Result of FASTA (ccds) for
pF1KE5788
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5788, 780 aa
1>>>pF1KE5788 780 - 780 aa - 780 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7332+/-0.0013; mu= 13.0322+/- 0.077
mean_var=82.6556+/-15.961, 0's: 0 Z-trim(100.5): 52 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.141071
statistics sampled from 6207 (6229) to 6207 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.53), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16
Scan time: 1.700
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS31668.1 CUL5 gene_id:8065|Hs109|chr11 ( 780) 5062 1040.9 0
CCDS7179.1 CUL2 gene_id:8453|Hs109|chr10 ( 745) 539 120.4 1.1e-26
CCDS73086.1 CUL2 gene_id:8453|Hs109|chr10 ( 758) 539 120.4 1.1e-26
CCDS55709.1 CUL2 gene_id:8453|Hs109|chr10 ( 764) 539 120.4 1.1e-26
CCDS34772.1 CUL1 gene_id:8454|Hs109|chr7 ( 776) 521 116.7 1.5e-25
CCDS9533.1 CUL4A gene_id:8451|Hs109|chr13 ( 659) 441 100.4 1e-20
CCDS73604.1 CUL4A gene_id:8451|Hs109|chr13 ( 667) 441 100.4 1e-20
CCDS41908.1 CUL4A gene_id:8451|Hs109|chr13 ( 759) 441 100.4 1.1e-20
CCDS58751.1 CUL3 gene_id:8452|Hs109|chr2 ( 702) 324 76.6 1.6e-13
CCDS2462.1 CUL3 gene_id:8452|Hs109|chr2 ( 768) 324 76.6 1.7e-13
CCDS43987.1 CUL4B gene_id:8450|Hs109|chrX ( 895) 288 69.3 3.2e-11
CCDS83487.1 CUL4B gene_id:8450|Hs109|chrX ( 900) 288 69.3 3.2e-11
CCDS35379.1 CUL4B gene_id:8450|Hs109|chrX ( 913) 288 69.3 3.2e-11
>>CCDS31668.1 CUL5 gene_id:8065|Hs109|chr11 (780 aa)
initn: 5062 init1: 5062 opt: 5062 Z-score: 5567.3 bits: 1040.9 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 5062; 100.0% identity (100.0% similar) in 780 aa overlap (1-780:1-780)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MATSNLLKNKGSLQFEDKWDFMRPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSDVHAVCLWDDKGPAK
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CCDS31 MATSNLLKNKGSLQFEDKWDFMRPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSDVHAVCLWDDKGPAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 IHQALKEDILEFIKQAQARVLSHQDDTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPFCQLEITLMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IHQALKEDILEFIKQAQARVLSHQDDTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPFCQLEITLMG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 KQGSNKKSNVEDSIVRKLMLDTWNESIFSNIKNRLQDSAMKLVHAERLGEAFDSQLVIGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KQGSNKKSNVEDSIVRKLMLDTWNESIFSNIKNRLQDSAMKLVHAERLGEAFDSQLVIGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 RESYVNLCSNPEDKLQIYRDNFEKAYLDSTERFYRTQAPSYLQQNGVQNYMKYADAKLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RESYVNLCSNPEDKLQIYRDNFEKAYLDSTERFYRTQAPSYLQQNGVQNYMKYADAKLKE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 EEKRALRYLETRRECNSVEALMECCVNALVTSFKETILAECQGMIKRNETEKLHLMFSLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EEKRALRYLETRRECNSVEALMECCVNALVTSFKETILAECQGMIKRNETEKLHLMFSLM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 DKVPNGIEPMLKDLEEHIISAGLADMVAAAETITTDSEKYVEQLLTLFNRFSKLVKEAFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DKVPNGIEPMLKDLEEHIISAGLADMVAAAETITTDSEKYVEQLLTLFNRFSKLVKEAFQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 DDPRFLTARDKAYKAVVNDATIFKLELPLKQKGVGLKTQPESKCPELLANYCDMLLRKTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DDPRFLTARDKAYKAVVNDATIFKLELPLKQKGVGLKTQPESKCPELLANYCDMLLRKTP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 LSKKLTSEEIEAKLKEVLLVLKYVQNKDVFMRYHKAHLTRRLILDISADSEIEENMVEWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSKKLTSEEIEAKLKEVLLVLKYVQNKDVFMRYHKAHLTRRLILDISADSEIEENMVEWL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE5 