Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2690
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2690, 543 aa
1>>>pF1KE2690 543 - 543 aa - 543 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4922+/-0.000779; mu= 15.0006+/- 0.047
mean_var=123.5355+/-24.135, 0's: 0 Z-trim(113.0): 16 B-trim: 85 in 1/50
Lambda= 0.115393
statistics sampled from 13706 (13722) to 13706 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.422), width: 16
Scan time: 2.950
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5914.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 543) 3781 640.4 1.6e-183
CCDS5915.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 549) 3406 578.0 1e-164
CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 ( 531) 3390 575.3 6.2e-164
CCDS42296.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 ( 512) 1027 181.9 1.6e-45
CCDS58228.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 562) 1019 180.6 4.3e-45
CCDS44876.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 528) 1006 178.4 1.8e-44
CCDS8796.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 ( 574) 1006 178.4 2e-44
CCDS11276.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 ( 563) 713 129.7 9.3e-30
CCDS2442.1 ASIC4 gene_id:55515|Hs108|chr2 ( 647) 659 120.7 5.2e-27
CCDS3793.1 ASIC5 gene_id:51802|Hs108|chr4 ( 505) 440 84.2 4.1e-16
CCDS8543.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 669) 411 79.4 1.4e-14
CCDS53739.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 692) 411 79.5 1.5e-14
CCDS53738.1 SCNN1A gene_id:6337|Hs108|chr12 ( 728) 411 79.5 1.5e-14
CCDS10609.1 SCNN1B gene_id:6338|Hs108|chr16 ( 640) 367 72.1 2.2e-12
>>CCDS5914.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (543 aa)
initn: 3781 init1: 3781 opt: 3781 Z-score: 3408.3 bits: 640.4 E(32554): 1.6e-183
Smith-Waterman score: 3781; 100.0% identity (100.0% similar) in 543 aa overlap (1-543:1-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 HSSTNLTSHPSLCRHQDSLRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 HSSTNLTSHPSLCRHQDSLRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQ
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 IKS
:::
CCDS59 IKS
>>CCDS5915.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (549 aa)
initn: 3381 init1: 3381 opt: 3406 Z-score: 3070.8 bits: 578.0 E(32554): 1e-164
Smith-Waterman score: 3406; 95.0% identity (96.0% similar) in 525 aa overlap (1-522:1-523)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE2 HSSTNLTSHPSLCRHQDS---LRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAFPS
:::::: .. .: :. . : : : : : : : : : ::
CCDS59 HSSTNLLQE-GLGSHRTQVPHLSLGPSTLLCSEDLPPLPVPS-PRLSPPPTAPATLSHSS
490 500 510 520 530
540
pF1KE2 SPQIKS
CCDS59 RPAVCVLGAPP
540
>>CCDS5916.1 ASIC3 gene_id:9311|Hs108|chr7 (531 aa)
initn: 3381 init1: 3381 opt: 3390 Z-score: 3056.6 bits: 575.3 E(32554): 6.2e-164
Smith-Waterman score: 3390; 96.3% identity (96.5% similar) in 513 aa overlap (1-508:1-512)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 EHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 EHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 TRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 IHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 IHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 SPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 KDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 KDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 ETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS59 ETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE2 HSSTNLT-----SHPSLCRHQDSLRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAF
:::::: :: . : :: : ::
CCDS59 HSSTNLLQEGLGSHRTQVPHL-SLGPRPPTPPCAVTKTLSASHRTCYLVTQL
490 500 510 520 530
540
pF1KE2 PSSPQIKS
>>CCDS42296.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 (512 aa)
initn: 1727 init1: 707 opt: 1027 Z-score: 930.8 bits: 181.9 E(32554): 1.6e-45
Smith-Waterman score: 1747; 49.3% identity (75.3% similar) in 519 aa overlap (7-515:7-507)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQV
: :. :.:..::.. ..::. :.: : :..:: .::.: : :.. .: .
