Result of FASTA (omim) for
pF1KE2690
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2690, 543 aa
1>>>pF1KE2690 543 - 543 aa - 543 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
62035967 residues in 87258 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2857+/-0.0003; mu= 16.1695+/- 0.019
mean_var=123.6622+/-24.548, 0's: 0 Z-trim(120.5): 45 B-trim: 116 in 1/55
Lambda= 0.115334
statistics sampled from 36257 (36302) to 36257 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.758), E-opt: 0.2 (0.416), width: 16
Scan time: 9.300
The best scores are: opt bits E(87258)
NP_064718 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel ( 543) 3781 640.1 5.2e-183
NP_064717 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel ( 549) 3406 577.7 3.2e-164
NP_004760 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel ( 531) 3390 575.0 2e-163
NP_001085 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel ( 512) 1027 181.9 4.4e-45
NP_001243759 (OMIM: 602866) acid-sensing ion chann ( 562) 1019 180.6 1.2e-44
NP_001086 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel ( 528) 1006 178.4 5.1e-44
NP_064423 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel ( 574) 1006 178.4 5.4e-44
XP_011536654 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 529) 1000 177.4 1e-43
NP_899233 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel ( 563) 713 129.6 2.5e-29
XP_016859928 (OMIM: 606715) PREDICTED: acid-sensin ( 320) 656 119.9 1.2e-26
NP_878267 (OMIM: 606715) acid-sensing ion channel ( 647) 659 120.7 1.4e-26
NP_061144 (OMIM: 606715) acid-sensing ion channel ( 666) 659 120.7 1.4e-26
XP_011536653 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 559) 575 106.7 2e-22
XP_011536652 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensin ( 560) 569 105.7 4.1e-22
XP_016863780 (OMIM: 616693) PREDICTED: acid-sensin ( 463) 440 84.1 1e-15
NP_059115 (OMIM: 616693) acid-sensing ion channel ( 505) 440 84.2 1.1e-15
NP_001029 (OMIM: 264350,600228,613021) amiloride-s ( 669) 411 79.5 3.8e-14
NP_001153047 (OMIM: 264350,600228,613021) amilorid ( 692) 411 79.5 3.9e-14
NP_001153048 (OMIM: 264350,600228,613021) amilorid ( 728) 411 79.5 4.1e-14
NP_000327 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) amil ( 640) 367 72.1 5.9e-12
XP_011544216 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 646) 367 72.1 5.9e-12
XP_011544215 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 651) 367 72.1 6e-12
XP_016879014 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 659) 367 72.1 6e-12
NP_001030 (OMIM: 177200,264350,600761,613071) amil ( 649) 312 63.0 3.4e-09
XP_011540235 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 638) 264 55.0 8.5e-07
XP_011540234 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 638) 264 55.0 8.5e-07
XP_011540231 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 696) 264 55.0 9e-07
XP_011540227 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 704) 264 55.0 9.1e-07
XP_016857533 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 732) 264 55.0 9.4e-07
XP_011540222 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 736) 264 55.0 9.4e-07
XP_016857532 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 749) 264 55.0 9.5e-07
XP_016857531 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 757) 264 55.1 9.6e-07
XP_016857530 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 760) 264 55.1 9.6e-07
XP_016857529 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 764) 264 55.1 9.7e-07
XP_011540210 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 795) 264 55.1 1e-06
NP_001123885 (OMIM: 601328) amiloride-sensitive so ( 802) 264 55.1 1e-06
XP_016857528 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 810) 264 55.1 1e-06
XP_011540208 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 816) 264 55.1 1e-06
XP_011540207 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 827) 264 55.1 1e-06
XP_016857527 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 846) 264 55.1 1e-06
XP_011540204 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 851) 264 55.1 1e-06
XP_011540203 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 859) 264 55.1 1.1e-06
XP_011540201 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 895) 264 55.1 1.1e-06
XP_016857526 (OMIM: 601328) PREDICTED: amiloride-s ( 895) 264 55.1 1.1e-06
XP_016879015 (OMIM: 177200,211400,264350,600760) P ( 623) 188 42.3 0.0053
>>NP_064718 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel 3 is (543 aa)
initn: 3781 init1: 3781 opt: 3781 Z-score: 3406.8 bits: 640.1 E(87258): 5.2e-183
Smith-Waterman score: 3781; 100.0% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 EHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 TRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 IHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 SPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 KDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 ETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 HSSTNLTSHPSLCRHQDSLRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 HSSTNLTSHPSLCRHQDSLRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQ
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 IKS
:::
NP_064 IKS
>>NP_064717 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel 3 is (549 aa)
initn: 3381 init1: 3381 opt: 3406 Z-score: 3069.5 bits: 577.7 E(87258): 3.2e-164
