FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9635, 1544 aa
1>>>pF1KE9635 1544 - 1544 aa - 1544 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8855+/-0.000972; mu= 17.4770+/- 0.059
mean_var=131.2701+/-25.716, 0's: 0 Z-trim(109.6): 112 B-trim: 5 in 1/51
Lambda= 0.111942
statistics sampled from 10902 (11015) to 10902 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.338), width: 16
Scan time: 5.840
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1 (1544) 10553 1716.9 0
CCDS81417.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1 (1580) 8878 1446.4 0
CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12 (1690) 4883 801.2 0
CCDS55554.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1482) 3442 568.5 5.6e-161
CCDS14794.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1539) 3442 568.5 5.8e-161
CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1379) 3359 555.0 5.8e-157
CCDS65269.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1559) 3359 555.1 6.3e-157
CCDS14351.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1560) 3359 555.1 6.3e-157
CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1570) 2616 435.1 8.4e-121
CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11 ( 506) 450 84.9 7.1e-16
CCDS8302.1 KDM4D gene_id:55693|Hs108|chr11 ( 523) 446 84.3 1.1e-15
CCDS491.1 KDM4A gene_id:9682|Hs108|chr1 (1064) 445 84.3 2.2e-15
CCDS55286.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 813) 434 82.5 6.1e-15
CCDS55285.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 ( 835) 434 82.5 6.2e-15
CCDS6471.1 KDM4C gene_id:23081|Hs108|chr9 (1056) 434 82.6 7.5e-15
CCDS12138.1 KDM4B gene_id:23030|Hs108|chr19 (1096) 426 81.3 1.9e-14
>>CCDS30974.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1 (1544 aa)
initn: 10553 init1: 10553 opt: 10553 Z-score: 9209.8 bits: 1716.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10553; 100.0% identity (100.0% similar) in 1544 aa overlap (1-1544:1-1544)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAMN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 IKIEPEETTEARTHNLRRRMGCPTPKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIVENEKEKPKSRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 IKIEPEETTEARTHNLRRRMGCPTPKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIVENEKEKPKSRS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 KKATNAVDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 KKATNAVDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 CSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 CSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEED
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 VTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 VTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADIC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 GMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 GMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 LFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 NFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 DEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 ELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 ALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 ELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 ELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 DVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSLTLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSLTLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMAR
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 LQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDW
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 LQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 LQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 NSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRKQRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERALTESKETAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRKQRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERALTESKETAS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE9 AMATLGEARLREMEALQSLRLANEGKLLSPLQDVDIKICLCQKAPAAPMIQCELCRDAFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AMATLGEARLREMEALQSLRLANEGKLLSPLQDVDIKICLCQKAPAAPMIQCELCRDAFH
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 TSCVAVPSISQGLRIWLCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 TSCVAVPSISQGLRIWLCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTV
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE9 NWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGTTSFSLPDDWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGTTSFSLPDDWD
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE9 NRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 NRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQT
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE9 DRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGINSLERKLKRRLEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGINSLERKLKRRLEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKL
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE9 SHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHSLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 SHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHSLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEV
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540
pF1KE9 DWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRCTVKDAPSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS30 DWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRCTVKDAPSRK
1510 1520 1530 1540
>>CCDS81417.1 KDM5B gene_id:10765|Hs108|chr1 (1580 aa)
initn: 8878 init1: 8878 opt: 8878 Z-score: 7747.7 bits: 1446.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 10448; 97.7% identity (97.7% similar) in 1576 aa overlap (5-1544:5-1580)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
pF1KE9 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAE---
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAERQS
190 200 210 220 230 240
240 250 260
pF1KE9 ---------------------------------AMNIKIEPEETTEARTHNLRRRMGCPT
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LAVLPRLECSGAILAHCNLRLLDSSNSSASASQAMNIKIEPEETTEARTHNLRRRMGCPT
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE9 PKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIVENEKEKPKSRSKKATNAVDLYVCLLCGSGNDEDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 PKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIVENEKEKPKSRSKKATNAVDLYVCLLCGSGNDEDRL
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 LLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGE
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 MADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGK
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KE9 IKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 IKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHW
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KE9 SYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTH
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 EVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRY
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KE9 CVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFEL
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KE9 LPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPM
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KE9 MNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVT
790 800 810 820 830 840
810 820 830 840 850 860
pF1KE9 QDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKD
850 860 870 880 890 900
870 880 890 900 910 920
pF1KE9 LLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQ
910 920 930 940 950 960
930 940 950 960 970 980
pF1KE9 QACLDPSSLTLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QACLDPSSLTLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPR
970 980 990 1000 1010 1020
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE9 HSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 HSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE9 RGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 RGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRK
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE9 QRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE9 GKLLSPLQDVDIKICLCQKAPAAPMIQCELCRDAFHTSCVAVPSISQGLRIWLCPHCRRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GKLLSPLQDVDIKICLCQKAPAAPMIQCELCRDAFHTSCVAVPSISQGLRIWLCPHCRRS
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE9 EKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGS
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KE9 GLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGTTSFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGTTSFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KE9 EVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 EVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGIN
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KE9 SLERKLKRRLEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SLERKLKRRLEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KE9 THSLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 THSLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEM
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1530 1540
pF1KE9 AEKEDYICVRCTVKDAPSRK
::::::::::::::::::::
CCDS81 AEKEDYICVRCTVKDAPSRK
1570 1580
>>CCDS41736.1 KDM5A gene_id:5927|Hs108|chr12 (1690 aa)
initn: 5217 init1: 3675 opt: 4883 Z-score: 4260.4 bits: 801.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5090; 55.9% identity (80.6% similar) in 1333 aa overlap (17-1331:1-1322)
10 20 30 40 50
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLG---EFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAE
..: :: : ::.:::::::::::::::.::..:: .:::.::
CCDS41 MAGVGPGGYAAEFVPPPECPVFEPSWEEFTDPLSFIGRIRPLAE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE9 QTGICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGST
.:::::.::: ::::::::.: ...::::.::::::::.:::.:.::::.::.:::::::
CCDS41 KTGICKIRPPKDWQPPFACEVKSFRFTPRVQRLNELEAMTRVRLDFLDQLAKFWELQGST
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE9 LKIPHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYER
:::: ::::::::. :.:.:: .::: .: :..::.:.....:. :::..:: ...::::
CCDS41 LKIPVVERKILDLYALSKIVASKGGFEMVTKEKKWSKVGSRLGYLPGKGTGSLLKSHYER
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE9 ILNPYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAE
:: ::.:: :: :: .: ::: : :.: .:. . ...: :. : . . .
CCDS41 ILYPYELFQSGVSLMGVQMPNL--DLKEK-VEPEVLSTDTQTSPE----PGTRMNILPKR
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE9 AMNIKIEPEETTEARTHNLRR-RMGCPTPKCENEKEMKSSIKQEPIERKDYIVE-NEKEK
. .: . : .:. .:.. .. :: . : .. :.. . :. ... .. .