CCDS42 MDLKESPSEGSLQPSSIQIFANTSTLHGIRHIFVYGPLTIRRVLWAVAFVGSLGLLLVES
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE2 AERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLD--
.::: :: ..: : .:: .. :.::::::::.: .: :::: :::. :: : ::
CCDS42 SERVSYYFSYQHVTKVDEVVAQSLVFPAVTLCNLNGFRFSRLTTNDLYHAGELLALLDVN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 ---PAEHAA---FLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCG
: : : :.:: . . :. :.: .. :.::.: ::.: :.:.:: ::
CCDS42 LQIPDPHLADPSVLEALRQKANFKHYKPKQ-FSMLEFLHRVGHDLKDMMLYCKFKGQECG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 PENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETP
..:::.::..:::: :::: :: ::::..:: ::::.::::.::.::::.: ..:::
CCDS42 HQDFTTVFTKYGKCYMFNSGEDGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 FEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYE
::.:..:::::: :::.:..::.::.::.::::. :.:.:..::::::.: :. .. ..
CCDS42 FEAGVKVQIHSQSEPPFIQELGFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMGLDFF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 PEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAH
: :.. .::. :::::....:.::::.::::.: :.:.:.:.::.
CCDS42 ---------------PVYSITACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAE
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 PAIDAMLRKDS--CACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLA
::. . .::: : : .:: ::: ::::::.:::...:..: .:.:.:: ::.::.:.
CCDS42 PALGLLAEKDSNYCLCRTPCNLTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 LDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLG
::::::::::::.:::::::.. ::::::::::::::::.:::::..::. :....:.:
CCDS42 LDIFFEALNYETIEQKKAYEVAALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLLD
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 YFWNRQHSQRHSSTNLTSHPSLCRHQDSLRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPS
. ... :. :... .. :.... .. : .:.: :
CCDS42 LLGKEEDEGSHDE-NVSTCDTMPNHSETISHTVNV-PLQTTLGTLEEIAC
470 480 490 500 510
540
pF1KE2 LHVAFPSSPQIKS
>>CCDS58228.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (562 aa)
initn: 1721 init1: 714 opt: 1019 Z-score: 923.1 bits: 180.6 E(32554): 4.3e-45
Smith-Waterman score: 1745; 50.6% identity (76.0% similar) in 516 aa overlap (9-511:57-553)
10 20 30
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSL
:.. : :. .::..:..:: .:.: :.
CCDS58 PHHHQQQQDISESEEEEEEKEKEAVRKEASEGHSPM-DLVAFANSCTLHGTNHIFVEGGP
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SLRRGMWAAAVVLSVATFLYQVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLR
. :. .::.: ::....:: ::..:: :: . : : :.: . .: :::::::: : .:
CCDS58 GPRQVLWAVAFVLALGAFLCQVGDRVAYYLSYPHVTLLNEVATTELAFPAVTLCNTNAVR
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 RSRLTPNDLHWAGSALLGLDPAEHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLD
:.:. :: . . .:::: .. . : ::.: .: : :.. ..: :. : :.
CCDS58 LSQLSYPDLLYL-APMLGLDESDDPGVPLA---PPGPEAFSGEP-FNLHRFYNRSCHRLE
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE2 DMLLDCRFRGQPCGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQ
:::: : ..: ::::.::...:::.::::::::: :: : : .:: ::::.::::.::
CCDS58 DMLLYCSYQGGPCGPHNFSVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQ
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE2 EEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPP
.:::::: ...:: ::.::.::::::.:::.:::::.::.::.::::.::.:.: .::::
CCDS58 DEYLPVWGETDETSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPP
270 280 290 300 310 320
280 290 300 310 320 330
pF1KE2 WGDCSSASLNPNYEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGD
:: :...... . : . : :.. .::. :::::....:.::::.::::
CCDS58 WGTCKAVTMDSDL-----DFFDS--------YSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGD
330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 VPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLRKDS--CACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARK
.: :.:.:::.:: ::.: ...::. :.: :: :::.::::::.:::.:.:..::.:
CCDS58 APYCTPEQYKECADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKK
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 LNRSEAYIAENVLALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEI
.:.:: ::.::.:.::::::.:::::.:::::::.. ::::::::::::::::.::.::.
