Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3330
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3330, 943 aa
1>>>pF1KE3330 943 - 943 aa - 943 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.6130+/-0.00131; mu= -24.5262+/- 0.076
mean_var=573.0001+/-128.394, 0's: 0 Z-trim(110.9): 268 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.053579
statistics sampled from 11689 (11947) to 11689 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.706), E-opt: 0.2 (0.367), width: 16
Scan time: 3.960
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9 ( 943) 6520 520.2 7.4e-147
CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 937) 3657 298.9 3.1e-80
CCDS41344.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 ( 393) 1768 152.6 1.4e-36
CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 ( 783) 876 83.9 1.4e-15
CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 ( 869) 876 83.9 1.5e-15
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 827 80.1 2e-14
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 827 80.1 2e-14
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 820 79.5 2.9e-14
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 820 79.5 2.9e-14
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 795 77.6 1e-13
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 795 77.6 1.1e-13
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 795 77.6 1.1e-13
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 698 70.1 1.8e-11
CCDS1241.1 DDR2 gene_id:4921|Hs108|chr1 ( 855) 695 69.9 2.4e-11
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 690 69.5 2.9e-11
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 802) 690 69.5 3e-11
CCDS42487.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1370) 695 70.0 3.5e-11
CCDS12176.1 INSR gene_id:3643|Hs108|chr19 (1382) 695 70.0 3.5e-11
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 671 68.0 7.5e-11
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 667 67.6 8.1e-11
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 667 67.7 9.2e-11
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 667 67.7 9.2e-11
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 667 67.7 9.3e-11
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 667 67.7 9.5e-11
>>CCDS6691.1 ROR2 gene_id:4920|Hs108|chr9 (943 aa)
initn: 6520 init1: 6520 opt: 6520 Z-score: 2750.0 bits: 520.2 E(32554): 7.4e-147
Smith-Waterman score: 6520; 99.8% identity (100.0% similar) in 943 aa overlap (1-943:1-943)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MARGSALPRRPLLCIPAVWAAAALLLSVSRTSGEVEVLDPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MARGSALPRRPLLCIPAVWAAAALLLSVSRTSGEVEVLDPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 FLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWLKNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 FLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWLKNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RIQDLDTTDTGYYQCVATNGMKTITATGVLFVRLGPTHSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 RIQDLDTTDTGYYQCVATNGMKTITATGVLFVRLGPTHSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 ACARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGTSTHLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ACARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGTSTHLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNPLILMRLQLPKCEALPMPESPDAANC
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 ARSRTPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNPLILMRLQLPKCEALPMPESPDAANC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 MRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTTKSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 MRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTTKSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 GHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMELCDVPSCSPRDSSKMGILYILVPSIAIPLVIAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMELCDVPSCSPRDSSKMGILYILVPSIAIPLVIAC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 LFFLVCMCRNKQKASASTPQRRQLMASPSQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 LFFLVCMCRNKQKASASTPQRRQLMASPSQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEELG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 EDRFGKVYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 EDRFGKVYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 GVVTKDQPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 GVVTKDQPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 AGMEYLSSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 AGMEYLSSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 PEAIMYGKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PEAIMYGKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 VYALMIECWNEFPSRRPRFKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 VYALMIECWNEFPSRRPRFKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 VSNARYVGPKQKAPPFPQPQFIPMKGQIRPMVPPPQLYIPVNGYQPVPAYGAYLPNFYPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS66 VSNARYVGPKQKAPPFPQPQFIPMKGQIRPMVPPPQLYVPVNGYQPVPAYGAYLPNFYPV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 QIPMQMAPQQVPPQMVPKPSSHHSGSGSTSTGYVTTAPSNTSMADRAALLSEGADDTQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 QIPMQMAPQQVPPQMVPKPSSHHSGSGSTSTGYVTTAPSNTSMADRAALLSEGADDTQNA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940