CCDS41 TRRVKTQSESGDVSRNTELKKLQIFGAGPKVVGLA-MGTKDKEDEVTRRRKVTNRSDAFN
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE9 PKSRSKKAT---NAVDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWR
. :..:.: : ::::::..:: ::.::.:::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS41 MQMRQRKGTLSVNFVDLYVCMFCGRGNNEDKLLLCDGCDDSYHTFCLIPPLPDVPKGDWR
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KE9 CPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWR
::::.:.:::::.::::::::.:.:::..:::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS41 CPKCVAEECSKPREAFGFEQAVREYTLQSFGEMADNFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWR
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE9 LVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVL
:::.::::: :::::::.::.:::::::.::. :. :::::: ::::::::::.:::::
CCDS41 LVSSIEEDVIVEYGADISSKDFGSGFPVKDGRRKILPEEEEYALSGWNLNNMPVLEQSVL
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KE9 AHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLEN
:::..:: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::..::::::.
CCDS41 AHINVDISGMKVPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSHAAEQLEE
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KE9 VMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQ
::..:::::: ::::::::::::::::.:: : ::::::::::::::.::::::::::::
CCDS41 VMRELAPELFESQPDLLHQLVTIMNPNVLMEHGVPVYRTNQCAGEFVVTFPRAYHSGFNQ
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KE9 GFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQ
:.::::::::::.::::.:::::.::: :.:.:::::.:.: :::. . ::: .:. :
CCDS41 GYNFAEAVNFCTADWLPIGRQCVNHYRRLRRHCVFSHEELIFKMAADPECLDVGLAAMVC
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KE9 KDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGL
:....: :.: :::.: ..::. ::. :::.::::::: :.::::.::..:::.:
CCDS41 KELTLMTEEETRLRESVVQMGVLMSEEEVFELVPDDERQCSACRTTCFLSALTCSCNPER
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE9 LVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINK
::::.: .:: :: : ::::: :.:: .. ..:.::.::. :. :.::: :..:.
CCDS41 LVCLYHPTDLCPCPMQKKCLRYRYPLEDLPSLLYGVKVRAQSYDTWVSRVTEALSANFNH
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KE9 KKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGK
::.:. .....:..: .:.:.:::.:.:: ....:: :::::: ::. :.. : .:.
CCDS41 KKDLIELRVMLEDAEDRKYPENDLFRKLRDAVKEAETCASVAQLLLSKKQKHRQSPDSGR
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KE9 SQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQD
....:::.::. :: ::..::::.::. .:.::. ::.:....:. . .:::....::
CCDS41 TRTKLTVEELKAFVQQLFSLPCVISQARQVKNLLDDVEEFHERAQEAMMDETPDSSKLQM
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KE9 LLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSLTLDDMRRLIDLGVGLAPYS
:.:.. . ::::.: ... .:.:::::.::. . ::...::: :..::: ::::::.
CCDS41 LIDMGSSLYVELPELPRLKQELQQARWLDEVRLTLSDPQQVTLDVMKKLIDSGVGLAPHH
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE9 AVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKD
:::::::.:::::::::.:..::: :.::::::. :: . :.: ..:::.::: .::.
CCDS41 AVEKAMAELQELLTVSERWEEKAKVCLQARPRHSVASLESIVNEAKNIPAFLPNVLSLKE
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE9 SVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKEC
..:.::.: ::..:.:. :. : : ..:: :::.:..::..:. :: ..::.:
CCDS41 ALQKAREWTAKVEAIQSGSNYAYLEQLESLSAKGRPIPVRLEALPQVESQVAAARAWRER
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE9 AVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGL-KRKQRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERA
. ::: .:: ..::.:: :: :::. : : ...:.:: . . :.:. :: :::::..
CCDS41 TGRTFLKKNSSHTLLQVLSPRTDIGVYGSGKNRRKKVKELIEKEKEKDLDLEPLSDLEEG
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE9 LTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANEGKLLSPLQDVDIKICLCQKAPAAPMIQ
: :...:: ..:.. : . .:.::..::: :: .:. . ..:.:.:.:. .. :.:
CCDS41 LEETRDTAMVVAVFKEREQKEIEAMHSLRAANLAKMTMVDRIEEVKFCICRKTASGFMLQ
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE9 CELCRDAFHTSCVAVPSISQGLR--IW-------LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRI
::::.: ::.::: .:. :. . : ::: : ::..: :: :: ::.:::..
CCDS41 CELCKDWFHNSCVPLPKSSSQKKGSSWQAKEVKFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVSLQKL
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1250 1260 1270 1280 1290 1300
pF1KE9 RVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTN
::::::.::. . ::...:: ::.: :.. .:. . ... .: .: .:.. :.
CCDS41 PVRLPEGEALQCLTERAMSWQDRARQALATDELSSALAKLS--VLSQRMVEQAAR-EKTE
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE9 KVSQPPGTTSFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVSLPE
:. . . . :: . :. .: :.
CCDS41 KIISAELQKAAANPDLQGHLPSFQQSAFNRVVSSVSSSPRQTMDYDDEETDSDEDIRETY
1300 1310 1320 1330 1340 1350
>--
initn: 496 init1: 366 opt: 403 Z-score: 350.3 bits: 77.7 E(32554): 3.4e-13
Smith-Waterman score: 497; 40.7% identity (67.5% similar) in 231 aa overlap (1341-1541:1440-1664)
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE9 TSFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTL
:.. ...::.: ..::.::: : :.... :
CCDS41 SQGSSTPRKQPRKSPLVPRSLEPPVLELSPGAKAQLEELMMVGDLLEVSLDETQHIWRIL
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1380 1390 1400 1410 1420
pF1KE9 LAKPSPAQQTDRSSPVRPSS---EKNDCCRGKRDGINSLERKLKRRLERE----GLSSER
: :.. :: . .. :: .:: .: :.: ::.::. : ....
CCDS41 QATHPPSE--DRFLHIMEDDSMEEKPLKVKGK----DSSEKKRKRKLEKVEQLFGEGKQK
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1430 1440 1450 1460
pF1KE9 WERVKKMRTPKKKKIKLS--HPKDMNNF--KL--ERERS----------YELVR-SAETH
...::: :.:::.::. . :..:.. :: :.::. :::. :.: .
CCDS41 SKELKKMDKPRKKKLKLGADKSKELNKLAKKLAKEEERKKKKEKAAAAKVELVKESTEKK
1530 1540 1550 1560 1570 1580
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KE9 ------SLPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGV
..:: ..: :.:.::.:.: : .: .: :.::::::::.:..:::::::::
CCDS41 REKKVLDIPSKYDWSGAEESDDENAVCAAQNCQRPCKDKVDWVQCDGGCDEWFHQVCVGV
1590 1600 1610 1620 1630 1640
1530 1540
pF1KE9 SPEMAEKEDYICVRCTVKDAPSRK
::::::.:::::. :. :..:
CCDS41 SPEMAENEDYICINCAKKQGPVSPGPAPPPSFIMSYKLPMEDLKETS
1650 1660 1670 1680 1690
>>CCDS55554.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1482 aa)
initn: 4253 init1: 2529 opt: 3442 Z-score: 3003.5 bits: 568.5 E(32554): 5.6e-161
Smith-Waterman score: 4205; 44.9% identity (69.1% similar) in 1555 aa overlap (20-1490:3-1468)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
:: ::::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS55 MEPG-CDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
:::.::: ::::::: .::...::::.:::::::::::::::.::::::.::.:::.:::
CCDS55 ICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
:.::::::::..:.: :. .:
CCDS55 PNVERKILDLYSLSKQ----------CN--------------------TH----------
110 120
190 200 210 220 230
pF1KE9 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAM-
:.. ...::::::::.:: :::::::. .:::::.. .
