Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3344
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3344, 1004 aa
1>>>pF1KE3344 1004 - 1004 aa - 1004 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2280+/-0.00113; mu= 3.4045+/- 0.066
mean_var=289.9254+/-59.860, 0's: 0 Z-trim(109.0): 81 B-trim: 88 in 2/51
Lambda= 0.075324
statistics sampled from 10527 (10579) to 10527 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.325), width: 16
Scan time: 4.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11768.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 (1004) 6603 732.6 9.3e-211
CCDS58605.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 ( 740) 4838 540.7 4.1e-153
CCDS5336.2 CARD11 gene_id:84433|Hs108|chr7 (1154) 636 84.3 1.6e-15
CCDS48057.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 ( 492) 594 79.3 2.1e-14
CCDS6997.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 ( 536) 594 79.4 2.2e-14
>>CCDS11768.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 (1004 aa)
initn: 6603 init1: 6603 opt: 6603 Z-score: 3897.2 bits: 732.6 E(32554): 9.3e-211
Smith-Waterman score: 6603; 99.8% identity (99.8% similar) in 1004 aa overlap (1-1004:1-1004)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEVLHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEVLHS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSGLME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSGLME
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQEHLGLAETRAEGLHQLEADHSRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQEHLGLAETRAEGLHQLEADHSRM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 KREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRANMVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRANMVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SCELELQEQSLRTASDQESGDEELNRLKEENEKLRSLTFSLAEKDILEQSLDEARGSRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SCELELQEQSLRTASDQESGDEELNRLKEENEKLRSLTFSLAEKDILEQSLDEARGSRQE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LVERIHSLRERAVAAERQREQYWEEKEQTLLQFQKSKMACQLYREKVNALQAQVCELQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LVERIHSLRERAVAAERQREQYWEEKEQTLLQFQKSKMACQLYREKVNALQAQVCELQKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 RDQAYSARDSAQREISQSLVEKDSLRRQVFELTDQVCELRTQLRQLQAEPPGVLKQEART
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RDQAYSARDSAQREISQSLVEKDSLRRQVFELTDQVCELRTQLRQLQAEPPGVLKQEART
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 REPCPREKQRLVRMHAICPRDDSDCSLVSSTESQLLSDLSATSSRELVDSFRSSSPAPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 REPCPREKQRLVRMHAICPRDDSDCSLVSSTESQLLSDLSATSSRELVDSFRSSSPAPPS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 QQSLYKRVAEDFGEEPWSFSSCLEIPEGDPGALPGAKAGDPHLDYELLDTADLPQLESSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QQSLYKRVAEDFGEEPWSFSSCLEIPEGDPGALPGAKAGDPHLDYELLDTADLPQLESSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 QPVSPGSLDVSESGVLMRRRPARRILSQVTMLAFQGDALLEQISVIGGNLTGIFIHRVTP
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QPVSPGRLDVSESGVLMRRRPARRILSQVTMLAFQGDALLEQISVIGGNLTGIFIHRVTP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 GSAADQMALRPGTQIVMVDYEASEPLFKAVLEDTTLEEAVGLLRRVDGFCCLSVKVNTDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GSAADQMALRPGTQIVMVDYEASEPLFKAVLEDTTLEEAVGLLRRVDGFCCLSVKVNTDG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 YKRLLQDLEAKVATSGDSFYIRVNLAMEGRAKGELQVHCNEVLHVTDTMFQGCGCWHAHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YKRLLQDLEAKVATSGDSFYIRVNLAMEGRAKGELQVHCNEVLHVTDTMFQGCGCWHAHR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 VNSYTMKDTAAHGTIPNYSRAQQQLIALIQDMTQQCTVTRKPSSGGPQKLVRIVSMDKAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VNSYTMKDTAAHGTIPNYSRAQQQLIALIQDMTQQCTVTRKPSSGGPQKLVRIVSMDKAK
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 ASPLRLSFDRGQLDPSRMEGSSTCFWAESCLTLVPYTLVWPHRPARPRPVLLVPRAVGKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::
CCDS11 ASPLRLSFDRGQLDPSRMEGSSTCFWAESCLTLVPYTLVRPHRPARPRPVLLVPRAVGKI
