Result of FASTA (omim) for
pF1KE5665
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5665, 528 aa
1>>>pF1KE5665 528 - 528 aa - 528 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
65089639 residues in 91964 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7934+/-0.000396; mu= 15.5203+/- 0.024
mean_var=71.3286+/-14.301, 0's: 0 Z-trim(112.4): 37 B-trim: 640 in 1/53
Lambda= 0.151860
statistics sampled from 22043 (22066) to 22043 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.605), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 4.680
The best scores are: opt bits E(91964)
NP_001622 (OMIM: 171740) intestinal-type alkaline ( 528) 3513 779.3 0
NP_112603 (OMIM: 171810) alkaline phosphatase, pla ( 532) 3080 684.4 2.4e-196
NP_001623 (OMIM: 171800) alkaline phosphatase, pla ( 535) 3040 675.7 1.1e-193
XP_005245875 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) a ( 524) 1900 425.9 1.6e-118
NP_000469 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) alka ( 524) 1900 425.9 1.6e-118
XP_006710609 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) a ( 524) 1900 425.9 1.6e-118
NP_001120973 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) a ( 469) 1779 399.4 1.4e-110
XP_016856392 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) a ( 472) 1681 377.9 4e-104
NP_001170991 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) a ( 447) 1593 358.6 2.4e-98
>>NP_001622 (OMIM: 171740) intestinal-type alkaline phos (528 aa)
initn: 3513 init1: 3513 opt: 3513 Z-score: 4159.3 bits: 779.3 E(91964): 0
Smith-Waterman score: 3513; 100.0% identity (100.0% similar) in 528 aa overlap (1-528:1-528)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGVIPAEEENPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQKVAKNLILFLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGVIPAEEENPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQKVAKNLILFLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 DGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATAYLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATAYLC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTYA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIATQLISNMDIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPADA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIATQLISNMDIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPADA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SQNGIRLDGKNLVQEWLAKHQGAWYVWNRTELMQASLDQSVTHLMGLFEPGDTKYEIHRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQNGIRLDGKNLVQEWLAKHQGAWYVWNRTELMQASLDQSVTHLMGLFEPGDTKYEIHRD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 PTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFDDAIERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFDDAIERA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 GQLTSEEDTLTLVTADHSHVFSFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQDSKAYTSILYGNGPGYVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQLTSEEDTLTLVTADHSHVFSFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQDSKAYTSILYGNGPGYVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 NSGVRPDVNESESGSPDYQQQAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQSFVAHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NSGVRPDVNESESGSPDYQQQAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQSFVAHV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE5 MAFAACLEPYTACDLAPPACTTDAAHPVAASLPLLAGTLLLLGASAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAFAACLEPYTACDLAPPACTTDAAHPVAASLPLLAGTLLLLGASAAP
490 500 510 520
>>NP_112603 (OMIM: 171810) alkaline phosphatase, placent (532 aa)
initn: 3084 init1: 3005 opt: 3080 Z-score: 3646.6 bits: 684.4 E(91964): 2.4e-196
Smith-Waterman score: 3080; 86.8% identity (94.9% similar) in 532 aa overlap (1-528:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGVIPAEEENPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQKVAKNLILFLG
:::::::::::::::::::.::.::::: :::::::::: ::::::: : .:::::.:::
NP_112 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGIIPVEEENPDFWNRQAAEALGAAKKLQPAQTAAKNLIIFLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 DGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATAYLC
::.:: ::::.:::::::. :::::: ::::::::.::::::.::..::::.::::::::
NP_112 DGMGVSTVTAARILKGQKKDKLGPETFLAMDRFPYVALSKTYSVDKHVPDSGATATAYLC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTYA
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.::
NP_112 GVKGNFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKKAGKSVGVVTTTRVQHASPAGAYA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIATQLISNMDIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPADA
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
NP_112 HTVNRNWYSDADVPASARQEGCQDIATQLISNMDIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPDDY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SQNGIRLDGKNLVQEWLAKHQGAWYVWNRTELMQASLDQSVTHLMGLFEPGDTKYEIHRD
::.: :::::::::::::::::: ::::::::.::::: ::::::::::::: :::::::
NP_112 SQGGTRLDGKNLVQEWLAKHQGARYVWNRTELLQASLDPSVTHLMGLFEPGDMKYEIHRD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 PTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFDDAIERA
:::::::::::::: :::::::::.::::::::::::::. ::.::::..:::::::::
NP_112 STLDPSLMEMTEAALLLLSRNPRGFFLFVEGGRIDHGHHESRAYRALTETIMFDDAIERA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 GQLTSEEDTLTLVTADHSHVFSFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQDSKAYTSILYGNGPGYVF
::::::::::.::::::::::::::: :::::::::::.::.: :::: .:::::::::.