CCDS55 PFD-----------------NEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPEP
130 140 150 160
240 250 260 270
pF1KE9 ---NIKIEPEET-----------------TEARTHNLRRRMGCP-TPKCENEKEMKSSIK
.:. .:: .. . ....... :: : ..:. ....
CCDS55 TEEDIEKHPELKKLQIYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNVS
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 QEPIERKDYIVENEKEKPKSRSKKATNA-VDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHTF
. .... . : . :..... .: :.: .:. :...:.::.::::::.:: :
CCDS55 STLLKQHLSLEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHIF
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 CLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMP
::.::: ..:.: ::::::. ::..: ::::::::...:.:..::::::.:::::::::
CCDS55 CLLPPLPEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNMP
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 VHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDS
::::::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::: ..: .:::::.:: :
CCDS55 VHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYATS
350 360 370 380 390 400
460 470 480 490 500 510
pF1KE9 GWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPK
::::: :::..:::: ::.::: :::.::::::: ::.::::::::::::::::::::::
CCDS55 GWNLNVMPVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPK
410 420 430 440 450 460
520 530 540 550 560 570
pF1KE9 TWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGE
::::::. :::.::.::: :.:::: :::::::::::.:::::::.: ::: ::::::::
CCDS55 TWYGVPSLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGE
470 480 490 500 510 520
580 590 600 610 620 630
pF1KE9 FVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMA
::::::::::::::::.::::::::::.:::: ::::.:::: :.:::::::.:.:::::
CCDS55 FVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMA
530 540 550 560 570 580
640 650 660 670 680 690
pF1KE9 SKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKT
. ..::. .: .:.:.: ::...:. ::... . :: ..:: :::::::::::.::::
CCDS55 AFPETLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKT
590 600 610 620 630 640
700 710 720 730 740 750
pF1KE9 TCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNE
:::.::..: : :::: :...::.: . ::::::::.: :.. ::.::::..
CCDS55 TCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDT
650 660 670 680 690 700
760 770 780 790 800 810
pF1KE9 WALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQL
:: .: :::.. ..:.:. ..:: :.. ..::...::..:. ...: : . . :
CCDS55 WANKVRVALEVEDGRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGL
710 720 730 740 750 760
820 830 840 850 860 870
pF1KE9 LNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQ
..:. .:. . :::..::: .. :. .:::.. : .::.:..:: .: ...
CCDS55 VSGQV-ARMDT------PQLTLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAR
770 780 790 800 810
880 890 900 910 920 930
pF1KE9 KLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSL--TL
. :. : . :..::. . .. ::.:. ... ..:::.::.::.:: : ::. .:
CCDS55 EALATLPSSPGLLRSLLERGQQLGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQA-LAPSAHRGSL
820 830 840 850 860 870
940 950 960 970 980 990
pF1KE9 DDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVK
:. :. .:. .: .:.:: :.::::::..:.:..::. :.:: .: .: . ..
CCDS55 VIMQGLLVMGAKIASSPSVDKARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIR
880 890 900 910 920 930
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE9 EIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNS
: :.::..::: :::... .:. :. ::. .: : . : :: : ::. ::..:: :.
CCDS55 ETENIPVHLPNIQALKEALTKAQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEE
940 950 960 970 980 990
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE9 LPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRKQRKLKEPLPNG
: .:: : ...:.: : .::: .:: :.::::::: : : . ::. : ... : .
CCDS55 LRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRS-RWMEKAL-GL
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE9 KKKSTKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANEGKL--LSP--L
. .:.: .:: . .. .:..... :.. .: :.. .:: .: .: :.: .
CCDS55 YQCDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLM
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1180 1190 1200 1210
pF1KE9 QDVDIKICLCQKAPAA-PMIQCELCRDAFHTSCVAVPSI---------SQGLRIW-----
. .::.: ..::. ..::.::.: :: .::.:: . :. : :
CCDS55 ASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDWFHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDT
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE9 --LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGN
::: : ::..: :: :: ::..:::. ::::::.::. . ::...:: ::.. :.: .
CCDS55 KFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASED
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1280 1290 1300
pF1KE9 L--------KFVQD----------------------RVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKV
. .. :. : ::: :. : : . . ..:
CCDS55 VTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYTSATACDPIREGSGNNISKVQ---GLLENGDSV
1240 1250 1260 1270 1280
1310 1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE9 SQP----PGTTSFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVSL
..: :: : : . .: : : :: ... ..::.::..::.:.:
CCDS55 TSPENMAPGKGS-----DLELLSSLL--PQLTGPVLELPEAIRAPLEELMMEGDLLEVTL
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE9 PEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCC-RGKRDGINSLERKLKRRLEREGL
: . ..: : : : . :: .: : . .:.: .:::. .:. .:
CCDS55 DENHSIWQLLQAGQPP--DLDR---IRTLLELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGR
1350 1360 1370 1380 1390
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE9 SSERW-ERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHS--LPSDTSYSE
. : .. . . ... : . .. .... . .: .. . :: : .. . .
CCDS55 NVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSLQ
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KE9 QEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRCT
..:: .: ::..
CCDS55 HKDS-GSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL
1460 1470 1480
>>CCDS14794.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1539 aa)
initn: 4486 init1: 2529 opt: 3442 Z-score: 3003.3 bits: 568.5 E(32554): 5.8e-161
Smith-Waterman score: 4550; 46.5% identity (71.9% similar) in 1556 aa overlap (20-1490:3-1525)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
:: ::::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS14 MEPG-CDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
:::.::: ::::::: .::...::::.:::::::::::::::.::::::.::.:::.:::
CCDS14 ICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
:.::::::::..:.:.: ::::. ..::::.:...: .. . ::: .:: .:.:::::.
CCDS14 PNVERKILDLYSLSKIVIEEGGYEAICKDRRWARVAQRLHYPPGKNIGSLLRSHYERIIY
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE9 PYNLFLSG-DSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAM
::..: :: . ..: .: . ...::::::::.:: :::::::. .:::::.. .
CCDS14 PYEMFQSGANHVQCNTHP-FDNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270
pF1KE9 ----NIKIEPEET-----------------TEARTHNLRRRMGCP-TPKCENEKEMKSSI
.:. .:: .. . ....... :: : ..:. ...
CCDS14 PTEEDIEKHPELKKLQIYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNV
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 KQEPIERKDYIVENEKEKPKSRSKKATNA-VDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHT
.. .... . : . :..... .: :.: .:. :...:.::.::::::.::
CCDS14 SSTLLKQHLSLEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHI
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 FCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNM
:::.::: ..:.: ::::::. ::..: ::::::::...:.:..::::::.::::::::
CCDS14 FCLLPPLPEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNM
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 PVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLD
:::::::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::: ..: .:::::.::
CCDS14 PVHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKEYAT
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500 510
pF1KE9 SGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEP
:::::: :::..:::: ::.::: :::.::::::: ::.:::::::::::::::::::::
CCDS14 SGWNLNVMPVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEP
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE9 KTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAG
:::::::. :::.::.::: :.:::: :::::::::::.:::::::.: ::: :::::::
CCDS14 KTWYGVPSLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAG
530 540 550 560 570 580
580 590 600 610 620 630
pF1KE9 EFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKM
:::::::::::::::::.::::::::::.:::: ::::.:::: :.:::::::.:.::::
CCDS14 EFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKM
590 600 610 620 630 640
640 650 660 670 680 690
pF1KE9 ASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCK
:. ..::. .: .:.:.: ::...:. ::... . :: ..:: :::::::::::.:::
CCDS14 AAFPETLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCK
650 660 670 680 690 700
700 710 720 730 740 750
pF1KE9 TTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYN
::::.::..: : :::: :...::.: . ::::::::.: :.. ::.::::..
