Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3911
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3911, 710 aa
1>>>pF1KE3911 710 - 710 aa - 710 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8661+/-0.000995; mu= 4.0906+/- 0.060
mean_var=192.5978+/-38.514, 0's: 0 Z-trim(110.5): 75 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.092416
statistics sampled from 11573 (11638) to 11573 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.697), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16
Scan time: 4.290
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2500.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 ( 710) 4700 639.6 4.8e-183
CCDS46544.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 ( 618) 3841 525.0 1.3e-148
CCDS170.1 ARHGEF19 gene_id:128272|Hs108|chr1 ( 802) 1216 175.1 3.6e-43
CCDS34771.1 ARHGEF5 gene_id:7984|Hs108|chr7 (1597) 1222 176.1 3.6e-43
CCDS46.2 ARHGEF16 gene_id:27237|Hs108|chr1 ( 709) 1083 157.3 7e-38
CCDS11139.1 ARHGEF15 gene_id:22899|Hs108|chr17 ( 841) 977 143.3 1.5e-33
CCDS58858.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 ( 791) 819 122.2 3e-27
CCDS46938.1 ARHGEF26 gene_id:26084|Hs108|chr3 ( 871) 819 122.2 3.3e-27
>>CCDS2500.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 (710 aa)
initn: 4700 init1: 4700 opt: 4700 Z-score: 3399.8 bits: 639.6 E(32554): 4.8e-183
Smith-Waterman score: 4700; 99.9% identity (99.9% similar) in 710 aa overlap (1-710:1-710)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 METRESEDLEKTRRKSASDQWNTDNEPAKVKPELLPEKEETSQADQDIQDKEPHCHIPIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 METRESEDLEKTRRKSASDQWNTDNEPAKVKPELLPEKEETSQADQDIQDKEPHCHIPIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 RNSIFNRSIRRKSKAKARDNPERNASCLADSQDNGKSVNEPLTLNIPWSRTPPCRTAMQT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::
CCDS25 RNSIFNRSIRRKSKAKARDNPERNASCLADSQDNGKSVNEPLTLNIPWSRMPPCRTAMQT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 DPGAQEMSESSSTPGNGATPEEWPALADSPTTLTEALRMIHPIPADSWRNLIEQIGLLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 DPGAQEMSESSSTPGNGATPEEWPALADSPTTLTEALRMIHPIPADSWRNLIEQIGLLYQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 EYRDKSTLQEIETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPEEEEEEEEEEEPASPPERKTLPQIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 EYRDKSTLQEIETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPEEEEEEEEEEEPASPPERKTLPQIC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LLSNPHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LLSNPHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 ENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 LLVQNILKRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEFKIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LLVQNILKRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEFKIKS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 VPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 DSAPRGLLRVEELEDQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 DSAPRGLLRVEELEDQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 RTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 RTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQER
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE3 GWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 GWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
670 680 690 700 710
>>CCDS46544.1 NGEF gene_id:25791|Hs108|chr2 (618 aa)
initn: 3839 init1: 3839 opt: 3841 Z-score: 2781.7 bits: 525.0 E(32554): 1.3e-148
Smith-Waterman score: 3841; 98.5% identity (98.8% similar) in 594 aa overlap (117-710:25-618)
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 CLADSQDNGKSVNEPLTLNIPWSRTPPCRTAMQTDPGAQEMSESSSTPGNGATPEEWPAL
: .. : :::::::::::::::::::
CCDS46 MELLAAAFSAACAVDHDSSTSESDARDSAAGHLPGSESSSTPGNGATPEEWPAL
10 20 30 40 50
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 ADSPTTLTEALRMIHPIPADSWRNLIEQIGLLYQEYRDKSTLQEIETRRQQDAEIEDNTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ADSPTTLTEALRMIHPIPADSWRNLIEQIGLLYQEYRDKSTLQEIETRRQQDAEIEDNTN
60 70 80 90 100 110
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 GSPASEDTPEEEEEEEEEEEPASPPERKTLPQICLLSNPHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 GSPASEDTPEEEEEEEEEEEPASPPERKTLPQICLLSNPHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEI
120 130 140 150 160 170
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 LQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLA
180 190 200 210 220 230
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 VSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VSERFLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAA
240 250 260 270 280 290
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 FRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILKRVEERSERECTALDAHKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FRELIAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILKRVEERSERECTALDAHKE
300 310 320 330 340 350
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 LEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LEMVVKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSR
360 370 380 390 400 410
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 TLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLRVEELEDQGQTLANVFIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLRVEELEDQGQTLANVFIL
420 430 440 450 460 470
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 RLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQ
480 490 500 510 520 530
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 QPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 QPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFR
540 550 560 570 580 590
690 700 710
pF1KE3 VHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
::::::::::::::::::::::::
CCDS46 VHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
600 610
>>CCDS170.1 ARHGEF19 gene_id:128272|Hs108|chr1 (802 aa)
initn: 1220 init1: 1180 opt: 1216 Z-score: 888.6 bits: 175.1 E(32554): 3.6e-43
Smith-Waterman score: 1241; 35.3% identity (63.4% similar) in 688 aa overlap (32-687:106-790)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 ETRESEDLEKTRRKSASDQWNTDNEPAKVKPELLPEKEETSQADQDIQDKEPHCHIPIKR
: : : . . : .. : :.
