Result of FASTA (ccds) for
pF1KE6787
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6787, 691 aa
1>>>pF1KE6787 691 - 691 aa - 691 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8518+/-0.000983; mu= 16.4003+/- 0.059
mean_var=65.9002+/-13.175, 0's: 0 Z-trim(103.9): 34 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.157990
statistics sampled from 7625 (7656) to 7625 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16
Scan time: 2.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44362.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 ( 691) 4534 1042.8 0
CCDS60493.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 ( 690) 4515 1038.4 0
CCDS60494.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 ( 557) 3632 837.2 0
CCDS7124.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 ( 654) 3142 725.5 6e-209
CCDS43782.1 SLC39A4 gene_id:55630|Hs108|chr8 ( 622) 950 225.9 1.4e-58
CCDS6424.1 SLC39A4 gene_id:55630|Hs108|chr8 ( 647) 950 225.9 1.5e-58
CCDS3656.1 SLC39A8 gene_id:64116|Hs108|chr4 ( 460) 605 147.2 5.1e-35
CCDS8912.2 SLC39A5 gene_id:283375|Hs108|chr12 ( 540) 599 145.8 1.5e-34
CCDS47117.1 SLC39A8 gene_id:64116|Hs108|chr4 ( 444) 554 135.6 1.6e-31
CCDS33353.1 SLC39A10 gene_id:57181|Hs108|chr2 ( 831) 541 132.7 2.2e-30
CCDS42428.1 SLC39A6 gene_id:25800|Hs108|chr18 ( 755) 521 128.1 4.7e-29
CCDS6030.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 ( 492) 481 118.9 1.8e-26
CCDS47823.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 ( 492) 481 118.9 1.8e-26
CCDS47822.1 SLC39A14 gene_id:23516|Hs108|chr8 ( 481) 421 105.2 2.2e-22
CCDS45854.1 SLC39A6 gene_id:25800|Hs108|chr18 ( 433) 420 105.0 2.4e-22
CCDS43453.1 SLC39A7 gene_id:7922|Hs108|chr6 ( 469) 382 96.4 1e-19
CCDS7934.1 SLC39A13 gene_id:91252|Hs108|chr11 ( 364) 308 79.5 9.8e-15
>>CCDS44362.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 (691 aa)
initn: 4534 init1: 4534 opt: 4534 Z-score: 5579.1 bits: 1042.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4534; 100.0% identity (100.0% similar) in 691 aa overlap (1-691:1-691)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCFRTKLSVSWVPLFLLLSRVFSTETDKPSAQDSRSRGSSGQPADLLQVLSAGDHPPHNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MCFRTKLSVSWVPLFLLLSRVFSTETDKPSAQDSRSRGSSGQPADLLQVLSAGDHPPHNH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SRSLIKTLLEKTGCPRRRNGMQGDCNLCFEPDALLLIAGGNFEDQLREEVVQRVSLLLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SRSLIKTLLEKTGCPRRRNGMQGDCNLCFEPDALLLIAGGNFEDQLREEVVQRVSLLLLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YIIHQEEICSSKLNMSNKEYKFYLHSLLSLRQDEDSSFLSQNETEDILAFTRQYFDTSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YIIHQEEICSSKLNMSNKEYKFYLHSLLSLRQDEDSSFLSQNETEDILAFTRQYFDTSQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 QCMETKTLQKKSGIVSSEGANESTLPQLAAMIITLSLQGVCLGQGNLPSPDYFTEYIFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QCMETKTLQKKSGIVSSEGANESTLPQLAAMIITLSLQGVCLGQGNLPSPDYFTEYIFSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LNRTNTLRLSELDQLLNTLWTRSTCIKNEKIHQFQRKQNNIITHDQDYSNFSSSMEKESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LNRTNTLRLSELDQLLNTLWTRSTCIKNEKIHQFQRKQNNIITHDQDYSNFSSSMEKESE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 DGPVSWDQTCFSARQLVEIFLQKGLSLISKEDFKQMSPGIIQQLLSCSCHLPKDQQAKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DGPVSWDQTCFSARQLVEIFLQKGLSLISKEDFKQMSPGIIQQLLSCSCHLPKDQQAKLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 PTTLEKYGYSTVAVTLLTLGSMLGTALVLFHSCEENYRLILQLFVGLAVGTLSGDALLHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PTTLEKYGYSTVAVTLLTLGSMLGTALVLFHSCEENYRLILQLFVGLAVGTLSGDALLHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 IPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGHIWKLMGLIGGIHGFFLIEKCFILLVSPNDKQGLSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGHIWKLMGLIGGIHGFFLIEKCFILLVSPNDKQGLSLV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 NGHVGHSHHLALNSELSDQAGRGKSASTIQLKSPEDSQAAEMPIGSMTASNRKCKAISLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NGHVGHSHHLALNSELSDQAGRGKSASTIQLKSPEDSQAAEMPIGSMTASNRKCKAISLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 AIMILVGDSLHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPHEMGDFAVLLSSGLSMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AIMILVGDSLHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPHEMGDFAVLLSSGLSMK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 TAILMNFISSLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMTHVQTQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TAILMNFISSLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMTHVQTQR
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE6 PWMMFLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PWMMFLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
670 680 690
>>CCDS60493.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 (690 aa)
initn: 3140 init1: 3140 opt: 4515 Z-score: 5555.8 bits: 1038.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4515; 99.9% identity (99.9% similar) in 691 aa overlap (1-691:1-690)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCFRTKLSVSWVPLFLLLSRVFSTETDKPSAQDSRSRGSSGQPADLLQVLSAGDHPPHNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MCFRTKLSVSWVPLFLLLSRVFSTETDKPSAQDSRSRGSSGQPADLLQVLSAGDHPPHNH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SRSLIKTLLEKTGCPRRRNGMQGDCNLCFEPDALLLIAGGNFEDQLREEVVQRVSLLLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SRSLIKTLLEKTGCPRRRNGMQGDCNLCFEPDALLLIAGGNFEDQLREEVVQRVSLLLLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YIIHQEEICSSKLNMSNKEYKFYLHSLLSLRQDEDSSFLSQNETEDILAFTRQYFDTSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 YIIHQEEICSSKLNMSNKEYKFYLHSLLSLRQDEDSSFLSQNETEDILAFTRQYFDTSQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 QCMETKTLQKKSGIVSSEGANESTLPQLAAMIITLSLQGVCLGQGNLPSPDYFTEYIFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QCMETKTLQKKSGIVSSEGANESTLPQLAAMIITLSLQGVCLGQGNLPSPDYFTEYIFSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LNRTNTLRLSELDQLLNTLWTRSTCIKNEKIHQFQRKQNNIITHDQDYSNFSSSMEKESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LNRTNTLRLSELDQLLNTLWTRSTCIKNEKIHQFQRKQNNIITHDQDYSNFSSSMEKESE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 DGPVSWDQTCFSARQLVEIFLQKGLSLISKEDFKQMSPGIIQQLLSCSCHLPKDQQAKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DGPVSWDQTCFSARQLVEIFLQKGLSLISKEDFKQMSPGIIQQLLSCSCHLPKDQQAKLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 PTTLEKYGYSTVAVTLLTLGSMLGTALVLFHSCEENYRLILQLFVGLAVGTLSGDALLHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PTTLEKYGYSTVAVTLLTLGSMLGTALVLFHSCEENYRLILQLFVGLAVGTLSGDALLHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 IPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGHIWKLMGLIGGIHGFFLIEKCFILLVSPNDKQGLSLV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
CCDS60 IPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGHIWKLMGLIGGIHGFFLIEKCFILLVSPNDK-GLSLV
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 NGHVGHSHHLALNSELSDQAGRGKSASTIQLKSPEDSQAAEMPIGSMTASNRKCKAISLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 NGHVGHSHHLALNSELSDQAGRGKSASTIQLKSPEDSQAAEMPIGSMTASNRKCKAISLL
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 AIMILVGDSLHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPHEMGDFAVLLSSGLSMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AIMILVGDSLHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPHEMGDFAVLLSSGLSMK
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 TAILMNFISSLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMTHVQTQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 TAILMNFISSLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMTHVQTQR
600 610 620 630 640 650
670 680 690
pF1KE6 PWMMFLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 PWMMFLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
660 670 680 690
>>CCDS60494.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 (557 aa)
initn: 3632 init1: 3632 opt: 3632 Z-score: 4469.6 bits: 837.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3632; 100.0% identity (100.0% similar) in 557 aa overlap (135-691:1-557)
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 QLREEVVQRVSLLLLYYIIHQEEICSSKLNMSNKEYKFYLHSLLSLRQDEDSSFLSQNET
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MSNKEYKFYLHSLLSLRQDEDSSFLSQNET
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 EDILAFTRQYFDTSQSQCMETKTLQKKSGIVSSEGANESTLPQLAAMIITLSLQGVCLGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EDILAFTRQYFDTSQSQCMETKTLQKKSGIVSSEGANESTLPQLAAMIITLSLQGVCLGQ
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 GNLPSPDYFTEYIFSSLNRTNTLRLSELDQLLNTLWTRSTCIKNEKIHQFQRKQNNIITH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GNLPSPDYFTEYIFSSLNRTNTLRLSELDQLLNTLWTRSTCIKNEKIHQFQRKQNNIITH
100 110 120 130 140 150
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 DQDYSNFSSSMEKESEDGPVSWDQTCFSARQLVEIFLQKGLSLISKEDFKQMSPGIIQQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 DQDYSNFSSSMEKESEDGPVSWDQTCFSARQLVEIFLQKGLSLISKEDFKQMSPGIIQQL
160 170 180 190 200 210
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 LSCSCHLPKDQQAKLPPTTLEKYGYSTVAVTLLTLGSMLGTALVLFHSCEENYRLILQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 LSCSCHLPKDQQAKLPPTTLEKYGYSTVAVTLLTLGSMLGTALVLFHSCEENYRLILQLF
220 230 240 250 260 270
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 VGLAVGTLSGDALLHLIPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGHIWKLMGLIGGIHGFFLIEKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 VGLAVGTLSGDALLHLIPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGHIWKLMGLIGGIHGFFLIEKC
280 290 300 310 320 330
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 FILLVSPNDKQGLSLVNGHVGHSHHLALNSELSDQAGRGKSASTIQLKSPEDSQAAEMPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 FILLVSPNDKQGLSLVNGHVGHSHHLALNSELSDQAGRGKSASTIQLKSPEDSQAAEMPI
340 350 360 370 380 390
530 540 550 560 570 580
pF1KE6 GSMTASNRKCKAISLLAIMILVGDSLHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 GSMTASNRKCKAISLLAIMILVGDSLHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPH
400 410 420 430 440 450
590 600 610 620 630 640
pF1KE6 EMGDFAVLLSSGLSMKTAILMNFISSLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EMGDFAVLLSSGLSMKTAILMNFISSLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYL
460 470 480 490 500 510
650 660 670 680 690
pF1KE6 SLVEMLPEMTHVQTQRPWMMFLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 SLVEMLPEMTHVQTQRPWMMFLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
520 530 540 550
>>CCDS7124.1 SLC39A12 gene_id:221074|Hs108|chr10 (654 aa)
initn: 3142 init1: 3142 opt: 3142 Z-score: 3864.8 bits: 725.5 E(32554): 6e-209
Smith-Waterman score: 4213; 94.6% identity (94.6% similar) in 691 aa overlap (1-691:1-654)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MCFRTKLSVSWVPLFLLLSRVFSTETDKPSAQDSRSRGSSGQPADLLQVLSAGDHPPHNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 MCFRTKLSVSWVPLFLLLSRVFSTETDKPSAQDSRSRGSSGQPADLLQVLSAGDHPPHNH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 SRSLIKTLLEKTGCPRRRNGMQGDCNLCFEPDALLLIAGGNFEDQLREEVVQRVSLLLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 SRSLIKTLLEKTGCPRRRNGMQGDCNLCFEPDALLLIAGGNFEDQLREEVVQRVSLLLLY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 YIIHQEEICSSKLNMSNKEYKFYLHSLLSLRQDEDSSFLSQNETEDILAFTRQYFDTSQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 