FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2607, 1104 aa
1>>>pF1KE2607 1104 - 1104 aa - 1104 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
63214209 residues in 88908 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0631+/-0.000551; mu= 22.9056+/- 0.034
mean_var=76.2502+/-14.850, 0's: 0 Z-trim(106.6): 160 B-trim: 140 in 1/48
Lambda= 0.146877
statistics sampled from 14881 (15046) to 14881 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.501), E-opt: 0.2 (0.169), width: 16
Scan time: 11.210
The best scores are: opt bits E(88908)
NP_076985 (OMIM: 606678) transient receptor potent (1104) 7398 1578.9 0
XP_011510112 (OMIM: 606678) PREDICTED: transient r (1115) 7305 1559.2 0
XP_016860380 (OMIM: 606678) PREDICTED: transient r (1038) 6805 1453.2 0
NP_001307280 (OMIM: 603749) transient receptor pot (1469) 1536 336.8 5.8e-91
XP_005261228 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1503) 1536 336.8 5.9e-91
NP_003298 (OMIM: 603749) transient receptor potent (1503) 1536 336.8 5.9e-91
XP_016883946 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1499) 1533 336.2 9.2e-91
XP_011528038 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1533) 1533 336.2 9.3e-91
XP_016883945 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1533) 1533 336.2 9.3e-91
NP_001307279 (OMIM: 603749) transient receptor pot (1553) 1533 336.2 9.4e-91
XP_016869776 (OMIM: 602014,607009) PREDICTED: tran (1901) 867 195.2 3.3e-48
NP_055370 (OMIM: 604600) transient receptor potent (1165) 812 183.3 7.5e-45
XP_016873117 (OMIM: 604600) PREDICTED: transient r (1186) 798 180.4 5.9e-44
NP_002411 (OMIM: 603576,613216) transient receptor (1603) 604 139.4 1.8e-31
NP_001238953 (OMIM: 603576,613216) transient recep (1625) 604 139.4 1.8e-31
NP_001238949 (OMIM: 603576,613216) transient recep (1642) 604 139.4 1.8e-31
XP_016870649 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1172) 593 136.9 7e-31
XP_016870648 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1184) 593 136.9 7e-31
XP_016870645 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1290) 593 137.0 7.5e-31
XP_016870646 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1315) 593 137.0 7.6e-31
XP_011517349 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1325) 593 137.0 7.6e-31
XP_016870642 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1327) 593 137.0 7.7e-31
XP_016870644 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1337) 593 137.0 7.7e-31
XP_016870640 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1339) 593 137.0 7.7e-31
XP_016870643 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1352) 593 137.0 7.8e-31
XP_016870639 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1352) 593 137.0 7.8e-31
XP_016870638 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1354) 593 137.0 7.8e-31
XP_016870641 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1362) 593 137.0 7.8e-31
XP_016870637 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1364) 593 137.0 7.8e-31
NP_996827 (OMIM: 608961) transient receptor potent (1544) 593 137.0 8.6e-31
NP_066003 (OMIM: 608961) transient receptor potent (1554) 593 137.0 8.6e-31
NP_996828 (OMIM: 608961) transient receptor potent (1556) 593 137.0 8.6e-31
NP_079247 (OMIM: 608961) transient receptor potent (1566) 593 137.0 8.7e-31
NP_996830 (OMIM: 608961) transient receptor potent (1569) 593 137.0 8.7e-31
NP_996829 (OMIM: 608961) transient receptor potent (1579) 593 137.0 8.7e-31
XP_016870636 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1591) 593 137.0 8.8e-31
XP_016870633 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1591) 593 137.0 8.8e-31
XP_016870634 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1591) 593 137.0 8.8e-31
XP_016870635 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1591) 593 137.0 8.8e-31
XP_011517348 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1697) 593 137.1 9.2e-31
XP_011517347 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1699) 593 137.1 9.2e-31
NP_001007472 (OMIM: 608961) transient receptor pot (1707) 593 137.1 9.2e-31
XP_011517346 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1709) 593 137.1 9.2e-31
XP_011517345 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1709) 593 137.1 9.2e-31
XP_011517344 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1711) 593 137.1 9.2e-31
XP_011517343 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1719) 593 137.1 9.3e-31
XP_011517342 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1721) 593 137.1 9.3e-31
XP_011517341 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1722) 593 137.1 9.3e-31
XP_016870632 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1724) 593 137.1 9.3e-31