CCDS14 TTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFD
710 720 730 740 750 760
760 770 780 790 800 810
pF1KE9 EWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQ
:: .: :::.. ..:.:. ..:: :.. ..::...::..:. ...: : . .
CCDS14 TWANKVRVALEVEDGRKRSFEELRALESEARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLG
770 780 790 800 810 820
820 830 840 850 860 870
pF1KE9 LLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHS
:..:. .:. . :::..::: .. :. .:::.. : .::.:..:: .: ..
CCDS14 LVSGQV-ARMDT------PQLTLTELRVLLEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEA
830 840 850 860 870
880 890 900 910 920 930
pF1KE9 QKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSL--T
.. :. : . :..::. . .. ::.:. ... ..:::.::.::.:: : ::. .
CCDS14 REALATLPSSPGLLRSLLERGQQLGVEVPEAHQLQQQVEQAQWLDEVKQA-LAPSAHRGS
880 890 900 910 920 930
940 950 960 970 980 990
pF1KE9 LDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAV
: :. :. .:. .: .:.:: :.::::::..:.:..::. :.:: .: .: . .
CCDS14 LVIMQGLLVMGAKIASSPSVDKARAELQELLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAII
940 950 960 970 980 990
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE9 KEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLN
.: :.::..::: :::... .:. :. ::. .: : . : :: : ::. ::..:: :.
CCDS14 RETENIPVHLPNIQALKEALTKAQAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLE
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE9 SLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRKQRKLKEPLPN
: .:: : ...:.: : .::: .:: :.::::::: : : . ::. : ... : .
CCDS14 ELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRS-RWMEKAL-G
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE9 GKKKSTKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLANEGKL--LSP--
. .:.: .:: . .. .:..... :.. .: :.. .:: .: .: :.:
CCDS14 LYQCDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSL
1120 1130 1140 1150 1160
1180 1190 1200 1210
pF1KE9 LQDVDIKICLCQKAPAA-PMIQCELCRDAFHTSCVAVPSI---------SQGLRIW----
. . .::.: ..::. ..::.::.: :: .::.:: . :. : :
CCDS14 MASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDWFHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWD
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1220 1230 1240 1250 1260 1270
pF1KE9 ---LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSG
::: : ::..: :: :: ::..:::. ::::::.::. . ::...:: ::.. :.:
CCDS14 TKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASE
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1280 1290 1300
pF1KE9 NL--------KFVQD----------------------RVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNK
.. .. :. : ::: :. : : . . ..
CCDS14 DVTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYTSATACDPIREGSGNNISKVQ---GLLENGDS
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE9 VSQP----PGTTSFSLPDDWDNRTSYLHSPFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVS
:..: :: : : . .: : : :: ... ..::.::..::.:.
CCDS14 VTSPENMAPGKGS-----DLELLSSLL--PQLTGPVLELPEAIRAPLEELMMEGDLLEVT
1350 1360 1370 1380 1390
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE9 LPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCC-RGKRDGINSLERKLKRRLEREG
: : . ..: : : : . :: .: : . .:.: .:::. .:. .:
CCDS14 LDENHSIWQLLQAGQPP--DLDR---IRTLLELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQG
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE9 LSSERW-ERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHS--LPSDTSYS
. : .. . . ... : . .. .... . .: .. . :: : .. .
CCDS14 RNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREEEHYQEKADRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSL
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KE9 EQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRC
...:: .: ::..
CCDS14 QHKDS-GSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL
1520 1530
>>CCDS55417.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1379 aa)
initn: 4164 init1: 2583 opt: 3359 Z-score: 2931.5 bits: 555.0 E(32554): 5.8e-157
Smith-Waterman score: 4082; 46.5% identity (68.8% similar) in 1452 aa overlap (20-1384:3-1368)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
:: .:::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS55 MEPGS-DDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
:::.:::
CCDS55 ICKIRPPA----------------------------------------------------
50
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
.:.::::. ..::::.:...: .... ::: .:: .:.:::::.
CCDS55 ---------------IVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVY
60 70 80 90
190 200 210 220 230
pF1KE9 PYNLFLSGDSL-RCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAM
::... :: .: .: .: . .. ::::::::.:: :::::::. .:::::.. .
CCDS55 PYEMYQSGANLVQCNTRP-FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPE
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270
pF1KE9 NIKIEPEETTE-------------------ARTHNLRRR--MG--CPTPKCENEKEMKSS
. . :.. : :. ..::.. : :: : ..:. ..
CCDS55 PTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECP-PTVVVKEELGGD
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320
pF1KE9 IKQEPIERKDYIVENEK--EKPKSRSKKA-------TNA--VDLYVCLLCGSGNDEDRLL
.: : : .. .:. ..:. .: . .:: .. ::: .:. :...:.::
CCDS55 VKVESTSPKTFLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLL
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 LCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEM
:::::::.:: :::.::: ..::: ::::::. ::..: ::::::::.:.:::..::::
CCDS55 LCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEM
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 ADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKI
::.::.:::::::::::::::::::::::..::::::::::::: :::::::::: :.:
CCDS55 ADSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKR
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE9 KLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWS
.:.:::::: :::::: :::.::::: ::.::: :::.::::::: ::.::::::::::
CCDS55 HLTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWS
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE9 YSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHE
::::::::::::::::::. :::.::.:::::.:::: :::::::::::.:::::::.:
CCDS55 YSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHG
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 VPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYC
::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::: ::::.:::: :.:::
CCDS55 VPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYC
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KE9 VFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELL
::::.:.:::::. . ::. .:..:.:.: ::...:. ::... . :. ..:: ::::
CCDS55 VFSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELL
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KE9 PDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMM
:::::::.:::::::.::..: : :::: :...::.: . ::::::::.: :.
CCDS55 PDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAML
640 650 660 670 680 690
750 760 770 780 790 800
pF1KE9 NALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQ
. ::.::::.. :: .: :::.. ..:.:: ..:: :.. ..::...::..:. .
CCDS55 HKLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLS
700 710 720 730 740 750
810 820 830 840 850 860
pF1KE9 DAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDL
.:: :.: : :..:.. .: .: :.:..::: :. :. :::.. : .: .
CCDS55 EAEACVSRALGLVSGQEAGPHRVAGL----QMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGV
760 770 780 790 800
870 880 890 900 910 920
pF1KE9 LNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQ
:..:: .: .... :. : . ::.::. . .. ::.:. ... ..::::::.::..
CCDS55 LEQVEAYQAEAREALASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKR
810 820 830 840 850 860
930 940 950 960 970 980
pF1KE9 ACLDPSSL--TLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARP
. : ::. :: :: :. :...:: ::.::.:.::::::..:.:..::. :.::
CCDS55 T-LAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQ
870 880 890 900 910 920
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE9 RHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELV
.: .: . ..: :.::..::: :::... .:: :. ::. .: : . : :: : ::
CCDS55 KHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLV
930 940 950 960 970 980
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE9 TRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKR
. ::..:: :. : .:: : ...:.: : .::: .:: :.::::::: : : . ::
CCDS55 AVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKR
990 1000 1010 1020 1030 1040
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE9 KQRKLKEPLPNGKKKS-TKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLA
. : ... : : :: :.: .:: . .. .:..... :.. .: :.. .:: .
CCDS55 S-RWMEKEL--GLYKSDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRT
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1170 1180 1190 1200
pF1KE9 NEGKLLSPLQDVDI-----KICLCQKAPA-APMIQCELCRDAFHTSCVAVPSI-------
: .: ::: . . .::.: .. : : .::.::.: :: ::.:: .
CCDS55 NSAKP-SPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPN
1110 1120 1130 1140 1150
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 --SQGLRIW-------LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTV
:. : : ::: : ::..: :: :: ::..:::. ::::::.::. . ::..
CCDS55 PTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAI
1160 1170 1180 1190 1200 1210
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE9 NWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGT-----TSFSL
.:: ::.: :.: .. . :.. : .: :: : . : . .. ..
CCDS55 SWQGRARQALASEDVTALLGRLAE--LRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDM
1220 1230 1240 1250 1260 1270
1320 1330 1340 1350
pF1KE9 P------DDWDNRTSYLHSPFSTGR------SCIP-LHGVS---PE-----VNELLMEAQ
: .. :. :: . : : .: : : :: ..::.::..
CCDS55 PKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSDLELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGD
1280 1290 1300 1310 1320 1330
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE9 LLQVSLPEIQELYQTL-LAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGINSLERKLKRR
::.:.: : . . ..: . .: .: ::
CCDS55 LLEVTLDENHSIPESLDFCILTPRYCSDLSSWGPAPGVFPPW
1340 1350 1360 1370
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE9 LEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHSLPSDTS
>>CCDS65269.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1559 aa)
initn: 4574 init1: 2583 opt: 3359 Z-score: 2930.8 bits: 555.1 E(32554): 6.3e-157
Smith-Waterman score: 4675; 48.3% identity (72.0% similar) in 1558 aa overlap (20-1489:3-1528)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
:: .:::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS65 MEPGS-DDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
:::.::: ::::::: .::...::::::::::::::::::::.::::::.::.:::.:::
CCDS65 ICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
:.:::.::::..:.:.:.::::. ..::::.:...: .... ::: .:: .:.:::::.
CCDS65 PNVERRILDLYSLSKIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVY
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 PYNLFLSGDSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAMN
::... :: .: : .: . .. ::::::::.:: :::::::. .:::::.. .
CCDS65 PYEMYQSGANLVCNTRP-FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPEP
170 180 190 200 210 220
250 260 270
pF1KE9 IKIEPEETTE-------------------ARTHNLRRR--MG--CPTPKCENEKEMKSSI
. . :.. : :. ..::.. : :: : ..:. ...
CCDS65 TEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECP-PTVVVKEELGGDV
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KE9 KQEPIERKDYIVENEK--EKPKSRSKKA-------TNA--VDLYVCLLCGSGNDEDRLLL
: : : .. .:. ..:. .: . .:: .. ::: .:. :...:.:::
CCDS65 KVESTSPKTFLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLLL
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 CDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMA
::::::.:: :::.::: ..::: ::::::. ::..: ::::::::.:.:::..:::::
CCDS65 CDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEMA
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 DAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIK
:.::.:::::::::::::::::::::::..::::::::::::: :::::::::: :.: .
CCDS65 DSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKRH
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE9 LSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSY
:.:::::: :::::: :::.::::: ::.::: :::.::::::: ::.:::::::::::
CCDS65 LTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSY
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE9 SINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEV
:::::::::::::::::. :::.::.:::::.:::: :::::::::::.:::::::.: :
CCDS65 SINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGV
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 PVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYCV
:: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::: ::::.:::: :.::::
CCDS65 PVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYCV
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KE9 FSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELLP
:::.:.:::::. . ::. .:..:.:.: ::...:. ::... . :. ..:: :::::
CCDS65 FSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELLP
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730 740
pF1KE9 DDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMN
::::::.:::::::.::..: : :::: :...::.: . ::::::::.: :..
CCDS65 DDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAMLH
710 720 730 740 750 760
750 760 770 780 790 800
pF1KE9 ALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQD
::.::::.. :: .: :::.. ..:.:: ..:: :.. ..::...::..:. ..
CCDS65 KLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLSE
770 780 790 800 810 820
810 820 830 840 850 860
pF1KE9 AEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDLL
:: :.: : :..:.. .: .: :.:..::: :. :. :::.. : .: .:
CCDS65 AEACVSRALGLVSGQEAGPHRVAGL----QMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGVL
830 840 850 860 870
870 880 890 900 910 920
pF1KE9 NRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQA
..:: .: .... :. : . ::.::. . .. ::.:. ... ..::::::.::...
CCDS65 EQVEAYQAEAREALASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKRT
880 890 900 910 920 930
930 940 950 960 970 980
pF1KE9 CLDPSSL--TLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARPR
: ::. :: :: :. :...:: ::.::.:.::::::..:.:..::. :.:: .
CCDS65 -LAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQK
940 950 960 970 980 990
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE9 HSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELVT
: .: . ..: :.::..::: :::... .:: :. ::. .: : . : :: : ::.
CCDS65 HPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLVA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE9 RGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKRK
::..:: :. : .:: : ...:.: : .::: .:: :.::::::: : : . ::.
CCDS65 VGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKRS
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE9 QRKLKEPLPNGKKKS-TKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLAN
: ... : : :: :.: .:: . .. .:..... :.. .: :.. .:: .:
CCDS65 -RWMEKEL--GLYKSDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRTN
1120 1130 1140 1150 1160
1170 1180 1190 1200
pF1KE9 EGKLLSPLQDVDI-----KICLCQKAPA-APMIQCELCRDAFHTSCVAVPSI--------
.: ::: . . .::.: .. : : .::.::.: :: ::.:: .
CCDS65 SAKP-SPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPNP
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 -SQGLRIW-------LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTVN
:. : : ::: : ::..: :: :: ::..:::. ::::::.::. . ::...
CCDS65 TSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAIS
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE9 WQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGT-----TSFSLP
:: ::.: :.: .. . :.. : .: :: : . : . .. ..:
CCDS65 WQGRARQALASEDVTALLGRLAE--LRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDMP
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1320 1330 1340 1350
pF1KE9 ------DDWDNRTSYLH-SPF-STGR-------SCIP-LHGVS---PE-----VNELLME
.. :. :: . .: ..:. : .: : : :: ..::.::
CCDS65 KVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMME
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE9 AQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGINSLERKLKR
..::.:.: : . ..: : : : . :. ..:.. :.: .:::. .:
CCDS65 GDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKAERH----GSRARGRALERRRRR
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE9 RLEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHSLPSDT
...: : : . ... ::. .. : : . .. . :.: : . .:.
