FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3662, 976 aa
1>>>pF1KE3662 976 - 976 aa - 976 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
64369986 residues in 92320 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.5052+/-0.000637; mu= -13.2228+/- 0.038
mean_var=814.1399+/-184.441, 0's: 0 Z-trim(116.0): 1216 B-trim: 1546 in 1/55
Lambda= 0.044949
statistics sampled from 26329 (28009) to 26329 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.303), width: 16
Scan time: 6.910
The best scores are: opt bits E(92320)
NP_004422 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A rece ( 976) 6628 447.5 1.7e-124
NP_001316019 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A r ( 922) 6253 423.2 3.5e-117
XP_016856026 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A r ( 577) 3875 268.6 7e-71
XP_016865854 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 989) 3390 237.5 2.8e-61
NP_004429 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor 4 ( 986) 3324 233.3 5.4e-60
NP_001291465 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 986) 3324 233.3 5.4e-60
NP_001350677 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 949) 3261 229.1 9e-59
NP_001291466 (OMIM: 602188) ephrin type-A receptor ( 935) 3231 227.2 3.4e-58
NP_005223 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor 1 ( 976) 2932 207.8 2.4e-52
NP_872272 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1015) 2829 201.2 2.5e-50
NP_001268695 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1016) 2817 200.4 4.3e-50
XP_005264772 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor ( 982) 2700 192.8 8.2e-48
NP_005224 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 983) 2651 189.6 7.4e-47
XP_005264773 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor ( 918) 2516 180.8 3.1e-44
NP_004435 (OMIM: 600011,617300,618196) ephrin type ( 987) 2298 166.7 5.8e-40
XP_016863369 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 852) 2039 149.8 6e-35
XP_016863367 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 904) 2035 149.6 7.5e-35
NP_004434 (OMIM: 601839) ephrin type-B receptor 3 ( 998) 1991 146.8 5.7e-34
XP_016863370 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 817) 1945 143.7 4e-33
XP_016863368 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 869) 1944 143.7 4.4e-33
NP_001275558 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 993) 1888 140.1 5.8e-32
XP_005248726 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 994) 1881 139.7 8e-32
XP_005265710 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 874) 1850 137.6 3e-31
XP_011530037 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 926) 1850 137.6 3.1e-31
NP_001305690 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor ( 969) 1850 137.7 3.2e-31
NP_004430 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor 5 (1037) 1850 137.7 3.3e-31
NP_001268694 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1038) 1850 137.7 3.3e-31
NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1 ( 984) 1830 136.4 7.9e-31
XP_024309158 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor (1016) 1830 136.4 8e-31
XP_024309157 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor (1016) 1830 136.4 8e-31
XP_016861356 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor (1032) 1830 136.4 8.1e-31
XP_016861355 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor (1038) 1830 136.4 8.1e-31
XP_024309663 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin t ( 545) 1796 133.8 2.6e-30
XP_016867305 (OMIM: 600011,617300,618196) ephrin t (1005) 1799 134.4 3.2e-30
NP_059145 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin type ( 986) 1796 134.2 3.6e-30
NP_001296122 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin t (1055) 1796 134.2 3.8e-30
NP_004431 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor 7 ( 998) 1787 133.6 5.5e-30
XP_006710505 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin t ( 956) 1771 132.5 1.1e-29
XP_006710504 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin t ( 980) 1771 132.5 1.1e-29
NP_004433 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin type ( 987) 1771 132.5 1.1e-29
NP_001268696 (OMIM: 600004) ephrin type-A receptor (1004) 1756 131.6 2.2e-29
XP_016861699 (OMIM: 600066) ephrin type-A receptor (1104) 1754 131.5 2.6e-29
NP_001296121 (OMIM: 600997,603688,618462) ephrin t ( 928) 1743 130.7 3.8e-29
XP_006715943 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor ( 861) 1737 130.3 4.8e-29
XP_005248728 (OMIM: 602190) ephrin type-A receptor ( 610) 1659 125.0 1.3e-27
NP_872585 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 539) 1616 122.1 8.5e-27
XP_011539277 (OMIM: 176945) ephrin type-A receptor ( 600) 1598 121.0 2e-26
XP_024309660 (OMIM: 176945) ephrin type-A receptor ( 600) 1598 121.0 2e-26
XP_011539275 (OMIM: 176945) ephrin type-A receptor ( 930) 1598 121.3 2.6e-26
XP_011539271 (OMIM: 176945) ephrin type-A receptor ( 930) 1598 121.3 2.6e-26
>>NP_004422 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A receptor (976 aa)
initn: 6628 init1: 6628 opt: 6628 Z-score: 2356.7 bits: 447.5 E(92320): 1.7e-124