YIIHQEEICSSKLNMSNKEYKFYLHSLLSLRQDEDSSFLSQNETEDILAFTRQYFDTSQS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 QCMETKTLQKKSGIVSSEGANESTLPQLAAMIITLSLQGVCLGQGNLPSPDYFTEYIFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 QCMETKTLQKKSGIVSSEGANESTLPQLAAMIITLSLQGVCLGQGNLPSPDYFTEYIFSS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 LNRTNTLRLSELDQLLNTLWTRSTCIKNEKIHQFQRKQNNIITHDQDYSNFSSSMEKESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 LNRTNTLRLSELDQLLNTLWTRSTCIKNEKIHQFQRKQNNIITHDQDYSNFSSSMEKESE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 DGPVSWDQTCFSARQLVEIFLQKGLSLISKEDFKQMSPGIIQQLLSCSCHLPKDQQAKLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 DGPVSWDQTCFSARQLVEIFLQKGLSLISKEDFKQMSPGIIQQLLSCSCHLPKDQQAKLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 PTTLEKYGYSTVAVTLLTLGSMLGTALVLFHSCEENYRLILQLFVGLAVGTLSGDALLHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 PTTLEKYGYSTVAVTLLTLGSMLGTALVLFHSCEENYRLILQLFVGLAVGTLSGDALLHL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 IPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGHIWKLMGLIGGIHGFFLIEKCFILLVSPNDKQGLSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 IPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGHIWKLMGLIGGIHGFFLIEKCFILLVSPNDK------
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 NGHVGHSHHLALNSELSDQAGRGKSASTIQLKSPEDSQAAEMPIGSMTASNRKCKAISLL
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 -------------------------------KSPEDSQAAEMPIGSMTASNRKCKAISLL
480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 AIMILVGDSLHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPHEMGDFAVLLSSGLSMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 AIMILVGDSLHNFADGLAIGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPHEMGDFAVLLSSGLSMK
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KE6 TAILMNFISSLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMTHVQTQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 TAILMNFISSLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMTHVQTQR
570 580 590 600 610 620
670 680 690
pF1KE6 PWMMFLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS71 PWMMFLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
630 640 650
>>CCDS43782.1 SLC39A4 gene_id:55630|Hs108|chr8 (622 aa)
initn: 1029 init1: 597 opt: 950 Z-score: 1165.0 bits: 225.9 E(32554): 1.4e-58
Smith-Waterman score: 1005; 35.1% identity (64.7% similar) in 521 aa overlap (177-689:130-620)
150 160 170 180 190 200
pF1KE6 LLSLRQDEDSSFLSQNETEDILAFTRQYFDTSQSQCMETKTLQKKSGIVSSEGANESTLP
: . :.. : ... . :: :.
CCDS43 HLLALLESPKALTPGLSWLLQRMQARAAGQTPKMACVDIPQLLEEA---VGAGAPGSAGG
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE6 QLAAMIITLSLQGVCLGQGNLPSPDYFTEYIFSSLNRTNTLRLSELDQLLNTLWTRSTCI
:::.. . .: :. ::::.::....:.. . . :.::. :.. : .
CCDS43 VLAALLDHVR-SGSCFHA--LPSPQYFVDFVFQQHSSEVPMTLAELSALMQRLGV-----
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... :. . ... . . .::: .. :: .:.:::... . . .
CCDS43 -GREAHSDHSHRHRGASSRDPVPLISSS------NSSSVWDTVCLSARDVMAAYGLSEQA
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330 340 350 360 370 380
pF1KE6 LISKEDFKQMSPGIIQQLLSCSCHLPKDQQAKLPPTTLEKYGYSTVAVTLLTLGSMLGTA
.. : . :.::...:: :: .: . .. . :.: :...:. :. : ...:
CCDS43 GVTPEAWAQLSPALLQQQLSGACTSQSRPPVQDQLSQSERYLYGSLATLLICLCAVFGLL
270 280 290 300 310 320
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pF1KE6 LVLFHSCEENYRLILQLFVGLAVGTLSGDALLHLIPQVLGLHKQEAPEFGHFHESKGHIW
:. .:. . ::: :..::::...:::.::: :.::::: . : : : :
CCDS43 LLTCTGCRGVTHYILQTFLSLAVGAVTGDAVLHLTPKVLGLHTH--SEEGL---SPQPTW
330 340 350 360 370
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pF1KE6 KLMGLIGGIHGFFLIEKCFILLVSPNDKQGLSLVNGHVGHSHHLALNSELSDQAGRGKSA
.:.....:...:::.:. : ::. : : . : .: ::: : :. . . : . .
