Result of FASTA (ccds) for
pF1KE3139
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3139, 350 aa
1>>>pF1KE3139 350 - 350 aa - 350 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1936+/-0.00111; mu= 17.2073+/- 0.067
mean_var=67.8952+/-13.230, 0's: 0 Z-trim(102.6): 50 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.155652
statistics sampled from 6998 (7046) to 6998 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 1.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3 ( 350) 2296 524.8 4.1e-149
CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 ( 354) 1937 444.2 7.6e-125
CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 ( 354) 1860 426.9 1.2e-119
CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 354) 1653 380.4 1.2e-105
CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 ( 354) 1607 370.1 1.5e-102
CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 355) 1605 369.7 2.1e-102
CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 318) 1497 345.4 3.9e-95
CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 339) 1497 345.4 4.1e-95
CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 302) 1471 339.5 2.1e-93
CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1445 333.7 1.4e-91
CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 303) 1418 327.6 8.2e-90
CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 1413 326.6 2e-89
CCDS13804.1 GNAZ gene_id:2781|Hs108|chr22 ( 355) 1293 299.6 2.6e-81
CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9 ( 355) 1094 254.9 7.4e-68
CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9 ( 359) 1093 254.7 8.7e-68
CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19 ( 359) 1086 253.1 2.6e-67
CCDS5335.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 381) 880 206.9 2.3e-53
CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19 ( 374) 871 204.9 9.2e-53
CCDS11661.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 377) 868 204.2 1.5e-52
CCDS11852.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 381) 809 190.9 1.4e-48
CCDS11851.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 458) 802 189.4 5e-48
CCDS42892.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 379) 800 188.9 5.8e-48
CCDS46624.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 380) 788 186.2 3.8e-47
CCDS64584.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 322) 708 168.2 8.5e-42
CCDS62302.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 282) 677 161.2 9.5e-40
CCDS13472.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 394) 626 149.9 3.5e-36
CCDS46623.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 395) 626 149.9 3.5e-36
CCDS64583.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 305) 621 148.7 6.2e-36
CCDS46622.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 (1037) 626 150.1 7.6e-36
CCDS58614.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 174) 366 91.2 6.8e-19
>>CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3 (350 aa)
initn: 2296 init1: 2296 opt: 2296 Z-score: 2790.6 bits: 524.8 E(32554): 4.1e-149
Smith-Waterman score: 2296; 100.0% identity (100.0% similar) in 350 aa overlap (1-350:1-350)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MGAGASAEEKHSRELEKKLKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDGYSLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 MGAGASAEEKHSRELEKKLKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDGYSLE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 ECLEFIAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEEGTMPKEMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 ECLEFIAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEEGTMPKEMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 DIIQRLWKDSGIQACFERASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRVKTTGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 DIIQRLWKDSGIQACFERASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRVKTTGI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 IETQFSFKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDDEVNRMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 IETQFSFKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDDEVNRMH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 ESLHLFNSICNHRYFATTSIVLFLNKKDVFFEKIKKAHLSICFPDYDGPNTYEDAGNYIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 ESLHLFNSICNHRYFATTSIVLFLNKKDVFFEKIKKAHLSICFPDYDGPNTYEDAGNYIK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KE3 VQFLELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS28 VQFLELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 (354 aa)
initn: 1908 init1: 1908 opt: 1937 Z-score: 2354.8 bits: 444.2 E(32554): 7.6e-125
Smith-Waterman score: 1937; 81.9% identity (94.6% similar) in 354 aa overlap (1-350:1-354)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGAGASAEEKH----SRELEKKLKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
::.:::::.:. :.::::::.:::.:.:.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 MGSGASAEDKELAKRSKELEKKLQEDADKEAKTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 YSLEECLEFIAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEEGTMP
:: :::::: ::::::.:::::::.::::::.:.:.. . ::.:.: ..::.:::::::
CCDS80 YSPEECLEFKAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMP
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 KEMSDIIQRLWKDSGIQACFERASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRVK
:. ..:.:::::.:.:::::::.::::::::.:::..:::.. : :.:.::::::::::
CCDS80 PELVEVIRRLWKDGGVQACFERAAEYQLNDSASYYLNQLERITDPEYLPSEQDVLRSRVK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 TTGIIETQFSFKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDDEV
:::::::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS80 TTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDDEV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHRYFATTSIVLFLNKKDVFFEKIKKAHLSICFPDYDGPNTYEDAG
::::::::::::::::..::.:::::::::::.: :::::.:::::::.::: :.:.:::
CCDS80 NRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDDAG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKVQFLELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
:::: :::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS80 NYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 (354 aa)
initn: 1844 init1: 1844 opt: 1860 Z-score: 2261.4 bits: 426.9 E(32554): 1.2e-119
Smith-Waterman score: 1860; 78.2% identity (92.7% similar) in 354 aa overlap (1-350:1-354)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGAGASAEEKHS----RELEKKLKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
::.: :.: :.: .::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::..:
CCDS47 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 YSLEECLEFIAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEEGTMP
:: .::.:: :.::.::::::::::.:::::.:.: . .: :.:. ::.:.:.: :
CCDS47 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDGGMT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 KEMSDIIQRLWKDSGIQACFERASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRVK
.....:.:::.: ::::::::::::::::::.:::.::.:... ::::.:::::.::::
CCDS47 PQLAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRVK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 TTGIIETQFSFKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDDEV
::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::.::
CCDS47 TTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEEV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHRYFATTSIVLFLNKKDVFFEKIKKAHLSICFPDYDGPNTYEDAG
::::::::::::::::.::.::::::::::::.: ::. :.:::::::.: ::::.::::
CCDS47 NRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDAG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKVQFLELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
:::: :::.::.... ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 (354 aa)
initn: 1639 init1: 1639 opt: 1653 Z-score: 2010.2 bits: 380.4 E(32554): 1.2e-105
Smith-Waterman score: 1653; 67.8% identity (89.3% similar) in 354 aa overlap (1-350:1-354)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGAGASAEEK----HSRELEKKLKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
:: :::.: .:. ....:.::.:: :: ::::::::::::::::::::::::. :
CCDS55 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 YSLEECLEFIAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEEGTMP
:: ::: .. :..:.::.:::.::.::: :.:..::::: ::::.:. .: . ::: :
CCDS55 YSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 KEMSDIIQRLWKDSGIQACFERASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRVK
:.. .:.:::::::.::::.:. ::::::::.:::.::.:.. :.:.::.:::::.:::
CCDS55 AELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 TTGIIETQFSFKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDDEV
::::.::.:.::::.:.:::::::::::::::::::::: ::: .::: ::.::.::.:.
CCDS55 TTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHRYFATTSIVLFLNKKDVFFEKIKKAHLSICFPDYDGPNTYEDAG
::::::..::.::::...:. :::.:::::::.: :::::. :.::.:.: : ::::.:.
CCDS55 NRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKVQFLELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
::. :: .:: :.:.::::.:.::::::.::.::::::::.:::.::::::::
CCDS55 AYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 (354 aa)
initn: 1624 init1: 1570 opt: 1607 Z-score: 1954.3 bits: 370.1 E(32554): 1.5e-102
Smith-Waterman score: 1607; 65.0% identity (88.7% similar) in 354 aa overlap (1-350:1-354)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGAGASAEEK----HSRELEKKLKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
:: :::.: .:. ....:.::.:: :. ::::::::::::::::::::::::.::
CCDS80 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 YSLEECLEFIAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEEGTMP
:: .:: .. ...:.::.:::.::.::: :.:..:..:: ::::.:. .: . :::.:
CCDS80 YSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMT
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 KEMSDIIQRLWKDSGIQACFERASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRVK
:.. .:.:::.:.:.:::: :. ::::::::.:::.::.:. .:.::.:::::.:::
CCDS80 PELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 TTGIIETQFSFKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDDEV
::::.::.:.:::: :.:::::::::::::::::::::: ::: .::: ::.::.::.:.