Smith-Waterman score: 6628; 100.0% identity (100.0% similar) in 976 aa overlap (1-976:1-976)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MELQAARACFALLWGCALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MELQAARACFALLWGCALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 DMPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTNWVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCKETFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DMPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTNWVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCKETFN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 AFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHAVVPPGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHAVVPPGG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 EEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEKVEDACQACSPGFFKFEASESPCLECPEHTLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEKVEDACQACSPGFFKFEASESPCLECPEHTLPS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 PEGATSCECEEGFFRAPQDPASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQDSGGREDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 PEGATSCECEEGFFRAPQDPASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQDSGGREDI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VYSVTCEQCWPESGECGPCEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEARNGVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VYSVTCEQCWPESGECGPCEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEARNGVSG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 LVTSRSFRTASVSINQTEPPKVRLEGRSTTSLSVSWSIPPPQQSRVWKYEVTYRKKGDSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LVTSRSFRTASVSINQTEPPKVRLEGRSTTSLSVSWSIPPPQQSRVWKYEVTYRKKGDSN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 SYNVRRTEGFSVTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHEFQTLSPEGSGNLAVIGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SYNVRRTEGFSVTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHEFQTLSPEGSGNLAVIGG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 VAVGVVLLLVLAGVGFFIHRRRKNQRARQSPEDVYFSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VAVGVVLLLVLAGVGFFIHRRRKNQRARQSPEDVYFSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 VLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTSSGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTSSGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 LGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYMENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYMENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGML
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 RGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 IRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGERPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGERPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 DCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLIRAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLIRAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSG
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 SEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAY
910 920 930 940 950 960
970
pF1KE3 SLLGLKDQVNTVGIPI
::::::::::::::::
NP_004 SLLGLKDQVNTVGIPI
970
>>NP_001316019 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A recep (922 aa)
initn: 6253 init1: 6253 opt: 6253 Z-score: 2225.5 bits: 423.2 E(92320): 3.5e-117
Smith-Waterman score: 6253; 100.0% identity (100.0% similar) in 922 aa overlap (55-976:1-922)
30 40 50 60 70 80
pF1KE3 QGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMNDMPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTN
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MQNIMNDMPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTN
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE3 WVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCKETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCKETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDT
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE3 IAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPEL
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE3 LQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHAVVPPGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHAVVPPGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQA
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE3 GYEKVEDACQACSPGFFKFEASESPCLECPEHTLPSPEGATSCECEEGFFRAPQDPASMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GYEKVEDACQACSPGFFKFEASESPCLECPEHTLPSPEGATSCECEEGFFRAPQDPASMP
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 CTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQDSGGREDIVYSVTCEQCWPESGECGPCEASVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQDSGGREDIVYSVTCEQCWPESGECGPCEASVR
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 YSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEARNGVSGLVTSRSFRTASVSINQTEPPKVRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEARNGVSGLVTSRSFRTASVSINQTEPPKVRL
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 EGRSTTSLSVSWSIPPPQQSRVWKYEVTYRKKGDSNSYNVRRTEGFSVTLDDLAPDTTYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EGRSTTSLSVSWSIPPPQQSRVWKYEVTYRKKGDSNSYNVRRTEGFSVTLDDLAPDTTYL
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 VQVQALTQEGQGAGSKVHEFQTLSPEGSGNLAVIGGVAVGVVLLLVLAGVGFFIHRRRKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQVQALTQEGQGAGSKVHEFQTLSPEGSGNLAVIGGVAVGVVLLLVLAGVGFFIHRRRKN
460 470 480 490 500 510
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pF1KE3 QRARQSPEDVYFSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQAVLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QRARQSPEDVYFSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQAVLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEF
520 530 540 550 560 570
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pF1KE3 GEVYKGMLKTSSGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDFLGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GEVYKGMLKTSSGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDFLGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISK
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 YKPMMIITEYMENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YKPMMIITEYMENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARN
640 650 660 670 680 690
750 760 770 780 790 800
pF1KE3 ILVNSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ILVNSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFG
700 710 720 730 740 750
810 820 830 840 850 860
pF1KE3 IVMWEVMTYGERPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVMWEVMTYGERPYWELSNHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKF
760 770 780 790 800 810
870 880 890 900 910 920
pF1KE3 ADIVSILDKLIRAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADIVSILDKLIRAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEH
820 830 840 850 860 870
930 940 950 960 970
pF1KE3 FMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI
880 890 900 910 920
>>XP_016856026 (OMIM: 116600,176946) ephrin type-A recep (577 aa)
initn: 3875 init1: 3875 opt: 3875 Z-score: 1394.1 bits: 268.6 E(92320): 7e-71
Smith-Waterman score: 3875; 99.5% identity (100.0% similar) in 564 aa overlap (1-564:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MELQAARACFALLWGCALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MELQAARACFALLWGCALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DMPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTNWVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCKETFN
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYL
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XP_016 AFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHAVVPPGG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VYSVTCEQCWPESGECGPCEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEARNGVSG
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.... : :: :.::.:: .:.:::::::. .:.:.:::.:::::.:::::.:: .
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.::::::::: :.: : : :... :..:::::: :: ...:. :..:::.: : .:::
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..:::::::::.:::.::.::.:::::: ....:: ::.:..::. ::. : ::::.
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: . . :::::...::::::::.:.:.:::.. :.:. :. ::.: ... : .:
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: :.. . ::.. ::::.:..:::.:: . ::::::::. : . : :.:.:: :
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.:::.:..: . :..: :.::: :: ... : :: . ::: :: : :::: ::
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. .. .:. :::. ...::. ::.: ::. . ..: : . :..:: .
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.: :::::::.::::::: ::: ::.:::::.: :...::::... ::.::. :.:::::
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..::..:.:::..:.:::.:::::....:::..:::.:::.:::: .::.::::.:: :.
XP_016 DMSNQDVIKAIEEGYRLPAPMDCPAGLHQLMLDCWQKERAERPKFEQIVGILDKMIRNPN
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:::: :. . .: : ... . . : .:.:::..:::..: ..: ::::...:.:..
XP_016 SLKTPLGTCSRPISPLLDQNT-PDFTTFCSVGEWLQAIKMERYKDNFTAAGYNSLESVAR
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:: .:. .:. : ::::.: :. .. :.
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. :.:.:..:::::::::.:::.::.:. ::::. :..: .... : .:: :
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. :::::: :..::::: .: :::::::::::: : . ..:.:.:. ::..::
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:.:: :.:.:..: . ..: :: ..:.:. .:: :.:...:: : :::: . :
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: : .: :.: :: . :: . .. . : : :.:. .:.: : : : :. : : .
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. ..::::: ::::::::: .:. :: ::. .::::.:::::: .: ::. ::.:.
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:::::::::::.::: :::.::.:::::.: :::.::::..: ::.::::::::::.::
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:::..::.:.:.:::::::::..:::::..:.:::::::::::::::::::::::::.::
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::::::::.::: ::::::::::::::.::::::::::::.::::::::.:::::::..:
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:..:.:::..:.::: ::::: :..:::..:::.::. ::::..::..:::::: :.:::
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. . : . : . :. : .:..::..:::..: ..: :::::..: ::.....
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:. :::. ::..: :. ... :.
NP_004 DLARIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MELQAARACFALLWG-C-ALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNI
: :. :.: : :.... . ..::.::: .. :::::.. : ::. . .:
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pF1KE3 MND--MPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTNWVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCK
:.. :: :.::::: .:.:::::.:. : :.:..::.:::.:::::.:: ..::
NP_001 MDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCK
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::::::: ::: : ... :.:::::: :: .. :. : .:::.: :.::::..:
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pF1KE3 GFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHAVV
::::::::.:::.::.::::.::::: ...::.::.::.:.:. ::. : :.::...
