Result of FASTA (omim) for
pF1KE2677
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2677, 1820 aa
1>>>pF1KE2677 1820 - 1820 aa - 1820 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
61573307 residues in 86401 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 18.2569+/-0.000827; mu= -38.7976+/- 0.051
mean_var=830.4201+/-176.265, 0's: 0 Z-trim(113.5): 619 B-trim: 0 in 0/55
Lambda= 0.044507
statistics sampled from 22369 (22951) to 22369 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.548), E-opt: 0.2 (0.266), width: 16
Scan time: 12.110
The best scores are: opt bits E(86401)
NP_001271188 (OMIM: 605498) kinesin-like protein K (1820) 11453 753.5 4.3e-216
NP_057279 (OMIM: 605498) kinesin-like protein KIF2 (1780) 6978 466.1 1.3e-129
XP_011529848 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2633) 803 69.8 4.2e-10
XP_016863148 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2551) 794 69.2 6e-10
XP_011529851 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2553) 794 69.2 6e-10
XP_011529850 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2604) 794 69.2 6.1e-10
XP_011529849 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2605) 794 69.2 6.1e-10
XP_011529847 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2648) 794 69.2 6.2e-10
NP_001804 (OMIM: 117143,616051) centromere-associa (2701) 794 69.2 6.3e-10
NP_004847 (OMIM: 605064) kinesin-like protein KIF2 ( 856) 765 67.0 9e-10
NP_612565 (OMIM: 605064) kinesin-like protein KIF2 ( 960) 765 67.0 9.9e-10
NP_001273663 (OMIM: 117143,616051) centromere-asso (2580) 699 63.1 4.2e-08
XP_011529846 (OMIM: 117143,616051) PREDICTED: cent (2676) 699 63.1 4.3e-08
NP_060046 (OMIM: 611253) kinesin-like protein KIF2 (1401) 612 57.3 1.2e-06
XP_016870393 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1401) 612 57.3 1.2e-06
XP_016870392 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1401) 612 57.3 1.2e-06
XP_011520541 (OMIM: 605064) PREDICTED: kinesin-lik ( 839) 562 54.0 7.5e-06
NP_001258856 (OMIM: 611253) kinesin-like protein K (1335) 563 54.2 1e-05
XP_016870396 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1335) 563 54.2 1e-05
NP_002069 (OMIM: 602509) golgin subfamily A member (2230) 569 54.7 1.2e-05
NP_001166184 (OMIM: 602509) golgin subfamily A mem (2243) 569 54.7 1.2e-05
XP_005265131 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2245) 569 54.7 1.2e-05
XP_016861675 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2251) 569 54.7 1.2e-05
XP_016861674 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2251) 569 54.7 1.2e-05
XP_005265130 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2252) 569 54.7 1.2e-05
XP_016861673 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2276) 569 54.7 1.2e-05
XP_005265128 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2278) 569 54.7 1.2e-05
XP_005265127 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2283) 569 54.7 1.2e-05
XP_005265126 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2285) 569 54.7 1.2e-05
XP_016870395 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1355) 559 53.9 1.3e-05
NP_004514 (OMIM: 148760,152950) kinesin-like prote (1056) 549 53.2 1.6e-05
XP_016870390 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 554 53.6 1.6e-05
XP_011517152 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 554 53.6 1.6e-05
XP_016870389 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 554 53.6 1.6e-05
XP_011517151 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 554 53.6 1.6e-05
XP_016870391 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 554 53.6 1.6e-05
XP_011517150 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1427) 554 53.6 1.6e-05
XP_005265132 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2214) 562 54.2 1.6e-05
XP_016861676 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2236) 562 54.2 1.7e-05
XP_005265129 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2269) 562 54.2 1.7e-05
XP_016861677 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2195) 559 54.0 1.9e-05
XP_006713173 (OMIM: 602509) PREDICTED: golgin subf (2250) 559 54.0 1.9e-05
NP_001258857 (OMIM: 611253) kinesin-like protein K (1304) 549 53.3 1.9e-05
XP_016870397 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1304) 549 53.3 1.9e-05