REVGMPADYVNKLARMFQDIKVSEDLNQAFKEMHKNNKLALPADSVNIKILNAGAWSRSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 REVGMPADYVNKLARMFQDIKVSEDLNQAFKEMHKNNKLALPADSVNIKILNAGAWSRSS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE5 EKVFVSLPTELEDLIPEVEEFYKKNHSGRKLHWHHLMSNGIITFKNEVGQYDLEVTTFQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EKVFVSLPTELEDLIPEVEEFYKKNHSGRKLHWHHLMSNGIITFKNEVGQYDLEVTTFQL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE5 AVLFAWNQRPREKISFENLKLATELPDAELRRTLWSLVAFPKLKRQVLLYEPQVNSPKDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AVLFAWNQRPREKISFENLKLATELPDAELRRTLWSLVAFPKLKRQVLLYEPQVNSPKDF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE5 TEGTLFSVNQEFSLIKNAKVQKRGKINLIGRLQLTTERMREEENEGIVQLRILRTQEAII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TEGTLFSVNQEFSLIKNAKVQKRGKINLIGRLQLTTERMREEENEGIVQLRILRTQEAII
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE5 QIMKMRKKISNAQLQTELVEILKNMFLPQKKMIKEQIEWLIEHKYIRRDESDINTFIYMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 QIMKMRKKISNAQLQTELVEILKNMFLPQKKMIKEQIEWLIEHKYIRRDESDINTFIYMA
730 740 750 760 770 780
>>CCDS7179.1 CUL2 gene_id:8453|Hs109|chr10 (745 aa)
initn: 811 init1: 143 opt: 539 Z-score: 592.6 bits: 120.4 E(33420): 1.1e-26
Smith-Waterman score: 1031; 27.6% identity (60.6% similar) in 787 aa overlap (13-780:8-745)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MATSNLLKNKGSLQFEDKWDFMRPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSDVHAVCL-WDDKGPA
..:.. :. . . .. : : . : : :::..:.:. . .
CCDS71 MSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSDIYALCVAYPEPLGE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 KIHQALKEDILEFIKQAQARVLSHQDDTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPFCQLEITLM
... : . . ... . ::: ... .: : :... : . . :. ..
CCDS71 RLYTETKIFLENHVRHLHKRVL--ESEEQVLVMYHRYWEEYSKGADYMDCLYRYLNTQFI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE5 GK--------QGSNKKSNVEDSIVR--KLMLDTWNESIFSNIKNRLQDSAMKLVHAERLG
: : . .... ... .: :: : . . .. : .. .. .: :
CCDS71 KKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWRKLMVEPLQAILIRMLLREIKNDRGG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 EAFDSQLVIGVRESYVNLCSNPED-KLQIYRDNFEKAYLDSTERFYRTQAPSYLQQNGVQ
: ..... :: .:.:.. . . :..:.. ::. .: : ..:. .: . ::... .
CCDS71 EDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQEASNLLQESNCS
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 NYMKYADAKLKEEEKRALRYLETRRECNSVEALMECCVNALVTSFKETILAECQGMIKRN
.::. . ..::.:: : .::. .: ... : . .:.. . . :::...:...
CCDS71 QYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHP----SSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHAECHNIIRQE
240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE5 ETEKLHLMFSLMDKVPNGIEPMLKDLEEHIISAGL-ADMVAAAETITTDSEKYVEQLLTL
. . . :. :. : .:. :...:..:: . :: : . :.. : .::..: .
CCDS71 KKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQENMPT---LFVESVLEV
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE5 FNRFSKLVKEAFQDDPRFLTARDKAYKAVVNDATIFKLELPLKQKGVGLKTQPESKC--P
..: .:.. ... : .:..: ::: .::: .:.: : :
CCDS71 HGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVN------------------YREPKSVCKAP
350 360 370 380
410 420 430 440 450 460
pF1KE5 ELLANYCDMLLRKTPLSKKLTSEEIEAKLKEVLLVLKYVQNKDVFMRYHKAHLTRRLILD
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CCDS71 ELLAKYCDNLLKKS--AKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARMLAKRLIHG
390 400 410 420 430 440
470 480 490 500 510 520
pF1KE5 ISADSEIEENMVEWLREVGMPADYVNKLARMFQDIKVSEDLNQAFKEMHKNNKLALPAD-
.: . . :: :.. :... ....:: ::. :..:: :::. :... ::. ..