XP_011517340 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1732) 593 137.1 9.3e-31
>>NP_076985 (OMIM: 606678) transient receptor potential (1104 aa)
initn: 7398 init1: 7398 opt: 7398 Z-score: 8469.1 bits: 1578.9 E(88908): 0
Smith-Waterman score: 7398; 100.0% identity (100.0% similar) in 1104 aa overlap (1-1104:1-1104)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSFRAARLSMRNRRNDTLDSTRTLYSSASRSTDLSYSESDLVNFIQANFKKRECVFFTKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 MSFRAARLSMRNRRNDTLDSTRTLYSSASRSTDLSYSESDLVNFIQANFKKRECVFFTKD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SKATENVCKCGYAQSQHMEGTQINQSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKKGKYIRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 SKATENVCKCGYAQSQHMEGTQINQSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKKGKYIRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSRLIYIAQSKGAWIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 SCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSRLIYIAQSKGAWIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSSEENIVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLAQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 TGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSSEENIVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLAQY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGKIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 LMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGKIP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 IVCFAQGGGKETLKAINTSIKNKIPCVVVEGSGQIADVIASLVEVEDALTSSAVKEKLVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 IVCFAQGGGKETLKAINTSIKNKIPCVVVEGSGQIADVIASLVEVEDALTSSAVKEKLVR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 FLPRTVSRLPEEETESWIKWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFSTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 FLPRTVSRLPEEETESWIKWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFSTSE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QDKDNWNGQLKLLLEWNQLDLANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALIKDRPKFVRLFLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 QDKDNWNGQLKLLLEWNQLDLANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALIKDRPKFVRLFLEN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GLNLRKFLTHDVLTELFSNHFSTLVYRNLQIAKNSYNDALLTFVWKLVANFRRGFRKEDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 GLNLRKFLTHDVLTELFSNHFSTLVYRNLQIAKNSYNDALLTFVWKLVANFRRGFRKEDR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 NGRDEMDIELHDVSPITRHPLQALFIWAILQNKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 NGRDEMDIELHDVSPITRHPLQALFIWAILQNKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LAKVKNDINAAGESEELANEYETRAVELFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 LAKVKNDINAAGESEELANEYETRAVELFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VEATDQHFIAQPGVQNFLSKQWYGEISRDTKNWKIILCLFIIPLVGCGFVSFRKKPVDKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 VEATDQHFIAQPGVQNFLSKQWYGEISRDTKNWKIILCLFIIPLVGCGFVSFRKKPVDKH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 KKLLWYYVAFFTSPFVVFSWNVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPPELVLYSLVFVLFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 KKLLWYYVAFFTSPFVVFSWNVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPPELVLYSLVFVLFC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 DEVRQWYVNGVNYFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHSSNKSSLYSGRVIFCLDYIIFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 DEVRQWYVNGVNYFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHSSNKSSLYSGRVIFCLDYIIFT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 LRLIHIFTVSRNLGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFAVWMVAFGVARQGILRQNEQRWRWIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 LRLIHIFTVSRNLGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFAVWMVAFGVARQGILRQNEQRWRWIF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 RSVIYEPYLAMFGQVPSDVDGTTYDFAHCTFTGNESKPLCVELDEHNLPRFPEWITIPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 RSVIYEPYLAMFGQVPSDVDGTTYDFAHCTFTGNESKPLCVELDEHNLPRFPEWITIPLV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 CIYMLSTNILLVNLLVAMFGYTVGTVQENNDQVWKFQRYFLVQEYCSRLNIPFPFIVFAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 CIYMLSTNILLVNLLVAMFGYTVGTVQENNDQVWKFQRYFLVQEYCSRLNIPFPFIVFAY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 FYMVVKKCFKCCCKEKNMESSVCCFKNEDNETLAWEGVMKENYLVKINTKANDTSEEMRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 FYMVVKKCFKCCCKEKNMESSVCCFKNEDNETLAWEGVMKENYLVKINTKANDTSEEMRH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KE2 RFRQLDTKLNDLKGLLKEIANKIK
