FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3718, 2471 aa
1>>>pF1KE3718 2471 - 2471 aa - 2471 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.4485+/-0.00192; mu= -1.0525+/- 0.116
mean_var=538.6481+/-107.588, 0's: 0 Z-trim(110.6): 293 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.055261
statistics sampled from 11438 (11720) to 11438 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.36), width: 16
Scan time: 6.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471) 18249 1472.7 0
CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555) 6850 563.9 3.6e-159
CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321) 5232 434.9 2.3e-120
CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003) 3253 277.0 6.5e-73
CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3144) 1714 154.6 7.4e-36
CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3165) 1714 154.6 7.4e-36
CCDS72880.1 NOTCH2NL gene_id:388677|Hs108|chr1 ( 236) 1641 147.4 8.1e-35
CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218) 1395 128.6 1.8e-28
CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1238) 1209 113.8 5.4e-24
CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1200) 1179 111.4 2.8e-23
CCDS12196.1 FBN3 gene_id:84467|Hs108|chr19 (2809) 1168 111.0 8.8e-23
CCDS58052.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 ( 870) 1114 106.1 8.3e-22
CCDS1390.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1406) 1100 105.2 2.4e-21
CCDS33390.1 DNER gene_id:92737|Hs108|chr2 ( 737) 1069 102.4 8.9e-21
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571) 1027 99.9 2.5e-19
CCDS58053.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1382) 1013 98.3 2.9e-19
CCDS6852.2 CRB2 gene_id:286204|Hs108|chr9 (1285) 966 94.5 3.8e-18
CCDS5313.1 DLL1 gene_id:28514|Hs108|chr6 ( 723) 954 93.2 5.1e-18
CCDS45232.1 DLL4 gene_id:54567|Hs108|chr15 ( 685) 933 91.5 1.6e-17
CCDS10213.2 MEGF11 gene_id:84465|Hs108|chr15 (1044) 895 88.7 1.7e-16
CCDS34222.1 FBN2 gene_id:2201|Hs108|chr5 (2912) 899 89.6 2.6e-16
CCDS4142.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5 (1140) 880 87.5 4e-16
CCDS32232.1 FBN1 gene_id:2200|Hs108|chr15 (2871) 885 88.4 5.5e-16
CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 774 79.3 1.7e-13
CCDS53454.1 CRB1 gene_id:23418|Hs108|chr1 (1294) 748 77.1 6.5e-13
CCDS75111.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1521) 741 76.6 1.1e-12
CCDS75110.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1525) 741 76.6 1.1e-12
CCDS3426.1 SLIT2 gene_id:9353|Hs108|chr4 (1529) 741 76.6 1.1e-12
CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 732 75.9 1.7e-12
CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 726 75.4 2.4e-12
CCDS46562.1 SNED1 gene_id:25992|Hs108|chr2 (1413) 685 72.1 2.2e-11
CCDS74370.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1557) 683 72.0 2.6e-11
CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10 (3623) 689 72.9 3.2e-11
CCDS4897.1 DLK2 gene_id:65989|Hs108|chr6 ( 383) 663 69.7 3.3e-11
CCDS74368.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1587) 670 71.0 5.5e-11
CCDS74369.1 LTBP4 gene_id:8425|Hs108|chr19 (1624) 670 71.0 5.6e-11
CCDS44647.1 LTBP3 gene_id:4054|Hs108|chr11 (1303) 666 70.6 6e-11
>>CCDS908.1 NOTCH2 gene_id:4853|Hs108|chr1 (2471 aa)
initn: 18249 init1: 18249 opt: 18249 Z-score: 7882.8 bits: 1472.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 18249; 100.0% identity (100.0% similar) in 2471 aa overlap (1-2471:1-2471)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPALRPALLWALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MPALRPALLWALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 YCQHRDPCEKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 YCQHRDPCEKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 CHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 TDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 TDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 DFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 ECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 ECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 MANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 LCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 CLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 GAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHGICM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 GAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHGICM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 DGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 VNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 CTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPN
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCFDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPN
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 PCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 PCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 PGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 PGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKN
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 GGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 GGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGS
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 FCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 FCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 KKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 KKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLG
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 YTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 YTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 TCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCARGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 TCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCARGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGER
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 CEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCA
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 VASNMPDGFICRCPPGFSGARCQSSCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCPSPRDCESGCAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VASNMPDGFICRCPPGFSGARCQSSCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCPSPRDCESGCAS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 SPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYCADKARDGVCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYCADKARDGVCD
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 EACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINNQCDELCNTVECLFDNFECQGNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 EACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINNQCDELCNTVECLFDNFECQGNS
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 KTCKYDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 KTCKYDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQ
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 DARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLPGEQEQEVAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLPGEQEQEVAG
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 SKVFLEIDNRQCVQDSDHCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYPLVSVVSESLTPERTQLLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SKVFLEIDNRQCVQDSDHCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYPLVSVVSESLTPERTQLLY
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE3 LLAVAVVIILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRDASNHKRREPVGQDAVGLKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LLAVAVVIILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRDASNHKRREPVGQDAVGLKNL
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE3 SVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQHLEAADIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 SVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQHLEAADIR
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KE3 RTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDSSANIIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 RTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDSSANIIT
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE3 DLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPLHAAVAA
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KE3 DAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVDDHGKSA
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE3 LHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFANRDITD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFANRDITD
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2050 2060 2070 2080 2090 2100
pF1KE3 HMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVICGPNRSFLSLKHTPMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 HMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVICGPNRSFLSLKHTPMG
2050 2060 2070 2080 2090 2100
2110 2120 2130 2140 2150 2160
pF1KE3 KKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSPVDSLESPHTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 KKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSPVDSLESPHTY
2110 2120 2130 2140 2150 2160
2170 2180 2190 2200 2210 2220
pF1KE3 VSDTTSSPMITSPGILQASPNPMLATAAPPAPVHAQHALSFSNLHEMQPLAHGASTVLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VSDTTSSPMITSPGILQASPNPMLATAAPPAPVHAQHALSFSNLHEMQPLAHGASTVLPS
2170 2180 2190 2200 2210 2220
2230 2240 2250 2260 2270 2280
pF1KE3 VSQLLSHHHIVSPGSGSAGSLSRLHPVPVPADWMNRMEVNETQYNEMFGMVLAPAEGTHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VSQLLSHHHIVSPGSGSAGSLSRLHPVPVPADWMNRMEVNETQYNEMFGMVLAPAEGTHP
2230 2240 2250 2260 2270 2280
2290 2300 2310 2320 2330 2340
pF1KE3 GIAPQSRPPEGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPLPTMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 GIAPQSRPPEGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPLPTMY
2290 2300 2310 2320 2330 2340
2350 2360 2370 2380 2390 2400
pF1KE3 QIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSNAAER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 QIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSNAAER
2350 2360 2370 2380 2390 2400
2410 2420 2430 2440 2450 2460
pF1KE3 TPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPGTHMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 TPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPGTHMS
2410 2420 2430 2440 2450 2460
2470
pF1KE3 EPPHNNMQVYA
:::::::::::
CCDS90 EPPHNNMQVYA
2470
>>CCDS43905.1 NOTCH1 gene_id:4851|Hs108|chr9 (2555 aa)
initn: 7355 init1: 4381 opt: 6850 Z-score: 2971.2 bits: 563.9 E(32554): 3.6e-159
Smith-Waterman score: 9945; 53.7% identity (74.2% similar) in 2522 aa overlap (6-2403:2-2499)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MPALRPALLWALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGE
: :: :: : : : :.. .: . : :.: : : ::: : : .:.:
CCDS43 MPPLLAPLLCLALLPALAARGPRCSQPGETCLNGGKC-EAANGTEACVCGGAFVGP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE3 YCQHRDPCEKNRCQNGGTC--VAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNG
:: .:: .. :.:.::: : . .. .: :: ::.: : .. :. . :: ::
CCDS43 RCQDPNPCLSTPCKNAGTCHVVDRRGVADYACSCALGFSGPLCLTPLDNACL-TNPCRNG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 GTCHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQK
::: .:. :.: : :..:: :: .: : :.:::::. : .. :.: .: :
CCDS43 GTCDLLTLTEYKCRCPPGWSGKSCQQADPCASNPCANGGQCLPFEASYICHCPPSFHGPT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 CETDVNEC-DIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCR
:. ::::: . :: :.::::: : :::.: : :: :. ::::.:::: ::::::
CCDS43 CRQDVNECGQKPGLCRHGGTCHNEVGSYRCVCRATHTGPNCERPYVPCSPSPCQNGGTCR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 QTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTE
::: : :: ::::: :..::.::::::.. :.:::.::::::::::::::.::::.:::
CCDS43 PTGDVTHECACLPGFTGQNCEENIDDCPGNNCKNGGACVDGVNTYNCRCPPEWTGQYCTE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 DVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRV
::::: :.:::::::::: : .:::.:::::::.:.:::::::::: :.: :.:: :::
CCDS43 DVDECQLMPNACQNGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCASAACFHGATCHDRV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 ASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVD
::: : ::.:..::::::.::::::::..:. :::::.::. :::::.:: : :..:::
CCDS43 ASFYCECPHGRTGLLCHLNDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYTGPACSQDVD
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 ECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGG
::... .:::::::::.:: :.:.:.::.::.:::::.:.::: :.::::::::::.::
CCDS43 ECSLG-ANPCEHAGKCINTLGSFECQCLQGYTGPRCEIDVNECVSNPCQNDATCLDQIGE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 FTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCS
: :.::::..:::::.. .:: :.::..::.:.::.:.::: :: :::: .:: :.:.:.
