Result of FASTA (ccds) for
pF1KE2672
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2672, 765 aa
1>>>pF1KE2672 765 - 765 aa - 765 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8366+/-0.00114; mu= 12.9040+/- 0.068
mean_var=121.0174+/-24.317, 0's: 0 Z-trim(105.7): 47 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.116587
statistics sampled from 8567 (8594) to 8567 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 3.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5874.2 TRPV6 gene_id:55503|Hs108|chr7 ( 765) 5171 881.9 0
CCDS5875.1 TRPV5 gene_id:56302|Hs108|chr7 ( 729) 3577 613.7 3.2e-175
CCDS53829.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 837) 561 106.5 1.8e-22
CCDS9134.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 871) 561 106.5 1.9e-22
CCDS32576.1 TRPV2 gene_id:51393|Hs108|chr17 ( 764) 528 100.9 8e-21
CCDS45576.1 TRPV1 gene_id:7442|Hs108|chr17 ( 839) 503 96.7 1.6e-19
CCDS53828.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 ( 824) 467 90.7 1e-17
>>CCDS5874.2 TRPV6 gene_id:55503|Hs108|chr7 (765 aa)
initn: 5171 init1: 5171 opt: 5171 Z-score: 4708.0 bits: 881.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5171; 100.0% identity (100.0% similar) in 765 aa overlap (1-765:1-765)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGPLQGDGGPALGGADVAPRLSPVRVWPRPQAPKEPALHPMGLSLPKEKGLILCLWSKFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MGPLQGDGGPALGGADVAPRLSPVRVWPRPQAPKEPALHPMGLSLPKEKGLILCLWSKFC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 RWFQRRESWAQSRDEQNLLQQKRIWESPLLLAAKDNDVQALNKLLKYEDCKVHQRGAMGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RWFQRRESWAQSRDEQNLLQQKRIWESPLLLAAKDNDVQALNKLLKYEDCKVHQRGAMGE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 TALHIAALYDNLEAAMVLMEAAPELVFEPMTSELYEGQTALHIAVVNQNMNLVRALLARR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TALHIAALYDNLEAAMVLMEAAPELVFEPMTSELYEGQTALHIAVVNQNMNLVRALLARR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 ASVSARATGTAFRRSPCNLIYFGEHPLSFAACVNSEEIVRLLIEHGADIRAQDSLGNTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ASVSARATGTAFRRSPCNLIYFGEHPLSFAACVNSEEIVRLLIEHGADIRAQDSLGNTVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 HILILQPNKTFACQMYNLLLSYDRHGDHLQPLDLVPNHQGLTPFKLAGVEGNTVMFQHLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HILILQPNKTFACQMYNLLLSYDRHGDHLQPLDLVPNHQGLTPFKLAGVEGNTVMFQHLM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 QKRKHTQWTYGPLTSTLYDLTEIDSSGDEQSLLELIITTKKREARQILDQTPVKELVSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QKRKHTQWTYGPLTSTLYDLTEIDSSGDEQSLLELIITTKKREARQILDQTPVKELVSLK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 WKRYGRPYFCMLGAIYLLYIICFTMCCIYRPLKPRTNNRTSPRDNTLLQQKLLQEAYMTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WKRYGRPYFCMLGAIYLLYIICFTMCCIYRPLKPRTNNRTSPRDNTLLQQKLLQEAYMTP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 