Smith-Waterman score: 3406; 95.0% identity (96.0% similar) in 525 aa overlap (1-522:1-523)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 EHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 TRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 IHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 SPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 KDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_064 ETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE2 HSSTNLTSHPSLCRHQDS---LRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAFPS
:::::: .. .: :. . : : : : : : : : : ::
NP_064 HSSTNLLQE-GLGSHRTQVPHLSLGPSTLLCSEDLPPLPVPS-PRLSPPPTAPATLSHSS
490 500 510 520 530
540
pF1KE2 SPQIKS
NP_064 RPAVCVLGAPP
540
>>NP_004760 (OMIM: 611741) acid-sensing ion channel 3 is (531 aa)
initn: 3381 init1: 3381 opt: 3390 Z-score: 3055.3 bits: 575.0 E(87258): 2e-163
Smith-Waterman score: 3390; 96.3% identity (96.5% similar) in 513 aa overlap (1-508:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE2 HSSTNLT-----SHPSLCRHQDSLRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAF
:::::: :: . : :: : ::
NP_004 HSSTNLLQEGLGSHRTQVPHL-SLGPRPPTPPCAVTKTLSASHRTCYLVTQL
490 500 510 520 530
540
pF1KE2 PSSPQIKS
>>NP_001085 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel 2 is (512 aa)
initn: 1727 init1: 707 opt: 1027 Z-score: 930.6 bits: 181.9 E(87258): 4.4e-45
Smith-Waterman score: 1747; 49.3% identity (75.3% similar) in 519 aa overlap (7-515:7-507)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
: :. :.:..::.. ..::. :.: : :..:: .::.: : :.. .: .
NP_001 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE2 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLD--
.::: :: ..: : .:: .. :.::::::::.: .: :::: :::. :: : ::
NP_001 SERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDVN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ---PAEHAA---FLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCG
: : : :.:: . . :. :.: .. :.::.: ::.: :.:.:: ::
NP_001 LQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQ-FSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETP
..:::.::..:::: :::: :: ::::..:: ::::.::::.::.::::.: ..:::
NP_001 HQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 FEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYE
::.:..:::::: :::.:..::.::.::.::::. :.:.:..::::::.: :. .. ..
NP_001 FEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMGLDFF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 PEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAH
: :.. .::. :::::....:.::::.::::.: :.:.:.:.::.
NP_001 ---------------PVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAE
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 PAIDAMLRKDS--CACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLA
::. . .::: : : .:: ::: ::::::.:::...:..: .:.:.:: ::.::.:.
NP_001 PALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 LDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLG
::::::::::::.:::::::.. ::::::::::::::::.:::::..::. :....:.:
NP_001 LDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLLD
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 YFWNRQHSQRHSSTNLTSHPSLCRHQDSLRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPS
. ... :. :... .. :.... .. : .:.: :
NP_001 LLGKEEDEGSHDE-NVSTCDTMPNHSETISHTVNV-PLQTTLGTLEEIAC
470 480 490 500 510
540
pF1KE2 LHVAFPSSPQIKS
>>NP_001243759 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel 1 (562 aa)
initn: 1721 init1: 714 opt: 1019 Z-score: 922.8 bits: 180.6 E(87258): 1.2e-44
Smith-Waterman score: 1745; 50.6% identity (76.0% similar) in 516 aa overlap (9-511:57-553)
10 20 30
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSL
:.. : :. .::..:..:: .:.: :.
NP_001 PHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPM-DLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGP
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SLRRGMWAAAVVLSVATFLYQVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLR
. :. .::.: ::....:: ::..:: :: . : : :.: . .: :::::::: : .:
NP_001 GPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVR
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 RSRLTPNDLHWAGSALLGLDPAEHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLD
:.:. :: . . .:::: .. . : ::.: .: : :.. ..: :. : :.
NP_001 LSQLSYPDLLYL-APMLGLDESDDPGVPLA---PPGPEAFSGEP-FNLHRFYNRSCHRLE
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 DMLLDCRFRGQPCGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQ
:::: : ..: ::::.::...:::.::::::::: :: : : .:: ::::.::::.::
NP_001 DMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQ
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 EEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPP
.:::::: ...:: ::.::.::::::.:::.:::::.::.::.::::.::.:.: .::::
NP_001 DEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPP
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 WGDCSSASLNPNYEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGD
:: :...... . : . : :.. .::. :::::....:.::::.::::
NP_001 WGTCKAVTMDSDL-----DFFDS--------YSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGD
330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 VPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLRKDS--CACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARK
.: :.:.:::.:: ::.: ...::. :.: :: :::.::::::.:::.:.:..::.:
NP_001 APYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKK
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 LNRSEAYIAENVLALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEI
.:.:: ::.::.:.::::::.:::::.:::::::.. ::::::::::::::::.::.::.