CCDS43 FQCICMPGYEGVHCEVNTDECASSPCLHNGRCLDKINEFQCECPTGFTGHLCQYDVDECA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 STPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNP
:::: :::::.: :: : : :. :.::. :: .::.:::::::.:.:.::. ..::.: :
CCDS43 STPCKNGAKCLDGPNTYTCVCTEGYTGTHCEVDIDECDPDPCHYGSCKDGVATFTCLCRP
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 GYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHG
:: : : .:.:: :.:: . : : : :.: : : ::.: :::::.:::::.:: :
CCDS43 GYTGHHCETNINECSSQPCRHGGTCQDRDNAYLCFCLKGTTGPNCEINLDDCASSPCDSG
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 ICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSC
:.: :. : :.: ::.::. :::.:::::.:::..:.:: .:.::: : :::: : :.:
CCDS43 TCLDKIDGYECACEPGYTGSMCNINIDECAGNPCHNGGTCEDGINGFTCRCPEGYHDPTC
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 YSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVN
:.:::: ::::.:: : .:.:::: :: :: : ::....::: :::: ::::: ....
CCDS43 LSEVNECNSNPCVHGACRDSLNGYKCDCDPGWSGTNCDINNNECESNPCVNGGTCKDMTS
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE3 GYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPC
:: :::..::.: :::.::.::::::::::::: ::..:: :.:.::::: .:..:::::
CCDS43 GYVCTCREGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGATCEVVLAPC
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE3 SPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMC
.:.::.:.. :..: ..::..:.: ::::: : .::.::. .:: . . :.::.:.: :
CCDS43 APSPCRNGGECRQSEDYESFSCVCPTGWQGQTCEVDINECVLSPCRHGASCQNTHGGYRC
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KE3 ECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEP
.: :.:: .:: ::::: :::.::::: ::.:: : ::::: : :. :.::: :.:
CCDS43 HCQAGYSGRNCETDIDDCRPNPCHNGGSCTDGINTAFCDCLPGFRGTFCEEDINECASDP
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE3 CKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGF
:.::..:.: :.:::: : :::.:.::::: .:::::::::::::::::::.:::: ::
CCDS43 CRNGANCTDCVDSYTCTCPAGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGF
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE3 TGSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGT
:::.: :..:::.:.:::. ::: :: :.:::.:: :::: :::.::. :. ::::: :
CCDS43 TGSYCQHDVNECDSQPCLHGGTCQDGCGSYRCTCPQGYTGPNCQNLVHWCDSSPCKNGGK
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE3 CVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQC
: : ... .: :::::.: :::::.:::..::.:.:: : .::::.:.:..:::::.:.:
CCDS43 CWQTHTQYRCECPSGWTGLYCDVPSVSCEVAAQRQGVDVARLCQHGGLCVDAGNTHHCRC
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KE3 PLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQ
::::::::. .:::. .:::.::::.:..::: :.:: ::.:::: :.::: ..:::
CCDS43 QAGYTGSYCEDLVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCKCVAGYHGVNCSEEIDECLSHPCQ
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1200 1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE3 NGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDC-------ARGPHCLNGGQCMDRIGGYSC
:::::.:: : .::::: ::.:. :: :.::: .:.:.:.:.: :.:..:::::
CCDS43 NGGTCLDLPNTYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCNPPVDPVSRSPKCFNNGTCVDQVGGYSC
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE3 RCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQ
: :::.:::::::.::::::::...:. .:.: .::. : ::.. :::.::. .. :
CCDS43 TCPPGFVGERCEGDVNECLSNPCDARGTQNCVQRVNDFHCECRAGHTGRRCESVINGCKG
1260 1270 1280 1290 1300 1310
1320 1330 1340 1350 1360
pF1KE3 MPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPPGFSGARCQS---SCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCF
:: :::::::::: ::::.:: :: :: :.. .::...: .: :. .: :.
CCDS43 KPCKNGGTCAVASNTARGFICKCPAGFEGATCENDARTCGSLRCLNGGTCISGPRSPTCL
1320 1330 1340 1350 1360 1370
1370 1380 1390 1400 1410
pF1KE3 CPSPR---DCE----SGC-ASSPCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCEL--YT--
: .: .:. : : ...:: . :.:.: . :.: : : :.: :.. :.
CCDS43 CLGPFTGPECQFPASSPCLGGNPCYNQGTCEPTSESPFYRCLCPAKFNGLLCHILDYSFG
1380 1390 1400 1410 1420 1430
1420 1430 1440 1450 1460
pF1KE3 ------APPSTPPATCLSQYCADKARDGVCDEACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSP
:: .: : . : . ::. ::.::: ::::::::....:: ::..
CCDS43 GGAGRDIPPPLIEEACELPECQEDAGNKVCSLQCNNHACGWDGGDCSLNFNDPWKNCTQS
1440 1450 1460 1470 1480 1490
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KE3 LPCWDYINN-QCDELCNTVECLFDNFECQGNSKTCK--YDKYCADHFKDNHCDQGCNSEE
: :: :... .:: ::.. ::::.:.:: :. ::.:: :::.:.:::::::: :
CCDS43 LQCWKYFSDGHCDSQCNSAGCLFDGFDCQRAEGQCNPLYDQYCKDHFSDGHCDQGCNSAE
1500 1510 1520 1530 1540 1550
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KE3 CGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGE
: ::::::: :: :: ::::.::::::::: ... ::: :. .::::. .:::..:.
CCDS43 CEWDGLDCAEHVPERLAAGTLVVVVLMPPEQLRNSSFHFLRELSRVLHTNVVFKRDAHGQ
1560 1570 1580 1590 1600 1610
1590 1600 1610
pF1KE3 LMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRS-----------------LPGEQE----------QEVA
:..:::: . ..:. . : . ::: .: ..:
CCDS43 QMIFPYYG-REEELRKHPIKRAAEGWAAPDALLGQVKASLLPGGSEGGRRRRELDPMDVR
1620 1630 1640 1650 1660 1670
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KE3 GSKVFLEIDNRQCVQDSDHCFKNTDAAAALLASHAIQGTLSYP--LVSVVSESLTPERTQ
:: :.:::::::::: :..::... .::.:.. : :.:. : . .: ::.. :
CCDS43 GSIVYLEIDNRQCVQASSQCFQSATDVAAFLGALASLGSLNIPYKIEAVQSETVEPPPPA
1680 1690 1700 1710 1720 1730
1680 1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE3 LLYLL--AVAVVIILFIILLGVIMA-KRKRKHGSLWLPEGFTLRRDASNHKRREPVGQDA
:... :.:. ..::.. ::... ::.:.::.::.:::: . .::..:::::.:.:.
CCDS43 QLHFMYVAAAAFVLLFFVGCGVLLSRKRRRQHGQLWFPEGFKVS-EASKKKRREPLGEDS
1740 1750 1760 1770 1780 1790
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE3 VGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQHL
:::: :. ..:.. :. . .: : :: . :: . :. ..: . :: :.: ::::::
CCDS43 VGLKPLK-NASDGALMDDNQNE-W-GDEDLETKKFRFEEPVVLPDLDDQTDHRQWTQQHL
1800 1810 1820 1830 1840
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KE3 EAADIRRTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAEDS
.:::.: . ..: ::::.: ..: .::::::::: ::::.:: ::. . .. .:. ::.
CCDS43 DAADLRMS-AMAPTPPQGEVDADCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETGNSEEE-EDA
1850 1860 1870 1880 1890 1900
1860 1870 1880 1890 1900 1910
pF1KE3 SANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRCPL
: .:.:..::::::. ::::::: ::::::::::.:::::::.:.:::: :::::: ::
CCDS43 PA-VISDFIYQGASLHNQTDRTGETALHLAARYSRSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPL
1910 1920 1930 1940 1950 1960
1920 1930 1940 1950 1960 1970
pF1KE3 HAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNAVD
::::.::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::. .::: .:::::::
CCDS43 HAAVSADAQGVFQILIRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMLEDLINSHADVNAVD
1970 1980 1990 2000 2010 2020
1980 1990 2000 2010 2020 2030
pF1KE3 DHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDHFA
: ::::::::::::::.:...:::::::.:::.:.:::::::::::::::.::.::::::
CCDS43 DLGKSALHWAAAVNNVDAAVVLLKNGANKDMQNNREETPLFLAAREGSYETAKVLLDHFA
2030 2040 2050 2060 2070 2080
2040 2050 2060 2070 2080 2090
pF1KE3 NRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPP--GTVL--TSALSPVICGPNRS
::::::::::::::.:..::::::::::::::.. :: :. : : .::: .:.::
CCDS43 NRDITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVRLLDEYNLVRSPQLHGAPLGGTPTLSPPLCSPNGY
2090 2100 2110 2120 2130 2140
2100 2110 2120 2130 2140 2150
pF1KE3 FLSLKHTPMGKKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSP
. ::: .::: :.::.:. : .::::: : .::::: . : : .:: :::
CCDS43 LGSLKPGVQGKKVRKPSSKG-----LACGSKEAKDLK-ARRKKSQDGKGCLLDSSGMLSP
2150 2160 2170 2180 2190
2160 2170 2180 2190 2200
pF1KE3 VDSLESPHTYVSDTTSSPMITSPGILQASPN-PMLATAAPPAPVHAQHALSFSNLHEMQP
:::::::: :.::..: :.. :: .: ::. :. . : . :. . ::
CCDS43 VDSLESPHGYLSDVASPPLLPSP--FQQSPSVPLNHLPGMPDTHLGIGHLNVAAKPEMAA
2200 2210 2220 2230 2240 2250
2210 2220 2230 2240 2250 2260
pF1KE3 LAHGASTVLPSVSQLLSHHHIVSP-----GSGSAGSLSRL----HPVPVPADWMNRMEVN
:. :. .. . ::: ..: ::.:.:.:. . .:..:.. .