pF1KE3 PEDGAQSTVQEAEEEEEGSVPETELLGDCDTLQVDEAQVQLEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS66 PEDGAQSTVQEAEEEEEGSVPETELLGDCDTLQVDEAQVQLEA
910 920 930 940
>>CCDS626.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 (937 aa)
initn: 2749 init1: 1334 opt: 3657 Z-score: 1554.0 bits: 298.9 E(32554): 3.1e-80
Smith-Waterman score: 3657; 57.6% identity (79.1% similar) in 946 aa overlap (8-942:4-936)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MARGSALPRRPLLCIPAVWAAAALLLSVSRTSGEVEVLDPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGY
::: : . :::::.. .... :. . : : .. . :
CCDS62 MHRPRRRGTRPPLLALLAALLLAARGAAAQETELSVSAELVPTSSWNISSELNKDS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 FLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWLKNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRL
.:.. ::.:::: :::: :::::.:::::..::.::::::::::::. .:.: :::::
CCDS62 YLTLDEPMNNITTSLGQTAELHCKVSGNPPPTIRWFKNDAPVVQEPRRLSFRSTIYGSRL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RIQDLDTTDTGYYQCVATNGMKTITATGVLFVRLGPTHSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGI
::..::::::::.::::::: .....::::::..:: . . ...:.:.:::::::::::
CCDS62 RIRNLDTTDTGYFQCVATNGKEVVSSTGVLFVKFGPPPTASPGYSDEYEEDGFCQPYRGI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 ACARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGTSTHLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCD
::::::::::.:..::.:::::::.:::::::::::.::::.::::::::.::..:: ::
CCDS62 ACARFIGNRTVYMESLHMQGEIENQITAAFTMIGTSSHLSDKCSQFAIPSLCHYAFPYCD
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNPLILMRLQLPKCEALPMPESPDAANC
: .::::.:::::::.::. ::. :: .:::::.:::::.::.:: ::.::::.::::
CCDS62 ETSSVPKPRDLCRDECEILENVLCQTEYIFARSNPMILMRLKLPNCEDLPQPESPEAANC
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE3 MRIGIP-AERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTTKSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELG
.::::: :. ... :.:::..:.:::::.:.::::.::::: :.::.: ... ::::.
CCDS62 IRIGIPMADPINKNHKCYNSTGVDYRGTVSVTKSGRQCQPWNSQYPHTHTFTALRFPELN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 GGHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMELCDVPSCSPRDS---SKMGILYILVPSIAIPL
:::.::::::.: :.::::: ..: . .:::.:.:. .:: .:: ::::::::.::::
CCDS62 GGHSYCRNPGNQKEAPWCFTLDENFKSDLCDIPACDSKDSKEKNKMEILYILVPSVAIPL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 VIACLFFLVCMCRNKQKASASTPQRRQLMASPSQDMEMPLINQHK-QAKLKEISLSAVRF
.:: :::..:.:::.:: :.:.: .:: .:..:: ..: .: ..: ::. ::::::
CCDS62 AIALLFFFICVCRNNQK-SSSAPVQRQPKHVRGQNVEMSMLNAYKPKSKAKELPLSAVRF
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE3 MEELGEDRFGKVYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPN
:::::: :::.:::::. :. ...: :::::::: . ::..:: : :.:.:::
CCDS62 MEELGECAFGKIYKGHLYLPGM-DHAQLVAIKTLKDYNNPQQWTEFQQEASLMAELHHPN
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE3 VVCLLGVVTKDQPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVG-STDDDRTVKSALEPPDFVH
.:::::.::..::. :.: : ..:::::::.::::::::: :.:.: ::::.:. ::.:
CCDS62 IVCLLGAVTQEQPVCMLFEYINQGDLHEFLIMRSPHSDVGCSSDEDGTVKSSLDHGDFLH
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 LVAQIAAGMEYLSSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLL
.. :::::::::::: ::::::.::.:. ..:.:::::::: ::.:.::::.. ..:::
CCDS62 IAIQIAAGMEYLSSHFFVHKDLAARNILIGEQLHVKISDLGLSREIYSADYYRVQSKSLL
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 PIRWMAPEAIMYGKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCP
::::: :::::::::: ::::::.::::::.::.::::: :.:::.:.::.:.::.:::
CCDS62 PIRWMPPEAIMYGKFSSDSDIWSFGVVLWEIFSFGLQPYYGFSNQEVIEMVRKRQLLPCS
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 DDCPAWVYALMIECWNEFPSRRPRFKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLS
.::: .:.:: :::::.::::::::::: :::.: .::...::. ::.. ::::.:::
CCDS62 EDCPPRMYSLMTECWNEIPSRRPRFKDIHVRLRSWEGLSSHTSSTTPSGGNATTQTTSLS
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE3 TSPVSNVSNARYVGPKQKAPP---FPQPQFIPMKGQIRPMVPPPQLYIPVNGYQPVPAYG
.:::::.:: :: :. : :: : . : : : .: : .::.::: :.:.