CCDS58 FNKSEQYIGENILVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLEL
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500
pF1KE2 LDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQRHSSTN--LTSHPSLCRHQ--DSLRLPP-------HL
.:: ::.. :. .....: :. . : .. ::. .::: : ..
CCDS58 FDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANI
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540
pF1KE2 LPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQIKS
:: : :
CCDS58 LPHHPARGTFEDFTC
550 560
>>CCDS44876.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (528 aa)
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Smith-Waterman score: 1732; 50.7% identity (75.4% similar) in 521 aa overlap (12-511:14-519)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLY
.:.: :..:::. ..:::.:.:. :::.:..:: . :.:..:
CCDS44 MELKAEEEEVGGVQPVS-IQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 QVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLD
.:::.:: ..:: : ::: . .: ::::::::.: .: :... :::. :: : :.
CCDS44 VCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 -----PAEHAA---FLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQP
: . : :. : .: :.: :.: ..: ::::.. ::::.:.:::.
CCDS44 NRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKP-FNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 CGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEE
:. :.: ..:::.::::::::: :: : : .:: ::::.::::.::.:::::: ...:
CCDS44 CSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 TPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPN
: ::.::.::::::.:::.:::::.::.::.::::.::.:.: .:::::: :...... .
CCDS44 TSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 YEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNC
. : :.. .::. :::::....:.::::.::::.: :.:.:::.:
CCDS44 LDFFDS-------------YSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKEC
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KE2 AHPAIDAMLRKDS--CACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENV
: ::.: ...::. :.: :: :::.::::::.:::.:.:..::.:.:.:: ::.::.
CCDS44 ADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENI
350 360 370 380 390 400
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pF1KE2 LALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKV
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CCDS44 LVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKL
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510
pF1KE2 LGYFWNRQHSQRHSSTN--LTSHPSLCRHQ--DSLRLPP-------HLLPCHTALDLLSV
.....: :. . : .. ::. .::: : ..:: : :
CCDS44 CRRGKCQKEAKRSSADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFED
470 480 490 500 510 520
520 530 540
pF1KE2 SSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQIKS
CCDS44 FTC
>>CCDS8796.1 ASIC1 gene_id:41|Hs108|chr12 (574 aa)
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Smith-Waterman score: 1630; 46.6% identity (69.3% similar) in 567 aa overlap (12-511:14-565)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLY
.:.: :..:::. ..:::.:.:. :::.:..:: . :.:..:
CCDS87 MELKAEEEEVGGVQPVS-IQAFASSSTLHGLAHIFSYERLSLKRALWALCFLGSLAVLLC
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 QVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLD
.:::.:: ..:: : ::: . .: ::::::::.: .: :... :::. :: : :.
CCDS87 VCTERVQYYFHYHHVTKLDEVAASQLTFPAVTLCNLNEFRFSQVSKNDLYHAGELLALLN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 -----PAEHAA---FLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQP
: . : :. : .: :.: :.: ..: ::::.. ::::.:.:::.
CCDS87 NRYEIPDTQMADEKQLEILQDKANFRSFKPKP-FNMREFYDRAGHDIRDMLLSCHFRGEV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE2 CGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEE
:. :.: ..:::.::::::::: :: : : .:: ::::.::::.::.:::::: ...:
CCDS87 CSAEDFKVVFTRYGKCYTFNSGRDGRPRLKTMKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPVWGETDE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 TPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPN
: ::.::.::::::.:::.:::::.::.::.::::.::.:.: .:::::: :...... .
CCDS87 TSFEAGIKVQIHSQDEPPFIDQLGFGVAPGFQTFVACQEQRLIYLPPPWGTCKAVTMDSD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 YEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNC
. : :.. .::. :::::....:.::::.::::.: :.:.:::.:
CCDS87 LDFFDS-------------YSITACRIDCETRYLVENCNCRMVHMPGDAPYCTPEQYKEC
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KE2 AHPAIDAMLRKDS--CACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENV
: ::.: ...::. :.: :: :::.::::::.:::.:.:..::.:.:.:: ::.::.