CCDS65 KVDRGG---EGDDPAREELEPKR--VRSSGP-EAEEVQEEEELEEETGGEGPPAPIPTTG
1470 1480 1490 1500 1510
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KE9 SYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYIC
: : : :..... ::
CCDS65 SPSTQ---ENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL
1520 1530 1540 1550
>>CCDS14351.1 KDM5C gene_id:8242|Hs108|chrX (1560 aa)
initn: 4556 init1: 2583 opt: 3359 Z-score: 2930.8 bits: 555.1 E(32554): 6.3e-157
Smith-Waterman score: 4667; 48.3% identity (72.0% similar) in 1559 aa overlap (20-1489:3-1529)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
:: .:::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS14 MEPGS-DDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
:::.::: ::::::: .::...::::::::::::::::::::.::::::.::.:::.:::
CCDS14 ICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
:.:::.::::..:.:.:.::::. ..::::.:...: .... ::: .:: .:.:::::.
CCDS14 PNVERRILDLYSLSKIVVEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPPGKNIGSLLRSHYERIVY
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE9 PYNLFLSGDSL-RCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAM
::... :: .: .: .: . .. ::::::::.:: :::::::. .:::::.. .
CCDS14 PYEMYQSGANLVQCNTRP-FDNEEKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFNSYGRRAKRLQPDPE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270
pF1KE9 NIKIEPEETTE-------------------ARTHNLRRR--MG--CPTPKCENEKEMKSS
. . :.. : :. ..::.. : :: : ..:. ..
CCDS14 PTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMMGLGLMAKDKTLRKKDKEGPECP-PTVVVKEELGGD
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320
pF1KE9 IKQEPIERKDYIVENEK--EKPKSRSKKA-------TNA--VDLYVCLLCGSGNDEDRLL
.: : : .. .:. ..:. .: . .:: .. ::: .:. :...:.::
CCDS14 VKVESTSPKTFLESKEELSHSPEPCTKMTMRLRRNHSNAQFIESYVCRMCSRGDEDDKLL
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KE9 LCDGCDDSYHTFCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEM
:::::::.:: :::.::: ..::: ::::::. ::..: ::::::::.:.:::..::::
CCDS14 LCDGCDDNYHIFCLLPPLPEIPKGVWRCPKCVMAECKRPPEAFGFEQATREYTLQSFGEM
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE9 ADAFKSDYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKI
::.::.:::::::::::::::::::::::..::::::::::::: :::::::::: :.:
CCDS14 ADSFKADYFNMPVHMVPTELVEKEFWRLVNSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSDSKR
410 420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KE9 KLSPEEEEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWS
.:.:::::: :::::: :::.::::: ::.::: :::.::::::: ::.::::::::::
CCDS14 HLTPEEEEYATSGWNLNVMPVLEQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWS
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KE9 YSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHE
::::::::::::::::::. :::.::.:::::.:::: :::::::::::.:::::::.:
CCDS14 YSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKKLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHG
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KE9 VPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGRQCVEHYRLLHRYC
::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::: ::::.:::: :.:::
CCDS14 VPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPAGRQCIEHYRRLRRYC
590 600 610 620 630 640
630 640 650 660 670 680
pF1KE9 VFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETVRKLGVIDSERMDFELL
::::.:.:::::. . ::. .:..:.:.: ::...:. ::... . :. ..:: ::::
CCDS14 VFSHEELICKMAACPEKLDLNLAAAVHKEMFIMVQEERRLRKALLEKGITEAEREAFELL
650 660 670 680 690 700
690 700 710 720 730 740
pF1KE9 PDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMM
:::::::.:::::::.::..: : :::: :...::.: . ::::::::.: :.
CCDS14 PDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKCSSSRQYLRYRYTLDELPAML
710 720 730 740 750 760
750 760 770 780 790 800
pF1KE9 NALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEESEMKKFPDNDLLRHLRLVTQ
. ::.::::.. :: .: :::.. ..:.:: ..:: :.. ..::...::..:. .
CCDS14 HKLKVRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSLEELRALESEARERRFPNSELLQQLKNCLS
770 780 790 800 810 820
810 820 830 840 850 860
pF1KE9 DAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQFVTQLYALPCVLSQTPLLKDL
.:: :.: : :..:.. .: .: :.:..::: :. :. :::.. : .: .
CCDS14 EAEACVSRALGLVSGQEAGPHRVAGL----QMTLTELRAFLDQMNNLPCAMHQIGDVKGV
830 840 850 860 870
870 880 890 900 910 920
pF1KE9 LNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELPQLAEMRIRLEQARWLEEVQQ
:..:: .: .... :. : . ::.::. . .. ::.:. ... ..::::::.::..
CCDS14 LEQVEAYQAEAREALASLPSSPGLLQSLLERGRQLGVEVPEAQQLQRQVEQARWLDEVKR
880 890 900 910 920 930
930 940 950 960 970 980
pF1KE9 ACLDPSSL--TLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQELLTVSEHWDDKAKSLLKARP
. : ::. :: :: :. :...:: ::.::.:.::::::..:.:..::. :.::
CCDS14 T-LAPSARRGTLAVMRGLLVAGASVAPSPAVDKAQAELQELLTIAERWEEKAHLCLEARQ
940 950 960 970 980 990
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE9 RHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQDVEGLQAGGRVPVLDTLIELV
.: .: . ..: :.::..::: :::... .:: :. ::. .: : . : :: : ::
CCDS14 KHPPATLEAIIREAENIPVHLPNIQALKEALAKARAWIADVDEIQNGDHYPCLDDLEGLV
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE9 TRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSPYSLLEVLCPRCDIGLLGLKR
. ::..:: :. : .:: : ...:.: : .::: .:: :.::::::: : : . ::
CCDS14 AVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSDSTKR
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE9 KQRKLKEPLPNGKKKS-TKLESLSDLERALTESKETASAMATLGEARLREMEALQSLRLA
. : ... : : :: :.: .:: . .. .:..... :.. .: :.. .:: .
CCDS14 S-RWMEKEL--GLYKSDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIVAFKEGEQKEKEGILQLRRT
1120 1130 1140 1150 1160
1170 1180 1190 1200
pF1KE9 NEGKLLSPLQDVDI-----KICLCQKAPA-APMIQCELCRDAFHTSCVAVPSI-------
: .: ::: . . .::.: .. : : .::.::.: :: ::.:: .
CCDS14 NSAKP-SPLASSSTASSTTSICVCGQVLAGAGALQCDLCQDWFHGRCVSVPRLLSSPRPN
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 --SQGLRIW-------LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRIRVRLPEGDALRYMIERTV
:. : : ::: : ::..: :: :: ::..:::. ::::::.::. . ::..
CCDS14 PTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRLPVRLPEGEALQCLTERAI
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE9 NWQHRAQQLLSSGNLKFVQDRVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQPPGT-----TSFSL
.:: ::.: :.: .. . :.. : .: :: : . : . .. ..
