Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3483
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3483, 1746 aa
1>>>pF1KE3483 1746 - 1746 aa - 1746 aa
Library: human.CCDS.faa
18921897 residues in 33420 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8286+/-0.00102; mu= -6.6685+/- 0.062
mean_var=307.5108+/-64.947, 0's: 0 Z-trim(112.7): 38 B-trim: 212 in 1/55
Lambda= 0.073138
statistics sampled from 13615 (13633) to 13615 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.408), width: 16
Scan time: 3.420
The best scores are: opt bits E(33420)
CCDS42062.1 PEAK1 gene_id:79834|Hs109|chr15 (1746) 11672 1246.6 0
CCDS43706.1 PRAG1 gene_id:157285|Hs109|chr8 (1406) 1148 136.1 8.5e-31
>>CCDS42062.1 PEAK1 gene_id:79834|Hs109|chr15 (1746 aa)
initn: 11672 init1: 11672 opt: 11672 Z-score: 6666.5 bits: 1246.6 E(33420): 0
Smith-Waterman score: 11672; 99.9% identity (100.0% similar) in 1746 aa overlap (1-1746:1-1746)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSACNTFTEHVWKPGECKNCFKPKSLHQLPPDPEKAPITHGNVKTNANHSNNHRIRNTGN
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CCDS42 MSACNTFTEHVWKPGECKNCFKPKSLHQLPPDPEKAPITHGNVKTNANHSNNHRIRNTGN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 FRPPVAKKPTIAVKPTMIVADGQSICGELSIQEHCENKPVIIGWNRNRAALSQKPLNNNN
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CCDS42 FRPPVAKKPTIAVKPTMIVADGQSICGELSIQEHCENKPVIIGWNRNRAALSQKPLNNNN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 EDDEGISHVPKPYGNNDSAKKMSDNNNGLTEVLKEIAGLDTAPQIRGNETNSRETFLGRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EDDEGISHVPKPYGNNDSAKKMSDNNNGLTEVLKEIAGLDTAPQIRGNETNSRETFLGRI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NDCYKRSLERKLPPSCMIGGIKETQGKHVILSGSTEVISNEGGRFCYPEFSSGEESEEDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NDCYKRSLERKLPPSCMIGGIKETQGKHVILSGSTEVISNEGGRFCYPEFSSGEESEEDV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LFSNMEEEHESWDESDEELLAMEIRMRGQPRFANFRANTLSPVRFFVDKKWNTIPLRNKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LFSNMEEEHESWDESDEELLAMEIRMRGQPRFANFRANTLSPVRFFVDKKWNTIPLRNKS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LQRICAVDYDDSYDEILNGYEENSVVSYGQGSIQSMVSSDSTSPDSSLTEESRSETASSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LQRICAVDYDDSYDEILNGYEENSVVSYGQGSIQSMVSSDSTSPDSSLTEESRSETASSL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 SQKICNGGLSPGNPGDSKDMKEIEPNYESPSSNNQDKDSSQASKSSIKVPETHKAVLALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SQKICNGGLSPGNPGDSKDMKEIEPNYESPSSNNQDKDSSQASKSSIKVPETHKAVLALR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 LEEKDGKIAVQTEKEESKASTDVAGQAVTINLVPTEEQAKPYRVVNLEQPLCKPYTVVDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LEEKDGKIAVQTEKEESKASTDVAGQAVTINLVPTEEQAKPYRVVNLEQPLCKPYTVVDV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 SAAMASEHLEGPVNSPKTKSSSSTPNSPVTSSSLTPGQISAHFQKSSAIRYQEVWTSSTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SAAMASEHLEGPVNSPKTKSSSSTPNSPVTSSSLTPGQISAHFQKSSAIRYQEVWTSSTS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 PRQKIPKVELITSGTGPNVPPRKNCHKSAPTSPTATNISSKTIPVKSPNLSEIKFNSYNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PRQKIPKVELITSGTGPNVPPRKNCHKSAPTSPTATNISSKTIPVKSPNLSEIKFNSYNN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 