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 LSEKLCLLQGFKKCLAEYLSQEEYEAWSQRGDIIQEGEVSGGRCWVTRHAVESLMEKNTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LSEKLCLLQGFKKCLAEYLSQEEYEAWSQRGDIIQEGEVSGGRCWVTRHAVESLMEKNTH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE3 ALLDVQLDSVCTLHRMDIFPIVIHVSVNEKMAKKLKKGLQRLGTSEEQLLEAARQEEGDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALLDVQLDSVCTLHRMDIFPIVIHVSVNEKMAKKLKKGLQRLGTSEEQLLEAARQEEGDL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000
pF1KE3 DRAPCLYSSLAPDGWSDLDGLLSCVRQAIADEQKKVVWTEQSPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DRAPCLYSSLAPDGWSDLDGLLSCVRQAIADEQKKVVWTEQSPR
970 980 990 1000
>>CCDS58605.1 CARD14 gene_id:79092|Hs108|chr17 (740 aa)
initn: 4838 init1: 4838 opt: 4838 Z-score: 2862.3 bits: 540.7 E(32554): 4.1e-153
Smith-Waterman score: 4838; 99.9% identity (99.9% similar) in 740 aa overlap (1-740:1-740)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEVLHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEVLHS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSGLME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSGLME
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQEHLGLAETRAEGLHQLEADHSRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQEHLGLAETRAEGLHQLEADHSRM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 KREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRANMVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRANMVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 SCELELQEQSLRTASDQESGDEELNRLKEENEKLRSLTFSLAEKDILEQSLDEARGSRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SCELELQEQSLRTASDQESGDEELNRLKEENEKLRSLTFSLAEKDILEQSLDEARGSRQE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 LVERIHSLRERAVAAERQREQYWEEKEQTLLQFQKSKMACQLYREKVNALQAQVCELQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LVERIHSLRERAVAAERQREQYWEEKEQTLLQFQKSKMACQLYREKVNALQAQVCELQKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 RDQAYSARDSAQREISQSLVEKDSLRRQVFELTDQVCELRTQLRQLQAEPPGVLKQEART
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RDQAYSARDSAQREISQSLVEKDSLRRQVFELTDQVCELRTQLRQLQAEPPGVLKQEART
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 REPCPREKQRLVRMHAICPRDDSDCSLVSSTESQLLSDLSATSSRELVDSFRSSSPAPPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 REPCPREKQRLVRMHAICPRDDSDCSLVSSTESQLLSDLSATSSRELVDSFRSSSPAPPS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 QQSLYKRVAEDFGEEPWSFSSCLEIPEGDPGALPGAKAGDPHLDYELLDTADLPQLESSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QQSLYKRVAEDFGEEPWSFSSCLEIPEGDPGALPGAKAGDPHLDYELLDTADLPQLESSL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 QPVSPGSLDVSESGVLMRRRPARRILSQVTMLAFQGDALLEQISVIGGNLTGIFIHRVTP
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QPVSPGRLDVSESGVLMRRRPARRILSQVTMLAFQGDALLEQISVIGGNLTGIFIHRVTP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 GSAADQMALRPGTQIVMVDYEASEPLFKAVLEDTTLEEAVGLLRRVDGFCCLSVKVNTDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSAADQMALRPGTQIVMVDYEASEPLFKAVLEDTTLEEAVGLLRRVDGFCCLSVKVNTDG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 YKRLLQDLEAKVATSGDSFYIRVNLAMEGRAKGELQVHCNEVLHVTDTMFQGCGCWHAHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YKRLLQDLEAKVATSGDSFYIRVNLAMEGRAKGELQVHCNEVLHVTDTMFQGCGCWHAHR
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 VNSYTMKDTAAHGTIPNYSRAQQQLIALIQDMTQQCTVTRKPSSGGPQKLVRIVSMDKAK
::::::::::::::::::::
CCDS58 VNSYTMKDTAAHGTIPNYSR
730 740
>>CCDS5336.2 CARD11 gene_id:84433|Hs108|chr7 (1154 aa)
initn: 1455 init1: 488 opt: 636 Z-score: 392.1 bits: 84.3 E(32554): 1.6e-15
Smith-Waterman score: 1251; 30.9% identity (57.6% similar) in 1004 aa overlap (15-864:18-1014)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEV
.:..::: .: .:: . : : :..::::::: ::. . ::.::
CCDS53 MPGGGPEMDDYMETLKDEEDALWENVECNRHMLSRYINPAKLTPYLRQCKVIDEQDEDEV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 LHSPRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSG
:..: : .. :::.:::.:.:.:. : ..:::::.:. :..: :::: .: ::..