NP_001 GFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNS--
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pF1KE3 PPGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEKVEDACQACSPGFFKFEASESPCLECPEH
. :.:.:..:::::::::.:::.::.:. ::::. :..: .... : .:: :
NP_001 -EEKDVPKMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKCPPH
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pF1KE3 TLPSPEGATSCECEEGFFRAPQDPASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQDSGG
. :::::: :..::::: .: :::::::::::: : . ..:.:.:. ::..::
NP_001 SYSVWEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPCTRPPSAPLNLISNVNETSVNLEWSSPQNTGG
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pF1KE3 REDIVYSVTCEQCWP-ESGECGPCEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEAR
:.:: :.:.:..: . ..: :: ..:.:. .:: :.:...:: : :::: . :
NP_001 RQDISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEIWAV
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pF1KE3 NGVSGLVTSRSFRTASVSI--NQTEPPKVRL-EGRSTTSLSVS--WSIPPPQQSRVWKYE
:::: . . ...::.. ::. : .. : ... .: ::. : : .. . .::
NP_001 NGVSKYNPNPD-QSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRYSVALAWLEPDRPNGVILEYE
420 430 440 450 460 470
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pF1KE3 VTYRKKGDSN--SYNVRRTEGFSVTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHEFQTLS
: : .: :.: :: . :: . .. . : : :.:. .:.: : : : :. : : .
NP_001 VKYYEK-DQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTTNT
480 490 500 510 520 530
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pF1KE3 -PE---GSGNLAVIGGVAV-GVVLLLVLAGVGFFIHRRR-KNQRARQSPEDVYFSKSEQL
: :.: ... :.: : :.:.:. ..: : ::: : ..:.: .. ...
NP_001 VPSRIIGDGANSTVLLVSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADE----EKHLN
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590 600 610 620 630 640
pF1KE3 KPLKTYVDPHTYEDPNQAVLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTSSGKKEVP
. ..::::: ::::::::: .:. :: ::. .::::.:::::: .: ::. ::.:.
NP_001 QGVRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVP-GKREIC
600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 VAIKTLKAGYTEKQRVDFLGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYMENGALDK
:::::::::::.::: :::.::.:::::.: :::.::::..: ::.::::::::::.::
NP_001 VAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLDA
650 660 670 680 690 700
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pF1KE3 FLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSR
:::..::.:.:.:::::::::..:::::..:.:::::::::::::::::::::::::.::
NP_001 FLRKNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMSR
710 720 730 740 750 760
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pF1KE3 VLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGERPYWELS
::::::::.::: ::::::::::::::.::::::::::::.::::::::.:::::::..:
NP_001 VLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMS
770 780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 NHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLIRAPDSLK
:..:.:::..:.::: ::::: :..:::..:::.::. ::::..::..:::::: :.:::
NP_001 NQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSLK
830 840 850 860 870 880
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pF1KE3 TLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTND
. . : . : . :. : .:..::..:::..: ..: :::::..: ::.....
NP_001 RTGTESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQE
890 900 910 920 930 940
950 960 970
pF1KE3 DIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI
:. :::. ::..: :. ... :.
NP_001 DLARIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV
950 960 970 980
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10 20 30 40 50
pF1KE3 MELQAARACFALLWG-C-ALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNI
: :. :.: : :.... . ..::.::: .. :::::.. : ::. . .:
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10 20 30 40 50
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pF1KE3 MND--MPIYMYSVCNVMSGDQDNWLRTNWVYRGEAERIFIELKFTVRDCNSFPGGASSCK
:.. :: :.::::: .:.:::::.:. : :.:..::.:::.:::::.:: ..::
NP_001 MDEKNTPIRTYQVCNVMEPSQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCK
60 70 80 90 100 110
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::::::: ::: : ... :.:::::: :: .. :. : .:::.: :.::::..:
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::::::::.:::.::.::::.::::: ...::.::.::.:.:. ::. : :.::...