KDDIRLVGELVTVIGAIIILLVEVPDIFRMGVTRFFGQTILGGPFHVLIITYAFMVLVTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KDDIRLVGELVTVIGAIIILLVEVPDIFRMGVTRFFGQTILGGPFHVLIITYAFMVLVTM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VMRLISASGEVVPMSFALVLGWCNVMYFARGFQMLGPFTIMIQKMIFGDLMRFCWLMAVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VMRLISASGEVVPMSFALVLGWCNVMYFARGFQMLGPFTIMIQKMIFGDLMRFCWLMAVV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 ILGFASAFYIIFQTEDPEELGHFYDYPMALFSTFELFLTIIDGPANYNVDLPFMYSITYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ILGFASAFYIIFQTEDPEELGHFYDYPMALFSTFELFLTIIDGPANYNVDLPFMYSITYA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 AFAIIATLLMLNLLIAMMGDTHWRVAHERDELWRAQIVATTVMLERKLPRCLWPRSGICG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AFAIIATLLMLNLLIAMMGDTHWRVAHERDELWRAQIVATTVMLERKLPRCLWPRSGICG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 REYGLGDRWFLRVEDRQDLNRQRIQRYAQAFHTRGSEDLDKDSVEKLELGCPFSPHLSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 REYGLGDRWFLRVEDRQDLNRQRIQRYAQAFHTRGSEDLDKDSVEKLELGCPFSPHLSLP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KE2 MPSVSRSTSRSSANWERLRQGTLRRDLRGIINRGLEDGESWEYQI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MPSVSRSTSRSSANWERLRQGTLRRDLRGIINRGLEDGESWEYQI
730 740 750 760
>>CCDS5875.1 TRPV5 gene_id:56302|Hs108|chr7 (729 aa)
initn: 3547 init1: 3503 opt: 3577 Z-score: 3259.3 bits: 613.7 E(32554): 3.2e-175
Smith-Waterman score: 3577; 74.8% identity (87.8% similar) in 729 aa overlap (41-759:1-724)
20 30 40 50 60 70
pF1KE2 ALGGADVAPRLSPVRVWPRPQAPKEPALHPMGLSLPKEKGLILCLWSKFCRWFQRRESWA
:: ::: .: : . . .. :...:
CCDS58 MGGFLPKAEGPGSQLQKLLPSFLVREQDWD
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE2 QSRDEQNLLQQKRIWESPLLLAAKDNDVQALNKLLKYEDCKVHQRGAMGETALHIAALYD
: :. ..:::::: ::::: :.:.::...: .:: : :.::::.::::::::::::
CCDS58 QHLDKLHMLQQKRILESPLLRASKENDLSVLRQLLLDCTCDVRQRGALGETALHIAALYD
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE2 NLEAAMVLMEAAPELVFEPMTSELYEGQTALHIAVVNQNMNLVRALLARRASVSARATGT
:::::.::::::::::::: : : . :::::::::::::.:::::::.::::::::::::
CCDS58 NLEAALVLMEAAPELVFEPTTCEAFAGQTALHIAVVNQNVNLVRALLTRRASVSARATGT
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE2 AFRRSPCNLIYFGEHPLSFAACVNSEEIVRLLIEHGADIRAQDSLGNTVLHILILQPNKT
:::.:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AFRHSPRNLIYFGEHPLSFAACVNSEEIVRLLIEHGADIRAQDSLGNTVLHILILQPNKT
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 FACQMYNLLLSYDRHGDHLQPLDLVPNHQGLTPFKLAGVEGNTVMFQHLMQKRKHTQWTY
::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: ::::
CCDS58 FACQMYNLLLSYDGHGDHLQPLDLVPNHQGLTPFKLAGVEGNTVMFQHLMQKRRHIQWTY
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 GPLTSTLYDLTEIDSSGDEQSLLELIITTKKREARQILDQTPVKELVSLKWKRYGRPYFC
::::: ::::::::: :.: :.:::.... ::::::::.:::::::::.::..:::::::
CCDS58 GPLTSILYDLTEIDSWGEELSFLELVVSSDKREARQILEQTPVKELVSFKWNKYGRPYFC
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 MLGAIYLLYIICFTMCCIYRPLKPRTNNRTSPRDNTLLQQKLLQEAYMTPKDDIRLVGEL
.:.:.::::.:::: ::.::::: : .::: :: :.:::::::::: : .: :::::::
CCDS58 ILAALYLLYMICFTTCCVYRPLKFRGGNRTHSRDITILQQKLLQEAYETREDIIRLVGEL
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KE2 VTVIGAIIILLVEVPDIFRMGVTRFFGQTILGGPFHVLIITYAFMVLVTMVMRLISASGE
:...::.::::.:.:::::.:..:.::.:::::::::.::::: .::::::::: ...::