CCDS53 LNAPMLPSKINRAGRLLDILHTKGQRGYVVFLESLEFYYPELYKLVTGKEPTRRFSTIVV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 LMETSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQ-EHLGLAETRAEGLHQLEAD
::. : . . .::.... . :. :: : .::. :. .. ::.: : ..
CCDS53 EEGHEGLTHFLMNEVIKLQQQMKAKDLQRCELLARLRQLEDEKKQMTLTRVE-LLTFQER
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 HSRMKREVSAHFHEVLRLKDEMLSLSLHYSNALQEKELAASRCRSLQEELYLLKQELQRA
. .::.: ... :....::. .:...:.. .::..:. : :.:: :. ::..:..
CCDS53 YYKMKEERDSYNDELVKVKDDNYNLAMRYAQLSEEKNMAVMRSRDLQLEIDQLKHRLNK-
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE3 NMVSSCELELQEQSLRTASDQESGDE-----ELNR----LKEENEKLRSLT----FSLAE
: :.:: ..:::. .: :. . ::.: :: .:..:.:. :: .
CCDS53 -MEEECKLE-RNQSLKLKNDIENRPKKEQVLELERENEMLKTKNQELQSIIQAGKRSLPD
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KE3 KD-----ILEQSLDEARGSRQELVERIHSLRERAVAAERQREQYWEEKEQTLLQFQKSKM
.: :::.. :: .:::::.::..:.:.: ::. :..: ::::. :. .
CCDS53 SDKAILDILEHDRKEALEDRQELVNRIYNLQEEARQAEELRDKYLEEKEDLELKCSTLGK
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 ACQLYREKVNALQAQVCELQKERDQAYSARDSAQREISQSLVEKDSLRRQVFELTDQVCE
:..:....:... :. :...:::::. .:: :: . :: :.:::. :.:. :: .. :
CCDS53 DCEMYKHRMNTVMLQLEEVERERDQAFHSRDEAQTQYSQCLIEKDKYRKQIRELEEKNDE
360 370 380 390 400 410
400 410
pF1KE3 LR--------------TQLRQL--------QAEP----------------PGVLKQEA--
.: ..::.: :. : : . :::
CCDS53 MRIEMVRREACIVNLESKLRRLSKDSNNLDQSLPRNLPVTIISQDFGDASPRTNGQEADD
420 430 440 450 460 470
420 430 440 450 460
pF1KE3 -RTREPCPREK---------QRLVRMHAI-CPRDDSDCSLVSSTESQLL------SDLSA
: : :... :: . ...: : : :: ... : .: :
CCDS53 SSTSEESPEDSKYFLPYHPPQRRMNLKGIQLQRAKSPISLKRTSDFQAKGHEEEGTDASP
480 490 500 510 520 530
470 480 490 500 510
pF1KE3 TS--SRELVDSFRSSSPAPPSQQSLYKRVAEDFG--------EEPWSFSSCLEIPEGDPG
.: : ...:: . .: : :..:... .:: : .: : .: ..: :
CCDS53 SSCGSLPITNSFTKMQP-PRSRSSIMSITAEPPGNDSIVRRYKEDAPHRSTVE-EDNDSG
540 550 560 570 580 590
520 530 540 550 560
pF1KE3 ALPGAKAGDPHLDYELLDTADLPQLESSLQPVSPGSLDVSESGVLMRR----RPARRILS
.. . : . . ... . :: : . . :. . ....:. :: : ..
CCDS53 GFDALDLDDDSHERYSFGPSSIHSSSSSHQSEGLDAYDLEQVNLMFRKFSLERPFRPSVT
600 610 620 630 640 650
570 580 590 600 610
pF1KE3 QVTML----------AFQGDALLEQISVIGGNLTGIFIHRVTPGSAADQMALRPGTQIVM
.: . ...::.: :....::: : :.: : ::: :.. .:: : :...