NP_001268230 (OMIM: 605064) kinesin-like protein K ( 766) 531 52.0 2.8e-05
XP_005254856 (OMIM: 605064) PREDICTED: kinesin-lik ( 870) 519 51.2 5.2e-05
XP_005254855 (OMIM: 605064) PREDICTED: kinesin-lik ( 890) 519 51.2 5.3e-05
XP_005254854 (OMIM: 605064) PREDICTED: kinesin-lik ( 925) 519 51.2 5.5e-05
XP_016870394 (OMIM: 611253) PREDICTED: kinesin-lik (1361) 526 51.8 5.5e-05
XP_005254853 (OMIM: 605064) PREDICTED: kinesin-lik ( 974) 519 51.3 5.7e-05
>>NP_001271188 (OMIM: 605498) kinesin-like protein KIF20 (1820 aa)
initn: 11453 init1: 11453 opt: 11453 Z-score: 4000.6 bits: 753.5 E(86401): 4.3e-216
Smith-Waterman score: 11453; 99.9% identity (99.9% similar) in 1820 aa overlap (1-1820:1-1820)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MESNFNQEGVPRPSYVFSADPIARPSEINFDGIKLDLSHEFSLVAPNTEANSFESKDYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MESNFNQEGVPRPSYVFSADPIARPSEINFDGIKLDLSHEFSLVAPNTEANSFESKDYLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VCLRIRPFTQSEKELESEGCVHILDSQTVVLKEPQCILGRLSEKSSGQMAQKFSFSKVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VCLRIRPFTQSEKELESEGCVHILDSQTVVLKEPQCILGRLSEKSSGQMAQKFSFSKVFG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PATTQKEFFQGCIMQPVKDLLKGQSRLIFTYGLTNSGKTYTFQGTEENIGILPRTLNVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PATTQKEFFQGCIMQPVKDLLKGQSRLIFTYGLTNSGKTYTFQGTEENIGILPRTLNVLF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DSLQERLYTKMNLKPHRSREYLRLSSEQEKEEIASKSALLRQIKEVTVHNDSDDTLYGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DSLQERLYTKMNLKPHRSREYLRLSSEQEKEEIASKSALLRQIKEVTVHNDSDDTLYGSL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 TNSLNISEFEESIKDYEQANLNMANSIKFSVWVSFFEIYNEYIYDLFVPVSSKFQKRKML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TNSLNISEFEESIKDYEQANLNMANSIKFSVWVSFFEIYNEYIYDLFVPVSSKFQKRKML
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 RLSQDVKGYSFIKDLQWIQVSDSKEAYRLLKLGIKHQSVAFTKLNNASSRSHSIFTVKIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLSQDVKGYSFIKDLQWIQVSDSKEAYRLLKLGIKHQSVAFTKLNNASSRSHSIFTVKIL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 QIEDSEMSRVIRVSELSLCDLAGSERTMKTQNEGERLRETGNINTSLLTLGKCINVLKNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIEDSEMSRVIRVSELSLCDLAGSERTMKTQNEGERLRETGNINTSLLTLGKCINVLKNS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 EKSKFQQHVPFRESKLTHYFQSFFNGKGKICMIVNISQCYLAYDETLNVLKFSAIAQKVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKSKFQQHVPFRESKLTHYFQSFFNGKGKICMIVNISQCYLAYDETLNVLKFSAIAQKVC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VPDTLNSSQDKLFGPVKSSQDVSLDSNSNSKILNVKRATISWENSLEDLMEDEDLVEELE
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VPDTLNSSQEKLFGPVKSSQDVSLDSNSNSKILNVKRATISWENSLEDLMEDEDLVEELE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 NAEETQNVETKLLDEDLDKTLEENKAFISHEEKRKLLDLIEDLKKKLINEKKEKLTLEFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NAEETQNVETKLLDEDLDKTLEENKAFISHEEKRKLLDLIEDLKKKLINEKKEKLTLEFK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 IREEVTQEFTQYWAQREADFKETLLQEREILEENAERRLAIFKDLVGKCDTREEAAKDIC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IREEVTQEFTQYWAQREADFKETLLQEREILEENAERRLAIFKDLVGKCDTREEAAKDIC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 ATKVETEETHNYVGFEDIIDSLQDNVADIKKQAEIAHLYIASLPDPQEATACLELKFNQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATKVETEETHNYVGFEDIIDSLQDNVADIKKQAEIAHLYIASLPDPQEATACLELKFNQI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 KAELAKTKGELIKTKEELKKRENESDSLIQELETSNKKIITQNQRIKELINIIDQKEDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KAELAKTKGELIKTKEELKKRENESDSLIQELETSNKKIITQNQRIKELINIIDQKEDTI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 NEFQNLKSHMENTFKCNDKADTSSLIINNKLICNETVEVPKDSKSKICSERKRVNENELQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NEFQNLKSHMENTFKCNDKADTSSLIINNKLICNETVEVPKDSKSKICSERKRVNENELQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 QDEPPAKKGSIHVSSAITEDQKKSEEVRPNIAEIEDIRVLQENNEGLRAFLLTIENELKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDEPPAKKGSIHVSSAITEDQKKSEEVRPNIAEIEDIRVLQENNEGLRAFLLTIENELKN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 EKEEKAELNKQIVHFQQELSLSEKKNLTLSKEVQQIQSNYDIAIAELHVQKSKNQEQEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKEEKAELNKQIVHFQQELSLSEKKNLTLSKEVQQIQSNYDIAIAELHVQKSKNQEQEEK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 IMKLSNEIETATRSITNNVSQIKLMHTKIDELRTLDSVSQISNIDLLNLRDLSNGSEEDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IMKLSNEIETATRSITNNVSQIKLMHTKIDELRTLDSVSQISNIDLLNLRDLSNGSEEDN