CCDS14 SWQGRARQALASEDVTALLGRLAE--LRQRLQAEPRPEEPPNYPAAPASDPLREGSGKDM
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1320 1330 1340 1350
pF1KE9 P------DDWDNRTSYLH-SPF-STGR-------SCIP-LHGVS---PE-----VNELLM
: .. :. :: . .: ..:. : .: : : :: ..::.:
CCDS14 PKVQGLLENGDSVTSPEKVAPEEGSGKRDLELLSSLLPQLTGPVLELPEATRAPLEELMM
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1360 1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE9 EAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRPSSEKNDCCRGKRDGINSLERKLK
:..::.:.: : . ..: : : : . :. ..:.. :.: .:::. .
CCDS14 EGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPPDLERIRTLLELEKAERH----GSRARGRALERRRR
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1420 1430 1440 1450 1460 1470
pF1KE9 RRLEREGLSSERWERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDMNNFKLERERSYELVRSAETHSLPSD
:...: : : . ... ::. .. : : . .. . :.: : . .:.
CCDS14 RKVDRGG---EGDDPAREELEPKR--VRSSGP-EAEEVQEEEELEEETGGEGPPAPIPTT
1470 1480 1490 1500 1510
1480 1490 1500 1510 1520 1530
pF1KE9 TSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQCDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYI
: : : :..... ::
CCDS14 GSPSTQ---ENQNGLEPAEGTTSGPSAPFSTLTPRLHLPCPQQPPQQQL
1520 1530 1540 1550 1560
>>CCDS55555.1 KDM5D gene_id:8284|Hs108|chrY (1570 aa)
initn: 3671 init1: 1714 opt: 2616 Z-score: 2282.2 bits: 435.1 E(32554): 8.4e-121
Smith-Waterman score: 4476; 45.6% identity (70.6% similar) in 1582 aa overlap (25-1490:7-1556)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MEAATTLHPGPRPALPLGGPGPLGEFLPPPECPVFEPSWEEFADPFAFIHKIRPIAEQTG
::::::::::::::: :: ::...: :::::::..:
CCDS55 MEPGCDEFLPPPECPVFEPSWAEFQDPLGYIAKIRPIAEKSG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 ICKVRPPPDWQPPFACDVDKLHFTPRIQRLNELEAQTRVKLNFLDQIAKYWELQGSTLKI
:::.::: ::::::: .::...::::.:::::::::::::::.::::::.::.:::.:::
CCDS55 ICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRVQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKI
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 PHVERKILDLFQLNKLVAEEGGFAVVCKDRKWTKIATKMGFAPGKAVGSHIRGHYERILN
:.::::::::..:.:.: ::::. ..::::.:...: .. . ::: .:: .:.:::::.
CCDS55 PNVERKILDLYSLSKIVIEEGGYEAICKDRRWARVAQRLHYPPGKNIGSLLRSHYERIIY
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KE9 PYNLFLSG-DSLRCLQKPNLTTDTKDKEYKPHDIPQRQSVQPSETCPPARRAKRMRAEAM
::..: :: . ..: .: . ...::::::::.:: :::::::. .:::::.. .
CCDS55 PYEMFQSGANHVQCNTHP-FDNEVKDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSSYSRRAKRLQPDPE
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270
pF1KE9 ----NIKIEPEET-----------------TEARTHNLRRRMGCP-TPKCENEKEMKSSI
.:. .:: .. . ....... :: : ..:. ...
CCDS55 PTEEDIEKHPELKKLQIYGPGPKMMGLGLMAKDKDKTVHKKVTCPPTVTVKDEQSGGGNV
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KE9 KQEPIERKDYIVENEKEKPKSRSKKATNA-VDLYVCLLCGSGNDEDRLLLCDGCDDSYHT
.. .... . : . :..... .: :.: .:. :...:.::.::::::.::
CCDS55 SSTLLKQHLSLEPCTKTTMQLRKNHSSAQFIDSYICQVCSRGDEDDKLLFCDGCDDNYHI
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 FCLIPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNM
:::.::: ..:.: ::::::. ::..: ::::::::...:.:..::::::.::::::::
CCDS55 FCLLPPLPEIPRGIWRCPKCILAECKQPPEAFGFEQATQEYSLQSFGEMADSFKSDYFNM
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 PVHMVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEE-----
:::::::::::::::::::.::::::::::::: :::::::::: ..: .:::::
CCDS55 PVHMVPTELVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVSNSKQNLSPEEKRQSL
410 420 430 440 450 460
460 470 480
pF1KE9 --------------------------EEYLDSGWNLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLP
.:: :::::: :::..:::: ::.::: :::.:
CCDS55 TVLTRLISSFWAQAVLPPWPPKVLGLQEYATSGWNLNVMPVLDQSVLCHINADISGMKVP
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 WLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQ
:::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::. :::.::.::: :.:::: ::
CCDS55 WLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEEVMKMLTPELFDSQ
530 540 550 560 570 580
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 PDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTV
:::::::::.:::::::.: ::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::.
CCDS55 PDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTA
590 600 610 620 630 640
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 DWLPLGRQCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKMASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKAL
:::: ::::.:::: :.:::::::.:.:::::. ..::. .: .:.:.: ::...:. :
CCDS55 DWLPAGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPETLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRL
650 660 670 680 690 700
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 RETVRKLGVIDSERMDFELLPDDERQCVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSC
:... . :: ..:: :::::::::::.:::::::.::..: : :::: :...::.:
CCDS55 RKALLEKGVTEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDGLVCLSHINDLCKC
710 720 730 740 750 760
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 PPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLRAESYNEWALNVNEALEAKINKKKSLVSFKALIEE
. ::::::::.: :.. ::.::::.. :: .: :::.. ..:.:. ..:: :
CCDS55 SSSRQYLRYRYTLDELPTMLHKLKIRAESFDTWANKVRVALEVEDGRKRSFEELRALESE
770 780 790 800 810 820
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 SEMKKFPDNDLLRHLRLVTQDAEKCASVAQQLLNGKRQTRYRSGGGKSQNQLTVNELRQF
.. ..::...::..:. ...: : . . :..:. .:. . :::..::: .
CCDS55 ARERRFPNSELLQRLKNCLSEVEACIAQVLGLVSGQV-ARMDTP------QLTLTELRVL
830 840 850 860 870
850 860 870 880 890 900
pF1KE9 VTQLYALPCVLSQTPLLKDLLNRVEDFQQHSQKLLSEETPSAAELQDLLDVSFEFDVELP
. :. .:::.. : .::.:..:: .: .... :. : . :..::. . .. ::.:
CCDS55 LEQMGSLPCAMHQIGDVKDVLEQVEAYQAEAREALATLPSSPGLLRSLLERGQQLGVEVP
880 890 900 910 920 930
910 920 930 940 950 960
pF1KE9 QLAEMRIRLEQARWLEEVQQACLDPSSL--TLDDMRRLIDLGVGLAPYSAVEKAMARLQE
. ... ..:::.::.::.:: : ::. .: :. :. .:. .: .:.:: :.:::
CCDS55 EAHQLQQQVEQAQWLDEVKQA-LAPSAHRGSLVIMQGLLVMGAKIASSPSVDKARAELQE
940 950 960 970 980 990
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE9 LLTVSEHWDDKAKSLLKARPRHSLNSLATAVKEIEEIPAYLPNGAALKDSVQRARDWLQD
:::..:.:..::. :.:: .: .: . ..: :.::..::: :::... .:. :. :
CCDS55 LLTIAERWEEKAHFCLEARQKHPPATLEAIIRETENIPVHLPNIQALKEALTKAQAWIAD
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE9 VEGLQAGGRVPVLDTLIELVTRGRSIPVHLNSLPRLETLVAEVQAWKECAVNTFLTENSP
:. .: : . : :: : ::. ::..:: :. : .:: : ...:.: : .::: .::
CCDS55 VDEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVGLEELRQLELQVLTAHSWREKASKTFLKKNSC
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE9 YSLLEVLCPRCDIGLLGLKRKQRKLKEPLPNGKKKSTKLESLSDLERALTESKETASAMA
:.::::::: : : . ::. : ... : . . .:.: .:: . .. .:...