CCDS62 ASPVSNLSNPRY--PNYMFPSQGITPQGQ---IAGFIGPPIPQNQRFIPINGYPIPPGYA
780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KE3 AYLPNFYPVQIPMQMAPQQVPPQMVPKPSSHHSGSGSTSTGYVTTAPSNTSMADRAALLS
:. : : .. :. :: :: : :.:::::::.::. ::. : . :
CCDS62 AFPAAHYQPTGPPRVI-QHCPP---PKSRSPSSASGSTSTGHVTSLPSSGSNQEANIPLL
830 840 850 860 870 880
900 910 920 930 940
pF1KE3 EGADDTQNAPEDGAQSTV--QEAEEEEEGSVPETELLGDCDTLQVDEAQVQLEA
. : : : :: ..... . . .. :::: . :.... :
CCDS62 PHMS-IPNHP-GGMGITVFGNKSQKPYKIDSKQASLLGDANIHGHTESMISAEL
890 900 910 920 930
>>CCDS41344.1 ROR1 gene_id:4919|Hs108|chr1 (393 aa)
initn: 1747 init1: 1334 opt: 1768 Z-score: 770.2 bits: 152.6 E(32554): 1.4e-36
Smith-Waterman score: 1768; 61.9% identity (84.5% similar) in 388 aa overlap (8-394:4-391)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MARGSALPRRPLLCIPAVWAAAALLLSVSRTSGEVEVLDPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGY
::: : . :::::.. .... :. . : : .. . :
CCDS41 MHRPRRRGTRPPLLALLAALLLAARGAAAQETELSVSAELVPTSSWNISSELNKDS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 FLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWLKNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRL
.:.. ::.:::: :::: :::::.:::::..::.::::::::::::. .:.: :::::
CCDS41 YLTLDEPMNNITTSLGQTAELHCKVSGNPPPTIRWFKNDAPVVQEPRRLSFRSTIYGSRL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RIQDLDTTDTGYYQCVATNGMKTITATGVLFVRLGPTHSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGI
::..::::::::.::::::: .....::::::..:: . . ...:.:.:::::::::::
CCDS41 RIRNLDTTDTGYFQCVATNGKEVVSSTGVLFVKFGPPPTASPGYSDEYEEDGFCQPYRGI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 ACARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGTSTHLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCD
::::::::::.:..::.:::::::.:::::::::::.::::.::::::::.::..:: ::
CCDS41 ACARFIGNRTVYMESLHMQGEIENQITAAFTMIGTSSHLSDKCSQFAIPSLCHYAFPYCD
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNPLILMRLQLPKCEALPMPESPDAANC
: .::::.:::::::.::. ::. :: .:::::.:::::.::.:: ::.::::.::::
CCDS41 ETSSVPKPRDLCRDECEILENVLCQTEYIFARSNPMILMRLKLPNCEDLPQPESPEAANC
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE3 MRIGIP-AERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTTKSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELG
.::::: :. ... :.:::..:.:::::.:.::::.::::: :.::.: ... ::::.
CCDS41 IRIGIPMADPINKNHKCYNSTGVDYRGTVSVTKSGRQCQPWNSQYPHTHTFTALRFPELN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 GGHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMELCDVPSCSPRDSSKMGILYILVPSIAIPLVIA
:::.::::::.: :.::::: ..: . .:::.:.:
CCDS41 GGHSYCRNPGNQKEAPWCFTLDENFKSDLCDIPACGK
360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 CLFFLVCMCRNKQKASASTPQRRQLMASPSQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEEL
>>CCDS75874.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 (783 aa)
initn: 910 init1: 608 opt: 876 Z-score: 393.3 bits: 83.9 E(32554): 1.4e-15
Smith-Waterman score: 995; 30.5% identity (57.2% similar) in 732 aa overlap (67-753:126-782)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 VLDPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGYFLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWL
: :. :..: :.: : . ::: :.: :.
CCDS75 IYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNPKPSVSWI
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 KNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRLRIQDLDTTDTGYYQCVATNGMKTITATGVLFVRLGP
:.:.:. .: :: . : :: :::.... :.: :.::: :.. : . :.:
CCDS75 KGDSPL-RENSRIAV--LESGS-LRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSK---VVKL--
160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 THSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGIACARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGTS
. .:.. .: : .... : . :
CCDS75 ----------EVEEES--EP------------------------EQDTKVFARILRAPES
210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 THLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCDARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNPL
... : :: : : . : : .. ... : :: . : .
CCDS75 HNVT----------FGSFVTLHCTA-TGIPVPTITWIENGNAVSSG-SIQESVKDR---V
240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 ILMRLQLPKCEALPMPESPDAANCMRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTTKSGHQ
: :::: . .: .:. . .:... . . : ..: ..:
CCDS75 IDSRLQL-------FITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAATISIAEWREYCLAVKELFC
280 290 300 310 320
340 350 360 370 380
pF1KE3 CQPWALQHPHSH--------HLSS----TDFPELGGGHAYC-RNPGGQMEGPWCFTQNKN
. : ... ..: :: : . .: . . : : : .. : ... .