CCDS43 RLLAMLAGLYAFFLFENLFNLLL-PRDPEDLE--DGPCGHSSH----SHGGHSHGVSLQL
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pF1KE6 STIQLKSPE--------DSQAAEMPIGSMTASNRKCKAISLLAIMILVGDSLHNFADGLA
. .:..:. : : : : : . :: :: .::..::::::::
CCDS43 APSELRQPKPPHEGSRADLVAEESPELLNPEPRRLSPELRLLPYMITLGDAVHNFADGLA
430 440 450 460 470 480
560 570 580 590 600 610
pF1KE6 IGAAFSSSSESGVTTTIAILCHEIPHEMGDFAVLLSSGLSMKTAILMNFISSLTAFMGLY
.::::.:: ..:..:..:..:::.:::.::::.:: .:::.. :.:.:. :.:::: :::
CCDS43 VGAAFASSWKTGLATSLAVFCHELPHELGDFAALLHAGLSVRQALLLNLASALTAFAGLY
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pF1KE6 IGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMTHVQTQRPWMMFLLQNFGLILGWLS
..:.:... . ::..:..:.:::..: .::: : .:. :::..:::.: ::. ::
CCDS43 VALAVGVSEESEAWILAVATGLFLYVALCDMLPAMLKVRDPRPWLLFLLHNVGLLGGWTV
550 560 570 580 590 600
680 690
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::::..::..:
CCDS43 LLLLSLYEDDITF
610 620
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... :: ::..:..:. ... . :..:
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pF1KE6 LLEKTGCPRRRNGMQGDCNLCFEPDALLL--IAGGNFEDQ--LREEVVQRVSLLLLYYII
: ... : :: : : : : ::: : :... :. . : :.: . :.
CCDS64 LADRVHCA---NGPCGKC-LSVE-DALGLGEPEGSGLPPGPVLEARYVARLSAAAVLYLS
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. : : . . .: .:: :. . :. . . . . .: .: . :
CCDS64 NPEGTCEDARAGLWASHADHLLALL-----ESPKALTPGLSWLLQRMQARAAGQTPKMAC
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.. : ... . :: :. :::.. . .: :. ::::.::....:.. .
CCDS64 VDIPQLLEEA---VGAGAPGSAGGVLAALLDHVR-SGSCFH--ALPSPQYFVDFVFQQHS
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. :.::. :.. : . ... :. . ... . . .::: ..
CCDS64 SEVPMTLAELSALMQRLGV------GREAHSDHSHRHRGASSRDPVPLISSS------NS
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:: .:.:::... . . . .. : . :.::...:: :: .: . .. .
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:.: :...:. :. : ...: :. .:. . ::: :..::::...:::.::: :
CCDS64 QSERYLYGSLATLLICLCAVFGLLLLTCTGCRGVTHYILQTFLSLAVGAVTGDAVLHLTP
330 340 350 360 370 380
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.::::: . : : : :.:.....:...:::.:. : ::. : : . : .:
CCDS64 KVLGLHTHS--EEGL---SPQPTWRLLAMLAGLYAFFLFENLFNLLL-PRDPEDLE--DG
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::: : :. . . : . . . .:..:. : : : : :
CCDS64 PCGHSSH----SHGGHSHGVSLQLAPSELRQPKPPHEGSRADLVAEESPELLNPEPRRLS
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. :: :: .::..::::::::.::::.:: ..:..:..:..:::.:::.::::.::
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pF1KE6 SGLSMKTAILMNFISSLTAFMGLYIGLSVSADPCVQDWIFTVTAGMFLYLSLVEMLPEMT
.:::.. :.:.:. :.:::: :::..:.:... . ::..:..:.:::..: .::: :
CCDS64 AGLSVRQALLLNLASALTAFAGLYVALAVGVSEESEAWILAVATGLFLYVALCDMLPAML
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CCDS64 KVRDPRPWLLFLLHNVGLLGGWTVLLLLSLYEDDITF
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: ... :. ..... : .:.. . : . .. : . :. .: :: . :.