CCDS58 VSIVGAVIILLLEIPDIFRVGASRYFGKTILGGPFHVIIITYASLVLVTMVMRLTNTNGE
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KE2 VVPMSFALVLGWCNVMYFARGFQMLGPFTIMIQKMIFGDLMRFCWLMAVVILGFASAFYI
:::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VVPMSFALVLGWCSVMYFTRGFQMLGPFTIMIQKMIFGDLMRFCWLMAVVILGFASAFYI
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KE2 IFQTEDPEELGHFYDYPMALFSTFELFLTIIDGPANYNVDLPFMYSITYAAFAIIATLLM
::::::: ::.:::::::::.:::::::.::.::::.::::::.::. ::.:::::::
CCDS58 IFQTEDPTSLGQFYDYPMALFTTFELFLTVIDAPANYDVDLPFMFSIVNFAFTIIATLLM
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KE2 LNLLIAMMGDTHWRVAHERDELWRAQIVATTVMLERKLPRCLWPRSGICGREYGLGDRWF
:::.::::::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::: :.:::::::
CCDS58 LNLFIAMMGDTHWRVAQERDELWRAQVVATTVMLERKLPRCLWPRSGICGCEFGLGDRWF
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720
pF1KE2 LRVEDRQDLNRQRIQRYAQAFHTRGSEDLDKDSVEKL----ELGCPFSPHLSLPMPSVSR
::::...: : :. ::...:.. .:: .. :: : : :.:: :.::
CCDS58 LRVENHNDQNPLRVLRYVEVFKNSDKEDDQEHPSEKQPSGAESGTLARASLALPTSSLSR
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760
pF1KE2 STSRSSAN--WERLRQGTLRRDLRGIINRGLE----DGESWEYQI
..:.::.. :: :::.:: : .: ::. :::
CCDS58 TASQSSSHRGWEILRQNTL-----GHLNLGLNLSEGDGEEVYHF
700 710 720
>>CCDS53829.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 (837 aa)
initn: 808 init1: 203 opt: 561 Z-score: 516.8 bits: 106.5 E(32554): 1.8e-22
Smith-Waterman score: 941; 33.8% identity (61.6% similar) in 580 aa overlap (144-675:191-748)
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 QRGAMGETALHIAALYDNLEAAMVLMEAAPELVFEPMTSELYEGQTALHIAVVNQNMNLV
:.. :. . :.::::::::. . . :
CCDS53 LPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRGQTALHIAIERRCKHYV
170 180 190 200 210 220
180 190 200 210 220
pF1KE2 RALLARRASVSARATGTAFR-RSPCNLIYFGEHPLSFAACVNSEEIVRLLIEHG---ADI
. :.:. :.: :.: : :. .. . .:::: :::.:::.:. .:: : :. ::.
CCDS53 ELLVAQGADVHAQARGRFFQPKDEGGYFYFGELPLSLAACTNQPHIVNYLTENPHKKADM
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 RAQDSLGNTVLHILI-----LQPNKTFACQMYNLLLSYDRHGDHLQPLDLVPNHQGLTPF
: ::: :::::: :. . : :. .::.::: . . :. : :..::.:.
CCDS53 RRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGLSPL
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330
pF1KE2 KLAGVEGNTVMFQHLMQK-----------RKHTQWTYGPLTSTLYDLTEIDSSGDEQSLL
.:. :. .:::.... :: .:.:::. :.::::. .:. :.: :.:
CCDS53 MMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTCGEEASVL
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 ELIITTKKREAR-QILDQTPVKELVSLKWKRYGRPYFCMLGAIYLLYIICFTMCCIYRPL
:... ..: : : ..: :..::. ::...: : . . :: .. ::. :.::
CCDS53 EILVYNSKIENRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLCAMVIFTLTAYYQPL
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 KPRTNNRTSPRDNTLLQQKLLQEAYMTPKDDIRLVGELVTVIGAIIILLVEVPDIFRM--
. : : : : : .::.::..:.. ......... :.:
CCDS53 EG-----TPPYP------------YRTTVDYLRLAGEVITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKC
470 480 490 500
460 470 480 490 500
pF1KE2 -GVTRFFGQTILGGPFHVLIITYAFMVLVTMVMRLISASGEVVPMSFALVLGWCNVMYFA
::. .: . : :..: . :. .:.:. .. : . . .. : ::::::: :..::.