CCDS80 TTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEM
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 NRMHESLHLFNSICNHRYFATTSIVLFLNKKDVFFEKIKKAHLSICFPDYDGPNTYEDAG
::::::..::.::::...:. :::.:::::::.: ::::.. :.::.:.: : ::::.:.
CCDS80 NRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 NYIKVQFLELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
::. :: .:: :.:.::::.:.::::::.::.::::::::.:::.:::.:::.
CCDS80 AYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
310 320 330 340 350
>>CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 1193 init1: 1193 opt: 1605 Z-score: 1951.9 bits: 369.7 E(32554): 2.1e-102
Smith-Waterman score: 1605; 65.9% identity (88.7% similar) in 355 aa overlap (1-350:1-355)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGAGASAEEK----HSRELEKKLKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
:: .:::.: .:. ..:.:.::.:: :: ::::::::::::::::::::::::.::
CCDS28 MGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 YSLEECLEFIAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEE-GTM
:: ::: .. :..:.::.:::.:::.:: .:.:...: .: ::::.:. .. : :: :..
CCDS28 YSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 PKEMSDIIQRLWKDSGIQACFERASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRV
: ..: .:.::: : :.:::: :. ::::::::.:::.::::.. :.::.:::::.::
CCDS28 PDDLSGVIRRLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 KTTGIIETQFSFKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDDE
:::::.::.:.::::.:.:::::::::::::::::::::: ::: .::::::.::.::.:
CCDS28 KTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 VNRMHESLHLFNSICNHRYFATTSIVLFLNKKDVFFEKIKKAHLSICFPDYDGPNTYEDA
.::::::..::.::::...:. :::.:::::::.: ::: .. :.::::.: : : :..:
CCDS28 MNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEA
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 GNYIKVQFLELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
..::. .: .:: :.:.::::.:.::::::.::.::::::::.:::.::::::::
CCDS28 ASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (318 aa)
initn: 1193 init1: 1193 opt: 1497 Z-score: 1821.5 bits: 345.4 E(32554): 3.9e-95
Smith-Waterman score: 1497; 67.4% identity (90.2% similar) in 316 aa overlap (36-350:3-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 SAEEKHSRELEKKLKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDGYSLEECLEF
::::::::::::::::::.:::: ::: ..
CCDS54 MRGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 IAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEE-GTMPKEMSDIIQ
:..:.::.:::.:::.:: .:.:...: .: ::::.:. .. : :: :..: ..: .:.
CCDS54 RAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVLPDDLSGVIR
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RLWKDSGIQACFERASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRVKTTGIIETQ
::: : :.:::: :. ::::::::.:::.::::.. :.::.:::::.:::::::.::.
CCDS54 RLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETH
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FSFKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDDEVNRMHESLH
:.::::.:.:::::::::::::::::::::: ::: .::::::.::.::.:.::::::..
CCDS54 FTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMK
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LFNSICNHRYFATTSIVLFLNKKDVFFEKIKKAHLSICFPDYDGPNTYEDAGNYIKVQFL
::.::::...:. :::.:::::::.: ::: .. :.::::.: : : :..:..::. .:
CCDS54 LFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFE
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350
pF1KE3 ELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
.:: :.:.::::.:.::::::.::.::::::::.:::.::::::::
CCDS54 DLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
280 290 300 310
>>CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (339 aa)
initn: 1193 init1: 1193 opt: 1497 Z-score: 1821.1 bits: 345.4 E(32554): 4.1e-95
Smith-Waterman score: 1497; 67.4% identity (90.2% similar) in 316 aa overlap (36-350:24-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 SAEEKHSRELEKKLKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDGYSLEECLEF
::::::::::::::::::.:::: ::: ..
CCDS63 MTEGVKTLGWTKQKGGCHWGRSEGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 IAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEE-GTMPKEMSDIIQ
:..:.::.:::.:::.:: .:.:...: .: ::::.:. .. : :: :..: ..: .:.
CCDS63 RAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVLPDDLSGVIR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RLWKDSGIQACFERASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRVKTTGIIETQ
::: : :.:::: :. ::::::::.:::.::::.. :.::.:::::.:::::::.::.