AGMPPFPIIIHDEPTYARSSKNAIKVPIVINPNAYDNLAIYKSFLGTSGELSVKEKTTSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AGMPPFPIIIHDEPTYARSSKNAIKVPIVINPNAYDNLAIYKSFLGTSGELSVKEKTTSV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 ISHTYEEIETESKVPDNTTSKTTDCLQTKGFSNSTEHKRGSVAQKVQEFNNCLNRGQSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ISHTYEEIETESKVPDNTTSKTTDCLQTKGFSNSTEHKRGSVAQKVQEFNNCLNRGQSSP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 QRSYSSSHSSPAKIQRATQEPVAKIEGTQESQMVGSSSTREKASTVLSQIVASIQPPQSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QRSYSSSHSSPAKIQRATQEPVAKIEGTQESQMVGSSSTREKASTVLSQIVASIQPPQSP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 PETPQSGPKACSVEELYAIPPDADVAKSTPKSTPVRPKSLFTSQPSGEAEAPQTTDSPTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PETPQSGPKACSVEELYAIPPDADVAKSTPKSTPVRPKSLFTSQPSGEAEAPQTTDSPTT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 KVQKDPSIKPVTPSPSKLVTSPQSEPPAPFPPPRSTSSPYHAGNLLQRHFTNWTKPTSPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KVQKDPSIKPVTPSPSKLVTSPQSEPPAPFPPPRSTSSPYHAGNLLQRHFTNWTKPTSPT
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 RSTEAESVLHSEGSRRAADAKPKRWISFKSFFRRRKTDEEDDKEKEREKGKLVGLDGTVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RSTEAESVLHSEGSRRAADAKPKRWISFKSFFRRRKTDEEDDKEKEREKGKLVGLDGTVI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 HMLPPPPVQRHHWFTEAKGESSEKPAIVFMYRCDPAQGQLSVDQSKARTDQAAVMEKGRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HMLPPPPVQRHHWFTEAKGESSEKPAIVFMYRCDPAQGQLSVDQSKARTDQAAVMEKGRA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 ENALLQDSEKKRSHSSPSQIPKKILSHMTHEVTEDFSPRDPRTVVGKQDGKGCTSVTTAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS42 ENALLQDSEKKRSHSSPSQIPKKILSHMTHEVTEDFSPRDPRTVVGKQDGRGCTSVTTAL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 SLPELEREDGKEDISDPMDPNPCSATYSNLGQSRAAMIPPKQPRQPKGAVDDAIAFGGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SLPELEREDGKEDISDPMDPNPCSATYSNLGQSRAAMIPPKQPRQPKGAVDDAIAFGGKT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 DQEAPNASQPTPPPLPKKMIIRANTEPISKDLQKSMESSLCVMANPTYDIDPNWDASSAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DQEAPNASQPTPPPLPKKMIIRANTEPISKDLQKSMESSLCVMANPTYDIDPNWDASSAG
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE3 SSISYELKGLDIESYDSLERPLRKERPVPSAANSISSLTTLSIKDRFSNSMESLSSRRGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSISYELKGLDIESYDSLERPLRKERPVPSAANSISSLTTLSIKDRFSNSMESLSSRRGP
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE3 SCRQGRGIQKPQRQALYRGLENREEVVGKIRSLHTDALKKLAVKCEDLFMAGQKDQLRFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SCRQGRGIQKPQRQALYRGLENREEVVGKIRSLHTDALKKLAVKCEDLFMAGQKDQLRFG
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE3 VDSWSDFRLTSDKPCCEAGDAVYYTASYAKDPLNNYAVKICKSKAKESQQYYHSLAVRQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VDSWSDFRLTSDKPCCEAGDAVYYTASYAKDPLNNYAVKICKSKAKESQQYYHSLAVRQS
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE3 LAVHFNIQQDCGHFLAEVPNRLLPWEDPDDPEKDEDDMEETEEDAKGETDGKNPKPCSEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LAVHFNIQQDCGHFLAEVPNRLLPWEDPDDPEKDEDDMEETEEDAKGETDGKNPKPCSEA
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE3 ASSQKENQGVMSKKQRSHVVVITREVPCLTVADFVRDSLAQHGKSPDLYERQVCLLLLQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ASSQKENQGVMSKKQRSHVVVITREVPCLTVADFVRDSLAQHGKSPDLYERQVCLLLLQL
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE3 CSGLEHLKPYHVTHCDLRLENLLLVHYQPGGTAQGFGPAEPSPTSSYPTRLIVSNFSQAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CSGLEHLKPYHVTHCDLRLENLLLVHYQPGGTAQGFGPAEPSPTSSYPTRLIVSNFSQAK