::::::::::::::::::::::::
NP_076 RFRQLDTKLNDLKGLLKEIANKIK
1090 1100
>>XP_011510112 (OMIM: 606678) PREDICTED: transient recep (1115 aa)
initn: 7305 init1: 7305 opt: 7305 Z-score: 8362.6 bits: 1559.2 E(88908): 0
Smith-Waterman score: 7305; 99.9% identity (100.0% similar) in 1089 aa overlap (1-1089:1-1089)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MSFRAARLSMRNRRNDTLDSTRTLYSSASRSTDLSYSESDLVNFIQANFKKRECVFFTKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSFRAARLSMRNRRNDTLDSTRTLYSSASRSTDLSYSESDLVNFIQANFKKRECVFFTKD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 SKATENVCKCGYAQSQHMEGTQINQSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKKGKYIRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SKATENVCKCGYAQSQHMEGTQINQSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKKGKYIRL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 SCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSRLIYIAQSKGAWIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSRLIYIAQSKGAWIL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 TGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSSEENIVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLAQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSSEENIVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLAQY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 LMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGKIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGKIP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 IVCFAQGGGKETLKAINTSIKNKIPCVVVEGSGQIADVIASLVEVEDALTSSAVKEKLVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IVCFAQGGGKETLKAINTSIKNKIPCVVVEGSGQIADVIASLVEVEDALTSSAVKEKLVR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 FLPRTVSRLPEEETESWIKWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFSTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FLPRTVSRLPEEETESWIKWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFSTSE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 QDKDNWNGQLKLLLEWNQLDLANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALIKDRPKFVRLFLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QDKDNWNGQLKLLLEWNQLDLANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALIKDRPKFVRLFLEN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 GLNLRKFLTHDVLTELFSNHFSTLVYRNLQIAKNSYNDALLTFVWKLVANFRRGFRKEDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GLNLRKFLTHDVLTELFSNHFSTLVYRNLQIAKNSYNDALLTFVWKLVANFRRGFRKEDR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 NGRDEMDIELHDVSPITRHPLQALFIWAILQNKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGRDEMDIELHDVSPITRHPLQALFIWAILQNKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 LAKVKNDINAAGESEELANEYETRAVELFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LAKVKNDINAAGESEELANEYETRAVELFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE2 VEATDQHFIAQPGVQNFLSKQWYGEISRDTKNWKIILCLFIIPLVGCGFVSFRKKPVDKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEATDQHFIAQPGVQNFLSKQWYGEISRDTKNWKIILCLFIIPLVGCGFVSFRKKPVDKH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE2 KKLLWYYVAFFTSPFVVFSWNVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPPELVLYSLVFVLFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KKLLWYYVAFFTSPFVVFSWNVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPPELVLYSLVFVLFC
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE2 DEVRQWYVNGVNYFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHSSNKSSLYSGRVIFCLDYIIFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DEVRQWYVNGVNYFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHSSNKSSLYSGRVIFCLDYIIFT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE2 LRLIHIFTVSRNLGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFAVWMVAFGVARQGILRQNEQRWRWIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LRLIHIFTVSRNLGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFAVWMVAFGVARQGILRQNEQRWRWIF
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE2 RSVIYEPYLAMFGQVPSDVDGTTYDFAHCTFTGNESKPLCVELDEHNLPRFPEWITIPLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RSVIYEPYLAMFGQVPSDVDGTTYDFAHCTFTGNESKPLCVELDEHNLPRFPEWITIPLV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE2 CIYMLSTNILLVNLLVAMFGYTVGTVQENNDQVWKFQRYFLVQEYCSRLNIPFPFIVFAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CIYMLSTNILLVNLLVAMFGYTVGTVQENNDQVWKFQRYFLVQEYCSRLNIPFPFIVFAY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE2 FYMVVKKCFKCCCKEKNMESSVCCFKNEDNETLAWEGVMKENYLVKINTKANDTSEEMRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FYMVVKKCFKCCCKEKNMESSVCCFKNEDNETLAWEGVMKENYLVKINTKANDTSEEMRH
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100
pF1KE2 RFRQLDTKLNDLKGLLKEIANKIK
::::::::.