CCDS17 LLWPLSPGGSDTEITSGGMRPSRAGSWPHCPGAQPPALEGPWSPRHTQPQRRASHGSEKK
80 90 100 110 120 130
70 80 90 100
pF1KE3 NSIFNRSIRRKSKAKARDNPERNASCLADSQ---DNGKSVNEP---------LTLNIPWS
.. :..: .. .. :: .: : .: ... :..:: ..:. :
CCDS17 SAW--RKMRVYQREEVPGCPEAHAVFLEPGQVVQEQALSTEEPRVELSGSTRVSLEGPER
140 150 160 170 180 190
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 RTPPCRTAMQTDPGAQEMSESS------STPGNGATPEEWPALADSPTTLTEALRMIHPI
: : .. .....: : :.::. : . .. .. . :. .:
CCDS17 RRFSASELMTRLHSSLRLGRNSAARALISGSGTGAAREGKASGMEARSVEMSGDRVSRPA
200 210 220 230 240 250
170 180 190 200 210
pF1KE3 PADSWRNLIEQIGLLYQE---YRDKSTLQEIETRRQQDA----EIEDNTNGSPASEDTPE
:.:: .. . : :: ..:: .. ..: .. : : ... .. :
CCDS17 PGDSREGDWSEPRLDTQEEPPLGSRSTNERRQSRFLLNSVLYQEYSDVASARELRRQQRE
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 EE---EEEEEEEEPASPPERKTLPQICLLSNPHSR---FNLWQDLPEIRSSGVLEILQPE
:: .: : :: .::. . :. . .. .: :.::::.:..:.:::: :. .
CCDS17 EEGPGDEAEGAEEGPGPPRANLSPSSSFRAQRSARGSTFSLWQDIPDVRGSGVLATLSLR
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 EIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSER
. ::::: :::.:::::: .::.. :.::. . .. . : .. . :::.. .: ..:::
CCDS17 DCKLQEAKFELITSEASYIHSLSVAVGHFLGSAELSECLGAQDKQWLFSKLPEVKSTSER
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 FLLELEHRMEENIVISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFREL
:: .::.:.: ... .:::.: . ::. ::.::.::::::..:: :. : .
CCDS17 FLQDLEQRLEADVLRFSVCDVVLDHCPAFRRVYLPYVTNQAYQERTYQRLLLENPRFPGI
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 IAQLELDPKCRGLPFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILKRVEERSERECTALDAHKELEMV
.:.:: .: :. ::..::::::::::::::.::.:::::. . :: : : : . :. .
CCDS17 LARLEESPVCQRLPLTSFLILPFQRITRLKMLVENILKRTAQGSEDEDMATKAFNALKEL
500 510 520 530 540 550
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 VKACNEGVRKMSRTEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRT
:. :: .:..:.:::..: ..::..:. : :.::..:::...::: ... .. .
CCDS17 VQECNASVQSMKRTEELIHLSKKIHFEGKIFPLISQARWLVRHGELVELAPLPAAPPAKL
560 570 580 590 600 610
520 530 540 550 560
pF1KE3 KKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLRVEELEDQGQTL-ANVFILRLL
: . .:: :::: :.. :. :. :: : . :.:..: . : . ..::.:.::
CCDS17 KLSSKAVYLHLFNDCLLLSRRKELGKFAVFVHAKMAELQVRDLSLKLQGIPGHVFLLQLL
620 630 640 650 660 670
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 ENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPD
... . ..:.: ..:: .::...: :. . :. ::::::::. : : .::
CCDS17 -HGQHMKHQFLLRARTESEKQRWISALCPSSPQEDKEVISEGEDCPQVQCVRTYKALHPD
680 690 700 710 720 730
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 ELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHK
::::: .:::.. :.:::. : :: : :.:: :....::: . . : .::.: ::
CCDS17 ELTLEKTDILSVRTWTSDGWLEGVRLADGEKGWVPQAYVEEISSLSARLRNLRENKRVTS
740 750 760 770 780 790
690 700 710
pF1KE3 MDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
CCDS17 ATSKLGEAPV
800
>>CCDS34771.1 ARHGEF5 gene_id:7984|Hs108|chr7 (1597 aa)
initn: 1121 init1: 801 opt: 1222 Z-score: 888.5 bits: 176.1 E(32554): 3.6e-43
Smith-Waterman score: 1267; 38.9% identity (64.6% similar) in 619 aa overlap (76-687:1001-1585)
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 QDIQDKEPHCHIPIKRNSIFNRSIRRKSKAKARDNPERNASCLADSQDNGKSV--NEPLT
:: . :.: : ....:..: .: .