CCDS43 LGGGGRLAFETGPPRLSHLPVASGTSTVLGSSSGGALNFTVGGSTSLNGQCEWLSRLQSG
2260 2270 2280 2290 2300 2310
2270 2280 2290
pF1KE3 --ETQYNEMFGMVL-------APA--EGT----HPGIA-------------PQSRPPEGK
.::: . : : ::. .: : ..: :..:
CCDS43 MVPNQYNPLRGSVAPGPLSTQAPSLQHGMVGPLHSSLAASALSQMMSYQGLPSTRLATQP
2320 2330 2340 2350 2360 2370
2300 2310 2320 2330
pF1KE3 HITTPREPLPPIVTFQ---LIP-----KGSIAQPAGAPQPQSTCPPAVAGPL--------
:.. .. : . .: : : . :. : :::. :..: :
CCDS43 HLVQTQQVQPQNLQMQQQNLQPANIQQQQSLQPPPPPPQPHLGVSSAASGHLGRSFLSGE
2380 2390 2400 2410 2420 2430
2340 2350 2360 2370 2380 2390
pF1KE3 PTMYQIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYPTPPSQHSYASSN
:.. .. .. :: ...::.. . : ::. :...... ::::::::.:
CCDS43 PSQADVQPLG--PSSLAVHTILPQESPALP-TSLPSSLVPPVTAAQFLTPPSQHSYSSP-
2440 2450 2460 2470 2480 2490
2400 2410 2420 2430 2440 2450
pF1KE3 AAERTPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPTPGGAGGGQRGPG
.. :::
CCDS43 -VDNTPSHQLQVPEHPFLTPSPESPDQWSSSSPHSNVSDWSEGVSSPPTSMQSQIARIPE
2500 2510 2520 2530 2540 2550
>>CCDS12326.1 NOTCH3 gene_id:4854|Hs108|chr19 (2321 aa)
initn: 5367 init1: 2004 opt: 5232 Z-score: 2274.5 bits: 434.9 E(32554): 2.3e-120
Smith-Waterman score: 8769; 50.6% identity (70.7% similar) in 2436 aa overlap (67-2450:42-2278)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 NEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPC-EKNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASG
:: . . : ::: :. : .:.: : :
CCDS12 RRPMSPPPPPPPVRALPLLLLLAGPGAAAPPCLDGSPCANGGRCT-QLPSREAACLCPPG
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 FTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCH---MLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHP
..:: :: :: : :: . :.:. . . . : : :: : .:. : ::: :
CCDS12 WVGERCQLED--PCH-SGPCAGRGVCQSSVVAGTARFSCRCPRGFRGPDCSLPDPCLSSP
80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 CANGSTCTTVAN-QFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQ
::.:. :.. . .: :.: :. :..:..::.:: . :.::::::: :::..::::
CCDS12 CAHGARCSVGPDGRFLCSCPPGYQGRSCRSDVDECRVGEPCRHGGTCLNTPGSFRCQCPA
130 140 150 160 170 180
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 GFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQN
:.:: :.. :::::::: :::::::.::.:..: :::::::..:: :.::::.::: :
CCDS12 GYTGPLCENPAVPCAPSPCRNGGTCRQSGDLTYDCACLPGFEGQNCEVNVDDCPGHRCLN
190 200 210 220 230 240
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 GGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWS
::.::::::::::.:::.::::::::::::: ::::::.::::: : ::..:::::::.
CCDS12 GGTCVDGVNTYNCQCPPEWTGQFCTEDVDECQLQPNACHNGGTCFNTLGGHSCVCVNGWT
250 260 270 280 290 300
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 GDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCD
:..::.:::::: : : :.:: :::::: : :: ::.::::::::::.:::::. :.::
CCDS12 GESCSQNIDDCATAVCFHGATCHDRVASFYCACPMGKTGLLCHLDDACVSNPCHEDAICD
310 320 330 340 350 360
400 410 420 430 440 450
pF1KE3 TNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGP
:::.::. ::::: :. :. : .:::::... .::::: :.::::.:.: :.: .::.::
CCDS12 TNPVNGRAICTCPPGFTGGACDQDVDECSIG-ANPCEHLGRCVNTQGSFLCQCGRGYTGP
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 RCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVD
::: :.::: : ::.:.:::::.:: :::.:: :: :..::..:.::::.::::.: : :
CCDS12 RCETDVNECLSGPCRNQATCLDRIGQFTCICMAGFTGTYCEVDIDECQSSPCVNGGVCKD
430 440 450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 KVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENI
.:: :.: :: ::.: .::.:.:.:.:::: :::::.:.:.::::.:: :: :.::..:.
CCDS12 RVNGFSCTCPSGFSGSTCQLDVDECASTPCRNGAKCVDQPDGYECRCAEGFEGTLCDRNV
490 500 510 520 530 540
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 DNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQC
:.:.:::::::.: ::: :..: : ::: :. : .:.::: :.:: . :.:.:::. : :
CCDS12 DDCSPDPCHHGRCVDGIASFSCACAPGYTGTRCESQVDECRSQPCRHGGKCLDLVDKYLC
550 560 570 580 590 600
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 NCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPC
: ::.:::::.:.:::::::: :.: ::::::.:::.::::: ::..:.::::.::
CCDS12 RCPSGTTGVNCEVNIDDCASNPCTFGVCRDGINRYDCVCQPGFTGPLCNVEINECASSPC
610 620 630 640 650 660
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 RKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVG
.:..:..: :::::.:: : : : . : .:: :: : . .:..:.:. :: :
CCDS12 GEGGSCVDGENGFRCLCPPGSLPPLCLPPSHPCAHEPCSHGICYDAPGGFRCVCEPGWSG
670 680 690 700 710 720
760 770 780 790 800
pF1KE3 INCE--VDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGT
: . .. : :.::. ::::.. :..::: : .: .:..
CCDS12 PRCSQSLARDACESQPCRAGGTCSSDGMGFHCTCPPGVQGRQCEL---------------
730 740 750 760 770
810 820 830 840 850 860
pF1KE3 CSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQR
:.::.:::::... :. .:. . .: : :::: :
CCDS12 ------------------------LSPCTPNPCEHGGRCESAPG-QLPVCSCPQGWQGPR
780 790 800
870 880 890 900 910 920
pF1KE3 CTIDIDECISK-PCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMD
: :.::: . :: ::.: : ::. : : :..: .:..::.:: ::: :::::.:
CCDS12 CQQDVDECAGPAPCGPHGICTNLAGSFSCTCHGGYTGPSCDQDINDCDPNPCLNGGSCQD
810 820 830 840 850 860
930 940 950 960 970 980
pF1KE3 GVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNI
::..::: :::::.: .: :..::::.:: . :::.:.: :.:: : :. : :::...
CCDS12 GVGSFSCSCLPGFAGPRCARDVDECLSNPC-GPGTCTDHVASFTCTCPPGYGGFHCEQDL
870 880 890 900 910 920
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KE3 NECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYR
.:. ::::::::::::.::::::: :.::. : :: . : :.:::. :.: . .:
CCDS12 PDCSPSSCFNGGTCVDGVNSFSCLCRPGYTGAHCQHEADPCLSRPCLHGGVCSAAHPGFR
930 940 950 960 970 980
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KE3 CSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIA
:.: ..:: .:::::. :::.::.: : ::: : :::: ::.: ::. .. : :
CCDS12 CTCLESFTGPQCQTLVDWCSRQPCQNGGRCVQTGA--YCLCPPGWSGRLCDIRSLPCREA
990 1000 1010 1020 1030 1040
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KE3 ASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFI
:.. :: .:.::: .: :.. ..::: :: : :::.::...: : ..:::::.:: ..
CCDS12 AAQIGVRLEQLCQAGGQCVDEDSSHYCVCPEGRTGSHCEQEVDPCLAQPCQHGGTCRGYM
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KE3 GGYRCECVPGYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDD
::: :::.:::.: ::: .:::: .::::.::.::::: .. ::::::: :.::: : ::
CCDS12 GGYMCECLPGYNGDNCEDDVDECASQPCQHGGSCIDLVARYLCSCPPGTLGVLCEINEDD
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KE3 CA------RGPHCLNGGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCI
:. ::.::..: :.: .::. : : ::..: :::.::::: :. : . . ::.
CCDS12 CGPGPPLDSGPRCLHNGTCVDLVGGFRCTCPPGYTGLRCEADINECRSGACHAAHTRDCL
1170 1180 1190 1200 1210 1220
1290 1300 1310 1320 1330
pF1KE3 QLTND-YLCVCRSAFTGRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDG---FICRCPPGFS
: . . :.:...:.: .:.: .. : ..:: .:: : : : : : :.: :
CCDS12 QDPGGGFRCLCHAGFSGPRCQTVLSPCESQPCQHGGQCR-PSPGPGGGLTFTCHCAQPFW
1230 1240 1250 1260 1270 1280
1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 GARCQS---SCGQVKCRKGEQCVHTASGPRCFCP---SPRDCES-----------GCASS
: ::. :: ...: : : .: :::: :: : .:.: .::..
CCDS12 GPRCERVARSCRELQCPVGVPCQQTPRGPRCACPPGLSGPSCRSFPGSPPGASNASCAAA
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE3 PCQHGGSCHPQRQPPYYSCQCAPPFSGSRCELYTAPP--STPPATCLSQYCADKARDGVC
:: :::::.: :.. : :: ..: ::: .: : : : : : : : :
CCDS12 PCLHGGSCRPAPLAPFFRCACAQGWTGPRCEAPAAAPEVSEEP-RCPRAACQAKRGDQRC
1350 1360 1370 1380 1390 1400
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE3 DEACNSHACQWDGGDCSLTMENPWANCSSPLPCWDYINN-QCDELCNTVECLFDNFECQ-
:. ::: .: ::::::::.. .:: .: . : :: .:: .:: :.. ::.:::.:.
