Result of FASTA (ccds) for
pF1KE5665
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5665, 528 aa
1>>>pF1KE5665 528 - 528 aa - 528 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6975+/-0.000907; mu= 16.1015+/- 0.054
mean_var=66.4834+/-13.038, 0's: 0 Z-trim(105.2): 21 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.157296
statistics sampled from 8399 (8409) to 8399 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 1.480
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS2492.1 ALPI gene_id:248|Hs109|chr2 ( 528) 3513 806.4 0
CCDS2491.1 ALPG gene_id:251|Hs109|chr2 ( 532) 3080 708.1 6.5e-204
CCDS2490.1 ALPP gene_id:250|Hs109|chr2 ( 535) 3040 699.0 3.5e-201
CCDS217.1 ALPL gene_id:249|Hs109|chr1 ( 524) 1900 440.3 2.6e-123
CCDS53275.1 ALPL gene_id:249|Hs109|chr1 ( 469) 1779 412.8 4.4e-115
CCDS53274.1 ALPL gene_id:249|Hs109|chr1 ( 447) 1593 370.6 2.1e-102
>>CCDS2492.1 ALPI gene_id:248|Hs109|chr2 (528 aa)
initn: 3513 init1: 3513 opt: 3513 Z-score: 4305.7 bits: 806.4 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 3513; 100.0% identity (100.0% similar) in 528 aa overlap (1-528:1-528)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGVIPAEEENPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQKVAKNLILFLG
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CCDS24 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGVIPAEEENPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQKVAKNLILFLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 DGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATAYLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 DGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATAYLC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTYA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIATQLISNMDIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPADA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 HTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIATQLISNMDIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPADA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SQNGIRLDGKNLVQEWLAKHQGAWYVWNRTELMQASLDQSVTHLMGLFEPGDTKYEIHRD
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CCDS24 SQNGIRLDGKNLVQEWLAKHQGAWYVWNRTELMQASLDQSVTHLMGLFEPGDTKYEIHRD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 PTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFDDAIERA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 PTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFDDAIERA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 GQLTSEEDTLTLVTADHSHVFSFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQDSKAYTSILYGNGPGYVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GQLTSEEDTLTLVTADHSHVFSFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQDSKAYTSILYGNGPGYVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 NSGVRPDVNESESGSPDYQQQAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQSFVAHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 NSGVRPDVNESESGSPDYQQQAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQSFVAHV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE5 MAFAACLEPYTACDLAPPACTTDAAHPVAASLPLLAGTLLLLGASAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MAFAACLEPYTACDLAPPACTTDAAHPVAASLPLLAGTLLLLGASAAP
490 500 510 520
>>CCDS2491.1 ALPG gene_id:251|Hs109|chr2 (532 aa)
initn: 3084 init1: 3005 opt: 3080 Z-score: 3774.6 bits: 708.1 E(33420): 6.5e-204
Smith-Waterman score: 3080; 86.8% identity (94.9% similar) in 532 aa overlap (1-528:1-532)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGVIPAEEENPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQKVAKNLILFLG
:::::::::::::::::::.::.::::: :::::::::: ::::::: : .:::::.:::
CCDS24 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGIIPVEEENPDFWNRQAAEALGAAKKLQPAQTAAKNLIIFLG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 DGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATAYLC
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CCDS24 DGMGVSTVTAARILKGQKKDKLGPETFLAMDRFPYVALSKTYSVDKHVPDSGATATAYLC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 GVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTYA
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.::
CCDS24 GVKGNFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKKAGKSVGVVTTTRVQHASPAGAYA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 HTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIATQLISNMDIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPADA
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS24 HTVNRNWYSDADVPASARQEGCQDIATQLISNMDIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPDDY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 SQNGIRLDGKNLVQEWLAKHQGAWYVWNRTELMQASLDQSVTHLMGLFEPGDTKYEIHRD
::.: :::::::::::::::::: ::::::::.::::: ::::::::::::: :::::::
CCDS24 SQGGTRLDGKNLVQEWLAKHQGARYVWNRTELLQASLDPSVTHLMGLFEPGDMKYEIHRD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 PTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFDDAIERA
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CCDS24 STLDPSLMEMTEAALLLLSRNPRGFFLFVEGGRIDHGHHESRAYRALTETIMFDDAIERA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE5 GQLTSEEDTLTLVTADHSHVFSFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQDSKAYTSILYGNGPGYVF
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CCDS24 GQLTSEEDTLSLVTADHSHVFSFGGYPLRGSSIFGLAPGKARDRKAYTVLLYGNGPGYVL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE5 NSGVRPDVNESESGSPDYQQQAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQSFVAHV
..:.::::.:::::::.:.::.::::..:::.::::::::::::::::::::::.:.:::
CCDS24 KDGARPDVTESESGSPEYRQQSAVPLDGETHAGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQTFIAHV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE5 MAFAACLEPYTACDLAPPACTTDAAHP----VAASLPLLAGTLLLLGASAAP
::::::::::::::::: : ::::::: : : ::::::::::::...::
CCDS24 MAFAACLEPYTACDLAPRAGTTDAAHPGPSVVPALLPLLAGTLLLLGTATAP
490 500 510 520 530
>>CCDS2490.1 ALPP gene_id:250|Hs109|chr2 (535 aa)
initn: 3039 init1: 2971 opt: 3040 Z-score: 3725.5 bits: 699.0 E(33420): 3.5e-201
Smith-Waterman score: 3040; 86.0% identity (93.8% similar) in 535 aa overlap (1-528:1-535)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQGP---WVLLLLGLRLQLSLGVIPAEEENPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQKVAKNLIL
: :: .:::::::::::::.::.::::: ::::.::::: ::::::: : .:::::.
CCDS24 MLGPCMLLLLLLLGLRLQLSLGIIPVEEENPDFWNREAAEALGAAKKLQPAQTAAKNLII
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 FLGDGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATA
:::::.:: ::::.:::::::. ::::: :::::::::.:::::::::..::::.:::::
CCDS24 FLGDGMGVSTVTAARILKGQKKDKLGPEIPLAMDRFPYVALSKTYNVDKHVPDSGATATA
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 YLCGVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAG
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS24 YLCGVKGNFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKKAGKSVGVVTTTRVQHASPAG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 TYAHTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIATQLISNMDIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYP
:::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS24 TYAHTVNRNWYSDADVPASARQEGCQDIATQLISNMDIDVILGGGRKYMFRMGTPDPEYP
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 ADASQNGIRLDGKNLVQEWLAKHQGAWYVWNRTELMQASLDQSVTHLMGLFEPGDTKYEI
: ::.: ::::::::::::::.::: :::::::::::::: ::::::::::::: ::::
CCDS24 DDYSQGGTRLDGKNLVQEWLAKRQGARYVWNRTELMQASLDPSVTHLMGLFEPGDMKYEI
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 HRDPTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFDDAI
::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::. ::.::::..::::::
CCDS24 HRDSTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFFLFVEGGRIDHGHHESRAYRALTETIMFDDAI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 ERAGQLTSEEDTLTLVTADHSHVFSFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQDSKAYTSILYGNGPG
:::::::::::::.::::::::::::::: :::::::::::.::.: :::: .:::::::
CCDS24 ERAGQLTSEEDTLSLVTADHSHVFSFGGYPLRGSSIFGLAPGKARDRKAYTVLLYGNGPG
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 YVFNSGVRPDVNESESGSPDYQQQAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQSFV
::...:.::::.:::::::.:.::.::::. :::.::::::::::::::::::::::.:.