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:::: :::::::. . : .:..:.:::::.:.:::.:::..::..:.: . :.:.::.:
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. . ..:: .:. :. . . . ::....:::::.::..:.:::. . .. .
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.:..:: :.. :. ..::...: .:..
CCDS36 FFMIQNAGMLTGFTAILLITLYAGEIELE
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.. :... ::. : . . .. ..: .
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:... :. : : : :: : :..:: ::.: : : . :.: .
CCDS89 CPALLYQIDSRVC---IGAPAPAPPGDLLSALLQSALAVLLLSLPSPL-SLLLLRLLGPR
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: .: .. .:::::: :::::::.: : ::. . : . . ....::.
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.:..:. . :: ..:: . . .. :... :. . : : . . .: .:
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: .:: : : : . :. . .. . .. :.:.::.:::..:::::::::
CCDS89 EPGAQGQREKNSQHPPALAPPGHQGHSHGH-QGGTDITWMVLLGDGLHNLTDGLAIGAAF
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:.. ::..::.:..:::.:::.::::.::.::::.. .:....:. .. : .:...
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: : . :.: ::::.:::..::.::: . . : :::..::.:: .: .
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.. :. .
CCDS89 TLLEERLLPVTTEG
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CCDS47 CYANPAVTEANGH-IHFDNVSVVSLQDGK--KEPSSCTCLKGPKLSEIGTIAWMITLCDA
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CCDS47 ACSCYVGLAFGILVGNN-FAPNIIFALAGGMFLYISLADMFPEMNDMLREKIIKWATDDI
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CCDS47 KSQLHLLWIYTAR
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CCDS33 HTRKREAPHVKNNAIISLRKDLNEDDHHHECLNVTQLLKYYGHGANSPISTDLFTYLCPA
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pF1KE6 IIQQLLS--CSCHLPK------DQQAKLPPTTLEKYGYST-----VAVTLLTLGSMLGTA
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CCDS33 LLYQIDSRLCIEHFDKLLVEDINKDKNLVPEDEANIGASAWICGIISITVISLLSLLGVI
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:: . ..: ....: ..:.:::::.::::::::.:. : : .:.: :: :
CCDS33 LVPIINQGC---FKFLLTFLVALAVGTMSGDALLHLLPHSQGGHDHSHQHAHGHGHSHGH
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::. . . : ::. :::. .:.::.:. .. ....: . .. .:.
CCDS33 ESNKFLEEYDAVLKGLVALGGIYLLFIIEHCIRMFKHYKQQRGKQKWFMKQNTEESTIGR
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490 500 510
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CCDS33 KLSDHKLNNTPDSDWLQLKPLAGTDDSVVSEDRLNETELTDLEGQQESPPKNYLCIEEEK
550 560 570 580 590 600
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::. : . :: :..
CCDS33 IIDHSHSDGLHTIHEHDLHAAAHNHHGENKTVLRKHNHQWHHKHSHHSHGPCHSGSDLKE
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:. .: :...::..:::.::::::::::.. .:..:.::..:::.:::.:::::::.
CCDS33 TGIANIAWMVIMGDGIHNFSDGLAIGAAFSAGLTGGISTSIAVFCHELPHELGDFAVLLK
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.:...: ::..:..:.. :..:. :: .:. . :::.::::::::..::.:::::
CCDS33 AGMTVKQAIVYNLLSAMMAYIGMLIGTAVGQYANNITLWIFAVTAGMFLYVALVDMLPEM
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pF1KE6 THVQTQR------PWMMFLLQNFGLILGWLSLLLLAIYEQNIKI
: . . : .:.:::.::..:. .:..:.::..:
CCDS33 LHGDGDNEEHGFCPVGQFILQNLGLLFGFAIMLVIALYEDKIVFDIQF
790 800 810 820 830
691 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 17:34:32 2016 done: Tue Nov 8 17:34:32 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]