CCDS75 AKEWLVMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTACARLP--HLAFPPMTSSKPS
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430
pF1KE3 VRMELCDVPSCSPRDSS-----KMGILYILVPSIAIPLVIACLFFLVCMCR------NKQ
: .. ..:: : . : .: .. .. :.:: .:. . : : :: ::.
CCDS75 V--DIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAI-FVLLTITTLYC-CRRRKQWKNKK
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480
pF1KE3 KASAST-----PQR---RQLMASPSQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEELGEDRF
. ::.. :.. .: .: . ..:::. . : .: : . .......:: :
CCDS75 RESAAVTLTTLPSELLLDRLHPNP-MYQRMPLLLNPKLLSL-EYPRNNIEYVRDIGEGAF
450 460 470 480 490 500
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 GKVYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVT
:.:.... : : : ::.: ::..: . .. .:..:: : :....::.: :::: .
CCDS75 GRVFQARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCA
510 520 530 540 550 560
550 560 570 580 590
pF1KE3 KDQPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALE---PPDF-----VHLV
.:. ..: : ..:::.::: :::. . . .: .... . :: . . ..
CCDS75 VGKPMCLLFEYMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIA
570 580 590 600 610 620
600 610 620 630 640 650
pF1KE3 AQIAAGMEYLSSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPI
:.:::: ::: .. ::.:::::: :: ... :::.:.:: :..:.::::: :. .::
CCDS75 RQVAAGMAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPI
630 640 650 660 670 680
660 670 680 690 700 710
pF1KE3 RWMAPEAIMYGKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDD
::: ::.:.:.... .::.:.:::::::.:::::::: :.....:. ..:. ..: ::..
CCDS75 RWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPEN
690 700 710 720 730 740
720 730 740 750 760 770
pF1KE3 CPAWVYALMIECWNEFPSRRPRFKDIHSRL-----RAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTS
::. .: :: ::...:. :: : .:: : :: :..:
CCDS75 CPVELYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV
750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KE3 SLSTSPVSNVSNARYVGPKQKAPPFPQPQFIPMKGQIRPMVPPPQLYIPVNGYQPVPAYG
>>CCDS48005.1 MUSK gene_id:4593|Hs108|chr9 (869 aa)
initn: 910 init1: 608 opt: 876 Z-score: 392.7 bits: 83.9 E(32554): 1.5e-15
Smith-Waterman score: 1072; 31.6% identity (57.8% similar) in 722 aa overlap (69-753:221-868)
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 DPNDPLGPLDGQDGPIPTLKGYFLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWLKN
.:.:. :. . ::: ..: : :.. :..:
CCDS48 VAKNSLGTAYSKVVKLEVEVFARILRAPESHNVTF--GSFVTLHCTATGIPVPTITWIEN
200 210 220 230 240
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 DAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRLRIQDLDTTDTGYYQCVATN--GMKTITATGVLFVRLGP
: . . .. :::. : : : : :.::: : : :: .. . ..
CCDS48 GNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQ---LFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAATISIAE
250 260 270 280 290 300
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 THSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGIAC-ARFIGNRTIYVDSLQMQGEIENRITAAFTMIGT
.: : : . :.: ::: .: : . . ..... . : : . . : .
CCDS48 WSKP----QKD--NKGYCAQYRGEVCNAVLAKDALVFLNTSYADPE-EAQELLVHTAWNE
310 320 330 340 350
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 STHLSDQCSQFAIPSFCHFVFPLCDARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNP
.: : : .:. .: :. . .: : .::. : ... .: .:. . . .
CCDS48 LKVVSPVCRPAAEALLCNHIFQECSP-GVVPTPIPICREYCLAVKELFCAKEWLVMEEKT
360 370 380 390 400 410
280 290 300 310 320
pF1KE3 LI-LMR-----LQLPKCEALP-MPESPDAANCMRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMDYRGTA
:.: :..:.: :: : .: : : : .: : .::
CCDS48 HRGLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTA--CAR--LP-------H-------LDY----
420 430 440 450
330 340 350 360 370 380
pF1KE3 STTKSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELGGGHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMEL
.: . . : : . :.:.:.: :... . :
CCDS48 --NKENLKTFP-----PMTSSKPSVDIPNL---------PSSSSSS---F----------
460 470 480
390 400 410 420 430
pF1KE3 CDVPSCSPRDSSKMGILYILVPSIAIPLVIACLFFLVCMCR------NKQKASAST----
: :: : : .. .. :.:: .:. . : : :: ::.. ::..