CCDS12 DRECNSPGCGWDGGDCSLSVGDPWRQCEA-LQCWRLFNNSRCDPACSSPACLYDNFDCHA
1410 1420 1430 1440 1450 1460
1500 1510 1520 1530 1540 1550
pF1KE3 -GNSKTCK--YDKYCADHFKDNHCDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMP
: .::. :.::::::: :..::::::.:::::::::::.. : ::.:.::..::.:
CCDS12 GGRERTCNPVYEKYCADHFADGRCDQGCNTEECGWDGLDCASEVPALLARGVLVLTVLLP
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1560 1570 1580 1590 1600 1610
pF1KE3 PEQLLQDARSFLRALGTLLHTNLRIKRDSQGELMVYPYYGEKSAAMKKQRMTRRSLPGEQ
::.::... .::. :...:.:.::.. :..:. ::.::. . . .. : :. :
CCDS12 PEELLRSSADFLQRLSAILRTSLRFRLDAHGQAMVFPYH--RPSPGSEPRARRELAP---
1530 1540 1550 1560 1570
1620 1630 1640 1650 1660 1670
pF1KE3 EQEVAGSKVFLEIDNRQCVQ--DSDHCFKNTDAAAALL-ASHAIQGT-LSYPLVSVVSES
:: :: :.:::::: :.: ..:::: ....:: : : :.. . ::: .: .:
CCDS12 --EVIGSVVMLEIDNRLCLQSPENDHCFPDAQSAADYLGALSAVERLDFPYPLRDVRGEP
1580 1590 1600 1610 1620 1630
1680 1690 1700 1710 1720
pF1KE3 LTPERTQ--LLYLLAVAVVIILFIILLGVIMAKRKRKHGSLWLPEGFTLRRD-ASNHK-R
: : . . :: ::....:..: :..:::..:.:::.:..::.::::.:..: ::.:: :
CCDS12 LEPPEPSVPLLPLLVAGAVLLLVILVLGVMVARRKREHSTLWFPEGFSLHKDVASGHKGR
1640 1650 1660 1670 1680 1690
1730 1740 1750 1760 1770 1780
pF1KE3 REPVGQDAVGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDR
::::::::.:.::.. : :.: ... :.: : :. :..:.:. .. .:: .:
CCDS12 REPVGQDALGMKNMAKGES---LMGEVATD-WMDTECPEAKRLKVEEPGMGAEE--AVDC
1700 1710 1720 1730 1740
1790 1800 1810 1820 1830 1840
pF1KE3 RPWTQQHLEAADIRRTPSLALTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSD-LS
: :::.:: ::::: .:..::::::.. ..: .::::::::: :::::::. ::. . .
CCDS12 RQWTQHHLVAADIRVAPAMALTPPQGDADADGMDVNVRGPDGFTPLMLASFCGGALEPMP
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1850 1860 1870 1880 1890 1900
pF1KE3 DEDEDAEDSSANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANA
:...:.:.::.::.::. :::.: :.:::::: ::::::::.::::::::::::::.::
CCDS12 TEEDEADDTSASIISDLICQGAQLGARTDRTGETALHLAARYARADAAKRLLDAGADTNA
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1910 1920 1930 1940 1950 1960
pF1KE3 QDNMGRCPLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELIN
::. :: :::.::.:::::::::::::: ::::::: ::.: ::::::::::::: :::
CCDS12 QDHSGRTPLHTAVTADAQGVFQILIRNRSTDLDARMADGSTALILAARLAVEGMVEELIA
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1970 1980 1990 2000 2010 2020
pF1KE3 CQADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEA
.:::::::. :::::::::::::::::: :::::::.::::.:::::::::::::::::
CCDS12 SHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVEATLALLKNGANKDMQDSKEETPLFLAAREGSYEA
1930 1940 1950 1960 1970 1980
2030 2040 2050 2060 2070 2080
pF1KE3 AKILLDHFANRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVIC
::.::::::::.::::.::::::::..:.:.:::::::. . :::: .:.:..:
CCDS12 AKLLLDHFANREITDHLDRLPRDVAQERLHQDIVRLLDQPSGPRSPPGP---HGLGPLLC
1990 2000 2010 2020 2030 2040
2090 2100 2110 2120 2130 2140
pF1KE3 GPNRSFLSLKHTPMG-KKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSES
:. . .:: . : :::::: .:. . . : .: .: .:. :..:
CCDS12 PPGAFLPGLKAAQSGSKKSRRPPGKAGLGPQGP---------RGRGKKLTLACPGPLADS
2050 2060 2070 2080 2090
2150 2160 2170 2180 2190 2200
pF1KE3 SVTLSPVDSLESPHTYVSDTTSSPMITSPGILQASPNPMLATAAPPAPVHAQHALSFSNL
::::::::::.::. . ..: .::: . :. .: : . : :.:...:
CCDS12 SVTLSPVDSLDSPRPF-----GGPP-ASPGGF-----PL---EGPYAAATAT-AVSLAQL
2100 2110 2120 2130 2140
2210 2220 2230 2240 2250 2260
pF1KE3 HEMQPLAHGASTVLPSVSQLLSHHHIVSPGSGSAGSLSRLHPVPVPADWMNRMEVNETQY
:. :. . : . : .: . ::. :.:: :: :: :.
CCDS12 --------GG----PGRAGLGRQ-----PPGGCVLSLGLLNPVAVPLDWA-RL-------
2150 2160 2170
2270 2280 2290 2300 2310 2320
pF1KE3 NEMFGMVLAPAEGTHPGIAPQSRPPEGKHITTPREPLPPIVTFQLIPKGSIAQPAGAPQP
:: : :: .: :.: :: :
CCDS12 -----------------------PP----------PAPPGPSF-LLPL--------APGP
2180 2190
2330 2340 2350 2360 2370 2380
pF1KE3 QSTCPPAVAGPLPTMYQIPEMARLPSVAFPTAMMPQQDGQVAQTILPAYHPFPASVGKYP
: : . :. . . : : .: : :. .::. : .
CCDS12 QLLNP---GTPVSPQERPP-----PYLAVPG------HGE----------EYPAA-GAHS
2200 2210 2220
2390 2400 2410 2420 2430 2440
pF1KE3 TPPSQHSYASSNAAERTPSHSGHLQGEHPYLTPSPESPDQWSSSSPHSASDWSDVTTSPT
.::. . :.:: ::::::::::::..:.: :: : ::::. ..:.
CCDS12 SPPKARFL-------RVPS-------EHPYLTPSPESPEHWASPSPPSLSDWSE--STPS
2230 2240 2250 2260 2270
2450 2460 2470
pF1KE3 PGGAGGGQRGPGTHMSEPPHNNMQVYA
:. : :
CCDS12 PATATGAMATTTGALPAQPLPLSVPSSLAQAQTQLGPQPEVTPKRQVLA
2280 2290 2300 2310 2320
>>CCDS34420.1 NOTCH4 gene_id:4855|Hs108|chr6 (2003 aa)
initn: 2794 init1: 835 opt: 3253 Z-score: 1422.5 bits: 277.0 E(32554): 6.5e-73
Smith-Waterman score: 5205; 38.8% identity (57.9% similar) in 2126 aa overlap (6-2063:4-1820)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MPALRPALLWALLALWLCCAAPAH--ALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFL
:.:: :: : : :.. .. .: : . :::.: : :.. : : :.: :::
CCDS34 MQPPSLLLLLLLLLLLCVSVVRPRGLLCGSFPEPCANGGTCLSLSLGQGTCQCAPGFL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE3 GEYCQHRDPCEKNR-CQNGGTCVA--QAMLGKAT----------CRCASGFTGEDCQYST
:: :: :::.. . :::::.: : : :: . : : ::::: :: .
CCDS34 GETCQFPDPCQNAQLCQNGGSCQALLPAPLGLPSSPSPLTPSFLCTCLPGFTGERCQAKL
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 SHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTYECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQ
:: : : . : ::. . .:.:. :.::..:: : : ..::.::..: .. :
CCDS34 EDPCPPSF-CSKRGRCHIQASGRPQCSCMPGWTGEQCQLRDFCSANPCVNGGVCLATYPQ
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 FSCKCLTGFTGQKCETDVNEC-DIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVP
..:.: :: :. :: ::::: . :: : .: .: : ::.:: :: : : :. :
CCDS34 IQCHCPPGFEGHACERDVNECFQDPGPCPKGTSCHNTLGSFQCLCPVGQEGPRCELRAGP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 CAPSPCVNGGTCR--QTGDFTFE-CNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNT
: : : :::::. : ::. : : ::: : :: : :.: .:.:::::.: ::..:
CCDS34 CPPRGCSNGGTCQLMPEKDSTFHLCLCPPGFIGPDCEVNPDNCVSHQCQNGGTCQDGLDT
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 YNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQ-PNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNGWSGDDCSENID
:.: :: ::: :.:::::: : : :.::::: : :.. ::::.::.: .: ::.:
CCDS34 YTCLCPETWTGWDCSEDVDECETQGPPHCRNGGTCQNSAGSFHCVCVSGWGGTSCEENLD
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 DCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACISNPCHKGALCDTNPLNGQYI
:: :.:.:::::::::.::::.:: :..::::::.: :.:.::: : :.::::.:. .
CCDS34 DCIAATCAPGSTCIDRVGSFSCLCPPGRTGLLCHLEDMCLSQPCHGDAQCSTNPLTGSTL
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KE3 CTCPQGYKGADCTEDVDECAMANS--NPCEHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDIN
: : ::.: : .:.::: ::.. .::::.:.:.:: :.:.: : ::.: ::: : :
CCDS34 CLCQPGYSGPTCHQDLDECLMAQQGPSPCEHGGSCLNTPGSFNCLCPPGYTGSRCEADHN
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE3 ECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQC
:: :.::. .:::: .. : ::: ::..: ::.: ::: : ::.:...: : .: :::
CCDS34 ECLSQPCHPGSTCLDLLATFHCLCPPGLEGQLCEVETNECASAPCLNHADCHDLLNGFQC
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KE3 LCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDP
.: :::.: :. :::.: :.:: ::..: :.:....:.:
CCDS34 ICLPGFSGTRCEEDIDECRSSPCANGGQCQDQPGAFHCKCL-------------------
540 550 560 570
580 590 600 610 620 630
pF1KE3 CHHGQCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTS
::. : :. ..::: :.:: . :.:: ::.