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 LPNTQLDLLGNDYLVSKQVKEYRIQEPNRENSFHSSIEAIWEECKEIVKASSKKSHQIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPNTQLDLLGNDYLVSKQVKEYRIQEPNRENSFHSSIEAIWEECKEIVKASSKKSHQIEE
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE2 LEQQIEKLQAEVKGYKDENNRLKEKEHKNQDDLLKEKETLIQQLKEELQEKNVTLDVQIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEQQIEKLQAEVKGYKDENNRLKEKEHKNQDDLLKEKETLIQQLKEELQEKNVTLDVQIQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE2 HVVEGKRALSELTQGVTCYKAKIKELETILETQKVERSHSAKLEQDILEKESIILKLERN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::
NP_001 HVVEGKRALSELTQGVTCYKAKIKELETILETQKVECSHSAKLEQDILEKESIILKLERN
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE2 LKEFQEHLQDSVKNTKDLNVKELKLKEEITQLTNNLQDMKHLLQLKEEEEETNRQETEKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKEFQEHLQDSVKNTKDLNVKELKLKEEITQLTNNLQDMKHLLQLKEEEEETNRQETEKL
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE2 KEELSASSARTQNLKADLQRKEEDYADLKEKLTDAKKQIKQVQKEVSVMRDEDKLLRIKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KEELSASSARTQNLKADLQRKEEDYADLKEKLTDAKKQIKQVQKEVSVMRDEDKLLRIKI
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE2 NELEKKKNQCSQELDMKQRTIQQLKEQLNNQKVEEAIQQYERACKDLNVKEKIIEDMRMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NELEKKKNQCSQELDMKQRTIQQLKEQLNNQKVEEAIQQYERACKDLNVKEKIIEDMRMT
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KE2 LEEQEQTQVEQDQVLEAKLEEVERLATELEKWKEKCNDLETKNNQRSNKEHENNTDVLGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEEQEQTQVEQDQVLEAKLEEVERLATELEKWKEKCNDLETKNNQRSNKEHENNTDVLGK
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE2 LTNLQDELQESEQKYNADRKKWLEEKMMLITQAKEAENIRNKEMKKYAEDRERFFKQQNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTNLQDELQESEQKYNADRKKWLEEKMMLITQAKEAENIRNKEMKKYAEDRERFFKQQNE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KE2 MEILTAQLTEKDSDLQKWREERDQLVAALEIQLKALISSNVQKDNEIEQLKRIISETSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEILTAQLTEKDSDLQKWREERDQLVAALEIQLKALISSNVQKDNEIEQLKRIISETSKI
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KE2 ETQIMDIKPKRISSADPDKLQTEPLSTSFEISRNKIEDGSVVLDSCEVSTENDQSTRFPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ETQIMDIKPKRISSADPDKLQTEPLSTSFEISRNKIEDGSVVLDSCEVSTENDQSTRFPK
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KE2 PELEIQFTPLQPNKMAVKHPGCTTPVTVKIPKARKRKSNEMEEDLVKCENKKNATPRTNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PELEIQFTPLQPNKMAVKHPGCTTPVTVKIPKARKRKSNEMEEDLVKCENKKNATPRTNL
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KE2 KFPISDDRNSSVKKEQKVAIRPSSKKTYSLRSQASIIGVNLATKKKEGTLQKFGDFLQHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KFPISDDRNSSVKKEQKVAIRPSSKKTYSLRSQASIIGVNLATKKKEGTLQKFGDFLQHS
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE2 PSILQSKAKKIIETMSSSKLSNVEASKENVSQPKRAKRKLYTSEISSPIDISGQVILMDQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PSILQSKAKKIIETMSSSKLSNVEASKENVSQPKRAKRKLYTSEISSPIDISGQVILMDQ
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820
pF1KE2 KMKESDHQIIKRRLRTKTAK
::::::::::::::::::::
NP_001 KMKESDHQIIKRRLRTKTAK
1810 1820
>>NP_057279 (OMIM: 605498) kinesin-like protein KIF20B i (1780 aa)
initn: 6937 init1: 6937 opt: 6978 Z-score: 2447.9 bits: 466.1 E(86401): 1.3e-129
Smith-Waterman score: 11101; 97.7% identity (97.7% similar) in 1820 aa overlap (1-1820:1-1780)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MESNFNQEGVPRPSYVFSADPIARPSEINFDGIKLDLSHEFSLVAPNTEANSFESKDYLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MESNFNQEGVPRPSYVFSADPIARPSEINFDGIKLDLSHEFSLVAPNTEANSFESKDYLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 VCLRIRPFTQSEKELESEGCVHILDSQTVVLKEPQCILGRLSEKSSGQMAQKFSFSKVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 VCLRIRPFTQSEKELESEGCVHILDSQTVVLKEPQCILGRLSEKSSGQMAQKFSFSKVFG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 PATTQKEFFQGCIMQPVKDLLKGQSRLIFTYGLTNSGKTYTFQGTEENIGILPRTLNVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 PATTQKEFFQGCIMQPVKDLLKGQSRLIFTYGLTNSGKTYTFQGTEENIGILPRTLNVLF
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