CCDS48 ----SVSPTYS--MTVIISIMSSFAI-FVLLTITTLYC-CRRRKQWKNKKRESAAVTLTT
490 500 510 520 530
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 -PQR---RQLMASPSQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEELGEDRFGKVYKGHLFG
:.. .: .: . ..:::. . : .: : . .......:: ::.:.... :
CCDS48 LPSELLLDRLHPNP-MYQRMPLLLNPKLLSL-EYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQARAPG
540 550 560 570 580 590
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 PAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVTKDQPLSMIFS
: : ::.: ::..: . .. .:..:: : :....::.: :::: . .:. ..:
CCDS48 LLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFE
600 610 620 630 640 650
560 570 580 590 600
pF1KE3 YCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALE---PPDF-----VHLVAQIAAGMEYL
: ..:::.::: :::. . . .: .... . :: . . .. :.:::: ::
CCDS48 YMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYL
660 670 680 690 700 710
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMY
: .. ::.:::::: :: ... :::.:.:: :..:.::::: :. .::::: ::.:.:
CCDS48 SERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFY
720 730 740 750 760 770
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 GKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMI
.... .::.:.:::::::.:::::::: :.....:. ..:. ..: ::..::. .: ::
CCDS48 NRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELYNLMR
780 790 800 810 820 830
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 ECWNEFPSRRPRFKDIHSRL-----RAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSNV
::...:. :: : .:: : :: :..:
CCDS48 LCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV
840 850 860
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 SNARYVGPKQKAPPFPQPQFIPMKGQIRPMVPPPQLYIPVNGYQPVPAYGAYLPNFYPVQ
>>CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 (817 aa)
initn: 849 init1: 701 opt: 827 Z-score: 372.6 bits: 80.1 E(32554): 2e-14
Smith-Waterman score: 827; 43.2% identity (73.1% similar) in 294 aa overlap (458-750:514-806)
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 CRNKQKASASTPQRRQLMASPSQDMEMPLINQHK-QAKLKEISLSAVRFMEELGEDRFGK
: :: .. ...:. . . .:::: :::
CCDS58 SSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAFGK
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 VYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVTKD
:. .. .. .: .. . ::.:.::: . . :..:..:: : . ::: ..: . ::
CCDS58 VFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAA-RKDFQREAELLTNLQHEHIVKFYGVCGDG
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 QPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIAAGMEYL
.:: :.: : .::::..:: ..: . . . : .:. : ...:...:::.:: ::
CCDS58 DPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASGMVYL
610 620 630 640 650 660
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMY
.:.: ::.:::::: :: .: :::.:.:. :.::..:::.. :...:::::: ::.:::
CCDS58 ASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMY
670 680 690 700 710 720
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 GKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMI
::. .::.::.::.:::.:.:: ::. :: .:.: : . .:: : :: :: .:.
CCDS58 RKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVML
730 740 750 760 770 780
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 ECWNEFPSRRPRFKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSNVSNARY
::.. :..: .:.:.. :.: :
CCDS58 GCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
790 800 810
>>CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 (825 aa)
initn: 849 init1: 701 opt: 827 Z-score: 372.6 bits: 80.1 E(32554): 2e-14
Smith-Waterman score: 827; 43.2% identity (73.1% similar) in 294 aa overlap (458-750:522-814)
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 CRNKQKASASTPQRRQLMASPSQDMEMPLINQHK-QAKLKEISLSAVRFMEELGEDRFGK
: :: .. ...:. . . .:::: :::
CCDS10 SSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELGEGAFGK
500 510 520 530 540 550
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 VYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVTKD
:. .. .. .: .. . ::.:.::: . . :..:..:: : . ::: ..: . ::
CCDS10 VFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAA-RKDFQREAELLTNLQHEHIVKFYGVCGDG
560 570 580 590 600 610
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 QPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIAAGMEYL
.:: :.: : .::::..:: ..: . . . : .:. : ...:...:::.:: ::
CCDS10 DPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAHGPDAMILVDGQPRQAKGELGLSQMLHIASQIASGMVYL
620 630 640 650 660 670
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SSHHVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMY
.:.: ::.:::::: :: .: :::.:.:. :.::..:::.. :...:::::: ::.:::
CCDS10 ASQHFVHRDLATRNCLVGANLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMY
680 690 700 710 720 730
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 GKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMI
::. .::.::.::.:::.:.:: ::. :: .:.: : . .:: : :: :: .:.