CCDS63 RLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETH
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 FSFKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDDEVNRMHESLH
:.::::.:.:::::::::::::::::::::: ::: .::::::.::.::.:.::::::..
CCDS63 FTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LFNSICNHRYFATTSIVLFLNKKDVFFEKIKKAHLSICFPDYDGPNTYEDAGNYIKVQFL
::.::::...:. :::.:::::::.: ::: .. :.::::.: : : :..:..::. .:
CCDS63 LFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KE3 ELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
.:: :.:.::::.:.::::::.::.::::::::.:::.::::::::
CCDS63 DLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
300 310 320 330
>>CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 (302 aa)
initn: 1471 init1: 1471 opt: 1471 Z-score: 1790.3 bits: 339.5 E(32554): 2.1e-93
Smith-Waterman score: 1471; 68.5% identity (90.7% similar) in 302 aa overlap (49-350:1-302)
20 30 40 50 60 70
pF1KE3 LKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDGYSLEECLEFIAIIYGNTLQSIL
:::::. ::: ::: .. :..:.::.:::.
CCDS59 MKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSII
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE3 AIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEEGTMPKEMSDIIQRLWKDSGIQACFER
::.::: :.:..::::: ::::.:. .: . ::: : :.. .:.:::::::.::::.:
CCDS59 AIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNR
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE3 ASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSRVKTTGIIETQFSFKDLNFRMFDVG
. ::::::::.:::.::.:.. :.:.::.:::::.:::::::.::.:.::::.:.:::::
CCDS59 SREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVG
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE3 GQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDDEVNRMHESLHLFNSICNHRYFATT
::::::::::::::::: ::: .::: ::.::.::.:.::::::..::.::::...:. :
CCDS59 GQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDT
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE3 SIVLFLNKKDVFFEKIKKAHLSICFPDYDGPNTYEDAGNYIKVQFLELNMRRDVKEIYSH
::.:::::::.: :::::. :.::.:.: : ::::.:. ::. :: .:: :.:.::::.:
CCDS59 SIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTH
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350
pF1KE3 MTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
.::::::.::.::::::::.:::.::::::::
CCDS59 FTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
280 290 300
>>CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 (354 aa)
initn: 1295 init1: 892 opt: 1445 Z-score: 1757.7 bits: 333.7 E(32554): 1.4e-91
Smith-Waterman score: 1445; 62.6% identity (82.9% similar) in 356 aa overlap (1-350:1-354)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MGAGASAEEK----HSRELEKKLKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
:: ::::. .:. .::.::::. . :. ::::::::::::::::::::::::.::
CCDS10 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 YSLEECLEFIAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEEGTMP
.: :. .. ..:.::.::. :::::: ::.:.:::. :. ::. . ... .:. : :
CCDS10 FSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRMED-TEP
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 --KEMSDIIQRLWKDSGIQACFERASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSR
:. . ..::: ::::: ::.:. :::::::: :::..:.:. . : :::::.::.:
CCDS10 FSAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRTR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 VKTTGIIETQFSFKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDD
::::::.::.:.::.:.::.:::::::::::::::::: :: ::: .:::.::.:: ::.
CCDS10 VKTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHEDE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 EVNRMHESLHLFNSICNHRYFATTSIVLFLNKKDVFFEKIKKAHLSICFPDYDGPNTYED
.::::::: ::.::::...: :::.:::::::.: :::::. :.::::.: :::::::
CCDS10 TTNRMHESLMLFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDLFGEKIKKSPLTICFPEYTGPNTYED
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 AGNYIKVQFLELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
:. ::..:: : . : :::: ::::::::.:.. :::::::::: .::. :::.
CCDS10 AAAYIQAQF-ESKNRSPNKEIYCHMTCATDTNNIQVVFDAVTDIIIANNLRGCGLY
300 310 320 330 340 350
350 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 22:51:49 2016 done: Sat Nov 5 22:51:49 2016
Total Scan time: 1.880 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]