CCDS87 ADPALDFLVEKDQEYCVCEMPCNLTRYGKELSMVKIPSKASAKYLAKKFNKSEQYIGENI
350 360 370 380 390 400
410 420 430
pF1KE2 LALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLG--------------------------------
:.::::::.:::::.:::::::.. :::
CCDS87 LVLDIFFEVLNYETIEQKKAYEIAGLLGELLMTPVPFSCHGHGVAPYHPKAGCSLLSHEG
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480
pF1KE2 --------------DIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQRHS
:::::::::::::.::.::..:: ::.. :. .....: :
CCDS87 PPPQRPFPKPCCLGDIGGQMGLFIGASILTVLELFDYAYEVIKHKLCRRGKCQKEAKRSS
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490 500 510 520 530
pF1KE2 STN--LTSHPSLCRHQ--DSLRLPP-------HLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSL
. . : .. ::. .::: : ..:: : :
CCDS87 ADKGVALSLDDVKRHNPCESLRGHPAGMTYAANILPHHPARGTFEDFTC
530 540 550 560 570
540
pF1KE2 HVAFPSSPQIKS
>>CCDS11276.1 ASIC2 gene_id:40|Hs108|chr17 (563 aa)
initn: 1587 init1: 704 opt: 713 Z-score: 647.7 bits: 129.7 E(32554): 9.3e-30
Smith-Waterman score: 1610; 46.1% identity (71.9% similar) in 534 aa overlap (2-515:46-558)
10 20 30
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGH
. .:: ::: .. : ..::: :
CCDS11 GPGRFRMAREEPAPAALAAAGQPGGGRGGERALQGPGVARRGRPSL----SRAKLHGLRH
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KE2 VFG----PGSLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFP
. . :. ::..:. : : . .: ..:. :. : .: . .. :..: ::
CCDS11 MCAGRTAAGGSFQRRALWVLAFCTSFGLLLSWSSNRLLYWLSFPSHTRVHREWSRQLPFP
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130
pF1KE2 AVTLCNINPLRRSRLTPNDLHWAGSALLGLDPAEHA-AFLRALGRPPAPPG---------
:::.:: :::: ::. .::..:: : : : . : .. : : :
CCDS11 AVTVCNNNPLRFPRLSKGDLYYAGHWLGLLLPNRTARPLVSELLRGDEPRRQWFRKLADF
140 150 160 170 180 190
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 --FMPSPTFD--MAQLYARAGHSLDDMLLDCRFRGQPCGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGA
:.: :. : .. : ::.:.::::.:..::. :::.::...::..:::: ::::
CCDS11 RLFLPPRHFEGISAAFMDRLGHQLEDMLLSCKYRGELCGPHNFSSVFTKYGKCYMFNSGE
200 210 220 230 240 250
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 DGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQL
:: ::::..:: ::::.::::.::.::::.: ..::: ::.:..:::::: :::.:..:
CCDS11 DGKPLLTTVKGGTGNGLEIMLDIQQDEYLPIWGETEETTFEAGVKVQIHSQSEPPFIQEL
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 GLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLM
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CCDS11 GFGVAPGFQTFVATQEQRLTYLPPPWGECRSSEMGLDF---------------FPVYSIT
320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 GCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLRKDS--CACPNPCA
.::. :::::....:.::::.::::.: :.:.:.:.::.::. . .::: : : .::
CCDS11 ACRIDCETRYIVENCNCRMVHMPGDAPFCTPEQHKECAEPALGLLAEKDSNYCLCRTPCN
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 STRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNYETVEQKKAYEM
::: ::::::.:::...:..: .:.:.:: ::.::.:.::::::::::::.:::::::.
CCDS11 LTRYNKELSMVKIPSKTSAKYLEKKFNKSEKYISENILVLDIFFEALNYETIEQKKAYEV
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 SELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQRHSSTNLTSHPS
. ::::::::::::::::.:::::..::. :....:.: . ... :. :... .