NP_001 GFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNS--
180 190 200 210 220 230
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. :.:.:..:::::::::.:::.::.:. ::::. :..: .... : .:: :
NP_001 -EEKDVPKMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKCPPH
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. :::::: :..::::: .: :::::::::::: : . ..:.:.:. ::..::
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300 310 320 330 340 350
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:.:: :.:.:..: . ..: :: ..:.:. .:: :.:...:: : :::: . :
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:::: . . ...::.. ::. : .. : ... .: ::. : : .. . .::
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420 430 440 450 460 470
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: : .: :.: :: . :: . .. . : : :.:. .:.: : : : :. : : .
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: :.: ... :.: : :.:.:. ..: : ::: : ..:.: . :. .....
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NP_001 CVAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLD
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pF1KE3 KFLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAAGMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLS
:::..::.:.:.:::::::::..:::::..:.:::::::::::::::::::::::::.:
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pF1KE3 RVLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTAPEAISYRKFTSASDVWSFGIVMWEVMTYGERPYWEL
:::::::::.::: ::::::::::::::.::::::::::::.::::::::.:::::::..
NP_001 RVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDM
770 780 790 800 810 820
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pF1KE3 SNHEVMKAINDGFRLPTPMDCPSAIYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLIRAPDSL
::..:.:::..:.::: ::::: :..:::..:::.::. ::::..::..:::::: :.::
NP_001 SNQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSL
830 840 850 860 870 880
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pF1KE3 KTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVPFRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTN
: . . : . : . :. : .:..::..:::..: ..: :::::..: ::....
NP_001 KRTGTESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQ
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pF1KE3 DDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGLKDQVNTVGIPI
.
NP_001 E
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pF1KE3 TKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTRKGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYK
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::: ...::.::.::.:.:. ::. : :.::... . :.:.:..:::::::::.
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:::.::.:. ::::. :..: .... : .:: :. :::::: :..::::: .:
NP_001 CLCNAGHEERSGECQACKIGYYKALSTDATCAKCPPHSYSVWEGATSCTCDRGFFRADND
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pF1KE3 PASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPPQDSGGREDIVYSVTCEQCWP-ESGECGP
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pF1KE3 CEASVRYSEPPHGLTRTSVTVSDLEPHMNYTFTVEARNGVSGLVTSRSFRTASVSI--NQ
: ..:.:. .:: :.:...:: : :::: . : :::: . . ...::.. ::
NP_001 CGSGVHYTPQQNGLKTTKVSITDLLAHTNYTFEIWAVNGVSKYNPNPD-QSVSVTVTTNQ
330 340 350 360 370 380
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NP_001 AAPSSIALVQAKEVTRYSVALAWLEPDRPNGVILEYEVKYYEK-DQNERSYRIVRTAARN
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. . : : :.:. .:.: : : : :. : : . : :.: ... :.: : :
NP_001 TDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTTNTVPSRIIGDGANSTVLLVSVSGSV
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pF1KE3 LLLVLAGVGFFIHRRR-KNQRARQSPEDVYFSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQAVLKFT
.:.:. ..: : ::: : ..:.: .. ... . ..::::: ::::::::: .:.
NP_001 VLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADE----EKHLNQGVRTYVDPFTYEDPNQAVREFA
510 520 530 540 550 560
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NP_001 KEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVP-GKREICVAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEAS
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pF1KE3 IMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYMENGALDKFLREKDGEFSVLQLVGMLRGIAA
:::::.: :::.::::..: ::.::::::::::.:: :::..::.:.:.:::::::::..
NP_001 IMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLDAFLRKNDGRFTVIQLVGMLRGIGS
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pF1KE3 GMKYLANMNYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEATYTTSGGKIPIRWTA
:::::..:.:::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::: ::::::::::
NP_001 GMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTA
690 700 710 720 730 740
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::::.::::::::::::.::::::::.:::::::..::..:.:::..:.::: ::::: :
NP_001 PEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIA
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pF1KE3 IYQLMMQCWQQERARRPKFADIVSILDKLIRAPDSLKTLADFDPRVSIRLPSTSGSEGVP
..:::..:::.::. ::::..::..:::::: :.::: . . : . : . :. :
NP_001 LHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSLKRTGTESSRPNTALLDPSSPEFSA
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pF1KE3 FRTVSEWLESIKMQQYTEHFMAAGYTAIEKVVQMTNDDIKRIGVRLPGHQKRIAYSLLGL
.:..::..:::..: ..: :::::..: ::.....:. :::. ::..: :. ..
