FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5061, 391 aa
1>>>pF1KE5061 391 - 391 aa - 391 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5834+/-0.00109; mu= 14.5439+/- 0.064
mean_var=58.4273+/-12.188, 0's: 0 Z-trim(100.9): 26 B-trim: 53 in 1/50
Lambda= 0.167790
statistics sampled from 6362 (6385) to 6362 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.191), width: 16
Scan time: 1.130
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs109|chr11 ( 391) 2593 636.5 1.2e-182
CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs109|chr11 ( 372) 2481 609.4 1.7e-174
CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs109|chr1 ( 379) 1181 294.7 9.3e-80
CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs109|chr21 ( 375) 1159 289.4 3.7e-78
CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs109|chr17 ( 433) 1111 277.8 1.3e-74
CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs109|chr17 ( 433) 1110 277.6 1.6e-74
CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs109|chr17 ( 427) 1094 273.7 2.3e-73
CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs109|chr11 ( 419) 1072 268.4 9e-72
CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs109|chr21 ( 423) 1063 266.2 4.1e-71
CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs109|chr2 ( 501) 1048 262.6 6e-70
CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs109|chr1 ( 393) 1037 259.9 3e-69
CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs109|chr11 ( 390) 1016 254.8 1e-67
CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs109|chr19 ( 436) 985 247.3 2e-65
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs109|chr12 ( 424) 978 245.6 6.4e-65
CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs109|chr17 ( 418) 858 216.6 3.5e-56
CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs109|chr17 ( 453) 858 216.6 3.8e-56
CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs109|chr22 ( 445) 850 214.6 1.4e-55
CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs109|chr11 ( 303) 823 208.1 9.3e-54
CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs109|chr2 ( 360) 758 192.3 5.9e-49
CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs109|chr2 ( 235) 645 164.9 6.8e-41
>>CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs109|chr11 (391 aa)
initn: 2593 init1: 2593 opt: 2593 Z-score: 3392.6 bits: 636.5 E(33420): 1.2e-182
Smith-Waterman score: 2593; 100.0% identity (100.0% similar) in 391 aa overlap (1-391:1-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNASSRNVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MNASSRNVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RFIFFVDIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHPSANHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 RFIFFVDIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHPSANHTP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CVENINGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 CVENINGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 KISRPKKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 KISRPKKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TIILDQININFVVDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELVVFLDGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 TIILDQININFVVDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELVVFLDGT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 VESTSATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVETPHCAMCLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VESTSATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVETPHCAMCLY
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KE5 NEKDVRARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NEKDVRARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM
370 380 390
>>CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs109|chr11 (372 aa)
initn: 2481 init1: 2481 opt: 2481 Z-score: 3246.4 bits: 609.4 E(33420): 1.7e-174
Smith-Waterman score: 2481; 100.0% identity (100.0% similar) in 372 aa overlap (20-391:1-372)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MNASSRNVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQS
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 RFIFFVDIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHPSANHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 RFIFFVDIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHPSANHTP
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 CVENINGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 CVENINGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILA
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 KISRPKKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 KISRPKKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 TIILDQININFVVDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELVVFLDGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 TIILDQININFVVDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELVVFLDGT
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 VESTSATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVETPHCAMCLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 VESTSATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVETPHCAMCLY
290 300 310 320 330 340
370 380 390
pF1KE5 NEKDVRARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NEKDVRARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM
350 360 370
>>CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs109|chr1 (379 aa)
initn: 1132 init1: 862 opt: 1181 Z-score: 1545.6 bits: 294.7 E(33420): 9.3e-80
Smith-Waterman score: 1181; 53.4% identity (82.9% similar) in 322 aa overlap (32-353:20-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 NASSRNVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQSR
..: . .: :...:::: :... .. :..:
CCDS11 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHI-ADKR
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FIFFVDIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHPSANHTPC
:... :.::: .:..::::. .: ..: :.::.::..:: :: : :: :. : ::::::
CCDS11 FLYLKDLWTTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPC
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VENINGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILAK
: ... ::.:::::::.:.::::::: ..:.: :: ::: : .: .:.. :. :..:::
CCDS11 VVQVHTLTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAK
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ISRPKKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGET
:.::::::.:: ::..::.....:: ::.:::::.::::::: .. ::::.: : :::.