CCDS11 AALLGDIGGQMGLFIGASILTILELFDYIYELIKEKLLDLLGKEEDEGSHDE-NVSTCDT
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540
pF1KE2 LCRHQDSLRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPRPDILDMPSLHVAFPSSPQIKS
. :.... .. : .:.: :
CCDS11 MPNHSETISHTVNV-PLQTTLGTLEEIAC
540 550 560
>>CCDS2442.1 ASIC4 gene_id:55515|Hs108|chr2 (647 aa)
initn: 1473 init1: 477 opt: 659 Z-score: 598.3 bits: 120.7 E(32554): 5.2e-27
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10 20 30 40
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPGSLSLRRGMW
:. .:::. ..::::.. ::: .::: .:
CCDS24 FAEEDAKPKEKEAGDEQSLLGAVAPGAAPRDLATFASTSTLHGLGRACGPGPHGLRRTLW
140 150 160 170 180 190
50 60 70 80 90 100
pF1KE2 AAAVVLSVATFLYQVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLI-FPAVTLCNINPLRRSRLTP
: :.. :.:.::::.: .: : : .:.: . :::::::::: .:.: :.
CCDS24 ALALLTSLAAFLYQAAGLARGYLTRPHLVAMDPAAPAPVAGFPAVTLCNINRFRHSALSD
200 210 220 230 240 250
110 120 130 140 150 160
pF1KE2 NDL-HWAGSALLGLDPAEHAAFLRALG-RPPAPPGFMPSPTFDMAQLYARAGHSLDDMLL
:. : :. : :: : .. . :: : : : : ::... :.::.: :::
CCDS24 ADIFHLAN--LTGLPPKDRDGH-RAAGLRYPEP---------DMVDILNRTGHQLADMLK
260 270 280 290 300
170 180 190 200 210 220
pF1KE2 DCRFRGQPCGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTRGGMGNGLDIMLDVQQEEYL
.: : :. :. ::....::.::::::: :: : . ::::.::.::::.::::::
CCDS24 SCNFSGHHCSASNFSVVYTRYGKCYTFN--ADPRSSLPSRAGGMGSGLEIMLDIQQEEYL
310 320 330 340 350 360
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 PVWRDNEETPFEVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSPGYQTFVSCQQQQLSFLPPPWGDC
:.::...:: ::.::::::::::::: : :::.:::::.:::::::.:.:..:: :::.:
CCDS24 PIWRETNETSFEAGIRVQIHSQEEPPYIHQLGFGVSPGFQTFVSCQEQRLTYLPQPWGNC
370 380 390 400 410 420
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 SSASLNPNYEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARKCGCRMVYMPGDVPVC
. : ::: : . : :.. .::: :: . : ..: ::::.:: :
CCDS24 RAES--ELREPE----LQGYSA-----YSVSACRLRCEKEAVLQRCHCRMVHMP-DSLGG
430 440 450 460 470
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pF1KE2 SPQQYKNCAHPAIDAMLRKDSCACPNPCASTRYAKELSMVRIPSRAAARFLARKLNRSEA
.:. : : ::.:: :::.::.::::::.:..::.:::: ::.:.
CCDS24 GPE------GP----------CFCPTPCNLTRYGKEISMVRIPNRGSARYLARKYNRNET
480 490 500 510
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 YIAENVLALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGGQMGLFIGASLLTILEILDYLCE
:: :: :.::.:::::. :..::. :: .: ::::.:::::::::::.::.::::::. :
CCDS24 YIRENFLVLDVFFEALTSEAMEQRAAYGLSALLGDLGGQMGLFIGASILTLLEILDYIYE
520 530 540 550 560 570
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 VFRDKVLGYFWNRQHSQRHSSTNLTSHPSLCRHQDSLRLPPHLLPCHTALDLLSVSSEPR
: :. : : : .. ..::
CCDS24 VSWDR-LKRVWRRPKTPLRTSTGGISTLGLQELKEQSPCPSRGRVEGGGVSSLLPNHHHP
580 590 600 610 620 630
>>CCDS3793.1 ASIC5 gene_id:51802|Hs108|chr4 (505 aa)
initn: 772 init1: 309 opt: 440 Z-score: 402.8 bits: 84.2 E(32554): 4.1e-16
Smith-Waterman score: 804; 33.0% identity (59.3% similar) in 479 aa overlap (2-464:26-471)
10 20 30
pF1KE2 MKPTSGPEEARRPASDIRVFASNCSMHGLGHVFGPG
:: .: : .. : :: . :.::. ..