CCDS34 TTPQQGASGPGRSPVGQARQPEKPSHLHLEKASSWPHRRDSGRPPGDSSGQAVAPSEGAN
980 990 1000 1010 1020 1030
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 LNIPWSRTPPCRTAMQTDPGAQEMSESSSTPGNGATPEEWPALADSPTTLTEALRMIHPI
. ::: : .. . :.:: . : . :. :. .:. . . . .
CCDS34 KHKGWSRQGLRRPSI--------LPEGSSD-SRGPAVEKHPGPSDTVVFREKKPKEVMGG
1040 1050 1060 1070 1080
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 PADSWRNLIEQIGLLYQEYRDKSTLQEIETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPEEEEEEEE
. .::.. :::::: : .::.. :: : ..: : :.: :..
CCDS34 FSRRCSKLINSSQLLYQEYSDVVLNKEIQS--QQRLESLSETPG-PSSPRQPRK------
1090 1100 1110 1120 1130
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 EEEPASPPERKTLPQICLLSNPHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVT
: .. : .. . :. .:::..: .:.: :: . :. ::::. :::..
CCDS34 ----ALVSSESYLQRLSMASSG----SLWQEIPVVRNSTVLLSMTHEDQKLQEVKFELIV
1140 1150 1160 1170 1180
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 SEASYYKSLNLLVSHFMENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENI
::::: .:::. :.::. . .: : .: . ::: . :: :: :: .::. .:.::
CCDS34 SEASYLRSLNIAVDHFQLSTSLRATLSNQEHQWLFSRLQDVRDVSATFLSDLEENFENNI
1190 1200 1210 1220 1230 1240
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 VISDVCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGL
.:::.: .: : ::. ::.::::::::...:.. .. :::.. .:: :: :. :
CCDS34 FSFQVCDVVLNHAPDFRRVYLPYVTNQTYQERTFQSLMNSNSNFREVLEKLESDPVCQRL
1250 1260 1270 1280 1290 1300
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 PFSSFLILPFQRITRLKLLVQNILKRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSR
..::::::::::::::::.::::::.. : .: : ::. ::.... ::..:..: :
CCDS34 SLKSFLILPFQRITRLKLLLQNILKRTQPGSSEEAEATKAHHALEQLIRDCNNNVQSMRR
1310 1320 1330 1340 1350 1360
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 TEQMISIQKKMEFKIKSVPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFN
::..: ...:.::. : :.::.::::.:.::: . ..: :: : . ..: :::
CCDS34 TEELIYLSQKIEFECKIFPLISQSRWLVKSGELTALEF-SASPGLRRKLNTRPVHLHLFN
1370 1380 1390 1400 1410 1420
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 DLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLRVE--ELEDQGQTLANVFILRLLENADDREATYML
: :.. : :... ::: :: . .: : :.. .: :.: : : .:.. .: ...
CCDS34 DCLLLSRPREGSRFLVFDHAPFSSIRGEKCEMKLHGPH-KNLFRLFLRQNTQGAQAEFLF
1430 1440 1450 1460 1470 1480
590 600 610 620 630
pF1KE3 KASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDC---PQVQCVHPYVAQQPDELTLELADI
.. .::: ::...:: :. ::.: :::::.. : .. :::.:: ::.