CCDS53 PGVNSLF----IDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFALVLGWMNALYFT
510 520 530 540 550
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 RGFQMLGPFTIMIQKMIFGDLMRFCWLMAVVILGFASAFYIIFQ--------TEDPEELG
::... : ..:::::..: ::.:: .. . ..:.:::. ... .:: .
CCDS53 RGLKLTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCT
560 570 580 590 600 610
570 580 590 600 610
pF1KE2 HFYDYPMA----LFSTF--ELF-LTIIDGPANY--NVDLPFMYSITYAAFAIIATLLMLN
:: :::: .:: ::: : .. .. : .. : ... :.. .:.::
CCDS53 -VPTYPSCRDSETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILLVTYIILTFVLLLN
620 630 640 650 660 670
620 630 640 650 660
pF1KE2 LLIAMMGDTHWRVAHERDELWRAQIVATTVMLERKLPRCLWP--RSG---ICGREY-GLG
.:::.::.: .:..: ..:. : ..: . .::..: : ::: :. :
CCDS53 MLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTP
680 690 700 710 720 730
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 DR-WFLRVEDRQDLNRQRIQRYAQAFHTRGSEDLDKDSVEKLELGCPFSPHLSLPMPSVS
:: : .::..
CCDS53 DRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVEL
740 750 760 770 780 790
>>CCDS9134.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 (871 aa)
initn: 808 init1: 203 opt: 561 Z-score: 516.5 bits: 106.5 E(32554): 1.9e-22
Smith-Waterman score: 941; 33.8% identity (61.6% similar) in 580 aa overlap (144-675:225-782)
120 130 140 150 160 170
pF1KE2 QRGAMGETALHIAALYDNLEAAMVLMEAAPELVFEPMTSELYEGQTALHIAVVNQNMNLV
:.. :. . :.::::::::. . . :
CCDS91 LPKALLNLSNGRNDTIPVLLDIAERTGNMREFINSPFRDIYYRGQTALHIAIERRCKHYV
200 210 220 230 240 250
180 190 200 210 220
pF1KE2 RALLARRASVSARATGTAFR-RSPCNLIYFGEHPLSFAACVNSEEIVRLLIEHG---ADI
. :.:. :.: :.: : :. .. . .:::: :::.:::.:. .:: : :. ::.
CCDS91 ELLVAQGADVHAQARGRFFQPKDEGGYFYFGELPLSLAACTNQPHIVNYLTENPHKKADM
260 270 280 290 300 310
230 240 250 260 270 280
pF1KE2 RAQDSLGNTVLHILI-----LQPNKTFACQMYNLLLSYDRHGDHLQPLDLVPNHQGLTPF
: ::: :::::: :. . : :. .::.::: . . :. : :..::.:.
CCDS91 RRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKCARLFPDSNLEAVLNNDGLSPL
320 330 340 350 360 370
290 300 310 320 330
pF1KE2 KLAGVEGNTVMFQHLMQK-----------RKHTQWTYGPLTSTLYDLTEIDSSGDEQSLL
.:. :. .:::.... :: .:.:::. :.::::. .:. :.: :.:
CCDS91 MMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGPVYSSLYDLSSLDTCGEEASVL
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KE2 ELIITTKKREAR-QILDQTPVKELVSLKWKRYGRPYFCMLGAIYLLYIICFTMCCIYRPL
:... ..: : : ..: :..::. ::...: : . . :: .. ::. :.::
CCDS91 EILVYNSKIENRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYINVVSYLCAMVIFTLTAYYQPL
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KE2 KPRTNNRTSPRDNTLLQQKLLQEAYMTPKDDIRLVGELVTVIGAIIILLVEVPDIFRM--
. : : : : : .::.::..:.. ......... :.:
CCDS91 EG-----TPPYP------------YRTTVDYLRLAGEVITLFTGVLFFFTNIKDLFMKKC
500 510 520 530
460 470 480 490 500
pF1KE2 -GVTRFFGQTILGGPFHVLIITYAFMVLVTMVMRLISASGEVVPMSFALVLGWCNVMYFA
::. .: . : :..: . :. .:.:. .. : . . .. : ::::::: :..::.