CCDS55 YTLLEVLCPCADAGSDSTKRS-RWMEKAL-GLYQCDTELLGLSA-----QDLRDPGSVIV
1120 1130 1140 1150 1160
1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE9 TLGEARLREMEALQSLRLANEGKL--LSP--LQDVDIKICLCQKAPAA-PMIQCELCRDA
.. :.. .: :.. .:: .: .: :.: . . .::.: ..::. ..::.::.:
CCDS55 AFKEGEQKEKEGILQLRRTNSAKPSPLAPSLMASSPTSICVCGQVPAGVGVLQCDLCQDW
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1200 1210 1220 1230 1240
pF1KE9 FHTSCVAVPSI---------SQGLRIW-------LCPHCRRSEKPPLEKILPLLASLQRI
:: .::.:: . :. : : ::: : ::..: :: :: ::..:::.
CCDS55 FHGQCVSVPHLLTSPKPSLTSSPLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILALLVALQRL
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1250 1260 1270 1280
pF1KE9 RVRLPEGDALRYMIERTVNWQHRAQQLLSSGNL--------KFVQD--------------
::::::.::. . ::...:: ::.. :.: .. .. :.
CCDS55 PVRLPEGEALQCLTERAIGWQDRARKALASEDVTALLRQLAELRQQLQAKPRPEEASVYT
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1290 1300 1310 1320
pF1KE9 --------RVGSGLLYSRWQASAGQVSDTNKVSQP----PGTTSFSLPDDWDNRTSYLHS
: ::: :. : : . . ..:..: :: : : . .: :
CCDS55 SATACDPIREGSGNNISKVQ---GLLENGDSVTSPENMAPGKGS-----DLELLSSLL--
1350 1360 1370 1380 1390
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE9 PFSTGRSCIPLHGVSPEVNELLMEAQLLQVSLPEIQELYQTLLAKPSPAQQTDRSSPVRP
: :: ... ..::.::..::.:.: : . ..: : : : . :: .:
CCDS55 PQLTGPVLELPEAIRAPLEELMMEGDLLEVTLDENHSIWQLLQAGQPP--DLDR---IRT
1400 1410 1420 1430 1440 1450
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE9 SSEKNDCC-RGKRDGINSLERKLKRRLEREGLSSERW-ERVKKMRTPKKKKIKLSHPKDM
: . .:.: .:::. .:. .: . : .. . . ... : . ..
CCDS55 LLELEKFEHQGSRTRSRALERRRRRQKVDQGRNVENLVQQELQSKRARSSGIMSQVGREE
1460 1470 1480 1490 1500 1510
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE9 NNFKLERERSYELVRSAETHS--LPSDTSYSEQEDSEDEDAICPAVSCLQPEGDEVDWVQ
.... . .: .. . :: : .. . ...:: .: ::..
CCDS55 EHYQEKADRENMFLTPSTDHSPFLKGNQNSLQHKDS-GSSAACPSLMPLLQLSYSDEQQL
1520 1530 1540 1550 1560 1570
1510 1520 1530 1540
pF1KE9 CDGSCNQWFHQVCVGVSPEMAEKEDYICVRCTVKDAPSRK
>>CCDS44713.1 KDM4E gene_id:390245|Hs108|chr11 (506 aa)
initn: 485 init1: 418 opt: 450 Z-score: 398.5 bits: 84.9 E(32554): 7.1e-16
Smith-Waterman score: 452; 30.5% identity (55.0% similar) in 331 aa overlap (370-692:83-381)
340 350 360 370 380 390
pF1KE9 IPPLHDVPKGDWRCPKCLAQECSKPQEAFGFEQAARDYTLRTFGEMADAFKSDYFNMPVH
: : . :.. .: .. : :
CCDS44 EWKARQMYDDIEDILIATPLQQVTSGQGGVFTQYHKKKKAMRVGQYRRLANSKKYQTPPH
60 70 80 90 100 110
400 410 420 430 440 450
pF1KE9 MVPTELVEKEFWRLVSTIEEDVTVEYGADIASKEFGSGFPVRDGKIKLSPEEEEYLDSGW
. ..: :...:. . . . :::::. :: : :: . :
CCDS44 QNFADL-EQRYWK---SHPGNPPI-YGADIS----GSLF-----------EEST---KQW
120 130 140
460 470 480 490 500 510
pF1KE9 NLNNMPVMEQSVLAHITADICGMKLPWLYVGMCFSSFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTW
::... .. . . . . : :.. :.:: :: ..: :: :: :::::::.::::::
CCDS44 NLGHLGTILDLLEQECGVVIEGVNTPYLYFGMWKTTFAWHTEDMDLYSINYLHFGEPKTW
150 160 170 180 190 200
520 530 540 550 560 570
pF1KE9 YGVPGYAAEQLENVMKKLAPELFVSQPDLLHQLVTIMNPNTLMTHEVPVYRTNQCAGEFV
: :: ...:: . ..: :.. . .:.. :....:..: . .: .: ::::.
CCDS44 YVVPPEHGQHLERLARELFPDISRGCEAFLRHKVALISPTVLKENGIPFNCMTQEAGEFM
210 220 230 240 250 260
580 590 600 610 620 630
pF1KE9 ITFPRAYHSGFNQGFNFAEAVNFCTVDWLPLGR---QCVEHYRLLHRYCVFSHDEMICKM
.::: .::.:::.::: :::.:: : :. :. :: . .:: : .. .
CCDS44 VTFPYGYHAGFNHGFNCAEAINFATPRWIDYGKMASQCSCGESTV----TFSMDPFVRIV
270 280 290 300 310 320
640 650 660 670 680 690
pF1KE9 ASKADVLDVVVASTVQKDMAIMIEDEKALRETV-----RKLGVIDSERMDFELLPDDERQ
.. : ..:.::. . : . :. : :. . ..:::. :
CCDS44 QPESYEL-----WKHRQDLAIVEHTEPRVAESQELSNWRDDIVLRRAALGLRLLPNLTAQ
330 340 350 360 370 380
700 710 720 730 740 750
pF1KE9 CVKCKTTCFMSAISCSCKPGLLVCLHHVKELCSCPPYKYKLRYRYTLDDLYPMMNALKLR
:
CCDS44 CPTQPVSSGHCYNPKGCGTDAVPGSAFQSSAYHTQTQSLTLGMSARVLLPSTGSWGSGRG
390 400 410 420 430 440
1544 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 19:19:33 2016 done: Sat Nov 5 19:19:34 2016
Total Scan time: 5.840 Total Display time: 0.860
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]