CCDS34 RTETQSEKLRWISALAMPREEL------DLLECYNSPQVQCLRAYKPRENDELALEKADV
1490 1500 1510 1520 1530
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 LNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQN
. . ....:::. : :: : :::::: ...: : ::..:.::::: ::
CCDS34 VMVTQQSSDGWLEGVRLSDGERGWFPVQQVEFISNPEVRAQNLKEAHRVKTAKLQLVEQQ
1540 1550 1560 1570 1580 1590
700 710
pF1KE3 KDRRKLGSRNRQ
CCDS34 A
>>CCDS46.2 ARHGEF16 gene_id:27237|Hs108|chr1 (709 aa)
initn: 1023 init1: 664 opt: 1083 Z-score: 793.5 bits: 157.3 E(32554): 7e-38
Smith-Waterman score: 1097; 32.2% identity (60.9% similar) in 686 aa overlap (27-692:55-708)
10 20 30 40 50
pF1KE3 METRESEDLEKTRRKSASDQWNTDNEPAKVKPELLPEKEETSQADQDIQDKEPHCH
:: .:. : .:: . . :
CCDS46 LDAGGNPASGLPMVRGSPRVRDDAAFQPQVPAPPQPRP-PGHEEPWPI---VLSTESPAA
30 40 50 60 70 80
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 IPIKRNSIFNRSIRRKSKAKARDNPERNASCLADSQDNGKSVNEPLTLNIPWSRTPPCRT
. . .... .:. ::::. : :. : : . . .: : :
CCDS46 LKLGTQQLIPKSLAVASKAKT---PARHQSFGAAVLSREAARRDPKLLPAPSFSLDD--M
90 100 110 120 130
120 130 140 150 160
pF1KE3 AMQTDPGA------QEMSESSSTPGNGATPEEWPALADSPTTLTEALRMIHP---IPADS
.. :::. ...: .. : : . :. :: . : . .: :: .
CCDS46 DVDKDPGGMLRRNLRNQSYRAAMKGLGKPGGQGDAIQLSPKLQALAEEPSQPHTRSPAKN
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 WRNLIEQIGLLYQEYRDKSTLQEIETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPEEEEEEEEEEEP
..: .. : . : . :::. : . : : :.: . .:
CCDS46 KKTLGRKRGHKGSFKDDPQLYQEIQER---------GLNTSQESDD--------DILDES
200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 ASPPERKTLPQICLLSNPHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEAS
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CCDS46 SSPEGTQKVDATIVVKSYRPAQVTWSQLPEVVELGILDQLSTEERKRQEAMFEILTSEFS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 YYKSLNLLVSHFMENERIRKILHPSEAHILFSNVLDVLAVSERFLLELEHRMEENIVISD
: .::..:: .:......: . : : ::::.::::..:.::. .::.: . .... :
CCDS46 YQHSLSILVEEFLQSKELRATVTQMEHHHLFSNILDVLGASQRFFEDLEQRHKAQVLVED
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 VCDIVYRYAADHFSVYITYVSNQTYQERTYKQLLQEKAAFRELIAQLELDPKCRGLPFSS
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CCDS46 ISDILEEHAEKHFHPYIAYCSNEVYQQRTLQKLISSNAAFREALREIERRPACGGLPMLS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 FLILPFQRITRLKLLVQNILKRVEERSERECTALDAHKELEMVVKACNEGVRKMSRTEQM
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CCDS46 FLILPMQRVTRLPLLMDTLCLKTQGHSERYKAASRALKAISKLVRQCNEGAHRMERMEQM
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 ISIQKKMEF-KIKSVPIISHSRWLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLL
... ...: :.::.:.:: ::::::.::: . : . .. :::::::.:
CCDS46 YTLHTQLDFSKVKSLPLISASRWLLKRGELFLVEETGLFRKIASRPTC---YLFLFNDVL
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570
pF1KE3 VICRQIPGDKYQVFDSAPRGLLRVEELE----------DQGQTLANVFILRLLENADDRE
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CCDS46 VVTKKKSEESYMVQDYAQMNHIQVEKIEPSELPLPGGGNRSSSVPHPFQVTLLRNSEGRQ
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 ATYMLKASSQSEMKRWMTSLAPNRRTKFVSFTSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELA
.:...: :. ::...:. ..: .. ...:. : :::. .. . :.: ::.::. :
CCDS46 EQLLLSSDSASDRARWIVALTHSER-QWQGLSSKG-DLPQVEITKAFFAKQADEVTLQQA
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640 650 660 670 680 690
pF1KE3 DILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSMTEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRS
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CCDS46 DVVLVLQQ-EDGWLYGERLRDGETGWFPEDFARFITSRVAVEGNVRRMERLRVETDV
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700 710
pF1KE3 QNKDRRKLGSRNRQ
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CCDS11 RTSRSRPHPPSIGHPAVVLTSYRSTAERKLLPLLKPPKPTRVRQDATIFGDPPQPDLDLL
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CCDS11 SEDGIQTGDSPDEAPQNTPPATVEGREEEGLEVLKEQNWE-LPLQDEPLYQTYRAAVLSE
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CCDS11 ELW------GVGED---GSPS----------------PANAGDAPTFPR-----PPGPRN