CCDS34 ------------------PGFEGPRCQTEVDECLSDPCPVGASCLDL---------PGA-
580 590 600 610
640 650 660 670 680 690
pF1KE3 GVNCEINFDDCASNPCIHGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCI
. :.: ::::: :.. . :: : :. :
CCDS34 ---------------------------FFCLCPSGFTGQLCEVPL--CAPNLCQPKQICK
620 630 640
700 710 720 730 740 750
pF1KE3 NGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCIHGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDK
. . :.::.: :.: ..: : ::.: . .:.::.::.: .::..
CCDS34 DQKDKANCLCPDGS--PGCAPPEDNCT---CHHGHCQRS----SCVCDVGWTGPECEAEL
650 660 670 680 690
760 770 780 790 800 810
pF1KE3 NECLSNPCQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYT
. :.: :: .:::: .:: ::: :. : .:. .. : :.:::: :.:
CCDS34 GGCISAPCAHGGTCYPQPSGYNCTCPTGYTGPTCSEEMTACHSGPCLNGGSC--------
700 710 720 730 740
820 830 840 850 860 870
pF1KE3 CHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECI
:: ::
CCDS34 ---------------------NP---------SP--------------------------
880 890 900 910 920 930
pF1KE3 SKPCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANPCQNGGSCMDGVNTFSCLCL
:.:.: :::.
CCDS34 --------------GGYYCTCPPSH-----------------------------------
750
940 950 960 970 980 990
pF1KE3 PGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFN
:: .:::. . :.: :: ::
CCDS34 ---TGPQCQTSTDYCVSAPC--------------------------------------FN
760 770
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 GGTCVDGINSFSCLCPVGFTGSFCLHEINE-CSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTG
:::::. ..::::: .:: : : .. :.. :: :..:: :. :: :: ::::
CCDS34 GGTCVNRPGTFSCLCAMGFQGPRCEGKLRPSCADSPCRNRATCQDSPQGPRCLCPTGYTG
780 790 800 810 820 830
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 KNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVE
.::::..::...:: .. :.: .::: .::.: :..: ::. :: .:. :
CCDS34 GSCQTLMDLCAQKPCPRNSHCLQTGPSFHCLCLQGWTGPLCNLPLSSCQKAALSQGIDVS
840 850 860 870 880 890
1120 1130 1140 1150 1160 1170
pF1KE3 HLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLGYTGSYCEEQLDECASNPCQHGATCSDFIGGYRCECVP
::...:.:...: ...:.:: :. :: :..... : : :::.:::: .:: :.:.:
CCDS34 SLCHNGGLCVDSGPSYFCHCPPGFQGSLCQDHVNPCESRPCQNGATCMAQPSGYLCQCAP
900 910 920 930 940 950
1180 1190 1200 1210 1220 1230
pF1KE3 GYQGVNCEYEVDECQNQPCQNGGTCIDLVNHFKCSCPPGTRGLLCEENIDDCARGPHCLN
::.: :: :.: ::.:::.: ::: :
CCDS34 GYDGQNCSKELDACQSQPCHNHGTCT----------P-----------------------
960 970 980
1240 1250 1260 1270 1280 1290
pF1KE3 GGQCMDRIGGYSCRCLPGFAGERCEGDINECLSNPCSSEGSLDCIQLTNDYLCVCRSAFT
. ::. : : :::.: :::::..:::..:: :. : .:.: . : : . :
CCDS34 ------KPGGFHCACPPGFVGLRCEGDVDECLDQPCHPTGTAACHSLANAFYCQCLPGHT
990 1000 1010 1020 1030
1300 1310 1320 1330 1340 1350
pF1KE3 GRHCETFVDVCPQMPCLNGGTCAVASNMPDGFICRCPPGFSGARCQS---SCGQVKCRKG
:. ::. .: : ..::..:::: .... : ::::.:: :: : :. ::: .:..:
CCDS34 GQWCEVEIDPCHSQPCFHGGTCEATAGSPLGFICHCPKGFEGPTCSHRAPSCGFHHCHHG
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1360 1370 1380 1390 1400
pF1KE3 EQCVHTASG---PRCFCPSPR---DCES-----GCAS-SPCQHGGSCHPQRQ--PPYYSC
:. . . ::: : : :: . ::. ::: ..::: : . :
CCDS34 GLCLPSPKPGFPPRCACLSGYGGPDCLTPPAPKGCGPPSPCLYNGSCSETTGLGGPGFRC
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KE3 QCAPPFSGSRCELYTAPPSTPPATCLSQYCADKARDGVCDEACNSHACQWDGGDCSLTME
.: : ::. : : . : .. ::.:: .:.. . .:::::::: .
CCDS34 SCPHSSPGPRCQ-------KPGA----KGCEGRSGDGACDAGCSGPGGNWDGGDCSLGVP
1160 1170 1180 1190 1200
1470 1480 1490 1500 1510
pF1KE3 NPWANCSSPLPCWD-YINNQCDELCNTVECLFDNFECQGNSKTCK--YDKYCADHFKDNH
.:: .: : :: . ..:: :.. :::::...:. . .: ::.:: :::...:
CCDS34 DPWKGCPSHSRCWLLFRDGQCHPQCDSEECLFDGYDCE-TPPACTPAYDQYCHDHFHNGH
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1520 1530 1540 1550 1560 1570
pF1KE3 CDQGCNSEECGWDGLDCAADQPENLAEGTLVIVVLMPPEQLLQDARSFLRALGTLLHTNL
:..:::. :::::: :: .. . .:...:.. : : :. .. :.:. :...:
CCDS34 CEKGCNTAECGWDGGDCRPEDGDPEWGPSLALLVVLSPPALDQQLFALARVLSLTLRVGL
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 RIKRDSQGELMVYPYYG----EKSAAMKKQRMTRRSLPGEQE--QEV----AGSKVFLEI
...: .:. ::::: : :: .. . . .:. : : .:. :: : . .
CCDS34 WVRKDRDGRDMVYPYPGARAEEKLGGTRDPTYQERAAPQTQPLGKETDSLSAGFVVVMGV
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 DNRQCVQD--SDHCFKNTDAA----AALLASHAIQGTLSYPLVSVVSESLT-PERTQLLY
: .: : ...: . ::. : :.. : ::..: .. : : .:: .
CCDS34 DLSRCGPDHPASRCPWDPGLLLRFLAAMAAVGALEPLLPGPLLAVHPHAGTAPPANQLPW
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1690 1700 1710 1720 1730
pF1KE3 LLAVAVVIILFIILLGVIMA-----KRKRKHGSLWLPEGFTLR-RDASN-HKRREPVGQD
. . : .... ::.... .:.:.::.:::: ::: : : : :.:: :.:.:
CCDS34 PVLCSPVAGVILLALGALLVLQLIRRRRREHGALWLPPGFTRRPRTQSAPHRRRPPLGED
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1740 1750 1760 1770 1780 1790
pF1KE3 AVGLKNLSVQVSEANLIGTGTSEHWVDDEGPQPKKVKAEDEALLSEEDDPIDRRPWTQQH
..::: :. . .:.. :. : ::. ..:. . : : . :. .
CCDS34 SIGLKALKPK-AEVDEDGV------VMCSGPE----EGEEVGQAEETGPPSTCQLWSLSG
1510 1520 1530 1540 1550
1800 1810 1820 1830 1840 1850
pF1KE3 LEAADIRRTPSLA-LTPPQAEQEVDVLDVNVRGPDGCTPLMLASLRGGSSDLSDEDEDAE
.: :. : ::::: :.:... :...::::: :::: : : . : . :
CCDS34 GCGA----LPQAAMLTPPQ-ESEMEAPDLDTRGPDGVTPLMSAVCCGEVQ--SGTFQGAW
1560 1570 1580 1590 1600
1860 1870 1880 1890 1900 1910
pF1KE3 DSSANIITDLVYQGASLQAQTDRTGEMALHLAARYSRADAAKRLLDAGADANAQDNMGRC
. . :. :: ::.: ::: ::::::.:: ::.:::.:::. : : ::
CCDS34 LGCPEPWEPLLDGGACPQAHTVGTGETPLHLAARFSRPTAARRLLEAGANPNQPDRAGRT
1610 1620 1630 1640 1650 1660
1920 1930 1940 1950 1960 1970
pF1KE3 PLHAAVAADAQGVFQILIRNRVTDLDARMNDGTTPLILAARLAVEGMVAELINCQADVNA
::::::::::. : :.:.:.: : .::: .::::::.:::::::: .: ::: ::::.:
CCDS34 PLHAAVAADAREVCQLLLRSRQTAVDARTEDGTTPLMLAARLAVEDLVEELIAAQADVGA
1670 1680 1690 1700 1710 1720
1980 1990 2000 2010 2020 2030
pF1KE3 VDDHGKSALHWAAAVNNVEATLLLLKNGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSYEAAKILLDH
: ::.::::::::::..:. ::. ::..: :::.:.::::::::::. :.:..::
CCDS34 RDKWGKTALHWAAAVNNARAARSLLQAGADKDAQDNREQTPLFLAAREGAVEVAQLLLGL
1730 1740 1750 1760 1770 1780
2040 2050 2060 2070 2080 2090
pF1KE3 FANRDITDHMDRLPRDVARDRMHHDIVRLLDEYNVTPSPPGTVLTSALSPVICGPNRSFL
: :.. :. : :::..: : :.. ::.
CCDS34 GAARELRDQAGLAPADVAHQRNHWDLLTLLEGAGPPEARHKATPGREAGPFPRARTVSVS
1790 1800 1810 1820 1830 1840
2100 2110 2120 2130 2140 2150
pF1KE3 SLKHTPMGKKSRRPSAKSTMPTSLPNLAKEAKDAKGSRRKKSLSEKVQLSESSVTLSPVD
CCDS34 VPPHGGGALPRCRTLSAGAGPRGGGACLQARTWSVDLAARGGGAYSHCRSLSGVGAGGGP
1850 1860 1870 1880 1890 1900
>>CCDS47445.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3144 aa)
initn: 1551 init1: 802 opt: 1714 Z-score: 757.2 bits: 154.6 E(32554): 7.4e-36
Smith-Waterman score: 2021; 34.1% identity (57.3% similar) in 911 aa overlap (177-1035:403-1246)
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 ACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPG-HCQHGGTCLNLPGSY
..:: ...: . . .: . :.:. : .