XP_011 RFRQLDTKIILRNADEQFCYRLLNERFSDPWVHGG
1090 1100 1110
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pF1KE2 NFKKRECVFFTKDSKATENVCKCGYAQSQHMEGTQINQSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQ
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MEGTQINQSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQ
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110 120 130 140 150 160
pF1KE2 FETLGKKGKYIRLSCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FETLGKKGKYIRLSCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSR
40 50 60 70 80 90
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pF1KE2 LIYIAQSKGAWILTGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSSEENIVAIGIAAWGMVSNRDTLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LIYIAQSKGAWILTGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSSEENIVAIGIAAWGMVSNRDTLI
100 110 120 130 140 150
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RNCDAEGYFLAQYLMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISE
160 170 180 190 200 210
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTIQDSNYGGKIPIVCFAQGGGKETLKAINTSIKNKIPCVVVEGSGQIADVIASLVEVED
220 230 240 250 260 270
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALTSSAVKEKLVRFLPRTVSRLPEEETESWIKWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNA
280 290 300 310 320 330
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISYALYKAFSTSEQDKDNWNGQLKLLLEWNQLDLANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KDRPKFVRLFLENGLNLRKFLTHDVLTELFSNHFSTLVYRNLQIAKNSYNDALLTFVWKL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VANFRRGFRKEDRNGRDEMDIELHDVSPITRHPLQALFIWAILQNKKELSKVIWEQTRGC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TLAALGASKLLKTLAKVKNDINAAGESEELANEYETRAVELFTECYSSDEDLAEQLLVYS
520 530 540 550 560 570
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pF1KE2 CEAWGGSNCLELAVEATDQHFIAQPGVQNFLSKQWYGEISRDTKNWKIILCLFIIPLVGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CEAWGGSNCLELAVEATDQHFIAQPGVQNFLSKQWYGEISRDTKNWKIILCLFIIPLVGC
580 590 600 610 620 630
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pF1KE2 GFVSFRKKPVDKHKKLLWYYVAFFTSPFVVFSWNVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GFVSFRKKPVDKHKKLLWYYVAFFTSPFVVFSWNVVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPP
640 650 660 670 680 690
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pF1KE2 ELVLYSLVFVLFCDEVRQWYVNGVNYFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHSSNKSSLYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ELVLYSLVFVLFCDEVRQWYVNGVNYFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHSSNKSSLYS
700 710 720 730 740 750
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pF1KE2 GRVIFCLDYIIFTLRLIHIFTVSRNLGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFAVWMVAFGVARQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GRVIFCLDYIIFTLRLIHIFTVSRNLGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFAVWMVAFGVARQG
760 770 780 790 800 810
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pF1KE2 ILRQNEQRWRWIFRSVIYEPYLAMFGQVPSDVDGTTYDFAHCTFTGNESKPLCVELDEHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ILRQNEQRWRWIFRSVIYEPYLAMFGQVPSDVDGTTYDFAHCTFTGNESKPLCVELDEHN
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pF1KE2 LPRFPEWITIPLVCIYMLSTNILLVNLLVAMFGYTVGTVQENNDQVWKFQRYFLVQEYCS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LPRFPEWITIPLVCIYMLSTNILLVNLLVAMFGYTVGTVQENNDQVWKFQRYFLVQEYCS
880 890 900 910 920 930
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pF1KE2 RLNIPFPFIVFAYFYMVVKKCFKCCCKEKNMESSVCCFKNEDNETLAWEGVMKENYLVKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RLNIPFPFIVFAYFYMVVKKCFKCCCKEKNMESSVCCFKNEDNETLAWEGVMKENYLVKI
940 950 960 970 980 990
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pF1KE2 NTKANDTSEEMRHRFRQLDTKLNDLKGLLKEIANKIK
:::::::::::::::::::::.
XP_016 NTKANDTSEEMRHRFRQLDTKIILRNADEQFCYRLLNERFSDPWVHGG
1000 1010 1020 1030
>>NP_001307280 (OMIM: 603749) transient receptor potenti (1469 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 LSMRNRRNDTLDSTRTLYSSASRSTDLSYSESDLVNFIQANFKKRECVFFTKDSKATEN-
. .: ..: :.::.:::.:...:: ..
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70 80 90 100 110 120
pF1KE2 --VCKCGYAQSQHME-GTQIN--QSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKK-GKYIRL
::.:::.. ::.: .:. . :. .:. :::..:.:::::::: : :..: ::.:.