CCDS10 RKFTTESDVWSFGVILWEIFTYGKQPWFQLSNTEVIECITQGRVLERPRVCPKEVYDVML
740 750 760 770 780 790
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 ECWNEFPSRRPRFKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSNVSNARY
::.. :..: .:.:.. :.: :
CCDS10 GCWQREPQQRLNIKEIYKILHALGKATPIYLDILG
800 810 820
>>CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (822 aa)
initn: 866 init1: 585 opt: 820 Z-score: 369.6 bits: 79.5 E(32554): 2.9e-14
Smith-Waterman score: 858; 29.5% identity (53.0% similar) in 759 aa overlap (11-747:149-808)
10 20 30
pF1KE3 MARGSALPRRPLLC-IPAVWAAAALLLSVSRTSGEVEVLD
:. : .: . . : . .. :.
CCDS35 HINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLN
120 130 140 150 160 170
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 P---NDPLGPLDGQDGPIPTLKGYFLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWL
: ::. :. . .:. :. : :.:. .:.. : :.:::.: ::. :
CCDS35 ESSKNIPLANLQIPNCGLPS-----ANLAAP--NLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYW-
180 190 200 210 220 230
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 KNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRLRIQDLDTTDTG-YYQCVATNGMKTITATGVLFVRLG
:. . . .:. :: ::: .... :.: .::: : . . : :...
CCDS35 --DVGNLVSKHMNETSHTQ-GS-LRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFA
240 250 260 270 280
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 PTHSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGIACARFIGNRTIYVDSLQ--MQGEIENRITAAFTMI
:: . .. .:.: .: :. :: .:: ..: : :. : :
CCDS35 PTITFLESPTSDHH---WCIPF------TVKGNPK---PALQWFYNGAILNESKYICTKI
290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 GTSTHLSDQ-CSQFAIPSFCHFVFPLCDARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIAR
...: . : :. :. : . .. : .:: ..
CCDS35 HVTNHTEYHGCLQLDNPT--H----MNNGDYTLIAKNEYGKDEKQI--------------
340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 SNPLILMRLQLPKCEALPMPESPDAANCMRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTTK
: . . : . :. ::. : :. .: . : :. . .: : :
CCDS35 SAHF----MGWPGIDDGANPNYPDVIY-EDYGTAANDIG---DTTNRSN-EIPSTDVTDK
380 390 400 410 420
340 350 360 370 380
pF1KE3 SGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELGGGHAYC-----------RNPGGQMEGPWCFTQN
.:.. ::: ... ..: :. :.:: .:
CCDS35 TGRE------------HLSVYAVVVIASVVGFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKGPASVISN
430 440 450 460 470
390 400 410 420 430
pF1KE3 KNVR---MELCDVPSCSPRDSSKMGILYILVPSIAIPLVIACLFFLVCMCRNKQKASAST
. .. . : .: .::. : ... ::.. .: : . ..
CCDS35 DDDSASPLHHISNGSNTP-SSSEGGPDAVIIGMTKIPVI-----------ENPQYFGITN
480 490 500 510 520
440 450 460 470 480 490
pF1KE3 PQRRQLMASPSQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEELGEDRFGKVYKGHLFGPAPG
: . : : . :..:. . . .:::: ::::. .. .. :
CCDS35 SQLK-----P--DTFVQHIKRHN-----------IVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPE
530 540 550 560
500 510 520 530 540 550
pF1KE3 EQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVTKDQPLSMIFSYCSH
.. ::.::::: ... :..:..:: : . ::: ..: . :: .. .:: :.: : .:
CCDS35 QDKILVAVKTLKDASDNA-RKDFHREAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKH
570 580 590 600 610 620
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 GDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIAAGMEYLSSHHVVHKDLAT
:::..:: ..: . . . . : : ...:.. :::::: ::.:.: ::.::::
CCDS35 GDLNKFLRAHGPDAVLMAEGNPPT---ELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLAT
630 640 650 660 670
620 630 640 650 660 670
pF1KE3 RNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMYGKFSIDSDIWSY
:: :: ..: :::.:.:. :.::..:::.. :...:::::: ::.::: ::. .::.::
CCDS35 RNCLVGENLLVKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSL
680 690 700 710 720 730
680 690 700 710 720 730
pF1KE3 GVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMIECWNEFPSRRPR
::::::.:.:: ::. ::..:.: : . .:: : :: :: ::. ::.. : :
CCDS35 GVVLWEIFTYGKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKN
740 750 760 770 780 790
740 750 760 770 780 790
pF1KE3 FKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSNVSNARYVGPKQKAPPFPQ
.: ::. :.