CCDS47 SCESFPLRNNATCKKCEKDYPCSCISGFTEKNCEKAIDHCKLLSINCLNEEWCFNIIGRF
380 390 400 410 420 430
210 220 230 240 250
pF1KE3 QCQCPQGFTGQYC---DSLYVPCAPSPCVNG----GTCRQTGDFTFECNCLPGF---EGS
. : : : . : ..:. : : : :.. : :: :: ::
CCDS47 KYVCIPGCTKNPCWFLKNVYL-IHQHLCYCGVTFHGICQDKGPAQFEYVWQLGFAGSEGE
440 450 460 470 480 490
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 TCERNIDD--CPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGG
:. :: : . .. :. . : : : . :... : ::
CCDS47 KCQGVIDAYFFLAANCTEDATYVNDPEDNNSSC---WFPHEGTKEI---------CANGC
500 510 520 530
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 TCANRNGG--YGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGL
.: ... . : .: :.:. :: : : ..: :.. : : . :
CCDS47 SCLSEEDSQEYRYLCFLRWAGNMYLENTTDDQENECQHEAVCKDEINRPRCSCSLSYIGR
540 550 560 570 580 590
380 390 400 410 420
pF1KE3 LCHLD-DACISNPCHK-GALCDTNPLNGQYICTCP--QGYKGADCTEDVDECAMANSNPC
:: .. : :..: . .:: : .. :.: : :. : :...: .: :
CCDS47 LCVVNVDYCLGNHSISVHGLC----LALSHNCNCSGLQRYERNICEIDTEDC---KSASC
600 610 620 630 640 650
430 440 450 460 470
pF1KE3 EHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIG-----------
... .. : : .:. :. : .::.::.:: : ::.: :::.:. :
CCDS47 KNGTTSTHLRGYFFRKCVPGFKGTQCEIDIDECASHPCKNGATCIDQPGNYFCQCVPPFK
660 670 680 690 700 710
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 ---GFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDI
::.::: ::. :..:: .:..: : : .:. : : .::.: . : :. .
CCDS47 VVDGFSCLCNPGYVGIRCEQDIDDCILNACEHNSTCKDLHLSYQCVCLSDWEGNFCEQES
720 730 740 750 760 770
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 DDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQ-CQDGI--DS
..:. .:: :.. : : ..:.:.:..:.:: : :.:..:: ::: .: :... .
CCDS47 NECKMNPCKNNSTCTDLYKSYRCECTSGWTGQNCSEEINECDSDPCMNGGLCHESTIPGQ
780 790 800 810 820 830
600 610 620 630 640
pF1KE3 YTCICNPGYMGAICSDQIDEC--YSSPCLNDGRCIDLVNGYQ-CNCQPGTSGVNCEINFD
..:.: : : : .: .. . : .:: :.. :. ::.. : : :. : ::::.
CCDS47 FVCLCPPLYTGQFCHQRYNLCDLLHNPCRNNSTCLALVDANQHCICREEFEGKNCEIDVK
840 850 860 870 880 890
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 DCASNPCI-HGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRC
:: : .: : : .: . :.: :::.:. :.:.:.::.:.::....::.. .: : :
CCDS47 DCLFLSCQDYGDCEDMVNNFRCICRPGFSGSLCEIEINECSSEPCKNNGTCVDLTNRFFC
900 910 920 930 940 950
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 ICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCI-HGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNP
: : : : .::.: .::. . ::. .::.::: :..:::::.. .::::.:
CCDS47 NCEPEYHGPFCELDVNKCKISPCLDEENCVYRTDGYNCLCAPGYTGINCEINLDECLSEP
960 970 980 990 1000 1010
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 CQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPY
: . :.: . .: : : ::.:: : .:..: ..: :::::. : :.. :. :
CCDS47 CLHDGVCIDGINHYTCDCKSGFFGTHCETNANDCLSNPCLH-GRCTELINEY--------
1020 1030 1040 1050 1060
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 TGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNH
::: :. : : . : : : :..: : ::::.
CCDS47 ----------PCS---CD------------------ADGTSTQ-CKIKINDCTSIPCMNE
1070 1080 1090
890 900 910 920 930
pF1KE3 GLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANP------CQNGGSCMDGV-NTFSCLCL
:.:... .. : :: :..: ::..::.: :.: : ::: :.:: .::.: ::
CCDS47 GFCQKSAHGFTCICPRGYTGAYCEKSIDNC-AEPELNSVICLNGGICVDGPGHTFDCRCL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
940 950 960 970 980 990
pF1KE3 PGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFN
:::.:. :. ..::: : :: .:. : :..:.:.:::: :..: ::::.. :: .:: .
CCDS47 PGFSGQFCEININECSSSPCLHGADCEDHINGYVCKCQPGWSGHHCENEL-ECIPNSCVH
1160 1170 1180 1190 1200
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 GGTCVDGINSFSCLCPVGFT----GSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLG
:... . .::: :: : .: :: . . ::
CCDS47 E-LCMENEPGSTCLCTPGFMTCSIGLLCGDEIRRIT---CLTPIFQRTDPISTQTYTIPP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 YTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGV
CCDS47 SETLVSSFPSIKATRIPAIMDTYPVDQGPKQTGIVKHDILPTTGLATLRISTPLESYLLQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
>>CCDS78156.1 EYS gene_id:346007|Hs108|chr6 (3165 aa)
initn: 1551 init1: 802 opt: 1714 Z-score: 757.2 bits: 154.6 E(32554): 7.4e-36
Smith-Waterman score: 2021; 34.1% identity (57.3% similar) in 911 aa overlap (177-1035:403-1246)
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 ACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPG-HCQHGGTCLNLPGSY
..:: ...: . . .: . :.:. : .
CCDS78 SCESFPLRNNATCKKCEKDYPCSCISGFTEKNCEKAIDHCKLLSINCLNEEWCFNIIGRF
380 390 400 410 420 430
210 220 230 240 250
pF1KE3 QCQCPQGFTGQYC---DSLYVPCAPSPCVNG----GTCRQTGDFTFECNCLPGF---EGS
. : : : . : ..:. : : : :.. : :: :: ::
CCDS78 KYVCIPGCTKNPCWFLKNVYL-IHQHLCYCGVTFHGICQDKGPAQFEYVWQLGFAGSEGE
440 450 460 470 480 490
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 TCERNIDD--CPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGG
:. :: : . .. :. . : : : . :... : ::
CCDS78 KCQGVIDAYFFLAANCTEDATYVNDPEDNNSSC---WFPHEGTKEI---------CANGC
500 510 520 530
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 TCANRNGG--YGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGL
.: ... . : .: :.:. :: : : ..: :.. : : . :
CCDS78 SCLSEEDSQEYRYLCFLRWAGNMYLENTTDDQENECQHEAVCKDEINRPRCSCSLSYIGR
540 550 560 570 580 590
380 390 400 410 420
pF1KE3 LCHLD-DACISNPCHK-GALCDTNPLNGQYICTCP--QGYKGADCTEDVDECAMANSNPC
:: .. : :..: . .:: : .. :.: : :. : :...: .: :
CCDS78 LCVVNVDYCLGNHSISVHGLC----LALSHNCNCSGLQRYERNICEIDTEDC---KSASC
600 610 620 630 640 650
430 440 450 460 470
pF1KE3 EHAGKCVNTDGAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIG-----------
... .. : : .:. :. : .::.::.:: : ::.: :::.:. :
CCDS78 KNGTTSTHLRGYFFRKCVPGFKGTQCEIDIDECASHPCKNGATCIDQPGNYFCQCVPPFK
660 670 680 690 700 710
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 ---GFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDI
::.::: ::. :..:: .:..: : : .:. : : .::.: . : :. .
CCDS78 VVDGFSCLCNPGYVGIRCEQDIDDCILNACEHNSTCKDLHLSYQCVCLSDWEGNFCEQES
720 730 740 750 760 770
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 DDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQ-CQDGI--DS
..:. .:: :.. : : ..:.:.:..:.:: : :.:..:: ::: .: :... .
CCDS78 NECKMNPCKNNSTCTDLYKSYRCECTSGWTGQNCSEEINECDSDPCMNGGLCHESTIPGQ
780 790 800 810 820 830
600 610 620 630 640
pF1KE3 YTCICNPGYMGAICSDQIDEC--YSSPCLNDGRCIDLVNGYQ-CNCQPGTSGVNCEINFD
..:.: : : : .: .. . : .:: :.. :. ::.. : : :. : ::::.
CCDS78 FVCLCPPLYTGQFCHQRYNLCDLLHNPCRNNSTCLALVDANQHCICREEFEGKNCEIDVK
840 850 860 870 880 890
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 DCASNPCI-HGICMDGINRYSCVCSPGFTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRC
:: : .: : : .: . :.: :::.:. :.:.:.::.:.::....::.. .: : :
CCDS78 DCLFLSCQDYGDCEDMVNNFRCICRPGFSGSLCEIEINECSSEPCKNNGTCVDLTNRFFC
900 910 920 930 940 950
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 ICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCI-HGNCTGGLSGYKCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNP
: : : : .::.: .::. . ::. .::.::: :..:::::.. .::::.:
CCDS78 NCEPEYHGPFCELDVNKCKISPCLDEENCVYRTDGYNCLCAPGYTGINCEINLDECLSEP
960 970 980 990 1000 1010
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 CQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPY
: . :.: . .: : : ::.:: : .:..: ..: :::::. : :.. :. :
CCDS78 CLHDGVCIDGINHYTCDCKSGFFGTHCETNANDCLSNPCLH-GRCTELINEY--------
1020 1030 1040 1050 1060
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 TGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNH
::: :. : : . : : : :..: : ::::.