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE3 QKSHLVDPEILRDQSRLAPEIITATQYKKCDEFQTGILIYEMLHLPNPFDENPELKEREY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QKSHLVDPEILRDQSRLAPEIITATQYKKCDEFQTGILIYEMLHLPNPFDENPELKEREY
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE3 TRADLPRIPFRSPYSRGLQQLASCLLNPNPSERILISDAKGILQCLLWGPREDLFQTFTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TRADLPRIPFRSPYSRGLQQLASCLLNPNPSERILISDAKGILQCLLWGPREDLFQTFTA
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE3 CPSLVQRNTLLQNWLDIKRTLLMIKFAEKSLDREGGISLEDWLCAQYLAFATTDSLSCIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CPSLVQRNTLLQNWLDIKRTLLMIKFAEKSLDREGGISLEDWLCAQYLAFATTDSLSCIV
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE3 KILQHR
::::::
CCDS42 KILQHR
>>CCDS43706.1 PRAG1 gene_id:157285|Hs109|chr8 (1406 aa)
initn: 1504 init1: 430 opt: 1148 Z-score: 666.6 bits: 136.1 E(33420): 8.5e-31
Smith-Waterman score: 1494; 33.3% identity (56.1% similar) in 1092 aa overlap (717-1744:408-1404)
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 QTKGFSNSTEHKRGSVAQKVQEFNNCLNRGQSSPQRSYSSSHSSPAKIQRATQEPVAKIE
: : . :..... : . .: ::::
CCDS43 QDPGCPGVTPSRCLGLTGEPQPPAHPREATQPEPIYAESTKRKKAAPVPSKSQ---AKIE
380 390 400 410 420 430
750 760 770 780 790
pF1KE3 GTQESQMVGSSSTREKASTVLSQIVASIQPPQSPPETPQSGPK----ACSVEE----LYA
. .: :. : ... .: .:: .:: ::: . : :: .:
CCDS43 HAAAAQGQGQVCT----GNAWAQKAASGWGRDSPDPTPQVSATITVMAAHPEEDHRTIYL
440 450 460 470 480 490
800 810 820 830 840 850
pF1KE3 IPPDADVAKSTPKSTPVRPKSLFTSQPSGEAEAPQTTDSPT-TKVQKDPSIKPVTP---S
::. :. . :.. :: .: . .. ... .. .: . . .. :. .:. : :
CCDS43 SSPDSAVGVQWPRG-PVSQNSEVGEEETSAGQGLSSRESHAHSASESKPKERPAIPPKLS
500 510 520 530 540
860 870 880 890 900 910
pF1KE3 PSKLVTSPQSEPPAPFPP--PRSTSSPYHAGNLLQRHFTNWTKPTSPTRSTEAESVLHSE
:. : :: : : : :: : . : .:. :..:. : ....: :.
CCDS43 KSSPVGSPVS-PSAGGPPVSPLADLSDGSSGGSSIGPQPPSQGPADPAPSCRTNGVAISD
550 560 570 580 590 600
920 930 940 950 960
pF1KE3 GSR----RAADAKPKRWISFKSFFRRRKTDEEDDKEKEREKGKLVGLDGTVIHMLPPPPV
:: :..:. .: :.. :. :...: :.: .
CCDS43 PSRCPQPAASSASEQRRPRFQAGTWSRQCRIEEEEEVEQE-------------------L
610 620 630 640
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE3 QRHHWFTEAKGESSEKPAIVFMYRCDPAQGQLSVDQSKARTDQAAVMEKGRAEN-ALLQD
: : :.:. ... . .: :..:. : ..::. : : :. . . .:
CCDS43 LSHSWGRETKNGPTDHSNSTTWHRLHPTDGS-SGQNSKVGTG----MSKSASFAFEFPKD
650 660 670 680 690 700
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE3 SEKKRSHSSPSQIPKKILSHMTHEVTEDFSPRDPRTVVGKQDGKGCTSVTTALSLPELER
.. : : ::. : . . : : . : ..:.. :.. .. ..
CCDS43 RSGIETFSPPPPPPKS-----RHLLKMNKSSSDLEKV---SQGSA-ESLSPSFRGVHVSF
710 720 730 740 750
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE3 EDGKEDISDPMDPNPCSATYSNLGQSRAAMIPPKQPRQPKGAVDDAIAF-GGKTDQEAPN
:. : : : :: . : : : . . : . : .:.:.. .:.
CCDS43 TTGSTD-SLASDSRTCS----DGGPSSELAHSPTNSGKKLFA---PVPFPSGSTEDVSPS
760 770 780 790 800
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE3 ASQPTPPPLPKKMII-RANTEPISKDLQKSMESSLCVMANPTYDIDPNWDASSAGSSISY
. : :::::.: :. :: . : . .. : :.: ... . : .::
CCDS43 GPQQ-PPPLPQKKIVSRAASSP--DGFFWTQGSPKPGTASPKLNLSHSETNVHDESHFSY
810 820 830 840 850 860
1210 1220 1230 1240 1250
pF1KE3 ELKGLD-----IESYDSLERPLRKE-RPVPSAANSISSLTTLSIKDRFSNSMESLSSRRG
:. . . : : ::. .. . .:.:. . . : . ... . ::. .