CCDS91 PGVNSLF----IDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIEAYLAVMVFALVLGWMNALYFT
540 550 560 570 580 590
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 RGFQMLGPFTIMIQKMIFGDLMRFCWLMAVVILGFASAFYIIFQ--------TEDPEELG
::... : ..:::::..: ::.:: .. . ..:.:::. ... .:: .
CCDS91 RGLKLTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASALVSLLNPCANMKVCNEDQTNCT
600 610 620 630 640 650
570 580 590 600 610
pF1KE2 HFYDYPMA----LFSTF--ELF-LTIIDGPANY--NVDLPFMYSITYAAFAIIATLLMLN
:: :::: .:: ::: : .. .. : .. : ... :.. .:.::
CCDS91 -VPTYPSCRDSETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKYPVVFIILLVTYIILTFVLLLN
660 670 680 690 700 710
620 630 640 650 660
pF1KE2 LLIAMMGDTHWRVAHERDELWRAQIVATTVMLERKLPRCLWP--RSG---ICGREY-GLG
.:::.::.: .:..: ..:. : ..: . .::..: : ::: :. :
CCDS91 MLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVFLRKAFRSGEMVTVGKSSDGTP
720 730 740 750 760 770
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 DR-WFLRVEDRQDLNRQRIQRYAQAFHTRGSEDLDKDSVEKLELGCPFSPHLSLPMPSVS
:: : .::..
CCDS91 DRRWCFRVDEVNWSHWNQNLGIINEDPGKNETYQYYGFSHTVGRLRRDRWSSVVPRVVEL
780 790 800 810 820 830
>>CCDS32576.1 TRPV2 gene_id:51393|Hs108|chr17 (764 aa)
initn: 650 init1: 195 opt: 528 Z-score: 487.4 bits: 100.9 E(32554): 8e-21
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::.
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>>CCDS45576.1 TRPV1 gene_id:7442|Hs108|chr17 (839 aa)
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CCDS45 IINEDPGNCEGVKRTLSFSLRSSRVSGRHWKNFALVPLLREASARDRQSAQPEEVYLRQF
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>>CCDS53828.1 TRPV4 gene_id:59341|Hs108|chr12 (824 aa)
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CCDS53 CTNQPHIVNYLTENPHKKADMRRQDSRGNTVLHALVAIADNTRENTKFVTKMYDLLLLKC
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CCDS53 ARLFPDSNLEAVLNNDGLSPLMMAAKTGKIGIFQHIIRREVTDEDTRHLSRKFKDWAYGP
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CCDS53 VYSSLYDLSSLDTCGEEASVLEILVYNSKIENRHEMLAVEPINELLRDKWRKFGAVSFYI
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CCDS53 NVVSYLCAMVIFTLTAYYQPLEG-----TPPYP------------YRTTVDYLRLAGEVI
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CCDS53 TLFTGVLFFFTNIKDLFMKKCPGVNSLF----IDGSFQLLYFIYSVLVIVSAALYLAGIE
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CCDS53 AYLAVMVFALVLGWMNALYFTRGLKLTGTYSIMIQKILFKDLFRFLLVYLLFMIGYASAL
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CCDS53 VSLLNPCANMKVCNEDQTNCT-VPTYPSCRDSETFSTFLLDLFKLTIGMGDLEMLSSTKY
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CCDS53 PVVFIILLVTYIILTFVLLLNMLIALMGETVGQVSKESKHIWKLQWATTILDIERSFPVF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]