CCDS78 ----------PCS---CD------------------ADGTSTQ-CKIKINDCTSIPCMNE
1070 1080 1090
890 900 910 920 930
pF1KE3 GLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDCLANP------CQNGGSCMDGV-NTFSCLCL
:.:... .. : :: :..: ::..::.: :.: : ::: :.:: .::.: ::
CCDS78 GFCQKSAHGFTCICPRGYTGAYCEKSIDNC-AEPELNSVICLNGGICVDGPGHTFDCRCL
1100 1110 1120 1130 1140 1150
940 950 960 970 980 990
pF1KE3 PGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFN
:::.:. :. ..::: : :: .:. : :..:.:.:::: :..: ::::.. :: .:: .
CCDS78 PGFSGQFCEININECSSSPCLHGADCEDHINGYVCKCQPGWSGHHCENEL-ECIPNSCVH
1160 1170 1180 1190 1200
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KE3 GGTCVDGINSFSCLCPVGFT----GSFCLHEINECSSHPCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLG
:... . .::: :: : .: :: . . ::
CCDS78 E-LCMENEPGSTCLCTPGFMTCSIGLLCGDEIRRIT---CLTPIFQRTDPISTQTYTIPP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KE3 YTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSGWAGAYCDVPNVSCDIAASRRGV
CCDS78 SETLVSSFPSIKATRIPAIMDTYPVDQGPKQTGIVKHDILPTTGLATLRISTPLESYLLQ
1270 1280 1290 1300 1310 1320
>>CCDS72880.1 NOTCH2NL gene_id:388677|Hs108|chr1 (236 aa)
initn: 1641 init1: 1641 opt: 1641 Z-score: 738.5 bits: 147.4 E(32554): 8.1e-35
Smith-Waterman score: 1641; 99.5% identity (99.5% similar) in 211 aa overlap (40-250:1-211)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 WALLALWLCCAAPAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPCE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPCE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 KNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KNRCQNGGTCVAQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTY
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ECTCQVGFTGKECQWTDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIP
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 GHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCL
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GHCQHGGTCLNLPGSYQCQCLQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 PGFEGSTCERNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNAC
:
CCDS72 PETVRRGTELWERDREVWNGKEHDEN
220 230
>>CCDS13112.1 JAG1 gene_id:182|Hs108|chr20 (1218 aa)
initn: 2044 init1: 790 opt: 1395 Z-score: 624.4 bits: 128.6 E(32554): 1.8e-28
Smith-Waterman score: 2031; 34.0% identity (57.5% similar) in 892 aa overlap (117-989:173-960)
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 KATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTYECT-CQVGF-TGKECQW
: :. :. . : :: .: :.
CCDS13 NDTVQPDSIIEKASHSGMINPSRQWQTLKQNTGVAHFEYQIRVTCDDYYYGFGCNKFCRP
150 160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 TDACLSHPCANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGS
: ..: .: .:. :. :. : .:. . : : . :.: .:::.
CCDS13 RDDFFGH-----YACDQNGNK---TCMEGWMGPECNRAI--CR-QGCSPKHGSC-KLPGD
210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 YQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSP-CVNGGTCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDD
:.: :. : :::. : : : ::.: : . ..: : .. :. :.....
CCDS13 --CRCQYGWQGLYCDK----CIPHPGCVHG-ICNEP----WQCLCETNWGGQLCDKDLNY
260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 CPNHR-CQNGGVCVD-GVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGG
: .:. : :::.: . : . :.: :: ..: : :: .: :.: :.: . . :
CCDS13 CGTHQPCLNGGTCSNTGPDKYQCSCPEGYSGPNCEIAEHACLSDP--CHNRGSCKETSLG
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 YGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLDDACIS
. : : ::.: :: :::::. .:. :.:: : : .:.:.::
CCDS13 FECECSPGWTGPTCSTNIDDCSPNNCSHGGTCQDLVNGFKCVCP----------------
360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 NPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFH
:: . : : :..:: ...:: .: .: : ....
CCDS13 ----------------------PQ-WTGKTCQLDANEC---EAKPCVNAKSCKNLIASYY
410 420 430
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 CECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSN
:.:: :. : :...::.: .. :::::.: : ..:. :.: ::. : ::: .:.:: ::
CCDS13 CDCLPGWMGQNCDININDCLGQ-CQNDASCRDLVNGYRCICPPGYAGDHCERDIDECASN
440 450 460 470 480 490
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 PCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATG
::.:.:.: ...:::::::: ::.: .::.::: : .:: :::.: .. . : :.:
CCDS13 PCLNGGHCQNEINRFQCLCPTGFSGNLCQLDIDYCEPNPCQNGAQCYNRASDYFCKCPED
500 510 520 530 540 550
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 FTGVLCEENIDNCDPDPCHHGQCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGR
. : : . :.: :: . ::: :. .. . . . :. : :.
CCDS13 YEGKNCSHLKDHCRTTPC------EVIDS----CTVAMASNDTPEGVRYISSNVCGPHGK
560 570 580 590 600
630 640 650 660 670
pF1KE3 CIDLVNG-YQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHG-ICMDGINRYSCVCSPGFTGQRC
: . .: . :.:. : .:. :. :..:: :::: .: :.::.: :.:.:: :. : :
CCDS13 CKSQSGGKFTCDCNKGFTGTYCHENINDCESNPCRNGGTCIDGVNSYKCICSDGWEGAYC
610 620 630 640 650 660
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 NIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPCIHGN-CTGGL
. .:..:..:::..:.:: . :: : : : .: . .:.:. ..: : .:. :
CCDS13 ETNINDCSQNPCHNGGTCRDLVNDFYCDCKNGWKGKTCHSRDSQCDEATCNNGGTCYDEG
670 680 690 700 710 720
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 SGYKCLCDAGWVGINCEVDKNE-CLSNPCQNGGTCDNLVNG--YRCTCKKGFKGYNCQVN
...::.: .:: : .:.. .: :: :::.::::: .::: . :.::.:..: : :
CCDS13 DAFKCMCPGGWEGTTCNIARNSSCLPNPCHNGGTC--VVNGESFTCVCKEGWEGPICAQN
730 740 750 760 770 780
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 IDECASNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFE
..:. .:: :.::: : . : :.:. ..: .:. . :. .:: .:.: . :
CCDS13 TNDCSPHPCYNSGTCVDGDNWYRCECAPGFAGPDCRININECQSSPCAFGATCVDEIN--
790 800 810 820 830 840
860 870 880 890 900 910
pF1KE3 SYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDIDDC
.: :.: :: .: .: .: ..::. :.:: . : : . : :::
CCDS13 GYRCVCPPGHSGAKC----QEVSGRPCI-------TMGSVI---PDG-AKWD-----DDC
850 860 870 880
920 930 940 950 960
pF1KE3 LANPCQNGGSCMDGV--NTFSCLCLPGFT----GDKCQTDMNE-CLSEPCKNGGTC-SDY
. : :: . : . :: : . :..: ... :. .:: . : : :.
CCDS13 NTCQCLNGRIACSKVWCGPRPCLLHKGHSECPSGQSCIPILDDQCFVHPCTGVGECRSSS
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 VNSYTCKCQAGFDGVHCENNINECTESSCFNGGTCVDGINSFSCLCPVGFTGSFCLHEIN
.. :: . :. . .: :
CCDS13 LQPVKTKCTS--DSYYQDNCANITFTFNKEMMSPGLTTEHICSELRNLNILKNVSAEYSI
950 960 970 980 990
>>CCDS9998.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1238 aa)
initn: 2407 init1: 755 opt: 1209 Z-score: 544.2 bits: 113.8 E(32554): 5.4e-24
Smith-Waterman score: 2006; 33.9% identity (58.1% similar) in 908 aa overlap (183-1070:172-1017)
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 CANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCLNLPGSYQCQCPQG
.: : . .: .: . . .: ..
CCDS99 FTLIVEAWDWDNDTTPNEELLIERVSHAGMINPEDRWKSLHFSGHVAHLELQIRVRCDEN
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 FTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGG-TCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCERNIDDCPNHRCQ-
. . :... : : : :: : :. . :. :. :. :.. . : .. :.
CCDS99 YYSATCNKF---CRPRNDFFGHYTCDQYGNKA----CMDGWMGKECKEAV--C-KQGCNL
210 220 230 240 250
280 290 300 310 320
pF1KE3 -NGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANRNGGYGCVCVNG
.:: : : .::: : :.:: :::. :. : .: .:.. . : : ..
CCDS99 LHGGCTVPG----ECRCSYGWQGRFC----DECVPYPG-CVHG-SCVE---PWQCNCETN
260 270 280 290
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 WSGDDCSENIDDC-AFASCTPGSTCID-RVASFSCMCPEGKAGLLCH-LDDACISNPCHK
:.: :..... : . :: :.:::. . .. : ::.: .: :. . :: :::: .
CCDS99 WGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCINAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNPCAN
300 310 320 330 340 350
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 GALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTDGAFHCECLK
:. : : .: . : ::.:..: :. :.:::: :::: .: ::. .:.: : .
CCDS99 GGSCHEVP-SG-FECHCPSGWSGPTCALDIDECA---SNPCAAGGTCVDQVDGFECICPE
360 370 380 390 400 410
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 GYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGGFTCLCMPGFKGVHCELEINECQSNPCVNN
..: :..: :::.. :: : .: . :::. : :.::.::..:....:.:... : ..
CCDS99 QWVGATCQLDANECEGKPCLNAFSCKNLIGGYYCDCIPGWKGINCHINVNDCRGQ-CQHG
420 430 440 450 460 470
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 GQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYECQCATGFTGVL
: : : :: .::.:: :: : :... :.:.:.:: .:. : : .:..:.: ::.: :
CCDS99 GTCKDLVNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPL
480 490 500 510 520 530
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 CEENIDNCDPDPCHHG-QCQDGIDSYTCICNPGYMGAICSDQIDECYSSPCLNDGRCIDL
:: ..: :.:.::..: .: . .: : : . : :: . : .. : : ::
CCDS99 CEVDVDLCEPSPCRNGARCYNLEGDYYCACPDDFGGKNCSVPREPCPGGAC----RVID-
540 550 560 570 580
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 VNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPC-IHGICMD--GINRYSCVCSPGFTGQRCNID
: . :: :. ::. : :: :.. : : .::.:. :::: :. .