NP_001 FNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLEL
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460 470 480 490 500
pF1KE2 LDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQRHSSTN--LTSHPSLCRHQ--DSLRLPP-------HL
.:: ::.. :. .....: :. . : .. ::. .::: : ..
NP_001 FDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANI
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540
pF1KE2 LPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQIKS
:: : :
NP_001 LPHHPARGTFEDFTC
550 560
>>NP_001086 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel 1 is (528 aa)
initn: 1720 init1: 711 opt: 1006 Z-score: 911.5 bits: 178.4 E(87258): 5.1e-44
Smith-Waterman score: 1732; 50.7% identity (75.4% similar) in 521 aa overlap (12-511:14-519)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLY
.:.: :..:::. ..:::.:.:. :::.:..:: . :.:..:
NP_001 MELKAEEEEVGGVQPVS-IQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLC
10 20 30 40 50
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pF1KE2 QVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLD
.:::.:: ..:: : ::: . .: ::::::::.: .: :... :::. :: : :.
NP_001 VCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 -----PAEHAA---FLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQP
: . : :. : .: :.: :.: ..: ::::.. ::::.:.:::.
NP_001 NRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKP-FNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 CGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEE
:. :.: ..:::.::::::::: :: : : .:: ::::.::::.::.:::::: ...:
NP_001 CSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 TPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPN
: ::.::.::::::.:::.:::::.::.::.::::.::.:.: .:::::: :...... .
NP_001 TSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 YEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNC
. : :.. .::. :::::....:.::::.::::.: :.:.:::.:
NP_001 LDFFDS-------------YSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKEC
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KE2 AHPAIDAMLRKDS--CACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENV
: ::.: ...::. :.: :: :::.::::::.:::.:.:..::.:.:.:: ::.::.
NP_001 ADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENI
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 LALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKV
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NP_001 LVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKL
410 420 430 440 450 460
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pF1KE2 LGYFWNRQHSQRHSSTN--LTSHPSLCRHQ--DSLRLPP-------HLLPCHTALDLLSV
.....: :. . : .. ::. .::: : ..:: : :
NP_001 CRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFED
470 480 490 500 510 520
520 530 540
pF1KE2 SSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQIKS
NP_001 FTC
>>NP_064423 (OMIM: 602866) acid-sensing ion channel 1 is (574 aa)
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Smith-Waterman score: 1630; 46.6% identity (69.3% similar) in 567 aa overlap (12-511:14-565)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLY
.:.: :..:::. ..:::.:.:. :::.:..:: . :.:..:
NP_064 MELKAEEEEVGGVQPVS-IQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLC
10 20 30 40 50
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pF1KE2 QVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLD
.:::.:: ..:: : ::: . .: ::::::::.: .: :... :::. :: : :.
NP_064 VCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLN
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 -----PAEHAA---FLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQP
: . : :. : .: :.: :.: ..: ::::.. ::::.:.:::.
NP_064 NRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKP-FNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 CGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEE
:. :.: ..:::.::::::::: :: : : .:: ::::.::::.::.:::::: ...:
NP_064 CSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 TPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPN
: ::.::.::::::.:::.:::::.::.::.::::.::.:.: .:::::: :...... .
NP_064 TSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 YEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNC
. : :.. .::. :::::....:.::::.::::.: :.:.:::.:
NP_064 LDFFDS-------------YSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKEC
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KE2 AHPAIDAMLRKDS--CACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENV
: ::.: ...::. :.: :: :::.::::::.:::.:.:..::.:.:.:: ::.::.
NP_064 ADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENI
350 360 370 380 390 400
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pF1KE2 LALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLG--------------------------------
:.::::::.:::::.:::::::.. :::
NP_064 LVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGELLMTPVPFSCHGHGVAPYHPKAGCSLLSHEG
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480
pF1KE2 --------------DIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQRHS
:::::::::::::.::.::..:: ::.. :. .....: :
NP_064 PPPQRPFPKPCCLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSS
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490 500 510 520 530
pF1KE2 STN--LTSHPSLCRHQ--DSLRLPP-------HLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSL
. . : .. ::. .::: : ..:: : :
NP_064 ADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
530 540 550 560 570
540
pF1KE2 HVAFPSSPQIKS
>>XP_011536654 (OMIM: 602866) PREDICTED: acid-sensing io (529 aa)
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Smith-Waterman score: 1726; 50.8% identity (75.3% similar) in 522 aa overlap (12-511:14-520)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLY
.:.: :..:::. ..:::.:.:. :::.:..:: . :.:..:
XP_011 MELKAEEEEVGGVQPVS-IQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 QVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLD
.:::.:: ..:: : ::: . .: ::::::::.: .: :... :::. :: : :.