CCDS43 SLSPGNRHHPVFSSSDPLEKAFKGSGHWLPAAGLAGNRGGCGSPGLQCKGAPSASSSQLS
870 880 890 900 910 920
1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KE3 PSCRQGRGIQKPQRQALYRGLENREEVVGKIRSLHTDALKKLAVKCEDLFMAGQKDQLRF
: . . : . : ..: .. ..: . .:. .:.:..: .:..:::::::.::: .:.:
CCDS43 VSSQASTGSTQLQLHGLLSNISSKEGTYAKLGGLYTQSLARLVAKCEDLFMGGQKKELHF
930 940 950 960 970 980
1320 1330 1340 1350 1360 1370
pF1KE3 GVDSWSDFRLTSDKPCCEAGDAVYYTASYAKDPLNNYAVKICKSKAKESQQYYHSLAVRQ
. ..:: :.:: .::::..:::.:: :. ..:: ..:::::::. .. .:
CCDS43 NENNWSLFKLTCNKPCCDSGDAIYYCATCSEDPGSTYAVKICKAPEPKTVSY-----CSP
990 1000 1010 1020 1030
1380 1390 1400 1410 1420 1430
pF1KE3 SLAVHFNIQQDCGHFLAEVPNRLLPWEDPDDPEKDEDDMEETEEDAKGETDGKNPKPCSE
:. ::::::::::::.: ::. .: .:: : :.: :
CCDS43 SVPVHFNIQQDCGHFVASVPSSML--SSPDAP--------------------KDPVP---
1040 1050 1060 1070
1440 1450 1460 1470 1480 1490
pF1KE3 AASSQKENQGVMSKKQRSHVVVITREVPCLTVADFVRDSLAQHGKSPDLYERQVCLLLLQ
: .. : ... ::::::::: :..:::::: :.: :. :::.::.::::
CCDS43 ALPTHPPAQ------EQDCVVVITREVPHQTASDFVRDSAASHQAEPEAYERRVCFLLLQ
1080 1090 1100 1110 1120
1500 1510 1520 1530 1540
pF1KE3 LCSGLEHLKPYHVTHCDLRLENLLLVH--YQPG-GTAQGFGPAEPSPTSSYPT-------
::.:::::: . . : :: :::::::: : : : : . .:: :.:... :
CCDS43 LCNGLEHLKEHGIIHRDLCLENLLLVHCTLQAGPGPAPAPAPA-PAPAAAAPPCSSAAPP
1130 1140 1150 1160 1170 1180
1550 1560 1570 1580
pF1KE3 -----------------------RLIVSNFSQAKQKSHLVDPEIL--RDQSRLAPEIITA
:::.::: .:::: . :.. ..:.::::::..:
CCDS43 AGGTLSPAAGPASPEGPREKQLPRLIISNFLKAKQKPGGT-PNLQQKKSQARLAPEIVSA
1190 1200 1210 1220 1230 1240
1590 1600 1610 1620 1630 1640
pF1KE3 TQYKKCDEFQTGILIYEMLHLPNPFDENPELKEREYTRADLPRIPFRSPYSRGLQQLASC
.::.: :::::::::::.:: ::::. .:.::.: . ::: .: : :: ::::::
CCDS43 SQYRKFDEFQTGILIYELLHQPNPFEVRAQLRERDYRQEDLPPLPALSLYSPGLQQLAHL
1250 1260 1270 1280 1290 1300
1650 1660 1670 1680 1690 1700
pF1KE3 LLNPNPSERILISDAKGILQCLLWGPREDLFQTFTACPSLVQRNT--LLQNWLDIKRTLL
::. .: .:: :..:: .:::::::::..: : :. .. :.::.:.::.:.
CCDS43 LLEADPIKRIRIGEAKRVLQCLLWGPRRELVQQ----PGTSEEALCGTLHNWIDMKRALM
1310 1320 1330 1340 1350 1360
1710 1720 1730 1740
pF1KE3 MIKFAEKSLDREGGISLEDWLCAQYLAFATTDSLSCIVKILQHR
:.:::::..::. :. :::::: :::: : .: .:.::
CCDS43 MMKFAEKAVDRRRGVELEDWLCCQYLASAEPGALLQSLKLLQLL
1370 1380 1390 1400
1746 residues in 1 query sequences
18921897 residues in 33420 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Jul 16 15:54:40 2019 done: Tue Jul 16 15:54:40 2019
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]