CCDS24 YVLKDGARPDVTESESGSPEYRQQSAVPLDEETHAGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQTFI
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520
pF1KE5 AHVMAFAACLEPYTACDLAPPACTTDAAHP----VAASLPLLAGTLLLLGASAAP
:::::::::::::::::::::: ::::::: : : ::::::::::: ...::
CCDS24 AHVMAFAACLEPYTACDLAPPAGTTDAAHPGRSVVPALLPLLAGTLLLLETATAP
490 500 510 520 530
>>CCDS217.1 ALPL gene_id:249|Hs109|chr1 (524 aa)
initn: 1296 init1: 713 opt: 1900 Z-score: 2327.5 bits: 440.3 E(33420): 2.6e-123
Smith-Waterman score: 1900; 56.1% identity (79.0% similar) in 529 aa overlap (1-521:1-524)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MQGPWVLLLLGLRLQLSLGVIPAEEENPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQ-KVAKNLILFL
: .:...: .: : :: .: .:..: .: :: :.: : .:: .. .::::.:.::
CCDS21 MISPFLVLAIGTCLTNSL--VPEKEKDPKYWRDQAQETLKYALELQKLNTNVAKNVIMFL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 GDGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATAYL
:::.:: ::::.:::::: . . : :: : ::.::..:::::::.. ::::::.::::::
CCDS21 GDGMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEETRLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 CGVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTY
:::::: :.:.:::.. ..::::.:::: :.. ::.::::::.::::::.::.:...:
CCDS21 CGVKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGNEVTSILRWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 AHTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIATQLISNM-DIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPA
::...:.:::: .:: : ..::.::: ::. :. :::::.:::::::.: . : :: .
CCDS21 AHSADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIAYQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYES
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 DASQNGIRLDGKNLVQEWLA---KHQGAWYVWNRTELMQASLD-QSVTHLMGLFEPGDTK
: . : :::: .::. : . ... . ..::::::. .:: ..: .:.::::::: .
CCDS21 DEKARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKHSHFIWNRTELL--TLDPHNVDYLLGLFEPGDMQ
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 YEIHRDPTLDPSLMEMTEAALRLLSRNPRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFD
::..:. . :::: ::. .:...: .::.::.:.::::::::::::: : ::: ::: .:
CCDS21 YELNRNNVTDPSLSEMVVVAIQILRKNPKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE5 DAIERAGQLTSEEDTLTLVTADHSHVFSFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQ-DSKAYTSILYG
:: .::.::: :::::.:::::::::.::::: ::.::::::: .. :.: .:.::::
CCDS21 RAIGQAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE5 NGPGYVFNSGVRPDVNESESGSPDYQQQAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQE
::::: .: : .:. . . .:: :.:::: :::::::::::..::.:::.:::.:
CCDS21 NGPGYKVVGGERENVSMVDYAHNNYQAQSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KE5 QSFVAHVMAFAACLEPYTA-CDLAPPACTTDAAHPVAASLPLLAGTLLLLGASAAP
:..: ::::.:::. . : : : . :: :. .: : ..:.
CCDS21 QNYVPHVMAYAACIGANLGHCAPASSAGSL-AAGPLLLALALYPLSVLF
480 490 500 510 520
>>CCDS53275.1 ALPL gene_id:249|Hs109|chr1 (469 aa)
initn: 1267 init1: 684 opt: 1779 Z-score: 2179.9 bits: 412.8 E(33420): 4.4e-115
Smith-Waterman score: 1779; 58.1% identity (80.3% similar) in 472 aa overlap (57-521:1-469)
30 40 50 60 70 80
pF1KE5 NPAFWNRQAAEALDAAKKLQPIQKVAKNLILFLGDGLGVPTVTATRILKGQKNGKLGPET
.:::::.:: ::::.:::::: . . : ::
CCDS53 MFLGDGMGVSTVTAARILKGQLHHNPGEET
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE5 PLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATAYLCGVKANFQTIGLSAAARFNQCNTTRGN
: ::.::..:::::::.. ::::::.:::::::::::: :.:.:::.. ..::::.::
CCDS53 RLEMDKFPFVALSKTYNTNAQVPDSAGTATAYLCGVKANEGTVGVSAATERSRCNTTQGN
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE5 EVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTYAHTVNRNWYSDADMPASARQEGCQDIA
:: :.. ::.::::::.::::::.::.:...:::...:.:::: .:: : ..::.:::
CCDS53 EVTSILRWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAYAHSADRDWYSDNEMPPEALSQGCKDIA
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE5 TQLISNM-DIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPADASQNGIRLDGKNLVQEWLA---KHQG
::. :. :::::.:::::::.: . : :: .: . : :::: .::. : . ...
