSSISQGAKPWYKEFLQLIGYS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770
pF1KSD NFQRVEEYCEKVWCTDRKRKKLKMSPSKWKYANPQEKKLRSKPEHYRLPRHTLDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NFQRVEEYCEKVWCTDRKRKKLKMSPSKWKYANPQEKKLRSKPEHYRLPRHTLDS
730 740 750 760 770
>>CCDS55121.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 (715 aa)
initn: 4936 init1: 4936 opt: 4936 Z-score: 5718.6 bits: 1068.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4936; 100.0% identity (100.0% similar) in 715 aa overlap (61-775:1-715)
40 50 60 70 80 90
pF1KSD PRLRLSHKELLNLNRTSIFHSPFGFLDLHTMLLDEYQERLFVGGRDLVYSLSLERISDGY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MLLDEYQERLFVGGRDLVYSLSLERISDGY
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KSD KEIHWPSTALKMEECIMKGKDAGECANYVRVLHHYNRTHLLTCGTGAFDPVCAFIRVGYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 KEIHWPSTALKMEECIMKGKDAGECANYVRVLHHYNRTHLLTCGTGAFDPVCAFIRVGYH
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KSD LEDPLFHLESPRSERGRGRCPFDPSSSFISTLIGSELFAGLYSDYWSRDAAIFRSMGRLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LEDPLFHLESPRSERGRGRCPFDPSSSFISTLIGSELFAGLYSDYWSRDAAIFRSMGRLA
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KSD HIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNEDRDDNKVYFFFTEKALEAENNAHAIYTRVGRLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNEDRDDNKVYFFFTEKALEAENNAHAIYTRVGRLC
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KSD VNDVGGQRILVNKWSTFLKARLVCSVPGMNGIDTYFDELEDVFLLPTRDHKNPVIFGLFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VNDVGGQRILVNKWSTFLKARLVCSVPGMNGIDTYFDELEDVFLLPTRDHKNPVIFGLFN
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KSD TTSNIFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPYAHKEGPEYHWSVYEGKVPYPRPGSCASKVNGGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TTSNIFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPYAHKEGPEYHWSVYEGKVPYPRPGSCASKVNGGR
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KSD YGTTKDYPDDAIRFARSHPLMYQAIKPAHKKPILVKTDGKYNLKQIAVDRVEAEDGQYDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YGTTKDYPDDAIRFARSHPLMYQAIKPAHKKPILVKTDGKYNLKQIAVDRVEAEDGQYDV
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KSD LFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVILEELQIFKDPVPIISMEISSKRQQLYIGSASA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVILEELQIFKDPVPIISMEISSKRQQLYIGSASA
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KSD VAQVRFHHCDMYGSACADCCLARDPYCAWDGISCSRYYPTGTHAKRRFRRQDVRHGNAAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VAQVRFHHCDMYGSACADCCLARDPYCAWDGISCSRYYPTGTHAKRRFRRQDVRHGNAAQ
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KSD QCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIENNSTLLECTPRSLQAKVIWFVQKGRETRKEEVKTDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIENNSTLLECTPRSLQAKVIWFVQKGRETRKEEVKTDD
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KSD RVVKMDLGLLFLRLHKSDAGTYFCQTVEHSFVHTVRKITLEVVEEEKVEDMFNKDDEEDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RVVKMDLGLLFLRLHKSDAGTYFCQTVEHSFVHTVRKITLEVVEEEKVEDMFNKDDEEDR
580 590 600 610 620 630
700 710 720 730 740 750
pF1KSD HHRMPCPAQSSISQGAKPWYKEFLQLIGYSNFQRVEEYCEKVWCTDRKRKKLKMSPSKWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HHRMPCPAQSSISQGAKPWYKEFLQLIGYSNFQRVEEYCEKVWCTDRKRKKLKMSPSKWK
640 650 660 670 680 690
760 770
pF1KSD YANPQEKKLRSKPEHYRLPRHTLDS
:::::::::::::::::::::::::
CCDS55 YANPQEKKLRSKPEHYRLPRHTLDS
700 710
>>CCDS5599.1 SEMA3A gene_id:10371|Hs108|chr7 (771 aa)
initn: 1874 init1: 1317 opt: 2692 Z-score: 3116.7 bits: 587.5 E(32554): 2.8e-167
Smith-Waterman score: 2692; 48.6% identity (78.9% similar) in 771 aa overlap (8-770:7-769)
10 20 30 40 50 60
pF1KSD MASAGHIITLLLWGYLLELWTGGHTADTTHPRLRLSHKELLNLNRTSIFHSPFGFLDLHT
:. :.:: :: .. ... .. :::.::.::.:. : . :.. . . ::
CCDS55 MGWLTRIVCLFWGVLLTARANYQNGKNNVPRLKLSYKEMLESNNVITFNGLANSSSYHT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KSD MLLDEYQERLFVGGRDLVYSLSLERISDGYKEIHWPSTALKMEECIMKGKDA-GECANYV
.:::: . ::.::..: ..:..: :.: ...: :: . . .:: ::: ::::..