CCDS37 MEQTEKSKVYAENGLLEKIKLCLSKKPLPSPTERKKFDHD---FAISTSFHGIHNIVQNR
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 SLSLRRGMWAAAVVLSVATFLYQVAERVRYYREFHHQTALDERESHRLIFPAVTLCNINP
: ..:: .: ..:. ::. .:. :. : . :... . ... :::::.::.:
CCDS37 S-KIRRVLWLVVVLGSVSLVTWQIYIRLLNYFTWPTTTSIEVQYVEKMEFPAVTFCNLNR
60 70 80 90 100 110
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pF1KE2 LRRSRLTPNDL---HW-AGSALLGLDPAEHAAFLRALGRPPAPPGFMPSPTFDMAQLYAR
.. . .. . : : .: :. : .: . : : .:.....
CCDS37 FQTDAVAKFGVIFFLWHIVSKVLHLQ--EITA--NSTGSREATDFAASHQNFSIVEFIRN
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KE2 AGHSLDD-MLLDCRFRGQPCGPENFTTIFTRMGKCYTFNSGADGAELLTTTR--GGMGNG
: :.. ::::.: :.::.:..:. .::..:.:.::: : : : . : . : :
CCDS37 KGFYLNNSTLLDCEFFGKPCSPKDFAHVFTEYGNCFTFNHG----ETLQAKRKVSVSGRG
180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 LDIMLDVQQEEYLPVWRDNEETPF-EVGIRVQIHSQEEPPIIDQLGLGVSP-GYQTFVSC
:.....:.:: . :: : ..:: ::: .. : .: ::: .:: :... :.
CCDS37 LSLLFNVNQEAFT----DNPALGFVDAGIIFVIHSPKKVPQFDGLGL-LSPVGMHARVTI
230 240 250 260 270 280
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pF1KE2 QQQQLSFLPPPWGDCSSASLNPNYEPEPSDPLGSPSPSPSPPYTLMGCRLACETRYVARK
.: . :::.: ::: . : . : :. :: :..... ..
CCDS37 RQVKTVHQEYPWGEC-----NPNIK------LQNFSS-----YSTSGCLKECKAQHIKKQ
290 300 310 320
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pF1KE2 CGCRMVYMPGDVPVCSPQQYKNCAHPAIDAMLRKDSC-------ACPNPCASTRYAKELS
::: .:: :. :.: .:. :..: . :: : .:: : .: .:
CCDS37 CGCVPFLLPGYGIECDLQKYFSCVSPVLDHIEFKDLCTVGTHNSSCPVSCEEIEYPATIS
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 MVRIPSRAAARFLARKLNRSEAYIAENVLALDIFFEALNYETVEQKKAYEMSELLGDIGG
. .::. : ..:..:::.:. :: ::.. ..: . :::. ..:.:: .::::.:.::
CCDS37 YSSFPSQKALKYLSKKLNQSRKYIRENLVKIEINYSDLNYKITQQQKAVSVSELLADLGG
390 400 410 420 430 440
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pF1KE2 QMGLFIGASLLTILEILDYLCEVFRDKVLGYFWNRQHSQRHSSTNLTSHPSLCRHQDSLR
:.::: ::::.::.::..:: :
CCDS37 QLGLFCGASLITIIEIIEYLFTNFYWICIFFLLKISEMTQWTPPPQNHLGNKNRIEEC
450 460 470 480 490 500
543 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Jun 2 11:45:33 2017 done: Fri Jun 2 11:45:34 2017
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]