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130 140 150 160 170
pF1KE2 SCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSR-LIYIAQSKGAWI
: :: . ..:.:.:::: : .:::.:::::::::: .:::...:: : :. .::. ::::
NP_001 SQDTPSSVIYHLMTQHWGLDVPNLLISVTGGAKNFNMKPRLKSIFRRGLVKVAQTTGAWI
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180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LTGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSSEEN-IVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLA
.:::.: :.:: .::.::: ..: : .:. ...::.:.:: : :. ::. : : :
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240 250 260 270 280 290
pF1KE2 QYLMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGK
.:..:. . : ::.::.:..:::.: ::. :: ::..:::.:::.: . .. . :
NP_001 EYILDEDGQGNLTCLDSNHSHFILVDDGTHGQYGVEIPLRTRLEKFISEQTKERGGVAIK
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300 310 320 330 340 350
pF1KE2 IPIVCFAQGGGKETLKAINTSIKNKIPCVVVEGSGQIADVIASLVEVE-DALTSSAVKEK
::::: . :: ::..:... : :::::::::..:::::..... . .: : ...:
NP_001 IPIVCVVLEGGPGTLHTIDNATTNGTPCVVVEGSGRVADVIAQVANLPVSDITISLIQQK
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LVRFLPRTVSRLPEEETESWIKWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFS
: :. . . : . : : ...:.. .::::.. . :.. :. :: :: ::
NP_001 LSVFFQEMFETFTESRIVEWTKKIQDIVRRRQLLTVFREGKDGQQDVDVAILQALLKASR
390 400 410 420 430 440
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 TSEQ-DKDNWNGQLKLLLEWNQLDLANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALIKDRPKFVRL
.... ..::. :::: . ::..:.: .::: .. .:. .::. .: .:::...:.::.:
NP_001 SQDHFGHENWDHQLKLAVAWNRVDIARSEIFMDEWQWKPSDLHPTMTAALISNKPEFVKL
450 460 470 480 490 500
480 490 500 510 520
pF1KE2 FLENGLNLRKFLTHDVLTELFSN-HFSTLVYRNLQ--IAKNSYNDA------------LL
:::::..:..:.: :.: :. : : : . .:: .... : .
NP_001 FLENGVQLKEFVTWDTLLYLYENLDPSCLFHSKLQKVLVEDPERPACAPAAPRLQMHHVA
510 520 530 540 550 560
530 540 550 560
pF1KE2 TFVWKLVANFRRGFRKEDR-NGR-------DEMDIELHDVS------------PITRHPL
. .:...: . . . : : : .. .... :: .: :.
NP_001 QVLRELLGDFTQPLYPRPRHNDRLRLLLPVPHVKLNVQGVSLRSLYKRSSGHVTFTMDPI
570 580 590 600 610 620
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 QALFIWAILQNKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKTLAKVKNDINAAGESEELANEY
. :.::::.::..::. .:: :.. : :::. ::.:: :.: ..: ... : ::.::
NP_001 RDLLIWAIVQNRRELAGIIWAQSQDCIAAALACSKILKELSKEEEDTDSSEEMLALAEEY
630 640 650 660 670 680
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 ETRAVELFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELAVEATDQHFIAQPGVQNFLSKQ
: ::. .::::: .::. :..::. :::: ..::.::.:: :..:... :.: ::.:
NP_001 EHRAIGVFTECYRKDEERAQKLLTRVSEAWGKTTCLQLALEAKDMKFVSHGGIQAFLTKV
690 700 710 720 730 740
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 WYGEISRDTKNWKIILCLFIIPLVGCGFVSFRKKPVDKHKKLLWYYVAFFTSPFVVFSWN
:.:..: :. :.. ::.. .::. :..:::.: .. ::::.: ::: :
NP_001 WWGQLSVDNGLWRVTLCMLAFPLLLTGLISFREKRLQDVGTPAARARAFFTAPVVVFHLN
750 760 770 780 790 800
750 760 770 780 790
pF1KE2 VVFYIAFLLLFAYVLLMDFHSVPHPPELVLYSLVFVLFCDEVRQWYVN----GVN-----
.. :.::: ::::::..::. :: : ..: .: : :.:.:: . . :.