CCDS53 SVGHVRGPGPSVQHTTLNGDSLTSQLTLLGGNARGSFVHSVKPGSLAEKAGLREGHQLLL
660 670 680 690 700 710
620 630 640 650 660 670
pF1KE3 VDYEASEPLFKAVLEDTTLEEAVGLLRRVDGFCCLSVKVNTDGYKRLLQDLEAKVATSGD
.. .. :. : ::: ..: .: : ::: .::..:..:.: . ::::
CCDS53 LEGCIRGERQSVPLDTCTKEEAHWTIQRCSGPVTLHYKVNHEGYRKLVKDMEDGLITSGD
720 730 740 750 760 770
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 SFYIRVNLAMEGRAKG-ELQVHCNEVLHVTDTMFQGCGCWHAHRVNSYTMKDTAAHGTIP
:::::.:: . .. . ....:..:.:: :::.: : ::. .: .: ::::
CCDS53 SFYIRLNLNISSQLDACTMSLKCDDVVHVRDTMYQDRHEWLCARVDPFTDHDLDM-GTIP
780 790 800 810 820 830
740 750 760
pF1KE3 NYSRAQQQLIALIQDMTQQCTV---------------TRKP----SSGGPQ---------
.:::::: :.. .: . .. . : .: :.. :.
CCDS53 SYSRAQQLLLVKLQRLMHRGSREEVDGTHHTLRALRNTLQPEEALSTSDPRVSPRLSRAS
840 850 860 870 880 890
770 780 790 800
pF1KE3 ----KLVRIVSMDKAK--------------ASPL----RLSFDRGQLDPSRMEGSSTCFW
.:...:: .. : .::: : :.: .: ..: .
CCDS53 FLFGQLLQFVSRSENKYKRMNSNERVRIISGSPLGSLARSSLDATKLLTEKQEELDPESE
900 910 920 930 940 950
810 820 830 840 850 860
pF1KE3 AESCLTLVPYTLVWPHRPARPRPVLLVPRAVGKILSEKLCLLQG---FKKCLAEYLSQEE
. :.:.::.:: : ::::..: ...: : ..: : : : .. ....:
CCDS53 LGKNLSLIPYSLVRAFYCERRRPVLFTPTVLAKTLVQRLLNSGGAMEFTICKSDIVTRDE
960 970 980 990 1000 1010
870 880 890 900 910 920
pF1KE3 YEAWSQRGDIIQEGEVSGGRCWVTRHAVESLMEKNTHALLDVQLDSVCTLHRMDIFPIVI
.
CCDS53 FLRRQKTETIIYSREKNPNAFECIAPANIEAVAAKNKHCLLEAGIGCTRDLIKSNIYPIV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
>>CCDS48057.1 CARD9 gene_id:64170|Hs108|chr9 (492 aa)
initn: 600 init1: 261 opt: 594 Z-score: 372.0 bits: 79.3 E(32554): 2.1e-14
Smith-Waterman score: 607; 32.1% identity (61.8% similar) in 461 aa overlap (15-458:7-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGELCRRDSALTALDEETLWEMMESHRHRIVRCICPSRLTPYLRQAKVLCQLDEEEVLHS
:.: : ..:. : .. : :::.:::::: ::: :::.:: .
CCDS48 MSDYENDDEC-WSVLEGFRVTLTSVIDPSRITPYLRQCKVLNPDDEEQVLSD
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PRLTNSAMRAGHLLDLLKTRGKNGAIAFLESLKFHNPDVYTLVTGLQPDVDFSNFSGLME
: :. ..: :::.:. :..: .::::::... :..: ::: .: :: .
CCDS48 PNLVIRKRKVGVLLDILQRTGHKGYVAFLESLELYYPQLYKKVTGKEPARVFSMIIDASG
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 TSKLTECLAGAIGSLQEELNQEKGQKEVLLRRCQQLQEHLGLAETRAEGLHQLEADHSRM
: ::. : . .::..... .:: ... ..: . .. . :: ... :.
CCDS48 ESGLTQLLMTEVMKLQKKVQD----LTALLSSKDDFIKELRVKDSLLRK-HQERVQ--RL
120 130 140 150 160
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