CCDS99 --GCGSDAGPGMPGTA--------ASGVCGPHGRCVSQPGGN-FSCICDSGFTGTYCHEN
590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 IDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVNECLSNPC-IHGNCTGGLSGY
::.: ..:::.:.:::. :..:::.:: : . : .. :.:: .:: .: : .. .
CCDS99 IDDCLGQPCRNGGTCIDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDF
640 650 660 670 680 690
750 760 770 780 790 800
pF1KE3 KCLCDAGWVGINCEVDKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYRCTCKKGFKGYNCQVNIDE-CA
: :: :: : .:. . .: . :.::::: . . .::.: :.:: .: : . :
CCDS99 YCACDDGWKGKTCHSREFQCDAYTCSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAKNSSCL
700 710 720 730 740 750
810 820 830 840 850 860
pF1KE3 SNPCLNQGTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSPNPCENAAVCKESPNFESYTCL
:::.: ::: . ....: : . :..: :.: :: :...: .. :. . :
CCDS99 PNPCVNGGTCVGSGASFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNW--FRCE
760 770 780 790 800 810
870 880 890 900 910
pF1KE3 CAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCECPPGFSGMDCEEDID---DCLA
::::. : : :.:::: :.:: . : . ..: : :::: .: :.: : .: .
CCDS99 CAPGFAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWS
820 830 840 850 860 870
920 930 940 950 960 970
pF1KE3 --NPCQNGGSCMDGVNTFSCLCLPGFTGDKCQTDMNECLSEPCKNGGTCSDYVNSYTCKC
.: .:.: .. : :: :: : :. : .:: .: .. . .:
CCDS99 RGTPFPHGSSWVEDCN--SCRCLDGRRD--CSKVW--CGWKPCLLAGQ----PEALSAQC
880 890 900 910 920
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE3 QAGFDGVHC-ENNINECTESSCFNGGTC-VDGINSFSCLCPVGFTGSFCLH-EINECSSH
: .: :. ..: . : : : .. : :: : . : . .. .:
CCDS99 PLG---QRCLEKAPGQCLRPPCEAWGECGAEEPPSTPCLPRSGHLDNNCARLTLHFNRDH
930 940 950 960 970 980
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE3 PCLNEGTCVDGLGTYRCSCPLGYTGKNCQTLVNLCSRSPCKNKGTCVQKKAESQCLCPSG
. .:: : .. . : : . . :: ::.:.
CCDS99 --VPQGTTVGAICSGIRSLPATRAVARDRLLVLLCDRASSGASAVEVAVSFSPARDLPDS
990 1000 1010 1020 1030
1100 1110 1120 1130 1140 1150
pF1KE3 WAGAYCDVPNVSCDIAASRRGVLVEHLCQHSGVCINAGNTHYCQCPLGYTGSYCEEQLDE
CCDS99 SLIQGAAHAIVAAITQRGNSSLLLAVTEVKVETVVTGGSSTGLLVPVLCGAFSVLWLACV
1040 1050 1060 1070 1080 1090
>>CCDS9999.1 JAG2 gene_id:3714|Hs108|chr14 (1200 aa)
initn: 1784 init1: 634 opt: 1179 Z-score: 531.4 bits: 111.4 E(32554): 2.8e-23
Smith-Waterman score: 1877; 34.5% identity (58.1% similar) in 809 aa overlap (52-838:197-955)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 PAHALQCRDGYEPCVNEGMCVTYHNGTGYCKCPEGFLGEYCQHRDPCE-KNRCQNGGTCV
.: :.. . :.. :. .: . ::
CCDS99 SHAGMINPEDRWKSLHFSGHVAHLELQIRVRCDENYYSATCNKF--CRPRNDFFGHYTC-
170 180 190 200 210 220
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 AQAMLGKATCRCASGFTGEDCQYSTSHPCFVSRPCLNGGTCHMLSRDTYECTCQVGFTGK
. . .:: : .:. :..:. .. : . :.:: : . . :: :. :. :.
CCDS99 -DQYGNKA---CMDGWMGKECKEAV---CKQGCNLLHGG-CTVPG----ECRCSYGWQGR
230 240 250 260 270
150 160 170 180 190
pF1KE3 ECQWTDACLSHP-CANGSTCTTVANQFSCKCLTGFTGQKCETDVNECDIPGHCQHGGTCL
: : :. .: :..:: :. . ..:.: :.. : :. :.: : : .::::.
CCDS99 FC---DECVPYPGCVHGS-CV---EPWQCNCETNWGGLLCDKDLNYCGSHHPCTNGGTCI
280 290 300 310 320
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 NL-PGSYQCQCPQGFTGQYCDSLYVPCAPSPCVNGGTCRQTGDFTFECNCLPGFEGSTCE
: : .:.: ::.:..:. :.. :. .::.:::.:... . :::.: :. : ::
CCDS99 NAEPDQYRCTCPDGYSGRNCEKAEHACTSNPCANGGSCHEVPS-GFECHCPSGWSGPTCA
330 340 350 360 370 380
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 RNIDDCPNHRCQNGGVCVDGVNTYNCRCPPQWTGQFCTEDVDECLLQPNACQNGGTCANR
.::.: .. : ::.::: :. ..: :: ::.: : ::..: : ::.:::: .
CCDS99 LDIDECASNPCAAGGTCVDQVDGFECICPEQWVGATCQLDVNDCRGQ---CQHGGTCKDL
390 400 410 420 430 440
320 330 340 350 360 370
pF1KE3 NGGYGCVCVNGWSGDDCSENIDDCAFASCTPGSTCIDRVASFSCMCPEGKAGLLCHLD-D
.:: ::: :..: : . :.:: . : :. : : . .: : ::.: .: ::..: :
CCDS99 VNGYQCVCPRGFGGRHCELERDECASSPCHSGGLCEDLADGFHCHCPQGFSGPLCEVDVD
450 460 470 480 490 500
380 390 400 410 420 430
pF1KE3 ACISNPCHKGALCDTNPLNGQYICTCPQGYKGADCTEDVDECAMANSNPCEHAGKCVNTD
: .::..:: : . :.:.: :.::. . : .:. . .:: .: : :
CCDS99 LCEPSPCRNGARCYN--LEGDYYCACPDDFGGKNCS--------VPREPCP-GGACRVID
510 520 530 540
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 GAFHCECLKGYAGPRCEMDINECHSDPCQNDATCLDKIGG-FTCLCMPGFKGVHCELEIN
: : : . : . : : . :... :: :.:.: :: :..:. .:.
CCDS99 G---CGSDAGPGMP------GTAASGVCGPHGRCVSQPGGNFSCICDSGFTGTYCHENID
550 560 570 580 590 600
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 ECQSNPCVNNGQCVDKVNRFQCLCPPGFTGPVCQIDIDDCSSTPCLNGAKCIDHPNGYEC
.: ..:: :.: :.:.:. :.:.:: :. : .:. . .:: :: . ..: : : . :
CCDS99 DCLGQPCRNGGTCIDEVDAFRCFCPSGWEGELCDTNPNDCLPDPCHSRGRCYDLVNDFYC
610 620 630 640 650 660
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 QCATGFTGVLCEENIDNCDPDPCHHG-QCQDGIDSYTCICNPGYMGAICS-DQIDECYSS
: :. : :. .:: : .: : :. :.. : : ::. :. :. . . : .
CCDS99 ACDDGWKGKTCHSREFQCDAYTCSNGGTCYDSGDTFRCACPPGWKGSTCAVAKNSSCLPN
670 680 690 700 710 720
620 630 640 650 660 670
pF1KE3 PCLNDGRCIDLVNGYQCNCQPGTSGVNCEINFDDCASNPCIHG-ICMDGINRYSCVCSPG
::.: : :. ...: :. : : .: : .:: :: .: ::.::.: . : :.::
CCDS99 PCVNGGTCVGSGASFSCICRDGWEGRTCTHNTNDCNPLPCYNGGICVDGVNWFRCECAPG
730 740 750 760 770 780
680 690 700 710 720
pF1KE3 FTGQRCNIDIDECASNPCRKGATCINGVNGFRCICPEGPHHPSCYSQVN---ECLS--NP
:.: : :.:::: :.:: ::::.. .::.:: :: : : : .. : : .:
CCDS99 FAGPDCRINIDECQSSPCAYGATCVDEINGYRCSCPPGRAGPRCQEVIGFGRSCWSRGTP
790 800 810 820 830 840
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 CIHGNC-TGGLSGYKCL-----CDAGWVGIN-CEV-DKNECLSNPCQNGGTCDNLVNGYR
::. . .. .:: :. : : . : . . : :: : : : . . : .
CCDS99 FPHGSSWVEDCNSCRCLDGRRDCSKVWCGWKPCLLAGQPEALSAQCPLGQRCLEKAPG-Q
850 860 870 880 890
790 800 810 820 830
pF1KE3 CTCKKGFKGYNCQVNIDECASNPCLNQ-GTCSDDISGYTCHCVLPYTGKNCQTVLAPCSP
: .: . .: :.::: . : ... . : : .. .. :: : ::
CCDS99 CLRPPCEAWGEC--GAEEPPSTPCLPRSGHLDNNCARLTLHFNRDHVPQGT-TVGAICSG
900 910 920 930 940 950
840 850 860 870 880 890
pF1KE3 NPCENAAVCKESPNFESYTCLCAPGWQGQRCTIDIDECISKPCMNHGLCHNTQGSYMCEC
CCDS99 IRSLPATRAVARDRLLVLLCDRASSGASAVEVAVSFSPARDLPDSSLIQGAAHAIVAAIT
960 970 980 990 1000 1010
2471 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 03:30:18 2016 done: Tue Nov 8 03:30:19 2016
Total Scan time: 6.370 Total Display time: 1.460
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]