NP_001 ILSYFAFLCLFAYVLMVDFQPVPSWCECAIYLWLFSLVCEEMRQLFYDPDECGLMKKAAL
810 820 830 840 850 860
800 810 820 830 840 850
pF1KE2 YFTDLWNVMDTLGLFYFIAGIVFRLHSSNKSSLYSGRVIFCLDYIIFTLRLIHIFTVSRN
::.:.:: .:. ... :.::.. :: ..:: ::::. ::.:.: :::.::::.:..
NP_001 YFSDFWNKLDVGAILLFVAGLTCRL---IPATLYPGRVILSLDFILFCLRLMHIFTISKT
870 880 890 900 910
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pF1KE2 LGPKIIMLQRMLIDVFFFLFLFAVWMVAFGVARQGILRQNEQRWRWIFRSVIYEPYLAMF
::::::...::. ::::::::.:::.:.::::.:.:: .::.: :.::...:. ::..:
NP_001 LGPKIIIVKRMMKDVFFFLFLLAVWVVSFGVAKQAILIHNERRVDWLFRGAVYHSYLTIF
920 930 940 950 960 970
920 930 940 950 960 970
pF1KE2 GQVPSDVDGTTYDFAHCTFTGNES-KPLCVELDE-HNLPRFPEWITIPLVCIYMLSTNIL
::.:. .::.... ::. .:.. :: : : : .. : ::::.:. :.:.:.: ::::
NP_001 GQIPGYIDGVNFNPEHCSPNGTDPYKPKCPESDATQQRPAFPEWLTVLLLCLYLLFTNIL
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980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KE2 LVNLLVAMFGYTVGTVQENNDQVWKFQRYFLVQEYCSRLNIPFPFIVFAYFYMVVKKCFK
:.:::.:::.:: :::..::.:::::. :..:: .: : :::..... . .:.
NP_001 LLNLLIAMFNYTFQQVQEHTDQIWKFQRHDLIEEYHGRPAAPPPFILLSHLQLFIKRVVL
1040 1050 1060 1070 1080 1090
1040 1050 1060 1070 1080 1090
pF1KE2 CCCKEKNMESSVCCFKNEDNETLAWEGVMKENYLVKINTKANDTSEEMRHRFRQLDTKLN
... . . :::. :.:: .::::: . . . .. :. .......:..
NP_001 KTPAKRHKQLKNKLEKNEEAALLSWEIYLKENYLQNRQFQQKQRPEQ---KIEDISNKVD
1100 1110 1120 1130 1140 1150
1100
pF1KE2 DLKGLLKEIANKIK
. ::
NP_001 AMVDLLDLDPLKRSGSMEQRLASLEEQVAQTARALHWIVRTLRASGFSSEADVPTLASQK
1160 1170 1180 1190 1200 1210
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 LSMRNRRNDTLDSTRTLYSSASRSTDLSYSESDLVNFIQANFKKRECVFFTKDSKATEN-
. .: ..: :.::.:::.:...:: ..
XP_005 DLGMVSNLRRSNSSLFKSWRLQCPFGNNDKQESLSSWIPENIKKKECVYFVESSKLSDAG
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70 80 90 100 110 120
pF1KE2 --VCKCGYAQSQHME-GTQIN--QSEKWNYKKHTKEFPTDAFGDIQFETLGKK-GKYIRL
::.:::.. ::.: .:. . :. .:. :::..:.:::::::: : :..: ::.:.