CCDS35 IKGIHTLLQNLAKASPVYLDILG
800 810 820
>>CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 (838 aa)
initn: 866 init1: 585 opt: 820 Z-score: 369.5 bits: 79.5 E(32554): 2.9e-14
Smith-Waterman score: 877; 29.5% identity (54.1% similar) in 749 aa overlap (11-747:149-824)
10 20 30
pF1KE3 MARGSALPRRPLLC-IPAVWAAAALLLSVSRTSGEVEVLD
:. : .: . . : . .. :.
CCDS66 HINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKTLQEAKSSPDTQDLYCLN
120 130 140 150 160 170
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 P---NDPLGPLDGQDGPIPTLKGYFLNFLEPVNNITIVQGQTAILHCKVAGNPPPNVRWL
: ::. :. . .:. :. : :.:. .:.. : :.:::.: ::. :
CCDS66 ESSKNIPLANLQIPNCGLPS-----ANLAAP--NLTVEEGKSITLSCSVAGDPVPNMYW-
180 190 200 210 220 230
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 KNDAPVVQEPRRIIIRKTEYGSRLRIQDLDTTDTG-YYQCVATNGMKTITATGVLFVRLG
:. . . .:. :: ::: .... :.: .::: : . . : :...
CCDS66 --DVGNLVSKHMNETSHTQ-GS-LRITNISSDDSGKQISCVAENLVGEDQDSVNLTVHFA
240 250 260 270 280
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 PTHSPNHNFQDDYHEDGFCQPYRGIACARFIGNRTIYVDSLQ--MQGEIENRITAAFTMI
:: . .. .:.: .: :. :: .:: ..: : :. : :
CCDS66 PTITFLESPTSDHH---WCIPF------TVKGNPK---PALQWFYNGAILNESKYICTKI
290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 GTSTHLSDQ-CSQFAIPSFCHFVFPLCDARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIAR
...: . : :. :. : . .. : .:: .. . .
CCDS66 HVTNHTEYHGCLQLDNPT--H----MNNGDYTLIAKNEYGKDEKQI-SAHFMGWPGIDDG
340 350 360 370 380
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 SNP-LILMRLQLPKCEALPMPESPDAANCMRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMDYRGTASTT
.:: . . : . .. . .: . ... :: : : . ::..
CCDS66 ANPNYPDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHL----SVYAVVVIASVV
390 400 410 420 430 440
340 350 360 370 380
pF1KE3 KSGHQCQPWALQHPHSHHLSSTDFPELGGGHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVR---MEL
. . :. . ... :: .: :.. : : :: .: . ..
CCDS66 GFCLLVMLFLLKLARHSKFGMKDFSWFGFGKVKSR----QGVGPASVISNDDDSASPLHH
450 460 470 480 490
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 CDVPSCSPRDSSKMGILYILVPSIAIPLVIACLFFLVCMCRNKQKASASTPQRRQLMASP
. : .: .::. : ... ::.. .: : . .. : . :
CCDS66 ISNGSNTP-SSSEGGPDAVIIGMTKIPVI-----------ENPQYFGITNSQLK-----P
500 510 520 530 540
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 SQDMEMPLINQHKQAKLKEISLSAVRFMEELGEDRFGKVYKGHLFGPAPGEQTQAVAIKT
: . :..:. . . .:::: ::::. .. .. : .. ::.::
CCDS66 --DTFVQHIKRHN-----------IVLKRELGEGAFGKVFLAECYNLCPEQDKILVAVKT
550 560 570 580
510 520 530 540 550 560
pF1KE3 LKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVTKDQPLSMIFSYCSHGDLHEFLVMR
::: ... :..:..:: : . ::: ..: . :: .. .:: :.: : .::::..:: .
CCDS66 LKDASDNA-RKDFHREAELLTNLQHEHIVKFYGVCVEGDPLIMVFEYMKHGDLNKFLRAH
590 600 610 620 630 640
570 580 590 600 610 620
pF1KE3 SPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIAAGMEYLSSHHVVHKDLATRNVLVYDKLN
.: . . . . : : ...:.. :::::: ::.:.: ::.:::::: :: ..:
CCDS66 GPDAVLMAEGNPPT---ELTQSQMLHIAQQIAAGMVYLASQHFVHRDLATRNCLVGENLL
650 660 670 680 690 700
630 640 650 660 670 680
pF1KE3 VKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMYGKFSIDSDIWSYGVVLWEVFSY
:::.:.:. :.::..:::.. :...:::::: ::.::: ::. .::.:: ::::::.:.:
CCDS66 VKIGDFGMSRDVYSTDYYRVGGHTMLPIRWMPPESIMYRKFTTESDVWSLGVVLWEIFTY
710 720 730 740 750 760
690 700 710 720 730 740
pF1KE3 GLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMIECWNEFPSRRPRFKDIHSRLRA
: ::. ::..:.: : . .:: : :: :: ::. ::.. : : .: ::. :.