CCDS71 LSMSMDSEEAMINKLKQA-CGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQDTVIDLGI
450 460 470 480 490 500
530 540 550 560 570 580
pF1KE5 SVNIKILNAGAW--SRSSEKVFVSLPTELEDLIPEVEEFYKKNHSGRKLHWHHLMSNGII
: .: .:.:::: ... ..: ..: ::: . : ::... ::::: : : . .: .
CCDS71 SFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTF-AIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWLHYLCTGEV
510 520 530 540 550 560
590 600 610 620 630 640
pF1KE5 TFKNEVGQ-YDLEVTTFQLAVLFAWNQRPREKISFENLKLATELPDAELRRTLWSLVAFP
. : .:. : :::.:.:::.:.:. : .:...:. .:.. . :: .:. ::
CCDS71 KM-NYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNS--ETVSYKELQDSTQMNEKELTKTIKSL----
570 580 590 600 610
650 660 670 680 690 700
pF1KE5 KLKRQVLLYEPQVNSPKDFTEGTLFSVNQEFSLIKNAKVQKRGKINLIGRLQLTTERMRE
: ... .. . .:. . ::.:..:: .:: :... .: : . :
CCDS71 -LDVKMINHDSE---KEDIDAESSFSLNMNFS-------SKRTKFKITTSMQKDTPQEME
620 630 640 650 660
710 720 730 740 750 760
pF1KE5 EENEGIVQLRILRTQEAIIQIMKMRKKISNAQLQTELVEILKNMFLPQKKMIKEQIEWLI
. .. . : . : ::..::: :: . . : :.. . : :. .:::. :: ::
CCDS71 QTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMIKKCIEVLI
670 680 690 700 710 720
770 780
pF1KE5 EHKYIRRDESDINTFIYMA
...::.:.... . . :.:
CCDS71 DKQYIERSQASADEYSYVA
730 740
>>CCDS73086.1 CUL2 gene_id:8453|Hs109|chr10 (758 aa)
initn: 811 init1: 143 opt: 539 Z-score: 592.5 bits: 120.4 E(33420): 1.1e-26
Smith-Waterman score: 1031; 27.6% identity (60.6% similar) in 787 aa overlap (13-780:21-758)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MATSNLLKNKGSLQFEDKWDFMRPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSDVHAVCL
..:.. :. . . .. : : . : : :::..:.:.
CCDS73 MVPGKEFQHYTCTMSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSDIYALCV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 -WDDKGPAKIHQALKEDILEFIKQAQARVLSHQDDTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPF
. . ... : . . ... . ::: ... .: : :... : . .
CCDS73 AYPEPLGERLYTETKIFLENHVRHLHKRVL--ESEEQVLVMYHRYWEEYSKGADYMDCLY
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE5 CQLEITLMGK--------QGSNKKSNVEDSIVR--KLMLDTWNESIFSNIKNRLQDSAMK
:. .. : : . .... ... .: :: : . . .. : ..
CCDS73 RYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWRKLMVEPLQAILIRMLLR
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE5 LVHAERLGEAFDSQLVIGVRESYVNLCSNPED-KLQIYRDNFEKAYLDSTERFYRTQAPS
.. .: :: ..... :: .:.:.. . . :..:.. ::. .: : ..:. .: .
CCDS73 EIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYYKQEASN
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE5 YLQQNGVQNYMKYADAKLKEEEKRALRYLETRRECNSVEALMECCVNALVTSFKETILAE
::... ..::. . ..::.:: : .::. .: ... : . .:.. . . ::
CCDS73 LLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHP----SSYTKVIHECQQRMVADHLQFLHAE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE5 CQGMIKRNETEKLHLMFSLMDKVPNGIEPMLKDLEEHIISAGL-ADMVAAAETITTDSEK
:...:.... . . :. :. : .:. :...:..:: . :: : . :.. :
CCDS73 CHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQENMPT---L
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 YVEQLLTLFNRFSKLVKEAFQDDPRFLTARDKAYKAVVNDATIFKLELPLKQKGVGLKTQ
.::..: . ..: .:.. ... : .:..: ::: .::: .