XP_005 KVVCQCGYTHEQHLEEATKPHTFQGTQWDPKKHVQEMPTDAFGDIVFTGLSQKVKKYVRV
90 100 110 120 130 140
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pF1KE2 SCDTDAEILYELLTQHWHLKTPNLVISVTGGAKNFALKPRMRKIFSR-LIYIAQSKGAWI
: :: . ..:.:.:::: : .:::.:::::::::: .:::...:: : :. .::. ::::
XP_005 SQDTPSSVIYHLMTQHWGLDVPNLLISVTGGAKNFNMKPRLKSIFRRGLVKVAQTTGAWI
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180 190 200 210 220 230
pF1KE2 LTGGTHYGLMKYIGEVVRDNTISRSSEEN-IVAIGIAAWGMVSNRDTLIRNCDAEGYFLA
.:::.: :.:: .::.::: ..: : .:. ...::.:.:: : :. ::. : : :
XP_005 ITGGSHTGVMKQVGEAVRDFSLSSSYKEGELITIGVATWGTVHRREGLIH---PTGSFPA
210 220 230 240 250 260
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 QYLMDDFTRDPLYILDNNHTHLLLVDNGCHGHPTVEAKLRNQLEKYISERTIQDSNYGGK
.:..:. . : ::.::.:..:::.: ::. :: ::..:::.:::.: . .. . :
XP_005 EYILDEDGQGNLTCLDSNHSHFILVDDGTHGQYGVEIPLRTRLEKFISEQTKERGGVAIK
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300 310 320 330 340 350
pF1KE2 IPIVCFAQGGGKETLKAINTSIKNKIPCVVVEGSGQIADVIASLVEVE-DALTSSAVKEK
::::: . :: ::..:... : :::::::::..:::::..... . .: : ...:
XP_005 IPIVCVVLEGGPGTLHTIDNATTNGTPCVVVEGSGRVADVIAQVANLPVSDITISLIQQK
330 340 350 360 370 380
360 370 380 390 400 410
pF1KE2 LVRFLPRTVSRLPEEETESWIKWLKEILECSHLLTVIKMEEAGDEIVSNAISYALYKAFS
: :. . . : . : : ...:.. .::::.. . :.. :. :: :: ::
XP_005 LSVFFQEMFETFTESRIVEWTKKIQDIVRRRQLLTVFREGKDGQQDVDVAILQALLKASR
390 400 410 420 430 440
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 TSEQ-DKDNWNGQLKLLLEWNQLDLANDEIFTNDRRWESADLQEVMFTALIKDRPKFVRL
.... ..::. :::: . ::..:.: .::: .. .:. .::. .: .:::...:.::.:
XP_005 SQDHFGHENWDHQLKLAVAWNRVDIARSEIFMDEWQWKPSDLHPTMTAALISNKPEFVKL
450 460 470 480 490 500
480 490 500 510 520
pF1KE2 FLENGLNLRKFLTHDVLTELFSN-HFSTLVYRNLQ--IAKNSYNDA------------LL
:::::..:..:.: :.: :. : : : . .:: .... : .
XP_005 FLENGVQLKEFVTWDTLLYLYENLDPSCLFHSKLQKVLVEDPERPACAPAAPRLQMHHVA
510 520 530 540 550 560
530 540 550 560
pF1KE2 TFVWKLVANFRRGFRKEDR-NGR-------DEMDIELHDVS------------PITRHPL
. .:...: . . . : : : .. .... :: .: :.
XP_005 QVLRELLGDFTQPLYPRPRHNDRLRLLLPVPHVKLNVQGVSLRSLYKRSSGHVTFTMDPI
570 580 590 600 610 620
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 QALFIWAILQNKKELSKVIWEQTRGCTLAALGASKLLKTLAKVKNDINAAGESEELANEY
. :.::::.::..::. .:: :.. : :::. ::.:: :.: ..: ... : ::.::
XP_005 RDLLIWAIVQNRRELAGIIWAQSQDCIAAALACSKILKELSKEEEDTDSSEEMLALAEEY
630 640 650 660 670 680
630 640 650 660 670 680
pF1KE2 ETRAVELFTECYSSDEDLAEQLLVYSCEAWGGSNCLELAVEATDQHFIAQPGVQNFLSKQ
: ::. .::::: .::. :..::. :::: ..::.::.:: :..:... :.: ::.:
XP_005 EHRAIGVFTECYRKDEERAQKLLTRVSEAWGKTTCLQLALEAKDMKFVSHGGIQAFLTKV
690 700 710 720 730 740
690 700 710 720 730 740
pF1KE2 WYGEISRDTKNWKIILCLFIIPLVGCGFVSFRKKPVDKHKKLLWYYVAFFTSPFVVFSWN
:.:..: :. :.. ::.. .::. :..:::.: .. ::::.: ::: :
XP_005 WWGQLSVDNGLWRVTLCMLAFPLLLTGLISFREKRLQDVGTPAARARAFFTAPVVVFHLN
750 760 770 780 790 800
750 760 770 780 790
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.. :.::: ::::::..::. :: : ..: .: : :.:.:: . . :.
XP_005 ILSYFAFLCLFAYVLMVDFQPVPSWCECAIYLWLFSLVCEEMRQLFYDPDECGLMKKAAL
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