CCDS53 YQLMHNIRDIDVIMGGGRKYMYPKNKTDVEYESDEKARGTRLDGLDLVDTWKSFKPRYKH
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE5 AWYVWNRTELMQASLD-QSVTHLMGLFEPGDTKYEIHRDPTLDPSLMEMTEAALRLLSRN
. ..::::::. .:: ..: .:.::::::: .::..:. . :::: ::. .:...: .:
CCDS53 SHFIWNRTELL--TLDPHNVDYLLGLFEPGDMQYELNRNNVTDPSLSEMVVVAIQILRKN
220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE5 PRGFYLFVEGGRIDHGHHEGVAYQALTEAVMFDDAIERAGQLTSEEDTLTLVTADHSHVF
:.::.:.::::::::::::: : ::: ::: .: :: .::.::: :::::.:::::::::
CCDS53 PKGFFLLVEGGRIDHGHHEGKAKQALHEAVEMDRAIGQAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVF
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KE5 SFGGYTLRGSSIFGLAPSKAQ-DSKAYTSILYGNGPGYVFNSGVRPDVNESESGSPDYQQ
.::::: ::.::::::: .. :.: .:.::::::::: .: : .:. . . .::
CCDS53 TFGGYTPRGNSIFGLAPMLSDTDKKPFTAILYGNGPGYKVVGGERENVSMVDYAHNNYQA
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490
pF1KE5 QAAVPLSSETHGGEDVAVFARGPQAHLVHGVQEQSFVAHVMAFAACLEPYTA-CDLAPPA
:.:::: :::::::::::..::.:::.:::.::..: ::::.:::. . : : :
CCDS53 QSAVPLRHETHGGEDVAVFSKGPMAHLLHGVHEQNYVPHVMAYAACIGANLGHCAPASSA
390 400 410 420 430 440
500 510 520
pF1KE5 CTTDAAHPVAASLPLLAGTLLLLGASAAP
. :: :. .: : ..:.
CCDS53 GSL-AAGPLLLALALYPLSVLF
450 460
>>CCDS53274.1 ALPL gene_id:249|Hs109|chr1 (447 aa)
initn: 1081 init1: 550 opt: 1593 Z-score: 1952.1 bits: 370.6 E(33420): 2.1e-102
Smith-Waterman score: 1593; 57.2% identity (79.9% similar) in 428 aa overlap (101-521:23-447)
80 90 100 110 120 130
pF1KE5 TRILKGQKNGKLGPETPLAMDRFPYLALSKTYNVDRQVPDSAATATAYLCGVKANFQTIG
:::.. ::::::.:::::::::::: :.:
CCDS53 MPWSFRSSTPTWLRMSSCSWEMTYNTNAQVPDSAGTATAYLCGVKANEGTVG
10 20 30 40 50
140 150 160 170 180 190
pF1KE5 LSAAARFNQCNTTRGNEVISVMNRAKQAGKSVGVVTTTRVQHASPAGTYAHTVNRNWYSD
.:::.. ..::::.:::: :.. ::.::::::.::::::.::.:...:::...:.::::
CCDS53 VSAATERSRCNTTQGNEVTSILRWAKDAGKSVGIVTTTRVNHATPSAAYAHSADRDWYSD
60 70 80 90 100 110
200 210 220 230 240
pF1KE5 ADMPASARQEGCQDIATQLISNM-DIDVILGGGRKYMFPMGTPDPEYPADASQNGIRLDG
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