XP_011 VCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 -----PAEHAA---FLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQP
: . : :. : .: :.: :.: ..: ::::.. ::::.:.:::.
XP_011 NRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKP-FNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 CGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEE
:. :.: ..:::.::::::::: :: : : .:: ::::.::::.::.:::::: ...:
XP_011 CSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE2 TPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQ-QLSFLPPPWGDCSSASLNP
: ::.::.::::::.:::.:::::.::.::.::::.::.: :: .:::::: :......
XP_011 TSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRQLIYLPPPWGTCKAVTMDS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 NYEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKN
. . : :.. .::. :::::....:.::::.::::.: :.:.:::.
XP_011 DLDFFDS-------------YSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKE
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 CAHPAIDAMLRKDS--CACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAEN
:: ::.: ...::. :.: :: :::.::::::.:::.:.:..::.:.:.:: ::.::
XP_011 CADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGEN
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 VLALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDK
.:.::::::.:::::.:::::::.. ::::::::::::::::.::.::..:: ::.. :
XP_011 ILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHK
410 420 430 440 450 460
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pF1KE2 VLGYFWNRQHSQRHSSTN--LTSHPSLCRHQ--DSLRLPP-------HLLPCHTALDLLS
. .....: :. . : .. ::. .::: : ..:: : :
XP_011 LCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFE
470 480 490 500 510 520
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pF1KE2 VSSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQIKS
XP_011 DFTC
>>NP_899233 (OMIM: 601784) acid-sensing ion channel 2 is (563 aa)
initn: 1587 init1: 704 opt: 713 Z-score: 647.7 bits: 129.6 E(87258): 2.5e-29
Smith-Waterman score: 1610; 46.1% identity (71.9% similar) in 534 aa overlap (2-515:46-558)
10 20 30
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGH
. .:: ::: .. : ..::: :
NP_899 GPGRFRMAREEPAPAALAAAGQPGGGRGGERALQGPGVARRGRPSL----SRAKLHGLRH
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KE2 VFG----PGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFP
. . :. ::..:. : : . .: ..:. :. : .: . .. :..: ::
NP_899 MCAGRTAAGGSFQRRALWVLAFCTSFGLLLSWSSNRLLYWLSFPSHTRVHREWSRQLPFP
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130
pF1KE2 AVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPAEHA-AFLRALGRPPAPPG---------
:::.:: :::: ::. .::..:: : : : . : .. : : :
NP_899 AVTVCNNNPLRFPRLSKGDLYYAGHWLGLLLPNRTARPLVSELLRGDEPRRQWFRKLADF
140 150 160 170 180 190
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 --FMPSPTFD--MAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGA
:.: :. : .. : ::.:.::::.:..::. :::.::...::..:::: ::::
NP_899 RLFLPPRHFEGISAAFMDRLGHQLEDMLLSCKYRGELCGPHNFSSVFTKYGKCYMFNSGE
200 210 220 230 240 250
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 DGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQL
:: ::::..:: ::::.::::.::.::::.: ..::: ::.:..:::::: :::.:..:
NP_899 DGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQEL
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 GLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLM
:.::.::.::::. :.:.:..::::::.: :. .. .. : :..
NP_899 GFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMGLDF---------------FPVYSIT
320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 GCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLRKDS--CACPNPCA
.::. :::::....:.::::.::::.: :.:.:.:.::.::. . .::: : : .::
NP_899 ACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNYCLCRTPCN
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 STRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNYETVEQKKAYEM
::: ::::::.:::...:..: .:.:.:: ::.::.:.::::::::::::.:::::::.
NP_899 LTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEV
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 SELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQRHSSTNLTSHPS
. ::::::::::::::::.:::::..::. :....:.: . ... :. :... .
NP_899 AALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLLDLLGKEEDEGSHDE-NVSTCDT
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KE2 LCRHQDSLRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQIKS
. :.... .. : .:.: :
NP_899 MPNHSETISHTVNV-PLQTTLGTLEEIAC
540 550 560
>>XP_016859928 (OMIM: 606715) PREDICTED: acid-sensing io (320 aa)
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