CCDS55 FLLDEERSRLYVGAKDHIFSFDLVNIKD-FQKIVWPVSYTRRDECKWAGKDILKECANFI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KSD RVLHHYNRTHLLTCGTGAFDPVCAFIRVGYHLEDPLFHLESPRSERGRGRCPFDPSSSFI
.::. ::.::: .:::::: :.:..:..:.: :: .:.::. . : :::. :.::.
CCDS55 KVLKAYNQTHLYACGTGAFHPICTYIEIGHHPEDNIFKLENSHFENGRGKSPYDPKLLTA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KSD STLIGSELFAGLYSDYWSRDAAIFRSMGRLAHIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNEDR
: :: .::..: .:. .:: ::::..:. ::::. : : :..:::.....: ....
CCDS55 SLLIDGELYSGTAADFMGRDFAIFRTLGHHHPIRTEQHDSRWLNDPKFISAHLISESDNP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KSD DDNKVYFFFTEKALEAENNAHAIYTRVGRLCVNDVGGQRILVNKWSTFLKARLVCSVPGM
.:.:::::: :.:...:....: ..:.:..: :: ::.: :::::.:::::::.:::::
CCDS55 EDDKVYFFFRENAIDGEHSGKATHARIGQICKNDFGGHRSLVNKWTTFLKARLICSVPGP
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KSD NGIDTYFDELEDVFLLPTRDHKNPVIFGLFNTTSNIFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPYAH
:::::.::::.::::. .: ::::..:.:.:.::::.: :.:.: ::..: .: :::::
CCDS55 NGIDTHFDELQDVFLMNFKDPKNPVVYGVFTTSSNIFKGSAVCMYSMSDVRRVFLGPYAH
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KSD KEGPEYHWSVYEGKVPYPRPGSCASKVNGGRYGTTKDYPDDAIRFARSHPLMYQAIKPAH
..::.:.: :.:.:::::::.: ::. :: . .::: :::.: :::::: ::. . : .
CCDS55 RDGPNYQWVPYQGRVPYPRPGTCPSKTFGG-FDSTKDLPDDVITFARSHPAMYNPVFPMN
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KSD KKPILVKTDGKYNLKQIAVDRVEAEDGQYDVLFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVIL
..::..::: .:.. ::.::::.::::::::.::::: : ::::..: .. ..:::.:
CCDS55 NRPIVIKTDVNYQFTQIVVDRVDAEDGQYDVMFIGTDVGTVLKVVSIPKETWYDLEEVLL
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KSD EELQIFKDPVPIISMEISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHCDMYGSACADCCLARDPYCAW
::. .:..:. : .::.:.:.:::::::...:::. .:.::.::.:::.:::::::::::
CCDS55 EEMTVFREPTAISAMELSTKQQQLYIGSTAGVAQLPLHRCDIYGKACAECCLARDPYCAW
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KSD DGISCSRYYPTGTHAKRRFRRQDVRHGNAAQQCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIENNSTL
:: .::::.:: :::: ::::.:.:. .: . . . ::.. ::.::.::.
CCDS55 DGSACSRYFPT---AKRRTRRQDIRNGDPLTHCSDLHHDNHHGHSPEERIIYGVENSSTF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KSD LECTPRSLQAKVIWFVQKGRETRKEEVKTDDRVVKMDLGLLFLRLHKSDAGTYFCQTVEH
:::.:.: .: : : :. : ::::...::.... : :::. :...:.:.:.:..:::
CCDS55 LECSPKSQRALVYWQFQRRNEERKEEIRVDDHIIRTDQGLLLRSLQQKDSGNYLCHAVEH
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CCDS55 PNLNTMDEFCEQVWKRDRKQRRQRPGHTPGNSNKWKHLQ-ENKKGRNRRTHEFERAPRSV
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CCDS28 TLEHGFSQTVVRLALVVIVASQLDNLFPPEPKPEE----P-PARGGLASTPPKAWYKDIL
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pF1KSD QLIGYSNFQRVEEYCEKVWCTD--------RKRKKLKMSPSK-WKYANPQEK-KLRSKPE
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CCDS28 QLIGFANLPRVDEYCERVWCRGTTECSGCFRSRSRGKQARGKSWAGLELGKKMKSRVHAE
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770
pF1KSD HYRLPRHTLDS
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CCDS28 HNRTPREVEAT
780
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CCDS34 PVAGGPTFKRINVDYRLTQIVVDHVIAEDGQYDVMFLGTDIGTVLKVVSI-SKEKWNMEE
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CCDS34 CAWDGNACSRYAPT---SKRRARRQDVKYGDPITQCWD---IEDSISHETADEKVIFGIE
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CCDS34 FNSTFLECIPKSQQATIKWYIQRSGDEHREELKPDERIIKTEYGLLIRSLQKKDSGMYYC
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CCDS34 KAQEHTFIHTIVKLTLNVIENEQMENTQRAEHEEGKVKDLL--AESRLR------YKDYI
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CCDS34 QILSSPNFS-LDQYCEQMWHREKRRQRNKGGP-KWKHMQEMKKK-RNRRHHRDLDELPRA