NP_001 VVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHVNQEDLARIGITAITHQNKILSSVQAM
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970
pF1KE3 KDQVNTVGIPI
. :.
NP_001 RTQMQQMHGRMVPV
930
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10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MELQAARACFALLWGCALAAAAAAQGKEVVLLDFAAAGGELGWLTHPYGKGWDLMQNIMN
:: .:..:::.:.: . : :::::: : ::. .:.:.:
NP_005 MERRWPLGLGLVLLLCA-PLPPGARAKEVTLMDTSKAQGELGWLLDPPKDGWSEQQQILN
10 20 30 40 50
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pF1KE3 DMPIYMYSVCNVMSG--DQDNWLRTNWVYRGE-AERIFIELKFTVRDCNSFPGGAS--SC
:.:::. : :.: : :.:::.::.:::: : :. .::.::::::.::::::. .:
NP_005 GTPLYMYQDCP-MQGRRDTDHWLRSNWIYRGEEASRVHVELQFTVRDCKSFPGGAGPLGC
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pF1KE3 KETFNLYYAESDLDYGTNFQKRLFTKIDTIAPDEITVSSDFEARHVKLNVEERSVGPLTR
:::::: : ::: : : .... :: :. :.: :. . :. . ::::::. :.: :::
NP_005 KETFNLLYMESDQDVGIQLRRPLFQKVTTVAADQSFTIRDLVSGSVKLNVERCSLGRLTR
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pF1KE3 KGFYLAFQDIGACVALLSVRVYYKKCPELLQGLAHFPETIAGSDAPSLATVAGTCVDHA-
.:.::::.. ::::::.::::.:..::: :.:::.::.:. : .:. :::::. ::
NP_005 RGLYLAFHNPGACVALVSVRVFYQRCPETLNGLAQFPDTLPG--PAGLVEVAGTCLPHAR
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pF1KE3 VVP-PGGEEPRMHCAVDGEWLVPIGQCLCQAGYEK--VEDACQACSPGFFKFEASESPCL
. : :.: :::::. :::::::.:.: :. :::. .:: :: : .... . ::
NP_005 ASPRPSGA-PRMHCSPDGEWLVPVGRCHCEPGYEEGGSGEACVACPSGSYRMDMDTPHCL
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pF1KE3 ECPEHTLPSPEGATSCECEEGFFRAPQDPASMPCTRPPSAPHYLTAVGMGAKVELRWTPP
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NP_005 ADTGGRQDVRYSVRCSQCQGTAQDGGPCQPCGVGVHFSPGARGLTTPAVHVNGLEPYANY
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pF1KE3 TFTVEARNGVSGLVTS-RSFRTASVSINQTEPPK---VRLEGRSTTSLSVSWSIPPPQQS
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NP_005 TFNVEAQNGVSGLGSSGHASTSVSISMGHAESLSGLSLRLVKKEPRQLELTWAGSRPRSP
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pF1KE3 RV-WKYEVTYRKKGDSNSYNVRRTEGFSVTLDDLAPDTTYLVQVQALTQEGQGAGSKVHE
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pF1KE3 FQTLSPEGSGNLAVIGGVAVGVVLLLVLAG---VGFFIHRRRKNQRARQSPE-----DVY
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NP_005 FRTSPPVSRG---LTGGEIVAVIFGLLLGAALLLGILVFRSRRAQRQRQQRQRDRATDVD
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pF1KE3 FSKSEQLKPLKTYVDPHTYEDPNQAVLKFTTEIHPSCVTRQKVIGAGEFGEVYKGMLKTS
. ::: ::: ..:::: :..: :: :. :. . . ::: :::::::.: :.
NP_005 REDKLWLKP---YVDLQAYEDPAQGALDFTRELDPAWLMVDTVIGEGEFGEVYRGTLRLP
590 600 610 620 630 640
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pF1KE3 SGKKEVPVAIKTLKAGYTEKQRVDFLGEAGIMGQFSHHNIIRLEGVISKYKPMMIITEYM
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NP_005 SQDCKT-VAIKTLKDTSPGGQWWNFLREATIMGQFSHPHILHLEGVVTKRKPIMIITEFM
650 660 670 680 690 700
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