CCDS11 IARPKKRAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGEN
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 IILDQININFVVDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELVVFLDGTV
: :.:.:..: ::..... :.: :::.:::.:..::. . .. . :::::..:.:::
CCDS11 IRLNQVNVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSG-EGDFELVLILSGTV
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 ESTSATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVETPHCAMCLYN
:::::::::::::.:::.::::.:.: .: . ::: .:: :...:.: .:
CCDS11 ESTSATCQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTV
290 300 310 320 330 340
370 380 390
pF1KE5 EKDVRARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM
CCDS11 RYGDPEKLKLEESLREQAEKEGSALSVRISNV
350 360 370
>>CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs109|chr21 (375 aa)
initn: 1091 init1: 1091 opt: 1159 Z-score: 1516.9 bits: 289.4 E(33420): 3.7e-78
Smith-Waterman score: 1159; 50.8% identity (83.1% similar) in 331 aa overlap (34-363:21-348)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 SSRNVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQSRFI
: . .: :..::.:. :... .:.. ..
CCDS13 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGI-YLL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FFVDIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHPSANHTPCVE
.. :.::::.:.:::::.:.: ..:. .::.::...::.:.:: :: .: .:::::.
CCDS13 YLQDLWTTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIM
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 NINGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILAKIS
....::.:::::::.:.::::: : .::.: :::::. : .. ..:. :. :..::::.
CCDS13 KVDSLTGAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIA
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 RPKKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGETII
::::::.:: ::. :::.:..:::::.:.:::.:::::: .. ::::.: :: ::: :.
CCDS13 RPKKRAETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERIL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 LDQININFVVDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELVVFLDGTVES
:.: ...: ::...:. :.: :.:.:::.:..::. .. ..: ...:::::.:..::::
CCDS13 LNQATVKFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVES
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 TSATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVETPHCAM-CLYNE
:::.:: ::::.:::. ::..:.:.:: .:.::: .:: .: . . .: :.. : .:
CCDS13 TSAVCQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SPDCTFYCADSE
290 300 310 320 330 340
370 380 390
pF1KE5 KDVRARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM
:
CCDS13 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
350 360 370
>>CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs109|chr17 (433 aa)
initn: 1007 init1: 810 opt: 1111 Z-score: 1453.0 bits: 277.8 E(33420): 1.3e-74
Smith-Waterman score: 1111; 46.6% identity (76.6% similar) in 363 aa overlap (1-356:1-358)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNASSRNVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFG----HSRQRAR--LVSKDGRCNIEFG
:.:.:: ... ... :: . :: :.:.: : .:.:.:.:::::.
CCDS11 MTAASRANPYSIVSSEEDGL--HLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIEFA
10 20 30 40 50
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pF1KE5 NVEAQSRFIFFVDIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHP
:.. .:. ...:..:: .:..::: . :: :::.::..::......: : :: :
CCDS11 NMDEKSQR-YLADMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGIIFWVIAVAHGDL-EPAE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SANHTPCVENINGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFM
. ..:::: ...:. .:::::.:::.:::::.:::::.: .:.:... :::.: ::.:::
CCDS11 GRGRTPCVMQVHGFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECPVAVFMVVAQSIVGCIIDSFM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 CGAILAKISRPKKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTT
:::.::..::::::.:. ::.:::.. : :::::. ::.::::: .. .:. ..:.:
CCDS11 IGAIMAKMARPKKRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 VTPEGETIILDQININFVVDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELV
:: ::: : ::::.:. : : . .:..::.:: : ::. ::.: .. . : .:::.:
CCDS11 VTEEGEYIPLDQIDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 VFLDGTVESTSATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVE-TP
:.:.: ::.:. : :.:.::. .:.:::.:: :.. . :. .:..:. .: :: :: ::
CCDS11 VILEGMVEATAMTTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKN-QYKIDYSHFHKTYEVPSTP
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KE5 HCAMCLYNEKDVRARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM
.:.
CCDS11 RCSAKDLVENKFLLPSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRL
360 370 380 390 400 410
>>CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs109|chr17 (433 aa)
initn: 963 init1: 809 opt: 1110 Z-score: 1451.7 bits: 277.6 E(33420): 1.6e-74
Smith-Waterman score: 1110; 46.3% identity (76.4% similar) in 365 aa overlap (1-356:1-358)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNASSRNVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFG----HSRQRAR--LVSKDGRCNIEFG
:.:.:: ... . ... :: . :: :.:.: : .:.:.:.::: :.
CCDS74 MTAASRANPYSIVSLEEDGL--HLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIAFA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE5 NVEAQSRFIFFVDIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHP
:.. .:. ...:..:: .:..::: . :: :::.::..::......: : :: .:
CCDS74 NMDEKSQR-YLADMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGVIFWVIAVAHGDL---EP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE5 SANH--TPCVENINGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINS
. .: :::: ...:. .:::::.:::.:::::.:::::.: .:.:... :::.: ::.:
CCDS74 AEGHGRTPCVMQVHGFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECLVAVFMVVAQSIVGCIIDS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 FMCGAILAKISRPKKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLK
:: :::.::..::::::.:. ::.:::.. : :::::. ::.::::: .. .:. ..:.:
CCDS74 FMIGAIMAKMARPKKRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 TTVTPEGETIILDQININFVVDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFE
:: ::: : ::::.:. : : . .:..::.:: : ::. ::.: .. . : .:::
CCDS74 PRVTEEGEYIPLDQIDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE5 LVVFLDGTVESTSATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVE-
.::.:.: ::.:. : :.:.::. .:.:::.:: :.. . :. .:..:. .: :: ::
CCDS74 IVVILEGMVEATAMTTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKN-QYKIDYSHFHKTYEVPS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390
pF1KE5 TPHCAMCLYNEKDVRARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM
::.:.
CCDS74 TPRCSAKDLVENKFLLPSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFD
360 370 380 390 400 410
>>CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs109|chr17 (427 aa)
initn: 1064 init1: 804 opt: 1094 Z-score: 1430.9 bits: 273.7 E(33420): 2.3e-73
Smith-Waterman score: 1094; 45.8% identity (74.4% similar) in 360 aa overlap (35-390:38-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 SRNVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFGHSRQ--RARLVSKDGRCNIEFGNV-EAQSR
:.:: :.:.:.:::.::..: :: : .:
CCDS11 RYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINVGEKGQR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 FIFFVDIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHPSANHTPC
.. .::.:: .:..::. ..:: ::. ::.::: ... .: .: :: : . :
CCDS11 YL--ADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDA---SKEGKAC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 VENINGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILAK
: ..:..:.:::::.:::.::::::::::..: :.:...::::.: ::..:. ::..::
CCDS11 VSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVMAK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 ISRPKKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGET
...:::: .:..::.::::. : :::::. ::.::::: :. .:. ..:::. .: :::
CCDS11 MAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEGEY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 IILDQININFVVDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELVVFLDGTV
: ::::.:: :.: . .:..::.:: : ::..::.. .. . . . :::.::.:.: :
CCDS11 IPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEGMV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE5 ESTSATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEV-ETPHCAMCLY
:.:. : : :.::. .:.:::.:. :.. . :. :.::. : :: :: .:: :.
CCDS11 EATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKH-YYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARDL
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KE5 NEKDVRARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM
:: .. : . .: ::..
CCDS11 AEKKYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDIDLHNQASVPLEPRPL
370 380 390 400 410 420
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Smith-Waterman score: 1072; 45.3% identity (76.4% similar) in 351 aa overlap (30-379:40-386)
10 20 30 40 50
pF1KE5 MNASSRNVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFGHSRQ-RARLVSKDGRCNIEFGNVEA
::....... : : . :.:.::.. :::.
CCDS84 NQDMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQE
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pF1KE5 QSRFIFFVDIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFHPSANH
:.. :..::..:::::... .: .. .:.:::..:. .:::. :: . . .
CCDS84 TYRYL--SDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGDLDHVG-DQEW
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120 130 140 150 160 170
pF1KE5 TPCVENINGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAI
:::::..:..::::::.::..::::::: .::.: .:.::. :.::: :.:.:: : .