CCDS73 FVESVLEVHGKFVQLINTVLNGDQHFMSALDKALTSVVN------------------YRE
360 370 380 390
400 410 420 430 440 450
pF1KE5 PESKC--PELLANYCDMLLRKTPLSKKLTSEEIEAKLKEVLLVLKYVQNKDVFMRYHKAH
:.: : :::::.::: ::.:. .: .: .:.: .: . :.::...::::....
CCDS73 PKSVCKAPELLAKYCDNLLKKS--AKGMTENEVEDRLTSFITVFKYIDDKDVFQKFYARM
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KE5 LTRRLILDISADSEIEENMVEWLREVGMPADYVNKLARMFQDIKVSEDLNQAFKEMHKNN
:..::: .: . . :: :.. :... ....:: ::. :..:: :::. :... ::.
CCDS73 LAKRLIHGLSMSMDSEEAMINKLKQA-CGYEFTSKLHRMYTDMSVSADLNNKFNNFIKNQ
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KE5 KLALPAD-SVNIKILNAGAW--SRSSEKVFVSLPTELEDLIPEVEEFYKKNHSGRKLHWH
.. : .: .:.:::: ... ..: ..: ::: . : ::... ::::: :
CCDS73 DTVIDLGISFQIYVLQAGAWPLTQAPSSTF-AIPQELEKSVQMFELFYSQHFSGRKLTWL
520 530 540 550 560
580 590 600 610 620 630
pF1KE5 HLMSNGIITFKNEVGQ-YDLEVTTFQLAVLFAWNQRPREKISFENLKLATELPDAELRRT
: . .: . . : .:. : :::.:.:::.:.:. : .:...:. .:.. . :: .:
CCDS73 HYLCTGEVKM-NYLGKPYVAMVTTYQMAVLLAFNNS--ETVSYKELQDSTQMNEKELTKT
570 580 590 600 610 620
640 650 660 670 680 690
pF1KE5 LWSLVAFPKLKRQVLLYEPQVNSPKDFTEGTLFSVNQEFSLIKNAKVQKRGKINLIGRLQ
. :: : ... .. . .:. . ::.:..:: .:: :... .:
CCDS73 IKSL-----LDVKMINHDSE---KEDIDAESSFSLNMNFS-------SKRTKFKITTSMQ
630 640 650 660 670
700 710 720 730 740 750
pF1KE5 LTTERMREEENEGIVQLRILRTQEAIIQIMKMRKKISNAQLQTELVEILKNMFLPQKKMI
: . :. .. . : . : ::..::: :: . . : :.. . : :. .::
CCDS73 KDTPQEMEQTRSAVDEDRKMYLQAAIVRIMKARKVLRHNALIQEVISQSRARFNPSISMI
680 690 700 710 720 730
760 770 780
pF1KE5 KEQIEWLIEHKYIRRDESDINTFIYMA
:. :: ::...::.:.... . . :.:
CCDS73 KKCIEVLIDKQYIERSQASADEYSYVA
740 750
>>CCDS55709.1 CUL2 gene_id:8453|Hs109|chr10 (764 aa)
initn: 811 init1: 143 opt: 539 Z-score: 592.5 bits: 120.4 E(33420): 1.1e-26
Smith-Waterman score: 1031; 27.6% identity (60.6% similar) in 787 aa overlap (13-780:27-764)
10 20 30 40
pF1KE5 MATSNLLKNKGSLQFEDKWDFMRPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSD
..:.. :. . . .. : : . : : :::
CCDS55 MYRVTWSTFWLRFQHYTCTMSLKPRVVDFDETWNKLLTTIKAVVMLEYVERATWNDRFSD
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE5 VHAVCL-WDDKGPAKIHQALKEDILEFIKQAQARVLSHQDDTALLKAYIVEWRKFFTQCD
..:.:. . . ... : . . ... . ::: ... .: : :... :
CCDS55 IYALCVAYPEPLGERLYTETKIFLENHVRHLHKRVL--ESEEQVLVMYHRYWEEYSKGAD
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE5 ILPKPFCQLEITLMGK--------QGSNKKSNVEDSIVR--KLMLDTWNESIFSNIKNRL
. . :. .. : : . .... ... .: :: : . . .. :
CCDS55 YMDCLYRYLNTQFIKKNKLTEADLQYGYGGVDMNEPLMEIGELALDMWRKLMVEPLQAIL
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE5 QDSAMKLVHAERLGEAFDSQLVIGVRESYVNLCSNPED-KLQIYRDNFEKAYLDSTERFY
.. .. .: :: ..... :: .:.:.. . . :..:.. ::. .: : ..:
CCDS55 IRMLLREIKNDRGGEDPNQKVIHGVINSFVHVEQYKKKFPLKFYQEIFESPFLTETGEYY
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE5 RTQAPSYLQQNGVQNYMKYADAKLKEEEKRALRYLETRRECNSVEALMECCVNALVTSFK
. .: . ::... ..::. . ..::.:: : .::. .: ... : . .:..