NP_112 GQLTSEEDTLSLVTADHSHVFSFGGYPLRGSSIFGLAPGKARDRKAYTVLLYGNGPGYVL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 NSGVRPDVNESESGSPDYQQQAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQSFVAHV
..:.::::.:::::::.:.::.::::..:::.::::::::::::::::::::::.:.:::
NP_112 KDGARPDVTESESGSPEYRQQSAVPLDGETHAGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQTFIAHV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE5 MAFAACLEPYTACDLAPPACTTDAAHP----VAASLPLLAGTLLLLGASAAP
::::::::::::::::: : ::::::: : : ::::::::::::...::
NP_112 MAFAACLEPYTACDLAPRAGTTDAAHPGPSVVPALLPLLAGTLLLLGTATAP
490 500 510 520 530
>>NP_001623 (OMIM: 171800) alkaline phosphatase, placent (535 aa)
initn: 3039 init1: 2971 opt: 3040 Z-score: 3599.2 bits: 675.7 E(91964): 1.1e-193
Smith-Waterman score: 3040; 86.0% identity (93.8% similar) in 535 aa overlap (1-528:1-535)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQGP---WVLLLLGLRLQLSLGVIPAEEENPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQKVAKNLIL
: :: .:::::::::::::.::.::::: ::::.::::: ::::::: : .:::::.
NP_001 MLGPCMLLLLLLLGLRLQLSLGIIPVEEENPDFWNREAAEALGAAKKLQPAQTAAKNLII
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLGDGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATA
:::::.:: ::::.:::::::. ::::: :::::::::.:::::::::..::::.:::::
NP_001 FLGDGMGVSTVTAARILKGQKKDKLGPEIPLAMDRFPYVALSKTYNVDKHVPDSGATATA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YLCGVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAG
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_001 YLCGVKGNFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKKAGKSVGVVTTTRVQHASPAG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TYAHTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIATQLISNMDIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYP
:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
NP_001 TYAHTVNRNWYSDADVPASARQEGCQDIATQLISNMDIDVILGGGRKYMFRMGTPDPEYP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ADASQNGIRLDGKNLVQEWLAKHQGAWYVWNRTELMQASLDQSVTHLMGLFEPGDTKYEI
: ::.: ::::::::::::::.::: :::::::::::::: ::::::::::::: ::::
NP_001 DDYSQGGTRLDGKNLVQEWLAKRQGARYVWNRTELMQASLDPSVTHLMGLFEPGDMKYEI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 HRDPTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFDDAI
::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::. ::.::::..::::::
NP_001 HRDSTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFFLFVEGGRIDHGHHESRAYRALTETIMFDDAI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 ERAGQLTSEEDTLTLVTADHSHVFSFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQDSKAYTSILYGNGPG
:::::::::::::.::::::::::::::: :::::::::::.::.: :::: .:::::::
NP_001 ERAGQLTSEEDTLSLVTADHSHVFSFGGYPLRGSSIFGLAPGKARDRKAYTVLLYGNGPG
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 YVFNSGVRPDVNESESGSPDYQQQAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQSFV
::...:.::::.:::::::.:.::.::::. :::.::::::::::::::::::::::.:.
NP_001 YVLKDGARPDVTESESGSPEYRQQSAVPLDEETHAGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQTFI
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KE5 AHVMAFAACLEPYTACDLAPPACTTDAAHP----VAASLPLLAGTLLLLGASAAP
:::::::::::::::::::::: ::::::: : : ::::::::::: ...::
NP_001 AHVMAFAACLEPYTACDLAPPAGTTDAAHPGRSVVPALLPLLAGTLLLLETATAP
490 500 510 520 530
>>XP_005245875 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) alkal (524 aa)
initn: 1296 init1: 713 opt: 1900 Z-score: 2249.5 bits: 425.9 E(91964): 1.6e-118
Smith-Waterman score: 1900; 56.1% identity (79.0% similar) in 529 aa overlap (1-521:1-524)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGVIPAEEENPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQ-KVAKNLILFL
: .:...: .: : :: .: .:..: .: :: :.: : .:: .. .::::.:.::
XP_005 MISPFLVLAIGTCLTNSL--VPEKEKDPKYWRDQAQETLKYALELQKLNTNVAKNVIMFL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 GDGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATAYL
:::.:: ::::.:::::: . . : :: : ::.::..:::::::.. ::::::.::::::
XP_005 GDGMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEETRLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 CGVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTY
:::::: :.:.:::.. ..::::.:::: :.. ::.::::::.::::::.::.:...:
XP_005 CGVKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGNEVTSILRWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 AHTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIATQLISNM-DIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPA
::...:.:::: .:: : ..::.::: ::. :. :::::.:::::::.: . : :: .