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CCDS11 TLWQELPAVQASGLLDTLSPQERRMQESLFEVVTSEASYLRSLRLLTDTFVLSQALRDTL
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310 320 330 340 350 360
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CCDS11 TPRDHHTLFSNVQRVQGVSERFLATLLSRVRSSPHISDLCDVVHAHAVGPFSVYVDYVRN
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CCDS11 QQYQEETYSRLMDTNVRFSAELRRLQSLPKCERLPLPSFLLLPFQRITRLRMLLQNILRQ
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CCDS11 TEEGSSRQENAQKALGAVSKIIERCSAEVGRMKQTEELIRLTQRLRFHKVKALPLVSWSR
580 590 600 610 620 630
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pF1KE3 WLLKQGELQQMSGPKTSRTLRTKKLFHEIYLFLFNDLLVICRQIPGDKYQVFDSAPRGLL
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CCDS11 RLEFQGELTELGCRRGGVLFASRPRFTPLCLLLFSDLLLITQPKSGQRLQVLDYAHRSLV
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pF1KE3 RVEELEDQGQTLANVFILRLLENADDREATYMLKASSQSEMKRWMTSL-APNRRTKFVSF
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CCDS11 QAQQVPDPSGP--PTFRLSLLSNHQGRPTHRLLQASSLSDMQRWLGAFPTPGPLPCSPDT
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pF1KE3 TSRLLDCPQVQCVHPYVAQQPDELTLELADILNILDKTDDGWIFGERLHDQERGWFPSSM
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CCDS11 IYEDCDCSQELCSESSAPAKTEGRSLESRAAPKHLHKTPEGWLKGL------PGAFPAQL
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pF1KE3 TEEILNPKIRSQNLKECFRVHKMDDPQRSQNKDRRKLGSRNRQ
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CCDS11 VCEVTGEHERRRHLRQNQRLLEAVGSSSGTPNAPPP
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CCDS58 VMEDKEKFSSLGRIKKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDSDEE-SEPKEQKSDE
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pF1KE3 QICLLSNPHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVS
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CCDS58 STFDPYVKYCTNEVYQQRTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVT
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CCDS58 RLPLLMDTICQKTPKDSPKYEVCKRALKEVSKLVRLCNEGARKMERTEMMYTINSQLEFK
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CCDS58 IKPFPLVSSSRWLVKRGELTAYVEDTVLFSRRTSK--QQVYFFLFNDVLIITKKKSEESY
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pF1KE3 QVFDSAPRGLLRVEELEDQ------GQ-----------TLANVFILRLLENADDREATYM
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CCDS58 NVNDYSLRDQLLVESCDNEELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEML
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CCDS58 LGAETQSERARWITALGHSSGKPPADRTCG
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CCDS46 VDNDVDSPGSLRRGLRSTSYRRAVVSGFDFDSPTSSKKKNRMSQPV-----------LKV
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pF1KE3 LYQEYRDKSTLQEIETRRQQDAEIEDNTNGSPASEDTPEEEEEEEEEEEPASPPERKTLP
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CCDS46 VMEDKEKFSSLGRIKKKMLKGQGTFDGEENAVLYQNYKEKALDIDSDEE-SEPKEQKSDE
350 360 370 380 390 400
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pF1KE3 QICLLSNPHSRFNLWQDLPEIRSSGVLEILQPEEIKLQEAMFELVTSEASYYKSLNLLVS
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CCDS46 KIVIHHKPLR--STWSQLSAVKRKGLSQTVSQEERKRQEAIFEVISSEHSYLLSLEILIR
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CCDS46 MFKNSKELSDTMTKTERHHLFSNITDVCEASKKFFIELEARHQNNIFIDDISDIVEKHTA
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CCDS46 STFDPYVKYCTNEVYQQRTLQKLLATNPSFKEVLSRIESHEDCRNLPMISFLILPMQRVT
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CCDS46 IKPFPLVSSSRWLVKRGELTAYVEDTVLFSRRTSK--QQVYFFLFNDVLIITKKKSEESY
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CCDS46 NVNDYSLRDQLLVESCDNEELNSSPGKNSSTMLYSRQSSASHLFTLTVLSNHANEKVEML
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CCDS46 LGAETQSERARWITALGHSSGKPPADRTS----LTQVEIVRSFTAKQPDELSLQVADVVL
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CCDS46 IYQRVSDGWYEGERLRDGERGWFPMECAKEITCQATIDKNVERMGRLLGLETNV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]