CCDS55 KQEASNLLQESNCSQYMEKVLGRLKDEEIRCRKYLHP----SSYTKVIHECQQRMVADHL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE5 ETILAECQGMIKRNETEKLHLMFSLMDKVPNGIEPMLKDLEEHIISAGL-ADMVAAAETI
. . :::...:.... . . :. :. : .:. :...:..:: . :: : . :..
CCDS55 QFLHAECHNIIRQEKKNDMANMYVLLRAVSTGLPHMIQELQNHIHDEGLRATSNLTQENM
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE5 TTDSEKYVEQLLTLFNRFSKLVKEAFQDDPRFLTARDKAYKAVVNDATIFKLELPLKQKG
: .::..: . ..: .:.. ... : .:..: ::: .:::
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... :..::: .: . . :: :.. :... ....:: ::. :..:: :::. :.
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.. ::. .. : .: .:.:::: ... ..: ..: ::: . : ::... ::
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::: : : . .: . . : .:. : :::.:.:::.:.:. : .:...:. .:.. .
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:: .:. :: : ... .. . .:. . ::.:..:: .:: :..
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. .: : . :. .. . : . : ::..::: :: . . : :.. . :
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.:. . . .: :. . .. .. .... . . .: : :: . .: ....
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:::: : . .:.: ..: ::: .: :...:::.:.:. .: . . . ..: .:.
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CCDS95 RIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
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CCDS73 QSLACG---KARVLIKSPK---GKEVEDGDKFIFNGEF---KHKLF--RIKINQI-QMKE
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CCDS73 KKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
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CCDS41 APAKPGGAGGSKKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSI-RYNLEELYQ
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. :.. :: ::: : .:. .: ... :. ::.:.:.:: .:. :. .: ...
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. . .. .:.. : :..:...: .: . .:. :.: . : : .: : ..
CCDS41 KGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTA-IVINPEK----DK
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.: .: ::.:.. : :: .:. :.::.: : ...........:::: ..: :
CCDS41 RP-NKPAELIAKHVDSKLRAG--NKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDL
410 420 430 440 450
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pF1KE5 TRRLILDISADSEIEENMVEWLR-EVGMPADYVNKLARMFQDIKVSEDLNQAFKEMHKNN
..::.. ::. . :..:. :. : : : ...:: ::.:...:.:. ::. .:.
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pF1KE5 KLALPADSVNIKILNAGAWSRSSEKVFVSLPTELEDLIPEVEEFYKKNHSGRKLHWHHLM
. . : : ....::. : : . . : : :. : . :: .::::::.:. .
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..... . . :. ...:. :: ::. .:. . .:::..:.:: . :.:::::: ::
CCDS41 GHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEG--DGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSL
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. : .::. :. :. .: : : :: :. : ::: : ... :.:
CCDS41 AC---GKARVLIKSPK---GKEVEDGDKFIFNGEF---KHKLF--RIKINQI-QMKETVE
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. . .: . : : . . ::..:::::: ... : .:: . :: : .:..:
CCDS41 E-QVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGD--LKKRI
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CCDS41 ESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVA
740 750
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.::..:. .:.. : ::. .. : .. :.: . . . : . . ::..::: :
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CCDS58 KKMQHNVLVAEVTQQLKARFLPSPVVIKKRIEGLIEREYLARTPEDRKVYTYVA
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CCDS24 ------RDILMYMDRVYVQQNNVEN--VYNLGLIIFRDQVVRYGCIRDHLRQTLLDMIAR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]