CCDS66 GKQPWYQLSNNEVIECITQGRVLQRPRTCPQEVYELMLGCWQREPHMRKNIKGIHTLLQN
770 780 790 800 810 820
750 760 770 780 790 800
pF1KE3 WGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSNVSNARYVGPKQKAPPFPQPQFIPMKGQI
CCDS66 LAKASPVYLDILG
830
>>CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 (760 aa)
initn: 706 init1: 562 opt: 795 Z-score: 359.7 bits: 77.6 E(32554): 1e-13
Smith-Waterman score: 807; 31.6% identity (60.5% similar) in 529 aa overlap (264-748:235-747)
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 FVFPLCDARSRAPKPRELCRDECEVLESDLCRQEYTIARSNPLILMRLQLPKCEALPMPE
: : ..:.. . . ...: .. .
CCDS30 SATVMKSGGLPSLGLTLANVTSDLNRKNVTCWAENDVGRAEVSVQVNVSFPA--SVQLHT
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340
pF1KE3 SPDAAN-CMRIGIPAERLGRYHQCYNGSGMD--------YRGTASTTKSGHQCQPWALQH
. . . :. ... .. . .::: .. . :.. : : :..
CCDS30 AVEMHHWCIPFSVDGQPAPSLRWLFNGSVLNETSFIFTEFLEPAANETVRHGCL--RLNQ
270 280 290 300 310 320
350 360 370 380 390
pF1KE3 PHSHHLSSTDFPELGG---GHAYCRNPGGQMEGPWCFTQNKNVRMELCDVPSCSP---RD
: :... .. :.. :.: .. :..:. : : . . . : .: .:
CCDS30 P--THVNNGNYTLLAANPFGQASASIMAAFMDNPFEF--NPEDPIPDTNSTSGDPVEKKD
330 340 350 360 370
400 410 420 430 440
pF1KE3 SSKMGILYILVPSIAIPL-VIACLFF----LV---CMCRNK---QKASASTPQRRQLMA-
. .:. :.:. : :.::::. :: : ::: .. .. .:. :.
CCDS30 ETPFGV------SVAVGLAVFACLFLSTLLLVLNKCGRRNKFGINRPAVLAPEDGLAMSL
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480
pF1KE3 ----------SPSQDMEMPL---INQHKQ----AKLKEISLSAVRFMEELGEDRFGKVYK
::.. : : .. : : ...:. . . :::: ::::.
CCDS30 HFMTLGGSSLSPTEGKGSGLQGHIIENPQYFSDACVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFL
440 450 460 470 480 490
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 GHLFGPAPGEQTQAVAIKTLKDKAEGPLREEFRHEAMLRARLQHPNVVCLLGVVTKDQPL
.. . : .. . ::.:.::. .:. :..:..:: : . ::: ..: ..:: :. .::
CCDS30 AECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESA-RQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPL
500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 SMIFSYCSHGDLHEFLVMRSPHSDVGSTDDDRTVKSALEPPDFVHLVAQIAAGMEYLSSH
:.: : ::::..:: ..: . . . .: .. . : ... ...:.:::: ::..
CCDS30 LMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGED-VAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 HVVHKDLATRNVLVYDKLNVKISDLGLFREVYAADYYKLLGNSLLPIRWMAPEAIMYGKF
: ::.:::::: :: . : :::.:.:. :..:..:::.. : ..:::::: ::.:.: ::
CCDS30 HFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 SIDSDIWSYGVVLWEVFSYGLQPYCGYSNQDVVEMIRNRQVLPCPDDCPAWVYALMIECW
. .::.::.::::::.:.:: ::. :: .... : . . : : :: :::.: ::
CCDS30 TTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCW
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 NEFPSRRPRFKDIHSRLRAWGNLSNYNSSAQTSGASNTTQTSSLSTSPVSNVSNARYVGP
.. :..: .::.:.::.:
CCDS30 QREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPVYLDVLG
730 740 750 760
943 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 19:44:23 2016 done: Sun Nov 6 19:44:24 2016
Total Scan time: 3.960 Total Display time: 0.240
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]