XP_005 AHSADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYES
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 DASQNGIRLDGKNLVQEWLA---KHQGAWYVWNRTELMQASLD-QSVTHLMGLFEPGDTK
: . : :::: .::. : . ... . ..::::::. .:: ..: .:.::::::: .
XP_005 DEKARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELL--TLDPHNVDYLLGLFEPGDMQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 YEIHRDPTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFD
::..:. . :::: ::. .:...: .::.::.:.::::::::::::: : ::: ::: .:
XP_005 YELNRNNVTDPSLSEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 DAIERAGQLTSEEDTLTLVTADHSHVFSFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQ-DSKAYTSILYG
:: .::.::: :::::.:::::::::.::::: ::.::::::: .. :.: .:.::::
XP_005 RAIGQAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 NGPGYVFNSGVRPDVNESESGSPDYQQQAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQE
::::: .: : .:. . . .:: :.:::: :::::::::::..::.:::.:::.:
XP_005 NGPGYKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KE5 QSFVAHVMAFAACLEPYTA-CDLAPPACTTDAAHPVAASLPLLAGTLLLLGASAAP
:..: ::::.:::. . : : : . :: :. .: : ..:.
XP_005 QNYVPHVMAYAACIGANLGHCAPASSAGSL-AAGPLLLALALYPLSVLF
480 490 500 510 520
>>NP_000469 (OMIM: 146300,171760,241500,241510) alkaline (524 aa)
initn: 1296 init1: 713 opt: 1900 Z-score: 2249.5 bits: 425.9 E(91964): 1.6e-118
Smith-Waterman score: 1900; 56.1% identity (79.0% similar) in 529 aa overlap (1-521:1-524)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGVIPAEEENPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQ-KVAKNLILFL
: .:...: .: : :: .: .:..: .: :: :.: : .:: .. .::::.:.::
NP_000 MISPFLVLAIGTCLTNSL--VPEKEKDPKYWRDQAQETLKYALELQKLNTNVAKNVIMFL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 GDGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATAYL
:::.:: ::::.:::::: . . : :: : ::.::..:::::::.. ::::::.::::::
NP_000 GDGMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEETRLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 CGVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTY
:::::: :.:.:::.. ..::::.:::: :.. ::.::::::.::::::.::.:...:
NP_000 CGVKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGNEVTSILRWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 AHTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIATQLISNM-DIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPA
::...:.:::: .:: : ..::.::: ::. :. :::::.:::::::.: . : :: .
NP_000 AHSADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYES
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 DASQNGIRLDGKNLVQEWLA---KHQGAWYVWNRTELMQASLD-QSVTHLMGLFEPGDTK
: . : :::: .::. : . ... . ..::::::. .:: ..: .:.::::::: .
NP_000 DEKARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELL--TLDPHNVDYLLGLFEPGDMQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 YEIHRDPTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFD
::..:. . :::: ::. .:...: .::.::.:.::::::::::::: : ::: ::: .:
NP_000 YELNRNNVTDPSLSEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 DAIERAGQLTSEEDTLTLVTADHSHVFSFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQ-DSKAYTSILYG
:: .::.::: :::::.:::::::::.::::: ::.::::::: .. :.: .:.::::
NP_000 RAIGQAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 NGPGYVFNSGVRPDVNESESGSPDYQQQAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQE
::::: .: : .:. . . .:: :.:::: :::::::::::..::.:::.:::.:
NP_000 NGPGYKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KE5 QSFVAHVMAFAACLEPYTA-CDLAPPACTTDAAHPVAASLPLLAGTLLLLGASAAP
:..: ::::.:::. . : : : . :: :. .: : ..:.
NP_000 QNYVPHVMAYAACIGANLGHCAPASSAGSL-AAGPLLLALALYPLSVLF
480 490 500 510 520
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10 20 30 40 50
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30 40 50 60 70 80
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NP_001 QSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHEQNYVPHVMAYAACIGANLGHCAPASSA
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450 460
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.:.
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528 residues in 1 query sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]