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pF1KSD TLDS
CCDS34 VAT
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CCDS82 YRILLKDEDHDRMYVGSKDYVLSLDLHDINREPLIIHWAASPQRIEECVLSGKDVNGECG
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CCDS82 TENNFKHVVTRVQLHVLGRDAVHAALFPPLS-------MSAPPPPGAGPPTPP-YQELAQ
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CCDS82 LLAQPEVGLIHQYCQGYW--RHVPPSPREAPGAPRSPEPQDQK---KPRNRR--HHPPDT
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CCDS74 MGRAGAAAVIPGLALLWAVGLGSAAPSPPRLRLSFQELQAWHGLQTF-SLERTCCYQ
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CCDS74 ALLVDEERGRLFVGAENHVASLNLDNISKRAKKLAWPAPVEWREECNWAGKDIGTECMNF
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CCDS74 VKLLHAYNRTHLLACGTGAFHPTCAFVEVGHRAEEPVLRLDPGRIEDGKGKSPYDPRHRA
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CCDS74 ASVLVGEELYSGVAADLMGRDFTIFRSLGQRPSLRTEPHDSRWLNEPKFVKVFWIPESEN
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CCDS74 PDDDKIYFFFRETAVEAAPALGRLSVSRVGQICRNDVGGQRSLVNKWTTFLKARLVCSVP
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CCDS74 GVEG-DTHFDQLQDVFLLSSRDHRTPLLYAVFSTSSSIFQGSAVCVYSMNDVRRAFLGPF
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CCDS74 AHKEGPMHQWVSYQGRVPYPRPGMCPSKTFG-TFSSTKDFPDDVIQFARNHPLMYNSVLP
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CCDS74 TGGRPLFLQVGANYTFTQIAADRVAAADGHYDVLFIGTDVGTVLKVISVPKGSRPSAEGL
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CCDS74 LLEELHVFEDSAAVTSMQISSKRHQLYVASRSAVAQIALHRCAAHGRVCTECCLARDPYC
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540 550 560 570 580
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pF1KSD EHSFVHTVRKITLEVVEEEKVEDMFNKDDEEDRHHRMPCPAQSSISQGAKPWYKEFLQLI
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CCDS77 EPGGGGSANSLRMC-------RPQPALQSLPLESRRKGRNRRTHAPEPRAERGPRSATHW
700 710 720 730 740
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:.:.: ::..:. .: .:: .::::.:. .::: : : :.::::: . ::..:.
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CCDS77 VEGSSAFLECEPRSLQARVEWTFQRAGVTAHTQVLAEERTERTARGLLLRRLRRRDSGVY
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CCDS77 LCAAVEQGFTQPLRRLSLHVLSATQAERLARAEE-----------AAPAAPPGPKLWYRD
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CCDS77 FLQLVEPGGGGSANSLRMC-------RPQPALQSLPLESRRKGRNRRTHAPEPRAERGPR
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CCDS77 SATHW
750
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CCDS82 QRIEECVLSGKDVNGECGNFVRLIQPWNRTHLYVCGTGAYNPMCTYVNRGRRAQDYIFYL
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CCDS82 EPERLESGKGKCPYDPKLDTASALINEELYAGVYIDFMGTDAAIFRTLGKQTAMRTDQYN
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CCDS82 SRWLNDPSFIHAELIPDSAERNDDKLYFFFRERSAEAPQSP-AVYARIGRICLNDDGGHC
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CCDS82 CLVNKWSTFLKARLVCSVPGEDGIETHFDELQDVFVQQTQDVRNPVIYAVFTSSGSVFRG
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CCDS82 DEVINFMRSHPLMYQAVYPLQRRPLVVRTGAPYRLTTIAVDQVDAADGRYEVLFLGTDRG
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CCDS82 TVQKVIVLPKDDQE-LEELMLEEVEVFKDPAPVKTMTISSKRQQLYVASAVGVTHLSLHR
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CCDS82 CQAYGAACADCCLARDPYCAWDGQACSRYTAS---SKRRSRRQDVRHGNPIRQCRG--FN
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CCDS82 SNANKNAVESVQYGVAGSAAFLECQPRSPQATVKWLFQRDPGDRRREIRAEDRFLRTEQG
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: ::.. : .: :.
CCDS82 K---KPRNRR--HHPPDT
680
775 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 01:18:04 2016 done: Thu Nov 3 01:18:04 2016
Total Scan time: 2.860 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]