CCDS84 IPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCM
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE5 LAKISRPKKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPE
..:::.:::::.:. ::.::::: : ::::..::..::.: .. . : .::.:. : :
CCDS84 FVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE5 GETIILDQININFVVDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELVVFLD
:: : :.: .:: :.:.. ::..::: : : :...:::..:. : :..::.::.:.
CCDS84 GEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINQKSPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILE
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300 310 320 330 340 350
pF1KE5 GTVESTSATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVETPHCAMC
: ::.:. :::.:.::. :::::.::.:... : : :.::...: : :..:: :
CCDS84 GMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEK-GFYEVDYNTFHDTYETNTPSCCAK
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360 370 380 390
pF1KE5 LYNEKDVRARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM
: ..:. . .: ..
CCDS84 ELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
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Smith-Waterman score: 1063; 46.4% identity (78.1% similar) in 334 aa overlap (37-369:51-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 NVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQSRFIFFV
:. : : :::.::.. :::. :.. .
CCDS42 VESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQRYVRKDGKCNVHHGNVRETYRYL--T
30 40 50 60 70
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pF1KE5 DIWTTVLDLKWRYKMTIFITAFLGSWFFFGLLWYAVAYIHKDLPEFH-PSANHTPCVENI
::.::..:::::... ::. .. .:.:::..:. .:::. :. ... :: :::: :.
CCDS42 DIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGDMDHIEDPSW--TPCVTNL
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130 140 150 160 170 180
pF1KE5 NGLTSAFLFSLETQVTIGYGFRCVTEQCATAIFLLIFQSILGVIINSFMCGAILAKISRP
::..::::::.::..:::::.: .:..: .:.::..::.:: :.:.:: : ...:::.:
CCDS42 NGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSIVNAFMVGCMFVKISQP
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190 200 210 220 230 240
pF1KE5 KKRAKTITFSKNAVISKRGGKLCLLIRVANLRKSLLIGSHIYGKLLKTTVTPEGETIILD
::::.:..:: .:::: : :::::..::..::.: .. . : .::.:. : ::: : :.
CCDS42 KKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSKQTSEGEFIPLN
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 QININFVVDAGNENLFFISPLTIYHVIDHNSPFFHMAAETLLQQDFELVVFLDGTVESTS
: .:: .:.. ::..::: : : :...:::.... : ....:.::.:.: ::.:.
CCDS42 QTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPKEELEIVVILEGMVEATG
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pF1KE5 ATCQVRTSYVPEEVLWGYRFAPIVSKTKEGKYRVDFHNFSKTVEVETPHCAMCLYNEKDV
:::.:.::. :.::::::.:... ..: :.::...: .: :. :: . :
CCDS42 MTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLT-LEDGFYEVDYNSFHETYETSTPSLSAKELAELAS
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370 380 390
pF1KE5 RARMKRGYDNPNFILSEVNETDDTKM
::..
CCDS42 RAELPLSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLEEQTERNGDVANLENESKV
380 390 400 410 420
>>CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs109|chr2 (501 aa)
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Smith-Waterman score: 1048; 47.5% identity (80.5% similar) in 318 aa overlap (37-353:41-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 NVFDTLIRVLTESMFKHLRKWVVTRFFGHSRQRARLVSKDGRCNIEFGNVEAQ-SRFIFF
..: :.:.:.::::.. ::. .. ::..
CCDS22 DYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQDPQQQLVPKKKRQRFVDKNGRCNVQHGNLGSETSRYL--
20 30 40 50 60
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:..::..:::::... ::: .. .:.:.. .:...:: . :: . : .:.:::: :.
CCDS22 SDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRGDLNKAH-VGNYTPCVANV
70 80 90 100 110 120
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.. ::::: .::..:::::.: .:..: .:.:..:::::: :...:. : .. :.:.:
CCDS22 YNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLFQSILGSIVDAFLIGCMFIKMSQP
130 140 150 160 170 180
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CCDS22 KKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMVSAQIRCKLLKSRQTPEGEFLPLD
190 200 210 220 230 240
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CCDS22 QLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLSQRSMQTEQFEIVVILEGIVETTG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]